1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9.

2.1 Strain Industri 2.1.1 Pengertian Strain industri adalah koloni mikrobia (atau hasil biakannya) dengan sifat-sifat fisiologi yang sama sebagai hasil proses isolasi atau rekayasa lainnya untuk memurnikan sifat tersebut. 2.1.2 Syarat Terlepas dari asal-usul suatu mikroorganisme industri, idealnya harus menunjukkan : Stabilitas genetik Efisiensi produksi produk sasaran di mana rute biosintesis harus ditandai dengan baik Terbatas atau tidak ada kebutuhan akan vitamin dan faktor pertumbuhan tambahan Pemanfaatan berbagai karbon rendah biaya dan ketersediaan sumber karbon Dapat dimanipulasi secara genetik Aman, bukan patogen dan tidak menghasilkan produk beracun kecuali jika produk beracun tersebut adalah produk sasaran Siap dipanen dari fermentasi Siap rusak jika produk sasaran adalah intraselular Produksi terbatas oleh produk sebagai produk sampingan untuk meringankan masalah pemurnian selanjutnya Fitur lain yang dapat dimanfaatkan adalah sifat thermofilik atau halofilik yang dapat berguna dalam lingkungan fermentasi. Juga, khususnya untuk sel yang tumbuh dalam suspensi, mereka harus tumbuh dengan baik dalam bioreaktor konvensional sehingga industri dapat meminimalisir kewajiban untuk mengembangkan sistem alternatif. 2.2 Pemurnian Galur (Strain Improvement) 2.2.1 Pengertian Pemurnian galur adalah bagian vital dari pengembangan proses di industri fermentasi. Hal ini dapat mengurangi harga produksi, meningkatkan produktivitas produk yang lebih unggul. Pada beberapa kasus pemurnian galur dapat dilakukan menggunakan metode alami, yaitu rekombinasi genetik yang menyatukan elemen genetik dari dua genom yang berbeda menjadi satu membentuk genotip baru. Strategi lain melalui mutagenesis. Rekombinan dan mutan dipilih dan diseleksi untuk mendapatkan strain yang memiliki karakteristik lebih spesifik untuk proses industri fermentasi. Namun strain seperti ini tidak mungkin bertahan di alam karena gen mereka telah dimanipulasi sehingga tercipta ketidaksetimbangan metabolik. Akibatnya, strain tersebut harus dipertahankan pada media spesifik agar mampu tumbuh. 2.2.2 Tujuan Tujuan dari pemurnian galur ini adalah untuk meningkatkan produktivitas mikroorganisme, untuk mengubah produk metabolisme yang tidak terpakai, untuk memperbarui sumber karbon dan nitrogen sebagai nutrisi bagi mikroorganisme, dan memperbaiki morfologi sel menjadi sel yang lebih baik sehingga dapat memisahkan sel dan produk yang dihasilkan. 2.2.3 Rekombinasi Alami DNA bakteri umumnya dalam bentuk kromosom tunggal dan plasmid; belakangan ini DNA dapat mereplikasi dirinya sendiri. Tiap plasmid membawa hingga beberapa ratus gen tambahan dan ada sebanyak 1000 kopi plasmid per sel. Plasmid tersebut mengandung kode informasi genetik tambahan untuk ciri-ciri yang tidak ditemukan di kromosom DNA bakteri. Tidak seperti organisme eukariotik, bakteri tidak mempunyai bentuk reproduksi seksual. Namun, bakteri itu mampu bertukar beberapa materi genetik melalui proses konjugasi, transduksi, transformasi dan pembelahan biner. KONJUGASI melibatkan kontak antar sel satu dengan sel yang lain, di mana pendonor kontak dengan resipien melalui struktur protein filamen yang dinamakan pilus seks yang menghubungkan 2 sel tersebut berdekatan. Pendonor menyalin semua bagian dari plasmid atau kromosom DNAnya dan dibagikan melalui pilus ke resipien.

Pada TRANSDUKSI, bakteri yang mengandung virus (bakteriofage) berperan sebagai vektor dalam mentransfer gen antar bakteri. Bakteriofage menempel ke sel bakteri dan memasukkan DNA-nya ke inang untuk menggabungkan DNA bakteriofage ke kromosom inangnya. Selama replikasi, bakteriofage memperoleh potongan dari DNA inang. Jika fage-fage tesebut terus memasuki inang-inang baru, mereka mampu menggabungkan DNA asli dan gen-gen yang diambil dari inang sebelumnya ke dalam kromosom inang baru. Bakteriofage, seperti plasmid, juga memperoleh transposon (bagian dari DNA yang memiliki kemampuan untuk berpindah-pindah dari tempat yang satu ke tempat yang lain, dalam kromosom yang sama ataupun yang berbeda); misalnya, dari plasmid ke kromosom dan sebaliknya. Bakteriofage dapat membawa transposon ke dalam sel bakteri inang baru di mana mereka dapat meloncat ke dalam plasmid atau kromosom DNA inang. TRANSFORMASI melibatkan serapan selular bagian DNA dari medium sekitar yang kemudian menjadi tergabung di dalam sel. Pada lingkungan alami, transformasi merupakan proses acak, fragmen DNA tersedia untuk penyerapan yang berasal dari sel yang segaris. Pada eukariot, rekombinasi genetik secara alami terjadi selama reproduksi seksual. Genotif baru dihasilkan dari kombinasi kromosom parental dan sebagai akibat dari peristiwa crossing-over selama meiosis. Belakangan ini melibatkan kerusakan bagian kromosom DNA dan perubahan dari segmen antar kromosom homolog untuk membentuk kombinasi baru. Beberapa fungi yang berperan penting dalam industri, meliputi Penicillium dan Aspergillus, tidak mempunyai fase seksual yang sebenarnya. Namun, siklus paraseksual telah menyediakan rute sehingga strain baru dapat diproduksi. Hal ini dikembangkan saat dua strain haploid yang berbeda secara genetik tumbuh bersama, membolehkan fusi hifa mereka. Peristiwa ini akibat dari pembentukan heterokarion, inti yang mengandung miselium yang berasal dari masing-masing strain. Pembentukan herokarion secara langsung dapat dilakukan secara in vitro dengan menggabungkan protoplas yang dinding selnya telah dihilangkan. Juga, eukariot tertentu termasuk beberapa kapang dan jamur berfilamen, memiliki plasmid autonomous, seperti 2μm plasmid Saccharomyces cerevisiae yang terbukti berguna sebagai vektor dalam rekayasa genetika. 2.2.4 Mutasi Mutasi didapatkan dari perubahan fisik DNA sel, seperti delesi, insersi, duplikasi, inversi dan translokasi dari sepotong DNA, atau perubahan dalam jumlah salinan dari seluruh gen atau kromosom. Penaklukan mikroorganisme untuk mengulangi siklus mutagenesis, diikuti oleh seleksi yang sesuai dan pemilihan organisme yang dapat bertahan, merupakan cara efektif dalam banyak mikroorganisme industri. Mutan dapat muncul secara alami atau juga diinduksi, mereka dianggap sebagai produk dari peristiwa alami. Akibatnya, ada beberapa masalah dalam memperoleh persetujuan dari berwenang ketika teknologi rekombinasi DNA digunakan untuk mengembangkan mikroorganisme untuk industri. Laju mutasi spontan lambat; misalnya pada banyak gen bakteri, laju diperkirakan 10 -10 per generasi per gen. Laju mutasi dapat ditingkatkan dengan menggunakan mutagaen, yang dapat dibedakan menjadi 2 jenis. Mutagen fisik meliputi ultraviolet, radiasi γ dan X; mutagen kimia adalah senyawa seperti EMS, NTG, asam nitrit dan acridine mustards. Mutan terbentuk saat mutagen menginduksi modifikasi dari urutan basa DNA yang hasilnya dalam substitusi sepasang basa, mutasi frame-shift atau delesi besar kemudian menjadi tidak sepasang. Mutagenesis dapat juga diinduksi menggunakan transposon yang dikirimkan menggunakan vektor yang cocok. Mereka memproduksi mutan penginsersi yang rangkaian nukleotida normalnya disela oleh rangkaian transposon. Metode tradisional ini telah berhasil digunakan pada pemindahan warna kuning dari penyiapan penisilin dikarenakan chrysogenin, pigmen kuning dihasilkan oleh Penicillium chrysogenum. Program mutagenesis memiliki keefektifan yang besar dalam meningkatkan produksi penisilin di strain industri pada organisme yang sama.
2

Baru-baru ini, metode yang dikembangkan untuk meningkatkan baik keseluruhan kemampuan mutasi dan laju mutasi dari gen spesifik agar mendapatkan frekuensi maksimum dari tipe mutan yang diinginkan. Mutagenesis langsung ini dengan jelas membutuhkan pengetahuan tentang gen yang mengontrol target produk dan sering gambaran genetik dari organisme. Sebagai tambahan, mutagenesis in vitro sekarang digunakan dalam kombinasi dengan rekayasa genetik untuk memodifikasi gen terisolasi atau bagian dari gen. 2.2.4 Rekayasa Genetika Selama 20 tahun, perkembangan dari teknologi rekombinasi DNA dan metode fusi sel, seperti pembentukan hybridoma untuk produksi antibodi monoklonal memiliki pengaruh besar dalam mikrobiologi industri. Berbeda dengan proses rekombinasi alami, teknologi modern rekombinasi DNA menyediakan banyak kesempatan tidak terbatas untuk memproduksi gen kombinasi baru. Metode ini juga secara spesifik dan terkontrol dan memiliki berbagai macam informasi genetik yang tersedia dari beberapa makhluk hidup dan bahkan organisme yang punah. Teknologi rekombinasi DNA memungkinkan rangkaian gen spesifik dipindah dari satu organisme ke organisme lain dan memungkinkan metode tambahan diperkenalkan ke perbaikan strain. Metode ini dapat digunakan untuk meningkatkan produk dengan menghapuskan kemacetan metabolik di bagian tertentu dan memperbesar atau memperbaiki langkah spesifik metabolisme. Secara keseluruhan, prosedur rekayasa genetika memperbolehkan sifat baru ditambahkan ke kemampuan mikroorganisme industri. Mikroorganisme dapat dimanipulasi untuk mensintesis dan meningkatkan rentangan enzim yang dapat memproduksi senyawa baru atau substrat kompleks yang lebih murah. Karena tidak ada pembatasan untuk gen alami yang ditampilkan mikroorganisme, produksi protein tanaman dan hewan dimungkinkan. Produk berharga yang diproduksi termasuk pertumbuhan hormon manusia, insulin dan interferon. Namun begitu, metode ini tidak secara total menggantikan metode mutagenesis tradisional dan pendekatan kepada kedua metode harus diperhatikan untuk menghasilkan strain improvement yang lebih banyak. Strategi Rekayasa Genetika Untuk Bakteri Rekayasa genetika melibatkan manipulasi DNA. Hal ini memerlukan isolasi awal dan pemulihan gen yang diinginkan dari genom organisme donor. Rangkaian DNA yang terisolasi kemudian dimodifikasi dan pengaturan ekspresi gen mereka diubah, sebelum dimasukkan ke dalam organisme inang melalui sistem vektor termanipulasi yang cocok. Langkah pertama membutuhkan ekstraksi DNA total dari organisme pendonor yang kemudian dipotong dalam urutan yang lebih kecil menggunakan endonuklease restriksi spesifik. Banyak dari enzim restriksi ditemukan pada beberapa spesies bakteri, membuat potongan DNA beruntai ganda yang memiliki urutan spesifik (palindrom) menjadi urutan tunggal. Bagian kecil dari DNA (fragmen restriksi) kemudian dapat bergabung atau disambung ke molekul DNA vektor yang telah dipotong dengan enzim restriksi yang sejenis. Penyambungan dilakukan oleh enzim DNA ligase, dan menciptakan sebuah molekul DNA sintesis. Plasmid dan bakteriofag adalah kloning vektor yang paling berguna. Mereka memainkan peran penting sebagai pengirim sistem untuk memperkenalkan molekul rekombinan ke sel inang melalui transduksi ataupun transformasi. Setelah masuk, mereka mampu mereplikasi diri sendiri sehingga dapat mempertahankan DNA rekombinan dalam sel inang. Pengenalan plasmid rekombinan dalam sel bakteri dapat dicapai setelah treatment kalsium klorida yang membuat membran sel lebih permeabel terhadap DNA. Setelah pengenalan, plasmid mereplikasi dirinya. Dalam beberapa kasus, banyak sekali salinan diproduksi dalam sel inang untuk meningkatkan jumlah DNA rekombinan per sel. Plasmid dapat dirancang untuk mengandung penanda genetik yang baik, seperti resistensi antibiotik, kebutuhan vitamin, dll. Penanda dapat digunakan untuk memilih sel inang yang telah memasukkan plasmid selama transformasi. Bakteriofag adalah vektor kloning yang sangat berguna. Setengah dari genom bakteriofag dapat dihilangkan dan diganti dengan DNA asing. Hal ini dilakukan secara in vitro menggunakan enzim restriksi
3

yang mungkin terakumulasi membentuk inklusi tubuh di dalam sel. intron. Pada tahap ini. ketidakstabilan produk gen tertentu dalam host mikroorganisme. Hal ini menghasilkan perpustakaan DNA yang terdiri dari individu klon yang mengandung molekul DNA rekombinan yang berbeda. Gen eukariot mengandung area non-coding. tujuan utama dari kloning gen adalah mendapatkana jumlah banyak dari suatu produk. yang akan menimbulkan masalah jika gen langsung ditransfer ke sistem prokariotik. setelah dikumpulkan dalam fag atau plasmid. keberadaan tantangan lebih lanjut pada beberapa organisme mengeluarkan lebih efisien dari yang lain. aktivitas enzim dapat dideteksi. Jika gen asing berhasil mengekspresikan bakteri inang dan membuat protein heterolog. bakteri gram negatif mampu untuk mengekspresikan gen dari bakteri gram positif. menyebabkan degradasi cepat mereka dengan protease. jika dari bakteri gen negatif ke positif. Atau. Namun. Coli. tidak mudah untuk diekspresikan. Namun. 4 . Namun. dan 3. Sekresi protein lebih sulit dari faktanya karena harus disintesis dengan ekstra urutan asam amina pada terminal akhir N. Atau jika protein rekombinan adalah enzim yang tidak diproduksi oleh inang. yang mampu menginfeksi inang yang dipilih. hal ini dapat diterima dengan menggunakan dinding sel bakteri. Fragmen DNA yang sesuai kemudian dikumpulkan menjadi partikel fag. Urutan sinyal dari 20-25 asam amino membantu jalan protein melewati membran sel. 2. Pembatasan Inang Prokariot Seringkali. yang mampu menginfeksi inang Fragmen DNA yang sesuai kemudian dikumpulkan menjadi partikel fag. salah lipat dari polipeptida yang menghasilkan sebuah aktif molekul. Selain itu. gen sintesis dapat disintesis. untuk memaksimalkan produksi proetin asing. Masalah ini dapat ditangani menggunakan vektor pengekspresi di mana gen asing dimasukkan dalam konfigurasi di bawah kontrol inang. Gen asing idealnya harus dihubungkan dengan promotor kuat yang memiliki afinitas tinggi untuk polimerase RNA dan mRNA tertranskripsi harus diterjemahkan secara efisien. mRNA eukariot dapat digunakan utnuk mensintesis gen yang dapat berfungsi dalam sebuah prokariot. Akibatnya. Coli. Kadang-kadang. Di mana sekresi dalam media dibutuhkan. klon spesifik yang berisi molekul DNA rekombinan yang diinginkan dapat diidentifikasi. Perbedaan antara ekspresi gen prokariot dan eukariot harus diperhitungkan. Masalah umum lainnya pada ekspresi protein heterolog yang juga dapat ditemui dengan beberapa host eukariotik termasuk : 1. Pada bakteri gram negatif. Ini memerlukan penggunaa reverse transcriptase untuk menghasilkan salinan pelengkap DNA atau cDNA dari RNA. digunakan untuk transformasi atau mentranduksi sel inang. Untuk beberapa tujuan. deteksi dapat dicapai dengan penggunaan reaksi antibodi spesifik dengan protein. Sekresi protein rekombinan sering disukai untuk stabilitas produk dan membuat proses downstream memulihkan produk yang kurang bermasalah. sekresi lebih sering ke ruang periplasmic daripada ke medium secara langsung. vektor pengekspresi harus mereplikasi hingga jumlah salinan tinggi dan stabil. glikosilasi atau amidasi. seperti pembelahan. misalnya gen heterolog. Setelah itu. Gen tidak dapat diekspresikan jika Escherchia coli digunakan sebagai inang dan gen yang dimasukkan pada inang bukan dari bentuk strain E. klon diperbolehkan untuk membentuk koloni pada media padat selektif. menguntungkan bagi ekspresi gen kloning untuk dimanipulasi dengan menempatkan Secara umum. ini mungkin bermanfaat seperti dalam proses downstream. sehingga bakteri gram negatif tidak bisa mudah melintasi membran luar. Tambahan masalah juga muncul jika tujuannya adalah untuk mengkloning dan mengekspresikan gen seperti E. intron dipotong selama proses RNA normal. jika urutan nukleotida gen atau urutan asam amino dari protein produk diketahui. kesulitan dalam mencapai pasca-translasi modifikasi protein. mewakili seluruh urutan DNA / gen dari genom donor.yang mirip dengan cara manipulasi plasmid. Campuran dari fragmen restriksi yang berasal dari ekstrak DNA utuh.

integrasi gen ke kromosom normalnya adalah solusi terbaik untuk mengatasi banyak masalah ketidakstablitasan. jaringan metabolis dalam mikroorganisme dapat direstrukturisasi dan rekayasa metabolik yang luas memiliki implikasi utama dalam mikrobiologi industri. seperti virus bovine papiloma. Proses downstream juga memiliki masalah yang sedikit karena jamur tersebut tidak mensekresikan banyak protein mereka sendiri ke dalam media. Jamur lain dapat pula menjadi inang yang baik. khususnya methylotroph. enzim phytase sebagai umpan tambahan dan antitrombotic hirudin. Pada in vivo. 5 . Protein individiual dapat direkayasa dengan mengubah beberapa komponen asam amino untuk memodifikasi sifat dan memiliki peluang untuk fitur pembangun dalam membantuk proses downstream. Sebagai akibatnya. 2. Namun. memberikan kegiatan katabolik baru dan memperbaiki kinerja fermentasi. P. Ketidakstabilan dihasilkan dari penghapusan dan penyusunan ulang plasmid rekombinan. urutan lengkap dari genom mikroba. Ketidakstabilan segregasi dapat pula diatasi dengan membangun strain pembunuh yang membutuhkan penanda spesifik pada plasmid untuk bertahan hidup.Pembatasan Inang Eukariot Strategi lain yang lebih baik untuk mengekspresikan gen heterolog eukariotik sering mempergunakan inang eukariot yang sesuai yang akan menunjukkan semua kebutuhan modifikasi protein post-translasi dan sekresi. yang dimediasi oleh plasmid Ri. Strain tersebut dibangun dengan penanda “lethal” di kromosom dan repressor dari penanda ini terletak di plasmid. A. Strain ditransformasi oleh plasmid harus dipertahankan di bawah seleksi terus-menerus untuk memastikan bahwa stabilitas plasmid. tapi tidak seperti eukariot yang lebih tinggi tingkatannya (seperti sel hewan dan tumbuhan). Relatif kecil rekayasa genetika telah diimpelementasikan untuk memperbaiki produksi dari metabolit yang ada. relatif cepat laju pertumbuhannya dan mudah mengalami manipulasi genetik. Sebagai tambahan. kerjanya pada proses industri farmasi. Beberapa protein heterolog eukariotik telah sukses diproduksi secara massa dari S. tumefaciens menginduksi tumor yang melibatkan plasmid Ti dan A. Pichia angusta. sel bebas-plasmid mati dan tidak boleh diakumulasikan di kultur. Perkembangan teknologi rekombinasi DNA maju dengan cepat dan kloning gen pada sel hewan dan tumbuhan sekarang diproduksi secara rutin. rhizogenes. retroviruses dan virus simian 40 digunakan untuk stabil mentransformasi sel mamalia. Juga. tetapi jika kehilangan sel akan mengekspresikan gen mematikan. dan Pichia pastoris yang memiliki beberapa keuntungan dibanding S. Beberapa masalah dapat diatasi dengan menmbangun plasmid dengan hati-hati dan penempatan gen penting dalam plasmid. yang leibh baik sebagi struktural ketidakstabilan. jamur ini dengan mudah dan murah tumbuh pada skala industri. Saccharomyces cerevisiae banyak dipilih karena aman dan mengandung jumlah informasi luas yang telah terakumulasi dari genetikanya. Namun. disebut stabilitas segregasi. Rhizogenes menginduksi pembentukan rambut akar. Hal ini melibatkan penyimpanan dalam larutan nitrogen atau lyophilization. Angusta seringkali lebih baik untuk aplikasi industri karena memiliki versatilitas yang lebih baik. cerevisiae. Mereka memiliki promotor induksi yang kuat dan mampu untuk menghasilkan modifikasi protein post-translasion mirip dengan yang dilakukan oleh sel manusia. produk jamur relatif sedikit yaitu 1-5% dari total protein dan beberapa protein disimpan dalam periplasma.3 Stabilitas Strain Faktor utama dalam perkembangan strain baru adalah stabilitas strain. fisiologi. vektor berdasarkan virus. Awalnya. Namun. cerevisiae. contohnya dalam produksi heterolog dari jamur termasuk vasin hepatitis B. Sel mengekspresikan repressor selama mereka memiliki plasmid. Sebagai contoh. Transformasi dari sel tumbuhan dikotil dapat ditunjukkan menggunakan plasmid yang berasal dari bakteri tanah Agrobacterium tumefaciens and A. Aspek penting dari stabilitas strain adalah pemeliharaan dan penyimpanan stok kultur sehingga mereka atirbut mereka yang dengan hatihati dipilih tidak hilang. atau menghilangkan plasmid. termasuk organisme “food grade” menstimulasi kemajuan lebih jauh dalam rekayasa metabolik.

Adanya proses modifikasi dalam inang 4. (Old and Primrose. 1989) 3. (Budiyanto. Teza Nur F. virus mengalami daur litik. perakitan virus dalam jumlah besar. menggabungkan DNA virus ke DNA bakteri inang untuk membentuk calon virus baru dan ikut membelah bersama bakteri. virus tidak memecahkan dinding bakteri dan keluar dari bakteri. (Old and Primrose. penetrasi. Perlunya gen khusus seperti gen TRA untuk proses konjugas (Brown. virus hanya mengalami tiga tahap. tetapi virus ikut membelah bersama bakteri. 2010) 2. Tahap eklifase. yang mana? Apakah salah satu atau keduanya? . ada yang pecah pada saat proses konjugasi. Hal ini terjadi karena pada proses transduksi. Kondisi morfologi (kemampuan untuk membentuk rambut getar / fili) 5. pecahnya dinding bakteri inang sehingga virus-virus baru akan terbebas. Albertus Ardika (115061101111005) Dijawab : Alfonsina Pada proses transduksi. Dewi Ariesi R (115061105111007) 6 . mikroorganisme yang ditempati virus itu waktu virus keluar dari mikroorganisme tersebut hilang.Mikroorganisme (bakteri) yang ditempati sebagai media berkembang biak bagi virus akan mati. lisis.Yang menyebabkan pecah adalah kondisi virus yang berada di dalam mikroorganisme sudah “matang” sehingga virus siap keluar dengan cara memcah dinding dari bakteri inang (fase lisis). Homologi DNA bakteri yang bersangkutan 3. Pandu Rahmat Pinasthiko (115061107111001) Dijawab : Gregorius Bagas Pada saat di video transduksi. virus merusak dan mengendalikan DNA bakteri hospesnya. 1986) 4.Metode replikasi virus (reproduksi virus) untuk memperbanyak diri yang digunakan pada proses transduksi adalah daur litik. Tahap sintesis. Kontak antar sel bakteri 2. Tahap terakhir. virus akan menghancurkan dinding bakteri inang dan menyebabkan bakteri mati. Sedangkan pada daur lisogenik. Ayu Indah Wibowo (115061100111011) Dijawab : Gregorius Bagas Bagaimana bisa bakteri mengalami transformasi? Apakah terjadi pada kondisi yang khusus? Atau terjadi pada bakteri tertentu? .LAMPIRAN PERTANYAAN 1. metode apa yang digunakan virus untuk menginjeksi agar menjadi banyak jumlahnya? Setau saya. Apa yang menyebabkan pecah? . 1989) 5. Tahap kedua. Apakah memang mikroorganisme tersebut hilang dan menjadi apa waktu mikroorganisme tersebut hilang? Jelaskan! . yaitu penginfeksian virus ke bakteri inangnya. (115061102111001) Dijawab : Gregorius Bagas Pada video proses transduksi. stelah mencapai dinding dari mikroorganisme tersebut. Sehingga pada daur lisogenik ini. DNA virus masuk ke sel inang dan menghancurkan dinding sel bakteri menggunakan enzim lisosom. pembelahan virus ada lisis dan lisogenik.Transformasi terjadi karena : 1. Pada fase lisis. Tahap pertama adalah adsorpsi yaitu fase di mana virus menempel dan menginfeksi bagian tertentu dari dinding bakteri hospes.

DNA)) bertemu dengan bakteri resipien (bakteri tanpa faktor F (F-)) dan mendonorkan DNA bakteri pendonor melalui tonjolan sitoplasma. Transduksi terjadi saat virus mengalami fase litik (keluarnya virus dari tubuh bakteriofag). Strain yang stabil. DNA) yang memiliki tonjolan pada dinding tubuhnya yang berfungsi untuk menempel dan mendonorkan DNAnya ke tubuh bakteri resipien. (115061100111007) Dijawab : Adit Iqbal Apakah syarat menjadi bakteri pendonor? Jika ada. 2006) Dhanang (115061101111007) Dijawab : Adit Iqbal Dampak dari mutagenesis itu apa saja? Tolong dijelaskan? Mutia Dhana F. Bakteri yang dapat melakukan transformasi adalah bakteri sejenis yang memiliki potongan DNA yang sejenis pula. dkk. yaitu bakteri penerima DNA / bakteri yang tidak memiliki faktor F (F-). untuk membantu proses pernafasan. apa syarat-syarat tersebut? Pada slide stabilitas strain. (Schaum. Bisa saja. dirusak kesetimbangannya dengan masuknya virus ke strain sehingga virus dapat mengambil alih kerja DNA strain dan terjadi mutasi yang tidak diinginkan pada strain. fermentasi substrat padat juga banyak digunakan.1. 7 .- - 6. 9. hasilnya dapat diwariskan pada keturunannya. satu spesies bakteri dapat memiliki lebih dari satu kemampuan (transduksi. Media fermentasi harus memenuhi kebutuhan nutrisi mikroorganisme dan mendukung proses teknik perlakuan objek. - - 7. apa yang membuat nitrogen cair tersebut berfungsi untuk penyimpanan galur? Winda Fauzi Istiqomah (115061101111003) Dijawab : Alfonsina Kunci dari stabilitas strain adalah menjaga kesetimbangan strain tersebut. (Walyo. Bakteri pendonor adalah bakteri yang memiliki faktor F+ (bahan genetik. - Dijawab : Alfonsina Bakteri yang seperti apa yang dapat melakukan transduksi. 2. Transformasi terjadi saat bakteri dengan spesies sama. dan dilakukan oleh manusia. transformasi ataupun konjugasi) namun kemampuan tersebut tidak terjadi secara bersamaan. Salah satu contoh faktor pengganggu adalah virus. Pembentukan Media Pada umumnya fermentasi membutuhkan media cair. 1. hanya pada kondisi-kondisi tertentu seperti yang telah dijelaskan di jawaban point pertama. Meskipun demikian. (Schaum. yang satu memberikan potongan DNAnya ke bakteri yang lain. 8. 2006) Sharfina Widyaningrum (11506110511103) Dijawab : Alfonsina Kapan terjadi perpindahan secara konjugasi. 2005) 2. bisakah strain tersebut mengalami ketidakseimbangan? Mengapa? Strain dapat mengalami ketidaksetimbangan jika terdapat faktor pengganggu. 2005). Syarat untuk melakukan mutasi buatan adalah adanya perubahan materi genetik / DNA. transformasi. transformasi dan transduksi pada mikroba? Syarat apa saja untuk melakukan mutasi buatan? Konjugasi terjadi saat bakteri pendonor (bakteri yang memiliki faktor F+ (bahan genetik. Nutrisi mikroorganisme harus terbentuk/ terformulasikan untuk mendukung proses sintesis dalam membentuk produk yang diinginkan begitu juga biomassa sel dan metabolik tertentu (Waites. Bakteriofag adalah bakteri yang diinjeksi oleh virus. dan pendonor? Jelaskan spesifikasi bakteri untuk setiap kemampuannya tersebut! Apakah mungkin satu bakteri mengalami lebih dari satu kemampuan? Bakteri yang dapat melakukan transduksi adalah bakteriofag.

Mesonutrien dibutuhkan dalam jumlah yang lebih sedikit seperti Mg. Dalam fermentasi konvensional. 2006). Medium tersebut dapat berupa padat atau cair (Hidayat. umumnya dipakai bahan baku yang tidak mahal. daging. Cu. protein non-heme dan kofaktor pada beberapa enzim Penyusun vitamin B12 Seng.5 0. Medium kultur harus mengandung semua elemen yang dibutuhkan untuk pertumbuhan mikroba. dkk. S dan mikronutrien dibutuhkan dalam jumlah yang sangat sedikit seperti Fe. Unsur-unsur yang ada pada mikroba Unsur Fungsi fisiologi Hidrogen Oksigen Karbon Nitrogen Sulfur Fosfor Magnesium Mangan Kalsium Besi Penyusun senyawa organik Penyusun senyawa organik Penyusun senyawa organik Penyusunan protein. Zn dam Mo (hidayat. 2006) Umumnya yang disebut makronutrien adalah yang dibutuhkan dalam jumlah yang besar seperti C. 2006) Pada fermentasi antibiotika. membutuhkan jumlah air yang banyak dalam pembentukan media. sulfur dan unsur lain yang diperlukan dalam jumlah yang sangat sedikit 8 .1 0. dkk. Tabel 1. dkk. H. fosfolipid dan koenzim Kofaktor pada sejumlah reaksi enzim (ATP) Kofaktor pada beberapa enzim Kofaktor pada beberapa enzim (protease) Penyusun sitokrom. Dalam bidang industri yang diperlukan adalah medium yang cocok secara ekonomi. O dan N.03 Molybdeum (sumber: Hidayat. prosesing serat dan sebagainya. Kebutuhan media secara umum termasuk didalamnya adalah sumber karbon. kecuali keterlibatan substrat padat.Suatu strain yang mampu memberikan hasil yang tinggi dari produk yang diinginkan saat dikembangkan dalam laboratorium belum tentu memberikan hasil yang sama ketika diaplikasikan dalam skala industry.03 Tembaga. dan sumber nitrogen. 2006). bahan baku yang digunakan tidak boleh mahal. yang mana sebenarnya semua industri fermentasi menghasilkan energi dan unit karbon untuk biosintesis. misalnya biji-bijian.2 Kobalt 0. P. sumber fosfor. produk bernilai lebih mahal sehingga penggunaan substrat dapat dipilih yang lebih dominan agar dihasilkan produk yang lebih banyak. karena produk yang dihasilkan tidak mahal.5 0. 2005). Kebanyakan fermentasi. dalam proporsi yang serupa dengan dengan adanya sel pada mikroba (Waites. Penyusun beberapa enzim Berat kering (%) 8 20 50 14 1 3 0.dkk. Dalam perkembangan produk bioteknologi dibutuhkan medium yang mahal seperti untuk pertumbuhan sel mamalia dan tanaman (hidayat. 0. asam nukleat dan koenzim Penyusun protein dan beberapa koenzim Penyusun asam nukleat. dkk. Namun pada produksi steroid.

kecepatan pembentukannya. dkk. dan agent antibusa yang mungkin dibutuhkan. 2005). 6. 2. pencampuran. dimana sumber karbon dan nitrogen hampir tidak dapat ditegaskan dengan jelas. Meskipun demikian. Perlakuan ini dapat diangkat untuk memelihara konsentrasi zat (yang mengganggu pembentukan produk) sehingga relatif rendah agar tidak lagi bersifat menekan. Kesehatan dan keselamatan untuk semua.1. Fermentasi skala industri pada dasarnya menggunakan pembagian kompleks untuk mendapatkan harga ongkos yang efektif. Level dan range ketidakmurnian dan muncul dan berkembangan produk yang tidak diinginkan selama proses berlangsung. sempurnanya. 4. Sifat fisika dan kimia dalam medium yang terbentuk dapat mempengaruhi operasi sterilisasi. Biasanya. masalah potensial dapat timbul ketika menggunakan senyawa tertentu. Pada beberapa proses. Percobaan skala kecil. 2. Ongkos dan pendapatan. Misalnya. 2005). Bahan mentah substrat harus disesuaikan dengan ekonominya. dkk. seperti biotin dan riboflavin. 2005). namun juga membentuk inhibitor by produk (penghalang) yang dapat menjadi pengganggu pada proses downstream (waites. 3. misalnya fermentasi bir. 2005). Fermentasi aerobik tergantung pada oksigen yang berkelanjutan sedangkan fermentasi anaerob membutuhkan aerasi awal dari media. dan beberapa mikroorganisme membutuhkan penambahan vitamin. Pembentukan.1. Kebutuhan sterilisasi dan potensi masalah perubahan sifat. Fermentasi Media Cair 9 . Selain itu juga membutuhkan purifikasi pada downstream dan bisa juga meningkatkan biaya penanganan limbahnya. dan yield per gram substrat yang digunakan. dkk. juga harus tersedia. Konsentrasi produk target yang dicapai. sel tunggal dapat berkembang ke dalam pseudo-miycelium atau flocculate. Di dalam beberapa yeast.1. filament jamur dapat membentuk lempengan. namun jika tingkat ketidakmurnian dari substrat tinggi. dkk. media menggabungkan buffer atau pengontrol pH dengan penambahan asam ataupun basa. dilakukan penambahan medium segar secara berkala ataupun kontinyu. sumber nutrisi yang cocok dapat digabungkan kedalam media untuk memenuhi permintaan ini. 7. biasanya dipertunjukkan dengan setiap batch baru untuk substrat. begitu juga ongkos penyimpanan misalnya memerlukan pengontrolan suhu. bahan haruslah tidak mahal dan tidak perlu ditanya kualitasnya dan setiap tahun/ sepanjang tahun bahan tersebut dapat didapatkan. khususnya untuk menguji adanya tabrakan yield produk dan tahap pemulihan produk (Waites. Faktor utama yang mempengaruhi pilihan akhir bahan baku tersendiri yang diikuti/ digunakan (waites. Panas tidak hanya mengurangi komposisi spesifik/ tertentu. ini penting untuk diketahui. Hal mungkin tidak sebagai keinginan utama. pendahuluan. Nutrisi media tertentu atau kondisi lingkungan dapat mempengaruhi tidak hanya fisiologi dan biokimia tetapi juga morfologi dari mikroorganisme tersebut. Untuk menagani masalah ini. senyawa induksi atau inhibitor dikenalkan pada tingat/ taraf tertentu dari fermentasi (waites. Pengendaliannya mudah untuk bentuk padatan ataupun cairan. 5. Pengaruh variasi batch-to-batch harus ditentukan. Saat kebutuhan unsur mikroorganisme sudah ditetapkan. Medium yang mudah disterilkan dengan panas yang relatif rendah adalah yang sangat penting. sering juga menggunakan by produk dari industry lainnya dengan divariasikan komposisi variabel. mempercepat metabolism dapat menekan pembentukan produk. namun perubahan morfologi dapat mempengaruhi produk dan sifat fermentasi yang lain. pengompleksan sifat viskositas yang mungkin mempengaruhi pergerakan dan aerasi selama fermentasi dan proses tingkat downstream. maka tidak menutup kemungkinan akan membutuhkan ongkos lebih dan pemulihan yang kompleks. Kebanyakan didapat dari material alami seperti hewan dan tumbuhan.

perebusan dan pengukusan mematikan banyak mikroba competitor (Dharma. 1992). Fermentasi media (substrat) padat mempunyai kandungan nutrien per volume jauh lebih pekat sehingga hasil per volume dapat lebih besar. 4. 2. Fermentasi cair dengan teknik tradisional tidak dilakukan pengadukan. Fermentasi yang diagitasi dimana zat yang tak larut dalam air tersuspensi dalam fasa cair. dan tape (Dharma. difusi oksigen. Jenis fermentasi ini dikerjakan dalam suatu labu atau gelas yang cocok atau yang lebih modern dengan menggunakan fermentor dimana substratnya larut sempurna dalam air. 1. Jenis fermentasi ini dan mekanisme pengambilan substrat dengan yang kedua kecuali substrat bersifat cair. 3. organisme.0 cm untuk produksi yang sangat tinggi. pengatur suhu (pendingin atau pemanasan) dan pengaturan pH. 2. yogurt dan kefir (Dharma. Fermentasi cair meliputi minuman anggur dan alkohol. Kisaran kadar air yang optimal adalah 50-75%. Fermentasi yang diagitasi dimana zat cair yang tak larut dalam air tersuspensi dalam fase cair. fermentasi asam cuka. Medium didistribusikan berupa larutan yang dangkal dalam suatu baki atau dalam suatu wadah yang mempunyai permukaan yang luas dan dalamnya media biasanya 2. Proses fermentasi cair modern dapat dikontrol lebih baik dan hasil uniform dan dapat diprediksi. agitasi dilakukan dengan bantuan alat pengocok (shaker). kecap. tetapi meningkatkan resiko kontaminasi dengan bakteri.2. volume gas. Fermentasi media padat Fermentasi media padat merupakan proses fermentasi yang berlangsung dalam substrat tidak terlarut. Konsentrasi substrat dalam media dapat bervariasi mulai dari satu persen sampai pada suatu keadaan yang menyerupai bubur. Fermentasi media cair diartikan sebagai fermentasi yang melibatkan air sebagai fase kontinyu dari sistem pertumbuhan sel yang bersangkutan atau substrat baik sumber karbon maupun mineral terlarut atau tersuspensi sebagai partikel-partikel dalam fase cair. 1992). pertukaran gas. Jenis-jenis fermentasi media cair yang dapat dilakukan adalah sebagai berikut: (Dharma. namun mengandung air yang cukup sekalipun tidak mengalir bebas. Pada fermentasi ini substrat larut dalam air tetapi medianya tidak diagitasi atau dikocok. Temperatur: temperatur berpengaruh pada laju reaksi biokimia selama proses fermentasi Pertukaran gas: pertukaran gas antara fase gas dengan substrat padat mempengaruhi proses fermentasi. dan tipe produk akhir. namun pemanasan. Pada fermentasi ini substrat zat padat tidak larut dalam air tetapi dalam bubuk-bubuk halus yang tersuspensi dalam sejumlah air yang banyak. 2. aerasi. 3. Produk dari fermentasi media padat misalnya oncom. 1992).1. Adapun faktor yang mempengaruhi fermentasi media padat diantaranya: (Dharma.5 – 5. Pengambilan substrat oleh mikriba biasanya disertai dengan produksi suatu faktor yang dapat melarutkan yang mungkin sifatnya ekstraseluler atau terletak didalam dinding dalam air sehingga partikel substrat tersipresi secara merata dalam medium yang mengandung air agar terjadi kontak dengan mikroba secara maksimum. 1992) Fermentasi yang diagitasi dimana substratnya larut dalam air. berbeda dengan fermentasi teknik fermentasi cair modern melibatkan fermentor yang dilengkapi dengan: pengaduk agar medium tetap homogen. Juga tidak dilakukan sterilisasi. Pada kultur labu yang dikocok. Pada fermentor agitasi dikerjakan dengan pengaduk yang dijalankan oleh motor dan dapat dibantu oleh aerasi (gelembung udara). Kadar air yang tinggi akan mengakibatkan penurunan porositas. . Garam dan zat hara lain mungkin terlarut dalam air.1. Pengambilan substrat melalui fase cair. Fermentasi substrat padat dengan kapang mempunyai keuntungan yaitu: (Dharma. Fermenatasi yang tidak diagitasi dimana substratnya larut dalam fasa cair. 1992) Medium yang digunakan relative sederhana 10 1. Pengambilan substrat oleh mikroba melalui fase larutan dalam air. 1992) Kadar air: kadar optimum tergantung pada substrat.

52 Phicia angusta 0. Meskipun demikian. dan pemeliharaan sel. karena air yang digunakan sedikit. 4.36 Penicillium chrysogenum 0.2. Kebutuhan karbon dapat ditentukan dari koefisien hasil biomasa (Y) maka: (waites. Jenis/ variasi organisme juga dapat menujukkan perbedaan koefisien yield (Y) pada substrat yang sama. Selain itu juga untuk biosintesa. 5. sekitar 50% berat mikroba adalah karbon. Konsentrasi nitrogen bervariasi dari 3-15 %. sehingga Y dapat ditentukan. Berdasarkan berat mikroba.68 Escherchia coli 0.07 Saccharomyces cereviceae 0. 2006). nilai yang didapatkan dapat menceritakan pada kondisi yang spesifik dengan memvariasi pH dan temperatur.63 Pertombuhan anaerob Moorella thermacetica 0. Tabel 2.2.11 Escherchia coli 0.54 1.43 Pseudomonas species 0. Sumber Karbon Dengan mengecualikan alga dan bakteri autotrof yang menggunakan karbondioksida sebagai sumber karbon. Karbon merupakan unsure yang paling penting. dkk.56 0. 3. Dengan memvariasi konsentrasi awal dari substrat pembatas pertumbuhan yang kemudian diplotkan dengan total pertumbuhan pada konsentrasi disetiap batch.12 Saccharomyces cereviceae 0.12 (Sumber: Waites. Oleh karena itu karbon merupakan bahan yang paling besar dalam medium kultur (hidayat. Setiap nutrient dapat dihitung melalui rangkaian perlakuan pada percobaan batch-culture dimana substrat yang spesifik hanya menjadi media pembatas pertumbuhan dan nutrient yang lain sebagai excess. 2005) - 11 . Pertumbuhan yield (Ycarbon) pada medium minimum dengan variasi sumber karbon dan energy Yglucosa Yethanol Ymethanol Yoktana Pertumbuhan aerob Aspergilus nidulans 0. Aerasi dihasilkan dengan mudah karena ada ruang udara diantara tiap partikel substrat. mikroba yang digunakan dalam industri membutuhkan senyawa organik sebagai sumber karbon dan energi.43 Pseudomonas aeruginosa 0.61 Candida utilis 0.13 Klebsiella pneumonia 0. yang dapat merubah nilai Y. Produk yang dihasilkan dapat dipanen dengan mudah. pembentukan produk. 2005) Ycarbon (g/g) = Pada fermentasi komersial perhitungan koefisien yield untuk semua nutrisi biasanya menjadi dasar. dkk. 6. Inokulum dapat disiapkan secara sederhana. 2. Ruang yang diperlukan untuk peralatan fermentasi relative kecil. dkk.51 0. Kondisi medium tempat pertumbuhan fungi mendekati kondisi habitat alaminya.

Perbedaan dapat juga tetrjadi pada satu individu misalnya Saccharomyces cereviceae tumbuh pada glukosa yang menpunyai koefisien biomasa (Y) 0. misalnya Rhizopus dan Sordaria. dkk. dkk. ceriviciae. karena mikroba tersebut tidak menggunakan banyak substrat untuk memperoleh energi. Misalnya S. Jadi metabolism aerob menghasilkan (36+2)/2 = 19 kali lebih tinggi dari pada ATP secara anaerob. Kebanyakan kapang tidak dapat tumbuh pada gula alcohol.1. Tiga molekul ATP diperoleh dari tiap pasang electron yang dipindah dari NADH ke oksigen. Beberapa jasad dapat menggunakan lebih dari satu sumber karbon. Kebanyakan kapang menggunakan glukosa sebagai sumber karbonnya. 2005). 2006). Pada sumber karbon lain tidak dapat tumbuh dengan baik. mikroba aerob mengubah substrat karbon dalam jumlah lebih besar (±50 %) menjadi biomassa dibanding mikroba anaerob. Senyawa karbon yang digunakan dapat berasal dari senyawa C2 sederhana (asam asetat. Molase 12 . Jadi selama glikolisis. dkk. Kapang tertentu tidak dapat menggunakan sukrosa. 2. Industri fermentasi dapat memilih antara beberapa bahan utama. Sebagian besar mikroba dapat menggunakan berbagai tipe nutrisi yang telah diketahui. Ada pula mikroba yang hanya dapat menggunakan substrat terbatas. 2006) Gula murni seperti glukosa dan sukrosa umumnya mahal bila digunakan dalam industri dan biasanya dicari sumber karbon yang murah. Biomassa ini diasumsikan mengandung 50 % karbon dan mikrobia mampu mengubah 50% karbon pada substrat menjadi karbon pada substrat menjadi biomassa secara aerob. 2006). Sebagai contoh adalah Methylomonas dan Methylococcus yang hanya menggunakan metana dan methanol sebagai sumber karbon dan energi (waites. dkk. dkk. fluktuasi pasar dalam menggunakan surplus (hidayat. Jumlah molekul ATP yang dibentuk dari sumber karbon dan energi dalam medium dapat dihitung berdasarkan berat kering yang diperoleh sebagai fungsi ATP yang dihasilkan selama katabolisme sumber energi (hidayat. Hal yang menarik adalah penggunaan limbah pertanian atau industri. protein) dan senyawa aromatik. Pertumbuhan yang terjadi disebut pertumbuhan diauksi. 2. Fosforilasi substrat Oksidasi substrtat adalah hilangnya electron disertai oleh sintesis fosfat kaya energy yang akan dipindah lewat ADP dengan membentuk ATP. tergantung harga. sehingga medium harus mengandung: 40 x (100/50) x (50/100) = 40 g karbon/L Jika sumber karbon adalah glukosa maka jumlah yang harus ditambahkan dalam medium: (40 x 180)/72 = 100 g glukosa/L (hidayat. mikroba mendapatkan dua molekul ATP dari tiap molekul glukosa. Energi diperoleh terutama melalui 2 jalan: (hidayat. Secara umum. Jika 12 pasang electron dapat digunakan dari tiap molekul glukosa yang dimetabolisme melalui glikolisis pada siklus kreb maka akan diperoleh 36 molekul ATP. 2006) 1.12 g/g pada kondisi aerob dan anaerob (waites. etanol) sampai senyawa kompleks (polisakarida.56 dan 0. Ini memungkinkan untuk menghitung jumlah minimum substrat karbon yang dibutuhkan dalam medium untuk memperoleh biomassa. 2006). laktosa didegradasi menjadi glukosa dan galaktosa. Fosforilasi oksidatif Dalam kasus ini energi diubah selama pemindahan electron dalam rantai respirasi. Sebagai contoh penelitian mula-mula menggunakan medium yang mengandung substrat berlebihan dan ini memungkinkan diperoleh berat kering sel bakteri maksimum perliter (misalnya 40 g). seperti manitol (hidayat. dkk.2. 2005). dkk.

Lagi pula. yang mana mungkin atau tidak mengalami metabolism. fosfor dan sulfur. dan 10 % maltotriosa sebuah trisakarida. Ekstrak gandum Ekstrak cair dari gandum dapat dibentuk seperti sirup yang secara khusus digunakan untuk sumber karbon yang biasanya untuk pembentukan filament pada jamur. dkk. asam amino dan protein dengan kelompok karbonil dari penurunan gula. Muncullah produk kondensat berwarna coklat hasil dari reaksi kelompok amino dari amin. 2005). dkk. 2006). Komposisi molase dapat dilihat pada tabel 3.2. 13 . dkk. Sebaliknya karbohidrat dalam molase siap untuk difermentasi tanpa perlakuan pendahuluan karena berbentuk gula (hidayat. 2006) 2. dkk. Persiapan ekstrak pada dasarnya sama dengan pemasakan bir. Unsur yang menurukan gula dan asam amino cenderung menghasilkan produk reaksi maillard ketika dipanaskan pada pH yang rendah. Pati Polisakarida ini tidak siap untuk digunakan seperti monoskarida dan disakarida.3. Bahan ini mengandung karbohidrat yang disimpan sebagai pati sehingga harus mengalami perlakuan awal dengan memasaknya dan membutuhkan kerja enzim untuk menghidrolisis pati menjadi gula yang dapat difermentasi. Kandungan nitrogen organik sedikit. Molase adalah limbah industri gula yang tentunya lebih murah. Sterilisasi media yang mengandung ekstrak gandum harus dikontrol dengan hati-hati untuk mencegah pemanasan berlebih. dikarenakan faktor biaya (waites. dkk. 55% disakarida (umumnya maltose dan sedikit sukrosa). asam pantotenat.- Glukosa dan sukrosa murni jarang digunakan dalam fermentasi skala industri. Komposisi dari ekstrak gandum biasanya mengandung 90% karbohidrat dalam basis kering.1-1 (sumber: Hidayat. ragi dan actinomycetes. Mengandung 62% gula yang terdiri dari sukrosa 32%. keton dan aldehid. Dimana terdiri dari 20 % heksosa (glukosa dan sedikit fruktosa). produksi ini mengandung dekstrin bercabang dan tidak bercabang (15-20%). dkk. sterol dan fosfolipid 0. Tabel 3. khususnya pembentukan filament jamur. glukosa 14% dan fruktosa 16% (hidayat. maltosa atau maltotriosa (waites. 2005). 2005).2. Tidak hanya karena warnanya yang berubah tetapi juga hasil hilangnya materi yang menyebabkan fermentasi dan produk beberapa reaksi yang menghalangi pertumbuhan mikroorganisme (waites. tiamin. Molase berbeda dengan bahan baku yang umum digunakan dalam produksi alkohol seperti jagung dan kentang. Ekstrak gandum juga mengandung beberapa vitamin dan kira-kira 5% substansi nitrogen. 2. enzim ekstra seluler menghidrolisis substansi yang merupakan campuran dari glukosa. namun dapat secara langsung mengalami metabolism dengan produksi amylase oleh miroorganisme. Komposisi molase Komponen Persentase Air 17-25 Sukrosa 30-40 Dektrosa 4-9 Fruktosa 5-12 Gula reduksi lain 1-5 Karbohidrat lain 2-5 Abu 7-15 Senyawa nitrogen 2-6 Asam-asam non nitrogen 2-8 Lilin.2. dkk. protein. 2006). tergantung pada mikroorganismenya. Molase tebu kaya akan biotin. 2005). peptide dan asam amino (waites.

Untuk diperbolekannya dalam fermentasi. namun ini dapat juga didapatkan dari cereal yang lain atau potongan akar. terjadi proses kontinyu (proses symba) dikembangkan di Swedia untuk produksi biomassa menggunakan khamir Endomycopsis fibulinger untuk menghidrolisis pati menjadi gula yang dapat difermentasi. hutan. sedangkan gymnospermae menghasilkan liquor yang mengandung gula 2% dengan 75%-nya adalah heksosa (terutama manosa). ini sama sulitnya dengan menghidrolisis. lapisan lignin dan memberikan area sempit untuk enzim menyerang. 2005). Asam sulfat dengan konsentrasi 0. dkk. pati biasanya dikonversi menjadi sirup gula. 2005). tetapi penggunaan mikroba selulolitik memungkinkan diperolehnya protein mikroba secara langsung dari limbah selulosa tanpa perlakuan. Gambar 1. Hidrolisis asam pada pada selulosa kayu itu sendiri memberikan 65-85% gula yang dapat difermentasi. Ini pertama-tama berubah menjadi agar-agar kemudian dihidrolisis dengan mengencerkan asam atau enzim amilolitik (waites. Ada 2 cara pretreatment yang biasa digunakan 14 . komposisi SWL tergantung kayu yang digunakan.4. Ini umumnya digunakan pada fermentasi substrat padat untuk memproduksi jamur yang bervariasi. Angiospermae memberikan Sulphite Liquor yang mengandung 3% gula yang 70 %-nya adalah pentosa (terutama silosa). Walaupun demikian ini dapat berpotensi tinggi yaitu sebagai sumber yang dapat diperbarui dari fermentasi gula saat dihidrolisis khususnya pada biokonversi menjadi etanol (waites. Sedikit mikroorganisme yang dapat langsung digunakan. Candida utilis akan menggunakan gula ini untuk pertumbuhannya (hidayat. limbah industri maupun domestik. Komponen dari selulosa adalah bagian kristalin. Setelah dihidrolisis meggunakan enzim tanaman atau amylase mikroba. proses perombakan atau pemecahan ikatan pada selulosa adalah proses hidrolisis enzimatik pada lignoselulosa (Mooney et al. Lignoselulosa tersedia dari pertanian.Pati jagung adalah yang paling banyak dipakai. dkk. dkk. yang mengandung paling banyak glukosa.5. Struktur lignoselulosa dan pre-treatmen (sumber: Anonymous. 2. Dalam proses kontinyu kemungkinan didapat dari sirup bubuk gergaji yang mengandung 4-5% gula pereduksi (campuran glukosa dan pentosa) dengan hasil 45-55% (hidayat. 1998). selulosa Selulosa paling dominan ditemukan sebagai lignoselulosa dalam dinding sel tumbuhan. Sulphite Waste Liquor Sulphite Waste Liquor (SWL) dari industri kertas mengandung gula dari hidrolisis hemiselulosa dalam kayu.4. dkk. hemiselulosa dan lignin. Selulosa biasanya dihidrolisis sebelum dapat digunakan sebagai substrat. yang mana terbentuk dari 3 polimer yaitu: selulosa. 2006). Berikut merupakan gambar lignoselulosa. 2011) Dalam dunia industri.5% biasanya digunakan pada 150o-185oC. Jamur berfilamen (Tricoderma viridae) dan bakteri (cellulomonas sp) merupakan mikroba yang sering digunakan. 2006). Beberapa hidrolisis asam dikembangkan selama perang dunia ke II.2. 2.

Oleh karena itu laktosa pekat sering disiapkan untuk fermentasi selanjutnya dari penguapan whey disertai dengan pemindahan protein susu yang digunakan sebagai misalnya. cerevisiae contohnya. bahan diperkaya dengan isoparafin.untuk menghilangkan lignin yaitu dengan delignifikasi oksidatif dan proses organosolv (Sun and Cheng.4.6. suplemen makanan. Setelah tumbuh pada fraksi minyak petroleum. protein sel tunggal. Bacillus. S. Sejumlah khamir. tidak memfermentasi laktosa. 2. Calcoaceticus).4. yaitu sebagai protein sel tunggal (PST). Sepanjang tahun produksi whey di dunia lebih dari 80 juta ton. Candida lipolytica hanya memetabolisme normal parafin. 2006) - Jumlah (g/ L) 45-50 7-9 1. Smegmatis). dkk. sedangkan pada proses organosolv lignin dalam bentuk cairan organic dapat didegradasi dengan menggunakan katalis inorganic seperti asam sulfat H2SO4 atau HCl (Aziz and Sarkanen. dkk. Disakarida ini secara pembentukannya digunakan dalam fermentasi penicillin dan ini juga dapat digunakan dalam fermentasi alcohol.2 juta ton protein susu. Whey Whey adalah by produk cair dari suatu indutri harian (industri keju). lipolytica secara ekonomis memberikan hasil yang baik (hidayat. Hidrokarbon sangat sesuai sebagai sumber karbon dan energi untuk pertumbuhan mikroba. Cladosporium resinae mengasimilasi bahan bakar minyak dan menyebabkan korosi pada tanki bahan bakar. seperti untuk terjadinya metabolism hanya sedikit mikroornaisme yang dapat melakukannya. Micobacterium (M. Nocardia. dkk.5 1-2 6-8 63-70 2. Komposisi Whey susu (g/L) Komponen Laktosa Protein Senyawa nitrogen terlarut Lipid Garam-garam mineral Berat kering (sumber : Hidayat. dan dari famili Enterobacteriaceae. Strain dari genus Pseudomonas. Merupakan hasil samping keju yang merupakan protein yang sulit menggumpal seperti kasein pada keju. alkana dan alcohol Minyak (fraksi kasar minyak petroleum) mengandung C10-C18 10-25% hidrokarbon parafin yang sangat mudah digunakan mikrobia. dkk. Laktosa pada umumnya kurang berguna sebagai umpan awal pada fermentasi dibandingkan sukrosa. Bahan ini cukup mahal untuk dijual. 15 .7. dkk. Hidrokarbon mempunyai rumus CnH2n+2 dapat berbentuk lurus ataupun rantai bercabang (iso) yang sukar didegradasi oleh semua mikroba. 2006) Tabel 4. Ini untuk proses penyempurnaan (hidayat. 1989). mengandung lebih dari 1 juta ton laktosadan 0. 2006). Spesies dari genus Candida seperti C. corynebacterium. 1989). sering digunakan untuk pakan babi (Hidayat. vitamuin B12 dan asam giberelik (waites. Pada proses delignifikasi oksidasi ini lignin dapat didegradasi dengan menggunakan katallis enzim peroksida H2O2 (Azzam. Crypococcaceae mampu menggunakan hidrokarbon. Sejumlah bakteri mampu tumbuh pada hidrokarbon. Dalam fraksi petroleum seperti bahan bakar mungkin mengandung hidrokarbon lain (parafin siklik atau aromatis) yang biasanya kurang tersedia untuk dimetabolisme. 2002). 2005). Acinetobacter (A. Isoparafin mempunyai sifat yang mirip dengan bahan bakar. Whey susu diperoleh dari limbah pembuatan keju dengan komposisi seperti tabel 4. asam laktat. 2006). Beberapa bakteri dapat mengasimilasi normal parafin (n-alkana) dan normal olefin (n-alkena).

Lemak dan minyak 16 . dkk. dkk.2 C5H9NO4 + 5.45 O2 + NH3  3. dkk. 1. vitamin. Meskipun hanya sedikit mikroorganisme yang dapat merombaknya. sedang alkana C11 dan C18 adalah yang paling banyak diasimilasi. dan sikloheksana).1 H2O (hasilnya adalah 320 % atau 208 % berdasarkan berat secara molekuler tetapi dengan kebutuhan oksigen 4 kali lebih besar) Dalam produksi asam glutamate. Beberapa perusahaan menggunakan methanol dan produksi protein mikroba pada tahun 1970an dan awal 1980an. 2005). Hidrokarbon alifatik bukanlah satusatunya yang dapat digunakan untuk metabolisme. Sejumlah hidrokarbon siklik komersia dapat pula digunakan ( benzene. Heksadekana C16H35 + 8. termasuk di dalamnya sebagian besar antibiotik dan produk-produk fermentasi anaerob.1 O2 + NH3  1.2. namun konversi produk metanol lebih disukai untuk industri fermentasi dengan masalah teknis yang cukup sedikit. Kemungkinan pembentukan biomasssa: (hidayat. dan oktana sebagai sumber karbon dan energi. tetapi ini akan lebih bermasalah ketika berkembang pada alkana. biotransformasi ke asam asetat dengan menggunakan bakteri sisa fermentasi utama (waites. Oksigen yang dibutuhkan 3 kali lipat dan panas yang dihasilkan 3. Sejumlah produk (asam lemak. 2005) Etanol lebih rendah sifat toksiknya dibandungkan methanol dan digunakan satu-satunya oleh banyak mikroorganisme. dkk. dan pigmen karatenoid) dapat diperoleh dari hidrokarbon sama baiknya dengan sumber karbon konvensional seperi karbohidrat. asam laktat. Jadi kultur Methylomonas methanica mengoksidasi propane menghasilkan campuran asam propionate dan aceton (hidayat. 2006). heksadekana digunakan untuk menggantikan glukosa. Pencampuran. Namun ini akan terlalu mahal jika dipakai sebagai sumber karbon umum. Sebagai contohnya adalah pembentukan biomassa (komposisi global C5H9NO4). Namun banyak senyawa. Kemungkinan alkana dengan berat molekul rendah adalah racun. Beberapa strain Pseudomonas dapat tumbuh pada heksana. senyawa tunggal biasaya yang banyak cocok untuk fermentasi mikoba. Penggunaan hidrokarbon membutuhkan oksigen lebih banyak daripada karbohidrat. Methanol mempunyai persentase karbon yang cukup besar dan relatif murah. dengan 1 atau lebih kemungkinan jalan melalui oksigenasi. Metabolism hidrokarbon harus melalui pembukaan cincin. Selama fermentasi methanol. karena mampu larut dalam lemak sehingga mampu merusak fosfolipid pada membrane sel. asam amino. Walaupun demikian. Glukosa C6H12O6 + 2. Oksigen dapat bereaksi dengan C1 dan C2. tidak dapat dihasilkan oleh hidrokarbon tersebut. industr menggunakan tergantung pada harga petroleum yang berlaku. dkk. Metana digunakan sebagai sumber karbon pada sebagian kecil mikroorganisme.35 kkal/ g asam glutamate yang dibentuk heksadekana sebanding dengan 2 kali denagn 2.98% berdasarkan berat secara molekuler) 2. Katabolisme normal parafin terjadi melalui oksigenase. 2006) 1.4 H2O (Hasilnya adalah 120 % . 2006). Cincin aromatik pertama mengalami hidrosilasi kemudian dihidrogenasi menjadi senyawa dihidroksi yang terbuka.Khamir tidak mengasimilasi alkana yang lebih pendek dari C9. heptana.2 C5H9NO4 + 4. biomassa optimum yang diperoleh pada C16-C20.73 kkal/g dari glukosa). Kemurnian methanol siap didapatkan dan ini sangat larut dalam air. Sejumlah produk fermentasi dapat diperoleh dari hidrokarbon. n-alkana dari panjang ikatan C10-C20 dapat dimetobolisasikan oleh mikroorganisme tertentu. Hidrokarbin siklik dan paraffin rantai pendek biasanya bersifat racun pada konsentrasi tinggi sehingga yang dikembangkan adalah membuatnya pada konsentrasi rendah (hidayat. Walaupun demikian. toluene.8.5 kali (10. kebutuhan oksigen dan panas fermentasinya tinggi. namun proses ini tidak ekonomis (waites. styerene naphtalena.

Minyak nabati umumnya terbuat dari biji kapas. seperti yang telah dijelaskan pada makalah ini yaitu bakteri saccaromyces. whey ini merupakan protein yang sukar menggumpal. Bakteri saccaromyces dapat mengalami metabolism dalam dua keadaan. dan asam stearat. nah oleh karena itu. Karbohidrat menempati volume yang paling besar. Namun jika fermentasi ini dilanjutkan dengan keadaan aerob maka fermentasi alkohol oleh bakteri saccaromyces menghasilkan asam cuka. Pertanyaan 3 (Ridhani Rida) Bagaimana proses fermentasi pada bakteri yang mempunyai 2 keadaan yang berbeda. dengan kapasitas cadangan dibutuhkan utuk memuat penambahan ke sumber karbon (waites. Minyak nabati dan minyak ikan biasanya digunakan sebagai sumber karbon primer atau suplementer. palm. maka keberadaan bakteri tersebut merupakan salah satu bentuk kontaminasi. Jawab: Maksud kontaminasi bakteri pada kasus ini adalah kontaminasi oleh bakteri lain. dkk. untuk membuat keju. pada fermentasi alkohol dari glukosa. Pertanyaan 4 (Febrika Larasati) 17 . Apa bakteri lain dapat hidup di dalam media tersebut (glukosa)? Jawabannya adalah iya. LAMPIRAN Pertanyaan 1 (Nanang Adi) Mengapa kontaminasi media fermentasi perlu dimasalahkan? Padahal kita mengetahui bahwa fermentasi pada dasarnya juga menggunakan bakteri. khususnya produksi antibiotic. berbeda dengan protein pada keju (kasein) yang mudah menggumpal. Namun seiring berkembangnya ilmu pengetahuan. hanya ada bakteri yang mendukung proses pembentukan produknya. jagung. jarang digunakan dalam fermentasi. dimana ada sumber karbon. Dimana seperti yang kita ketahui bahwa jika produksi keju meningkat. maka bakteri yang hanya (harus) hidup hanyalah bakteri saccaromyces cerreviceae. oleh karena itu. buah zaitun. Karbohidrat biasanya disiapkan pada larutan encer dengan konsentrasi tidak lebih dari 50% (w/w). whey ini dapat membentuk emulsi. Pertanyaan 2 (Lilis Triyowati) Mengapa whey itu harganya mahal? Padahal whey merupakan hasil produk sampingan pembuatan keju. Misalnya.Lemak kasar hewani yang kebanyakan tersusun atas gliserida. Minyak mengandung energi lebih per unit berat dibanding karbohidrat. yaitu anaerob dan aerob? Yang tentunya dari pengertiannya saja berbeda dari sumber kebutuhan oksigennya? Jawab: Memang. dan kedelai. Nah ternyata. terdapat bakteri tertentu yang dapat mengalami proses fernentasi dalam keadaan aerob ataupun anaerob. Bakteri saccaromyces dapat memproduksi alkohol jika kondisi pada keadaan anaerob. maka orang lama-kelamaan mengetahui bahwa sesungguhnya whey ternyata masih bisa digunakan sebagai bahan baku. yang mana menurut kandungannya yang ternyata didalamnya masih mengandung nutrisi penting. otomatis produksi whey juga meningkat? Lalu apa contoh penggunaan whey? Jawab: Memang dulu whey itu harganya murah. contohnya dapat diaplikasikan pada pembuatan eskrim. maka bakteri juga akan bertumbuh dan berkembang didalamnya. 2005). Hanya saja. maka dalam proses fermentasi. Jika dalam medium fermentasi terdapat bakteri lain yang tidak ikut andil dalam pembentukan produk. Minyak nabati kebanyakan tersusun atas asam oleic dan asam linoleic. minyak dapat berguna secara khusus dalam operasi fed-batch.

Mengapa? Karena kita memberikan bakteri itu sudah dalam bentuk kering. Merupakan suatu bakteri saccaromyces yang sudah dalam bentuk kering. tidak seperti kasein yang terdapat pada keju. bukan pada kejunya. 18 . 2002).Pada sumber energi untuk fermentasi yang berupa selulosa dikatakan bahwa perlu dilakukukan proses pretreatment terlebuh dahulu. Ada 2 cara pretreatment yang biasa digunakan untuk menghilangkan lignin yaitu dengan delignifikasi oksidatif dan proses organosolv (Sun and Cheng. bakteri wajib dikeringkan dahulu? Jawab: Jawabanya iya. Ini disebut dengan medium semi padat. Jadi untuk menghitung kebutuhan karbon yang menyertakan massa dari ragi tersebut. Jika susu tidak difermentasi dengan bakteri (lactobacillus casei) untuk pembuatan keju. Nah untuk menghitung karbon yang memakai perhitungan mikroba dalam keadaan kering. apa dalam kebutuhan karbon. tidaklah perlu dikhawatirkan. kita tidak perlu untuk mengeringkannya terlebih dahulu. karena jika kita menghitungnya tidak dalam keadaan bakteri kering.A Torimtubun) Apakah bisa suatu mikroba ditempatkan pada 2 media yang digabung menjadi 1 misalnya media cair (molasses atau yang lain) dicampur dengan media padat (pati atau yang lain) agar mendapat sumber karbon yang banyak? jika bisa. sebenarnya hal ini bergantung juga dengan produk apa yang ingin kita capai. 1989). Pertanyaan 8 (Gregorius Bagas) Tadi dijelaskan bahwa nilai Whey cukup mahal. 1989). ragi tape. maka tentunya. Pertanyaan 5 (Dianita Citra Dewi) 1). 1998). bagaimana caranya whey yang sebagai produk sampingan diubah menjadi produk utama? Agar industri berkonsentrasi pada wheynya. maka yang bersifat membasahinya merupakan suatu media (air). Pertanyaan 6 (Dian Nita) Dari sumber karbon yang sudah dijelaskan. Pada proses delignifikasi oksidasi ini lignin dapat didegradasi dengan menggunakan katallis enzim peroksida H2O2 (Azzam. proses perombakan atau pemecahan ikatan pada selulosa adalah proses hidrolisis enzimatik pada lignoselulosa (Mooney et al. bahwa whey merupakan hasil samping dari pembuatan keju. sedangkan pada proses organosolv lignin dalam bentuk cairan organic dapat didegradasi dengan menggunakan katalis inorganic seperti asam sulfat H2SO4 atau HCl (Aziz and Sarkanen. karena protein pada whey merupakan protein yang sulit untuk digumpalkan. mengapa? Jawab: Untuk pencampuran 2 medium dengan fase yang berbeda dapat dilakukan misalnya pada pembuatan asam sitrat dari ampas singkong dimana media tersebut dicampur dengan media cair (air). Misalnya. Untuk membuat suatu medium kan kebutuhan karbonnya dihitung. mengapa? jika Tidak. dapatkah dari berbagai sumber misalnya Whey + molase + pati dicampur? Jelaskan! Jawab: Untuk campuran dari berbagai sumber. bagaimana proses pre-treatment tersebut? Dan siapa yang melakukan proses tersebut? Jawab: Dalam dunia industri. Pertanyaan 7 (Alfonsina A. Seperti industri etanol di brazil yang konsentrasi pada ethanol bukan gula (tebu)? Jawab: Seperti yang telah dijelaskan pada makalah ini. dapat langsung dihitung (dengan kita mengetahui massa ragi itu sendiri). bakteri yang basah tidak bisa dikatakan bahwa ia adalah pure bakteri.

Pertanyaan 9 (adit Iqbal I) Pada selulosa bagaimana cara memisah sel pada ikatannya? Jawab: Untuk memisah/ memecah ikatan pada selulosa adalah dengan cara hidrolisis enzimatik. Bakteri dari kelompok ini memiliki cirri hidup dalam kondisi lingkungan yang cukup ekstrim. Semua sel diisi dengan matriks cairan dan dikelilingi oleh membran sitoplasma.maka whey pun tidak dapat diproduksi. Banyak diantaranya yang merupakan uniseluler dan lainnya berupa multiseluler. 2008) a. Namun seiring berkembangan ilmu pengetahuan. Sel dibagi menjadi dua kategori: Archaebacteria dan Eubacteria yang merupakan sel prokariotik. Pertanyaan 11 (Freshsya Zatalini) Dapatkah Anda memberikan contoh produk fermentasi yang menggunakan media molase? Jawab: Salah satu produk fermentasi molasses adalah etanol. yang memungkinkan spesialisasi sel. sedangkan sel-sel jamur. eskrim. Archaebacteria Archaebacteria merupakan kelompok bakteri yang pertama muncul di Bumi. Spesies metanogen lainnya hidup di lingkungan anaerobik di dalam perut hewan. protozoa. Metanogen merupakan Archaebacteria yang tergolong anaerob strict (tidak dapat mentolerir keberadaan oksigen). Karena pembentukan whey juga tergentung pada pembentukan keju (karena whey merupakan hasil samping keju). Pada dasarnya molasses masih mengandung gugus gula. dkk. ORGANISME PROKARIOTIK Organisme prokariotik telah dipisahkan menjadi dua kelompok yang berbeda atas dasar studi filogenetik (evolusi) hubungan. diproses buat apa? Jawab: Dahulu. memang whey itu dibuang. 1. Metanogen memiliki peranan sebagai pengurai yang penting. A. Contoh bakteri golongan ini adalah Methanococcus jannaschii. yaitu : (Karmana. atau hanya sebagai bahan pakan babi. tanpa pemasakan terlebih dahulu (oleh enzim) seperti pada jagung dan kentang. pembawa fisik dari informasi genetik. maka lama kelamaan orang di dunia mengetahui sebenarnya dalam whey ternyata masih terdapat nutrisi yang masih berguna. Archae kelompok ini hidup di lumpur dan rawa tempat mikroorganisme lain yang telah menghabiskan semua oksigen. Sel adalah unit dasar dari semua organisme hidup. Archaebacteria disebut juga bakteri purba (archae = purba). 2001). serta hewan yang tergolong sel eukariotik (Waites. Sehingga produksi whey sejalan dengan produksi keju. Dan berdasarkan lingkungan hidupnya tersebut. Metanogen Archaebacteria ini dinamai sesuai dengan metabolism energinya yang khas. mengapa hasilnya dipakai lagi dan harganya mahal? Jika digunakan. Seperti yang dijelaskan pada jawaban dari pertanyaan febrika larasati. bersama dengan ribosom yang mengambil bagian dalam sintesis protein. Whey sekarang digunakan untuk bahan pembuatan permen. dan makanan bayi. ganggang dan tanaman lainnya. Archaebacteria dibagi kedalam 3 kelompok utama. dalam pengolahan kotoran yang berasal dari sampah dan hewan. dimana gugus gula tersebut langsung dapat difermentasi. kemudian diubah menjadi metana yang dijadikan bahan bakar. Pertanyaan 10 (Adit Iqbal I) Whey itu dulu dibuang. yang berarti Archaebacteria ini akan teracuni bila terdapat oksigen. Misalnya. Mereka juga mengandung asam nukleat. khususnya hewan yang memakan 19 . susu bubuk. (Waites. Mereka adalah Archaebacteria atau archaea (bakteri „kuno‟) dan Eubacteria (bakteri „sesungguhnya‟). dkk. terutama terdiri dari lipid dan protein. yaitu H₂ digunakan untuk mereduksi CO₂ menjadi (CH)₄. 2001).

bakteri pun baru dapat diamati di bawah mikroskop. mempunyai panjang tubuh 0. dkk. USA. serta mempunyai dinding sel yang tersusun dari peptidoglikon. yaitu berupa lebih dari empat sel bakteri kokus berdempetan secara bergerombol membentuk rantai. a. Sulfolobus yang menempati mata air panas sulfur di Yellowstone National Park. Contoh : Streptococcus mutans (penyebab gigi berlubang) Staphylococcus.b. (Waites. dan philos = pecinta). yaitu : (Aryulina. panjang tubuhnya . Namun. Contoh dari Archaebacteria kelompok ini adalah Halobacterium salinatrium. (Karmana. Dialister pneumosintes. Aktivitas tertinggi bakteri terjadi pada kelmbapan 90%. Bakteri yang terkecil. c. Bakteri aktif bergerak pada kondisi lembap. yaitu berupa empat sel bakteri kokus berdempetan membentuk rantai. yaitu berupa delapan sel bakteri kokus berdempetan membentuk kubus. yaitu Bakteri Gram Positif dan Bakteri Gram Negatif. Pada kondisi kekurangan air. bahkan dapat menyebabkan kematian. 2006) Bentuk Bulat (Coccus) Berdasarkan koloninya dibagi menjadi: Monococcus. 1. 1) 2) 3) 4) 5) 6) tumbuhan. Dari asal bahasa tersebut.25 . yaitu berupa dua sel bakteri kokus berdempetan (tergabung secara berpasangan dua-dua). Misalnya di danau air asin dan di laut mati. Beberapa sepesies memerlukan suatu lingkungan yang salinitasnya sepuluh kali lebih asin dari air laut untuk tumbuh. Spirillium volutans. Contoh : Thiosarcina rosea (bakteri belerang) Streptococcus. Pada suatu larutan yang dipenuhi oleh koloni halofil. Adapun bakteri yang terbesar. bersifat mikroskopik. Bakteri orhodopsin merupakan suatu pigmen yang menangkap energy cahaya. Pigmen ini tertanam dalam membrane plasma. Termofil Archaebacteria ini memiliki cirri-ciri hidup pada suhu ekstrim (panas). Bakteri ini hidup dengan mengoksidasi sulfur. hampir semua bakteri yang terkandung dalam industri hanya dua. Contoh : Chlamydia trachomatis (penyebab penyakit mata) Diplococcus. Archaebacteria kelompok ini berperan penting dalam proses pembentukan nutrisi di hewanhewan tersebut. yaitu berupa lebih dari empat sel bakteri kokus berdempetan secara bergerombol membentuk seperti buah anggur. Eubacteria adalah kelompok yang sangat beragam yang dapat dibagi menjadi beberapa kelompok. terutama yang mengandalkan makanan berselulosa. Contohnya. Halofil Archaebacteria kelompok ini memiliki cirri hidup di tempat-tempat yang memiliki salinitas tinggi (halo = garam. 2006) Bentuk dasar sel bakteri beranekaragam. 2. Contoh : Pediococcus cerevisiae Sarcina. Archaebacteria halofil memiliki arti pecinta garam atau hidup di tempat yang memiliki salinitas (kadar garam) cukup tinggi. dkk. Archaebacteria ini dapat bertahan hidup dalam lingkungan panas dengan suhu optimum 60⁰C sampai 80⁰C. Walau berukuran lebih besar dari virus. bakteri menjadi tidak aktif. Contoh : Diplococcus pneumonia (penyebab penyakit pneumonia) Tetracoccus. 2001) Ukuran dan Bentuk Bakteri Bakteri merupakan organism mikroskopis dan rata-rata berdiameter 1.15 . Contoh : Staphylococcus aureus (penyebab penyakit radang paru-paru) 20 . yaitu berupa sel bakteri kokus tunggal. akan membentuk buih berwarna merah ungu yang dihasilkan oleh bakteri orhodopsin. bersifat uniseluler. Eubacteria (Bakteri) Eubacteria adalah bakteri yang bersifat prokariot. Inti dan organelnya tidak memiliki membran.

2009 2. Contoh : Vibrio cholera (penyebab penyakit kolera) Untuk lebih jelasnya.b. Contoh : Escherichia coli (bakteri usus besar manusia) 2) Diplobacillus. Bentuk Spiral (Spirillium) Berdasarkan bentuknya dibagi menjadi: 1) Spirillum. Contoh : Treponema pallidum (penyebab penyakit kelamin sifilis) 3) Vibrio. Contoh : Thiospirillopsis floridana (bakteri belerang) 2) Spirocheta. yaitu bentuk sel seperti tanda baca koma. Bentuk Batang (Bacillus) Berdasarkan koloninya dibagi menjadi: 1) Monobacillus. yaitu bentuk sel seperti sekrup. yaitu berupa beberapa sel bakteri basil berdempetan membentuk rantai. Struktur Bakteri Kistinnah dan Lestari. 2009 21 . Contoh : Salmonella typhosa (bakteri penyebab penyakit tifus) 3) Streptobacillus. yaitu berupa sel bakteri basil tunggal. yaitu bentuk sel bergelombang. lihat tabel berikut ini : Kistinnah dan Lestari. Contoh : Azotobacter (bakteri tanah yang mengikat nitrogen) c. yaitu berupa dua sel bakteri basil berdempetan.

Flagela terdiri atas tiga bagian. terdapat empat macam bakteri. bakteri dibedakan menjadi dua. Staphylococcus aureus. Treponema pallidum. 1) Flagelum (jamak: Flagela) Bentuk flagela seperti rambut yang teramat tipis. Berdasarkan letak dan jumlahnya. 2006) Struktur tubuh bakteri dibedakan menjadi struktur utama di luar dinding sel dan struktur di sebelah dalam dinding sel seperti berikut ini : (Kistinnah dan Lestari. 2009) Dinding sel bakteri tersusun dari peptidoglikan. Berdasarkan ketebalan lapisan peptidoglikan dinding sel. Contohnya : Propionibacterium acnes. Struktur Utama di Luar Dinding Struktur utama di luar dinding adalah flagela. kapsul ini berfungsi untuk menginfeksi inangnya (daya virulensi). dan sehelai filament panjang di luar dinding sel. mencuat menembus dinding sel. Akan tetapi untuk bakteri penyebab penyakit. juga berfungsi untuk melindungi isi sel.Dengan melihat Gambar 4. Vibrio cholera. dapat diamati bahwa stuktur sel bakteri masih sangat sederhana yang tersusun atas dinding sel dan isi sel. Streptococcus mutans. yaitu : 1. Perlu kita ketahui bahwa ada beberapa bakteri yang tidak memiliki flagelum yang disebut atrik. dkk. Panjangnya beberapa kali lebih panjang dari selnya. struktur seperti kait. perhatikan gambar kenampakan bakteri berdasarkan pewarnaan Gram di bawah ini : (Aryulina. dan Escheria coli. monotorik (memiliki satu flagelum pada salah satu ujung sel bakteri). dan fungsinya untuk pergerakan pada sel bakteri. Bakteri ini akan berwarna ungu jika diwarnai dengan pewarnaan Gram. Contohnya : Neisseria gonorrhoeae. dan Bacillus subtilis. (Kistinnah dan Lestari. Permukaan paling luar dilindungi oleh kapsul berupa lapisan lendir yang juga berfungsi sebagai cadangan makanan. Adapun pada lapisan di dalamnya terdapat dinding sel yang sangat kaku sehingga bisa memberikan bentuk dari bakteri itu sendiri. tetapi diameternya jauh lebih kecil dari diameter selnya. pili. dan kapsul. yaitu gabungan protein dan polisakarida. dkk. jika diwarnai dengan pewarnaan Gram. 2009) a. yaitu : (Aryulina. ∞ Bakteri gram negatif adalah bakteri yang memiliki dinding sel dengan lapisan peptidoglikan yang tipis. Bakteri ini akan berwarna merah muda atau merah. 22 .4 tersebut. Untuk lebih jelasnya. 2006) ∞ Bakteri gram positif adalah bakteri yang memiliki dinding sel dengan lapisan peptidoglikan yang tebal. yaitu tubuh dasar.

Pili ini tidak berfungsi untuk pergerakan. b. Bahan sel yang dikandungnya antara lain seperti berikut. Bagi bakteri. pili juga mempunyai fungsi lain. dan lebih banyak dari flagela. Diduga mesosom bisa berfungsi dalam sintesis dinding sel dan pembelahan nukleus. Bahan ini sebagai alat genetik yang terdiri atas kromosom. tetapi bukan flagela. baik eukariotik atau prokariotik. amfitrik (memiliki dua ataulebih flagella di kedua ujung sel bakteri). lopotrik (memiliki dua/lebih flagela pada salah satu ujung sel bakteri). 2) Mesosom Apabila membran sitoplasma mengalami pelipatan ke arah dalam/ invaginasi. 23 . juga berfungsi sebagai tempat perlekatan flagelum.2. yaitu sebagai alat untuk melekatkan pada berbagai permukaan jaringan hewan atau tumbuhan yang merupakan nutriennya. maka akan menghasilkan suatu struktur yang disebut mesosom. Contohnya. tetapi berfungsi sebagai pintu gerbang masuknya bahan genetik selama berlangsungnya perkawinan antarbakteri. Selain itu. Selain itu. 3) Kapsul Kapsul merupakan suatu bahan kental berupa lapisan lendir. dapat pula menambah kemampuan bakteri untuk menginfeksi. 3) Sitoplasma dan Struktur-Struktur di Dalamnya Sitoplasma merupakan cairan yang bersifat koloid dan berisi semua zat yang diperlukan untuk kehidupan sel. banyak terdapat pada bakteri gram negatif. perhatikan gambar berikut : Kistinnah dan Lestari. Struktur di Sebelah Dalam Dinding Sel Struktur paling umum yang terdapat di dalam dinding sel bakteri adalah sebagai berikut : 1) Membran Sitoplasma Membran ini amatlah penting karena berfungsi mengendalikan keluar masuknya substansi kimiawi dalam larutan sel. mineral. Ribosom ini merupakan biosintesis protein. bahan nukleus/DNA di dalam sel bakteri menempati posisi dekat pusat sel dan terikat pada mesosom sitoplasma. 3. dijumpai pada semua sel. Selain itu. b) Daerah nukleus. Sex pilus. dan 4. Kapsul bakteri mempunyai arti penting bagi bakteri maupun organisme lain. lebih pendek. yaitu mampu mengambil dan menahan nutrien seperti gula. dalam jumlah yang sesuai dan membuang kelebihan nutrien atau produk-produk buangannya. kapsul merupakan penutup atau pelindung dan juga sebagai gudang makanan cadangan. asam amino. Ukurannya dipengaruhi oleh medium tempat tumbuhnya. berisi partikel-partikel RNA protein (ribosom). Mesosom ini selalu bersambungan dengan membran sitoplasma. Membran sitoplasma merupakan membran plasma yang membungkus sitoplasma beserta isinya. 2009 2) Pili (Fimbriae) Bentuknya seperti filamen. Ukurannya lebih kecil. a) Daerah sitoplasma. Untuk lebih jelasnya. peritrik (memiliki flagela di seluruh permukaan sel bakteri).

atau kotoran. Penggolongan bakteri a. fotosintesis dapat terjadi. Sama halnya dengan plasmid dalam keadaan lingkungan yang jelek. Contohnya. 3. Klorosom hanya terdapat pada bakteri yang melakukan fotosintesis. Vakuola gas memungkinkan bakteri mengapung di air untuk memperoleh cahaya matahari. 2) Bakteri Autotrof Bakteri autotrof adalah bakteri yang dapat membuat makanannya sendiri. 6) Vakuola gas Vakuola gas terdapat pada bakteri yang hidup di air dan melakukan fotosintesis. baik secara langsung maupun tidak langsung. ataupun kontak langsung dengan penderita. bangkai. mengandung nutrien terlarut yang terbentuk sebagai tubuh inklusi. bakteri Escherichia coli yang berperan sebagai pembusuk sisa makanan dalam usus besar dan bakteri Lactobacillus garicus yang berperan dalam pembuatan yogurt. maka endospora akan bisa tumbuh menjadi bakteri seperti semula. Penularan penyakit yang disebabkan oleh bakteri dapat melalui makanan. proses oksidasi senyawa tertentu. bakteri nitrit dengan mengoksidkan NH₃. 24 . disentri disebabkan oleh bakteri Shigella dysenterriae. dan Nitrobacter. contohnya Chlorobium (bakteri hijau). TBC disebabkan oleh bakteri Mycobacterium tuberculosis. Bakteri ini sering disebut sebagai bakteri pembersih karena dapat menguraikan sampahsampah organik sehingga menguntungkan bagi manusia. bakteri tersebut akan membentuk endospora. Fungsinya untuk pertahanan sel bakteri terhadap lingkungan yang tidak menguntungkan. Bakteri ini biasanya bersifat merugikan makhluk hidup yang ditumpanginya karena dapat menimbulkan penyakit. Berdasarkan asal energi yang digunakan. bakteri nitrat dengan mengoksidkan HNO₂. Nitosococcus. Bakteri kemoautotrof adalah bakteri yang membuat makanannya dengan bantuan energi yang berasal dari reaksi-reaksi kimia. Dengan demikian. glikogen. Klorosom mengandung pigmen klorofil dan pigmen lainnya untuk proses fotosintesis. Contohnya. antara lain. dan pati. pembentukannya terjadi di dalam sel bakteri. dan radang paruparu (pneumoniae) disebabkan oleh bakteri Diplococcus pneumoniae. Berdasarkan Cara Memperoleh Makanannya 1) Bakteri Heterotrof Bakteri heterotrof adalah bakteri yang hidup dan memperoleh makanan dari lingkungannya karena tidak dapat membuat makanan sendiri. Jika kondisi telah membaik. contohnya. Endospora ini sebenarnya adalah spora/struktur yang berdinding tebal. Bakteri parasit adalah bakteri yang hidup menumpang pada makhluk hidup lain.c) Bagian zat alir. bakteri belerang dengan mengoksidkan senyawa belerang. Jika materi materi ini menumpuk maka akan membentuk granul/globul di dalam sitoplasma. Endospora ini tahan terhadap panas dengan batas sekitar 120° C. Bakteri saprofit adalah bakteri yang hidup pada jasad yang sudah mati. Pada bagian tubuh ini terdiri atas lipid. misalnya. sifilis disebabkan oleh bakteri Treponema pallidum. 4) Plasmid dan Endospora Pada umumnya bakteri memiliki plasmid berbentuk seperti cincin yang terdapat di dalam sitoplasma. 5) Klorosom Klorosom adalah struktur yang berada tepat di bawah membrane plasma. misalnya. kolera disebabkan oleh bakteri Vibrio cholerae. Bakteri ini dapat hidup secara saprofit dan parasit. sampah. yaitu bakteri yang bersifat kemoautotrof dan bakteri yang bersifat fotoatotrof. bakteri Thiobacillus thioparus yang menumpuk sejumlah besar sulfur yang tampak seperti granul. bakteri autotrof dapat dibedakan menjadi dua. pernapasan. Contoh penyakit yang disebabkan oleh bakteri ini. minuman. polifosfat.

bakteri yang terdiri dari sepasang sel (diplococcus). misalnya. Bakteri ini adalah bakteri yang mengandung zat warna hijau sehingga dapat melakukan fotosintesis. bakteri itu disebut bakteri anaerob fakultatif. dan Clostridium tetani. Contohnya bakteri-bakteri yang mempunyai zat warna. Bakteri aerob secara obligat adalah bakteri yang mutlak memerlukan oksigen bebas dalam hidupnya. bakteri asam susu. Faktor lingkungan ini adalah cahaya matahari yang terus-menerus. Keadaan tersebut juga menunjukkan bahwa meskipun populasi bakteri sangat besar. Pada kondisi yang kurang menguntungkan. 2) Bakteri Anaerob Bakteri anaerob adalah bakteri yang dapat hidup tanpa oksigen bebas. Pada keadaan optimal. bakteri Lactobacillus bulgaricus. kekeringan. Sel anakan hasil pembelahan ini akan membentuk suatu koloni yang dapat dijadikan satu tanda pengenal untuk jenis bakteri. tetap saja dapat dikendalikan oleh faktor-faktor penghambat sehingga peranan bakteri di alam sebagai salah satu pengurai dapat seimbang dengan makhluk hidup produsen dan konsumen. spora akan tumbuh kembali menjadi satu sel bakteri. Akan tetapi.Bakteri fotoautotrof adalah bakteri yang membuat makanannya dengan bantuan energi yang berasal dari cahaya matahari. seperti tumbuhan hijau. Dua sel bakteri ini mempunyai bentuk dan ukuran sama (identik). Berdasarkan Kebutuhan Oksigennya Berdasarkan kebutuhan oksigennya. 4. jika bakteri tersebut dapat hidup tanpa kebutuhan oksigen secara mutlak atau dapat hidup tanpa adanya oksigen. antara lain. yaitu dengan pembelahan biner : 25 . Dalam keadaan normal. bakteri dapat dibedakan menjadi bakteri aerob dan bakteri anaerob. CO₂. Misalnya. b. dan adanya zat-zat penghambat dan pembunuh bakteri. ada pula jenis bakteri yang akan mati karena perubahan faktor lingkungan. bakteri Nitrosomonas. 1 ) Bakteri Aerob Bakteri aerob adalah bakteri yang hidupnya memerlukan oksigen bebas. Akan tetapi. Reproduksi bakteri Bakteri dapat berkembang biak secara aseksual dengan membelah diri pada lingkungan yang tepat atau sesuai. dan berbentuk rantai (streptococus). Bakteri yang hidup secara aerob dapat memecah gula menjadi air. kenaikan suhu. delapan sel membentuk kubus (sarcina). beberapa jenis bakteri dapat membelah setiap 20 menit. Pembelahan biner melintang adalah pembelahan yang diawali dengan terbentuknya dinding melintang yang memisahkan satu sel bakteri menjadi dua sel anak. seperti antibiotika dan desinfektan. dan energi. dari golongan Thiorhodaceae (bakteri belerang berzat warna). Reproduksi bakteri dapat berlangsung dengan sangat cepat. sel-sel bakteri dapat mempertahankan diri dengan pembentukan spora. misalnya. Berikut adalah gambar yang menunjukkan perkembangbiakan bakteri secara aseksual. Proses pembelahan diri pada bakteri terjadi secara biner melintang. Dalam satu jam bakteri dapat berkembang biak menjadi berjutajuta sel.

Transduksi adalah pemindahan DNA dari sel pemberi ke sel penerima dengan perantaraan virus. seperti yang terjadi pada makhluk hidup eukariot. yaitu transformasi. 2006) 26 . b. a. perkembangbiakan bakteri yang terjadi dengan cara ini disebut perkembangbiakan paraseksual. harus terjadi hubungan langsung. Transformasi adalah pemindahan potongan materi genetik atau DNA dari luar ke sel bakteri penerima. Untuk lebih jelasnya. tidak terjadi kontak langsung antara bakteri pemberi DNA dan penerima. Meskipun demikian. Dalam hal ini. secara Selain reproduksi secara aseksual. dan transduksi. bakteri juga melakukan reproduksi 2006) seksual. konjugasi. Bakteri tidak melakukan pembiakan seksual yang sebenarnya. dkk. dkk. Dalam proses ini. Oleh karena itu. perhatikan gambar di bawah ini : (Aryulina. karena bakteri tidak mengalami penyatuan sel kelamin. Jadi. c. untuk memasukkan DNA dari sel pemberi ke sel penerima. Perkembangbiakan parasekual bakteri dapat terjadi dengan tiga cara. pada bakteri terjadi pertukaran materi genetik dengan sel pasangannya. Konjugasi adalah penggabungan antara DNA pemberi dan DNA penerima melalui kontak langsung.(Aryulina. protein virus yang berfungsi sebagai cangkang digunakan untuk pembungkus dan membawa DNA bakteri pemberi menuju sel penerima.

Proteobacteria kemoautotrof hidup bebas atau bersimbiosis dengan makhluk hidup lain. dan baeosit. Proteobacteria dikelompokkan menjadi bakteri ungu yang bersifat fotoautotrof atau fotoheterotrof.5. Perbedaan Cyanobacteria dengan bakteri fotoautotrof adalah Cyanobacteria menghasilkan O₂ dalam proses fotosintesisnya sedangkan bakteri fotoautotrof tidak menghasilkan O₂. Chlamydias. yaitu heterokista. Koloni Cyanobacteria dapat berbentuk benang. dan pigmen tambahan. yaitu mengikat nitrogen (mengubah N₂ di atmosfer menjadi senyawa nitrogen yang dapat digunakan tumbuhan). akinet terbentuk agar 27 . dan bakteri Gram-Positif. Disebut ganggang lendir karena pada bagian luar dinding selnya terdapat lapisan lendir. dan proteobacteria kemoheterotrof. sampai kehitaman. Pada kondisi lingkungan yang buruk. Spirochetes. Cyanobacteria. dan pembentukan akinet (spora). danau. Beberapa jeis bakteri ungu memiliki flagella. Cyanobacteia berukuran Cyanobacteria hidup soliter atau berkoloni. Pigmen-pigmen tersebut yang menyebabkan warna Cyanobacteria beraneka ragam dari hijau. Pigmen tambahan berupa fikosianin yang berwarna biru dan fikoeritrin yang berwarna merah. Cyanobacteria membutuhkan cahaya matahari untuk proses fotosintesis. Contoh proteobacteria kemoheterotrof adalah Escherichia coli dan Salmonella. (Aryulina. Sebagian besar bakteri dalam kelompok ini berbentuk batang dan anaerob fakultatif. misalnya Anabaena. fragmentasi bagian dari filamen (hormogonia). atau bola berongga. Tubuh Cyanobacteria juga memiliki vakuola gas yang memungkinkannya mengapung dekat permukaan air. Akinet adalah sel berdinding tebal yang berfungsi untuk pertahanan diri. atau lumpur. karoten. yang memiliki intensitas cahaya matahari yang tinggi. Rhizobium hidup bersimbiosis dalam akar tanaman kacangkacangan. akinet. lembaran. dan beberapa ion anorganik lainnya. Proteobacteria kemoheterotrof meliputi bakteri yang hidup dalam saluran pencernaan manusia dan hewan. Sedangkan baeosit adalah sel-sel bulat kecil hasil reproduksi. Contoh bakteri ungu adalah Chromatium. Bakteri ungu mengandung klorofil yang terdapat pada membran plasma. Heterokista merupakan sel berdinding tebal yang berguna untuk mengikat nitrogen. Sebagian besar bakteri ungu anaerob obligat dan hidup di endapan kolam. Membran fotosintetiknya (membran tilakoid) mengandung pigmen klorofil. ungu. ion nitrat atau ammonium. Disebut ganggan hijaubiru karena Cyanobacteria memiliki klorofil seperti halnya ganggang hijau. merah. Pada beberapa jenis Cyanobacteria. sedangkan fragmentasi pada bagian hormogonia dilakukan oleh Cyanobacteria yang berbentuk benang. Reproduksi Cyanobacteria adalah secara aseksual sengan cara membelah diri (pembelahan biner). Pembelahan biner dilakukan oleh Cyanobacteria bersel satu. Contoh proteobacteria kemoautotrof adalah Rhizobium. Cyanobacteria hidup secara fotoautotrof dengan mengasimilasi senyawa sederhana misalnya CO₂. 2006). Klasifikasi Eubacteria Eubacteria dikelompokkan menjadi lima filum. Sitoplasma Cyanobacteria tidak memiliki banyak organel serta tidak memiliki membran inti (prokariot). terdapat tiga macam sel utama. Pada Cyanobacteria bentuk benang. Baeosit juga berfungsi untuk melakukan fotosintesis. yaitu: Proteobacteria. lapisan lendir dapat membantu gerakan secara meluncur. Beberapa jenis berperan penting dalam siklus biogeokimia di dalam suatu ekosistem. 1) Proteobacteria Proteobacteria merupakan kelompok terbesar bakteri. proteobacteria kemoautotrof. 2) Cyanobacteria Cyanobacteria sering disebut juga ganggang hijau-biru atau ganggang lendir. Berbeda dengan kelompok bakteri yang lain. Cyanobacteia tidak memliki alat gerak dan dapat melakukan fotosintesis. dkk.

Badan inisial tumbuh dan membelah diri. Ada yang hidup bebas di lumpur atau air. Contoh Spirocheta antara lain Treponema pallidum (penyebab penyakit sifilis pada manusia). Filamen aksial berfungsi untuk membuat gerakan berputar. Pada saat tertentu. Sel induk pecah dan endospora dilepaskan. akinet dapat membentuk filamen baru. laut.0) dan temperatur tinggi (70⁰C). penyakit menular seksual. Spirocheta berbentuk spiral dengan panjang Spirocheta merupakan bakteri gram-negatif. Simbiosis antara Cyanobacteria dengan organisme lain saling member keuntungan. 28 . Kelompok bakteri ini merupakan prokariot yang unik karena memiliki dua bentuk sel dalam siklus hidupnya.Cyanobacteria dapat bertahan hifup. 4) Chlamydias Chlamydias merupakan kelompok bakteri yang memiliki ukuran paling kecil ( ). Beberapa jenis Cyanobacteria yang dapat mengikat nitrogen berperan sebagai tumbuhan perintis pada habitat miskin nutrisi (makanan). misalnya Nostoc dan Anabaena azollae. misalnya pantai berpasir atau gurun. batu. Bentuk tubuh Chlamydias tidak beraturan. Nostoc hidup bersama dengan jamur membentuk lumut kerak (Lichen) Peltigera. atau ungu kehitaman. di dalam selubung terluar. serta hidup di akar tumbuhan paku Cycas. Cyanobacteria yang hidup di air muncul berlimpah sehingga menyebabkan air tampak berwarna seperti warna Cyanobacteria tersebut. Endospora dapat bertahan dalam keadaan lingkungan yang ekstrim. Badan dasar masuk ke dalam sel inang dan berkembang menjadi badan inisial. Jika lingkungan telah membaik. Contohnya Cyanobacteria berwarna hijau-biru (Anabaena) membuat air sawah tampak kehijauan dan Cyanobacteria berwarna merah (Oscillatoria rubescens) membuat laut di daerah Timur Tengah berwarna merah sehingga disebut Laut Merah. Habitat Spirocheta bervariasi. Contoh Chlamydias adalah Chlamydia psittaci (penyebab penyakit mata. Spirocheta memiliki suatu struktur unik yang disebut filament aksial. merah. Synechococcus lividus dapat hidup di habitat yang ekstrim. misalnya habitat dengan tingkat keasaman tinggi (pH 4. Namun. Pada kondisi lingkungan yang membaik. tetapi di luar dinding sel. sebagai parasit dalam tubuh manusia. tanah. dan beberapa jenis penyakit pneumonia). Sedangkan organisme simbiotiknya memberikan kelembaban dan nutrisi anorganik pada Cyanobacteria. Endospora dibentuk ketika lingkungan miskin akan zat makanan. Chlamydias hanya dapat hidup sebagai parasit dalam sel-sel makhluk hidup lain. Anabaena azollae hidup di daun tumbuhan paku air Azolla piñata. endospora menjadi aktif dan membelah diri. sungai. dan Leptospira interrogans (penyebab penyakit leptospirosis). atau hidup dalam lambung hewan memamah biak. 3) Spirochetes Spirocheta bukan merupakan kelompok yang besar dari Eubacteria. Badan inisial membentuk badan dasar kembali dan dilepaskan dari sel inang yang disertai pecahnya sel inang.. Dormansi endospora dapat bertahan lebih dari seribu tahun. dan rawa. Contoh bakteri gram-positif yang dapat membentuk endospora adalah Bacillus dan Clostridium. Sedangkan jenis lainnya ada yang hidup bersimbiosis dengan organisme lain. Cyanobacteria terutama berperan dalam memberikan nutrisi organik pada organisme simbiotiknya. suhu rendah. beberapa jenis Treponema lain yang hidup dalam lambung hewan memamah biak. keberadaan Spirocheta mempengaruhi kehidupan manusia karena beberapa jenis menyebabkan penyakit. Cyanobacteria dapat ditemukan pada berbagai lingkungan. Cyanobacteria dapat terlihat dengan mata telanjang berupa lapisan tipis berwarna hijau-biru. Salah satu Cyanobacteria. misalnya : danau. 5) Bakteri Gram-Positif Beberapa bakteri gram-positif membentuk endospora (struktur dormansi yang bersifat tahan terhadap panas). atau kekeringan. Filamen aksial merupakan semacam serabut di sepanjang tubuh. membentuk sel-sel seperti induknya. Kedua bentuk sel tersebut yaitu badan dasar (elementary body) dan badan inisial (initial body). Reproduksi secara seksual belum diketahui. misalnya suhu tinggi.

29 .(Waluyo. Untuk bereproduksi virus hanya memerlukan asam nukleat saja. Virus berukuran aseluler (tidak mempunyai sel). Actinomycetes berbentuk filament bercabang yang menyerupai jamur. tetapi dapat dikristalkan. Virus umumnya berupa semacam hablur (kristal) dan bentuknya sangat bervariasi 5. Virus hanya dapat berkembang biak di sel-sel hidup lain (sifat virus parasit obligat) karenanya. Virus hanya memiliki sala satu macam asam nukleat (RNA atau DNA). 4. jauh lebih kecil daripada bakteri. isi tubuh. dan serabut ekor. vius dapat dibiakkan pada telur ayam yang berisi embrio hidup.2004) Morfologi virus 1. Virus tidak dapat diendapkan dengan sentrifugasi biasa. Contohnya Mycoplasma gallisepticum (dikenal sebagai bakteri terkecil). Selain itu irus tidak dapat membelah diri. Selanjutnya. Virus ini mempunyai ciri-ciri tidak dimiliki oleh organisme lain. VIRUS Virus merupakan salah satu jenis mikroorganisme parasit. Contoh Actinomycetes adalah Mycobacterium tuberculosis (penyebab penyakit TBC) dan Streptomyces (penghasil antibiotik streptomisin).2004) Anatomi virus Kepala Kepala virus berisi DNA dan bagian luarnya diselubungi kapsid. Virus berukuran amat kecil. filamen tersebut membelah diri. Mycoplasma tidak memiliki dinding sel. kulit(selubung atau kapsid).20 Anatomi virus(Waluyo. Beberapa Mycoplasma berukuran lebih kecil dibandingkan Chlamydias. 2. Ciri lainnya. Tubuh virus terdiri atas kepala. Actinomycetes berkembang biak dengan membentuk rantai spora di ujung filamen.4. virus tidak dapat bergerak maupun melakukan aktivitas metabolisme sendiri. B. 3.Contoh lain bakteri gram-positif adalah kelompok Actinomycetes dan Mycoplasma. Actinomycetes yang tidak membentuk spora berkembang biak dengan cara memutuskan ujung filamen dalam bentuk bulat atau batang.  Gambar. tetapi beberapa jenis memiliki struktur yang mengeras di luar membran plasma.

virus menginfeksi sel bakteri. sel hewan. virus akan menghancurkan sel induk setelah berhasil melakukan reproduksi.  Isi tubuh Isi tubuh yang disebut viorin adalah bahan genetik yakni asam nukleat (DNA atau RNA). Pada infeksi secara litik. yang masing-masing terdiri dari rantai polipeptida.  Virus yag isi tubuhnya tediri atas RNA. virus radang mulut. protein.virus tidak menghancurkan sel bakteri tetapi virus berintregasi dengan DNA sel bakteri. sehingga jika bakteri membelah atau berkembang biak virus pun ikut membelah. atau sel tumbuhan untuk bereproduksi. Ada dua macam cara virus menginfeksi bakteri. Kapsid terdiri atas bagian-bagian yang disebut kapsomer. Kapsid Kapsid adalah selubung yang berupa protein. yaitu secara litik an secara lisogeni. yaitu melalui fase adsorpsi. Pada prinsipnya cara perkembangbiakan virus pada hewan maupun pada tumbuhan mirip dengan yang berlangsung pada bakteriofag. disebut nukleokapsid. sintesis.2004) Reproduksi virus Untuk berkembang biak virus memerlukan tempat atau lingkungan yang hidup. Oleh karena itu.(waluyo.  Virus yang isi tubuhnya RNA. dan lisis. Kapsid juga dapat terdiri atas proten-protein monomer identik.2007) 30 . protein. dan polisakarida.  Ekor  Ekor virus merupakan alat penancap ketubuh organisme yang diserangnya.(Winami. sedangkan pada infeksi secara lisogenik. dan banyak lipida. contohnya paramixovirus.2007) Gambar 4. contohnya virus cacar. Ekor virus terdiri atas tabung bersumbat yang dilengkapi benang atau serabut. lipida. contohnya sebagai berikut:  Virus yang isi tubuhnya RNA dan bentuknya menyerupai kubus antara lain.Pada virus dijumpai asam nukleat yang diselubungi kapsid.20 Gambar Reproduksi Virus(Winami.

Membran plasma sangat berguna bagi kehidupan sel karena berfungsi untuk lalu-lalangnya substansi kimiawi dalam larutan atau keluar masuk dari dalam sel. 2). Membran Plasma – Berfungsi sebagai pelindung molekuler sel terhadap lingkungan di sekirnya. dengan jalan mengatur lalu lintas molekul dan ion-ion dari dalam. dan kemudian masuk ke dalam sitoplasma. terdapat klorosom di dalam selnya.DAFTAR PERTANYAAN BESERTA JAWABAN 1. Klorosom adalah struktur yang berada tepat di bawah membrane plasma. ke membran plasma.Pada dinding sel terdapat pori-pori sebagai jalan keluar masuknya molekul-molekul. Organel apa yang ada pada eukariotik tapi tidak ada di prokariotik. Dinding Sel . Selain itu. Klorosom mengandung pigmen klorofil dan pigmen lainnya untuk proses fotosintesis. 3. Membran sitoplasma juga menyediakan peralatan 31 . Bagaimana proses bakteri memperoleh makanan? (Gregorious Bagas) Jawab : Jalannya proses dimana bakteri memperoleh makanan adalah dari dinding sel. Bagaimana proses fotosintesis pada bakteri? (Vivi Anita) Jawab : Pada bakteri yang melakukan fotosintesis. atau sebaliknya? (Rahma Yulia Rusmo dan Ayu Indah Wibowo) Jawab : 2. fotosintesis dapat terjadi. menjaga keseimbangan nutrien yang terdapat didalam sel. Dengan demikian. Vakuola gas memungkinkan bakteri mengapung di air untuk memperoleh cahaya matahari. 1). terdapat vakuola gas pada bakteri yang hidup di air dan melakukan fotosintesis.

elektron. Waktu generasi bervariasi. dkk.  Batch Culture Mikroba jika dikembangbiakkan pada satu medium tertentu. Beberapa bakteri berbentuk filamen bereproduksi dengan menghasilkan rantai konidiospora pada ujung filamen. 2001). Sel pun memisah. bukan peningkatan ukuran tiap individu. Difusi pasif (osmosis) yaitu pemindahan substansi yang berkonsentrasi tinggi menuju konsentrasi rendah. mineral. Angkutan aktif yaitu kemampuan menghimpun nutrien secara selektif untuk kepentingan sel dalam pertumbuhan dan perkembangannya. Kebanyakan bakteri memiliki waktu generasi 1-3 jam. Dinding sel yang baru terbentuk di antara kedua DNA 4. dan kondisi lingkungannya. dan konsentrasi limbah akan meningkat. lalu ia memisah. A. Kurva yang terbentuk memiliki 6 fase yang berbeda. di mana kebanyakan bakteri melakukan reproduksi dengan metode ini. Ada pula beberapa spesies yang melakukan fragmentasi. Dinding sel dan membran plasma mulai melakukan pembelahan 3. 32 . mereka biasanya akan tumbuh sebagai batch culture atau closed system.Berfungsi untuk mencerna makanan secara ekstraselular untuk melakukan metabolisme sel. Beberapa spesies bakteri bereproduksi dengan cara membentuk tunas (budding). PERTUMBUHAN KULTUR MIKROBA Pertumbuhan di sini yang dimaksud adalah peningkatan jumlah bakteri. Karena banyaknya jumlah mikroba yang bisa dihasilkan selama beberapa waktu. Waktu generasi (generation time) adalah waktu yang dibutuhkan sel untuk membelah (dan populasinya untuk menggandakan diri). dkk. maka untuk mempermudah perhitungan biasanya dipakai skala logaritmik (Tortora. Mikroba membentuk suatu tunas yang terus membesar hingga ukurannya mendekati ukuran sel induknya. asam-asam amino. Pertumbuhan mikroorganisme yang bereproduksi secara biner bisa diplot kurva sebagai jumlah sel yang ada versus masa inkubasi. maka konsentrasi nutrien akan turun. gula. dipengaruhi jenis organisme. Untuk menghitung waktu generasi dari bakteri. 3). serta metabolit-metabolit lain melintasi membran. dan fragmen yang terbentuk lalu memulai pertumbuhan sel baru (Tortora. Tahapan-tahapan pembelahan biner yaitu: 1. reproduksi yang diperhatikan hanyalah reproduksi dengan pembelahan biner.biokimiawi yang berguna untuk memindahkan ion ion. Pemindahan substansi-substansi tersebut dilakukan dengan cara: a. 2001). ada pula yang lebih dari 24 jam per generasi. Sel memanjang dan terjadi replikasi DNA 2. b. Jika pada masa inkubasi tidak ada penyediaan medium baru yang segar. Bakteri pada umumnya bereproduksi dengan cara pembelahan biner. Sitoplasma .

dkk.Sel yang bersangkutan mungkin saja telah tua dan memiliki keterbatasan dalam jumlah ATP. . maupun ribosom. kofaktor. Fase ini bisa saja berlangsung lama apabila inokulumnya berasal dari kultur yang sudah tua. Jika laju maksimum. ini dikarenakan enzim yang baru dibutuhkan untuk mengolah nutrien yang baru. Kecepatan pertumbuhan mikroba adalah konstan. 3) Exponential phase / Log phase Pada fase eksponensial. Industrial Microbiology: An Introduction. 2) Acceleration phase Fase ini merupakan fase di mana pembelahan sel dimulai dan lajunya semakin meningkat hingga mencapai laju maksimum. maka fase eksponensial pun dimulai (Waites.Kemungkinan mikroba mengalami kerusakan dan membutuhkan waktu untuk memulihkan dirinya (Tortora. atau inokulasi suatu kultur yang ditempatkan pada medium yang berbeda secara kimiawi. kalaupun ada penambahannya dalam jumlah yang sangat sedikit. . medium. Fig 2. Namun fase ini juga bisa saja berlangsung cepat apabila kultur yang digunakan adalah kultur yang masih muda dan berada pada fase eksponensial ditempatkan pada medium yang masih segar dan dalam komposisi yang sesuai (Tortora. dkk.Medium kemungkinan berbeda dengan medium yang ditempati mikroorganisme itu sebelumnya. Sel harus menyintesis bahan-bahan tersebut sebelum pertumbuhan mikroorganisme dapat dilakukan. tergantung pada potensial genetik. dkk. dkk. Pembentukan komponen-komponen baru ini bisa disebabkan karena hal-hal berikut: . Lag phase bervariasi waktunya untuk setiap kondisi mikroba dan suasana dari medium yang bersangkutan. Meskipun tidak ada pembelahan sel maupun peningkatan massa. dan kondisi pada saat mereka tumbuh. Biasanya pada fase ini tidak ada penambahan jumlah sel. 2001). Pertumbuhan ini menghasilkan kurva naik yang 33 .Gambar 1: Pertumbuhan Mikroorganisme pada Batch Culture (Waites. sehingga mikroorganisme tersebut harus beradaptasi. 2001). namun pada fase ini sel melakukan sintesis komponen-komponen baru. 2001). kultur yang baru saja didinginkan.1) Kurva-kurva tersebut adalah: 1) Lag phase Lag phase adalah fase di ketika mikroorganisme dimasukkan ke dalam medium kultur yang masih segar. mikroba mengalami pertumbuhan dan membelah dengan kecepatan semaksimal mungkin yang mungkin dicapai.

tipe mikroorganisme yang dikembangkan. 2001). Pada akhirnya. dkk. kecepatan sintesis dari komponen-komponen sel bervariasi antara komponen satu dengan yang lain. Sel yang berada di bawahnya tidak dapat melakukan pertumbuhan. mikroba pun melakukan reproduksi (Tortora. pertumbuhan akan melambat. Jumlah maksimum populasi yang dapat dicapai ditentukan oleh banyak faktor. mikroba akan membutuhkan waktu untuk membuat enzim baru. Kemudian pertumbuhan yang seimbang dapat dimulai lagi dan kultur memasuki fase eksponensial (Tortora. sedangkan algae dan protozoa mencapainya pada level populasi sekitar 106 sel per mL. dan ini terjadi hingga keseimbangan yang baru telah tercapai (Tortora. dan sebagainya (Tortora. Pada konsentrasi nutrien yang sangat tinggi. 2001). 4) Deceleration phase Nutrien yang dikonsumsi mikroba lama-kelamaan pasti akan mengalami keterbatasan. akan terjadi pertumbuhan tidak seimbang (unbalanced growth). berarti sudah memasuki fase stasioner (Waites. Jika nutrien mulai mengalami keterbatasan. dkk. Jika mikroba dipindahkan dari medium bernutrisi rendah ke medium yang lebih kaya nutrisi. dkk. Ini lalu diikuti dengan peningkatan jumlah sintesis protein dan DNA. Pada fase stasioner jumlah mikroorganisme konstan. Jika mikroba dipindahkan dari medium kaya nutrisi ke medium miskin nutrisi. Saat seperti ini disebut dengan fase stasioner. misalnya saja nutrien yang tersedia. 2001). dkk. 2001). dkk. Populasi mikroba bisa memasuki fase stasioner bisa disebabkan karena beberapa hal. Pertumbuhan eksponensial termasuk dalam jenis pertumbuhan seimbang (balanced growth). 5) Stationary phase Pertumbuhan pada suatu saat akan berhenti dan kurva pertumbuhan membentuk garis horizontal. kecuali jika kultur diguncang atau diaerasi (Tortora. semua komponen sel dihasilkan dengan kecepatan yang sama antara satu komponen dengan yang lain. sistem transpor pada mikroba sudah jenuh. Pembelahan sel dan replikasi DNA tetap terjadi. Sel akan menjadi lebih kecil dan melakukan reorganisasi secara metabolik hingga mereka dapat tumbuh kembali. Kecepatan pertumbuhan juga meningkat seiring dengan konsentrasi nutrien. sel akan mulamula membentuk ribosom baru untuk meningkatkan kapasitas mereka dalam membentuk protein. Salah satunya adalah karena keterbatasan nutrien. Oksigen tidak terlalu bersifat larut dan bisa habis dalam waktu yang cukup cepat. Jika kurva sudah benar-benar datar (di mana tidak ada laju pertumbuhan mikroba). Namun jika level nutrien atau suasana lingkungan berubah. Kurva itu juga sekaligus menggambarkan jumlah nutrien yang mampu dimanfaatkan oleh mikroba. sehingga menghasilkan kurva yang cenderung menuju datar. 2001). namun pembentukan protein dan sintesis RNA melambat. dkk. 2001). sehingga tidak menghasilkan kurva diskret (Tortora. Jika nutrien jumlahnya semakin terbatas. maka laju pertumbuhan pun akan mulai melambat. Pada kondisi ini. Mulusnya kurva ini disebabkan tiap individu mikroba membelah berkali-kali dalam interval waktu yang sangat singkat. Bakteria pada umumnya mencapai fase stasioner pada level populasi sekitar 109 sel per mL. dkk. 2001). atau memang karena populasi benar-benar berhenti melakukan pembelahan namun masih aktif melakukan metabolisme (Tortora. Ini dapat disebabkan oleh seimbangnya jumlah sel yang mati dan yang membelah. 2001). 34 . sehingga hanya bagian permukaan kultur saja yang mendapatkan cukup oksigen dan melakukan pertumbuhan. dkk. Pada kondisi ini. dkk. dan kecepatan pertumbuhan tidak akan meningkat lagi (Tortora. menghasilkan suatu kurva yang lebih kompleks. Organisme aerobik seringkali mengalami keterbatasan O2. 2001).mulus.

di mana kondisi lingkungan mikroorganisme tetap dipertahankan dengan cara pemberian nutrien dan pembuangan limbah secara kontinu. 2001). dkk. 2001). Pada sistem ini. Banyak kultur anaerobik mengalami masalah ini. dkk.  Continuous Culture Pada penjabaran di sebelumnya. Mati di sini diartikan sebagai kehilangan kemampuan untuk bereproduksi (Tortora. dkk. Ini mengakibatkan kurva kematian terkadang bisa menjadi kompleks (Tortora.Pertumbuhan populasi juga bisa terhambat akibat akumulasi sisa metabolisme yang bersifat racun. Jika ia tidak tumbuh dan bereproduksi. Ini dikarenakan ada beberapa sel yang resisten dan tahan terhadap lingkungan yang tidak mendukung. 2001). Selain metode batch. dkk. seperti habisnya nutrien atau menumpuknya sisa metabolisme menyebabkan menurunnya jumlah populasi mikroba. Industrial Microbiology: An Introduction. berarti dia dinyatakan mati. Selain itu. mikroorganisme bisa ditumbuhkan di dalam suatu sistem terbuka. Sistem ini disebut dengan sistem kultur kontinu (continuous culture system). 2001). Sehingga fase eksponensial hanya berlangsung selama beberapa saat saja (Tortora. dkk. Gambar 2: Peralatan untuk Continuous Culture (Waites. laju kematian bisa saja mengalami penurunan drastis. yang menandakan terjadinya fase mati (death phase).4) 35 . dkk. streptococci dapat memproduksi asam laktat dan asamasam organik lain dalam jumlah yang besar hasil dari fermentasi gula. pengkulturan mikroba dilakukan secara batch di mana persediaan nutrien tidak diperbarui dan limbah tidak dibuang. Contohnya. 2001). Cara untuk memastikan apakah suatu sel bakteri hidup atau tidak adalah dengan menempatkannya di medium yang masih segar. 2001). Matinya mikroba biasanya berbentuk logaritmik pada kurva (Tortora. dkk. populasi mikroba dapat dipertahankan pada fase eksponensialnya untuk jangka waktu yang lebih lama (Tortora. Ini dapat menyebabkan medium menjadi asam dan menghambat pertumbuhan. 6) Death phase Memburuknya suasana lingkungan. Fig 2. Meskipun kebanyakan populasi mikroba mati dengan pola logaritmik. streptococci juga bisa memasuki fase stasioner akibat kehabisan gula (Tortora.

Menggunakan counting chamber merupakan cara yang mudah. MENGUKUR PERTUMBUHAN MIKROBA  Metode penghitungan langsung (Direct Method) Metode ini dilakukan dengan menghitung pertambahan jumlah dari sel. Kondisi steady-state dapat dipertahankan. 2002). B. Industrial Microbiology: An Introduction. namun pada fase eksponensialnya nutrien diberikan secara kontinu untuk memperpanjang fase eksponensialnya.5) Laju pertumbuhan mikroba bisa dikontrol laju volumetrik medium yang masuk. konsentrasi substrat yang dihasilkan juga lebih rendah. Ada beberapa kelemahan metode ini. dkk. Maka kontrol pada continuous culture sangatlah penting (Waites. mikroba akan terbuang dari fermentor sebelum sempat melakukan pembelahan. Sel prokariot lebih mudah dihitung dengan counting chamber apabila sel-sel itu diberi warna. Volume dari fermenter dibuat konstan dengan cara mengontrol antara jumlah medium kultur yang masuk dengan jumlah sel dan hasil metabolismenya yang dikeluarkan. Selain itu. dan juga memberikan informasi mengenai ukuran dan morfologi mokroorganisme. Counting Chamber / Direct Microscope Method Cara paling umum untuk menentukan jumlah mikroba adalah dengan menghitungnya langsung menggunakan counting chamber. 2001). murah. 36 . cepat. dkk. Jika laju pengenceran lebih cepat dari laju pertumbuhan mikroba. sedangkan hemocytometer digunakan untuk menghitung baik sel prokariot maupun eukariot.Pada metode ini. Semakin mendekati nilai laju pertumbuhan maksimum. dkk. Petroff-Hauser counting chamber bisa digunakan untuk menghitung sel prokariot. karena yang digunakan sebagai sampel hanyalah volume yang sangat kecil. namun juga laju pengenceran. Namun jika laju pengencerannya lambat. semakin banyak substrat yang dihasilkan oleh mikroba. 2002). dkk. mikroba pada mulanya ditumbuhkan secara batch. atau menggunakan mikroskop fase-kontras atau mikroskop fluorescence (Prescott. Gambar 3: Pertumbuhan Mikroorganisme dalam Kultur Kontinu (Waites. sulit dibedakan antara sel yang hidup dan mati jika menggunakan counting chamber tanpa teknik khusus (Prescott. 2001). dkk. Populasi mikroba harus cukup besar. Fig 2. di mana laju pertumbuhan mikroba sama dengan jumlah mikroba yang dikeluarkan (Waites. 1.

dkk. Filter lalu ditempatkan pada medium agar atau pada suatu tempat yang telah diberi media liquid dan diinkubasi hingga tiap sel membentuk koloni-koloni yang berbeda. Arus listrik dialirkan melalui lubang. bisa saja sejumlah bakteri yang melakukannya. Kelemahannya adalah. 2002). Jika coloni terlalu banyak. karena bakteri tersebut bisa mengalami kerusakan dan tidak bisa melakukan reproduksi. Bakteri yang telah tersebar tadi kemudian membentuk koloni-koloni yang tersebar.1 mL inokulum dituangkan ke dalam cawan. hambatan listrik terbentuk dan sel pun dihitung (Prescott. Selain itu. Inokulum disebar secara uniform dengan menggunakan glass rod yang steril. Teknik ini berguna khususnya dalam menganalisa sampel akuatik (Prescott. Plate count bisa dilakukan baik dengan cara pour plates maupun spread plates. Ketika agar memadat. dkk. Coulter Counter kurang cocok digunakan untuk menghitung bakteri. Untuk menghindari masalah-masalah itu. 4. maka pada inokulum yang jumlah mikrobanya banyak perlu dilakukan pengenceran (Prescott. Prosedur pour plates yaitu mula-mula suspensi bakteri yang telah diencerkan dimasukkan ke dalam cawan Petri sebanyak 1 mL atau 0. dkk. Selain metode di atas. Pada teknik ini 0. biasanya digunakan teknik spread plates. Coulter Counter Mikroorganisme berukuran besar seperti protozoa. 3. 2002). maka beberapa sel tidak dapat tumbuh. karena adanya kemungkinan terganggu oleh partikel kecil. suatu sampel yang mengandung mikroba dilewatkan pada filter membran.2. algae. dkk. sehingga mampu menangkap bakteri. Namun asumsi ini tidak selamanya benar. 2002). dan ragi nonfilamen bisa dihitung menggunakan alat hitung elektronik seperti Coulter Counter. Dengan teknik ini. Lalu medium agar dituangkan ke dalam cawan dan diaduk dengan merata. Metode ini mengasumsikan bahwa satu individu mikroba mampu bereproduksi dan membentuk koloni. koloni akan tumbuh di dalam atau di permukaan nutrien agar. Filter ini memiliki lubang pori yang kecil. 2002). pembentukan filamen. hanya beberapa koloni saja yang dapat ditumbuhkan dalam satu plate. 2002). Suspensi mikroba dipaksa masuk melalui sebuah lubang kecil.1 mL. 2002). karena satu koloni bisa saja dibentuk tidak hanya oleh 1 bakteri. 2002). filter membran juga bisa digunakan untuk menghitung mikroba secara langsung. hasil perhitungan plate count biasanya dinyatakan sebagai colony-forming unit (CFU) (Prescott. Biasanya plate yang digunakan adalah plate dengan 25-250 koloni. Sampel mula-mula disaring melalui membran polikarbonat hitam untuk memberikan background yang 37 . sehingga jumlah mikroba mula-mula sama dengan jumlah koloni yang ada saat ini. Selain itu metode ini tidak bisa membedakan antara sel hidup dan sel mati (Prescott. Oleh karena itu. Agar koloni berada dalam range ini. sehingga mudah dihitung (Prescott. dkk. dkk. cawan kemudian diinkubasi. dkk. 2002). Media-media tertentu dapat digunakan agar mikroorganisme yang dihitung bisa spesifik. Tiap kali sel mikroba melalui lubang. dan sebagainya. Plate Count: Pour Plates dan Spread Plates Plate Count adalah suatu metode untuk menghitung mikroba yang terdapat pada plate. Teknik Filter Membran Pada teknik ini. Jumlah koloni yang terbentuk merupakan jumlah mikroorganisme yang tersaring pada filter. dan elektrode dipasang di kedua sisi lubang untuk mengukur hambatan listrik. koloni yang terbentuk di dalam medium agar bisa saja tidak terlalu kelihatan. sehingga mempengaruhi perhitungan (Prescott. Perhitungan pun bisa dilakukan (Prescott. dkk. Jika plate count dilakukan. Kelemahan dari pour plate ini adalah tidak cocok digunakan pada bakteri yang tidak tahan panas ketika medium agar dituangkan ke dalam wadah.

C. Pada metode ini. Menghitung Jumlah Substansi Tertentu Jika jumlah substansi dalam tiap sel sama antara satu dengan yang lain. maka semakin keruh penampakannya dan semakin sedikit sinar yang diteruskan olehnya. Secara teori. Jika material-material tersebut ditumbuhkan mikrobanya pada suatu medium solid. lalu jerat ini digosokkan pada medium nutrien membentuk pola. air. Kelemahannya metode ini adalah terlalu memakan waktu dan tidak terlalu sensitif. 2002). Turbidimetri dan Spektrofotometri Metode lain yaitu dengan memanfaatkan fakta bahwa sel mikroba menyebarkan sinar yang mengenainya. pertumbuhan populasi juga ditandai dengan pertambahan massa total sel. Kelemahan teknik ini adalah tidak dapat dibedakan antara sel hidup dan sel mati. dkk. 1. Pada absorbansi rendah hubungannya dengan konsentrasi mikroba hampir linear. Metode isolasi yang seringkali digunakan untuk mendapatkan kultur murni adalah metode streak plate. Mikroba harus dipisahkan sejauh mungkin agar koloni yang tumbuh bisa terpisah secara jelas antara satu dengan yang lain (Tortora. Sel terakhir yang lepas dari jerat jarajnya cukup jauh dari mikroba yang lainnya 38 . suatu koloni yang tumbuh berasal dari satu sel atau spora. misalnya acridine orange dan dihitung dengan mikroskop epifluorescence.bagus untuk menentukan objek fluorescent. sampel dari suatu sel yang didapatkan dari suatu medium dengan volume tertentu dapat dianalisa dengan menghitung jumlah protein atau nitrogennya. makanan. maka koloni-koloni akan tumbuh persis sama dengan organisme induknya. mengandung tidak hanya satu jenis mikroba. 2. Tingkat sebaran sinar itu bisa ditentukan dengan spektrofotometer. suatu jerat inokulasi yang steril dicelupkan ke dalam kultur yang mengandung lebih dari satu jenis kultur. sehingga perlu sentrifugasi kultur dalam jumlah yang cukup besar (Prescott. 2001). Teknik ini sangat cocok untuk menentukan jumlah fungi. dan jumlah ATP dapat digunakan untuk menghitung massa mikroba hidup (Prescott. Selain itu. Koloni mikroba seringkali memiliki penampilan yang bisa dibedakan antara satu dengan yang lain. Besarnya pantulan sinar sebanding dengan massa sel yang dikenai sinar. maka total jumlah substansi itu berhubungan langsung dengan massa sel mikroba. 2002). dikeringkan di oven. 3. Metode Berat Kering (Dry Weight) Salah satu metode yang sering digunakan adalah dengan penentuan berat kering mikroba (microbial dry weight). Sel yang tumbuh di medium liquid dikumpulkan dengan sentrifugasi. dkk. Semakin besar konsentrasi mikroba. dkk. lalu dicuci. penentuan klorofil dapat digunakan untuk menghitung populasi algae. 2002). Namun sekarang terdapat reaagen fluorescent yang mampu membedakan antara sel hidup dan sel mati. Begitu pola terbentuk. sehingga kelemahan tadi dapat teratasi (Prescott. Contohnya. asalkan populasi mikroba terdapat dalam jumlah yang cukup untuk memberikan turbiditas yang dapat dideteksi (Prescott.  Metode penghitungan tidak langsung (Indirect Method) Selain pertambahan jumlah. dkk. dan ditimbang. seperti tanah. Sehingga pertumbuhan populasi dapat diukur dengan mudah dengan spektrofotometer. mikroba akan lepas dari jerat dan masuk ke medium. Kebanyakan dari pekerjaan bidang mikrobiologi membutuhkan kultur yang murni. Mikroba lalu diberi warna dengan suatu fluorescent. MENDAPATKAN KULTUR MURNI Kebanyakan sampel yang diambil dari alam. dan sebagainya. dkk. 2002).

Berdasarkan hal tersebut. Suhu maksimum yaitu suhu yang apabila berada di atasnya maka pertumbuhan tidak terjadi (Waites. dkk. kompenen sel menjadi tidak aktif dan rusak. 2001). yang ditemukan dalam air drainase dari tambang batubara dan mengoksidasi sulfur untuk membentuk asam sulfat dapat bertahan pada nilai pH kurang dari 1 (Waites. salah satu jenis bakteri chemoautotrophic. dkk. Sebaliknya apabila suhu turun. ada beberapa bakteri yang disebut acidophiles yang sangat toleran terhadap keasaman. dkk. dkk. dkk. 2. maka suhu yang berkaitan dengan pertumbuhan mikroba digolongkan menjadi tiga. 2001). 3. (Disebut juga suhu inkubasi). 2001). 2001). Metode sterak plate cocok digunakan ketika jumlah organisme yang akan diisolasi jumlahnya banyak. yaitu : 1. Meskipun demikian. dkk.5 (Waites. 2001). biasanya sekitar pH 5-6 (Waites. 39 .5. Suhu minimum yaitu suhu yang apabila berada di bawahnya maka pertumbuhan terhenti. Suhu dapat mempengaruhi mikroba dalam dua cara yang berlawanan: 1.untuk membentuk koloni murni. dkk. 2001). hal ini menyebabkan mengapa sejumlah makanan. 2001). Bakteri sangat sedikit tumbuh pada ph asam dibawah 4. EFEK DARI KONDISI LINGKUNGAN PADA PERTUMBUHAN MIKROBA  pH ph mengacu pada keasaman atau alkalinitas dari solusi.5 dan 7. Bakteri alkalophiles. sehingga sel-sel menjadi mati (Waites. seperti asinan kubis. memiliki pH optimum antara 8. Suhu optimum yaitu suhu dimana pertumbuhan berlangsung paling cepat dan optimum. tingkat pertumbuhan akan terhenti. bakteri dapat tumbuh dengan baik pada ph normal antara ph 6. maka mikroba jumlahnya harus ditingkatkan dengan pengayaan nutrien sebelum dilakukan metode streak plate (Tortora. banyak diawetkan dari pembusukan oleh asam yang dihasilkan oleh bakteri fermentasi (Waites.5 . acar dan keju . 2. Koloni yang terbentuk lalu bisa dipindahkan ke dalam test tube yang berisi nutrien untuk menumbuhkan kultur yang murni (Tortora. maka kecepatan metabolisme akan menurun dan pertumbuhan diperlambat. akan tetapi pH optimum dari jamur dan ragi umumnya di bawah bakteri. Apabila suhu naik maka kecepatan metabolisme naik dan pertumbuhan dipercepat. contohnya Bacillus dan Micrococcus. Sebagai contoh. Ragi akan tumbuh selama rentang ph lebih besar dari bakteri.  Suhu / Temperatur Suhu merupakan salah satu faktor penting di dalam mempengaruhi dan pertumbuhan mikroorganisme. 2001) D. Jika terlalu sedikit.11. dkk. Apabila suhu naik atau turun secara drastis.

2001). namun masih mampu melakukan pertumbuhan dengan lambat pada temperatur sekitar 0°C. Sebagai contoh. Pyrolobus fumarii memiliki temperatur optimum 106°C dan terus tumbuh hingga 113°C (Waites. Enzim termofil juga memiliki sifat stabil pada temperatur tinggi. ribosom dari termofil bekerja dengan baik pada temperatur tinggi. Ini menyebabkan ikatan hidrogen semakin banyak yang mendukung kestabilan DNA (Waites. hanya dapat tumbuh apabila tidak ada oksigen bebas / tanpa adanya oksigen 3) Anaerob fakultatif: dapat tumbuh baik dengan atau tanpa oksigen bebas. Spora mikroba umunya tahan terhadap panas. rusaknya ribosom. 2001). Beberapa jenis algae. Termofil ekstrim (hiper-termofil) bisa tumbuh pada temperatur 100°C ataupun lebih. Beberapa mikroba jenis ini bertanggung jawab pada pembusukan produk-produk yang didinginkan (Waites. Fig 2.6) Mesofil memiliki temperatur optimum pada range 20-45°C dan temperatur minimum sekitar 15-20°C (Waites. Akan tetapi mereka tumbuh lebih baik apabila ada oxygen. dkk. dkk.  Oksigen Mikroorganisme memiliki karakteristik sendiri-sendiri Mikroorganisme dalam hal ini digolongkan menjadi : 1) Aerobik obligat: 2) Anaerob obligat: di dalam kebutuhannya akan oksigen. 2001). hanya dapat tumbuh apabila ada oksigen bebas. DNA mereka juga tetap terintegritas pada temperatur tinggi. dkk. Mereka tumbuh dengan optimum pada temperatur di atas 20°C. dan rusaknya DNA. denaturasi enzim. dkk. dkk. 2001). dan beberapa bakteri termofil ekstrim memiliki DNA dengan rasio guanin-sitosin yang tinggi. Namun. Psikrofil biasanya memiliki temperatur optimum di bawah 15°C dan organisme ini biasanya mati pada temperatur ruang. dkk. Industrial Microbiology: An Introduction. Molekul ini tetap berbentuk cair pada temperatur rendah di mana membranmembran lain yang mengandung lemak jenuh tidak dapat berfungsi lagi (Waites. Mereka mampu hidup pada temperatur rendah karena membran mereka mengandung banyak lemak tak jenuh. 2001). dkk. Ia memiliki pelapis spora yang tebal dan aktifitas air yang rendah (Waites. dkk. protozoa. Bakteri non-termofil apabila dikenakan temperatur tinggi biasanya menyebabkan kerusakan pada membran sitoplasma. 2001). Psikotrop bisa disebut psikrofil fakultatif. Termofil adalah organisme yang memiliki temperatur optimum di atas 50°C.Gambar 4: Range Temperatur Pertumbuhan Mikroba (Waites. 2001). dan fungi memiliki temperatur maksimum hingga 55°C (Waites. 40 .

Jika tidak didetoksifikasi. Adanya asam aksorbat. namun dapat tumbuh dengan baik meskipun ada atau tidak ada oksigen (Waites. ataupun kalau ada dalam jumlah yang sangat sedikit (Waites. dkk. 2001) 41 . Jika kontak dengan oksigen. Aw= Psolution / Pwater (Waites. dkk. Ketersediaan air bagi mikroorganisme diistilahkan dengan aktivitas air (water activity). sebagian besar organisme akan menghasilkan senyawa-senyawa yang sangat beracun. Aerotolerant: Biasanya mengabaikan oxygen. namun bukan aerotolerant juga memiliki katalase. Lingkungan hipertonik mungkin mengandung air. mereka akan menyerap air. hidrogen peroksida (H2O2) dan radikal hidroksil (OH). 2001). Terdapat 3 enzim yang mampu menetralisir produk-produk di atas. dkk. yaitu superoksida (O2-).Mikroaerofil: dapat tumbuh apabila ada oksigen dalam jumlah kecil. produk-produk ini mampu bereaksi dengan molekul-molekul organik dan menghancurkannya. dkk. dkk. 2001). Mereka bisa tumbuh pada level oksigen 2-10%. Pada konstentrasi oksigen di atmosfer (21%) mereka tidak dapat tumbuh. katalase. 2001). dan beta-karoten juga membantu menghilangkan radikal bebas secara non-enzimatis. 2001). dan peroksidase: Superoksida dismutase superoksida (2O2-) + 2H+ hidrogen peroksida (2H2O2) glutathione peroksidase katalase O2 + H2O2 O2 + 2H2O H2O2 + 2GSH glutathione 2H2O + GSSG glutathione teroksidasi (Waites. Sel yang ditempatkan di larutan hipertonik akan kehilangan air akibat osmosis dan pertumbuhan sel pun terhambat (Waites. Aktifitas air adalah rasio dari tekanan uap dari air dalam larutan dengan tekanan uap dari air murni (Waites. 2001). dkk. Jika mikroba dengan dinding sel yang kaku ditempatkan di larutan hipotonik. namun jumlahnya cukup sedikit. dkk.  Water activity Kebanyakan mikroorganisme mengandung 70-80% air dan membutuhkan sejumlah air bebas untuk melangsungkan beberapa aktifitas metabolik (Waites. Bakteri anaerob oligat tidak memiliki superoksida dismutase dan katalase. yaitu superoksida dismutase. vitamin E. 2001). dan menjadi bengkak. Kebanyakan bakteri aerob. 2001) Bakteri-bakteri aerobik dan organisme lain yang mampu menoleransi oksigen memiliki superoksida dismutase. Mikroba yang tidak memiliki dinding akan terus mengembang dan pecah pada akhirnya (Waites. dkk.

6. 2001). dkk. Bakteri laut teradaptasi pada air laut yang berkonsentrasi tinggi (aw = 0. dkk. 2001). Ada pula mikroorganisme yang mampu memperbaiki DNA mereka yang rusak akibat radiasi (Waites. KONTROL PERTUMBUHAN MIKROBA Pencegahan pertumbuhan mikroorganisme sangat diperlukan di banyak bidang. di mana mereka terkena tekanan tinggi. seperti kesehatan. serta merusak DNA (Waites. o Konsentrasi dari agen anti mikrobial dan intensitas treatment. oksidasi bahan-bahan kimia. Mikroorganisme tidak dapat dimusnahkan secara langsung sekaligus. Beberapa spesies ini tidak tumbuh pada lingkungan di mana terdapat air dalam jumlah besar (Waites. Dan keefektifan pengontrolan dapat dipengaruhi oleh umur mikroba. Kebanyakan baktri tidak dapat tumbuh dengan Aw di bawah 0. 42 . 2001). dkk. o Periode paparan agen pengontrol terhadap mikroba. viskositas medium. bahkan hingga ratusan atm (Waites. Kontrol dapat dilakukan.Spesies mikroba memiliki toleransi yang berbeda-beda terhadap kondisi kering dan tekanan osmosis tinggi. dan hydrated elektron. misalkan saja pada Deinococcus radiodurans memiliki kemampuan alami untuk tahan terhadap radiasi. Beberapa fungi filamentous xerofilik dan ragi osmofilik bisa hidup pada lingkungan di mana Aw bisa mencapai 0. dan tekanan yang lebih tinggi dapat menghambat pertumbuhan mikroorganisme. seperti Halobacterium halobium tidak dapat tumbuh di tempat yang konsentrasi garamnya kurang dari 3mol/L (Waites. Beberapa mikroorganisme. dkk. 2001) E. Radikal bebas ini dapat merusak ikatan hidrogen. Beberapa bakteri juga memiliki pigmen yang dapat mengabsorpsi radiasi. Kebanyakan fungi yang menyebabkan biodeterioration merupakan xerotoleran (dapat tumbuh pada kelembaban rendah). 2001). Radiasi ionisasi. OH. Contohnya mikroorganisme laut adalah termasuk barotolerant. morfologi. 2001). khususnya pada pembentukan dimer thymine. semakin sulit populasi itu untuk dimusnahkan. True halofilik. misalkan saja sinar gamma yang dihasilkan dari eksitasi 60Co mampu menghasilkan radikal bebas. maupun kondisi fisiologisnya. dkk.  Tekanan hidrostatik Di alam.98) dan memiliki enzim yang mampu mengolah ion-ion sodium. banyak mikroorganisme yang tidak pernah diberi tekanan hingga lebih dari 1 atm. dan pengawetan berbagai macam benda.9. Populasi mikroba akan menurun secara eksponensial (Waites. food processing. yaitu dengan membunuh mikroba maupun mencegah pertumbuhan mikroba (Waites. Beberapa hal yang mempengaruhi mudah tidaknya pengontrolan jumlah mikroba: o Ukuran populasi Semakin besar ukuran populasi.  Radiasi Sinar UV. konsentrasi nutrien) (Waites. dkk. dkk. H. dkk. 2001). 2001). Namun ada beberapa mikroorganisme yang bersifat barotoleran. yang cukup berbahaya pada 260 nm mampu menyebabkan kerusakan pada DNA. o Komposisi populasi Tiap mikroorganisme memiliki sensitivitas yang berbeda-beda. o Kondisi lingkungan (pH. o Temperatur Pada umunya semakin tinggi temperatur akan meningkatkan efektifitas dari agen pengontrol.

Radiasi UV cukup efektif. Pengurangan kadar air Metode ini dilakukan dengan menghilangkan kandungan air dari suatu bahan dengan cara pemanasan. benda yang akan disterilisasi diinkubasi pada 37°C untuk memberi kesempatan pada endospora untuk tumbuh menjadi sel.  Dry heat Dilakukan pada hot air oven pada 160°C selama 2 jam. 2001). serta bisa menghancurkan beberapa vitamin (Waites. air. organisme biasanya tidak terbunuh. namun diduga listrik mampu merusak membran melalui elektroporasi (pembentukan pori dalam membran) (Waites. namun mayoritas tidak dapat tumbuh atau tumbuh dengan amat sangat lambat pada temperatur di bawah 5°C (Waites. 2001). dan sebagainya. X. Panas Jika panas digunakan untuk mengontrol pertumbuhan mikroba. bubuk. baik temperatur pemanasan maupun waktunya harus benar-benar diperhatikan. diikuti dengan perebusan kedua untuk membunuh sel-sel tersebut (Waites. sesudah direbus. Untuk membunuh endospora. dkk. Perebusan air atau pemanasan benda padat dalam air mendidih pada 100°C selama 30 menit tidak menjamin sterilitas. karena tiap jenis mikroba memiliki ketahanan sendiri-sendiri. 5. namun tidak bisa membunuh semua endospora. 4. 43 .  Moist heat Metode ini dilakukan dengan mengalirkan uap dalam tekanan tinggi untuk mencapai temperatur 121°C selama 15 menit. Proses ini cukup mahal. Bisa digunakan pada benda-benda gelas. Diterapkan pada proses fermentasi untuk sterilisasi wadah. Kontrol pertumbuhan mikroba dengan panas bisa dicapai dengan cara:  Insinerasi Pembakaran dengan metode ini bisa mencapai temperatur 500°C dan mampu menghancurkan mikroorganisme. 2001). Electric field treatment Metode ini dilakukan dengan cara memberi aliran listrik 15-20 kV/cm pada bahan yang akan disterilisasi hanya selama beberapa milidetik atau bahkan kurang dari itu. Pendinginan Dengan pendinginan atau pembekuan. Radiasi digunakan secara luas untuk mensterilisasi benda-benda seperti cawan Petri. Biasanya digunakan pada pengolahan limbah padat. penambahan gula ataupun garam (Waites. yaitu secara fisik dan kimia:  Kontrol pertumbuhan mikroba secara fisik 1. Bahan-bahan makanan bisa diberi radiasi untuk meningkatkan masa penyimpanannya hingga 500% dengan menghancurkan mikroorganisme pembusuk. bahkan buah dan sayuran.Kontrol pertumbuhan mikroba ada 2 cara. 2001). dkk. namun ia tidak mampu menembus gelas. Radiasi Gelombang microwave. serta media kultur. Sehingga yang sering digunakan adalah sinar X dan gamma. freeze-drying. 2. 3. UV. Mekanisme dari penonaktifan sel dengan metode ini belum diketahui. pipa penghubung. Ia memang mampu membunuh sel. dan gamma dapat digunakan untuk memusnahkan mikroorganisme. dkk. logam. dan tidak semua organisme bisa terbunuh (akibat sifat dari bahan itu dan dosis yang diberikan). dan bahan-bahan lain. dkk. 2001). dkk.

yaitu agen yang tidak membahayakan kulit dan membran mukus. namun tidak bisa dimakan. 2001). dan SO2. dan sebagainya. o Senyawa-senyawa lain yang aman bagi manusia dan hewan yang tidak dapat dimasukkan dalam kategori di atas (Waites. asam amino. karena antara sel bakteri (prokariot) dan sel inangnya (eukariot) terdapat perbedaan yang cukup jauh. Tidak cocok digunakan pada jaringan hidup. yaitu ia harus mampu menghambat atau membunuh mikroorganisme patogen. dkk.  Kontrol pertumbuhan mikroba secara kimia Agen kimia antimikroba dapat digunakan untuk membunuh mikroorganisme atau menghambat pertumbuhannya. 2001). vitamin. dan fenol (Waites. namun tidak membunuh sporanya. sehingga ultrafiltrasi dibutuhkan untuk menghilangkan virus (Waites. senyawa klorin. dan adsorpsi. 2001). Ada 3 tipe filtrasi:  Depth filter Yaitu filter dengan serat-serat tebal atau bergranula yang menghilangkan mikroorganisme dengan screening fisik. 2001). dan sebagainya). namun tidak memberikan dampak terhadap inangnya. sitrat. Disinfektan adalah agen yang membunuh mikroba. Ada 3 kategori untuk bahan pengawet tambahan. Hal paling penting dari agen antimikroba yang akan digunakan adalah selektifitasnya. dkk. Contohnya adalah larutan iodine. terdiri dari asam organik lainnya (benzoat. 2001). yaitu agen yang digunakan untuk menghambat pertumbuhan mikroorganisme pada produk-produk yang mungkin ditelan. hasil yang diperoleh mungkin saja tidak bebas virus.  Antimicrobial chemotherapy Antimicrobial chemotherapy adalah metode untuk mengontrol atau memusnahkan mikroorganisme penyebab penyakit di dalam jaringan hidup. Filtrasi Filtrasi digunakan untuk menghilangkan mikroba dari liquid atau gas.  Membrane filter Filter tipis dengan ukuran pori tertentu. dkk. berdasarkan FDA. dkk.  Antiseptik dan disinfektan Antiseptik adalah pencegahan infeksi jaringan hidup. 44 . entrapment. hipoklorit. Ini dapat dicapai dengan menggunakan agen antiseptik microbiocidal. biasanya 0. propionat. dkk. sehingga selektifitas agennya menjadi lebih efektif (Waites. Metode ini diterapkan pada sterilisasi antibiotik dan obat-obatan lain. Agen ini lebih mudah digunakan pada penyakit yang disebabkan oleh bakteri. Terdiri dari: o Asam organik alami (laktat. dkk.  High efficiency particulate air (HEPA) Biasanya digunakan pada containment room untuk mensterilisasi udara yang terdapat di dalam ruangan itu (Waites. ester dari para-hydrobenzoic acid). alkohol.4 µm.6.  Pengawetan antimikroba untuk makanan dan produk-produk terkait Senyawa yang digunakan kebanyakan agen statik. Contohnya adalah klorin. 2001). di mana mikroorganisme tidak dapat lewat. dan senyawa amonium kuartener (Waites. Namun. dan sebagainya) o Substansi yang diklasifikasikan sebagai GRAS (generally regarded as safe).2 atau 0.

Antimicrobial chemotherapy terdiri dari: o Bahan kimia sintetis Agen chemotherapy sintesis adalah inhibitor kompetitif. membran sangat penting untuk transpor nutrien dan produksi energi. LAMPIRAN PERTANYAAN 1. biasa disebut antimetabolit. manakah yang merupakan cara yang paling efektif? Cara-cara yang sudah disebutkan sebelumnya merupakan cara-cara menghambat pertumbuhan mikroorganisme dalam kondisi-kondisi tertentu. Struktur ribosom antara prokariot dan eukariot berbeda. d. Contohnya adalah sulfonamida. dkk. maka mikroba akan terbunuh. Contohnya adalah rifamisin dari spesies Streptomyces (Waites. Sulfonamida berperan sebagai substrat untuk enzim yang seharusnya digunakan untuk menyintesis THF. dan produk-produk dari Streptomyces bekerja dengan cara menghambat inisiasi sintesis protein. Polymyxin adalah satu-satunya senyawa yang mampu menyerang hanya membran bakteri. Penghambat sintesis protein Antibiotik tipe ini mampu menyerang dengan berbagai cara. Penisilin menghambat sintesis peptidoglikan yang berujung pada tidak terbentuknya dinding sel dari mikroba yang diserang. Golongan makrolida. 2001). Jika membran rusak. salah satunya menyerang ribosom pada saat translasi RNA. sehingga agen kimia tipe ini sulit untuk dibuat secara spesifik menyerang mikroba. Namun. o Antibiotik Antibiotik adalah obat yang dihasilkan oleh mikroorganisme untuk mengatasi infeksi mikroba. membran eubakterial dan eukariot memiliki struktur yang sama. dkk. 2001). Contohnya adalah penisilin. b. pertumbuhan mikroba terhambat (Waites. 2001). Membran terluar dari bakteri Gram negatif juga berperan sebagai pelindung. dkk. kanamisin. c. dkk. dkk. sehingga selektifitas agen bisa dicapai. sehingga fungsi membran terganggu (Waites. Akibatnya. Antibiotik bekerja dengan 4 cara: a. Salah satu contohnya adalah penisilin yang dihasilkan oleh Penicillium (Waites. Renanto Pandu Wirawan (115061107111009) Di antara cara-cara menghambat pertumbuhan mikroba. Penghambat membran sel Pada bakteri. seperti eritromisin dan oleandomisin bekerja dengan cara menghambat translokasi dari ribosom (Waites. Serangan terhadap asam nukleat Beberapa antibiotik mampu menghambat pertumbuhan sel dengan cara mengganggu sintesis DNA atau RNA. 2001). Golongan aminoglikosida. Cara kerjanya adalah polymyxin mengikatkan dirinya dengan membran mikroba. Akibatnya mikroba menjadi rentan terhadap tekanan osmosis yang dapat membunuh mikroba itu (Waites. Menghambat sintesis dinding sel Penghambat pembentukan dinding sel biasanya menyerang mikroba pada saat pembentukan peptidoglikan. dkk. 2001). Jadi dari semua cara itu. masing-masing memiliki penerapan sendiri-sendiri…… 45 . Ia bisa berperan sebagai pembunuh atau penghambat patogen. seperti streptomisin. Senyawa ini mampu menghambat pembentukan tetrahydrofolic acid (THF) yang cukup penting untuk bakteri. 2001).

4. 3. apa saja yang mempengaruhi kepekatan air? Jawab: Yang mempengaruhi kepekatan air adalah jumlah zat terlarut di dalamnya. maka semakin kecil vapor pressure dari larutan itu.05 mm. Dobita Amanda Feliciana (115061100111021) Pada gambar counting chamber yang telah ditunjukkan. Dengan cara inilah maka pertumbuhan mikroba dapat dijaga pada fase eksponensialnya. Semakin banyak zat terlarut. 1 bakteri melewati sensor lebih dari 1 kali. untuk mengatasinya maka pada fermentor diberi suatu saluran dimana jika terjadi overflow pada fermentor. Kotak-kotak besar yang berada di bagian terluar berukuran 1x1 mm. Apakah mungkin. Hal ini berakibat pada semakin pekatnya larutan itu. Menghitungnya ini mamakai mikroskop. suspensi bakteri yang akan dihitung dipaksa masuk ke dalam lubang dengan cara memberi hembusan angin atau aliran fluida melalui lubang itu. sehingga ukuran kotak-kotaknya pun harus sangat kecil. Di dalam wadah itu mikroba diberi nutrisi secara terukur dan kontinu. 46 . Oleh karena itu. Jawab: Pada continuous culture. Jika mikroba terus-menerus diberikan nutrisi. maka mikroba tidak akan mungkin bisa masuk kembali ke dalam lubang itu jika sudah melewatinya. mikroba dapat melakukan pertumbuhan dan melakukan metabolisme dengan terus-menerus. yaitu dengan cara mempertahankan fase eksponensialnya. bakteri disensor saat melewati electrode.Tolong jelaskan lagi pertumbuhan mikroba pada proses continuous culture! Terutama proses yang terjadi pada fermenter. Inggit Kresna Maharsih (115061100111005) Pada proses perhitungan coulter counter. sehingga akan mengurangi water activity larutan itu. terdapat garis-garis yang tebal dan yang tipis.05 mm kalau pada counting chamber ini. mikroba ditempatkan ke dalam suatu wadah yang disebut fermentor. yaitu 0. namun itu adalah garis tipis-tipis yang jajraknya berdekatan. Itu apa perbedaannya? Jawab: Itu bukan garis yang tebal. dan apakah hal tersebut mengurangi keakuratan perhitungan bakteri? Jawab: Pada coulter counter. Nutrisi diberikan secara terukur supaya fase pertumbuhan mikroba bisa dibuat optimal. sehingga terlihat seperti garis tebal. Febrika Larasati (115061101111001) Pada water activity. Sedangkan garisgaris tipis yang saya sebutkan tadi itu lebarnya 0. Rizka Dwi Octaria (115061101111017) . Dengan adanya nutrisi secara kontinu itu. Tujuan dari pemberian garis itu adalah untuk mempermudah penghitungan mikroba.2. produk metabolisme. 5. dan nutrisi pada fermentor. saluran tersebut dapat membuang kelebihan mikroba. maka suatu saat akan terjadi overload pada fermentor. Dengan aliran ini.

Jika makanan mulai membusuk. Jika mikroba selain jenis alkalophiles ditempatkan pada pH ini. Freshsya Zatalini (115061100111003) Dalam kehidupan sehari-hari kapan kita menggunakan cara menumbuhkan mikroba scara batch culture maupun continuous culture? Jawab: Untuk batch culture.5 disebut sebagai bakteri alkalophiles. lebih akurat memakai metode apa? Dan yang paling sering digunakan metode apa? Jawab: Dari cara-cara menghitung mikroba tersebut. tetapi apakah arus listrik yang digunakan itu tidak menghambat pertumbukan mikroba? Kemudian bagaimana agar cara penghitungan ini tidak menghambat pertumbuhan mikroba? Jawab: Arus listrik yang digunakan pada coulter counter ini kecil sekali. Lubang yang digunakan untuk melewatkan mikroba ukurannya sangat kecil. 47 . maka mikroba kehabisan nutrisi dan lambat laun akan mati. Pada filter membran. Jika ada makanan yang tidak diawetkan kita biarkan begitu saja. yaitu mulai dari stationery phase hingga death phase). ia mula-mula masih dalam kondisi baik. sehingga kita tidak menjumpainya secara alami. maka mikroba tersebut dapat melakukan pertumbuhan dan metabolisme secara normal (secara normal yang dimaksud adalah. Ini dikarenakan metode ini merupakan direct counting method. 6. Jika makanan sudah dibusukkan semuanya. berarti mikroba sudah mulai aktif dan memasuki exponential phase. Mar‟atus Sholihah (115061100111019) Pada metode coulter counter digunakan arus listrik untuk menghitung jumlah mikroba. 8. Suatu saat jumlah makanan yang dibusukkan sudah agak banyak. mikroba dapat diberi warna dengan fluorescent.5-11. bakteri ini melakukan pertumbuhan seperti biasanya. menandakan death phase. Ridhani Rida Ramadhan (115061100111007) Dari cara menghitung mikroba tersebut. 7. kita banyak sekali menjumpainya dalam kehidupan sehari-hari. Contoh yang paling sering kita jumpai adalah pembusukan makanan. hanya beberapa mV saja. ini menandakan mikroba itu masih dalam lag phase. apa contohnya? Jawab: Mikroba yang dapat tumbuh pada pH 8. sehingga aman digunakan untuk perhitungan. sehingga arus listrik yang dibutuhkan juga kecil. yang berarti tahan basa. dan juga mampu membedakan antara mikroba yang mati dengan mikroba yang masih hidup. yang paling akurat adalah metode filter membran. Untuk continuous culture kita sulit menjumpainya dalam kehidupan sehari-hari. Jika mikroba jenis ini ditempatkan pada kisaran pH seperti di atas.- Bagaimana pertumbuhan mikroba pada pH 8. sehingga pertumbuhan mikroba pun terhambat dan memasuki stationery phase. Arus listrik yang sekecil ini kebanyakan tidak dapat membunuh bakteri. Contohnya yaitu Bacillus dan Micrococcus. karena pertumbuhan ini adalah pertumbuhan yang sebelumnya sudah dikondisikan oleh manusia untuk tujuan tertentu (misalnya industri). Bahan kimia itu mampu memberi warna yang berbeda antara mikroba hidup dan mati.5. maka ia tidak akan tahan sehingga ia akan mati.5-11.

Dian Nita Citra Dewi (115061101111013) Jelaskan tentang cara kontrol kebutuhan oksigen pada jenis-jenis mikroba. yaitu produk metabolisme yang dihasilkan spesifik tiap jenis mikroorganisme. dan hal ini dapat diketahui menggunakan metode-metode perhitungan mikroba seperti yang telah diuraikan di atas. Adakah ciri-ciri mikroba yang kekurangan atau kelebihan oksigen? Jawab: Cara kontrol kebutuhan oksigen yang paling mudah adalah dengan menggunakan regulator udara. pertumbuhan mikroba akan mengalami hambatan. (115061100111007) Pada slide grafik pertumbuhan mikroba disebutkan idiophase. 12. grafik pertumbuhan juga dibagi menjadi dua. yaitu tropophase dan idiophase. Jika oksigennya tidak sesuai dengan kebutuhannya. sedangkan membrane filter bentuknya berupa lempengan yang memiliki lubang-lubang mikro. Oleh karena itulah pada grafik dituliskan bahwa idiophase hanya ada pada mikroorganisme tertentu. Bedanya. selain lag phase hingga death phase. depth filter bentuknya lebih tebal daripada yang membran. Apa yang dimaksud dengan idiophase? Dan kenapa hanya berlaku pada beberapa organisme? Jawab: Pada grafik di atas. Jadi dari penampilannya. Sitanggang (115061100111015) Apa beda paling konkrit antara depth filter dan membrane filter? Jawab: Depth filter dan membrane filter sama-sama merupakan alat untuk menyaring mikroba. Sedangkan idiophase adalah fase di mana mikroorganisme menghasilkan metabolit sekunder.G. dsb).9. Untuk mikroba non-patogen (misalnya mikroba pada makanan) jika ia resisten terhadap bahan kimia tertentu. Alfonsina Abat Amelenan Torimtubun (115061100111027) Bagaimana cara mengatasi penghambatan mikroba agar tidak mengganggu (misal pemberian bahan kimia untuk makanan. 11. Queen G. diasinkan. maka satu-satunya cara untuk mengatasinya adalah dengan membuat bahan kimia lain atau antibiotik yang mampu membunuh mikroba tersebut. Suatu mikroba kekurangan atau kelebihan oksigen dapat dilihat dari pertumbuhannya. 10. Mutia Dhana F. kemudian makanan tersebut disterilkan dari mikroba) jika mikroba tersebut telah mengalami evolusi sehingga resisten terhadap bahan kimia tersebut? Jawab: Untuk mikroba patogen yang telah resisten terhadap bahan kimia tertentu. 48 . Tropophase adalah fase di mana mikroorganisme menghasilkan metabolit primer. kalau depth filter bentuknya berupa serabut-serabut. selain dengan memberinya bahan kimia lain bisa pula dengan memberikan perlakuan fisik (dipanaskan.

Jika nutrisi ataupun lingkungan ini dapat diperbaiki atau dikembalikan ke kondisi semula. atau berfluktuasi.13. Meskipun mediumnya terus dipindahkan ketika overflow. naik. namun suatu saat nanti jumlah metabolit yang terakumulasi pada medium akan menjadi jenuh. sehingga akan menghentikan fase eksponensial. atau ada bakteri yang resisten. 15. 14. Jadi bukan bakterinya yang tidak tahan cahaya. 16. Dewi Ariesi R. pasien ditempatkan dalam ruangan yang gelap. (115061105111007) . namun bisa menjadi datar. Mengenai tetanus sendiri. serta yang paling ekonomis? 49 . (115061102111001) Apakah pada continuous culture tidak ada death phase? Jawab: Tentu saja ada. dsb) yang disukai mikroba itu. salah satunya cahaya. namun suatu saat nanti jumlah metabolit yang terakumulasi pada medium akan menjadi jenuh. kondisi lingkungan yang memburuk. maka kurva death phase tidak akan menurun lagi. Cara menanggulangi lingkungan yang buruk agar kurva death phase tidak terus menurun adalah memberikan nutrisi yang sesuai dengan mikroba itu dan mengatur kondisi (temperatur. Teza Nur F. Meskipun mediumnya terus dipindahkan ketika overflow.Bagaimana penanggulangan lingkungan yang buruk agar pada death phase kurva menjadi kompleks? Jawab: Pada umumnya death phase terjadi akibat kehabisan nutrisi. maka otomatis akan menghentikan pertumbuhan mikroba. Berbagai jenis mikroorganisme memiliki sensitivitas sendiri-sendiri terhadap radiasi. karena pada continuous culture fungsinya hanyalah memperpanjang fase eksponensial selama kurun waktu tertentu. karena racun yang dikeluarkan bakteri tetanus menyerang sistem saraf. Winda Fauzi Istiqomah (115061101111003) Kapankah suatu pembelahan sel berhenti pada fermentor? Jawab: Pembelahan sel terjadi pada saat mikroba dalam fermentor brada dalam fase eksponensial. sehingga pasien menjadi sensitif terhadap berbagai macam rangsangan. tekanan. sehingga akan menghentikan fase eksponensial yang bisa berujung pada death phase. Apakah penyataan tersebut benar? Jawab: Cahaya adalah salah satu bentuk dari radiasi yang berada dalam panjang gelombang cahaya tampak. Kelemahan dan kelebihan metode menghitung mikroba? Dan yang mana yang lebih cepat dan akurat. Jika fase eksponensial terhenti. Afida Khofsoh (115061100111031) Bagaimana tentang kebutuhan cahaya bagi pertumbuhan mikroorganisme? Misalnya saya pernah dengar bahwa pasien yang mengalami infeksi tetanus sebaiknya/harus ditempatkan pada tempat gelap/kurang cahaya agar bakteri yang menyebabkan penyakit tetanus tersebut agar tidak tumbuh lagi.

namun. dan cepat Coulter counter Kelemahan: tidak bisa membedakan mikroba hidup dan mati. tidak bisa membedakan mikroba hidup dan mati. dapat menggunakan substrat yang murah (yang dalam banyak kasus adalah limbah) dan keragaman produknya cukup berpotensi (Waites. A. Bakteri anaerob dapat ditemui pada sungai yang keruh. Untuk fermentor bakteri anaerob harus dikondisikan agar tidak ada oksigen yang masuk ke dalam fermentor. mudah dilakukan Menghitung substansi tertentu Kelemahan: sulit dilakukan Kelebihan: hasilnya akurat 17. Untuk penanganannya. Sejarah yang memicu perkembangan pemanfaatan mikroorganisme berawal dari proses fermentasi sederhana yang dahulu terlibat dalam produksi susu fermentasi dan minuman beralkohol (anggur) yang berkembang ribuan tahun lalu. Saluran itu bisa diberi regulator jika oksigen yang diberikan harus terukur. baru sekitar kurang dari 150 tahun lalu dasar ilmiah dari proses tersebut diperiksa. tidak bisa langsung dilakukan perhitungan Kelebihan: mudah. sampah. Saluran tempat pertukaran udara bisa diberi suatu regulator yang mencegah udara memasuki fermentor. industri tape. dan bahan-bahan organik non-xenobiotik lainnya semuanya dilakukan oleh bakteri aerob. Sharfina Widyaningrum (115061105111003) Aplikasi bakteri aerob dan anaerob dalam kehidupan sehari-hari apa? Penanganan khusus bakteri aerob dan anaerob dalam industri bagaimana? Jawab: Bakteri aerob dapat ditemui dengan mudah dalam kehidupan sehari-hari. membutuhkan mikroba dalam jumlah besar. mempunyai kecepatan tumbuh tinggi.. pembusukan makanan. dan Kelahiran dari mikrobiologi industri sebagian besar dimulai dari studi Pasteur. dan industri-industri lain yang proses produksinya membutuhkan mikroba. dan murah dilakukan Dry weight Kelemahan: membutuhkan waktu lama. tidak bisa membedakan antara mikroba dan benda mati Kelebihan: mudah dan cepat dilakukan Plate count dan membrane filter Kelemahan: tidak bisa membedakan mikroba hidup dan mati.o   o   o   o   o   o   Counting chamber Kelemahan: tidak bisa membedakan mikroba hidup dan mati Kelebihan: mudah. 50 . Mereka terbukti berguna karena mereka relative mudah untuk dibudidayakan. fermentor yang menggunakan bakteri aerob diberi saluran atau lubang untuk pertukaran udara. tidak bisa membedakan antara mikroba dan benda mati Kelebihan: cepat. murah. 2001). Sejarah Awal Perkembangan Mikroorganisme Industri Kebanyakan mikroorganisme digunakan secara ekstensif untuk membantu menghasilkan produk dan jasa. sulit dilakukan Kelebihan: murah Turbidimetri dan spektrofotometri Kelemahan: tidak bisa membedakan mikroba hidup dan mati. koloni yang terbentuk belum tentu berasal dari satu sel.

sebagian besar mikroorganisme terlepas dari asal-usul mereka. Penggunaan kultur murni untuk fermentasi pertama kali dilakukan tahun 1883 dengan menggunakan ragi yang telah diisolasi oleh Hansen. 2001 dan Okafor. Hal tersebut dilakukan untuk memenuhi kebutuhan akan mikroorganisme bagi kepentingan industry. Selain itu Pasteur juga mencatat bahwa organisme tertentu dapat merusak bir dan anggur. Pasteur menemukan mikroorganisme yang berbeda. atau dapat juga mendapatkan mikroorganisme yang cocok dengan koleksi kultur (cultur collection). sebagai ragi Carlsberg No. jika sebelumnya dipanasi dulu selama beberapa menit pada suhu 50-60oC. Beberapa proses telah dikembangakan selama 20 tahun terakhir yaitu melibatkan rekombinan mikroorganisme dan teknologi rekayasa genetika. pada tahun 1857 akhirnya Pasteur menunjukkan bahwa fermentasi alcohol dalam produksi bir dan anggur adalah hasil dari aktivitas mikroba. Denmark. Dengan meneliti anggur yang baik dan anggur yang kurang bagus. muncul beberapa kemajuan penting seperti adanya teknik pengembangan kultur murni oleh Hansen di Brewery Carlsberg.Pasteur berkeyakinan bahwa produk fermentasi anggur merupakan hasil mikroorganisme yang ada. bukan fermentasi yang menghasilkan mikroorganisme sebagaimana yang dipercaya pada waktu tersebut. karena akibat dari modifikasi oleh peningkatan strain secara konvensional dengan salah satu cara yaitu mutagenesis. Mikroorganisme tertentu mendominasi anggur yang bagus sementara mikroorganisme tipe lain mendominasi anggur yang kurang bagus. obat dan kosmetik oleh FDA ( Food and Drug Administration) Amerika. Fermentasi industry biasanya lebih memilih menggunakan mikroorganisme GRAS ( generally regarded as safe). 2001). yang ditandai dengan banyaknya industri strain yang didirikan. Proses ini dikenal dengan pasteurisasi ( proses pengawetan) yang digunakan secara luas dibidang industri makanan. dan beberapa fermentasi adalah aerobic. 2007). Perkembangan Pemanfaatan Mikroorganisme bagi Industri Dalam kebanyakan kasus. setelah dingin kedalam sari buah tersebut diinokulasi dengan anggur yang berkualitas baik yang mengandung mikroorganime yang diinginkan.1 (Saccharomyces carlsbergensis) yang sekarang diklasifikasikan sebagai strain Saccharomyces cerevisiae. Namun. yang melibatkan pemilihan secara acak ( random screening) dari banyak mikroorganisme yang telah diisolasi. Jadi bahan yang telah masuk dalam GRAS adalah bahan yang telah diteliti dan diakui aman oleh para ahli dari badan FDA tersebut. Sehingga disimpulkan bahwa mikroorganisme pertama kali diisolasi dari proses fermentasi sebagai kultur alami kemudian dipilih sesuai dengan strain yang berguna (Waites. mikroorganisme spesifik sering diisolasi dari lingkungan alam. Sejak 80 tahun pertama pada abad ke 20. Berikut ini merupakan contoh mikroorganime untuk industry yang telah diklasifikasikan sebagai GRAS (bahan tambahan yang dianggap aman) : 51 . Dia menyimpulkan bahwa pemilihan mikroorganime yang sesuai akan menghasilkan produk yang bagus. Pada tahun 1950. Hasilnya menunjukkan bahwa anggur yang dihasilkan memiliki kualitas yang baik dan tidak mengalami perubahan aroma selama disimpan. Setelah adanya publikasi dari Pasteur. khususnya untuk pembuatan produk makanan. B. Pasteur memecahkan masalah yang timbul di Industri anggur. Sehingga. sedangkan yang lain sudah anaerobik (Waites. pertimbangan regulasi merupakan hal yang paling utama ketika memilih mikroorganisme untuk keperluan industri. GRAS ( generally regarded as safe) merupakan kategori bagi bahan yang ditambahkan ke dalam makanan. Untuk itu dia memusnahkan mikroba yang telah ada dalam sari buah anggur dengan cara memanaskannya.

2001). juga terdapat contoh beberapa mikroorganisme industry beserta produk fermentasi yang dihasilkan. Strategi yang diadopsi untuk mengisolasi mikroorganisme industry yang cocok dari lingkungan dapat dibagi menjadi 2 tipe yaitu pendekatan „shotgun’ dan pendekatan „objective’ ( Waites. a) a) b) c) 52 . Jadi ketika industry memilih menggunakan mikroorganisme yang baru. membutuhkan persyaratan untuk proses dan persetujuan untuk produk. tanah. (Lihat lampiran).2 Mikroorganisme kategori GRAS. C. sampel dari mikroorganisme bebas atau kelompok mikroorganisme lainnya dikoleksi dari berbagai habitat seperti materi tanaman. ( sumber : Waites.Tabel 4. Selain itu. Hasil dari isolasi ini kemudian dipilih untuk mendapatkan sifat mikroorganisme yang diinginkan (Waites. dan khususnya berasal dari habitat alam atau habitat buatan manusia. 1986). Metode Isolasi Mikroorganisme dari Lingkungan Isolasi merupakan salah satu cara untuk memisahkan atau memindahkan mikroba tertentu dari lingkungan tertentu. hewan. sehingga hal tersebut lebih ketat terkait biaya yang jauh lebih tinggi. 2001) Mikroorganisme kategori diatas. biasanya tidak memerlukan pengujian yang terlalu lama jika kondisi budidaya yang digunakan dapat diterima.2001). Kultur murni ialah kultur yang selsel mikrobanya berasal dari pembelahan satu sel tunggal (Pelczar. air dan aliran limbah. sehingga diperoleh kultur murni atau biakan murni. Pendekatan ‘shotgun’ Pada pendekatan ini. sewage.

karena kebanyakan taksonomi saat ini mendukung konsep yang menyatakan bahwa untuk klasifikasi bobot yang sama harus diberikan terhadap masing. pertama-tama sampel ditumbuhkan di media pertumbuhan yang sesuai dan kondisi kultivasi (budidaya) harus disesuaikan untuk mengisolasi mikroorganisme target. dan juga tidak beracun (Waites. Setelah isolasi sebagai kultur murni pada media pertumbuhan padat termasuk pemilihan atau pengembangan media seleksi dan kondisi pertumbuhan yang tepat. mengamati dan mencatat berbagai uji. Kondisi ini dipilih ketika mikroorganisme mempunyai kemampuan untuk melakukan metabolisme dari suatu senyawa (Waites. Pernyataan ini benar. kita dapat menduga mungkin kultur tersebut tidak murni. ketika mencoba mengisolasi organism yang dapat menurunkan (mendegradasi) atau mendetoksifikasi suatu senyawa spesifik. Prosedur isolasi dan pemilihan ini lebih mudah diaplikasikan untuk mencari mikroorganisme tunggal. senyawa inhibitor. Penetapan nama ilmiah Internasional yang tepat terhadap mikroba didasarkan pada sistem penamaan „Binomial Nomenklatur’ Carolus Linoleus ( Ketchum. Langkah awal seringkali membunuh atau menekan proliferasi organism umum dan mendorong pertumbuhan mikroorganisme yang langka. Namun. tingkat aktivitas atau konsentrasi dari target produk per se bukan merupakan perhatian utama. atau seringkali lebih cocok dalam sistem kontinu. dll. Kelompok semacam ini dapat menjadi lebih efisien. tempat sampel yang dipilih adalah tempat (bahan) yang telah diketahui terkontaminasi organism ini. Ketika suatu organism tidak dapat diidentifikasi atau seperti spesies asing. pengambilan sampel diarahkan pada tempat yang spesifik yang sesuai untuk kehidupan mikroorganisme tertentu atau berasal dari komponen yang kemungkinan mengandung mikroorganisme yang diinginkan. pembuatan reagen dan pewarnaan serta ketelitian dalam melakukan. 2001). Perbedaan antara karakterisasi untuk klasifikasi dan identifikasi tidak teretak pada banyaknya uji yang dilakukan. hal ini lebih sulit dilakukan untuk isolasi consortia yang sama-sama memiliki kemampuan/karakteristik yang dicari dan komposisi yang bervariasi seiring waktu. Hasil dari perbandingan ini dapat dianalisa secara laborat melalui perhitungan atau lebih mudah dengan 53 . khususnya meliputi kemampuan untuk mendegradasi senyawa bandel yang kompleks (Waites.1988). tetapi pada hasil dari uji tersebut. seperti stabilitas. atau kita sudah membuat kesalahan (error) dalam observasi dan pencatatan.2001). pada tahap ini. Identifikasi karakteristik suatu organism dapat dilakukan dengan 2 metode pendekatan yaitu konvensional (mikrobiologis) dan pendekatan molekuler. Hubungan antara strain dapat dihitung dan diekspresikan sebagai kemiripan dari karakter positif atau dengan menjumlahkan antara ciri-ciri yang positif dan yang negative. c) aliran air b) Pendekatan ‘objective‟ Pada pendekatan ini. Hal ini mendorong pertumbuhan dari organisme-organisme dengan sifat (ciri-ciri) yang diinginkan dan meningkatkan kuantitas dari organisme target sebelum diisolasi dan diseleksi (screening). produksi dari enzim-enzim spesifik. Klasifikasi merupakan pengelompokan mikroba kedalam kelompok. Namun. Sebagai contoh. mode pemilihan ini hanya cocok untuk kasus dimana sifat yang diinginkan dari mikroorganisme. Namun. Teori identifikasi bakteri merupakan perbandingan antara yang tidak diketahui dan yang diketahui.Contoh habitat untuk pendekatan shotgun : a) tanah. karena pengembangan strain dapat dengan normal digunakan untuk pengembangan secara luas. Isolasi yang dipilih juga harus diseleksi bagi ciri-ciri yang penting lainnya. masing-masing harus diseleksi berdasarkan properti yang diinginkan. Tingkat keakuratan dari identifikasi bergantung pada ketelitian kerga preparasi seperti pembuatan media.2001). Setelah mendapatkan sampel mikroorganisme. Menyuburkan (menumbuhkan) kultur kemungkinan dapat dilakukan dengan sistem kultur batch. memberikan sebuah keuntungan bagi organisme itu sendiri. Karakterisasi terbagi dalam beberapa tahap yaitu klasifikasi dan identifikasi. b)sewage.masing karakter atau ciri.

 Isolasi Mikroorganisme Sampel dari tanah. Teknik Streak Plate. Kultur murni diperoleh ketika hanya satu jenis bakteri yang tumbuh pada plate. garis-garis pada permukaan media hanya digoreskan sekali. Masing-masing teknik memiliki keuntungan dan kekurangan sendiri-sendiri. tiap mikroorganisme menggunakan metode yang berbeda. Brefeld memperkenalkan cara mengisolasi sel tunggal. Sel bakteri kemudian berkembang membentuk koloni. Dengan cara ini. dengan memanaskan media inokulasi. Kultur murni awalnya digunakan saat meneliti jamur. Ini dapat dilakukan dengan meningkatkan temperatur. Berbagai macam teknik telah dikembangkan untuk isolasi kultur murni. dan plate yang mengandung medium diputar sekitar 90°. Pertama-tama. material yang mengandung bakteri disebar di atas permukaan dari medium agar yang padat. kawat nikrom diberi nyala api untuk menghilangkan bakteri-bakteri yang tersisa. tingkat pertumbuhannya harus ditingkatkan dengan menyuburkan bakteri tersebut sebelum isolasi menggunakan teknik goresan. plate diinkubasi pada temperature yang tepat untuk membiarkan bakteri tumbuh. sel bakteri dari sampel menyebar ke bagian-bagian ujung. untuk tujuan identifikasi kita memberikan bobot yang tinggi untuk beberapa karakter karena mempunyai nilai perbedaan yang sangat besar dan memberikan bobot yang kecil untuk yang lain. Dalam teknik ini. Dalam teknik ini. Merupakan metode klasik untuk isolasi bakteri. Hal ini mempelopori ahli bakteriologi dari Jerman. atau bahkan tidak sama sekali untuk karakter tertentu (Ketchum. Teknik aseptik ialah suatu cara menghilangkan kontak dari kultur murni dan membuat medium pertumbuhan menjadi steril dari kontaminan. Setelah digores. 54 . Kawat yang telah diberi nyala api kemudian digunakan untuk membuat goresan kedua yang berfungsi untuk memperkecil populasi bakteri. Anton de Bary dan O Brefeld. dan pour plate menjadi teknik yang sangat diperlukan. Kemudian. teknik streak plate. dengan cara kimia. Untuk memastikan kemurnian dari spesies bakteri tersebut. Maka dari itu. mendeteksi. Tokoh yang mendukung penggunaan kultur murni ini adalah dua orang ahli ilmu jamur. jika bakteri yang diisolasi berada dalam jumlah yang kecil. Kultur murni pertama kali dilakukan sekitar tahun 1870. Metodenya dapat digunakan dalam menghasilkan kultur untuk jamur tetapi tidak cocok untuk bakteri. Di antara prosedur yang digunakan. Teknik Isolasi Kultur Murni Kultur murni didefinisikan sebagai turunan (cloning) dari suatu mikroba. Ada beberapa teknik yang dapat digunakan untuk mengisolasi. Teknik goresan dapat bekerja dengan baik ketika bakteri yang diisolasi berada dalam jumlah yang besar. memutar plate dan membuat goresan tambahan. Ini dilakukan dengan membersihkan dan memberikan desifektan pada area kerja untuk mengurangi jumlah kontaminan. D. Namun. Pengenceran lebih lanjut dari material yang diuji dilakukan dengan membakar kembali kawat nikrom. spread plate.menggunakan komputerisasi. yaitu dengan memisahkan mereka pada medium padat dan membiarkannya berkembang membentuk koloni. Isolasi kultur dilakukan dengan teknik aseptic. inokulum bakteri disebarkan dengan menggunakan kawat nikrom pada permukaan media. seperti menumbuhkan jamur pada media padatan yang ia tambahkan dengan gelatin pada media cair. Namun. Robert Koch dan asistennya yang akhirnya mengembangkan kultur murni untuk bakteri. atau dengan radiasi untuk membunuh mikroorganisme.1988). dan bekerja dengan cepat serta efisien untuk meminimalisir adanya kontaminan. air. dan menghitung kehadiran bakteri dalam sampel dengan efektif. atau makanan mengandung jenis-jenis bakteri yang berbeda. Pemisahan mikroorganisme yang tidak diinginkan perlu dilakukan untuk membuat sebuah kultur murni dari mikroorganisme. tidak ada metode yang dapat digunakan untuk seluruh mikroorganisme. perlu dilakukan pengulangan proses goresan pada plate baru lainnya.

Isolasi koloni ini diambil dan digoreskan pada medium yang telah dipastikan kemurniannya. Dalam metode ini. teknik sebaran dapat digunakan untuk menentukan jumlah bakteri dari jenis tertentu yang ada pada sampel. 2009) (a – d) prosedur urutan goresan untuk mendapatkan koloni terisolasi (e) kultur streak plate yang menunjukkan koloni-koloni yang diisolasi Spread Plate Technique. batang kaca penyebar disterilkan dengan cara dicelupkan dalam alkohol kemudian dibakar dalam nyala api. Metode ini juga digunakan untuk isolasi bakteri. Dalam teknik agar tuang (pour plate). Setelah inkubasi pada temperature yang tepat. Ketika suspense menyebar. 2009) volume yang diketahui dari sampel dipipet secara aseptic pada permukaan medium agar cawan Petri. batang yang telah steril digunakan untuk menyebarkan sampel pada bagian permukaan dari media. sampel diencerkan dan kemudian diencerkan dan ditambahkan sejumlah kecil suspensi mikroba ke dalam tabung yang berisi agar cair pada suhu sekitar 45 °C. Teknik ini digunakan secara luas untuk isolasi bakteri. sekitar 0.1 ml dari sampel yang telah diencerkan ditempatkan pada bagian tengah dari agar dan disebarkan ke permukaan agar menggunakan batang kaca penyebar. bakteri yang tersebar berkembang menjadi koloni-koloni yang terisolasi.Gambar: Teknik streak plate (Sumbali. koloni dari hasil isolasi tampak setelah diinkubasi. Bakteri dan agar cair yang telah tercampur dengan baik dituangkan dengan segera ke dalam cawan Petri menggunakan teknik aseptik dan 55 . Pour Plate Technique. (a) (b) (c) (d) Gambar: Teknik spread plate untuk isolasi bakteri (Sumbali. Tidak seperti teknik goresan. sel bakteri terpisah dan tertanam pada tempat yang berbeda-beda.

atau untuk tujuan-tujuan lainnya. beberapa strain dari spesies yang sama memberikan hasil yang sama dengan prosedur yang sama. tetapi semua spesies memiliki metodenya sendiri-sendiri. Kultur-kultur ini seringkali dibutuhkan dalam bidang pendidikan. waktu. koloni-koloni tunggal kemudian diambil dan digoreskan ke plate lainnya untuk dimurnikan. ketersediaan alat. koloni-koloni tersebar dengan merata dalam medium padat. Teknik pour plate juga membantu dalam menghitung jumlah bakteri yang dapat hidup. . prosedur kultivasi. Setelah kultur dibuat. yang biasa disebut dengan koleksi stok kultur. dan umur dari kultur saat dipelihara. uji hayati. keahlian para pekerja laboratorium. Sebagai contoh. dan tanpa terjadi mutasi. Nutrient ini berasal dari potongan-potongan sayuran atau tanaman. Dalam prosedur ini. organisme yang tidak terkontaminasi.kemudian dibiarkan mengeras dan diinkubasi. dan perlu dipindahkan secara periodik ke medium yang lebih segar untuk menumbuhkan dan memastikan keberlangsungan hidup dari stok kultur. Pemeliharaan kultur dilakukan dalam kondisi yang semirip mungkin dengan isolasi alaminya. industri. Ada beberapa metode pemeliharaan koleksi kultur mikroba. rebusan sayur. garam mineral serta sumber karbohidrat. Media yang kecil biasanya diperlukan untuk memproduksi subkultur karena mereka membuat laju metabolisme organism menurun. Gambar: Teknik pour plate (Sumbali. keberadaan media penyimpanan. Kebanyakan laboratorium mikrobiologi memelihara sejumlah besar strain. hal berikunya yang penting dilakukan adalah menjaga kultur yang telah tumbuh dari adanya kontaminasi. 2009) Pemeliharaan dan Pelestarian Stok Kultur Setelah mikroorganisme diisolasi dan tumbuh dalam kultur murni. Metode ini memberikan keuntungan yaitu murah. mereka disimpan pada suhu 5-8 °C. Metode yang digunakan juga bergantung pada jumlah kultur yang akan dipelihara. Seperti metode lainnya. tidak membutuhkan 56 E. Kenyataannya. Beberapa metode yang umum digunakan dalam koleksi kultur mikroba ialah:  Subculturing (Agar Slants or Microgardening) Metode pemeliharaan bakteri dan jamur yang paling tradisional dan paling sederhana adalah menumbuhkannya pada nutrient agar slants yang dibuat dalam tabung-tabung atau botol-botol. Teknik ini memiliki satu kekurangan yaitu medium cair perlu diperhatikan karena temperature tinggi dari medium cair dapat membunuh beberapa spesies bakteri. dan iklim dari tempat di mana proses tersebut berlangsung. metode pour plate tidak cocok bagi isolasi bakteri psychrophilic. Tujuan utama dari pelestarian kultur adalah untuk memelihara organisme hidup. penelitian. Keberhasilan atau kegagalan dari metode pemeliharaan juga bergantung pada penggunaan media yang tepat.

dan koleksi kultur dapat bertahan selama beberapa tahun. Gambar: Agar slants menunjukkan pertumbuhan jamur (Sumbali. Kultur ditumbuhkan pada slant agar hingga mencapai pertumbuhan yang baik dan spora yang didapat dilindungi menggunakan teknik yang steril. Kerugian dari metode ini adalah dapat menyebabkan perubahan genetic (mutasi) dan adanya bahaya kontaminasi spora. Askomikota. Pertumbuhan yang subur menunjukkan media pertumbuhan yang baik.peralatan yang khusus.  Penyimpanan menggunakan air Ini adalah metode pemeliharaan yang tidak sulit dan murah yang berfungsi untuk menyimpan kultur dari beberapa jamur. Kultur minyak ini dapat disimpan dalam suhu ruang atau pada temperatur rendah (15 °C). Dalam metode ini. Hipomikota. Bubur ini kemudian dipindahkan ke botol kaca kecil. 2009)  Penyimpanan menggunakan mineral oil Kultur dengan kondisi baik disimpan dengan ditutupi oleh minyak mineral dan akan bertahan dalam jangka waktu yang lama. Metode alternative untuk sporulasi jamur meliputi inokulasi agar slants yang kemudian diinkubasi pada suhu 25 °C. Untuk mendapatkan kembali kultur dari minyak mineral. Metode ini pertama kali digagas oleh Castallani (1939). murah. dan yeasts. Air suling (sekitar 5 ml) ditambahkan ke kultur secara aseptik. Metode ini telah berhasil digunakan untuk memelihara Oomikota. Dalam metode ini. serta mudah unutk digunakan. Metode pemeliharaan ini sangat berguna di daerah dengan iklim tropis karena dapat mencegah hilangnya kandungan air dari kultur. Uap yang terjebak dihilangkan dengan memanaskan cairan dalam oven pengering pada 180 °C selama 1-2 jam. Basidiomikota. tidak membutuhkan peralatan dan keahlian khusus. Sejumlah besar spesies bakteri dan jamur berhasil disimpan menggunakan metode ini selama bertahun-tahun. dan bagian permukaan dari kultur dihilangkan dengan lembut untuk menghasilkan spora dan bubur miselium. Jumlah minyak dalam tabung atau botol-botol kecil harus diperiksa secara periodik dan ditambah jika perlu. cocok bagi koleksi berukuran kecil. Penutupnya kemudian dieratkan dan disimpan pada suhu 25 °C. tetapi plate dengan pertumbuha koloni yang sedikit menunjukkan media pertumbuhan yang buruk sehingga diperlukan stok yang baru. yaitu dengan dicelupkan dalam minyak mineral steril dengan kedalaman 10 mm di atas permukaan agar. minyak mineral disterilkan di autoclave selama 2 jam. endapan spora dalam air ditambahkan ke tanah yang steril dan dibiarkan tumbuh pada 57 .  Penyimpanan menggunakan tanah Tanah yang steril dapat digunakan untuk menumbuhkan dan menyimpan mikroorganisme. jamur pathogen. tidak membutuhkan waktu yang lama. sejumlah kecil bagian yang tumbuh diambil dan dibersihkan dari minyak dengan menggunakan potongan kertas dan kemudian digoreskan pada agar plate yang mengandung media pertumbuhan yang cocok.

glukosa. Ini adalah metode yang singkat. Banyak fisiologis telah berhasil memelihara jamur. dan keberhasilannya bergantung pada spesies dari mikroba. dan polyvinyl-pyrolidone. kultur tanah kemudian disimpan dalam sebuah pendingin (4-7 °C). pembekuan ini tidak disarankan bagi pemeliharaan kultur karena proses pembekuan dapat merusak sel-sel mikroba.suhu 20-25 °C selama sekitar 10 hari. dextran.  Ordinary Freezing Pemeliharaan mikroba dalam ruang pembeku atau dalam pendingin dengan temperature berkisar 0– -20 °C akan mendapatkan hasil yang bervariasi. dan zat non penetrasi seperti sukrosa. Keberhasilan lyophilisation bergantung pada keadaan sel mikroba yang digunakan pada kondisi optimum dari media yang dipilih. sel mikroba disuspensi dalam agen krioprotektif dalam botol kecil menggunakan teknik yang steril dan dibekukan pada suhu -60 hingga -70 °C dengan menggunakan campuran etil asetat dan es kering. spesies bakteri. Kultur lyophilize dapat dihidupkan kembali dengan membuka botol-botol kecil tersebut dan ditambahkan udara steril kemudian memindahkan kultur ke medium pertumbuhan yang tepat. air dan sel mikroba dalam kultur akan langsung berubah dari keadaan beku menjadi gas (sublimasi) sehingga sel menjadi kering. menggunakan teknik ini dan menghilangkan kemampuan perkembangan mikroorganisme selama 40 tahun. Selama proses lyophilisation. Dalam lyophilization. laktosa. yaitu pada akhir fasa logaritmik atau awal fasa stasioner. Batol-botol kecil kemudian dihubungkan dengan mesin pengering vakum dan dikeringkan sekitar 12 hingga 17 jam hingga menyisakan sekitar 1-2% kandungan air. Setelah mikroorganime tumbuh. Zat cryoprotectif adalah senyawa kimia yang memiliki sifat tertentu seperti non-toxic dan mampu menetrasi membrane sel dengan mudah. mannitol. yang dapat dengan mudah melewati membrane sel dan melindungi intrasel dan ekstrasel. Umumnya. Penanaman kultur mikroba dilakukan saat berada pada stabilitas maksimum. kultur dibekukan pada temperature yang sangat rendah dan ditempatkan pada tekanan vakum. kelangsungan hidup mikroba dibatasi dengan mengaturnya dalam keadaan dorman. Cryoprotectant terdiri dari dua macam: zat penetrasi seperti gliserol dan DMSO. Freeze drying akan lebih baik dilakukan pada suhu -20 °C karena dapat membekukan suspensi mikroba dengan adanya zat cryoprotective seperti gliserol atau dimetyl sulfoksida (DMSO).  Freeze-Drying (Lyophilization) Ini adalah salah satu metode yang efektif dan ekonomis untuk pemeliharaan mikroorganisme dalam jangka waktu yang lama.  Deep Freezing Ini adalah metode dengan jangka waktu yang pendek dalam memelihara mikroba yang dilakukan pada temperatur -70 °C dalam sebuah mesin pembeku. yang mencegah kerusakan sel selama proses pembekuan. Dengan menurunkan suhu atau menghilangkan kandungan air. dan bakteriofag. Botol-botol ini kemudian disimpan dalam kondisi vakum pada suhu 2 hingga 8 °C. 58 . Lyophilisation bertujuan untuk mempertahankan mikroba agar tidak berubah dari bentuk aslinya. Metode ini terbukti berhasil diaplikasikan pada beberapa jenis jamur. sorbitol. yang menggunakan efek protektif mereka pada membrane sel. yang dapat digunakan untuk memelihara bakteri selama 6 bulan hingga 2 tahun. hal ini memungkinkan pelestarian mikroorganisme untuk beberapa saat. Spora atau sel kemudian disuspensi dalam berbagai jenis zat cryoprotectif seperti gliserol atau DMSO yang dapat membantu menghilangkan kerusakan akibat pembekuan. Dengan cara ini. kultur kehilangan kemampuannya selama beberapa saat. Pada kondisi ini. Umur kultur dapat diperpanjang ketika kultur disimpan pada suhu -30 hingga -70 °C dalam mesin pembeku.

pemilihan zat cryoprotectan seringkali bervariasi berdasarkan organisme yang dipelihara. penghematan waktu. termasuk yang tidak dapat dilakukan dengan cara lyophilisation. Kerugian dari teknik ini adalah harga peralatan yang mahal dan nitrogen cair yang harus diisi ulang dalam interval waktu tertentu karena mengalami peristiwa evaporasi. Gambar: Liquid nitrogen vapor storage (biomedicalmarketing. Kebanyakan mikroba dapat kehilangan kemampuannya dalam kondisi ini selama 10 hingga 30 tahun atau bahkan dapat lebih lama pada bakteri. tetapi gliserol dan DMSO dapat digunakan secara efektif dalam upaya pemeliharaan sejumlah besar mikroba. 2009)  Penyimpanan menggunakan cairan nitrogen Penyimpanan dalam cairan nitrogen adalah cara pemeliharaan mikroorganisme jangka panjang yang efektif. Suspensi sel disegel dalam botol-botol kecil dan dibekukan pada suhu -150 °C. Ini menjadikan mikroorganisme berada dalam bentuk dorman sehingga organisme tidak mengalami perubahan genetik. Pada metode ini. Tabung-tabung kecil kemudian disimpan dalam pendingin nitrogen cair (tangki vakum yang besar dan dindingnya diisolasi) baik dengan perendaman dalam nitrogen cair (-195 °C) atau disimpan dalam fasa gas oleh nitrogen cair (-150 °C). dan perlindungan kultur dari kontaminasi.com) F. Keuntungan dari penyimpanan menggunakan nitrogen cair meliputi pencegahan peningkatan variasi genetik stok kultur.Gambar: Laboratorium freeze–drying (Lyophilization) (Sumbali. Koleksi Kultur (Culture Collection) 59 .

Koleksi kultur mikroba memberikan sumber yang kaya akan mikroorganisme. dari kepentingan lain di bidang industri atau medis. dan karakteristik biokimia dasar mereka telah diketahui. atau alga. Fungsi utama dari koleksi kultur adalah untuk memelihara koleksi-koleksi yang telah ada. fisiologi. Berikut ini adalah contoh perusahaan yang menyediakan koleksi kultur untuk kebutuhan mikrobiologi bagi industry (Waites. Sebagai contoh di Inggris. American Type Cultur Collection (ATCC). beserta metode penyimpanan miniatur. Namun.2001) : 60 . saat ini. sedangkan di Amerika terdapat pusat koleksi utama. Masalah-masalah dari pemeliharaan kultur telah diatasi dengan pengembangan dan penggunaan dari teknik cryopreservation dan freeze-drying (lyophilization). menerbitkan daftar katalog bagi organisasi industri dan akademis. koleksi-koleksi menyediakan kultur atau servis berdasarkan bagiannya tersendiri. menyediakan sampelsampel kultur dari masing-masing organisme. Penggunaan mikroorganisme yang dipilih dari sebuah koleksi kultur dengan jelas memberikan penghematan biaya yang signifikan dibandingkan dengan isolasi lingkungan dan memiliki keuntungan bahwa beberapa karakteristik dari mikroorganisme telah terbentuk. kebanyakan dari mereka berukuran kecil. Ada hampir 500 koleksi kultur di seluruh dunia. Koleksi-koleksi nasional lainnya. khamir. dan bentuk morfologi. Mereka terbagi menjadi institusi-institusi dan cenderung dikhususkan pada bakteri. kapang. yang berasal dari zaman dahulu. bebas dari mikroorganisme yang tak diinginkan. sedangkan isolasi yang berasal dari alam harus dimurnikan terlebih dahulu. untuk meneruskan mengumpulkan strain-strain baru dan memberikan biakan yang murni. kerugiannya adalah bahwa kompetitor memiliki akses ke mikroorganisme yang sama. kultur murni harus diisolasi dan dikarakteristikkan. yang menangani semua tipe mikroorganisme (Waites 2001). National Culture Collection (UKNCC) membuat beberapa koleksi. Kultur dihasilkan dari koleksi yang murni. dan potensi perhatian yang akan datang.

2001). 61 .LAMPIRAN Contoh Produk Industry Fermentasi dan Mikroorganisme yang Memproduksinya (Waites.

62 .

DEWI ARIESI R. 2001 Lampiran II PERTANYAAN DAN JAWABAN 1. SISCA DWI A. Sumber : Waites. ujung kawat berbentuk lingkaran (loop) atau yang berbentuk lurus disebut inoculating needle. WINDA FAUZI ISTIQOMAH (115061101111003) Pertanyaan : Pada teknik pour plate. AFIDA KHOFSOH ( 115061100111031) Pertanyaan : Apa saja syarat yang harus diperhatikan oleh pekerja pada saat mengulturkan mikroba? Jawaban : Pekerja yang akan mengkultur mikroorganisme haruslah steril . DEWI NUGRAHANI (115061100111001) Pertanyaan : Pada slide.Tabel 4. Diambil tanah yang agak liat. Cara sterilisasi tanah: 1. mikroba tidak mengalami perkembangan karena mikroba tersebut akan berada pada fasa dorman/beristirahat dan mikroba ini masih dalam keadaan hidup. pekerja kultur tidak akan mendapatkan kultur murni yang diharapkan.85%). (115061101111015) Pertanyaan : Pada saat pembekuan. apa larutan yang digunakan untuk mengencerkan? Jawaban : Larutan yang digunakan pada saat pengenceran dapat berupa larutan fosfat buffer. Kawat dengan bahan ini dapat berpijar saat dipanaskan sehingga dapat dengan mudah disterilkan. dikatakan bahwa tanah harus steril. Hal tersebut dilakukan untuk menghindari kontaminan – kontaminan pengganggu untuk mikroorganisme. terdapat beberapa bentuk bagian ujung dari kawat yang digunakan. waktu pembahasan penyimpanan media tanah. (115061105111007) Pertanyaan : Pada teknik streak plate kenapa menggunakan kawat nikrom? Apakah ada kawat lain selain kawat nikrom? Apa karakteristik kawat yang bisa digunakan pada teknik ini? Jawaban : kawat yang digunakan pada teknik streak plate biasanya merupakan kawat nikrom yang merupakan campuran dari nikel dan kromium atau kawat platinum. steril yang dimaksud adalah meliputi kebersihan dari pakaian dan alat yang digunakan pekerja selain itu juga sebaiknya dihindari pengkulturan di tempat yang terbuka. dikeringanginkan dan diayak untuk memisahkan partikel tanah yang agak besar dan membuang sisa-sisa tanaman. Tanah steril itu seperti apa? Bagaimana kita tahu bahwa tanah tersebut steril atau tidak? Kalau memang ada cara tersendiri untuk mensterilkan tanah. Pada teknik ini. larutan garam fisiologi (NaCl 0. apakah mikroba tetap hidup? Jawaban : Saat dibekukan. karena apabila mikroorganisme terkontaminasi. 63 .1 Produk fermentasi industry dan organisme yang memproduksinya. bagaimana caranya? Jawaban : Tanah steril adalah tanah yang tidak mengandung kuman dan mikroorganisme pathogen. atau larutan Linger.

5. Jawaban : Dari uraian materi diatas. (Desikator adalah suatu wadah yang terbuat dari bahan kaca yang kedap udara dan mengandung desikan yang berfungsi menghilangkan air dari kristal hasil pemurnian). selanjutnya bakteri diisolasi. pembentukan tunas dll) Dhanang Edy P (115061101111007) Pertanyaan : Jika kita mengambil mikroba dari alam. Tabung atau botol yang berisi tanah diberi aquadest steril hingga kebasahan 50% kapasitas lapang. Bilamana diperlukan. lalu disimpan untuk digunakan seanjutnya. dan setelah itu diambil 1 bakteri ( yang telah dipilih. Ayu Indah Wibowo (115061101111011) Pertanyaan : Bagaimana bisa terjadi biakan murni. hal ini mudah dilakukan yaitu dengan mengontrol terlebih dahulu suhu lingkungan dimana akan dilakukan teknik ini. Tanah yang sudah dikeringaninkan dan diayak dimasukkan ke dalam tabung atau botol dengan tutup berukuran 25 ml hingga 1 cm dari permukaan tutup. Untuk kontrol suhu agar tidak tinggi ( lebih dari 45 oC). botol dioven kering pada suhu 105 ºC selama satu jam. 1. apakah membelah diri ? Jawaban : Pada saat setelah pengambilan bakteri dari medium tertentu. Selanjutnya. Dari isolasi tersebut keadaan lingkungan (suhu) dan mediumnya disesuaikan dengan bakteri target. botol dapat dicelupkan dengan tali. Namun. suhu tinggi digunakan pada teknik pour plate. misalkan pengambilan bakteri dari air. 3. jika ingin 64 . bakteri dapat diambil dari lingkungan dengan beberapa pendekatan misalnya pendekatan shotgun. dan setelah dingin disimpan di dalam desikator hingga digunakan. kemudian diautoklaf pada suhu 121 ºC tiga kali berturut-turut selama 3 hari masingmasing selama satu jam. 4. Pengambilan sampel air bergantung kepada keadaan air itu sendiri. dari sinilah akan terbentuk koloni kultur murni. bagaimanakah alur prosesnya mulai dari pengambilan sampai penyimpanan.2. Jika berasal dari air sungai yang mengalir maka botol dicelupkan miring dengan bibir botol melawan arus air. Bila pengambilan sampel dilakukan pada air yang tenang. FRESHSYA ZATALINI (115061100111003) Pertanyaan : Bagaimana cara kontrol temperatur pada proses spread plate agar suhunya tidak tinggi sehingga tidak mematikan bakteri? Jawaban : Pada teknik spread plate tidak menggunakan suhu yang tinggi. Mikroba yang akan dikultur menggunakan teknik ini merupakan mikroba yang dapat bertahan pada suhu tinggi. sterilitas tanah diuji dengan menumbuhkan contoh tanah pada medium agar. teknik isolasi yang digunakan juga terdiri dari 3 macam misalnya kita memakai teknik pour plate dan penyimpanannya misalkan dengan metode freeze-drying. dan diteliti morfologinya) dan ditanam dimedium yang cocok agar bakteri dapat melakukan metabolisme dan perkembang biakan. Jika suhu tidak melebihi 45oC maka masih dianggap aman untuk melakukan teknik ini.karena bakteri mempunyai kemampuan berkembang biak ( seperti berkembang biak dengan membelah diri.

2.

3.

4. 5. 6. 7.

mengambil sampel dari air keran maka sebelumya keran dialirkan dulu beberapa saat dan mulut kran dibakar. jika air sampel mengandung padatan maka harus diencerkan dahulu menjadi suspensi dengan aquades steril, fungsi dari tahap ini adalah untuk memisahkan mikroba dari medium padatnya. Selanjutnya teknik penanaman sampel dari cairan diatas, metode yang digunakan missal pour plate. pertama – tama menyiapkan cawan steril, tabung pengenceran yang akan ditanam dan media padat yang masih cair (>45oC). Diteteskan 1 ml secara aseptis, suspensi sel kedalam cawan kosong dan setelah itu Tuangkan media yang masih cair ke cawan kemudian putar cawan untuk menghomogenkan suspensi bakteri dan media, kemudian diinkubasi (pada temperature kamar). Setelah 24-48 jam inkubasi, amati bentuk koloni bakteri yang tumbuh di permukaan dan di dalam agar, apakah koloni-koloni bakteri terpisah merata atau masih menyatu dengan bakteri lain membentuk spreader. Diperhatikan koloni yang tumbuh pada media baik yang dipermukaan, tengah atau dasar medium. lalu dicatat semua koloni berdasarkan warna, bentuk, ukuran dan konsistensi koloni. Dari hasil pengamatan, maka dipilih bakteri yang di inginkan, setelah itu dipindahkan inokulan tersebut dan dijadikan biakan murni ke medium yang baru. Dilakukan penyimpanan misalkan dengan metode freeze-drying. 9. Teza Nur F (11506110211100) Pertanyaan : Mikroorganisme dapat disimpan menggunakan media nitrogen cair, adakah media lain yang bagus untuk media penyimpanan mikroorganisme, metode apa yang paling baik ? Jawaban : Dari hasil literature yang kami dapatkan, media pendingin selain nitrogen cair belum ada namun seperti yang telah dijelaskan masih banyak media lain yang dapat digunakan seperti media air steril dan media tanah steril (penggunaan media biasanya bergantung pada jenis mikroba yang akan disimpan dan jangka waktu penyimpanan yang diinginkan) . Untuk metode yang efektif menurut Ilyas adalah metode penyimpanan freeze- Drying karena dapat memelihara mikroorganisme dengan jangka waktu lebih lama daripada metode lainnya.

I.

Fermentor control dan Monitoring Kontrol fermentor dan monitoring berfungsi untuk mendeteksi ketika suatu proses fermentasi berlangsung tidak sesuai dengan yang diinginkan sehingga membuat proses itu berjalan sesuai dengan design fermentor yang digunakan. Kebanyakan sistem fermentasi dibuat mendekati dengan kondisi natural atau kondisi sebenarnya agar menghasilkan produk yang sesuai dengan prosesnya. Sistem fermentasi bergantung pada pengaruh berbagai sumber dari luar fermentor, sehingga diharapkan terjadi proses yang menyebar keseluruh media di fermentor secara natural. Untuk mempersempit variasi kualitas produk, proses operasi harus dimodifikasi untuk memperhitungkan pencegahan variasi kualitas produk yang akan dihasilkan dari fermentasi itu sendiri. Metode kontrol dan monitoring efektif untuk mendeteksi penyimpangan dan mengimbangi proses fermentasi, sehingga sangat penting untuk mengatur efisiensi proses dalam fermentor. Dan, memaksimalkan performa ekonomik atau biaya yang dibutuhkan yang biasanya hanya bisa dikendalikan dengan mengimprofisasi kontrol fermentor.

65

( Gary montauge,1997) Sistem fermentasi harus dikontrol secara efisien untuk mengoptimalkan produktivitas dan produk hasil, dan memastikan reproduktifitasnya. Sebagian besar parameter kimia dan fisika yang terlibat tergantung pada bioreaktor, model operasi, dan mikroorganisme yang digunakan. Parameter tersebut terutama aerasi, pencampuran, temperatur, pH, dan kontrol busa. Kontrol dan pemeliharaan pada tingkat optimum di dalam reaktor dioperasikandengna sensor elektroda, sistem kontrol yang cocok dan data logging. 1. Temperatur Temperatur fermenter harus dikontrol dengan baik, dengan ketelitian lebih kurang 0,10C. Pada industri skala besar, pendingin untuk menjaga suhu biasanya dibuat dari jaket air atau kumparan pipa sehingga pemanasan akan jarang dilakukan. Jika fermentor didesign untuk produktivitas yang rendah atau biomassa dengan konsentrasi rendah tetapi fermentor tersebut digunakan untuk produktivitas tinggi atau fermentasi biomassa dengan konsentrasi tinggi, sehingga akan terjadi penambahan panas dalam proses dan akan dibutuhkan penambahan air untuk mengatur suhu dalam fermentor. Pada fermenter berskala kecil, kemampuan pendingin dan pemanas dibutuhkan tetapi temperatur kontrol juga harus diperhatikan. 2. Aliran gas laju aliran gas biasanya diatur dengan menggunakan katup, karena aliran tergantung tekanan, baik kompensasi feedforward dari posisi katup untuk perubahan tekanan yang dikendalikan atau keduanya, tekanan dan aliran gas yang dikendalikan. 3. Liquid flow Regulasi aliran bisa didapat pada skala kecil dengan menggunakan pompa meter. Sedangkan peristaltic pompa sering digunakan pada skala laboratorium. Pendekatan lain yang digunakan adalah dosing pot, katup bertekanan rendah diatas fermentor dengan katup isolasi. Dengan mengetahui tekanan katup tersebut maka volume penembakan dapat ditentukan.

66

( Gary montauge,1997) 4. pH pH biasa dinyatakan dengan kaca elektroda, dimana biasanya elektroda terbuat dari perak atau perak klorida atau mercury/mercurious chloride dengan potassium chloride sebagai elektrolit. Elektroda mampu bertahan pada kondisi sterilisasi ( 1210C) tetapi pengulangan sterilisasi membuat penurunan performa sepanjang waktu. Pengontrolan pH dapat diraih dengan penambahan asam atau alkali pada fermentor. Pada fermentasi skala kecil, kebanyakan liquid ditambahkan menggunakan pompa peristaltic. Pada skala besar, penambahan gas ammonia lebih dipilih daripada ammonia hydroxide untuk masuk menuju aliran udara pada fermentor. Pada kultur sel hewan, penambahan karbon dioksida pada media digunakan untuk meregulasi pH selama periode pertumbuhan. 5. Pressure Tekanan perlu dikontrol untuk proses sterilisasi dan memenuhi kebutuhan keamanan. Tekanan dapat dikontrol dengan menggunakan katup regulasi. Itu adalah standart alat yang secara hukum harus diinstal pada fermentor untuk melepas tekanan diatas batas tekanan yang sudah ditentukan
67

atau iridium dan hasil yang didapat dari elektroda diindikasikan pada analisa pH yaitu perak atau perak klorida. 7. Foam Masalah saat membentukan busa dapat diatasi dengan pemberian antibusa tetapi antibusa ini dapat mengakibatkan racun bagi mikroorganisme dan mengurangi laju aliran. emas. Sehingga dapat digunakan pemecah busa . Dissolved Oxygen Tipe penganalisa DO pada bioreactor ada dua. Analisa galvani digunakan untuk fermentor skala kecil karena peralatannya yang padat dan arena disebabkan oleh biaya yang rendah. 68 . Keduanya mengukur parsial DO dan membandingkannya dengan kejenuhan udara. Pengukuran dilakukan dengan menggunakan elektroda platinum.Metode elektrik pada pengukuran tekanan didasarkan pada penggunaan pembentukan kembali tranducer piezoelectric. d. b. 9. Pengontrolan DO dengan mengganti komposisi gas yang dimasukkan akan lebih mahal karena membutuhakan gas yang telah dipurifikasi. katoda perak dan potassium hydroxide. Kesetimbangan akan terbentuk antara konsentrasi karbon dioksida di sisi lain membran. yang mengukur tekanan dengan mendeteksi perubahan elektrik Kristal asimetri 6. Dua buffer dengan konsentrasi karbon dioksida yang diketahui digunakan sebagai bahan kalibrasi. Metode ini biasanya digunakan pada kultur sel hewan karena disana terdapat spesifikasi komposisi gas yang dimasukkan. Analisa galvani menggunakan anoda timbal dan seng. Respon yang didapat dari analisa polarografi lebih cepat. yaitu galvani dan polarografi. Alat ini menggunakan anoda perak dengan polarisasi negatif terhadap katoda platinum atau emas dengan menggunakan kalium klorida cair sebagai elektrolit. c. Control untuk DO pada skala kecil biasanya menggunakan empat cara: Merubah kecepatan pengaduk Variasi pada aliran udara Modifikasi komposisi pada gas yang masuk Variasi pada tekanan yang berlebihan a. Potensial redoks Redoks ialah ukuran untuk oksidasi atau reduksi pada system biologi. Dissolved Carbon Dioxide Dissolved carbon dioxide bisa diukur dengan menggunakan hydrophobic membrane. Pengukuran redoks ini digunakan pada fermentasi anaerob dan fermentasi sel hewan dimana terdapat perubahan jumlah sel atau perubahan kondisi fisiologis. Biaya untuk analisa ini lima kali lebih mahal daripada galvani tetapi biaya untuk pemeliharaan cenderung lebih rendah. Hasil perubahan konsetrasi karbon dioksida terlarut didapat dari variasi pH larutan yang dianalisa pada membrane yang bisa diketahui dengan elektroda pH. biasanya hanya membutuhkan waktu beberapa detik. 8. Sedangkan proses fermentasi skala besar menggunakan analisa elektroda polarografi .

Jika tidak dikontrol. busa ini bisa memicu kontaminan dan pemblokiran filter udara. Ada tiga cara untuk mencegah pembentukan busa. biasanya fosfat. Kontrol sistem fermentasi secara keseluruhan dapat dilakukan secara manual atau otomatis. 69 . yaitu modifikasi media. lemak. Prinsip dasar pengontrolan sistem melibatkan sistem sensor yang terhubung dengan sistem kontrol dan feedback loop. Ketika terdapat kondisi yang tidak sesuai dengan kondisi yang diinginkan maka akan muncul tanda peringatan dan sistem pengkoreksi akan teraktifikasi sehingga memberikan kontrol yang lebih intens pada sistem fermentasi. Media fermentasi banyak mengandung garam buffer.2001) Sampel dapat diambil secara acak untuk berbagai analisis seperti perhitungan sel dan penentuan DNA. Pemantauan suhu melalui termometer resistensi dan termistor yang terhubung dengan pemanas otomatis ataupun dengan sistem pendingin. Produksi busa pada bioreaktor adalah masalah utama. tetapi kapasitas fosfat untuk mengontrol pH dapat berlebihan sehingga dibutuhkan penambahan asam atau alkali. sistem kontrol kondisi fermentasi membutuhkan kalibrasi secara teratur saat pemasangan pertama kali dan di cek secara berkala. Data atau informasi yang didapat dari kontrol sistem dapat digunakan untuk membuat model proses dan dapat digunakan untuk pengembangan sistem fermentasi. Meskipun begitu. karbohidrat dan substrat atau hasil metabolisme yang lain. Pengontrolan pH adalah faktor.(Michael J. pH dalam fermentor dapat terjaga dengan cara penambahan asam atau basa secara otomatis jika pH yang ditangkap oleh sensor tidak sesuai. atau penambahan agen antibusa. alat pemecah busa. karena produk fermentasi bisa berubah disebabkan adanya perubahan pH dalam media fermentasi. terutama pada fermentasi aerasi. spesifik protein. Waites. RNA. Tingkat O2 dan CO2 terlarut ditentukan dengan elektroda O2 dan CO2. Sensor ini digunakan untuk mengukur dan mencatat kondisi pada bioreaktor. Banyak proses fermentasi memproduksi asam dan pengaturan pH dapat berlangsung dengan menggunakan amonium oksida. Pembentuka busabusa tersebut disebabkan oleh hadirnya protein yang dapat membentuk busa. yang juga dapat berperan sebagai sumber nitrogen.

semua kondisi sudah ditentukan dan dipastikan pada awal dan akhir proses. serta proses pengolahan air buangan.II. Peningkatan frekuensi sterilisasi juga dapat menyebabkan stres yang lebih besar pada instrumen pengontrol. Penambahan nutrisi ekstra dapat dilakukan terus menerus. Contoh proses ini yaitu meliputi produksi minuman berakhohol. 70 . Ketika produk sudah dihasilkan dan dipanen. atau kontinu. atau asam organil. fed-batch. fermentor harus dibersihkan sebelum proses fermentasi dimulai lagi. Kelemahan lain sistem batch yaitu keragaman produk. dan lain-lain. sterilisasi. Untuk model operasi ini. enzim. Bagaimanapun. Fed-batch dengan menggunakan sel daur ulang ( biomassa) juga dapat digunakan untuk tujuan tertentu seperti fermentasi beberapa etanol. Operasi fed-batch dapat memperpanjang fase pembentukan produk dan dapat mengatasi masalah yang terkait dengan penggunaan substrat yang banyak. Pada fermentasi batch. fermentasi batch secara teoritis kurang efektif untuk produksi biomassa dan produk metabolit primer. disterilkan. Yaitu sistem tertutup yang tidak ada inokulasi (penyuntikan) ataupun tambahan asam atau basa untuk kontrol pH pemakaian udara untuk fermentasi aerob. serta metabolisme yang berlangsung secara cepat. Mode Operasi Industri fermentasi berlangsung secara batch. banyak dari pembuatan asam amino. Fermentor disiapkan. dan diinokulasi sehingga organisme tumbuh berdasarkan profil yang khas. Hanya sebagian kecil dari siklus fermentasi batch yang dapat dikatakan produktif. Karena terdapat lag period yang cukup besar dan pada tahap selanjutnya dari fase eksponensial dengan banyaknya jumlah produk yang dihasilkan. Sistem fermentasi batch telah telah sukses digunakan untuk menghasilkan banyak produk fermentasi tradisional dan untuk memproduksi metabolit sekunder seperti antibiotik. Proses fermentasi yang lain yaitu fed-batch yang banyak digunakan dalam memproduksi ragi roti dan penicilin. Proses yang banyak digunakan adalah proses batch. perlu ditambahkan nutrisi ekstra selama proses fermentasi untuk menambah volume fermentasi. atau sesering mungkin sebagai satu suplementasi ketika kultur mendekati akhir fase pertumbuhan. Keuntungan dari sistem batch adalah bahwa pengeluaran modal lebih rendah dan jika terjadi kontaminasi maka relatif cukup mudah untuk dihentikan dan dapat memulai proses fermentasi lagi. ditambah meningkatnya fase non produktif downtime yang melibatkan proses pembersihan. dimana sel-sel pertama tumbuh melampaui fase pertumbuhan yang cepat sebelum akumulasi metabolit. Model fermentasi ini juga berguna saat substrat mengalami masalah viskositas atau racun ketika konsentrasi terlalu tinggi. Selain itu. pengisian dan pendinginan setelah sterilisasi. sesekali. fase non produktif ini disebut sebagai “down-time”.

Masalah yang terkait dengan proses fermentasi kontinu selain masalah pengeluaran air buangan.1997) 71 . sterilitas harus dipertahankan dan media harus disuplai secara terus menerus dengan komposisi konstan. sehingga sistem bekerja pada volume yang sama. Akibatnya. Namun sistem ini membutuhkan modal yang cukup tinggi. ( Gary montauge. Selain itu sistem ini memiliki sifat untuk mencapai stady state dimana konsentrasi nutrisi dan jumlah sel sudah tidak bervariasi terhadap waktu. masalah ini dapat diatasi dengan GMP dan praktek mikrobiologi yang benar. Dalam sistem kontinu. Sistem kontinu mengurangi down-time dan mengurangi biaya operasi yang lebih rendah. Fermentasi kontinu sangat cocok untuk produksi biomassa dan pertumbuhan yang berkaitan dengan metabolit primer. termasuk fakta bahwa sepanjang pengoperasian 20-50 hari atau lebih. sel-sel tumbuh secara eksponensial (membelah) untuk waktu lama yang ditentukan dalam laju pertumbuhan spesifik. dan umumnya dibutuhkan lebih banyak personil untuk mengoperasikan sistem batch. (Vogel. sistem tersebut lebih produktif daripada sistem batch. kondisi operasi menyebabkan membentuk mutan yang lebih banyak pada hasil dengan kualitas yang lebih rendah daripada hasil asli. 1996) Kultur kontinu adalah sistem terbuka dimana medium akan ditambahkan secara kontinu dan kultur secara serempak dipindahkan pada tingkat yang sama. Namun.biaya yang dibutuhkan lebih besar untuk mempersiapkan dan memelihara stok kultur. Meskipun begitu.

penyuplaian udara dibutuhkan secara kontinu. Gambar : filter membrane berserat 3. Teknik pensterilan udara yang paling efektif adalah dengan menggunakan filter membrane berserat (Dutta. yang disiapkan di dalam pemasak medium batch atau continous yang dapat mengoperasikan beberapa fermentasi.0 vvm (air volume per liquid volume per minute). STERILIZATION Kebanyakan industri fermentasi menggunakan kultur murni dimana pertumbuhan terjadi pada strain yang terpilih. Istilah ini banyak digunakan dalam industri fermentasi. Untuk skala industry fermentasi.1. 2001). Sebagai kemungkinan lain. atau pemanasan untuk membunuh mikroba spesifik tanpa memberikan efek yang berarti. Jjika terdapat mikroorganisme asing pada media atau pada peralatan. faktor del adalah ukuran pengurangan pecahan dalam jumlah organisme yang layak diproduksi oleh panas tertentu dan rezim waktu. Umumnya. produksi organisme harus bersaing dengan kontaminan untuk nutrisi yang terbatas. 3. media dan seluruh alat yang akan digunakan harus bebas dari kontaminasi. yang melibatkan peningkatan suhu atau waktu sterilisasi . Oleh karena itu. lalu kedua medium tersebut dapat di sterilkan bersamaan. Wadah atau vessel – nya lalu dimasuki media steril. kondisi aseptik harus dipertahankan (Waites. Laju aerasi untuk tipikal fermentasi aerob adalah 0. kontaminan yang dapat berkembang dengan cepat dapat tumbuh dan dapat menghilangkan nutrisi. mereka harus benar-benar disterilkan.MEDIA AND VESSEL STERILIZATION Untuk skala industry fermentasi aseptis fermenter dapat di sterilkan pada saat kosong. tetapi kontaminasi mikroba tetap terjadi dalam jumlah yang dapat ditoleransi dengan cara pasteurization. semakin besar waktu sterilisasi diperlukan.5 – 1. memproduksi senyawa beracun atau produk sekresi yang dapat memblokir filter dan mengganggu pengolahan hilir atau downstream process. tidak hanya media saja yang harus steril namun udara yang digunakan juga. dengan kata lain. Jika kontaminan adalah bakteriofag. Oleh karena itu. tujuannya adalah untuk memberikan kondisi sterilisasi yang memberikan probabilitas kontaminasi dari 0. Ini membutuhkan jumlah udara yang sangat besar. semakin besar faktor del. factor Del (▽=ln No/Nt)dapat dihitung (selengkapnya ligat chapter 2). Oleh karena itu. dibutuhkan sterilisasi secara ketat.AIR STERILIZATION Pada fermentasi aerob. Kontaminasi mikroorganisme juga dapat memetabolisme produk target. sebelum proses fermentasi dilakukan.III. Selain itu. Faktor del sendiri adalah jumlah organisme pada awal sterilisasi dan Nt adalah jumlah yang tersisa setelah waktu t. jika jumlah sel mikroba diketahui (No).2. Namun. 2008). Kontaminan dapat memproduksi produk yang berbahaya bagi organisme. Maka dari itu factor Del nya dapat dinyatakan sebagai berikut: 72 . Konsekuensinya. Penghancuran sel terjadi pada saat pemanasan (T=121 oC) dan pendinginan. Jika tidak. beberapa industry fermentasi tidak aseptis. seperti yang terjadi pada fermentasi yang melibatkan bakteri asam laktat.1% (1 dalam 10000). dapat melisiskan kultur. maka. fermenter diisi dengan media yang sudah terformulasi.

Bahan yang bersifat sensitive terhadap panas tadi sebelumnya disterilisasi dengan cara filter sterilization yang menggunakan filter membrane dimana pori – pori nya berukuran 0. Ini dapat membantu sterilisasi. Ini biasanya merupakan operasi continuous di mana waktu holding dikendalikan oleh laju aliran melalui sterilisasi dan material tersebut kemudian dengan cepat didinginkan dalam heat exchanger. e. Holding section dipertahankan dalam kondisi adiabatik. suhu dapat diasumsikan konstan. 140oC dengan lama waktu pemanasan hanya 50 detik. Sterilisasi kontinu memiliki beberapa kelebihan yaitu : Menyederhanakan strategi perencanaan produksi atau production planning. Dapat beroperasi pada suhu tinggi (T = 140oC). Metode injeksi uap secara langsunglebih efektif daripada pemanasan secara tidak langsung karena tidak ada penghalang antara media dan sumber panas. 2001) 3. (Waites. memerlukan sedikit air pendingin. tetapi dapat mengakibatkan perubahan volume media. 73 . Heating section : Metode pemanasan dapat dikategorikan menjadi dua yaitu (1) injeksi uap secara langsung.2 m yang akan secara efektif menyaring kontaminan microorganism.g. (2) pemanasan secara tidak langsung di heat exchanger. Beberapa juga dapat disterilisasi dengan panas namun untuk meminimalisir kerusaka digunakan suhu tinggi untuk waktu yang sangat singkat.▽total = ▽heating + ▽holding + ▽cooling Pada prakteknya. Proses sterilisasi kontinu terdiri dari tiga bagian utama: heating. glukosa. Uap yang dibutuhkan untuk memulihkan panas dari media steril jauh lebih sedikit.3. konstituen media tertentu yang bersifat rapuh akan dirusak oleh panas yang berlebihan. holding. 2.g. sterilisasi uap melibatkan pemberian uap dibawah tekanan kedalam selimut bejan atau kumparan internal. 1. e. 5. sehingga waktu sterilisasi dapat dipersingkat. Memberikan kondisi yang mudah dalam menghasilkan produk. Kelebihan sterilisasi uap adalah proses yang murah dan efektif dibandingkan sterilisasi panas kering. Jika panas yang hilang di bagian diabaikan. sehingga memungkinkan maximum utilisasi pabrik dan meminimalisir penundaan atau keterlambatan produksi. Namun. 3. 4.CONTINUOUS STERILIZATION Proses sterilisasi dapat dilakukan dengan cara kontinu. vitamin dan media kultur sel hewan.dan cooling. Holding section atau ▽holding merupakan pemanasan media yang biasanya terdiri dari tabung panjang. dengan demikian. memerlukan sedikit tenaga kerja. Akibatnya. Lebih mudah dalam pengotomatisasi proses. Uap juga dapat diinjeksikan secara langsung ke dalam ruang di atas media fermentasi.

kulit padi. (Dutta.BATCH STERILIZATION Media sterilisasi di dalam fermenter dapat dilakukan secara batch dengan penyebaran uap menggunakan pemanas elektrik atau sirkulasi tekanan konstan kondensasi uap melalui koil pemanas. leguminosa. suhu dapat diasumsikan konstan. Cooling : Untuk bagian pendingin. 2008) 3. Holding section dipertahankan dalam kondisi adiabatik. Fermentasi substrat-padat tidak memiliki mekanisme kontrol canggih yang biasanya berhubungan dengan fermentasi submerge. Kedua teknik pendinginan ini membutuhkan waktu yang sangat singkat. dsb. FERMENTASI SUBSTRAT-PADAT Fermentasi substrat-padat telah digunakan untuk memproduksi berbagai macam makanan fermentasi terutama di Asia selama beribu tahun lamanya. namun metode ini jarang digunakan di Eropa dan Amerika Utara. holding. Sirkulasi sterilisasi terdiri dari heating. Teknik lain adalah dengan menyuntikkan media panas melalui katup ekspansi keruang hampa.Holding section : merupakan pemanasan media yang biasanya terdiri dari tabung panjang. Penggunaan fermentasi substrat-padat sering terhambat dengan kurangnya control daripada kondisi didalam bioreactor. material dengan kadar air yang sangat kecil atau tampa air sana sekali. khususnya mempertahankan suhu dan kelembaban optimal.4. Fermentasi substrat-padat melibatkan penumbuhan mikroorganisme pada padatan. dan cooling. biasanya organic. sehingga dapat diabaikan (Dutta. asam organic dan etanol di produksi. 2008) IV. Pada proses fermentasi substrat-padat biasanya enzim. Substrat yang sering digunakan seperti butiran gandum. Adapun kekurangan dan kelebihan fermentasi substrat-padat yang dapat dilihat pada tabel dibahawah ini: 74 . pengurangan kapasitan panas dengan menggunakan quench cooler secara efektif. yang dikenal sebagai flash cooling. kondisi yang diinginkan sulit dicapai. Jika panas yang hilang di bagian diabaikan.

dapat mengganggu transfer oksigen. 4. Metode ini berhasil digunakan dalam memproduksi spora Coniothyrium minitans untuk bio kontrol terhadap jenis bakteri tanaman jamur. Mikroorganisme – mikroorganisme ini dapt berbentuk : 1. e. Suhu sebagian besar dikontrol menggunakan aerasi dan/atau agitasi pada substrat. jika level kelembaban terlalu tinggi akan terjadi penurunan porositas substrat. e.1. Laju aerasi yang disediakan berhubungan dengan penghilangan panas. penurunkan laju difusi oksigen. seperti proses produksi silage.2001) 4. substrat menjadi sulit untuk diterima sehingga terjadi penurunan pertumbuhan mikroba. Kultur campuran. proses ini tidak membutuhkan agitasi dan aerasi. yang biasanya membutukan proses kimiawi ataupun biologis. seperti yang dijelaskan sebelumnya. Bioreactor yang dipakai seperti yang terdapat pada gamabr dibawah ini: 75 . adalah jenis yang dapat menoleransi water activity yang rendah. laju degradasi substrat menurun dan resiko kontaminasi mikroba menaik. Namun. Penggunaan atau pemanfaatan produk daripada hydrolysis.g. AERASI Kebanyakan fermentasi substrat-padat bersifat aerob. Aw = 0. Beberapa proses tidak membutuhkan bioreactor. Agaricus bisporus. Sclerotinia sclerotiorum. dan Pemisahan dan pemurnian produk akhir. 2. Ini biasanya diganti dengan pelembaban atau penambahan air secara berkala. e. Monokultur. Akan tetapi. CO2 dan senyawa volatile yang dapat mengganggu. Hidrolysis polimer substrat. 2. (Waites.Bioreactor yang digunakan pada fermentasi substrat-padat Kebanyakan fermentasi substrat-padat merupakan proses batch. protein & polysakarida. Mikroorganisme yang terdapat pada fermentasi substrat-padat. Bagaimanapun juga. 3. Dual kultur. Laju transfer oksigen terpengaruh dengan ukuran partikel substrat yang juga menyatakan ruang kosong. kebanyakan fermentasi aerob membutuhkan aerasi dan agitasi.2.1. Transfer oksigen di dalam ruang kosong ini berhubungan dengan level kelembaban. ketika oksigen terlarut dalam film air di sekitar partikel substrat.g. Jika level kelembaban terlalu rendah.g.ENVIRONMENTAL PARAMETERS THAT INFLUENCE SOLID-SUBSTRATE FERMENTATIONS WATER ACTIVITY. seperti yang digunakan dalam composting (pembuatan pupuk kompos). mereka cukup melibatkan penyebaran substrat ke dasar. 3. Aw Air yang hilang pada proses fermentasi pada umumnya melalui evaporasi dan aktivitas metabolisme. (Waites. Proses fermentasi subtrat-padat merupakan multistep process yang melibatkan: Pretreatment substrat. seperti yang ada pada produksi jamur.2001) 4. jika air di dalam ruang kosong berlebih. SUHU Panas yang dihasilkan dapat menjadi masalah serta merupakan pengaruh besar pada kelembaban relatif dalam fermentasi. Alhasil. serta penurunan pertukaran gas. straw bioconversion yang menggunakan Chaetomium cellulilytic dan Candida tropicalis. namun adanya kebutuhan oksigen tergantung pada jenis mikroorganisme yang dipakai dan jenis proses. Sporulasi biasanya tercapai pada fermentasi substrat-padat. Beberapa proses anaerob.7.

etanol dan biomassa.3.) suhu optimum oksigen terlarut produksi busa - Penelitian dilakukan menggunakan fermenter skala laboratrium yaitu 1-10L fermenter. lalu dimasukkan ke dalam chamber yang di alirkan udara lembab. Fluidized bed reactor Bioreactor jenis ini menyediakan agitasi secara kontinu dengan udara yang dipakasa masuk untuk mencegah adhesi dan agregasi partikel substrat. Bioreactor ini digunakan untuk memproduksi asam organic. d.) formulasi media system fermentasi (stirred tank. dimana udara lembab di alirkan secara kontinu. airlift. continuous.2001) 4. Substrat di tambahkan dengan ketinggian beberapa cm pada setiap tray. dimana substrat padat dikemas dengan selimut yang berfungsi sebagai control suhu. packed bed. serta kualitas dan kuantitas inokulum yang digunakan untuk memulai fermentasi. penelitian terhadap kinerja mikroorganisme dilakukan dengan mempertimbangkan berbagai hal seperti: pH optimum strategi pemberian nutrisi ( batch. etc. hal ini disebabkan oleh kondisi dalam fermenter skala besar tidak identik dengan yang di praktekkan dalam laboraturium. terdiri dari alas substrat yang kedalamannya mencapai 1 m. a.Rotating drum fermenter Terdiri dari bejana silinder yang berkapasitas 100 L dan terdapat roller yang berfungsi untuk menegakkan dan memutar bejana. hollow fibre. 76 . b. Prosedur propagasi inokulum yang diadopsi. Namun dalam scale up terdapat kerugian – kerugian seperti menurunnya hasil produksi. Column bioreactor Terdiri dari kolom yang terbuat dari kaca atau plastic. System ini berguna untuk memproduksi pakan ternak. Factor utama yang mempengaruhi hasil atau yield pada saat proses scale up : 1. jika tidak pengadukan akan tidak efisien. solid state. fed-batch. Fermenter ini digunakan pada produksi enzim dan biomassa mikroba. Kerugian utama dari pada unit ini adalah hanya dapat diisi 30% dari kapasitas total. (Waites. c. etc. Tray fermenter Bioreactor jenis ini sering digunakan untuk produksi makanan fermentasi dan enzim. Bed system Seperti yang digunakan dalam produksi sake.Fermentation process development Setelah mikroorganisme telah dipilih sebagai produser organism untuk proses tertentu . Jika mikroorganisme dikatakan cocok maka akan dilakukan scale up. System ini membutuhkan sejumlah tray dan runag inkubasi yang luas dengan kapasitas volume mencapai 150 m3 .

Batch akan mudah mencapai fase datar( stasioner) 10. 3. ketika katup mendeteksi tekanan dalam fermentor mengalami penyimpangan maka katu akan memberikan sinyal kepada controller untuk mengoreksi fermentor 2. Foam terbentuk karena ada gas-gas yang menarik protein keatas 7. Bagaimana anti busa dapat mengurangi laju aliran dalam fermentor? Apa perbedaan antara penambahan antibusa dan tidak adanya penambahan antibusa pada kondisi fisik cairan dalam fermentor?  Fungsi antibusa adalah untuk memecah busa sedangkan busa dihasilkan karena laju aliran yang ada dalam fermentor. Bagaimana cara kerja katup dalam proses fermentasi dalam mengatur tekanan dalam fermentor?  Katup yang dipasang dalam fermentor memiliki sensor yang dapat mendeteksi tekanan dalam fermentor. metabolit primer bekerja pada fase eksponensial yang membutuhkan penambahan terus 9. 4. mudah dihentikan. maka laju aliran dalam fermentor akan otomatis menjadi berkurang. Protokol sterilisasi skala industri dapat menyebabkan degradasi yang lebih besar dari senyawa yang tidak stabil. yang tidak dilakukan dalam skala kecil. Vivi anita aprilia (115061107111005) a. b. 5. Pemilihan media. Pada fed batch substrat digunakan untuk controller. ph. Fermentor yang besar sering dikenakan perkembangan gizi. maka asam atau basa dimasukkan. Terjemahan 2.2001) Komentar: 1. Substrat yang seperti apa?  Substrat yang dimasukkan dalam fermentor adalah substrat yang dibutuhkan dalam proses fermentasi. maka akan semakin banyak protein yang dihasilkan dan busa yang terbentuk juga semakin banyak. Konsentrasi asam atau basa ditentukan tergantung pada proses fermentasi 4. Semakin besar laju aliran. Pada keadaan bagaimana uap langsung dipakai 6.. Pada mode operasi batch. gradien suhu. Fermentasi harus digunakan pada fermentasi awal 3. sedangkan pada kontinu penghentian akan berdampak kerugian yang besar 8. gaya geser dan laju penghapusan karbon dioksida. Batch tidak untuk pembuatan metabolit primer. Apakah limbah tersebut berpotensi untuk mencemari lingkungan? 77 . Scale up juga dapat merubah generasi busa. Control proses dan monitoring pada fermentasi anaerob 5. sumber nutrisi yang lebih murah sering digunakan untuk operasi skala besar karena kendala biaya. Pada proses fermentasi pasti akan menghasilkan limbah. (Waites. Untuk klasifikasi substrat yang dimasukkan bergantung pada macam fermentasi dan macam produk yang akan dihasilkan b. yang mempengaruhi kualitas akhir dari medium. Febrika Larasati (115061101111001) a. Saat pH naik atau turun. Ketika busa ditekan pembentukannya. Keuntungan fermentasi substrat-padat Prtanyaan: 1. dan oksigen.2.

Dobita Amanda Feliciana (1150611001110021) Apa yang membedakan metode Galvani dan Polarografi pada kontrol proses? Pada proses Galvanisasi elektroda yang digunakan adalah anoda timbal atau seng dan katoda perak. Sel hidup memiliki tiga tipe kerja utama. Untuk limbah-limbah ini biasanya digunakan untuk bahan baku proses lainnya. Katalis diletakkan pada suatu pipa lalu dari sela-sela katalis dilewatkan bahan baku seperti air melewati sela-sela pasir pada saringan.  4. Semua proses fisika dan kimia merupakan hasil aplikasi atau perpindahan dari energi. Sedangkan pada metode Polarografi menggunakan anoda perak dengan polarisasi negative terhadap katoda platinum/emas dengan menggunakan kalium klorida sebagai elektrolit. Asumsi yang digunakan adalah tidak ada perbedaan konsentrasi tiap komponen yang terlibat di sepanjang arah jari-jari pipa. Molekul dan ion ditransportasi melewati sel membran melawan gradien elektro-kimia. Sharfina W. Kesetimbangan akan terbentuk antara konsentrasi karbon dioksida di sisi lain membran. PFR Untuk reaksi heterogen. misalnya antara bahan baku gas dengan katalis padat menggunakan model PFR. 3. energi dibutuhkan untuk menambah kompleksitas molekular dari sel. G. sebuah molekul bisa bergerak ke 78 . Ketiganya penting untuk proses hidup. PFR mirip saringan air dari pasir. (1150611005111003) Professor Chandra pernah menyebutka tentang Reaktor Plug Flow? Adalah suatu alat yang digunakan untuk mereaksikan suatu reaktan dalam hal ini fluida dan mengubahnya menjadi produk dengan cara mengalirkan fluida tersebut dalam pipa secara berkelanjutan (continuous). dan lain-lain. Model ini biasanya digunakan pada reaksi homogen di mana semua bahan baku dan katalisnya berfasa cair.  Pada proses fermentasi. Afida khofsoh (1150611011110031) Kapan metode fermentasi tertentu dapat digunakan? Tergantung hasil produk apa yang diinginkan. Limbah fermentasi biasanya tidak mencemari lingkungan Winda Fauzi Istiqomah (115061101111003) Apa yang mendasari kondisi aliran pada proses? Jenis mikroorganisme yang digunakan dan produk yang akan dihasilkan dari proses fermentasi itu sendiri. • 8. atau reaksi antara cair dan gas dengan katalis cair.  5. limbah lainnya yaitu zat-zat yang merupakan hasil samping dalam fermentasi. Dua buffer dengan konsentrasi karbon dioksida yang diketahui digunakan sebagai bahan kalibrasi. yaitu kerja kimia. Sebagai contoh. dan kerja mekanik. Sitanggang (1150611001110015) Apa perbedaan CSTR & PFR? CSTR adalah reaktor model berupa tangki berpengaduk dan diasumsikan pengaduk yang bekerja dalam tanki sangat sempurna sehingga konsentrasi tiap komponen dalam reaktor seragam sebesar konsentrasi aliran yang keluar dari reaktor. Misalkan metode fermentasi kontinu digunakan untuk memproduksi vinegar atau cuka. Queen G. Biasanya reaktor ini dipakai untuk mempelajari berbagai proses kimia yang penting seperti perubahan kimia senyawa. Hasil perubahan konsetrasi karbon dioksida terlarut didapat dari variasi pH larutan yang dianalisa pada membrane yang bisa diketahui dengan elektroda pH. kerja transport.  6.  7. Intan Nuroniyah (115061101111001) Bagaimana cara menganalisa karbon dioksida terlarut? Diukur dengan menggunakan hydrophobic membrane. ENERGI DAN ENZIM Energi dapat didefinisikan sebagai kapasitas untuk melakukan kerja atau untuk melakukan suatu pergerakan. biasanya limbah yang dihasilkan yaitu gas keluaran mikroorganisme yaitu gas CO2. reaksi termal. Kerja kimia termasuk sintesis molekul biologi kompleks yang diperlukan oleh sel.

dalam sel meskipun konsentrasi di dalam sel lebih tinggi daripada konsentrasi di luar sel. Sama dengan larutan yang dapat keluar dari sel dengan melawan gradien konsentrasi. Proses ini disebut kerja transport dan membutuhkan energi agar dapat mengambil nutrisi, membuang kotoran, dan menjaga keseimbangan ion. Tipe ketiga adalah kerja mekanik. Energi dibutuhkan untuk mengubah lokasi fisik dari organisme, sel, dan struktur di dalam sel. Sumber energi pokok dari semua energi biologi adalah sinar matahari. Energi tersebut ditangkap oleh phototrops (organisme) selama fotosintesis, dimana ia diserap oleh klorofil dan pigmen lainnya, dan dikonversi menjadi energi kimia. Kemolithoautotrophs memeperoleh energi melalaui oksidasi komponen inorganik daripada melalui sinar matahari. Energi kimia dari fotosintesis dan kemolithotrofi dapat digunakan oleh fotolithoautotrophs dan chemolithoautotrophs untuk mengubah CO2 menjadi molekul biologi seperti glukosa. Molekul kompleks yang dihasilkan oleh organisme autotrophic (tanaman maupun produsen mikroba) bertindak sebagai sumber karbon untuk kemoheterotrophs dan konsumen lain yang menggunakan molekul organik kompleks sebagai sumber material dan energi untuk membangun struktur selulernya (autotrophs menggunakan molekul organik kompleks). Kemoheterotrophs selalu menggunakan O2 sebagai akseptor elektron ketika oksidasi glukosa dan molekul organik lain menjadi CO2. Proses ini, ketika O2 berperan sebagai akseptor elektron final dan O2 direduksi menjadi H2O, disebut respirasi aerobik. Banyak energi yang dihasilkan dalam proses ini. Jadi pada ekosistem, energi ditangkap oleh photoautotrophs dan kemolithoautotrophs; beberapa energi ini kemudian mengalir ke kemoheterotrophs ketika mereka memakai nutrisi yang didapat dari autotrophs. Produksi CO2 selama respirasi aerobik dapat digabungkan kembali ke dalam molekul organik kompleks selama fotosintesis dankemolithoautotrophy. Pada ekosistem, aliran karbon dan energi sangat berhubungan. Tabel mikroorganisme dan sumber energinya:

Sel-sel harus dengan efisien mentransfer energy dari produksi energy. Sel-sel harus memiliki bentuk yang sederhana dari energy, agar. Dalam kehidupan, kebanyakan organisme memiliki energi yang berupa adenosine 5‟ tripospat (ATP). Ketika ATP memecah diri menjadi adenosin dipospat (ADP)dan orthopospat (Pi), energi yang dihasilkan dapat digunakan untuk melakukan kerja. Kemudian, energi dari fotositesis,
79

respirasi aerobik, respirasi anaerobik, dan fermentasi digunakan untuk menyintesis ulang ATP dari ADP dan Pi. Siklus energi ini terjadi di dalam sel. Siklus energy dibuat dalam sel. Enzim adalah protein katalis yang memiliki spesivitas untuk reaksi. Katalis adalah substan yang mempercepat reaksi kimia tanpa ikut dalam proses reaksi tersebut. Enzim mempercepat reaksi seluler. Molekul yang bereaksi disebut substrat, substan yang terbentuk disebut produk. Banyak enzim yang merupakan protein murni, contohnya apoenzim, dan juga komponen nonprotein, yaitu kofaktor, yang dibutuhkan untuk aktivitas katalitik. Enzim lengkap terdiri dari apoenzim dan kofaktornya, yang disebut holoenzim. Jika kofaktor melekat pada apoenzim, ini disebut prosthetic group. Meskipun enzim berjumlah banyak dan jenisnya bermacam-macam, namun enzim dikelompokkan menjadi tujuh kelas umum. Pengelompokkan ini berdasarkan reaksi katalis yang dihasilkan oleh enzim. Enzim biasanya memiliki nama yang mirip dengan substrat yang akan direaksikan dan tipe reaksi katalis. Sebagai contoh, laktat dehidrogenase fungsinya adalah menghilangkan hidrogen dari laktat. Biasanya ditambah akhiran –ase. Klasifikasi enzim: Mekanisme reaksi enzim Enzim menambah kecepatan reaksi, tetapi tidak menjaga kesetimbangan secara konstan. Pada reaksi endergonik, enzim tidak melakukan kesetimbangan agar banyak produk terbentuk. Enzim mempercepat laju reaksi, agar laju reaksi melanjutkan kesetimbangan finalnya. Pada reaksi eksergonik, enzim akan menurunkan energi aktivasi. Energi aktivasi adalah energi yang dibutuhkan agar molekul reaktan dapat bereaksi bersama dan membentuk produk.

A B A tidak akan dikonversi menjadi B jika tidak disuplai oleh energi aktivasi. Enzim mengakselerasi reaksi dengan menurunkan energi aktivasi, sehingga banyak molekul yang memiliki cukup energi untuk membentuk produk. Enzim membawa substrat dengan bagian tertentu yang disebut sisi aktif atau katabolis aktif. Enzim dapat berinteraksi dengan substrat melalui dua cara, yaitu lock and key dan induced fit model. Pada lock and key, enzim dan substrat bergabung bersama membentuk kompleks, seperti kunci yang masuk dalam gembok. Di dalam kompleks, substrat dapat bereaksi dengan energi aktivasi yang rendah. Setelah bereaksi, kompleks lepas dan melepaskan produk serta membebaskan enzim. Ukuran molekul enzim > ukuran molekul substrat. Sementara itu pada induced fit model, sisi aktif enzim merupakan bentuk yang fleksibel. Ketika substrat
80

memasuki sisi aktif enzim, bentuk sisi aktif termodifikasi melingkupi substrat membentuk kompleks. Ketika produk sudah terlepas dari kompleks, enzim tidak aktif menjadi bentuk yang lepas. Sehingga, substrat yang lain kembali bereaksi dengan enzim tersebut. Contohnya adalah enzim heksokinase. Perubahan pH dan suhu mempengaruhi kerja enzim. Setiap enzim memiliki pH dan suhu optimum yang berbeda antara satu dengan yang lain. METABOLISME Metabolisme mencakup semua reaksi enzim-katalis dari sel, dan dapat dibagi menjadi proses primer dan sekunder. Jalur metabolisme primer umumnya digunakan oleh sebagian besar organisme. Terdapat dua jenismetabolisme, disebut sebagai katabolisme dan anabolisme, yang memanfaatkan energi dalam biosintesis komponen seluler untuk pertumbuhan dan perkembangan. Untuk mempermudah pemahaman, katabolisme dan anabolisme dianggap sebagai proses yang berbeda, tetapipada faktanya kedua jenis metabolisme tersebut sangat terintegrasi. Produk dari metabolisme primer yang penting untuk industri tertentu adalah alkohol, asam amino, asam organik, nukleotida, enzim dan mikroba sel (biomassa). Beberapa mikroorganisme juga melakukan metabolisme sekunder, yang melibatkan jalur yang tidak digunakan selama pertumbuhan yang cepat. Metabolisme, seringkali menghasilkan produk akhir yang spesifi. Metabolit sekunder yang penting untuk industri adalah alkaloid, antibiotik, racun dan beberapa pigmen. Metabolit sekunder tertentu dapat memberikan suatu keuntungan ekologi, sedangkan yang lain tidak memiliki nilai nyata untuk organisme produser. KATABOLISME Semua sel mikroba vegetatif memerlukan pasokan energi kontinyu untuk proses yang terkait dengan pertumbuhan,transportasi, gerakan, dan perkembangan. Dalam mikroorganismekemoheterotrophic, sumber energi organikdiperoleh dari lingkungan dan kemudianditransformasikan oleh serangkaian reaksi enzim yang dikendalikandalam jalur metabolik tertentu. Metabolisme ini (katabolisme) mengarah ke pembentukanenergi potensial dalam bentuk adenosine 5 ¢-trifosfat (ATP) dan koenzim tereduksi, sepertisebagai nikotinamida adenin dinukleotida (NADH), nicotinamideadenin dinukleotida fosfat (NADPH)dan flavin adenin dinukleotida (FADH2), dan panas. Sebagian besar mikroorganisme dapat memanfaatkan karbohidrat,yang dapat bertindak sebagai sumber karbon dan energy yang baik.Glukosa adalah substrat yang disukai banyak mikroorganisme danada sangat sedikit organisme yang tidak bisa menggunakannya. Di alam, glukosa bebas biasanya tidak tersedia, tetapi dapat diperoleh melalui berbagai bentuk. Ini mungkin berasal dari interkonversi heksosa lainnya, hidrolisis disakarida, oligosakarida dan polisakarida dari lingkungan, atau dari bahan sel penyimpanan, seperti pati, glikogen dan trehalosa. Pembentukan energi dari glukosa didahului oleh fosforilasi, awalnya diikuti oleh oksidasi melalui sebagian besar piruvat (C3). Metabolisme glukosa untuk piruvat disebut glikolisis yang menyediakan ATP, prekursor dan mengurangi daya (terutama NADH). Namun, hanya ATP dalam jumlah terbatas yang diproduksi, yang dibentuk melalui substrat-tingkat fosforilasi. Maksimal dua molekul ATP yang dihasilkan untuk setiap unit glukosa teroksidasi ke titik ini. Proses ini menghasilkan piruvat yang menempati posisi penting dalam metabolisme perantara dan merupakan titik awal untuk katabolisme lanjut. JALUR GLIKOLISIS 1. Embden-Meyerhof-Parnas (EMP)Pathway EMP merupakan rute yang paling umum dan ditemukan di semua kelompok utama organisme, termasuk flagelata, jamur, ragi dan bakteri. Jalur ini dapat beroperasi di bawah kondisi anaerobik atau aerobik dan terdiri dari reaksi 10 enzim-katalis yang terletak di dalam matriks sitoplasma. Kunci ketiga regulasi enzim dari jalur (heksokinase, fosfofruktokinase dan kinase piruvat) bertindak irreversibel. Semua langkah lainnya terjadi secara reversibel, yang penting untuk peran biosintesis dari jalur selama sintesis glukosa.

81

terutama erythrose-4-fosfat. enam NADPH dan dua fruktosa 6-fosfat (F6P). untuk membentuk 2-okso-3-deoksi-6-phosphogluconate.GAP secara langsung diproses di jalur ini dan DAP akan diisomer untuk GAP sebelum dapat digunakan. 2. Molekul enam-karbon dibelah oleh aldolase untuk membentuk dua senyawa C3. ribulosa 5-fosfat mengalami penataan ulang dalam serangkaianduakarbon dan tiga-karbon pertukaran fragmen.6-bifosfat. terutama untuk digunakan dalam langkah reduktif dalam proses anabolik.Untuk proses setiap tiga unit glukosa. Fosfat pentosa (PP) Pathway Jalur monofosfat ditemukan di banyak bakteri dan sebagian besar organisme eukariotik. Untuk setiap molekul glukosa dioksidasi menjadi dua molekul piruvat. satu ATP.Tahap awal dari pemecahan glukosa membutuhkandua molekul ATP dalam pembentukan tiga-tahap fruktosa1. Secara keseluruhan. Yang pertama pada akhirnya dikonversi ke laktat dan yang kedua ke etanol. ribulosa5-fosfat (Rump). dan fosfat dihidroksiaseton (DAP). Oksidasimolekul resultan GAP dua piruvat menghasilkanenergi dalam bentuk empat molekul ATP melalui reaksi fosforilasi duasubstrat. melalui 6-phosphoglukonat. Gula pentosa seperti xylose juga dapat dikatabolisasi melalui rute ini.Ini melibatkan hilangnya satu karbon sebagai CO2 danpembentukan dua NADPH. Jalur ini menghasilkan hanya setengah hasil ATP dibandingkan dengan jalur EMP. Xanthomonas dan Zymomonas. dan lainnya biosintesis intermediet. dihasilkan satuGAP.dapat menghasilkan dua molekul piruvat. intermediet untuk sintesis asam amino aromatik. Namun. gliseraldehida 3-fosfat(GAP). Molekul F6P dikonversikembali ke G6P untuk mempertahankan operasi dari siklus. Siklus enzim TCA terletak dalam matriks mitokondria pada bakteri eukariotik. Molekul ini kemudian dipecahmelalui aldolase untuk membentuk triose fosfat(C3). Jalur PP di bawah kondisi aerobik atau anaerobik. Jalur dimulai dengan pembentukan 6-phosphogluconate. dan yang terakhir juga dapat dikonversi menjadi piruvat. Setelah fase oksidatif ini. enzimnya terletakdi matriks sitoplasma. Jalur ini sangat penting dalam penyediaan NADPH. 3. The Entner-Doudoroff (ED) Pathway Relatif digunakan oleh sedikit mikroorganisme yang tidak memiliki jalur EMP. satu NADH dan satu NADPH. Kebanyakan bakteri gram-negatif. dari setiap molekul glukosa dimetabolisasi. dari piruvat dibawah kondisi aerobic dengan menggunakan siklus Asam Trikarboksilat (TCA). Phosphoketolase (PK) Pathway Jalur ini juga sering disebut sebagai jalur Warburg-Dickens yang dioperasikan oleh beberapa asam laktat bakteri. 10-20% glukosa (lebih selama pertumbuhan pesat) terdegradasi melalui jalur PP. Dekarboksilasi oksidatif piruvat dilibatkan untuk membentuk unit C2 asetil koenzim A (asetil KoA). yang merupakan hasil energi yang lebih rendah daripada jalur EMP. Pseudomonas. bukan teroksidasi. 82 . tapi jarang dalam jamur. 4. ganggang dan protozoa. jamur berfilamen. dan GAP. RuMP yang diisomerisasi untuk xylulose fosfat 5-(C5) dan kemudian dibelah oleh phosphoketolase untuk GAP (C3) dan asetil fosfat (C2). Ini melibatkan oksidasi dan dekarboksilasi glukosa 6-fosfat ke RuMP. Jalur PP adalah siklik dan seperti semua jalur glikolitik. Dalam ragi. terutama spesies Lactobacillus dan Leuconostoc. kemudian mengalami dehidrasi. Jalur ini dimulai dengan oksidasi dua langkah oksidasi glukosa6-fosfat (G6P) ke fosfat pentosa(C5). dan memiliki peran katabolik dan anabolik yang baik. sedangkan pada prokariota mereka berada di sitoplasma. Mayoritas katabolisme bakteri. termasuk spesies Azotobacter. pentosa. dan sisanya dikatabolisasi melalui jalur EMP. terutama ribosa untuk biosintesis asam nukleat. ragi. misalnya.dikatalisis oleh enzimtransketolase dan transaldolase. seperti di jalur PP. Rhizobium. seperti di jalur PP. GAP dapat dioksidasi menjadi piruvat dengan enzim pada jalur EMPatau juga dapat dikembalikan ke jalur awal melalui konversi dari dua GAP satu G6P. piruvat. Jalur ini seringkali beroperasi pada waktu yang sama dengan jalur EMP.

Hal ini membutuhkan oksigen . 2001) RESPIRASI Semua formasi ATP dari oksidasi glukosa memilikitelah dibentuk melalui substrat-tingkat fosforilasi. untuk biosintesis amino. dan molekul ATP tunggal dibentuk langsung oleh fosforilasi tingkat-substrat. sebagai perantara beberapa masih diperlukan untuk biosintesis. senyawa C4 dan C5. 83 . Asetil KoA juga dapat dibentuk melalui pemecahan lipid dan beberapa asam amino. namun juga menyediakan intermediet. yang mana mikroorganisme dapat memanfaatkan. Siklus TCA tidak hanya sebuah jalur katabolik. beroperasi sebagai bercabang biosintesis jalur. Namun. Hasilnya adalah sebagai berikut: Asetil KoA (C2) + 3NAD+ + FAD + ADP  2 CO2 + 3NADH + 3H+ + FADH2 + ATP Dalam hal katabolisme. dan mereduksi elektron pembawa untuk menghasilkan NADH dan FADH2. Selama delapan langkah berikut dari sikluslengkap TCA. Tiga reaksi dalam hasil siklus dalam pembentukan NADH dan satu menghasilkan FADH2. seperti dalam beberapa prokariota anaerob fakultatif dan obligate. Dalam kondisi anaerobik tidak berfungsi sebagai siklus. siklus TCA melengkapi oksidasi piruvat menjadi CO2. piruvatdehidrogenase. Respirasi mengarah ke pembentukanlebih banyak ATP dari oksidasi NADH dan FADH2. sedangkan beberapa dari produk akhir respirasi anaerob yang beracun. misalnya nitrat direduksi menjadi nitrit. ( Waites at all. senyawa lain atau ion yang memiliki potensial redoks rendah.dikatalisis oleh multienzim yang kompleks. asam purin dan pirimidin. dan dai oksidasi alkana. karena memiliki potensi redoks rendah dan direduksi menjadi air. untuk bertindak sebagai akseptor elektron terminal. koenzim ini tereduksi kemudian dapat digunakan untuk sintesis ATP dalam respirasi dan yang lebih penting. Siklus yang tepat dimulai dengan kondensasi senyawa dua-karbon dengan oksaloasetat (C4) untuk membentuk sitrat (C6). Fasilitas ini untuk menghasilkan biosintetik intermediet juga hadir dalam mikroorganisme lainnya yang tidak memiliki siklus TCA lengkap. Oksigen sangat ideal untuk ini. dua fragmen karbon teroksidasi menjadi dua molekul CO2 dan oksaloasetat adalah diregenerasi untuk menerima unit dua-karbon lebih lanjut.

Oleh karena itu. tujuh ATP maksimum didapat. Electron memasuki ETS dari pembawa. dengan rantai pemendek yang tidak lengkap pembentukannya sehingga hanya satu atau dua molekul ATP setiap NADH yang terbentuk. atau untuk produksi ATP melalui oksidatif fosforilasi. akan dibentuh per NADH jika eneginya dikonversi 100% secara efisien. Meskipun system ini hanya sampai 40% dan oleh karena itu produk maksimum hanya 3 molekul ATP per NADH. Akibatnya. seperti yang dijelaskan di atas. Pada eukariota. sedangkan pada prokariota itu terikat dalam membran sitoplasma. sedangkan proton pindah dari dalam ke luar membran. seperti transportasi terlarut.5. elektron tersebut kemudian melewati serangkaian dari pembawa dalam membran. dan o. ETS dalam membran sitoplasmik memiliki pembawa yang agak berbeda. d. Gradien proton Ini digunakan untuk mengankut pembentukan ATP oleh oksidatif kemiosmotik fosforilasi mekanisme. mereka yang direoksidasi untuk digunakan lebih lanjut dalam metabolisme. dimediasi oleh sintase ATP (ADP + Pi ÆATP). Proton akhirnya melekat menjadi oksigen. sebagian besar dalam bentuk hidroksil (OH-) ion. Pasti anaerobic 84 . proton (H+) yang dipindahkan dari dalam ke luar membran (ekskresi). dalam teori. ETS dalam membran mitokondria menghasilkan tiga ATP molekul per NADH. pH luar membran bisa mencapai 5. sedangkan di bagian dalam membrann mendekati 8. energi dilepaskan selama aliran elektron digunakan untuk membuat gradien proton untuk melintasi membran. 2001) Sebuah molekul NADH teridiri atas sekitar 218 kJ dari energy potensial dan itu diambil sekitar 30kJ untuk membentuk satu molekul ATP. Hipotesis kemiosmotik diusulkan oleh Mitchell (1961) menjelaskan proses sebagai berikut: sebagai aliran elektron melalui sistem transportasi. Ini merupakan energi potensial disimpan sebagai gradien proton atau proton-kekuatan pendorong. melalui serangkaian redoks atau reduksi-oksidasi reaksi. dan terdiri dari berikut rantai pembawa elektron: NADH  flavoprotein  iron shulphur protein  quinone  cytochrome b  cytochrome c  cytochrome a  cytochrome a3 oxygen Dalam bakteri prokariotik. sebagai positif biaya yang dikeluarkan dari dalam membran. b562. Dalam proses ini. Elektron yang berasal dari oksidasi substrat yang berasal dari NADH atau FADH2. muatan negatif tetap berada di dalam. membentuk air.ETS Eukariota terletak di membran mitokondria. yang mendorong sintesis ATP melalui kemiosmotik fosforilasi.5. mereka tidak bisa lewat kembali dan gradien proton didirikan. Cythochromic yang terlibat meliputi : b558. Rangkaian reaksi yang terlibat dapat digabungkan ke kebutuhan energi proses. Ketika operator menyumbangkan elektron. Karena membran pada dasarnya kedap proton. Respirasi aerobik dilakukan oleh bakteri aerob dan fakultatif anaerob dengan bantuan oksigen. ke terminal akseptor. ( Waites at all. terutama NADH atau FADH2.

fakultatif seperti Eshcerichia coli, setidaknya memiliki dua system respirasi, masing-masing berbeda afinitas oksigennya. Oleh karena itu, mereka dapat beradaptasi dengan konsentrasi oksigen yang bervariasi, dilanjutkan untuk menggunakan oksigen sebagai aseptor electron meskipun pada tingkat oksigen yang rendah. Beberapa bakteri anaerobic fakultatif atau anaerobic obligat melakukan respirasi anaerob. Keterlibatan ini serupa ETS, tetapi memiliki aseptor electron selain oksigen. Contoh dari respirasi anaerobic mencakup : 1. Respirasi Nitrogen, dilakukan oleh bakteri anaerobic fakultatif. Potensial redok dari nitrat adalah +0,42 volt, dibandingkan dengan +0,82 volt untuk oksigen. Oleh karena itu, lebih sedikit energy didapatkan kemudian oksigen sebagai electron aseptor dan molekul ATP dapat terbentuk. Prosesnya memiliki beberapa langkah, dimana nitrat direduksi melalui nitrat dan nitous oksida akhirnya menjadi dinitrogen, yangmana merujuk sebagai disimilator reduksi nitrat atau denitifikasi. Denitrifikasi meliputi spesies dari Pseudomonas, Paracoccus denitrificans, and Thiobacillius denitrificans.Bakterianaerob fakultativ yang lain meliputi E. coli dan relative, hanya mengurangi nitrat atau nitrit, dan tanggungjawab enzim, reduktase nitrat , dengan tingakt keberadaan oksigen yang terbatas. 2. Respirasi Sulfat, dipraktekan oleh kelompok kecil dari bakteri heterotrof, yang mana semuanya anaerobic obligat, misalnya spesies Desulfovibro. Mereka memproduksi hydrogen sulfide, yang berasal melalui beberapa kali intermediet. 3. Respirasi Karbon, dilakukan oleh archaeans seperti Methanococcus and Methanobacterium. Keduanya anaerob obligat yang mereduksi CO2 dan beberapa karbon monoksida menjadi metana. Bakteri metanogen ini biasanya menggunakan hydrogen sebagai sumber energy merekadan untuk mendapatkan anoksik lingkungan yang rendah nitrat dan sulfat. CO2 + 4H2 CH4 + 2H2O Dalam penambahan nitrat, sulfat, dan karbondioksida, Besi (Fe3+), magnesium (Mn4+) dan beberapa komponen organic (dimetil sulfoksida, fumarat,glisin, dan trimetilamin oksida )dapat digunakan sebagai aseptor pada respirasi anaerobic pada bakteri. FERMENTASI Ketika respirasi bukan sebuah pilihan, organisme harus menggunakan mekanisme alternative untuk regenerasi suplai coenzim yang terbatas, direduksi selama oksidasi glukosa menjadi piruvat. Jika NAD(P)H tidak dioksidasi kembali menjadi NAD(P)+, selanjutnya metabolisme akan berhenti. Oleh karena itu, sebuah aseptor electron yang cocok harus di dapatkan untuk membawa electron. Fermentasi digunakan oleh molekul organik, piruvat atau derivative, sebagai aseptor elektron akhir, dengan cara demikian pembentukan NAD(P)+ dan katabolisme akan berlanjut. Ini adalah hasil dari pembentukan reduksi produk limbah , seperti alkohol dan asam, yang kemudian dikeluarkan dari sel. Meskipun, ini sangat boros dalam ketentuan dari pemulihan energy potensial dari glukosa, sebagai sedikit atau tidak ada ATP lebih lanjut dibentuk. Sebaliknya, oksidasi yang lengkap menghasilkan CO2, dalam hubungan dengan oksidasi posporilasi selama respirasi akan dapat membentuk 36 molekul ATP bahkan lebih per molekul glukosa. Fermentasi alkohol dilakukan oleh ragi, filamen jamur tertentu dan bakteri. Ini adalah suatu penerusan proses, di mana piruvat dari jalur EMP, atau melalui jalur ED dalam kasus Zymomonas, adalah dekarboksilasipertama menjadi asetaldehida, NAD+ kemudian dibentuk kembali selama reduksi asetaldehida menjadi etanol. Fermentasi asam laktat dilakukan oleh sejumlah bakteri, termasuk Streptococcus, Lactobacillus, Lactococcus dan Leuconostoc, bersama dengan beberapa jamur, alga dan protozoa. Berikut piruvat, bukan turunan piruvat, adalah akseptor elektron dan bentuk laktat. Ada dua bentuk fermentasi ini: 1. Fermentasi Homolaktik yang dioperasikan oleh bakteri seperti Lactobacillus acidiophilus and Lactobacillus casei, yang mana mengurangi hampir semua piruvat yang dibentuk oleh glikolisis asam laktik.
85

2. Fermentasi heterofermentatif menghasilkan produk lainnya bersama dengan asam laktat. Organisme yang melakukan itu termasuk Leuconostoc mesenteroides dan Lactobacillus brevis, yang mengoperasikan jalur PK. Mereka membentuk laktat dari piruvat dan etanol dari fosfat asetil, dan dalam kasus tertentu asetat beberapa mungkin diproduksi. Fermentasi asam campuran yang dilakukan oleh E. coli dan terkait fakultatif anaerob. Produk meliputi laktat, asetat, jumlah kecil dari etanol dan format. Beberapa organisme memiliki kemampuan untuk mengurangi formate menjadi hidrogen dan CO2. Fermentasi 2,3-Butanediol dilakukan oleh Enterobacter, Erwinia, Klebsiella dan Serratia. Hal ini mirip dengan fermentasi campuran asam, namun menghasilkan butanadiol, bersama dengan etanol dan asam. Fermentasi asam propionat dilakukan oleh beberapa usus bakteri, seperti Propionibacterium spesies, beberapa yang terlibat dalam produksi komersial tertentu jenis kejuSwiss dan vitamin B12 (cobalamin). Propionat yang terbentuk dari piruvat melaluiCoA, di mana piruvat adalah terkarboksilasi oleh oksaloasetat, dan kemudian dikurangi menjadi propionat melalui malat, fumarat dan suksinat.Proses ini membutuhkan kofaktor, biotin, CoA dan CoB12. Fermentasi asam butirat dilakukan oleh spesies Clostridium. Spesies ini adalah pembentuk spora anaerobik yang juga memproduksi aseton, butanol, propanol, alkohol danasam lainnya. Mereka juga fermentasi asam amino, nitrogen dan senyawa lainnya, serta karbohidrat. KATABOLISME LIPID DAN PROTEIN Karbon merupakan sumber karbohidrat,sebelum karbon digunakan dalam katabolisme, seperti lipid sebagai digliserida dan trigliserida dihidrolisis oleh lipase untuk menghasilkan asam lemak bebas dan gliserol. Asam lemak kemudian dapat dipecah oleh jalur b-oksidasi. Berikut FAD dan NAD+ yang digunakan untuk menerima elektron, dan duaunitkarbon berhasil dihapus, dalam bentuk asetil CoA, yang kemudian dapat memberi makan langsung ke siklus TCA. Gliserol dapat terfosforilasi untuk fosfat gliserol, diikuti oleh oksidasi terhadap DAP dan isomerisasi untuk GAP. Unit C3 kemudian bisa masuk jalur EMP. Protein ekstraseluler yang dihidrolisis oleh protease untuk menghasilkan asam amino bebas, yang dapat diangkut ke sel. Katabolisme asam amino awalnya melibatkan penghapusan kelompok amino mereka. Hal ini biasanya dicapai melalui transaminasi, di mana kelompok amino yang disumbangkan ke host keto, misalnya aminasi piruvat untuk membentuk alanin. Asam keto yang dihasilkan dari transaminasi kemudian dapat dioksidasi dalam siklus TCA. Kelebihan gugus amino dapat terakumulasi dan sering diekskresikan sebagai ion amonium, yang menyumbang untuk meningkatkan pH media selama pertumbuhan beberapa bakteri. PENYIMPANAN ENERGI Ketika kelebihan gizi yang tersedia, mikroorganisme biasanya mensintesis senyawa yang dapat disimpan untuk kemudian gunakan selama periode kekurangan nutrisi. Penyimpanan karbohidrat termasuk polisakarida, glikogen dan pati, dan trehalosa disakarida, yang semuanya bertindak sebagai sumber karbon dan energi. Trehalosa diproduksi oleh jamur berfilamen, ragi dan beberapa bakteri, dan glikogen merupakan penyimpanan utama karbohidrat di banyak kelompok mikroorganisme. Bila diperlukan, cadangan polimer yang dihidrolisis oleh phosphorylases, membentuk glukosa 1-fosfat, yang secara langsung dapat masuk katabolisme. Banyak mikroorganisme menyimpan energi yang kaya lipid. Poli b-hidroksibutirat umumnya ditemukan pada bakteri, namun tidak diproduksi oleh eukariota. Jamur berfilamen dan ragi sering menyimpan lipid netral (trigliserida) dalam vakuola. Volutin butiran, terdiri dari polymetaphosphates, juga disimpan oleh beberapa prokariota dan eukariota, yang bertindak baik sebagai fosfat dan cadangan energi. Bakteri Sulphur dapat mengakumulasi butiran belerang oleh oksidasi H2S. Ketika tidak ada media lanjut pasokan sulfida yang tersedia, ini toko belerang teroksidasi untuk sulfat, menyediakan setara mengurangi CO2 untuk fiksasi atau fosforilasi oksidatif.
86

Pertanyaan: 1. Bagaimana proses pembentukan enzim? (Pandu Rahmat Pinasthiko/115061107111001). Pembentukan enzim memerlukan bahan baku asam amino, sehingga pembentukannya identik dengan sintesis protein. Sintesis protein dilakukan oleh RNA berdasarkan transkip kode dari DNA. Sintesis ini dilakukan di dalam ribosom (Sumardjo, 2006). 2. Mengapa pada siklus asam trikarboksilik, terdapat materi yang berubah-ubah? (Lilis Triyowati A./115061101111009) Pada siklus trikarboksilik, diperlukan enzim yang membantu untuk mengkatalis reaksi, enzim yang dibutuhkan tersebut berbeda-beda jenisnya dan nantinya akan keluar dari siklus membentuk enzim yang sama. 3. Pada proses respirasi sulfur anaerob, apa maksud intermediet yang menghasilkan hidrogen sulfida? (Ayu Indah W./115061101111011) Intermediet adalah molekul-molekul yang terbentuk dari reaksi sebelumnya. 4. Apa faktor-faktor yang mempengaruhi siklus krebs? (Dian Nita Citra D./115061101) Faktor yang mempengaruhi silus kreb adalah ketersediaannya glukosa sebagai material utama yang dipecah. 5. Dimana energi disimpan pada mikroorganisme? (Dwi Chandra P./115061107111003) Energi disimpan dengan berbagai macam cara, setiap mikroorganisme memiliki cara yang berbeda, salah satunya adalah di dalam vakuola. 6. Dimana siklus trikarboksilik terjadi? (Dhanang Edy P./115061101111). Siklus trikarboksilik terjadi di matriks mitokondria (Campbell, dkk., 2002). 7. Perubahan NAD+ menjadi NADH, FADH menjadi FADH2 atau sebaliknya dibantu dengan apa ? Lalu saat kapan dan dimana proses tersebut terjadi ? Jelaskan ! (Sharfina Widyaningrum/1150611051110) Penjelasan : NAD+ adalah hasil reduksi dari NADH. NADH bersama piruvat dan H+bereaksi dan membentuk NAD+ dan laktat, seperti reaksi berikut :

Piruvat tersebut berasal dari proses glikolisis yang terjadi pada mikroba. (John F, 1986). Sedangkan pembentukan FADH2 terjadi seperti digambarkan pada reaksi berikut :

(Kenneth B,2004) 8. Mikroorganisme terdiri dari berbagai macam jenis. Apakah energy yang disimpan oleh tiap-tiap mikroorganisme sama? (Febrika Larasati/115061101111001) Energi yang disimpan oleh tiap-tiap organisme berbeda, sebagai contoh, penyimpanan karbohidrat termasuk polisakarida, glikogen dan pati, dan trehalosa disakarida, yang semuanya bertindak sebagai sumber karbon
87

dan energi. Trehalosa diproduksi oleh jamur berfilamen, ragi dan beberapa bakteri, dan glikogen merupakan penyimpanan utama karbohidrat di banyak kelompok mikroorganisme. 9. Hasil dari respirasi nitrat, sulfat, dan karbohidrat tersebut digunakan untuk apa? (Mutia Dhana F./11506110011100) Hasil dari reaksi anaerob menyebabkan lingkungan tercemar, jadi adanya hasil respirasi anaerob dapat dijadikan indikator kesehatan lingkungan. 10. Pada siklus asam trikarboksilik, mengapa CoASH harus masuk dan keluar lagi dalam siklus ? fungsi dari CoASH itu apa ? Dan apakah ada bedanya CoASH yang masuk dan keluar (komposisi) ?(Freshsya Zatalini/115061100111003) CoASH adalah koenzim A yang fungsinya adalah sebagai enzim yang mengkatalis reaksi, sehingga CoASH yang masuk ke dalam siklus sama dengan yang keluar, tidak ada perbedaan dari segi komposisi karena sifat enzim tidak ikut bereaksi. 11. Pada respirasi sulfat tidak memerlukan oksigen, apakah itu benar? Padahal semua organisme itu selalu membutuhkan oksigen. (Mar‟atus Sholihah/11506110011100) Respirasi sulfat tidak memerlukan oksigen karena respirasi sulfat membutuhkan sufat yang direduksi, dalam peristiwa, oksigen tidak dibutuhkan

88

zat nonorganik dan zat yang memproduksi energi yang ditemukan dalam makanan dan di. mereduksi sulfat menjadi hidrogen sulfida (H2S). Banyak mineral lainnya sepertiMn2+. Semua organisme membutuhkan karbon Semua organisme hidup membutuhkan karbon dioksida walaupun dalam jumlah yang sedikit tetapi kebanyakan diantaranya juga membutuhkan beberapa senyawa karbon organik. Semua organisme yang hidup memerlukan nitrogen Tumbuhan menggunakan nitrogen dalam bentuk garam nitrogen anorganik seperti kalium nitrat (KNO3)sedangkan hewan membutuhkan senyawa nitrogen organik seperti protein dan produk-produk hasil peruraiannya yaitu peptida dan asam-asam amino tertentu.Belerang adalah komponen dari banyak substansi organik sel. Organisme yang membutuhkan senyawa-senyawa organik lain sebagai sumber karbonnya disebut organisme heterotrof . Mo2+. Mg2+.PENGERTIAN NUTRISI DAN NUTRIEN Nutrisi adalah apa yang dimakan seseorang dan bagamaina tubuh menggunakannya sedangkan nutrien adalah zat organik. 7. magnesium. 4. mangan. Semua organisme hidup membutuhkan beberapa unsur logam. dan bila memperoleh energinya dengan cara mengoksidasi senyawa kimia. Cu2+. dan besi. maka disebut organisme kemoautotrof. magnesium. seperti gula dan karbohidrat lain. Bila mereka memperoleh energinya dari cahaya maka disebut organisme fotoautotrof.Beberapa bentuk kehidupanseperti tumbuhan hijau dapat menggunakan energi pancaran atau cahaya dan dinamakan fotoautotrof. hal yang perlu dilakukan yaitu menyediakan sumber potassium. Mikroorganisme yang lain tidak dapat menggunakan karbon dioksida sebagai sumber karbon dan hidupnya bergantung pada organisme ototrof untuk memproduksi karbohidrat dan senyawa-senyawa organik lain yang digunakan sebagai makanan. kalium. biasanya dalam bentuk ionion (K+. dan Zn2+ dibutuhkan dan mineral ini seringkali terdapat dalam air kran atau sebagai kontaminan dari kandungan medium lainnya. alga dan beberapa kuman berklorofil membutuhkan karbon dioksida dan mengubahnya menjadi karbohidrat melalui proses fotosintesis. 6. kalsium. 5.2009) PERSYARATAN Persyaratan nutrisi bagi organisme secara umum adalah sebagai berikut:( Plezar. Seluruh organisme hidup memerlukan oksigen 89 3.butuhkan untuk fungsi tubuh. dan Fe2+). semua organisme yang disebutkan diatas adalah organism autotrof. Dalam memformulasikan medium untuk pembiakan sebagian besar mikroorganisme. natrium. 2. seng.Beberapa mikroorganisme dapat mengasimilasi H2S secara langsung dari medium pertumbuhan tetapi senyawa ini dapat menjadi racun bagi banyak organisme. Co2+. besi. Ca2+. Sedangkan persayaratan akan sulfur pada tumbuhan secara khas dipenuhi melalui senyawa-senyawa anorganik. Semua organisme hidup membutuhkan belerang (sulfur) dan fosfor Persyaratan akan zat sulfur pada hewan secara khas dipenuhi oleh senyawa-senyawa sulfur organik. Kebanyakan mikroorganisme dapat menggunakan sulfat sebagai sumber belerang. Semua organisme hidup membutuhkan sumber energi. Belerang membentuk bagian struktur beberapa koenzim dan ditemukan dalam rantai samping cisteinil dan merionil protein.2006) Nutrisi sebagai sumber energi NUTRISI 1. tembaga dan kobalt untuk pertumbuhannya yang normal.(Berman dkk. Fosfor biasanya diberikan sebagai fosfat yaitu garam-garam fosfat. . Ditinjau dari segi nutrisi. Tumbuhan. Semua organisme hidup membutuhkan air untuk fungsi-fungsi metabolisme danpertumbuhannya. Beberapa bakteri autotropik dapat mengoksidasinya menjadi sulfat (SO42-). kalsium.

makhluk hidup yang tidak membutuhkan nutrien organik untuk pertumbuhannya. Karbondioksida dibutuhkan pada sejumlah reaksi biosintesis. Meskipun bakteri membutuhkan vitamin didalam proses metaboliknya yang normal. tetapi sangat sedikit organisme yang memiliki jalur metabolik yang perlu untuk asimilasi naphthalene. dan sumber nitrogen.Jalur dissimilasi digunakan oleh organisme yang menggunakan ion ini sebagai 90 2. Semua organisme hidup membutuhkan vitamin Vitamin adalah senyawa organik khusus yang penting untuk pertumbuhan. .Mikroorganisme anaerob fakultatif tumbuh dengan adanya O2 udara. 1. Autotrof lain adalah khemolitotrof yaitu organisme yang menggunakan substrat anorganik seperti hidrogen atau thiosulfat sebagai reduktan dan karbondioksida sebagai sumber karbon.Jalur asimilasi ini berbeda dengan jalur dissimilasi nitrat dan nitrit. beberapa mikroba mampu mensintesis seluruh kebutuhan vitaminnya.8. oksigen tersedia dalam bentuk air. Organisme anaerob obligat hanya dapat hidup dalam lingkungan bebas oksigen. Heterotrof membutuhkan karbon organik untuk pertumbuhannya dan karbon organik tersebut harus dalam bentuk yang dapat diasimilasi.Selanjutnya oksigen juga terdapat dalam CO2 dan dalam bentuk senyawa organik. sumber mineral. bahan pembangun sel. dapat membantu pertumbuhan fermentatif atau respirasi dari banyak organisme.2003) Sumber Karbon Tumbuhan-tumbuhan dan beberapa bakteri mampu mengunakan energyfotosintetik untuk mereduksi karbondioksida pada penggunaan air. tetapi yang lain membutuhkan sumber karbondioksida pada medium pertumbuhannya.Organisme ini termasuk kelompok autotrof. Organisme dibedakan menjadi tiga yaitu organisme aerob obligat yang mampu menghasilkan energi hanya melalui respirasi dan dengan demikian tergantung pada oksigen. Oksigen yang berasal dari molekul oksigen hanya akan diinkorporasi ke dalam substansi sel sebagai sumber karbon yang digunakan metana atau hidrokarbon aromatik yang berantai panjang. sumber aseptor elektron. Untuk sel. JENIS NUTRIENT Nutrien dalam media perbenihan harus mengandung seluruh elemen yang penting untuk sintesis biologik organisme baru. sumber energi.Sebaliknya. Kebanyakan vitamin berfungsi membentuk subsansi yangmengaktifkan enzim. yaitu ±10 % dari berat kering sel bakteri. dan sebagai aseptor atau donor elektron.Contohnya naphthalene dapat menyediakan semua karbon dan energi yang dibutuhkan untuk pertumbuhan respirasi heterotropik. Dalam aspek nutrisi akan vitamin pada bakteri menunjukkan pola yang beragam.Hasil akhir dari seluruh jenis asimilasi nitrogen adalah bentuk paling tereduksi yaitu ion ammonium (NH4+). glukosa. Banyak organisme respiratif menghasilkan lebih dari cukup karbondioksida untuk memenuhi kebutuhannya.Untuk organisme ini O2 bersifat toksik. Bahan makanan yang digunakan oleh jasad hidup dapat berfungsi sebagai sumber energi. jadi bersifat aerotoleran tetapi organisme ini tidak dapat memanfaatkan O2tetapi memperoleh energi semata-mata dari peragian. faktor tumbuh.Nitrogen mungkin disuplai dalam bentuk yang berbedadan mikroorganisme beragam kemampuannya untuk mengasimilasi nitrogen. Nutrient diklasifikasikan berdasarkan elemen yang mereka suplai yaitu : (Rusdimin.Selain itu masih banyak organisme yang tergantung dari molekuloksigen (O2 atau dioksigen). sumber karbon. Sumber Nitrogen dan Belerang Nitrogen merupakan komponen utama protein dan asam nukleat.Substrat pertumbuhan disuplai pada tingkatan yang cocok untuk galur mikroba yang akan ditumbuhkan. Banyak mikroorganisme memiliki kemampuan untuk mengasimilasi nitrat (NO3) dan nitrit (NO2) secara reduksi dengan mengubahnya menjadi amoniak (NH3).Secara garis besar bahan makanan dibagi menjadi tujuh golongan yaitu air.

Fungsi air adalah sebagai sumber oksigen untuk bahan organik sel pada respirasi. NADP dan flavin. Bagi banyak golongan faali. yang dikeluarkan ke atmosfer. Berdasarkan jumlah yang digunakan nutrient juga dibedakan menjadi dua yaitu makronutrient(digunakan dalam jumlah besar) dan micronutrient(digunakan dalam jumlah kecil). Proses tersebut membutuhkan sejumlah besar energi metabolik dan tidak dapat aktif dengan adanya oksigen. dan Zn2+) dapat ditemukan dalam air kran atau sebagai kontaminan dari kandungan medium lainnya. lipid (fosfolipid. 6. lipid A).Hal yang perlu dilakukan yaitu menyediakan sumber potassium. oksigen molekular merupakan racun.Selain itu air berfungsi sebagai pelarut dan alat pengangkut dalam metabolism. magnesium. biasanya dalam bentuk ion-ion (K+.1 Nutrisi Makronutrien Bakteri Elemen % Berat Kering Sumber Fungsi Makronutrien Karbon 50 Senyawa organik Konstituen utama atau CO2 dari bahan material sel Oksigen 20 H2O.Dalam memformulasikan medium untuk pembiakan mikroorganisme. Sumber Mineral Sebagian besar mineral dibutuhkan untuk fungsi enzim. banyak metabolit. kalsium. . dan Fe2+). Organisme ini bergantung pada respirasi aerobik untuk memenuhi kebutuhan energi dan oksigen molekular berfungsi sebagai perantara yang mengoksidasi. Organisme semacam ini adalah anaerob obligat. maka organisme semacam iini disebut aerob obligat. Beberapa mikroorganisme yang dapat tumbuh baik dengan maupun tanpa oksigen molekular adalah anaerob fakultatif. senyawa Konstituen dalam organik.elektron penerima terminal dalam respirasi. beberapa polisakarida kapsul dan beberapa protein adalah bergugus fosfat. dan besi. Banyak organisme yang memerlukan oksigen molekular(O2). Mg2+. Fosfat selalu diasimilasi sebagai fosfat anorganik bebas (Pi). Sumber Oksigen Oksigen adalah komponen universal pada sel dan selalu terdapat dalam jumlah yang besar pada zat gizi yang utama yaitu air. Cu2+. asam nukleat dan sejumlah koenzim seperti NAD. 3. komponen dinding sel (teichoic acid). proses ini dikenal sebagai denitrifikasi. Selain itu. Tabel 2. dan hasilnya adalah gas nitrogen (N2). Kemampuan untuk mengasimilasi N2 secara reduksi melalui NH3 disebut fiksasi nitrogenadalah sifat untuk prokariota dan relatif sedikit bakteri yang memiliki kemampuan metabolisme ini. Ca2+. Mo2+. Air Air merupakan komponen utama sel mikroba dan medium. O2 91 4. Sumber Phospor Fosfat (PO43-) dibutuhkan sebagai komponen ATP. Kemampuan fiksasi nitrogen ditemukan pada beragam bakteri yang berevolusi sangat berbeda dalam strategi biokimia untuk melindungi enzim fixing-nitrogen nya dari oksigen. Co2+. baik membunuhnya maupun menghambat pertumbuhannya. 5. CO2 dan bahan material sel O2 dan cairan sel. Pada ekstrem faali yang lain terdapat mikroorganisme yang mendapat energi dari reaksi yang tidak menyertakan pemanfaatan oksigen molekular dan bentuk kimia unsur ini bukanlah zat gizi. Banyak mineral lainnya (seperti Mn2+.

fosfolipid Sumber : Rusdimin. Sumber : Rusdimin. senyawa Konstituen dari organik. Senyawa Konstituen dalam organik.5 Garam kalsium Kation sel. H2 senyawa organik dan cairan sel. Fosfat(PO4) Konstituen asam nukleat. NO3.2003 Tabel 2. Juga penting bagi pembentukan sebagai proton.2003 SUMBER ENERGI 92 .coli dalam fase pertumbuhan eksponensial. nukleotida.Nitrogen 14 Hidrogen 8 Fosforus 3 adalah akseptor dalam respirasi aerobik NH3.2 Nutrisi Mikronutrien Bakteri Elemen % Berat Kering Makronutrien Sulfur 1 Sumber SO2. Senyawa sulfur organik Garam kalium Fungsi Konstituen dari senyawa ionik dan beberapa koenzim Kalium 1 Kation selular utama dan kofaktor untuk enzim-enzim tertentu Magnesium 0. kofaktor untuk enzim tertentu. asam nukleat dan koenzim H2O.5 Garam magneesium Kation sel dan kofaktor untuk beberapa reaksi enzim tertentu Kalsium 0. N2 asam amino. dan salah satu komponen endospora Besi 0.2 Garam besi Komponen sitokrom dan protein lain serta salah satu kofaktor untuk beberapa reaksi enzim Ket : % berat kering tersebut untuk sel E. H2S. S.

khemoautotrof dan khemoheterotrof. Heterotrof dibedakan lagi menjadi jasad saprofit dan parasit. Heterotrof ialah jasad yang memerlukan sumber karbon dalam bentuk senyawa organik. Fungsi Unsur Nutrisi untuk Mikroba Setiap unsur nutrisi mempunyai peran tersendiri dalam fisiologi sel unsur tersebut di berikan kepada medium sebagai kation garam anornagilik yang jumlahnya berbeda-beda tergantung pada keperluannya.Pada mikrobia yang dapat berfungsi sebagai aseptor elektron ialah O2.Aseptor elektron ialah agen pengoksidasi. Dunia Mikroba 1. Edward Alderberg dan John Ingraham. CO2. fotoheterotrof. base purin dan pirimidinsebagai penyusun asam nukleat. 1982) 1. NO3-.Penangkap elektron ini disebut aseptor elektron.Berdasarkan struktur dan fungsinya dalam metabolisme. Jasad saprofit ialah jasad yang dapat menggunakan bahan organik yang berasal dari sisa jasad hidup atau sisa jasad yang telah mati. 1982.3 Perbedaan jasad berdasarkan sumber energi Jasad Sumber Karbon Fotoautotrof Zat anorganik Fotoheterotrof Zat organik Khemoautotrof Zat anorganik khemoheterotrof Zat organik Sumber Energi Cahaya matahari Cahaya matahari Oksidasi zat anorganik Oksidasi zat organik Sumber :Stanier Roger. Jakarta. maka harus ada suatu zat yang dapat menangkap elektron tersebut. dan khemotrof. 2. jika menggunakan energi dari reaksi kimia. NO2-. Karena elektron dalam sel tidak berada dalam bentuk bebas.Berdasarkan sumber karbon Berdasarkan atas kebutuhan karbon dibedakan menjadi autototrof dan heterotrof.1994) 1. Berdasarkan sumber energi Berdasarkan atas sumber energi jasad dibedakan menjadi jasad fototrof. Faktor tumbuh Faktor tumbuh ialah senyawa organik yang sangat diperlukan untuk pertumbuhan (penyusun bahan sel) dan senyawa ini tidak dapat disintesis dari sumber karbon yang sederhana. dan Fe3+. 3. misalnya CO2 dan senyawa karbonat. Jasad parasit ialah jasad yang hidup di dalam jasad hidup lain dan menggunakan bahan dari jasad inang nya. senyawa organik. 93 . jika menggunakan energi cahaya. Bharata Karya Aksara. Sumber aseptor elektron Proses oksidasi biologi merupakan proses pengambilan dan pemindahan elektron dari substrat.Faktor tumbuh sering juga disebut zat tumbuh dan hanya diperlukan dalam jumlah sangat sedikit.Ada beberapa sumber energi untuk mikroba yaitu senyawa organik atau anorganik yang dapat dioksidasi dan cahaya terutama cahaya matahari. faktor tumbuh digolongkan menjadi asam aminosebagai penyusun protein. N2O.Autotrof ialah jasad yang memerlukan sumber karbon dalam bentuk anorganik. Jasad parasit yang dapat menyebabkan penyakit pada inangnya disebut jasad patogen.( Schlegel. dan vitamin sebagai gugus prostetis atau bagian aktif dari enzim. Perbedaan dari keempat jasad tersebut sbb: Tabel 2. PENGGOLONGAN MIKROBA BERDASARKAN NUTRISI DAN OKSIGEN Mikroba berdasarkan nutrisi dan oksigen dibedakan menjadi :( Stanier Roger dkk. 2. maka dikenal jasad fotoautotrof.Jika didasarkan atas sumber energi dan karbonnya.

mikroba dapat dikategorikan menjadi beberapa yaitu: 1. Berdasarkan kebutuhan oksigen Berdasarkan akan kebutuhan oksigen. Mesofil. jasad dapat digolongkan dalam jasad aerob. Jasa anaerob. Psikrofil.Jasad kapnofil ialah jasad yang memerlukan kadar oksigen rendah dan kadar CO2 tinggi. Jasad mikroaerob ialah jasad yang hanya memerlukan oksigen dalam jumlah yang sangat sedikit. anaerob Obligat . Perbedaan keempat golongan jasad tersebut sbb: Tabel 2. Dunia Mikroba 1. Bharata Karya Aksara.Jasad litotrof ialah jasad yang dapat menggunakan donor elektron dalam bentuk senyawa anorganik seperti H2. dan kapnofil. Edward Alderberg dan John Ingraham.( Cotty.anaerob Aerotoleran/Anaerob Mikroaerofil Jasad aerob ialah jasad yang menggunakan oksigen bebas (O2) sebagai satusatunya aseptor hidrogen yang terakhir dalam proses respirasinya.4 Perbedaan jasad berdasarkan sumber enegidan donor elektron Jasad Sumber Energi Sumber Donor Contoh Elektron Fotolitotrof Cahaya Zat anorganik Tumbuhan tingkat Fotoorganotrof Cahaya Zat organik tinggi. fotoorganotrof. mikroaerob. mikroba yang tumbuh pada suhu 20-40oC. mikroba yang tumbuh dengan baik pada suhu di bawah 20oC. 2. Jasad organotrof ialah jasad yang menggunakan donor elektron dalam bentuk senyawa organik. bakteri nitrifikasi Jasad heterotrof Sumber : Stanier Roger. H2S. 3. anaerob. dan S. sering disebut anaerob obligat atau anaerob 100% ialah jasad yang tidak dapat menggunakan oksigen bebas sebagai aseptor hidrogen terakhir dalam proses respirasinya. 4. NH3.Jasad aerob fakultatif ialah jasad yang dapat hidup dalam keadaan anaerob maupun aerob. Selain mikroba dibedakan berdasarkan nutrisi dan oksigen. dan khemoorganotrof. mikroba juga dibedakan berdasarkan kondisi lingkungan yaitu suhu. 1988) Suhu Berdasarkan ketahanannya terhadap suhu. Beberapa bakteri mesofil dapat tumbuh (tetapi tidak optimal) pada suhu tinggi atau suhu yang lebih rendah. pH (Kemasaman) 94 . bahkan ada yang di atas 100 oC (ekstrim). bakteri hidrogen. Jakarta. Berdasarkan sumber energi dan donor elektron Berdasarkan atas sumber energi dan sumber donor elektron jasad dapat digolongkan menjadi jasad fotolitotrof.Jasad ini juga bersifat anaerob toleran. alga Khemolitotrof Oksidasi zat anorganik Zat anorganik Bakteri belerang Khemoorganotrof Oksidasi zat organik Zat organik fotosintetik Bakteri besi. khemolitotrof. anaerob fakultatif. dan masih dapat tumbuh pada suhu 0oC. Termofil. Berdasarkan sumber donor elektron Berdasarkan atas sumber donor elektron jasad digolongkan manjadi jasad litotrof dan organotrof.3.pH(keasaman) dan tekanan osmotik. Obligat aerob Fakultatif. 5. Pertumbuhan mikroba di dalam media cair dapat menunjukkan sifat berdasarkan kebutuhan oksigen. 1982. mikroba ini tumbuh optimum pada suhu di atas 45oC.

tidak dapat hidup pada pH di bawah 4 dan di atas 9. mikroba dapat dikategorikan menjadi beberapa yaitu: 1. 3. yang pertama harus dilakukan adalah memahami kebutuhan dasarnya kemudian memformulasikan suatu medium atau bahan yang akan digunakan. Contoh lain ialah biakan campuran yang terdiri atas dua jenis mikroba atau lebih sering tidak memerlukan faktor tumbuh untuk pertumbuhannya. Asidofil. 2008) MEDIA SEBAGAI SUMBER NUTRISI MIKROBA Media pertumbuhan mikroorganisme adalah suatu bahan yang terdiri dari campuran zat-zat makanan (nutrisi) yang di perlukan mikroorganisme untuk pertumbuhan. Fenomena ini merupakan hasil interaksi metabolisme atau interaksi dalam penggunaan nutrisi yang dikenal sebagai sintropik atau sintropisme atau sinergitik. Beberapa arkhaeobakteri hanya dapat tumbuh pada konsentrasi elektrolit (biasanya NaCl). Bakteri yang tahan pada kadar garam yang relatif tinggi disebut bakteri Halofil yang bersifat halotoleran. maka aktivitas metabolismenya secara kualitatif maupun kuantitatif akan berbeda jika dibandingkan dengan jumlah aktivitas masing-masing jasad yang ditumbuhkan dalam medium yang sama tetapi terpisah. Adanya ekskresi tersebut memungkinkan tumbuhnya mikroba lain. Contoh: fungi. Alkalofil. 1999) Medium yang digunakan untuk menumbuhkan dan mengembangbiakkan mikroorganisme tersebut harus sesuai susunanya dengan kebutuhan jenis-jenis mikroorganisme yang bersangkutan.Mikroorganisme memanfaatkan nutrisi media berupa molekul-melekul kecil yang dirakit untuk menyusun komponen sel. Neutrofil.( Suriawiria. bakteri Thiobacillus yang hidup pada pH 2-3. Dengan media pertumbuhan dapat dilakukan isolate mikroorganisme menjadi kultur murni dan juga memanipulasi komponen media pertumbuhannya. INTERAKSI ANTAR JASAD DALAM MENGGUNAKAN NUTRIEN Jika dua atau lebih jasad yang berbeda ditumbuhkan bersama-sama dalam suatu medium. ( Suriawiria. mikroba yang tumbuh optimum pada pH di atas 9. Bentuk interaksi lain adalah cross feeding yang merupakan bentuk sederhana dari simbiose mutualistik. tinggi. 2. Untuk menumbuhkan mikroorganisme yang kita inginkan.( Tryana. akan mengekskresikan berbagai vitamin atau asam amino yang sangat penting untuk mikroba lainnya. Sebagai contoh ialah bakteri penghasil metan yang anaerob obligat tidak dapat menggunakan glukosa sebagai substrat. Koloni satelit hanya dapat tumbuh kalau ada ekskresi dari mikroba lain yang menghasilkan faktor tumbuh eseniil bagi mikroba tersebut. karena kedua jasad tersebut saling memerlukanm faktor tumbuh esensiil yang diekskresikan oleh masing-masing jasad. mikroba yang tumbuh optimum pada pH di bawah 5.5. Dalam interaksi ini pertumbuhan jasad yang satu tergantung pada pertumbuhan jasad lainnya. Kenyataan ini dapat menimbulkan koloni satelit yang dapat dilihat pada medium padat. Tekanan Osmotik Perbedaan tekanan osmotik dapat memecahkan sel mikroba.T. tetapi bakteri tersebut akan segera tumbuh oleh adanya hasil metabolisme bakteri anaerob lain yang dapat menggunakan glukosa. S. 1999) 95 . mikroba yang hidup optimum pada pH netral (6-8).Berdasarkan ketahanannya terhadap pH. Mikroba yang dapat mensintesis bahan selnya dari senyawa organik sederhana dalam medium.

Jasad heterotrof memerlukan sumber karbon organik antara lain dari karbohidrat. Mg dan unsur pelekat/trace element. Yeast extract. N. sukrosa. Jika dicampur dengan air dingin. Air (H2O) sebagai pelarut b. O. untuk melarutkannya harus diasuk dan dipanasi. c. protein. Agar (dari rumput laut) yang berfungsi sebagai pemadat media. Glatin juga memiliki fungsi yang sama seperti agar.Bahan dasar a. msalnya phenol red (indicator asam basa) ditambahkan untuk indicator perbahan pH akibat produksi asam organic hasil metabolisme. Sumber nitrogen mencakup asam amino. dan asam organic. Sumber karbon dan energi yang dapat di peroleh berupa semyawa organic atau anorganik sesuai dengan sifat mikrobanya. d. ditambahkan untuk memperkaya asam amino dan gas dari karbohidrat. sintesis sel. unsur-unsur logam. d. dapat diperoleh dalam bentuk batangan. darah. semi-padat dan cair. fasfor. mengandung basa organic terbuat dari otak. galaktosa.Jenis karbohidrat yang umumnya digunakan adalah amilum. unsur mikro seperti Fe. Sejumlah mikroba dapat menggunakan sumber N anorganik seperti urea. karbon. c. b. vitamin dan air. Agar sulit di degradasi oleh mikroorganisme pada umunya dan mencair pada suhu 450C. liver. 2. b. dan daging sapi. susu.Kekurangannya adalah lebih banyak jemis mikroba yang mampu menguraikan dibandingkan agar. Yeast extract mengandung asam amino yang lengkap dan vitamin (B complex). 1999) 1. gelatin. nitrogen. limpa. Fungsinya juga sebagai pemadat media.Media biakan yang digunakan untuk menumbuhkan bakteri terdapat dalam bentuk padat. 96 . MEDIUM KULTUR Medium kultur adalah material nutrien yang disiapkan untuk pertumbuhan mikroorganisme di laboratorium.Media biakan harus berisi zat hara dan mempunyai keadaan fisik yang sesuai pertumbuhan bakteri. kasein. dan kedelai. terbuat dari ragi pengembang roti atau pembuat alcohol. agar tidak akan larut. adalah produk hidrolisis protein hewani aau nabati seperti otot. Karbohidrat. d. sulfur.Pada umumnya nutrisi atau kandungan unsure dalam media biakan yang dibutuhkan oleh bakteri adalah sumber energi. Glatin adalah polimer asam aminio yang diproduksi dari kologen. Agar. Beberapa mikroorganisme dapat umbuh pada berbagai media. c. plasenta. glukosa. namun ada pula yang membutuhkan media khusus. laktobumin. Kegunaannya adalah sebagai pemadat (gelling). Bahan yang sering digunakan dalam pembuatan media a. 3. dan lain-lain. lemak. manitol. Peptone.Silica gel khususnya digunakan untuk memadatkan media bagi mikroorganisme autotrof abligat. yaitu bahan yang mengandung natrium silikat. H. fruktosa.5-1%. P.Nutrisi atau zat makanan a. protein atau senyawa bernitrogen lain. dan bahkan ada yang tidak dapat tumbuh sama sekali dalam medium buatan. keperluan energi dalam metabolisme dan pergerakan. Silica gel. Meat extract. Vitamin-vitamin. Konsentrasi yang ditambahkan untuk analisis fermentasi adalah 0. granula atau bubuk dan terbuat dari rumput laut. Bahan-bahan media biakan: ( Suriawiria.Bahan tambahan Bahan-bahan tambahan yaitu bahan yang ditambahkan ke dalam medium dengan tujuan tertentu. Media harus mengandung unsur-unsur yang diperlukan untuk metabolisme sel yaitu berupa unsur malro seperti C.Nutrisi yang berbeda di dalam media biakan di gunakan untuk pertumbuhan.

yaitu: (Prescott dkk. yaitu bahan yang mengandung karbon dan energi. . Salah satu contohnya adalah Lactobacillus.0 g NaCl 8. yaitu menentukan konsentrasi vitamin dalam suatu substansi.Medium harus steril (tidak ada kehidupan lain di dalamnya) sehingga kultur hanya mengandung mikroba yang diinginkan. Untuk menumbuhkan mikroba kemoheterotrof.2002) .0 g Air 1 liter 97 bel 1: . dan mikroba digabungkan. Mikroba yang tumbuh dan berkembangbiak dalam medium kultur disebut dengan kultur. Supaya tetap cair. Jika dibutuhkan suatu medium solid untuk menumbuhkan bakteri. medium bisa diinkubasi bahkan hingga temperatur mendekati 100°C (agar mencair pada 100°C) sehingga bisa digunakan untuk menumbuhkan bakteri termofilik.  Media kompleks (Complex Media) Hampir semua bakteri heterotropik dan fungi ditumbuhkan dalam media kompleks. Medium dengan bahan kimia yang ditentukan adalah medium yang dapat diketahui dengan pasti komposisi kimianya. medium harus mengandung bahan organik yang dibutuhkan mikroba untuk tumbuh. dan sejenisnya. dan bahan-bahan lain yang tidak dapat disintesis oleh mikroba dalam medium itu. contohnya adalah Neisseria. Agar biasa digunakan dalam makanan seperti jeli dan es krim. daging. fosfor. Komposisi Nutrient Agar.0 g Agar 15. suatu medium harus menyediakan energi. Pada kisaran temperatur ini masih aman bagi bakteri ketika agar dituangkan pada mereka. Sebagai contoh. nitrogen. Organisme yang membutuhkan banyak bahan-bahan faktor pertumbuhan disebut “fastidious”. yang terdiri dari sejumlah nutrien seperti ekstrak dari ragi. karbon. Pertumbuhan bakteri. yang bisa dilihat dari jumlah asam laktat yang dihasilkan. suatu agen pemadat (solidifying agent) perlu ditambahkan ke dalam medium. sulfur. tanaman. . agar disimpan dalam air pada temperatur 50°C. maupun digest dari protein. medium pertumbuhan yang mengandung semua bahan yang dibutuhkan untuk pertumbuhan mikroorganisme disiapkan terlebih dahulu. Komposisi kimianya sedikit bervariasi dari batch satu dan batch lain. coli. Beberapa mikroorganisme juga bisa dimanfaatkan untuk melakukan microbiological assay. Begitu agar memadat.Kultur harus diinkubasi pada temperatur yang tepat. ia disebut inokulum.Mengandung nutrien yang tepat untuk mikroorganisme yang ingin ditumbuhkan. kecuali vitamin yang akan ditentukan konsentrasinya. substansi yang akan dites.0 g Ekstrak daging sapi 3. Suatu Medium Kompleks untuk Pertumbuhan Bakteri Heterotrof Konstituen Jumlah Pepton 5. suatu senyawa polisakarida kompleks yang berasal dari alga di lautan. Untuk melakukannya. Kemudian medium.Ketika mikroba pertama kali dimasukkan ke dalam medium kultur untuk memulai perkembangbiakan. Ada beberapa jenis medium. Tabel berikut menunjukkan resep yang umum digunakan. akan sebanding dengan jumlah vitamin dalam substansi. glukosa dimasukkan dalam medium untuk menumbuhkan mikroba kemoheterotrof E. Agen pemadat yang paling sering digunakan adalah agar.2002)  Chemically Defined Media Untuk mendukung pertumbuhan mikroba. Ada beberapa kriteria medium kultur agar dapat menumbuhkan suatu kultur: (Prescott dkk.

Staphylococcus aureus mampu menoleransi NaCl dalam konsentrasi tinggi. seperti Rickettsias dan Chlamydias tidak dapat tumbuh dalam media buatan. karbon. Reaksi yang terjadi menghasilkan H2 dan CO2. Media ini mengandung bahan seperti sodium thioglycolate yang mampu mengikat oksigen terlarut dan menghilangkan oksigen dalam media kultur.  Media pertumbuhan anaerobik (Anaerobic Growth Media) Bakteri anaerobik merupakan bakteri yang tidak tahan oksigen. Kondisi di mana O 2 sedikit dan CO2 banyak adalah merupakan representasi dari kondisi dalam sistem pencernaan dan sistem pernafasan. Jika medium kompleks dalam bentuk cair disebut nutrient broth. dan sulfur untuk pertumbuhan mikroba disediakan oleh digest protein. Ada beberapa bakteri aerobik yang membutuhkan CO2 dalam jumlah lebih besar daripada yang ada di atmosfer. bakteri obligat intraseluler. sehingga perlu penanganan khusus untuk menumbuhkannya. Cawan dimasukkan ke dalam wadah itu. lalu oksigen dihilangkan dengan cara memberi air pada sodium bikarbonat dan sodium borohidrat yang sudah ada dalam wadah. nitrogen. Terkadang media selektif dan diferensiasi dijadikan satu dalam sebuah medium. Medium ini merupakan medium yang cocok untuk mengisolasi bakteri gram-negatif Salmonella typhi dari feses. Misalnya saja pemberian agar bismuth sulfite. Jika kultur ternyata harus ditumbuhkan di cawan Petri. sehingga jika terkena oksigen ia akan mati. Selain itu. Typhi). Jika agar ditambahkan. yang temperatur tubuhnya sesuai dengan yang dibutuhkan bakteri itu. yaitu pepton. Pada umumnya. Suatu media khusus yang disebut media pereduksi (reducing media) digunakan untuk bakteri anaerobik. dan ia juga dapat memfermentasi manitol untuk membentuk asam. Lilin akan berhenti menyala ketika konsentrasi O2 dalam wadah menjadi sedikit (tapi masih cukup untuk pertumbuhan mikroba). diperlukan suatu wadah khusus anaerobik. medium disebut nutrient agar. Agar garam manitol mengandung 7. kultur dimasukkan ke dalam wadah yang di dalamnya terdapat lilin yang menyala. bakteri yang menyebabkan sakit tenggorokan membentuk suatu cincin di sekitar koloninya di mana mereka menghancurkan eritrosit di sekitarnya. H2 dan O2 di dalam wadah bereaksi membentuk air. Agar darah (mengandung eritrosit) adalah media yang digunakan untuk mengidentifikasi spesies bakteri yang menghancurkan sel darah merah.Dalam media kompleks. Vitamin dan bahan-bahan organik lain disediakan oleh ekstrak daging maupun ragi. ada cara yang lebih sederhana. Kandungan NaCl mampu menghambat 98 . Bismuth sulfite mampu menghambat bakteri gram-positif dan kebanyakan bakteri gram-negatif pada saluran pencernaan (kecuali S. yaitu dengan candle jar. Mycobacterium leprae hanya bisa ditimbuhkan di dalam armadillo. Ini menjadi masalah dalam kultivasi bakteri anaerobik. Wadah lalu ditutup rapat.  Teknik kultur khusus Ada beberapa jenis bakteri yang tidak pernah bisa ditumbuhkan dalam media buatan. Wadah kemudian ditutup rapat. Pada metode ini. Mereka hanya bisa tumbuh dalam sel hidup. Test tube yang digunakan untuk menumbuhkan bakteri ini haruslah tertutup rapat dan dipanaskan sebelum digunakan untuk menghilangkan O2. Dengan bantuan katalis paladium. Streptococcus pyogenes. Media diferensiasi adalah media yang mampu mempermudah untuk membedakan koloni mikroba yang diinginkan dengan koloni-koloni lain yang tumbuh pada tempat yang sama. kebutuhan energi. Saat ini konsentrasi CO2 bisa diatur lewat alat elektronik. Vitamin dan mineral dari daging atau ragi dilarutkan. lalu diuapkan airnya sehingga bahan-bahan yang larut tadi akan terkonsentrasi.  Media selektif dan media diferensiasi Media selektif adalah media yang didesain untuk menekan pertumbuhan mikroba yang tidak diinginkan dan mendukung pertumbuhan mikroba yang diinginkan.5% NaCl.

T. Medium ini juga mengandung indikator pH yang berubah warna ketika manitol dalam medium difermentasi menjadi asam oleh S. berguna untuk mendeteksi adanya asam yang dihasilkan 99 . aureus. digunakan untuk seleksi dan penumbuh Enterobacteriaceae dan bakteri Gram negatif yang berbentuk batang. EMB (Eosin Methylene Blue) EMB merupakan media diferensial berbentuk padat dapat digunakan untuk menggantikan Mac Conkey agar dan untuk mengadakan isolasi serta mendeteksi Enterobacteriaceae dan campuran spesiesspesies bakteri yangberbentuk batang koliform. Garam-garam empedu dan kristal-kristal violet di dalam media ini dapat menghambat pertumbuhan bakteri Gram positif dan bakteri Gram negatif. S. Medium ini juga mengandung mannitol. digunakan untuk menumbuhkan bakteri yang hidup di usus. Eosin dan methylene blue ini dapat juga berperan sebagai indikator produksi asam. Media ini mengandung natrium sulfit dan “basic fuchsin” yang dapat menghambat pertumbuhan bakteri Gram positif. Eosin dan methylene blue berfungsi untuk menghambat pertumbuhan bakteri Gram positif dan bakteri Gram negatif. Agar-darah (Blood agar) Agar darah merupakan media differensial yang digunakan untuk perbedaan beberapa bakteri patogen. Media ini dibubuhi darah. Berikut ini contoh media selektif dan media diferensial yang sering digunakan di dalam Laboratorium Mikrobiologi : (Tryana.pertumbuhan mikroba-mikroba lain dan mendukung pertumbuhan S. aureus. yang dapat menghambat pertumbuhan kebanyakan bakteria selainStreptococcus. misalnya Streptococcus. Bakteri hemolitik a dapat menghasilkan suatu zona yang menghijau di sekelilingkoloni. Mac Conkey Agar Media ini merupakan media padat dan media differensial. 5. Mannitol Salt Agar Mannitol salt agar merupakan medium yang mengandung 7. Endo agar Endo agar adalah media padat (solid plating media). 4. 3. 2008) 1. 2. sehingga kelihatan berwarna coklat kemerahmerahan dan digunakan untuk menyediakan faktor penumbuh yang diperlukan oleh bakteri patogen. menghasilkan suatu zona yang cerah di sekeliling koloni. sedangkan bakteri hemolitik b. fenol merah sebagai indikator pH. Bakteri dapat juga dibedakan berdasarkan kemampuannya untuk mengadakan hemolisis pada sel-sel darah. Asam yang dihasilkan dari perombakan laktosa dapat dideteksi dengan asetaldehida dan natrium sulfit.5% NaCl.

Setelah beberapa kali transfer. namun tidak untuk mikroba-mikroba lain. Pada pembuatan medium NA ini ditambahkan pepton agar mikroba cepat tumbuh.Mikroorganisme dapat tumbuh sesuai dengan medium yang digunakan.2007) Nutrien Agar(NA) Gambar:Nutrien Agar Sumber : (wikipedia. dalam artian mikroorganisme heterotrof. Metode ini hampir sama dengan medium selektif. Medium kultur diinkubasi beberapa hari. Selenite Broth Media ini digunakan untuk mengadakan isolasi spesies Salmonella dari spesimen-spesimen seperti urin dan feses. MEDIUM YANG SERING DIGUNAKAN Medium untuk menumbuhkan mikroorganisme ada berbagai macam. sehingga digunakanlah enrichment culture.NA juga digunakan untuk  pertumbuhan mayoritas dari mikroorganisme yang tidak selektif. Biasanya digunakan pada sampel tanah. Medium yang digunakan untuk memperkaya kultur minoritas tadi biasanya berbentuk cair dan menyediakan nutrien dan suasana yang mendukung pertumbuhan mikroba minoritas. pepton.oleh Staphylococcus yang memfermentasi mannitol dapat menghasilkan zona berwarna kuning di sekitar pertumbuhannya. 6. namun jumlahnya sangat sedikit dibandingkan mikroba lain.Media ini merupakan media sederhana yang dibuat dari ekstrak beef. karena mengandung banyak N2 (Dwidjoseputro. lalu sebagian dari mikroba ditempatkan pada wadah lain yang berisi medium yang sama. produk pangan. untuk membawa stok kultur.org/wiki/Nutrient_agar) Nutrien agar adalah medium umum untuk uji air dan produk dairy. dan agar. sewage. Berikut adalah berbagai medium yang sering digunakan :( Buckle. dan untuk mengisolasi organisme dalam kultur murni. sedangkan yang tidak dapat memfermentasikan manitol tidak akan menimbulkan perubahan warna. maka mikroba yang tidak bisa mengolah fenol tidak akan bisa tumbuh. Misalkan kita ingin mengisolasi mikroba dari tanah yang bisa tumbuh dengan fenol. untuk pertumbuhan sampel pada uji bakteri. Agar yang digunakan dalam proses ini untuk mengentalkan medium sama halnya dengan yang digunakan pada medium PDA yang juga 100 . terutama ketika bakteri spesies lain terdapat dalam jumlah besar. populasi yang tersisa itu adalah bakteri yang mampu mengolah fenol.  Kultur yang diperkaya (Enrichment culture) Terkadang suatu bakteri terdapat dalam jumlah yang sangat kecil terabaikan. Jika sampel tanah ditempatkan dalam medium cair kaya fenol (di mana fenol di sini sebagai sumber satu-satunya sumber karbon dan energi). Na merupakan salah satu media yang umum digunakan dalam prosedur bakteriologi seperti uji biasa dari air. Sodium Selenite dapat merupakan inhibitor terhadap Eschericia coli dan beberapa spesies dariShigella. namun ini didesain untuk meningkatkan jumlah mikroba yang ada dalam jumlah sangat kecil hingga mencapai level yang dapat dideteksi. 1994).

org) PDA digunakan untuk menumbuhkan atau mengidentifikasi yeast dan kapang.6+0. dan setelah dilarutkan dalam aquades berubah menjadi kekuning-kuningan dan terdapat endapan. Kemudian siapkan wadah sesuai yang dibutuhkan. Plate Count Agar (PCA) Gambar : Listeria monocytogenes pada PCA 101 .berperan sebagai media tumbuh yang ideal bagi mikroba (Schlegel. Tetapi pada praktikum kali ini PDA dilarutkan pada 50mL air dengan perhitungan : 39×50 = 1000x x = 1.Dapat juga digunakan untuk enumerasi yeast dan kapang dalam suatu sampel atau produk makanan.). Jadi untuk menghilangkan endapan tersebut maka dipanaskan dalam penangas air dengan tabung Erlenmeyer disumbat dengan alat penyumbat.95gr. Didihkan selama 1 menit untuk melarutkan media secara sempurna.95gr jadi PDA yang digunakan untuk 50 ml aquades adalah 1.2. medium dapat ditanami bakteri . 1993). Setelah sterilisasi warna medium menjadi agak coklat  Potato Dextrose Agar (PDA) Gambar : Fusarium roseum on Potato Dextrose Agar (PDA)  (Sumber : forestryimages.serbuk dicampur dan dipanaskan serta aduk. Setelah didinginkan. PDA mengandung sumber karbohidrat dalam jumlah cukup yaitu terdiri dari 20% ekstrak kentang dan 2% glukosa sehingga baik untuk pertumbuhan kapang dan khamir tetapi kurang baik untuk pertumbuhan bakteri. Cara membuat PDA adalah mensuspensikan 39 g media dalam 1 liter air yang telah didestilasi.Sterilisasi pada suhu 121°C selama 15 menit. Dalam percobaan warna NA sebelum dilarutkan dalam aquades adalah coklat. Agar dilarutkan dengan komposisi lain dan disterilisasi dengan autoklaf pada 121°C selama 15 menit.setelah disterilisasi dalam autoklaf medium berwarna kecoklatan dan didapat endapan berwarna putih. Serbuk PDA berwarna kuning karena merupakan ekstrak kentang yang pada dasarnya berarna kuning. Dinginkan hingga suhu 40-45°C dan tuang dalam cawan petri dengan pH akhir 5.

Pepton dan ekstrak beef menyediakan nutrien esensial untuk memetabolisme bakteri.5% pepton. Media PCA ini baik untuk pertumbuhan total mikroba (semua jenis mikroba) karena di dalamnya mengandung komposisi casein enzymic hydrolisate yang menyediakan asam amino dan substansi nitrogen komplek lainnya serta ekstrak yeast mensuplai vitamin B kompleks.org) PCA digunakan sebagai medium untuk mikroba aerobik dengan inokulasi di atas permukaan. PCA dibuat dengan melarutkan semua bahan (casein enzymic hydrolisate. Intinya sama dengan nutrient agar. dan produk susu.2007) Lactose Broth  Gambar : Kaldu hasil laktosa (Sumber: marietta. Nutrient broth dibuat dengan cara sebagai berikut. Lactose broth dibuat dengan komposisi 0. yeast extract.Jika laktosa tidak difermentasi media tetap merah.5 g/L kemudian disterilisasi pada autoklaf (15 menit pada suhu 121°C).wordpress.Laktosa menyediakan sumber karbohidrat yang dapat difermentasi untuk organisme koliform.Pertumbuhan dengan pembentukan gas adalah presumptive test untuk koliform. sebagai kaldu pemerkaya (pre-enrichment broth) untuk Salmonellae dan dalam mempelajari fermentasi laktosa oleh bakteri pada umumnya.com Nutrient broth merupakan media untuk mikroorganisme yang berbentuk cair. 0.(Sumber: mikrobiyoloji.3% ekstrak beef.edu) Lactose broth digunakan sebagai media untuk mendeteksi kehadiran koliform dalam air. dan 0.Produksi gas ditunjukkan oleh akumulasi dalam tabung Durham (panah). agar) hingga membentuk suspensi 22.5% laktosa. yaitu :( Buckle. 102 . makanan. MEDIUM LAINNYA Selain medium di atas masih terdapat medium lain yang juga memiliki fungsi untuk menumbuhkan kultur mikroorganisme. dextrose.  Nutrient Broth (NB) Gambar : media nutrient agar (NA) yang telah ditanam dari biakan media nutrient broth (NB) Sumber: mulyadiveterinary. Fermentasi laktosa menyebabkan produksi asam dan perubahan dalam indikator pH ke warna kuning.

Untuk mengetahui jumlah bakteri coli umumnya digunakan tabel Hopkins yang lebih dikenal dengan nama MPN (most probable number) atau tabel JPT (jumlah perkiraan terdekat). asetat.Mikroba yang memfermentasi laktosa menghasilkan koloni dengan inti berwarna gelap dengan kilap logam. Beri air distilasi sebanyak 1. dan mangan yang diketahui untuk beraksi/bertindak sebagai faktor pertumbuhan bagi Lactobacillus. Atur pH sampai 7. EMB yang menggunakan eosin dan metilin bklue sebagai indikator memberikan perbedaan yang nyata antara koloni yang meragikan laktosa dan yang tidak. tabel tersebut dapat digunakan untuk memperkirakan jumlah bakteri coli dalam 100 ml dan 0. sebaik nutrien diperkaya MRS agar tidak sangat selektif. jika media ini digunakan pada tahap awal karena kuman lain juga tumbuh terutama P.2 g/L 103 . Namun demikian.kvl. Ekstrak ragi 4. Bagaiamanapun media ini sangat baik untuk mengkonfirmasi bahwa kontaminan tersebut adalah E. 5. aureus. Media Eosin Methylene Blue mempunyai keistimewaan mengandung laktosa dan berfungsi untuk memilah mikroba yang memfermentasikan laktosa seperti S. Larutkan 5 g pepton dalam 850 ml air distilasi/akuades. Ekstrak daging 8. 2.coli. magnesium. sehingga ada kemungkinan Pediococcus dan jenis Leuconostoc serta jenis bakteri lain dapat tumbuh.0. dan Salmonella. 4.1 ml contoh air. Magnesium sulfat 0.000 ml.dk)  MRSA (deMann Rogosa Sharpe Agar) MRSA merupakan media yang diperkenalkan oleh De Mann. Agar EMB (levine) merupakan media padat yang dapat digunakan untuk menentukan jenis bakteri coli dengan memberikan hasil positif dalam tabung. Larutkan 3 g ekstrak daging dalam larutan yang 3.1. Adanya eosin dan metilen blue membantu mempertajam perbedaan tersebut. Gambar : Salmonella enteritidis tumbuh di EMB Agar (Sumber : microbiologyatlas. Protein dari kasein 10 g/L 2. Rogosa. dan mengisolasi jenis Lactobacillus dari seluruh jenis bahan. MRS agar mengandung: 1. P. Sterilisasi dengan autoklaf  EMBA (Eosin Methylene Blue Agar) dibuat pada langkah pertama. D (+) glukosa 20 g/L 5. aerugenosa.0 g/L 4. dan Shape (1960) untuk memperkaya. menumbuhkan.Medium tersebut mengandung sukrosa karena kemempuan bakteri koli yang lebih cepat meragikan sukrosa daripada laktosa.0 g/L 3. Aerugenosa dan Salmonella sp dapat menimbulkan keraguan. Sedangkan mikroba lain yang dapat tumbuh koloninya tidak berwarna. MRS agar mengandung polysorbat.

104  . pepton. Diamonium hidrogen sitrat 2 g/L 10. glukosa.04 g/L MRSB merupakan media yang serupa dengan MRSA yang berbentuk cair/broth Trypticase Soy Broth (TSB)  (Sumber : totallyfreeimages. menunjukkan pertumbuhan kolonial kasar. APDA Media APDA berfungsi untuk menumbuhkan dan menghitung jumlah khamir dan yeast yang terdapat dalam suatu sampel.4. Media TSB mengandung kasein dan pepton kedelai yang menyediakan asam amino dan substansi nitrogen lainnya yang membuatnya menjadi media bernutrisi untuk bermacam mikroorganisme. sedangkan sel mikroba bersifat asam. Bila kondisi terlalu basa maka sel akan mati. dan halus pada bakteri Enterobacter cloacae.com) Setelah 24 jam.Dikalium fosfat ditambahkan sebagai buffer untuk mempertahankan pH.Panaskan hingga mendidih sampai larut sempurna. Agar VRBA mengandung violet kristal yang bersifat basa. Dengan VRBA dapat dihitung jumlah bakteri E. Bahan-bahan yang dibutuhkan untuk membuat VRBA adalah yeast ekstrak. Campuran garam bile dan kristal violet menghambat bakteri gram positif. kristal violet. pH akhir adalah 7.coli.Neutral red sebagai indikator pH. Agar-agar 14 g/L 7. agar).Agar merupakan agen pemadat. Bahan-bahan tersebut kemudian dicampur dengan 1 liter air yang telah didestilasi. dan penumbuhan bermacam mikroorganisme.Dekstrosa adalah sumber energi dan natrium klorida mempertahankan kesetimbangan osmotik. Mangan sulfat 0. Laktosa merupakan sumber karbohidrat. Yeast ekstrak menyediakan vitamin B-kompleks yang mendukung pertumbuhan bakteri. Khamir dan yeast akan tumbuh dengan optimal pada media yang sesuai. neutral red. VRBA (Violet Red Bile Agar) VRBA dapat digunakan untuk perhitungan kelompok bakteri Enterobactericeae.Dinginkan hingga 50-60°C. empedu. TSB adalah media broth diperkaya untuk tujuan umum. 6. Media ini banyak digunakan untuk isolasi bakteri dari spesimen laboratorium dan akan mendukung pertumbuhan mayoritas bakteri patogen. APDA dibuat dengan merebus kentang selama 1 jam/45 menit. agar dilelehkan dalam 500 ml air. Pindahkan dalam tabung sesuai kebutuhan. untuk isolasi.0 g/L 9. Pada APDA jadi ini juga ditambah asam tartarat. Adanya asam tartarat dan pH rendah maka pertumbuhan bakteri terhambat. Campurkan ekstrak kentang dalam agar lalu ditambahkan glukosa dan diaduk rata. NaCl. Natrium asetat 5 g/L 11. dipotassium hidrogen phosphate 2 g/L 8. Tween 80 1.

5 g lalu dilarutkan dengan akuades. Dengan adanya dekstrosa yang terkandung dalam media ini.ATP terikat dan memfosforilasi permukaan sitoplasma dari pompa. enumerasi. Konformasi ini menunjukkan afinitas yang lebih rendah terhadap Na+ dibanding K+ 6. Ion Na terikat 4. Ion K dilepaskan dan kembali ke konformasi awal 105 . dan menumbuhkan sel khamir. Kemudian dimasukkan dalam erlenmeyer dan disumbat dengan kapas lalu disterilisasi pada suhu 121°C selama 15 menit. PGYA Media ini berfungsi untuk isolasi. Ion Na dilepaskan 7. semua bahan dicampur dengan ditambah CaCO3 terlebih dahulu sebanyak 0. PGYA dapat digunakan untuk mengidentifikasi mikroba terutama sel khamir. 2. 5. Nanang(11506110111025) Bagaimana cara kerja pompa Na? Jawaban : Kerja Pompa Na adalah sebagai berikut 1. dengan afinitas lebih rendah terhadap K+ dibanding Na+ 11. yang menyebabkan perubahan konformasi ATPase sehingga binding site terbuka ke arah luar. Untuk membuatnya. Pompa Na dengan binding site (3 untuk Na+. 2 untuk K+) dengan posisi terbuka pada sisi sitoplasma 2. Ion K terikat 8. LAMPIRAN II (TANYA-JAWAB) 1. mengubah konformasi ATPase 10. Dewi N (115061100111001) Bagaimana cara memisahkan mikroba dengan agar pada industri? Metode apa yang digunakan? Jawaban : Metode yang digunakan untuk memisahkan agar dan mikroba merupakan metode yang sederhana yaitu hanya dengan menggunakan pinset yang steril sehingga mikroba tidak tercemar oleh zat-zat lain. Konformasi menunjukkan afinitas yang lebih tinggi terhadap Na+ dibanding K+ 3. Binding site sekarang terbuka ke dalam. Glikosida digitalis menghambat pompa dengan berikatan pada 1 tempat K+ 9. Defosforilasi terjadi.

9. 4. microaerophil adalah mikroba yang selama hidupnya hanya membutuhkan oksigen dalam jumlah yang sedikit.perhitungan penguji dan khusus.spesifik. Dian Nita Citra Dewi(115061101111013) Apa di dalam industri juga menggunakan media agar dalam skala besar? Jawaban : Dalam industri juga menggunakan agar tetapi agar tersebut di letakkan di tempat. Pandu R(115061107111001) Tadi dikatakan bahwa kapasitol itu membutuhkan oksigen yang sedikit nah apa bedanya dengan microaerophil? Jawaban: Kapnofil adalah mikroba yang memerlukan CO2 dalam konsentrasi yang tinggi. Ada media lain selain agar yaitu media cair seperti kaldu tetapi sangat jarang digunakan karena keefektifannya lebih rendah jika dibandingkan dengan media agar. semi padat – berdasarkan fungsi yaitu diperkaya. 7. yaitu medium organik. Beberapa jenis bakteri terlibat dalam daur sulfur. Winda(115061101111003) Semua organisme membutuhkan belerang(sulfur) apa bahayannya jika sulfur menjadi sulfit? Jawaban : Tidak berbahaya karena perpindahan sulfat terjadi melalui proses rantai makanan lalu semua makhluk hidup yang mati akan diuraikan komponen organiknya oleh bakteri. antara lain Desulfomaculum dan Desulfibrio yang akan tereduksi sulfat menjadi sulfida dalam bentuk hidrogen sulfida(H2S). padat.medium sintetik dan medium nonsintetik -berdasarkan konsistensi medium separti medium cair. Kemudian H2S digunakan bakteri fotoautotrof naerob seperti Chromatium dan melepaskan sulfur dan oksigen.meium anorganik.tempat kecil dan tempat tersebut harus dalm jumlah banyak 8.aniseptis. Ayu Indah Wibowo(115061101111011) Bagaimana cara mengendalikan nutrient untuk mikroba agar tidak berlebihan? Jawaban : Dengan cara cleaning.Dll 5. dalam industri memakai media agar. Proses tersebut tergantung pada ketersediaan akseptor dan kondisi lingkungan 106 . Dewi Ariesi (115061105111007) Apakah di industri juga menggunakan agar dalam pemberian nutrient? Apakah ada media selain agar? Jawaban : Iya.3. sulfat dan karbon dioksida. Mutia Dhana (115061100111007) Syarat-syarat apa yang digunakan untuk untuk memilih medium yang cocok untuk mikroba yang kita gunakan? Jawaban : berdasarkan susunan kimianya. lalu bagaimana aseptor untuk mikroorganisme anaerob yang tidak menyukai O2? Jawaban: Yang tidak menyukai O2 pada mikroba anaerobik terjadi pemanfaatan berbagai akseptor elektron seperti nitrat. besi. mangan. 6.sterlisasi. desinfeksi. Vivi Anita Aprilia(115061107111005) Aseptor yang digunakan oleh mikroba aalah O2.

Sel dapat melakukan proses kehidupan seperti melakukan respirasi. sifat makhluk hidup dapat diwariskan kepada keturunannya. Nutrisi tersebut dapat diambil dari lingkungan maupun dari tubuh armadillo 11. penyusunan. Dhanang Edy Pratama(115061101111007) Ada berapa mikroba yng benar benar tida bisa ditumbuhkan dalam medium buatan. mitokondria yang terdapat di dalam sel berfungsi sebagai penghasil energy. Sel juga disebut sebagai satuan fungsional makhluk hidup. Bagaimana cara mengontrol asupan nutrisi pada mikroba seperti itu? Jawaban: Jawaban : Asupan pada mikrobakterium lepre berasal dari gula. meskipun ukuran sel sangat kecil. Mariatus Sholihah(115061100111019) Pada syarat nutrisi dijelaskan bahwa semua mikroorganisme membutuhkan oksigen.yaitu materi penentun sifat-sifat makhluk hidup. Sel disebut sebagai unit terkecil karena sudah tidak bisa dibagi-bagi lagi menjadi bagian yang lebih kecil yang berdiri sendiri. strukturnya sangat rumit dan masing-masing bagian sel memiliki fungsi khusus. reproduksi melalui pembelahan sel. Dengan adanya materi genetik. seperti mikrobkteriel leprae yang hanya bisa di tumbuhkan dalam tubuh armadillo.10. Sel disebut satuan struktural makhluk hidup. 1994) Struktur Sel Struktur sel dibagi menjadi struktuk sel prokariotik dan sel eukariotik. Ridhani Rida Ramadhan(115061100111009) Sisa sisa metabolisme dari bakteri bis dijadikan sebagai media pertumbuhan mikroba atau tidak? Dan tolong jelaskan medium pengaya dengan diperkaya? Jawaban: Sisa-sisa metebolisme bakteri tidak bisa dijadikan sebagai media pertumbuhan mikoba. Pembelahan sel dilakukan baik oleh organisme bersel satu maupun organisme bersel banyak. yang dapat melaksanakan kehidupan. Cara kerja aseptor elektron yaitu dengan membuat ATP dengan menggunakan reaksi anaerobik yaitu fermentasi. misalnya. Organisme bersel satu mengadakan pembelahan secara langsung sedangkan sel-sel pada organisme bersel banyak mengalami pembelahan secara mitosis. Perkembangbiakan dilakukan melalui pembelahan sel.  Struktur sel prokariotik 107 . sedangkan lisosom berfungsi sebagai pencerna. Sel mengandung materi genetic. ukuran sel bermacam-macam dan bentuk sel juga bermacam-macam . (Alberts B. Sel merupakan unit terkecil dari makhluk hidup. tetapi ada bakteri anaerob itu bagaimana? Dan bagaimana cara kerja aseptor elektron serta bagaimana mikroba menggunakannya? Jawaban: Bakteri anaerobik untuk memenuhi syarat nutrisinya dengan cara aseptor elektron. karena media pertumbuhan harus steril sedangkan pada sisa sisa metabolisme tidak steril Medium pengaya medium yang kaya akan nutrient tertentu sehingga vdapat menumbuhkan dan memperbanyak sel 12. dan terhadap rangsangan. perombakan. Pengertian Sel Sel berasal dari kata latin cella yang berarti ruangan kecil. hidrokarbon dan asam amino sebagai sumber karbon dan nitrogen mikroba.

sedangkan sel prokariotik tidak. sepert reticulum endoplasma dan komplek golgi. Membran sel Lipid Fosfolipid merupakan komponen utama dari membran sel. lipid dapat membuat mana saja dari 20 sampai 80 persen dari membran. dan lisosom. eukariotik memiliki sistem endomembran. sedangkan hidrofobik mereka (ditolak oleh air) daerah ekor wajah jauh dari cairan sitosol dan ekstraseluler. yakni memiliki organelorganel bermembram seperti retikulum endoplasma. The bilayer lipid adalah semipermeabel. Membran sel terutama terdiri dari campuran protein dan lipid . adapun sel eukariotik meliputi sebagai berikut: (Yunus. selain itu. Mereka membentuk bilayer lipid di mana mereka hidrofilik (menarik air) di daerah kepala spontan mengatur untuk menghadapi sitosol berair dan cairan ekstraselular. osmosis. nukleoid (berupa DNA dan RNA). berfungsi mengatur pemasukan dan pengeluaran zat ke dalam dan ke luar sel dengan cara difusi. 2009) 1. Sementara lipid membantu memberikan fleksibilitas membran mereka. protein memantau dan memelihara iklim kimia sel dan membantu dalam transfer molekul melintasi membran. Membran plasma Membran plasma membatasi sel dengan lingkungan luar. dan sitoplasma yang mengandung ribosom. Ciri lain dari sel prokariotik adalah tidak memiliki sistem endomembran (membran dalam). 108 . yaitu mesosom dan kromatofor. 2009)  Struktur sel eukariotik Perbedaan pokok antara sel prokariotik dan eukariotik adalah sel eukariotik memiliki membran inti. sel prokariotik juga tidak memiliki mitokondria dan kloropas. sehingga hanya molekul tertentu untuk meredakan melintasi membran. A. bersifat semi/selektif permeabel. namun mempunyai struktur yang berfungsi sama. Tergantung pada lokasi membran dan peran dalam tubuh. Karena tidak mempunyai membran inti maka bahan inti yang berada di dalam sel mengadakan kontak langsung dengan protoplasma. dan transport aktif.Semua sel prokariotik mempunyai membram plasma. mitokondria. selain itu sel. komplek Golgi. dengan sisanya menjadi protein. sel prokariotik tidak memiliki membram inti. sel eukariotik juga memiliki sentriol. sedangkan sel prokariotik tidak. A. (Yunus.

Kadang-kadang konten adalah setinggi satu molekul kolesterol per satu molekul fosfolipid. Membran sel Protein Protein struktural membantu memberikan dukungan sel dan bentuk. Yang berperan penting pada sel sebagai pengendali kegiatan sel. Pesan dari dalam perjalanan inti melalui pori-pori di amplop nuklir untuk memasuki sitoplasma. Sitoplasma berisi sisa organel seperti retikulum endoplasma dan mitokondria. Ini adalah salah satu fungsi dari filamen intermediate. Mereka tertanam dalam membran sel dan membantu dalam sel untuk komunikasi sel dan transportasi molekul melintasi membran. masing-masing diperlukan untuk reproduksi sel dan kelangsungan hidup. Selain itu. Di dalam inti. chromatins dikondensasikan untuk membentuk struktur yang sangat terorganisir yang disebut kromosom . sitoskeleton dapat membantu dalam pergerakan sel.Glikoprotein memiliki rantai karbohidrat yang menyertainya. Mereka membantu sel untuk mengenali sel-sel tubuh lainnya. Nukleus biasanya terletak di tengah sel dan berbentuk bulat dan oval. asam lemak. neurotransmitter dan molekul sinyal lainnya. Protein membran sel reseptor membantu sel berkomunikasi dengan lingkungan eksternal mereka melalui penggunaan hormon. Untuk sel tanpa dinding sel. Sitosol adalah struktur terbesar dalam sel. Inti bertanggung jawab untuk berkomunikasi dengan organel lain dalam sitoplasma (ruang seperti gel yang mengelilingi inti). Nukleus Inti sel atau nukleus merupakan organel terbesar yang berada di dalam sel. Selama replikasi. DNA terikat oleh protein histon dan disusun dalam kromatin. mikrotubulus dan filamen intermediar. molekul transportasi melintasi membran sel melalui difusi difasilitasi . Kolesterol merupakan komponen penting dari membran plasma hewan. Sitoskleton Merupakan rangka sel yang tersusun atas tiga jenis serabut yaitu mikrofilamen. 3. 4. Ini composes 54% dari total volume sel. Sitoplasma adalah materi yang mengisi antara inti dan selaput plasma. Glikolipid yang terletak pada permukaan membran sel dan memiliki karbohidrat rantai gula yang melekat pada mereka. Nukleus berdiameter 10 mikrometer. Sitoskeleton menyediakan kerangka kerja struktural penting untuk: a. seperti protein globular. Sitosol berisi ribuan enzim yang bertanggung jawab untuk catalyzation dari glikolisis dan glukoneogenesis dan untuk biosintesis gula. terdiri atas air dan zat-zat yang terlarut serta berbagai macam organel sel hidup. Protein transport. 109 . Sel bentuk. Sitoplasma Sitoplasma merupakan cairan sel yang berada di luar inti. Daerah sitoplasma di luar organel individu disebut sitosol.Kolesterol merupakan komponen lipid dari membran sel. inti sebagian besar juga mengandung satu atau lebih bola berbentuk organel yang disebut nukleolus. dan asam amino. Nucleolus adalah di mana ribosom dirakit. 2. disebut nucleoplasm. sitoskeleton menentukan bentuk sel. Struktur ini memberikan sel bentuk dan memungkinkan untuk mengatur banyak reaksi kimia yang terjadi di sitoplasma. Informasi genetik dikelilingi oleh amplop dua-lapisan nuklir dan umumnya ditemukan di tengah sel. Selain informasi genetik. Kolesterol sebagian melumpuhkan ekor asam lemak membuat membran kurang fleksibel dan dengan demikian kurang permeabel untuk molekul yang lebih kecil.

Koleksi dinamis mikrofilamen dan microtubles dapat terus dalam proses perakitan dan pembongkaran. detoksifikasi obat-obatan. Retikulum endoplasma memiliki struktur yang menyerupai kantung berlapis-lapis. sementara RE sarkoplasmik menyimpan dan memompa ion kalsium. sehingga kekuatan yang menggerakkan sel. Pembelahan sel.b. Struktur Ribosom Susunan ribosom merupakan susunan yang rumit antara RNA ribosom (rRNA) dan protein ribosom (disebut Ribonukleoprotein atau RNP). Sentriol Sentriol merupakan organel yang dapat dilihat ketika sel mengadakan pembelahan. cincin mikrofilamen membantu membagi sel mengembangkan dua oleh konstriksi wilayah tengah antara sel-sel. (kata endoplasmik berarti “di dalam sitoplasma” dan retikulum diturunkan dari bahasa latin yang berarti “jaringan”). RE halus berfungsi dalam beberapa proses metabolisme yaitu sintesis lipid. maupun manusia. terdapat bintik-bintik yang merupakan ribosom. Tanaman sel dan jamur tidak mengandung sentriol.Pada fase tertentu dalam daur hidupnya sentriol memiliki silia atau flagela. Ribosom Ribosom merupakan salah satu bagian penting dalam tubuh makhluk hidup karena dapat mengendalikan cara kerja tubuh tumbuh-tumbuhan. Mikrotubulus dan mikrofilamen dapat membantu organel bergerak dari satu tempat ke tempat dalam sel. Retikulum Endoplasma Adalah organel yang dapat ditemukan di seluruh sel hewan eukariotik. fungsi utama RE kasar adalah sebagai tempat sintesis protein. Gerakan sel. Sentriol adalah struktur yang ditemukan dalam sel-sel hewan eukariotik. mikrofilamen menempel vesikel dan menariknya ke dalam sel. RE halus tidak memiliki bintik-bintik ribosom di permukaannya. dan diperkirakan bahwa pergerakan vesikel dipandu oleh sitoskeleton. RE sarkoplasmik RE sarkoplasmik adalah jenis khusus dari RE halus. sedangkan yang besar mengikat tRNA (transport RNA). atau pada membran inti sel.Sebagian besar sintesis kompleks dan fungsi distribusi dari retikulum endoplasma dan kompleks Golgi memanfaatkan vescicles transportasi. Subunit kecil mengikat mRNA (messeger RNA). tergantung pada jenisnya. RE halus Berbeda dari RE kasar. RE sarkoplasmik ini ditemukan pada otot licin dan otot lurik. Ribosom tersuspensi dalam sitosol atau terikat pada retikulum endoplasma kasar. Kemudian untuk sel-sel hewan. Kantung ini disebut cisternae. Dalam kasusendositosis ketika vesikula terbentuk untuk menelan beberapa partikel dari luar sel. yang merupakan komponen sitoskeleton. metabolisme karbohidrat dan konsentrasi kalsium. . Ini adalah bagian dari sel. 7. Audesirk dan Audesirk memberikan contoh sel darah putih "merangkak" dan perubahan migrasi dan bentuk sel selama perkembangan organisme multicelled. dan tempat melekatnya reseptor pada protein membran sel. RE halus mensintesis molekul. mikrotubulus mencapai gerakan chromosones ke inti putri. d. soma. yang artinya tubuh. Ada tiga jenis retikulum endoplasma: RE kasar Di permukaan RE kasar. Ribosom ini berperan dalam sintesis protein. Selama pembelahan sel. yang bertindak sebagai pusat mikrotubulus memproduksi. Ada juga dapat geser gerakan struktur ini. Pembagian ribosom berdasarkan subunit besar dan subunit kecil. Maka. Perbandingan keduanya yaitu 65% rRNA dan 35% RNP. hewan. c. 5. Retikulum Endoplasma (RE) merupakan labirin membran yang demikian banyak sehingga retikulum endoplasma meliputi separuh lebih dari total membran dalam sel-sel eukariotik. Fungsi retikulum endoplasma bervariasi. RE sarkoplasmik berperan dalam pemicuan kontraksi otot. Ribosom merupakan organel terkecil dalam sel yang berbentuk bulat padat dengan diameter sekitar 20 sampai 25 nm. 110 6. Yang membedakan RE sarkoplasmik dari RE halus adalah kandungan proteinnya. Organel gerakan. Kata ribosom didapat dari penggabungan kata yaitu ribonucleic acid dan kosakata Yunani.

Sebagian besar protein dibuat oleh ribosom bebas akan berfungsi di dalam sitosol. Ribosom akan membaca urutan basa RNA dan menterjemahkan (translate) menjadi urutan asam amino tertentu sesuai dengan resep yang dibawa mRNA. Terjadi terutama pada sel-sel kelenjar kantung kecil tersebut. Pada saat sintesis protein ribosom mengelompok menjadi poliribosom (polisom). Terdapat tiga unsur yang terlibat dalam proses translasi yaitu adalah mRNA. sedangkan sel tumbuhan memiliki hingga ratusan badan Golgi. yang dalam pelaksanaannya adalah berupa penyusunan basa-basa pada rantai RNA dengan menggunakan runtunan basa DNA gen sebagai modelnya. berisi enzim dan bahan-bahan lain. Kompleks golgi Badan Golgi (disebut juga aparatus Golgi. beberapa fungsi badan golgi antara lain : Membentuk kantung (vesikula) untuk sekresi. Ribosom berperan sebagai tempat pertemuan mRNA dengan tRNA serta penterjemahan kodon serta reaksi perangkaian asamamino. • Translasi Pada tahap ini mRNA hasil transkripsi dibaca oleh ribosom dan diproses lebih lanjut oleh ribosom. Pada tahap transkripsi basa timin pada DNA digantikan oleh urasil pada RNA namun keduanya sama. misalnya ginjal. kompleks Golgi atau diktiosom) adalah organel yang dikaitkan dengan fungsi ekskresi sel. informasi pada gen digandakan satu per satu (basa per basa) dari sebuah rantai DNA menjadi rantai RNA pembawa pesan (mRNA).      . dan struktur ini dapat dilihat dengan menggunakan mikroskop cahaya biasa. Transkripsi adalah penyalinan informasi dari gen ke dalam molekul RNA. sel hati manusia memiliki beberapa juta ribosom. • Transkripsi Transkripsi adalah proses penggandaan DNA menjadi RNA. Badan Golgi pada tumbuhan biasanya disebut diktiosom. Kantung atau membran golgi sama seperti membran plasma. untuk pembungkusan dalam organel tertentu seperti lisosom atau dikirim ke luar sel.sama berpasangan dengan adenine. Membentuk dinding sel tumbuhan Fungsi lain ialah dapat membentuk akrosom pada spermatozoa yang berisi enzim untuk memecah dinding sel telur dan pembentukan lisosom. Misal. Proses pembentukan protein Ada tiga tahap proses pembentukan protein. • Replikasi DNA Replikasi adalah pencetakan dan penggandaan DNA dengan membelah dan membentuk sel yang baru yang urutan A-C-G-T nya sama.Fungsi ribosom Ribosom memiliki fungsi untuk mensintesis protein. Tempat untuk memodifikasi protein 111 8. dan rRNA. Setiap sel hewan memiliki 10 hingga 20 badan Golgi. Kantung yang dilepaskan dapat menjadi bagian dari membran plasma. Organel ini terdapat hampir di semua sel eukariotik dan banyak dijumpai pada organ tubuh yang melaksanakan fungsi ekskresi. Tidak mengejutkan jika sel yang aktif dalam mensintesis protein juga memiliki nukleus yang terlihat jelas. tRNA. Sel yang memiliki laju sintesis protein yang tinggi secara khusus memiliki jumlah ribosom yang sangat banyak. transkrpsi dan translasi. antara lain replikasi DNA. Membentuk membran plasma. Sedang ribosom terikat umumnya membuat protein yang dimasukkan ke dalam membran. Di sinilah asam-asam amino itu dirakit sesuai urutan yang diresepkan gen (DNA) dan kemudian melipat membentuk struktur tiga dimensi yang fungsional. Pada produksi awal protein.

Respirasi merupakan proses perombakan atau katabolisme untuk menghasilkan energi atau tenaga bagi berlangsungnya proses hidup. hanya bergaris tengah 0. seperti organel yang tidak berfungsi lagi. ruang antar membran.5 µm dan panjang 0. Semua enzim tersebut aktif pada pH 5. fagositosis. materi tersebut bertemu pertama kali dengan enzim hidrolitik. Lisosom Lisosom adalah organel sel berupa kantong terikat membran yang berisi enzim hidrolitik yang berguna untuk mengontrol pencernaan intraseluler pada berbagai keadaan. Pertama. Setelah itu. Proses autofagi digunakan untuk pembuangan dan degradasi bagian sel sendiri. fosfatase. Jumlah dan bentuk mitokondria bisa berbeda-beda untuk setiap sel. Dengan demikian. autofagosom berfusi dengan enzim hidrolitik dari trans Golgi dan berkembang menjadi lisosom (atau endosom lanjut). yang tidak dibawa ke endosom lanjut. lipase. Mula-mula. membran akan membungkus partikel atau mikroorganisme dan membentuk fagosom. 11. Endositosis ialah pemasukan makromolekul dari luar sel ke dalam sel melalui mekanisme endositosis. membran luar juga mengandung enzim yang terlibat dalam biosintesis lipid dan enzim yang berperan dalam proses transpor lipid ke matriks untuk menjalani ?-oksidasi menghasilkan Asetil KoA. Dalam hal ini. Mitokondria banyak terdapat pada sel yang memilki aktivitas metabolisme tinggi dan memerlukan banyak ATP dalam jumlah banyak. Beberapa materi tersebut dipilah dan ada yang digunakan kembali (dibuang ke sitoplasma). Stuktur krista ini meningkatkan luas permukaan membran dalam sehingga meningkatkan kemampuannya dalam memproduksi ATP.5 mikro meter .Untuk menyortir dan memaket molekul-molekul untuk sekresi sel Untuk membentuk lisosom 9. Struktur mitokondria terdiri dari empat bagian utama. fagosom akan berfusi dengan enzim hidrolitik dari trans Golgi dan berkembang menjadi lisosom (endosom lanjut). Di dalamnya. Luas permukaan ini meningkat sangat tinggi diakibatkan banyaknya lipatan yang menonjol ke dalam matriks. Kemudian. dan matriks yang terletak di bagian dalam membran [Cooper. yaitu membran luar.5 – 1. 2000]. organel ini memiliki 40 jenis enzim hidrolitik asam seperti protease. Fungsi utama lisosom adalah endositosis. nuklease. Lisosom ditemukan pada tahun 1950 oleh Christian de Duve dan ditemukan pada semua sel eukariotik. misalnya sel otot jantung.3-1. disebut krista [Lodish. Mitokondria berbentuk elips dengan diameter 0. Di dalam endosom awal. Membran dalam mengandung protein yang terlibat dalam reaksi fosforilasi 112   . Fagositosis merupakan proses pemasukan partikel berukuran besar dan mikroorganisme seperti bakteri dan virus ke dalam sel. Membran ini merupakan tempat utama pembentukan ATP. fosfolipase. transformasi berudu menjadi katak. Membran dalam yang kurang permeabel dibandingkan membran luar terdiri dari 20% lipid dan 80% protein. Terjadi penurunan pH (5) pada endosom lanjut sehingga terjadi pematangan dan membentuk lisosom. 2001]. yang disebut endosom awal. Membran luar terdiri dari protein dan lipid dengan perbandingan yang sama serta mengandung protein porin yang menyebabkan membran ini bersifat permeabel terhadap molekul-molekul kecil yang berukuran 6000 Dalton. 10. dan embrio manusia. yang kemudian materi-materi ini akan dibawa ke vesikel kecil dan tidak beraturan. ataupun sulfatase. Mitokondria Mitokondria adalah tempat di mana fungsi respirasi pada makhluk hidup berlangsung. membran dalam. glikosidase. Badan Mikro Badan mikro disebut karena ukurannya yang kecil . bagian dari retikulum endoplasma kasar menyelubungi organel dan membentuk autofagosom.0 µm. Selain itu. Di endosom lanjut. membran luar mitokondria menyerupai membran luar bakteri gram-negatif. Proses ini berguna pada sel hati. pH sekitar 6. mitokondria adalah “pembangkit tenaga” bagi sel.Badan mikro terdiri atas peroksisom dan glioksisom serta berisi enzim katalase. dan autofagi.

ATP. 1993). (Prawirohartono S & Suhargono H. (Prawirohartono S & Suhargono H. Mereka mengandung DNA.M. Serat dalam sel memberikan kerangka struktur kaku.5 mikrometer dengan diameter 25 nm. dan reaksi ?-oksidasi asam lemak. selaput inti meluruh. kalsium dan kalium.tipis yang memanjang. berpartisipasi dalam gerakan vesikel dan kromosom. Mereka juga mengikat mayoritas ribosom.Mikroorganisme yang termasuk jenis Eukariotik. ADP. sebuah alat khusus bernama spindel. Retikulum Endoplasma adalah selaput lain yang ditemukan dalam sel eukariotik. dan merupakan tipe organel khusus lainnya yang ditemukan dalam beberapa jenis sel eukariotik. biasanya dalam bentuk kromosom melingkar seperti yang ditemukan juga pada E. R. Sebagian besar sel eukariotik juga mengandung selaput dalam. yang panjangnya 2.yaitu aktin dan miosin. Dalam tiap siklus sel.1997) Dalam sitoplasma eukariotik ada sejumlah protein struktural yang membentuk jaringan. Saat sel membelah.dan juga membentuk rangka dalam pada sel. (Abercrombie. dan berpartisipasi dalam mengubah bentuk sel sehingga ia dapat bergerak. mitokondria mirip dengan bakteri dan kenyataannya tampaknya berevolusi dari bakteri. dibutuhkan untuk menarik kromosom ke sel-sel anakan.1996) Kloroplas melakukan fotosintesis pada sel tanaman. dan filamen tipis membentuk empat kategori serat yang ditemukan dalam sel eukariotik. (Syamsuri I & Suliestijono. Mikrotubula. Mikrotubulus dan Mikrofilamen Mikrotubulus merupakan organel berbentuk tabung atau pipa .coli dan ribosom yang berada di sitoplasma sel eukariotik. Inti dikelilingi oleh dua selaput. serta protein transpor yang mengatur keluar masuknya metabolit dari matriks melewati membran dalam. filamen intermediat. Ia terlibat dengan modifikasi protein untuk transpornya ke organel sel lain atau untuk ekspor ke luar sel.  Fungi. Retikulum Endoplasma berdampingan dengan selaput inti luar namun membentang di seluruh sitoplasma dalam banyak tipe sel dan terlibat dengan sintesis dan transpor protein selaput. dan kemudian menggumpal kembali. ribosom. yang fungsi utamanya tampaknya membantu DNA mempertahankan keadaan kakunya. fosfat inorganik serta ion-ion seperti magnesium. seperti siklus Krebs.yang juga berperan dalam gerakan sel adalah mikrofilamen.1996) Sel eukariotik juga mengandung organel khusus seperti mitokondria. yang melakukan fosforilasi oksidatif untuk membangkitkan energi kimia yang dibutuhkan sel. (Schleif. 12. ATP sintase yang berfungsi membentuk ATP pada matriks mitokondria. 2006) DNA sel eukariotik tidak mencampur bebas dengan sitoplasma. Ini adalah struktur besar yang secara aktif mentranspor protein atau RNA ke dalam atau ke luar inti. (Schleif.Mikrofilamen tersusun atas dua macam protein . hanya protein kecil dengan berat molekul kurang dari 20 hingga 40 ribu dapat bebas memasuki inti lewat selaput inti. namun terselubung dalam selaput inti. DNA sendiri terkekang erat dengan sejenis protein yang disebut histon.Diameter mikrofilamen hanya 5 nm. kloroplas juga mengandung DNA dan ribosom yang berbeda dari struktur yang analog di daerah lain sel tersebut. 1993). Organel ini berbentuk benangbenang halus . 113 .Mikrofilamen banyak terdapat pada sel-sel otot . Di dalam matriks mitokondria juga terdapat materi genetik. Selain mikrotubulus . reaksi oksidasi asam amino. Golgi adalah struktur lain yang mengandung selaput.oksidatif. yang dikenal dengan DNA mitkondria (mtDNA). Secara normal. Dalam banyak hal. Seperti mitokondria. R. dan terdiri dari sebagian mikrotubula. aktin. Ruang antar membran yang terletak diantara membran luar dan membran dalam merupakan tempat berlangsungnya reaksi-reaksi yang penting bagi sel.Tabung tabung kecil itu tersusun atas protein yang dikenal sebagai tubulin.

Selain itu. yaitu jamur yang hidup di akar tanaman kacang-kacangan atau pada liken. protein. Sebagian besar jamur saprofit mengeluar-kan enzim hidrolase pada substrat makanan untuk mendekomposisi molekul kompleks menjadi molekul sederhana sehingga mudah diserap oleh hifa. dan senyawa kimia lainnya. Dinding ini menyelubungi membran plasma dan sitoplasma hifa. a. beberapa jamur 114 . jamur tidak memangsa dan mencernakan makanan. Cara makan dan Habitat jamur Semua jenis jamur bersifat heterotrof. Simbiosis mutualisme jamur dengan tanaman dapat dilihat pada mikoriza. Jamur yang hidup bersimbiosis. Hifa membentuk jaringan yang disebutmiselium. berbeda dengan organisme lainnya. 2003) 1. haustoria dapat menembus jaringan substrat. dan reproduksinya. Oleh karena jamur merupakan konsumen maka jamur bergantung pada substrat yang menyediakan karbohidrat. Ada jamur yang satu sel. Hifa adalah struktur menyerupai benang yang tersusun dari dinding berbentuk pipa. Parasit Parasit obligat merupakan sifat jamur yang hanya sedangkan di luar inangnya tidak dapat carinii (khamir yang menginfeksi paru-paru penderita AIDS). obligat dapat hidup pada inangnya. Hifa pada jamur yang bersifat parasit biasanya mengalami modifikasi menjadi haustoria yang merupakan organ penyerap makanan dari substrat. 2. jamur dapat bersifat parasit obligat. Struktur hifa senositik dihasilkan oleh pembelahan inti sel berkali-kali yang tidak diikuti dengan pembelahan sitoplasma. Struktur jamur. dan kadangkala inti sel yang mengalir dari sel ke sel. contohnyojamur kayu. (Prawirohartono. tetapi cocok. Pneumonia adalah jamur yang bersifat saprofit bersifat jika parasit tidak fakultatif jika mendapatkan inang yang mendapatkan inang yang c. Septa mempunyai pori besar yang cukup untuk dilewati ribosom. Namun. Cara hidup jamur lainnya adalah melakukan simbiosis mutualisme. Saprofit Saprofit merupakan jamur pelapuk dan pengubah susunan zat organik yang mati. Clntuk memperoleh makanan. Jamur saprofit menyerap makanannya dari organisme yang telah mati seperti kayu tumbang dan buah jatuh. vitamin. Meskipun kebanyakan hidup di darat. misalnyo khamir. hidup. adapula hifa yang tidak bersepta atau hifa senositik. Kebanyakan hifa dibatasi oleh dinding melintang atau septa. Ciri-ciri jamur berbeda dengan organisme lainnya dalam hal cara makan. Sitoplasmanya mengandung organel eukariotik. ada pula jamur yang multiseluler membentuk tubuh buah besar yang ukurannya mencapai satu meter. Slamet. Semua zat itu diperoleh dari lingkungannya. selain menyerap makanan dari organisme lain juga menghasilkan zat tertentu yang bermanfaat bagi simbionnya. Parasit Parasit fakultatif sesuai. Miselium menyusun jalinan-jalinan semu menjadi tubuh buah. Misalnya.Jamur merupakan kelompok organisme eukariotik yang membentuk dunia jamur atau regnum fungi. Tubuh jamur tersusun dari komponen dasar yang disebut hifa. Sebagai makhluk heterotrof. jamur menyerap zat organik dari lingkungan melalui hifa dan miseliumnya. Struktur tubuh jamur tergantung pada jenisnya. parasit fakultatif. hifa dapat juga langsung menyerap bahanbaha organik dalam bentuk sederhana yang dikeluarkan oleh inangnya. Jamur berhabitat pada bermacammacam lingkungan dan berasosiasi dengan banyak organisme. b. struktur tubuh. atau saprofit. kemudian menyimpannya dalam bentuk glikogen. Akan tetapi. Jamur pada umumnya multiseluler (bersel banyak). pertumbuhan. mitokondria.

Khamir Saccharomyces berguna sebagai fermentor dalam industri keju. and K. Untuk identifikasi. hasil mikroskopik dan makroskopik merupakan dasar identifikasi. Epidermophy ton. Candida albicans. cembung bau seperti ragi. Rhizopus. Contoh : Histoplasma capsulatum. Yeast like merupakan jamur uniselluler yang mampu membentuk pseudohifa. Higroporus dan Lycoperdon perlatum berguna sebagai dekomposer. Ragi adalah chemoorganotrophs. kumpulan dari hifa disebut miselium yang membentuk suatu anyaman. dan kebanyakan dari kelas Oomycetes. 1994) b. 1991) 115 . 1994) c. berkembang biak dengan cara membelah diri (asexual) membentuk tunas atau budding cell. Cecie. Schmitdt.ada yang hidup di air dan berasosiasi dengan organisme air. Karbon diperoleh sebagian besar dari gula heksosa. Spesies ragi baik memerlukan oksigen untuk respirasi seluler aerobik (aerob obligat) atau anaerobik. Penicellium. Peranan Jamur Peranan jamur dalam kehidupan manusia sangat banyak. Jamur yang hidup di air biasanya bersifat parasit atau saprofit. H. (Schlegel. Microsporum. warna krem. and K. Jamur yang menguntungkan meliputi berbagai jenis antara lain sebagai berikut. Tidak seperti bakteri. Secara makroskopik (pada media padat SGA) koloni jamur bentuk yeast tampak Smooth. Ragi tumbuh terbaik di lingkungan pH netral atau sedikit asam. Berbentuk Yeast jika berada di dalam inang / host atau pada suhu inkubasi 37 derajat C. Schmitdt. Yeast Merupakan jamur uniselluler yang berbentuk oval / lonjong dengan diameter 3 – 15 mikron. 1994) Mold / Kapang Merupakan jamur multiselluler (mempunyai inti lebih dari satu) yang membentuk benang-benang hifa / filament. Hifa yang berada didalam media disebut Hifa Vegetatif berfungsi sebagai alat untuk menyerap makanan. e. Cryptococcus neoformans. yaitu dalam pembuatan tempe dan oncom. MORFOLOGI Bentuk jamur secara garis besar ada 3 bentuk yaitu : a. Coccidioides immitis. Penicillium notatum berguna sebagai penghasil antibiotik. karena mereka menggunakan senyawa organik sebagai sumber energi dan tidak membutuhkan sinar matahari untuk tumbuh. Rhizopus dan Mucor berguna dalam industri bahan makanan. Dimorfik Merupakan jamur yang mempunyai dua bentuk yaitu : Yeast dan Mold. (Starr. Torulla (koloni berwarna merah / orange). Contoh: Aspergillus. Trichophyton.G. (Schlegel. Hifa yang dibentuk ada yang bersekat maupun tak bersekat. dan bir. 3. a. b. c. tidak ada spesies ragi diketahui bahwa tumbuh hanya anaerob (anaerob obligat). seperti glukosa dan fruktosa.G. Secara makroskopik (pada media SGA) jamur yang berbentuk Mold membentuk koloni yang berserabut / granuler koloninya tampak kasar (Rought). Contoh : Candida sp. tetapi juga memiliki metode aerobik dari produksi energi (fakultatif anaerob). Yeast ada dua yaitu : Yeast murni merupakan jamur uniselluler yang tidak mampu membentuk pseudohifa/ klamidospora. Schmitdt. Blastomyces dermatidis. Hifa yang berada di atas permukaan media disebut Hifa aerial yang berfungsi sebagai alat perkembangbiakan. (Schlegel. H. dan berbentuk mold jika berada diluar inangnya atau pada suhu inkubasi suhu ruang. H. baik peran yang merugikan maupun yang menguntungkan.G. d. Volvariella volvacea (jamur merang) berguna sebagai bahan pangan berprotein tinggi. roti. and K. atau disakarida seperti sukrosa dan maltosa. Mucor.

Oogami terjadi jika antara sel kelamin jantan dan sel kelamin betina mempunyai bentuk dan ukuran yang berbeda dan mudah dibedakan. menyerupai tumbuhan. Karena ganggang merupakan Protista yang mengandung klorofil dan dapat berfotosintesis untuk memenuhi kebutuhan makanannya sendiri maka disebut protista mirip tumbuhan.Pada kondisi yang kurang menguntungkan.Protista dapat dikelompokkan menjadi tiga kelompok. (Starr. penyebab keputihan dan sariawan pada manusia. sedangkan kelompok Protista yang menyerupai jamur adalah jamur lendir dan jamur air. f. Ganggang dapat dikelompokkan menurut pigmen yang dimilikinya menjadi beberapa golongan. batang. kelompok Protista yang menyerupai hewan adalah Protozoa. atau koloni sel. Candida sp. Ganggang dapat hidup di air tawar dan di air laut.Protista biasanya ditemukan di dalam air. dapat berupa planktonyang melayanglayang di dalam air atau melekat di dasar sungai. Maka kingdom ini beranggotakan makhluk bersel satu atau bersel banyak yang tersusun sederhana. dan daun sejati seperti yang dimiliki oleh tumbuhan. Kelompok makhluk hidup Protista yang menyerupai tumbuhan adalah ganggang (Algae). e. Hanya dikatakan menyerupai tumbuhan karena ganggang tidak mempunyai akar. batu-batuan. Pada kenyataannya. ataupun menyerupai jamur.Ganggang dapat berbentuk benang. laut.Protista memiliki flagela atau cilia dalam hidupnya dan dapat berkembang secara aseksual atau seksual. baik sebagai parasit maupun sebagai saprofit. lembaran. antara lain sebagai berikut. sertadapat pula hidup bersimbiosis dengan organisme lainnya. Phythophthora inf'estan menyebabkan penyakit pada daun tanaman kentang. seperti dinding tembok kamar mandi. Isogami terjadi jika antara sel betina dan sel kelamin jantan mempunyai ukuran yang sama dan sulit dibedakan. heterotropik. Meskipun begitu. Nutrisi yang diperoleh dari fotosintesis Protista tersebut dapat bersifat fototropik.Reproduksi ganggang dapat dilakukan secara seksual dan aseksual. atau kulit-kulit pohon. 2004) A. beberapa jamur juga mempunyai peranan yang merugikan. Protista dapat pula hidup di dalam tanah dan di tempattempatyang lembap. (Syamsuri. 1991)  Protista Protista sendiri berasal dari bahasa yunani. protista sudah jauh lebih maju karena sel-selnya sudah memiliki membran inti atau eukariota.Ganggang juga memiliki ciri lain yang sama dengan Protista. akan terjadi pembuahan yang menghasilkan zigot. Protista dapat membentuk kistae. tetapi ada pulayang hidup di tempat-tempat yang lembap. dan berbentuk seperti benang-benang halus. Secara taksonomis.atau danau. Protista Menyerupai Tumbuhan (Ganggang atau Algae) Ganggang adalah Protista yang menyerupai tumbuhan. Dari peleburan dua sel kelamin tersebut. Protista bersifat aerobik dan menggunakan mitokondriauntuk respirasi. Protista tersebut dapat melakukan fotosintesis (dapat membuat makanan sendiri). berwarna hijau. Saprolegnia sebagai parasit pada tubuh organisme air. Semua makhluk hidup eukariotik yang bukan merupakan hewan dan tumbuhan masuk dalam kelompok Protista. ada yang bersifat uniseluler dan ada yang multiseluler. atau keduanya. yaitu ganggang cokelat 116 . dibandingkan dengan monera.Secara seksual dilakukan dengan cara isogami dan oogami. Cecie. yaitumemiliki membran inti. ada Protista yang dapat berlaku sebagai produsen. Pneumonia carinii menyebabkan penyakit pneumonia pada paru-paru manusia. dan ksitos artinya menyusun.. b. d. tetapi hanya mempunyai sifat yang menyerupai hewan. yaitu sebagai berikut. a.Umumnya. Phytium sebagai hama bibit tanaman yang menyebabkan penyakit rebah semai.Di samping peranan yang menguntungkan. Zigot akan terusmberkembang menjadi individu baru. Protista bukan merupakan hewan ataupun tumbuhan. yaitu protos yang berarti pertama atau mula-mula. Albugo merupakan parasit pada tanaman pertanian. atap rumah. c.

Plankton disebut sebagai produsen. sungai. 4) dari mulutnya muncul satu flagela (cambuk) yang berfungsi sebagai alat gerak.b. 2006) a . 2) sel berbentuk oval memanjang. ganggang yang terkena cahaya matahari akan mengeluarkan gas berupa gelembung-gelembung kecil yang menempel pada pinggir-pinggir kolam. Euglena viridis. Ciri-ciri Chlorophyta Ganggang hijau (Chlorophyta) mempunyai ciri-ciri sebagai berikut: 1) tubuhnya mengandung klorofil dan berwarna hijau. Makhluk hidup ini berwarna hijau. makhluk hidup ini dapat mengubah klorofil menjadi energi. (Syamsuri I & Suliestijono. Euglena biasa hidup di air tawar. Cara Euglena Bereproduksi Reproduksi Euglena dilakukan dengan membelah diri. (Syamsuri. (Syamsuri I & Suliestijono. 2006) c . Jika kalian perhatikan dengan baik. ganggang merah (Rhodophyta). Oksigen adalah gas yang dihasilkan dalam proses fotosintesis. dan berfotosintesis sehingga dimasukkan ke dalam dalam kelompok makhluk hidup yang menyerupai tumbuhan.. air danau. dan sitoplasma. Ganggang hijau dapat berbentuk benang. ganggang ini hidup di air tawar. Setiap sel anak mempunyai inti sel. Contoh ganggang hijau. atau parit. 2006) 2. Sel mengandung kloroplas yang berisi klorofil a. (Syamsuri. Makhluk hidup ini juga mempunyai ciri-ciri yang menyerupai hewan karena dapat bergerak aktif. 2004) a . ataupun air sungai. Chlorophyta (ganggang hijau) merupakan plankton yang hidup melayang-layang di air tawar atau laut. gas itu adalah oksigen. contohnya. Biasanya. cara memasukkan makanan melalui mulut sel. (Syamsuri I & Suliestijono. Filum Euglenophyta Euglenophyta merupakan ganggang bersel satu. filamen. 2004) 1. Bagaimana kalian tahu jika Chlorophyta sedang melakukan fotosintesis? Amati dan perhatikan kolam ikan air tawar pada siang hari. dan ganggang Euglenophyta. Cara Euglena Memperoleh Makanan Sebagai organisme yang menyerupai tumbuhan. Dengan bantuan cahaya matahari. sungai. ataupun berkoloni. sawah. 117 . Selain berfotosintesis. berklorofil.. 2006) b . Filum Ganggang Hijau (Chlorophyta) Chlorophyta adalah ganggang yang mengandung klorofil dan karotin berwarna kuning sehingga warnanya menjadi hijau kekuningan. ganggang pirang (Chrysophyta). membran sel. dan 5) mempunyai bintik mata yang terletak di dekat mulut sel yang berfungsi untuk membedakan antara gelap dan terang. (Syamsuri I & Suliestijono. Chlorophyta dapat melakukan fotosintesis. Plankton ini merupakan sumber makanan utama bagi hewan-hewan yang hidup di dalamnya. Volvox sp. karoten dan xantofil. makhluk hidup ini dapat pula memasukkan bahan makanan melalui mulut sel yang dimilikinya sehingga Euglena dapat disebut sebagai organisme fotoautotrof dan organisme heterotrof. air kolam. ganggang hijau (Chlorophyta). Ciri-Ciri Euglena Euglena mempunyai ciri-ciri sebagai berikut: 1) berwarna hijau karena mengandung klorofil. seperti air kolam. tidak berdinding sel.(Phaeophyta). 3) di salah satu ujungnya terdapat mulut sel. misalnya. atau danau akan berwarna hijau karena adanya jenis ganggang hijau di dalamnya. Dari pembelahan ini akan dihasilkan dua sel anak. Euglena dapat membuat makanan sendiri dengan melakukan fotosintesis. dan mempunyai bintik mata sehingga Euglena ini merupakan makhluk hidup yang menyerupai hewan dan sekaligus juga merupakan makhluk hidup yang menyerupai tumbuhan. dan Ulothrix sp. antara lain. Spirogyra sp. Air kolam. Dengan bantuan cahaya matahari.

(Syamsuri. berukuran mikroskopis. Reproduksi secara aseksual dilakukan dengan fragmentasi. Cara Chlorophyta Bereproduksi Reproduksi Chlorophyta dapat dilakukan dengan dua cara. Rongga ini terletak di dekat kloroplas yang disebut pirenoid. (Syamsuri. Chlamydomonas dapat berkembang biak dengan dua cara. Di perairan tersebut. dan hidup sebagai zoospora pada Chlorococcum hingga terbentuk satu sel dewasa. 2004) d . Reproduksi seksual dilakukan dengan cara peleburan sel kelamin jantan dan betina serta ada juga yang secara konjugasi. memiliki kromosom diploid (2n). fragmentasi (ganggang berbentuk benang dan berkoloni). Spirogyra mempunyai sel yang mengandung kloroplas berbentuk pita spiral dan dalam satu sel mengandung satu inti. 3) merupakan makhluk hidup bersel satu yang berbentuk benang. mempunyai ruas-ruas yang mengandung nukula dan globula. Kloroplas berbentuk mangkuk. 2) Chlamydomonas merupakan Chlorophyta bersel satu yang dapat bergerak dan bersifat mikroskopis. Sel Chlamydomonas mengandung satu inti. dan kloroplas. 4) telah memiliki dinding sel. 5) cadangan makanan disimpan di suatu rongga yang berbentuk bulat. Hasil peleburan tersebut adalah zigot yang dapat tumbuh menjadi individu baru. Globula mengandung anteridium penghasil spermatozoid. 2004) c . Reproduksi secara aseksual dilakukan tanpaadanya peleburan sel jantan dan betina. Banyak terdapat di air tawar dan bentuk koloninya seperti jala. 3) Spirogyra dan Oedogonium adalah sel yang membentuk benang atau untaian memanjang seperti benang dan bersifat mikroskopis. Ulva adalah ganggang yang hidup di air laut. Ganggang hijau berperan sebagai pemasok bahan makanan utama bagi hewan-hewan yang ada di perairan tersebut. Chlorella dapat berkembang biak dengan pembelahan sel. Cara Mendapatkan Makanan Ganggang hijau mengandung klorofil dan dapat melakukan fotosintesis untuk mendapatkan makanannya. Contoh-Contoh Chlorophyta Beberapa contoh ganggang hijau yang sering dijumpai adalah sebagai berikut : 1) Chlorococcum dan Chlorella merupakan Chlorophyta bersel satu yang tidak dapat bergerak dan bersifat mikroskopis. yaitu secara seksual dan secara aseksual. (Syamsuri. serta pembentukan zoospora (spora kembara). yaitu dengan pembentukan zoosprora dan konjugasi. Alat gerak berupa dua flagel. lembaran.2) hidup melayang-layang di air tawar atau air laut. 2004) b . Berkembang biak secara aseksual dengan spora dan fragmentasi. dan berkoloni. Selnya berbentuk bulat telur. Kloroplasnya berbentuk mangkuk. merupakan salah satu kelompok plankton air tawar. bahkan sekarang sedang dikembangkan untuk obat yang dikemas dalam bentuk kapsul. sedangkan secara seksual dengan konjugasi. dapat berkembang biak secara fragmentasi dan konjugasi. berkembang biak secara aseksual dengan spora yang menghasilkan Ulva haploi (n). Chara merupakan ganggang yang hidup di air tawar. satu vakuola. 118 . Spirogyra dan Oedogonium banyak hidup di air tawar. 4) Chara dan Ulva merupakan Chlorophyta yang berbentuk lembaran. Ulva haploid (n) akan berkembang biak secara seksual menghasilkan Ulva diploid (2n). Bintik mata dan pirenoid terletak di dalam mangkuk yang berfungsi sebagai tempat pembentukan zat tepung. Oedogonium mempunyai kloroplas berbentuk jala dan dalam satu sel mengandung satu inti serta dapat berkembang biak dengan zoospora dan peleburan spermatozoid (anteridium) dengan ovum (oogonium) yang dihasilkan oleh benang yang berbeda. ganggang hijau disebut sebagai produsen. Pembuahan ovum oleh spermatozoid akan menghasilkan zigospora yang selanjutnya akan berkembang menjadi individu baru. 5) Hydrodictyon merupakan Chlorophyta yang berbentuk koloni tak bergerak. Chlorococcum dan Chlorella dapat berkembang biak secara aseksual dengan membentuk zoospora yang bergerak dengan dua flagella. Chlorella dapat dimanfaatkan sebagai obat. tetapi dilakukan dengan pembelahan biner (ganggang bersel satu). Nukula mengandung arkegonium penghasil ovum.

Contohnya adalah Peridinium. baik air tawar. Contoh ganggang merah yang digunakan sebagai bahan makanan. Sebagian besar hidup di laut dan ada juga yang hidup di air tawar. Berwarna merah tua karena selain mengandung klorofil. Tulbilaria. Cyclotella. berbentuk seperti lembaran atau tumbuhan tinggi (memiliki alat. bersel satu (Ochromonas). sebagai bahan penggosok dan bahan isolasi. Vaucheria yang mempunyai ciri berbentuk seperti benang.Laminaria. Ganggang ini hidup di laut. Navicula. dan kuning keemasan (diatom). obat. Chrysophyta ada yang bersel satu. Chrysophyta kuning kecokelatan (Chrysophyceae) mengandung klorofil dan karoten (pigmen keemasan). dan bersifat mikroskopis. mempunyai tubuh yang multiseluler. Contoh ganggang cokelat adalah Fucus. misalnya. batang. Chrysophyta merupakan penyusun plankton yang terbesar. (Syamsuri. Volvox hidup di air tawar dan tiap sel mempunyai dua flagel dan stigma. juga mengandung zat warna merah (fikoeritrin). 2004) 6. kosmetik. dapat bergerak aktif. serta pengelmusi lemak dan cokelat batangan. 2004) 4. (Syamsuri. Filum Ganggang Cokelat (Phaeophyta) Ganggang cokelat berwarna cokelat karena selain mengandung klorofil juga memiliki zat warna cokelat (fukosantin). Filum Ganggang Merah (Rhodophyta) Ganggang merah merupakan makhluk hidup bersel banyak. dan benang berinti banyak (senosit). dan Pinnularia. Contoh ganggang ini adalah Diatom. (Prawirohartono. mengandung pigmen kuning kecokelatan. bercabang tidak bersekat. hijau kekuningan. Filum Ganggang Pirang atau Keemasan (Chrysophyta) Chrysophyta ada yang berwarna kuning kecokelatan. berklorofil. memiliki bentuk seperti rumput maka sering disebut rumput laut (sea weed) dan bersel banyak (berbentuk seperti lembaran).dan bahan cat. obat-obatan. maupun air laut. 2004) 3. secara seksual dengan peleburan sperma dan ovum yang menghasilkan zigot. Ganggang ini mempunyai ciri tubuhnya bersel satu. 2004) B. Contohnya. dan berkembang biak dengan cara membelah diri. Ganggang ini hidup di air laut. pelapis daging kaleng. bentuk koloni seperti bola dengan jumlah sel 500 – 50. Pinnularia sp. air payau. Euchema spinosum dan Gellidium yang digunakan manusia untuk bahan agar-agar. bersel banyak. Pembuahan sperma dan ovum menghasilkan zigot. bersel banyak. di luar sel terdapat celah dan alur yang masing-masing dilengkapi dengan satu flagel. dinding sel berupa lempengan selulosa yang rapat. agar-agar juga dimanfaatkan sebagai medium kultur mikroorganisme. Chrysophyta yang disebut diatom (Bacillariophyceae) berbentuk seperti kotak yang saling menutupi dan dapat hidup di tempat yang basah. Dinding sel Diatom mengandung zat kersik sehingga ganggang pirang sering disebut juga ganggang kersik. Selanjutnya. (Syamsuri. pengeras es krim. antara lain. Ganggang cokelat berkembang biak secara aseksual dengan fragmentasi. serta sering digunakan sebagai bahan pakan ternak. Selain untuk bahan makanan. dan Sargasum. Reproduksi secara aseksual dilakukan dengan cara fragmentasi. sedangkan secara seksual dilakukan dengan cara pembentukan konseptakel jantan yang mengandung anteridium penghasil spermatozoid dan konseptakel betina yang mengandung oogonium penghasil ovum. Filum Ganggang Api (Pyrrhophyta) Ganggang api sering disebut dengan Dinoflagelata. sedangkan secara seksual dengan konjugasi. Zat kersik ini sangat berguna bagi industri. dan daun). Protista yang Menyerupai Hewan (Protozoa) 119 . Berkembang biak secara seksual dengan peleburan sperma dan ovum yang menghasilkan zigot. (Syamsuri.000 buah. seperti akar. Reproduksi aseksual dilakukan dengan cara membelah diri. Reproduksi aseksual dilakukan dengan membentuk zoospora. zigot akan tumbuh menjadi individu baru. Chrysophyta hijau kekuningan (Xanthophyceae) mengandung klorofil dan pigmen kuning (xentofil). Ganggang merah dapat dimanfaatkan oleh manusia sebagai bahan makanan dan kosmetika.6) Volvox merupakan Chlorophyta yang berbentuk koloni dan bergerak. 2003) 3. dan berkoloni (Synura).

Protozoa hidup di air tawar (selokan.Bersatunya kedua ujung membran plasma membentuk vakuola. Rhizopoda atau Sarcodina (Berkaki Semu) Rhizopoda adalah Protozoa yang mempunyai alat gerak berupa kaki semu (pseudopodia). air laut. Amoeba Bentuk tubuh Amoeba dapat berubah-ubah. dan penangkap rangsang yang berasal dari luar tubuhnya. Pada keadaan yang tidak menguntungkan. Actinopoda. Protozoa merupakan makhluk hidup bersel satu yang bersifat mikroskopis. permukaan tanah yang lembap. Ia bersel satu dan hidup bebas di tempattempat yang becek. Flagellata dapat hidup bebas di dalam air atau sebagai parasit pada makhluk hidup lain. Entamoeba hystolytica masuk ke dalam usus melalui makanan yang tidak higienis. kista Amoeba akan pecah dan Amoeba akan keluar untuk memulai kembali hidupnya. Kedua sel anak ini akan mengalami pembelahan biner sehingga menjadi empat sel. pengeluaran. dan seterusnya. yaitu Rhizopoda atau Sarcodina (berkaki semu). alat gerak. Untuk mencegah diare. Amoeba yang hidup sebagai parasit ini biasa disebut dengan Entamoeba. parit. ada Entamoeba ginggivalis yang hidup sebagai parasit di dalam rongga mulut yang dapat menyebabkan penyakit radang dan gusi berdarah. Kemudian. dan Sporozoa (penghasil spora). lalu diikuti oleh pembelahan sitoplasma. Dengan kaki semunya. Entamoeba yang menyebabkan penyakit. Segala aktivitas hidup terjadi di dalam sel itu sendiri. dan waduk). Pada keadaan tertentu. dan sebuah inti sel. (Syamsuri. Pembelahan inti tersebut menimbulkan lekukan yang sangat dalam yang lama-lama akan putus sehingga terjadilah dua sel anak Amoeba. Penyakit yang disebabkan oleh Entamoeba histolytica adalah diare. hindarilah memakan makanan yang tidak bersih dan tidak ditutup. Amoeba dapat menangkap dan mengambil makanan. delapan sel. (Syamsuri. membran plasma bergerak mendekati dan mengikuti kaki semu mengelilingi makanan. Salah satu contoh Rhizopoda adalah Amoeba sp. 2004) 2. seperti Entamoeba histolytica. secara aseksual dilakukan dengan membelah diri dan secara seksual dengan konjugasi. Isi sel telah dilindungi oleh membran sel dan membran plasma yang sekaligus berfungsi sebagai pengatur pertukaran zat. Selain Amoeba.Protozoa merupakan makhluk hidup yang menyerupai hewan. Makanan dicerna di dalam vakuola makanan. Selain Entamoeba histolytica. Agar tidak sampai terserang. sari makanan diedarkan ke seluruh tubuh. Ada Amoeba yang dapat hidup bebas dan ada pula yang hidup sebagai parasit pada hewan atau manusia. Mula-mula kaki semu (pseudopoda) dijulurkan ke arah makanan lalu mengelilingi makanan tersebut. Protozoa dapat membentuk dirinya menjadi kista. enam belas sel. mungkin tidak ditutup. Dari sini. Foraminifera. bahkan dapat mencapai hati. yang dibahas dalam bab ini hanya empat filum. sitoplasma bagian dalam yang encer (endoplasma). Ciliata (berambut getar). terkena debu. Entamoeba ginggivalis ini dapat hidup di sela-sela gigi yang kotor. kista Amoeba mungkin saja tertinggal di dalam tubuh. Kelompok Flagellata atau Mastigophora (Bercambuk) Flagellata adalah Protozoa yang mempunyai alat gerak berupa bulu cambuk (flagela). berparasit dalam usus manusia. Amoeba dapat berkembang biak dengan pembelahan biner tanpa melalui tahap-tahap mitosis. sungai. ada beberapa Protozoa yang termasuk dalam Rhizopoda. Flagellata merupakan nenek moyang dari hewan dan tumbuhan. Trypanosoma gambiense dan 120 . yaitu Foraminifera dan Arcella. Jika keadaan luar telah membaik. pertukaran gas. gosoklah gigi setelah selesai makan dan sebelum tidur. atau dihinggapi lalat. 2004) 1. Misalnya. berair. seperti Trypanosoma dan Trichomonas. Pembelahan dimulai dari membelahnya inti sel menjadi dua. Sel berisi sitoplasma yang terdiri dari sitoplasma bagian luar yang kental (ektoplasma). Protozoa dibagi menjadi enam filum. dan mengandung makanan. yaitu sebagai berikut. Akan tetapi. rendaman jerami. Keduanya merupakan Rhizopoda yang diselimuti oleh cangkang. dan di dalam tubuh makhluk hidup lain atau di dalam jasad yang mati. Kita harus berhati-hati terhadap penyakit ini karena meskipun sudah sembuh. Protozoa dapat berkembang biak dengan cara aseksual dan seksual. Sisa makanan yang berupa cairan dikeluarkan melalui vakuola berdenyut. Flagellata atau Mastigophora (bercambuk). Amoeba dapat membentuk dirinya menjadi kista.

vakuola makanan (pencerna makanan). Cara reproduksi jamur lendir hampir sama dengan Fungi. Plasmodium berkembang biak secara aseksual dengan pembentukan spora terjadi di dalam tubuh manusia dan berkembang biak secara seksual dengan pembentukan gamet. Rambut getar ini adalah bulu-bulu halus yang melekat pada membran sel. sitoplasma. Trichomonas vaginalis yang menyerang vagina dapat menyebabkan keputihan. Ciliata. Ketika lalat menggigit. Pada saat bergetar. Bentuk selnya seperti sandal. 2004) 4. Makanannya adalah sel darah merah. Contoh Ciliata yang hidup bebas adalah Paramaecium sp. dan Vorticella. serta vakuola kontraktil (pengeluaran zat sisa). Protista Menyerupai Jamur Protista yang menyerupai jamur ini mempunyai struktur tubuh dan cara reproduksi yang tidak sama dengan kelompok Fungi. Ada juga Ciliata yang hidup di air tawar. Mereka biasa hidup di rawa. Babesia bigemina menyebabkan penyakit demam Texas dan Theileria parva menyebabkan penyakit demam Pantai Timur (Afrika). T. tidak berubah-ubah. dan tempat-tempat berair yang banyak mengandung bahan organik. makhluk hidup dapat bergerak bebas ke segala arah di dalam air. Sporozoa hidup sebagai parasit pada makhluk hidup lain. Sporozoa tidak memiliki alat gerak. Pada saat ini. yaitu Stylonichia (hidup di perairan yang banyak mengandung sampah organik).. sedangkan sisa makanan berupa cairan dikeluarkan melalui vakuola berdenyut yang terletak di kedua ujungnya. sedangkan yang hidup berparasit adalah Nyctoterus ovalis. hidupnya menumpang di usus kecoa. sawah. ukuran kira-kira 250 mikron. Paramaecium caudatum dapat berkembang biak secara aseksual dengan membelah diri menjadi dua anak sel (pembelahan biner) dan secara seksual dengan konjugasi. 2004) C. tetapi tidak dapat dikelompokkan dalam kingdom Fungi karena gerakan pada fase aseksualnya lebih mirip dengan Amoeba. Penyerapan sari makanan terjadi di dalam sitoplasma. 121 . Sisa makanan padat dikeluarkan melalui membran plasma. Dengan menggunakan rambut getar.Trypanosoma rhodiense menyebabkan penyakit tidur yang disebarkan oleh gigitan lalat Tse-tse. Makanan yang terkumpul akan masuk dalam sitofaring (kerongkongan sel) lalu masuk ke dalam vakuola makanan untuk dicerna dan diedarkan ke seluruh tubuhnya. (Syamsuri. rambut di sekitar mulut sel akan bergetar pula. (Syamsuri. Contoh makhluk hidup yang termasuk dalam Sporozoa adalah Plasmodium malariae dan Plasmodium vivax. Evansi merupakan penyebab penyakit sura pada hewan. Contoh lainnya adalah Babesia dan Theileria. cruzi merupakan penyebab penyakit nagana pada sapi dan kerbau. lalat juga mengeluarkan air liur yang mengandung Trypanosoma untuk mencegah pembekuan darah. Peleburan gamet jantan dan gamet betina terjadi di dalam tubuh nyamuk Anopheles. 2004) 3. Kelompok Sporozoa (Penghasil Spora) Tidak seperti Rhizopoda. Gerakan cilia sulit diamati oleh mikroskop karena gerakannya sangat cepat. T. Plasmodium hidup sebagai parasit pada tubuh manusia yang menyebabkan penyakit malaria. (Syamsuri. Gerakan Paramaecium caudatum dilakukan dengan menggetarkan cilianya. mempunyai sitostom (celah mulut) pada membran plasma. dan Flagellata yang telah mempunyai alat gerak. Pada Trichomonas terdapat tiga flagel atau lebih. Stentor (hidup di perairan sawah yang mengandung bahan organik). dan selnya diselubungi oleh pelikel. Paramaecium caudatum Paramaecium caudatum adalah Ciliata yang hidup bebas. terjadilah aliran keluar masuk air pada mulut sel. Sel berisi dua inti sel yang terdiri atas inti kecil (mikronukleus) dan inti besar (makronukleus). Penularan malaria terjadi melalui gigitan nyamuk Anopheles betina. Bentuk tubuh Ciliata adalah oval. Konjugasi didahului dengan pertukaran inti antara dua individu lalu berpisah dan masing-masing membelah menjadi dua individu. Air yang masuk dan keluar mulut sel banyak mengandung bakteri atau bahan organik atau bahan makanan lainnya yang tertambat atau terkumpul di dalam mulut sel. Kelompok Ciliata (Berambut Getar) Ciliata adalah Protozoa yang mempunyai alat gerak berupa rambut getar (cilia). Ciliata mendapatkan makanan dengan mulut sel. Didinium (hidup di perairan yang mengandung Protozoa).

dan di hutan basah. H. Pada saat Plasmodium membesar dan inti sel membelah sel individu tetap terpisah saat bergabung membentuk pseudoplasmodium. infestans (kentang). dan c. Jamur lendir hidup di batang kayu yang membusuk. Jamur ini merupakan saprofit pada hewan air yang telah mati. . Contoh Oomycota adalah Phytophthora. Sporangium yang masak 122 . Fase vegetatif Plasmodium bergerak amoeboid mengelilingi dan menelan makanan berupa bahan organik. Spora yang dihasilkan oleh zigot berdinding tebal yang berfungsi sebagai pelindung. tanah lembap. 1982) b. kayu lapuk. dan Pythium. dan P. 2003) Jamur lendir (Mycomycota) dibedakan menjadi dua tipe. Jika telah dewasa. (Timotius. Pada tingkat dewasa. Saphrolegnia. (Prawirohartono. Pencernaan makanan yang dilakukan pada fase vegetatif (aseksual) dilakukan menyerupai Amoeba. Sel-sel gamet ini bersifat haploid dan akan melakukan singami atau peleburan dua gamet dengan ukuran yang sama dan tidak dapat dibedakan antara sel jantan dan betina yang akan menghasilkan zigot. 2003) 2. bersifat uniseluler ataupun multiseluler. kotak spora ini akan pecah dan mengeluarkan spora. P. spora akan tumbuh menjadi hifa baru. spora yang tertinggal akan membentuk Amoeba baru dan siklus akan berulang. Sisa yang tidak dicerna ditinggal sewaktu plasmodium bergerak. Plasmodium akan berhenti bergerak dan membentuk tubuhnya yang mengandung spora reproduksi.Semetara itu. Filum Jamur Air (Oomycota) Oomycota dapat hidup di air atau tempat-tempat lembap dan mempunyai oospora sebagai penghasil spora. mempunyai banyak inti yang terdapat dalam benang-benang hifa yang tidak bersekat. Jamur lendir dapat berkembang biak dengan cara vegetatif dan generatif. (Prawirohartono. Spora yang berkecambah akan membentuk sel gamet yang menyerupai Amoeba. Jamur yang hidup secara parasit. b. Plasmodium membentuk sporangium (kotak spora). yaitu Acrasiomycota dan Myxomycota. Jamur ini dikatakan mempunyai spora kembara dimorf. biasa hidup di hutan-hutan basah. struktur tubuh vegetatif menyerupai Amoeba. e. Saprholegnia mempunyai miselium dan hifa sebagai alat reproduksi. c. berbentuk seperti lendir (plasmodium). atau sampah basah. misalnya. Saat makanan berkurang zat kimia yang dikeluarkan oleh Amoeba akan bergabung membentuk Plasmodium. berkembang biak secara aseksual dengan pembentukan zoospora. jamur air lebih menyerupai ganggang pada struktur molekulnya. Plasmodium akan bergerak ke arah cahaya. P. Pada saat ada makanan. Zoospora ini dilengkapi dengan alat berenang berupa dua buah flagel. Jamur ini memiliki ciriciri sebagai berikut: a. Filum Jamur Lendir (Mycomycota) Ciri-ciri jamur lendir adalah sebagai berikut: a. 1982) a. berinti banyak. dan dapat bergerak bebas. Setelah matang. bentuk tubuh seperti lendir (plasmodium) yang merupakan massa protoplasma tidak berdinding. Phytophthora adalah jamur karat putih yang dapat hidup secara saprofit atau parasit. tanah lembap. b. setiap intinya tidak dipisahkan oleh adanya sekat. kayu lapuk. Myxomycota (Jamur Lendir Tidak Bersekat) Myxomycota merupakan jamur lendir yang tidak bersekat. H. K. d. batang kayu yang membusuk. dinding sel berupa selulosa. Pada saat kondisi menguntungkan. Makanan dicerna dalam vakuola makanan. (Prawirohartono. 2003) 1. tetapi cara berkembang biaknya menyerupai Fungi. Jamur ini berinti banyak. (Timotius. palmifera (kelapa). Nicotin (tembakau). Acrasiomycota (Jamur Lendir Bersekat) Acrasiomycota dinamakan juga jamur lendir bersekat. K. hanya saja tidak mengandung klorofil. berkembang biak secara aseksual dan seksual. Plasmodium akan membentuk kotak spora seperti pada Fungi. sampah basah. Pada kondisi tertentu. bersel satu atau bersel banyak.

Singami adalah peleburan dua gamet yang bentuk dan ukurannya sama (yang tidak dapat dibedakan jantan dan betinanya). Myxomycota yang sedang bergerak dapat seukuran buah anggur. dalam konteks industrial mikrobiologi. Selain dari penggunaannya untuk budidaya sel. DESAIN DAN KONSTRUKSI FERMENTOR Fermentor kebanyakan didesain untuk menjaga konsentrasi biomass tetap tinggi. sel – sel yang ada berpencar dengan bebas dalam media dan berinteraksi sebagai bentuk tersendiri. yaitu laju agitasi. 1982) FERMENTATION SYSTEMS Fermentasi pada mikrobiologi memilki dua arti yang berbeda. dimana prosesnya dilakukan oleh enzim-enzim dalam mikroba atau enzim murni yang diisolasi. Pada fermentor ada parameter yang harus dikontrol. Sebaliknya. fermentasi mengacu pada energi yang menghasilkan senyawa organik di mana bertindak sebagai pendonor elektron dan akseptor. yaitu pada sel vegetatif dan spora. di daun. (waites. (waites.2001) Fungsi utama bioreaktor adalah memberikan lingkungan terkontrol bagi pertumbuhan mikroorganisme atau campuran tertentu mikroorganisme untuk memperoleh produk yang diinginkan. suhu. Fermentor merupakan system tertutup untuk reaksi biologis dari proses bioteknologi.tetapi tidak dapat dibagi menjadi beberapa sel-sel terpisah. . kontrol apa yang akan dilakukan bergantung pada proses tertentu. Saat Plasmodium membesar. Plasmodium mempunyai banyak inti. dalam sebuah alat biasanya sebagai fermentor atau bioreaktor.  Bioreaktor hendaknya mencegah kontaminasi produksi dari lingkungan pada kultur sambil mencegah pelepasan kultur ke lingkungan.2001) Alat yang biasa digunakan adalah fermentor (bioreactor) yaitu suatu unit alat yang digunakan untuk melangsungkan proses biokimia dari suatu bahan baku menjadi produk yang diinginkan. mengacu pada kuantitas pertumbuhan besar sel aerobik atau anaerobik. Fermentor yang digunakan berdasarkan kapasitasnya dibagi menjadi dua. transfer oksigen. bergerakberpindah tempat di tanah atau sepanjang dasar hutan. Meskipun media dalam bentuk padat sering digunakan tetapi kebanyakan fermentasi menggunakan media cair. Fermentasi juga diklasifikasikan sebagai proses dalam fasa biologi. (Timotius. yaitu skala laboratorium dan skala industry. Sistem fermentasi ini mungkin terlihat mudah tetapi dalam kenyataanya fermentasi menggunakan nutrisi dan oksigen bisa dikembangkan.2001) Pada penundaan pertumbuhan mikroorganisme. kayubusuk untuk memakan bakteri. H. K.akan pecah dan spora tersebar dengan bantuan angin. dan objek yang lebih spesifik untuk dihasilkan. Kedua. Pertama dalam metabolisme. massa berinti banyak yang disebut Plasmodium (jangan dikacaukan dengan plasmodium penyebab malaria). intinya membelah. kemudian sel gamet ini melakukan singami. pH. (waites. Jenis – Jenis Fermentor 123 . sel-sel individu tetap terpisah saat mereka bergabung membentuk pseudoplasmodium atau massa multiseluler. Pada Myxomycota. dan bahan baku. pada Acrasiomycota. Hasil peleburan berupa zigot dan zigot tumbuh dewasa. dimana yang penting untuk banyak proses fermentasi yang ingin dilakukan. Dalam skala laboratorium digunakan dalam botol erlenmeyer (volume 50-2000 ml dengan pengisian maksimum 20 %).  Bioreaktor sebaiknya memiliki instrumentasi untuk pemeriksaan agar terjadi pengawasan proses optimum. Spora yang berkecambah akan membentuk sel gamet yang bersifat haploid.

Menurut Pujaningsih (2005). Udara dipaksa masuk melewati pipa sehingga udara dapat terpancar keatas dan medium ikut terbawa. Bioreaktor dengan pancaran udara (Airlift bioreactor) terdiri dari dua kolum yang dimasukkan ke dalam kolum yang lain. Menurut Andhiko (2008). Bubble column bioreactor. sistem kontrol suhu. mamalia. b. Kinetika pertumbuhan sel dan pembentukan produk.2001) A. fermentor ini dikelompokkan atas tiga jenis: a. Loop reactor. PERANCANGAN FERMENTOR Rancangan dan kontroksi bioreaktor perlu diperhatikan tentang bejana harus dapat dioperasikan dalam jangka waktu lama. Jet loop reactor . c. Terdiri dari tabung panjang dengan beberapa sparger di bagian dasarnya. Merupakan biorekator yang paling lazim digunakan di berbagai industri fermentasi. Merupakan bioreaktor paling sederhana. 3. Merupakan reaktor kolom di mana percampuran dan sirkulasi diinduksi dengan alat-alat tertentu. 3. Berdasarkan penggunaan alat tersebut. macam-macam reactor adalah sebagai berikut : 1. serasi dan afitasi memadai untuk kelangsungan proses metabolik mirkobia. bejana harus dapat dicuci dan disterilisasi fasilitas sampling harus ada konsumsi tenaga serendah mungkin. Karakteristik stabilitas genetis dr sistem sel Desain peralatan yg aseptis Pengawasan lingkungan bioreaktor (makro dan mikro) Implikasi desain bioreaktor pada pemisahan produk menghilir Modal dan biaya operasi bioreactor Potensi pengembangan desain bioreactor 124 .Kriteria Dasar Dalam Desain Bioreaktor:           Karakteristik mikrobiologi dan biokimia dr sistem sel (mikrobia. Pro peller‟loop reactor. Berdasarkan proses penyebaran organisme dan media dalam bejana mengelompokkan jenis fermentor ke dalam 3 grup : 1. 2. Air lift loop reactor . Karakteristik massa dan panas bioreaktor. bahan kontruksi murah dan evaporasi diusahakan tidak terlalu besar. Karakteristik hidrodinamik bioreaktor. (waites. Grup ini termasuk stirred tank reactor. tumbuhan). Bioreaktor terkemas padat diisi dengan bahan padatan yang dapat menjaring mikrobia masuk kedalamnya. Reaktor dengan agitasi internal. Bioreaktor kolom gelembung (Bubble column bioreactor) udara dialirkan melalui sparger di dasar bejana. pH dan penambahan nutrien. Bioreaktor tangki adukan ( stirres tank bioreactor) 2.

Konstruksi Fermentor. E.  Dikonstruksi dari bahan yang murah. Sistem stirer dari fermenter & lubang pemasukannya cukup.  Semua bagian sistem harus dapat disterilisasi secara tersendiri. Evaporasi diusahakan tidak terlalu besar. mempunyai geometri yang sama baik untuk laboratorium maupun skala industri. Konstruksi fermentor aerobic Tebuat dari baja anti karat.     Fermentor anaerobik memerlukan alat khusus kecuali untuk menghilangkan panas.  Gunakan katup-katup yang mudah dibersihkan maupun disterilkan. karena bentuk demikian dapat mengendur akibat dari gerakan/fibrasi alat dan kenaikan suhu. Sistim kontrol temperatur. Syarat Fermentor adalah sebagai berikut :  Tidak boleh ada hubungan antara bagian sistem yang steril dengan non-steril. Bejana harus dapat dicuci. Aerasi dan agitasi cukup memadai untuk kelangsungan proses metabolik mikrobia. sehingga tidak mengalami stress mekanik akibat terlampau rapat. KONTROL KIMIA DAN KONDISI FISIK Konsep dasar dari Bioreaktor adalah untuk pemisahan. D. Bahan fermentor harus kuat utk sterilisasi berulang kali pd tekanan uap tinggi.  Pemeriksaan secara visual dari medium & kultur hrs tersedia. pH harus ada. misalnya katup bola atau diafragma. Desain Bioreaktor Harus Memperhatikan Beberapa Hal Yaitu :        Bejana dapat dioperasikan dalam keadaan aseptis untuk jangka waktu lama. Karakteristik Fermenter. dengan menggunakan pembatas antara lingkungan dalam fermentasi dengan lingkungan luar. dibersihkan dan mudah dipelihara. shg tdk menghambat pertumbuhan mikroba. Bahan fermentor harus tidak beracun & tidak mudah terlarut.  Bila mungkin seluruh konstruksi alat dilas. Berupa silinder besar. Fermentor aerobik memerlukan alat untuk mengaduk dan memberikan aerasi cukup. Konsumsi tenaga serendah mungkin.  Hindari ruang-ruang perangkap serta bentuk leher.B.  Setiap hubungan/kelep ke bejana harus dapat disterilkan dengan uap. C. tertutup di bagian atas atau bawah. Fasilitas untuk sampling harus ada. dan memungkinkan kontaminasi. dibuat dari bahan transparan.  Tekanan dalam fermentor harus tetap positif sehingga kalau ada kebocoran akan mengarah ke luar.  Hindari kelep-kelep / penghubung bentuk gelangan.     Bahan fermentor dibuat tahan karat untuk mencegah kontaminasi logam/ion selama proses. Apapun yang keluar ataupun masuk pada proses 125 . dilengkapi pipa-pipa. karena ruangan seperti itu sulit untuk dibersihkan.

Pada fasa gas di dominasi oleh oksigen dan karbon dioksida. Perpindahan panas sangat diperlukan pada proses sterilisasi dan penjagaan temperatur selama operasi terjadi. tetapi berat dari air (bagian extrinsif) adalah additive pada 45 gr. dan input yang lebih jauh berguna untuk fermentasi.2001) Tingkat agitasi mempunyai pengaruh yang nyata terhadap efisiensi transfer oksigen di dalam fermentasi dengan pengadukan mekanik. Stirred Tank Reactors(STRs) STRs secara mekanis menggerakkan agitator atau impeller dalam sebuah wadah silinder baffle. tekanan dan panas yang tepat. (waites. Perubahan fasa dari gas menjadi fasa cair meningkat dengan agitasi. hasilnya didapatkan air dengan temperature (bagian intensif) adalah 30ºC dan bukan 60ºC. Pada fermentasi ada bagian yang intensif. oksigen dan energi yang ada di sistem pada saat awal operasi.Agitasi memperkecil tebal lapisan film pada permukaan antar fase gas dan cairan karena sifat alir fluida yang menjadi tubulen. Fasa padat dibuat oleh sel dan kemungkinan terdapat substrat padat. yaitu temperature. Ada bagian extrinsif seperti massa. 1.Agitasi menyebabkan waktu tinggal gelembung udara di medium menjadi lebih lama.Agitasi menyebabkan ukuran gelembung udara menjadi lebih kecil sehingga luas permukaan untuk terjadinya transfer oksigen menjadi lebih besar. Dengan informasi yang didapat dapat digunakan untuk perhitungan matematik dan pemodelan pada computer yang kemungkinan bisa digunakan pada computer dan kontrol fermentasi selanjutnya.2001) Agitasi fermentor membutuhkan input energi dan ada 3 prinsip mekanisme yang biasanya digunakan. Tingkat agitasi dapat diukur berdasarkan tenaga yang dikonsumsi oleh motor yang menggerakkannya. sehingga dengan hubungan-hubungan yang diperoleh tersebut dapat digunakan untuk memperkirakan tenaga yang dibutuhkan dalam desain dan scale-up. apalagi ketika digabungkan dengan penetapan pada termodinamik ( perpindahan panas. . Pada fasa cair terkandung larutan nutrisi dan metabolit. 126 . Beberapa upaya telah dilakukan untuk mencari hubungan-hubungan antara konsumsi tenaga yang diperlukan dengan KLa. nitrogen. Normalnya pelat baffle dipasang 4 -6 buah pada dinding wadah untuk membantu proses pencampuran dan perpindahan panas secara turbulen.2001) Kunci pada bagian exrinsif adalah adalah pada energy dan massa. . (waites. entropi dan energy dapat diseimbangkan. Sistem ini harus menyediakan alat analitik yang baik.fermentasi dapat dimonitor.Agitasi mencegah bergabungnya kembali gelembung-gelembung udara yang sudah ada.(waites. Pencampuran yang efisien sangat penting untuk perpindahan oksigen pada fermentasi aerob. . densitas. Bagian ini memiliki jumlah tersendiri pada system fermentasi.2001) Agitasi Agitasi pada fermentasi sel tersuspensi adalah proses yang dilakukan dengan keinginan untuk mencampur 3 fasa yang berbeda dengan menggunakan fermentor. Proses pencampuran seharusnya terjadi pada kondisi produksi secara homogen dan meningkatkan fungsi nutrisi. volum. karena sebagai mikroorganisme hanya dapat mengambil oksigen pada saat fasa cair. agar tidak terjadi formasi vortex dan mengurangi “dead space”. hal ini diakibatkan karena jumlah atom karbon. Baffle selalu berupa pelat datar dipasang secara vertical dengan ketebalan 1 -10 diameter. dan semuanya dikalkulasi pada akhir proses. Agitasi sangat membantu proses transfer oksigen di dalam fermentor dengan cara sebagai berikut: . konsentrasi. (waites. gas dan perpindahan panas. Contohnya jika 10gr air dengan suhu 30ºC ditambahkan pada 35 gr air dengan suhu 30ºC. rheologi dan temperature) dan laju reaksi (produksi biomass).

tetapi ini juga menghasilkan kekuatan potong yang besar yang dapat merusak beberapa sel. Airlift Fermenter Sistem ini sangat cocok untuk proses aerobik seperti produksi biomassa mikroba.Pengurangan konsumsi energi .Produktivitas yang lebih tinggi . Keefektifan dari agitasi tergantung pada desain dari pisau impeller.Sebagai bagian dari perlindungan lingkungan . dan melepaskan mikroorganisme serta hasilnya ke lingkungan. dibutuhkan 2 atau 3 pelindung untuk meminimalkan adanya kontaminasi. Untuk menghindari adanya kontaminasi. yang secara signifikan meningkatkan sirkulasi di dalam reaktor dengan mengorganisir konsentrasi oksigen terlarut dan substrat yang dapat disesuaikan sepanjang silinder gerakan agar tidak mengganggu pertumbuhan mikroba karena oksigen tidak mencukupi dan kelebihan gula. Hal ini didasarkan pada proses yang dirancang setelah penelitian intensif dan pengembangan. impeller dipasang pada motor external dimana sebagai pengendali pada sistem pengadukan. banyal sel hewan dan tumbuhan mudah terpotong dan pengadukan berlebihan mebuat hasil sel menjadi kacau. STRs harus dibuat pada turbulen yang tinggi untuk menjaga kecepatan dari perpindahan. Cairan-dinamis kondisi dalam cairan fermentasi sangat homogen. Sebagai contohnya.Tidak ada tindakan geser .2001) Keuntungan: . ini biasanya sebagai jalur yang potensial untuk kontaminasi.(waites. sebuah batang pemisah dipasang pada fermenter sampai pada pelindung aseptik.(waites. kecepatan dari proses agitasi dan kedalaman dari cairan.Metode kompak konstruksi 127 .Pada wadah. Dalam hal ini. Untuk proses fermentasi tertentu. Kebanyakan STRs memiliki ratio ketinggian dan diameter 3 : 1 atau 4 : 1. Pada perakitan agitator yang juga terdapat sebuah pelindung.2001) 2. STRs tidak mungkin cocok tanpa dimodifikasi dan pancaran udara kemungkinan besar diperlukan.

ukuran dan geometri wadah.Waktu amortisasi Sangat singkat 3. Pola aliran pada fluida di tangki pengadukan dapat menjadi 2 tipe. serta membantu pengadukan air.2001) Perpindahan Massa Pada perpindahan nutrisi dari fasa larutan menjadi sel – sel microbial selama fermentasi secara relatif tanpa kesulitan sebagagai nutriri biasanya tersedia di kelbihannya. Hydrodynamic mechanism (Deep-jet Fermenter) Mekanisme hidrodinamik menggunakan energy kinetik cairan untuk pencampuran pada fermentor yang diterima menggunakan menggunakan pompa cairan diluar proses sirkulasi dan diinjeksi ulang. Sistem tersebut juga digunakan untuk sterilisasi wadah dan konten sebelum inokulasi.2001) Aerasi dipergunakan pula untuk menghilangkan kandungan gas-gas terlarut. Aplikasi aerasi dalam proses ini dapat memberikan cukup banyak oksigen untuk berlangsungnya reaksi. Oleh karena itu.(waites. yaitu aliran laminar dan turbulen. Proses ini biasanya digunakan pada air tanah yang kebanyakan mempunyai kandungan oksigen terlarut yang rendah.2001) Aerasi Aerasi merupakan salah satu proses dari transfer gas yang lebih dikhususkan pada transfer oksigen dari fase gas ke fase cair. Bagaimanapun. perpindahan oksigen pada fermentasi aerob lebih kompleks. dan banyaknya kekuatan yang digunakan pada sistem. STRs memiliki agitator dengan impeller berlipat agar memberikan pencampuran yang baik pada lingkungan yang homogen. oksidasi kandungan besi dan mangan dalam air. (waites. Fungsi utama aerasi dalam pengolahan air adalah melarutkan oksigen ke dalam air untuk meningkatkan kadar oksigen terlarut dalam air dan melepaskan kandungan gas-gas yang terlarut dalam air. Perpindahan panas utamanya dicapai menggunakan jaket luar di sekitar fasa internal atau menggunakan gulungan internal. aerasi dalam aplikasi ini akan menghasilkan endapan dan meningkatkan konsentrasi 128 .2001) Perpindahan Panas Pada desain fermentor. gulungan dan baffle.Cepat pembersihan tanpa masalah . Penyisihan besi dan mangan. Kontak tidak langsung antara sistem pendingin/pemanas dengan media fermentasi. Panas terkonduksi masuk melewati dinding wadah. Pencampuran gizi dan penukaran gas dengan fermentor sangatlah kompleks. Terbentuknya panas pada fermentasi terutama akibat dari aktivitas metabolis mikroorganisme dan proses mekanisme agitasi. pada kenyataannya kondisi yang tidak seragam terdapat pada wadah dengan kapasitas lebih dari 500 Liter.. Penyisihan besi dan mangan dapat dilakukan dengan proses oksidasi. Walaupun demikian.aliran laminar dan turbulen berkarakteristik dengan tinggi dan rendahnya reynold number. menggunakan injeksi penguap tekanan. Pengontrol otomatis temperature selama fermentasi berhasil terjadi dengan penginjeksi air panas/dingin menuju jaket terluar dan atau gulungan dalam. (waites. Hal tersebut dipengaruhi oleh densitas dari medium dan rheologi. mereduksi kandungan ammonia dalam air dan untuk meningkatkan kandungan oksigen terlarut agar air terasa lebih segar. efisiensi dari perpindahan panas sangat penting pada kontrol temperatur selama operasi penyeterilan dan mempertahankan temperature tetap selama proses fermentasi berlangsung. (waites.

Penyisihan hydrogen sulfide. sedangkan kombinasi gas NH3 dengan asam lemah akan menghasilkan konstanta Henry 15 MPa. Pre-asidifikasi dilakukan dengan menambahkan asam kuat seperti asam sulfat sehingga dicapai pH 5. Hidrogen sulfide adalah senyawa utama penyebab rasa dan bau yang dapat diolah cukup efektif dengan aerasi.(%) 129 . maka proses stripping akan semakin mudah dilakukan. Kombinasi gas H2S dengan asam lemah akan memungkin suhu proses stripping dapat diturunkan hingga suhu dibawah 80 oC.5 ambien 5-15 90-96 Kandungan S2-awal (g/L) Suhu (oC) Kandungan S2. Karbondioksida mempunyai kelarutan yang rendah dalam air. Hal tersebut didasari hasil percobaan bahwa kombinasi gas H2S dengan asam lemah akan menghasilkan konstanta Henry 150 MPa. Kondisi Proses Air Strippping Proses Air stripping 0. Senyawa organic yang bersifat mudah menguap (volatile) dapat disisihkan dengan cara aerasi.akhir (g/L) Efisiensi removal S2. Proses yang terjadi adalah digambarkan seperti persamaan berikut. Ammonia merupakan polutan yang dapat dipisahkan dari suatu limbah cair walaupun seringkali memerlukan pengaturan pH terlebih dahulu. sehingga aerasi sangat efisien dalam penyisihannya. 2 HSNH4 + H2SO4 à (NH4)2SO4 + 2 H2S / Gas H2S bersifat lebih volatile dibandingkan dengan gas NH3. Karbondioksida dapat cepat dihilangkan dengan cara aerasi. Mangan sering kali tidak dapat teroksidasi pada pH normal. Tujuan pre-asidifikasi adalah untuk mendisosiasi ammonium dalam bentuk garam. Tingginya konsentrasi karbondioksida dalam air dapat meningkatkan pemakaian bahan kimia untuk keperluan pelunakan. khususnya jika digunakan menara aerator. 1995) Tabel 1.5-6. 1995) AIR STRIPPING Proses air stripping biasanya diawali dengan proses pre-asidifikasi. Kondisi proses stripping yang dapat dijadikan acuan diperlihatkan pada Tabel 1. Proses pemisahan (stripping) lebih mudah dilakukan pada suhu tinggi. Telah disebutkan diawal bahwa semakin tinggi kostanta Henry. Peningkatan pH sampai 8. Hal tersebut sejalan dengan koefisien hukum Henry dimana koefisian akan meningkat seiring dengan meningkatnya suhu. (Berne dan Cordonnier. (Berne dan Cordonnier. Penyisihan senyawa organic volatile.2-0. Penyisihan karbondioksida.oksigen terlarut.5 dapat memperbesar oksidasi mangan. Proses ini biasanya diterapkan pada pelunakan air tanah yang umumnya mempunyai kandungan karbondioksida yang tinggi. Mekanisme pengolahannya adalah terjadi oksidasi hydrogen sulfide menghasilkan air dan belerang bebas. Proses pemisahan gas NH3 secara cepat umumnya dilakukan pada suhu 105 oC.

Apa pengaruhnya aliran kultur yang terlalu cepat dalam fermentor proses agitasi? (Queen Sitanggang 115061100111015) Jawab: Keefektifan dari agitasi tergantung pada desain dari pisau impeller. mikroba dikatakan akan keracunan bila mendapat oksigen. Kesulitan pada deep jet adalah desain alat yang rumit sehingga untuk cara pembersihannya lebih sulit dari alat yang lain. Pada proses fermentasi. Tolong dijelaskan proses yang terjadi dalam deep-jet fermentor! (Rizka Dwi Octaria 115061101111017) Jawab: Mekanisme hidrodinamik menggunakan energy kinetik cairan untuk pencampuran pada fermentor yang diterima menggunakan menggunakan pompa cairan diluar proses sirkulasi dan diinjeksi ulang. Hal tersebut dipengaruhi oleh densitas dari medium dan rheologi. Walaupun demikian. pada kenyataannya kondisi yang tidak seragam terdapat pada wadah dengan kapasitas lebih dari 500 Liter. ukuran dan geometri wadah. 4. lalu bagaimana peran sparger dan sterile air pada fermentasi anaerob? Fermentasi anaerob kan tidak 130 30-40 . kecepatan dari proses agitasi dan kedalaman dari cairan. banyal sel hewan dan tumbuhan mudah terpotong dan pengadukan berlebihan mebuat hasil sel menjadi kacau. STRs harus dibuat pada turbulen yang tinggi untuk menjaga kecepatan dari perpindahan. tapi ada fermentasi anaerobik itu ada pemasukan udara atau tidak?Kalau prosesnya anaerobik. 1995 DAFTAR PERTANYAAN BESERTA JAWABAN 1. yaitu aliran laminar dan turbulen. Kebanyakan STRs memiliki ratio ketinggian dan diameter 3 : 1 atau 4 : 1. Jadi apakah mikroba tidak bernafas? (Maratus 115061100111019) Jawab: Pada proses fermentasi yang dijelaskan adalah aerob. 3.40-80 V udara / V air 2-3 Tinggi kolom packing (m) Percolation velocity (m3/ jam. itu maksudnya apa? Memang fermentor lainnya ada masalah dalam pembersihan? Padahal proses fermentasi tadi dikatakan steril. STRs memiliki agitator dengan impeller berlipat agar memberikan pencampuran yang baik pada lingkungan yang homogen. Pola aliran pada fluida di tangki pengadukan dapat menjadi 2 tipe. 2. 5.aliran laminar dan turbulen berkarakteristik dengan tinggi dan rendahnya reynold number. dan banyaknya kekuatan yang digunakan pada sistem. Sebagai contohnya. Pencampuran gizi dan penukaran gas dengan fermentor sangatlah kompleks. (Winda Fauzi Istiqomah 115061101111003) Jawab: fermentor airlift ini wadahnya mudah dibuka serta didalamnya tidak terlalu banyak alat seperti pada STRs yang didalamnya ada alat pengaduk. tetapi ini juga menghasilkan kekuatan potong yang besar yang dapat merusak beberapa sel. Tadi dijelaskan pada airlift fermentor mempunyai keuntungan cepat pembersihan tanpa masalah. sebelumnya telah dijelaskan oleh kelompok sebelumnya bahwa bakteri anaerob tidak memerlukan oksigen untuk berespirasi sehingga saat proses fermentasi menggunakan bakteri anaerob tidak dialiri oksigen. Dalam hal ini. STRs tidak mungkin cocok tanpa dimodifikasi dan pancaran udara kemungkinan besar diperlukan. STR itu fermentor untuk fermentasi aerob atau anaerob? Kalau bisa digunakan untuk keduanya. m2) Sumber: Berne dan Cordonnier. prosesnya itu aerobik atau anaerobik? Yang dijelaskan tadi pada fermentor ada pemasukan udara.

Buffle terbuat dari bahan apa? Apakah ada spesifikasi tertentu tentang bahan-bahan yang digunakan untuk buffle? Misalnya harus kuat. (Inggit Kresna Maharsih 115061100111003) Jawab: Baffle selalu berupa pelat datar dipasang secara vertical dengan ketebalan 1 -10 diameter. jadi dapat dinyatakan bahwa mikroba anaerob benar akan mati bila masuk ke dalamnya. atau sebagainya. 6. 12. 8. reactor tersebut menggunakan media sponge filter yang berfungsi sebagai tempat melekatnya mikroorganisme. Nutrisi yang digunakan meliputi makro dan mikro karena 131 . apa tujuannya aliran secara turbulen? Kenapa jenis alirannya berbeda dengan fermentor lain? (Alfonsina 115061100111027) Jawab: Deep jet fermentor adalah salah satu alat dengan menggunakan mekanisme hidrodinamik. Untuk fermentor anaerob itu sendiri contohnya pada pembuatan etanol. Kalau mikroba anaerobic desain fermentornya bagaimana? Apa perbedaanya dengan desain fermentor untuk aerob? (Dhanang Edy Pratama 115061101111007) Jawab: Proses anaerobic yang terjadi dilakukan di dalam bioreactor anaerob dengan tipe Up-Flow anaerobic filter dengan volume 500L. Diketahui bahwa mikroba berespirasi secara aerob atau anaerob dan dijelaskan pada diagram stirred tank reactor ada udara steril yang masuk. Udara seperti apa yang digunakan pada sparger?serta pada perpindahan massa nutrisi seperti apa yang digunakan?makro apa mikro? (Lilis Triyowati 115061101111009) Jawab: Udara yang digunakan pada STR berupa udara yang steril yang bebas dari kontaminan dan masuk melalui sparger yang dihubungkan dengan selang. feed batch. BagaimPada deep-jet bagaimana cara menghilangkan kontaminan pada system penggeraknya? Menggunakan apa? (Sharfina Widyaningrum 115061105111003) Jawab: pada deep jet ini ada pompa untuk mengalirkan hasil fermentasinya. maupun continous? Dan apa dampak dari produk yang dihasilkan? (Freshsya Zatalini 115061100111003) Jawab: Kelompok kami tidak membahas fermentor dengan system baych. terdapat definisi yang lebih jelas yang mendefinisikan fermentasi sebagai respirasi dalam lingkungan anaerobic dengan tanpa akseptor elektron eksternal. 9.membutuhkan oksigen? Tapi kalau STR digunakan hanya untuk fermentasi aerob. lalu fermentor seperti apa yang biasa digunakan untuk fermentasi anaerob? (Dewi Nugrahani 115061100111001) Jawab: STR digunakam untuk aerob sedangkan Fermentor yang digunakan dalam produksi etanol dengan bahan baku gula biasanya mengunakan fermentor anaerob. Mikroba aerob mungkin akan tetap bisa hidup jika udara tersebut mengandung oksigen. feed batch. Normalnya pelat baffle dipasang 4 -6 buah pada dinding wadah untuk membantu proses pencampuran dan perpindahan panas 10. Bagaimana cara menentukan kapan kita menggunakan fermentor dengan system batch. 11. maupun continous karena telah dijelaskan dikelompok selanjutnya. Secara umum. 7.Jelaskan! (Vivi Anita Aprilia 115061107111005) Jawab: Pada prinsipnya STR adalah fermentor aerob. deep jet fermentor juga menggunakan aliran laminar dimana harus disesuaikan dengan reynould number. akan tetapi bagaimana untuk mikroba anaerob yang notabene tidak dapat hidup jika ada oksigen. untuk adanya kontaminan bisa dilakukan sterilisasi pada alat menggunakan udara bertekanan. Pada deep-jet fermentor.

Fermentasi merupakan suatu cara untuk mengubah substrat menjadi produk tertentu yang dikehendaki dengan menggunakan bantuan mikroba. Jadi dapat dikatakan pompa tersebut membuat kinerja dari fermentor ini kurang efisien karena harus menggunakan tenaga untuk melakukannya. Istilah ini digunakan untuk menggambarkan aksi dari ragi dalam ekstrak buah atau biji-bijian yang menghasilkan gelembunggelembung gas karbondioksida sebagai akibat dari proses katabolisme anaerob dari gula yang terdapat dalam ekstrak. mikroorganisme tersebut dapat memperoleh sumber nutrisi yang dapat digunakan untuk memperoleh energy dalam rangka pembentukan sel serta melakukan proses biosintesis untuk menghasilkan produk-produk metabolit. 14. Amortisasi adalah penyusutan secara berangsur – angsur pada proses fermentasi. Berikut ini terdapat tabel yang menjelaskan menganai kebutuhan nutrisi bagi 3 jenis mikroorganisme yang berbeda-beda. Idealnya suatu medium fermentasi harus mengandung komponen-komponen yang dapat berperan sebagai pensuplai nutrisi bagi mikroorganisme selama proses fermentasi berlangsung agar mikroorganisme tersebut dapat bekerja secara optimum selama proses fermentasi. 13. Sehingga melalui media fermentasi. Substrat sebagai tempat tumbuh (medium) dan sumber nutrisi bagi mikroba Medium fermentasi memiliki fungsi yaitu untuk menyediakan semua nutrisi yang dibutuhkan oleh mikroorganisme selama proses fermentasi berlangsung. Dalam suatu proses fermentasi memerlukan: 1. Oleh karena itu. BAB II TINJAUAN PUSTAKA II. Apa pengertian amortisasi? dan apa yang dimaksud sebagai bagian dari perlindungan lingkungan? (Ridhani 115061100111009) Jawab: alat dipasang ataupun dibuat dari bahan yang murah harganya dan ramah lingkungan.1 Medium Fermentasi Istilah fermentasi berasal dari bahasa latin fervare yang berarti mendidih. 3. Mikroba sebagai inoculum 2. 132 . karena setiap alat harus ada pengawasannya terhadap lingkungan.mikroorganisme adalah makhluk hidup dan pada dasarnya semua makhluk hidup butuh nutrisi baik makro maupun mikro. Produk-produk tersebut biasanya dimanfatkan sebagai produk minuman atau makanan. suatu medium fermentasi harus mengandung komponen-komponen yang diperlukan oleh mikroorganisme dalam proses fermentasi. Kenapa deep-jet fermentor jarang digunakan? Apa kekurangan dan kelebihannya? ( Pandu Rahmat 115061107111001) Jawab: Deep-jet fermentor jarang digunakan karena pada fermentor ini mekanisme hidrodinamik menggunakan energy kinetik cairan untuk pencampuran pada fermentor yang diterima menggunakan menggunakan pompa cairan diluar proses sirkulasi dan diinjeksi ulang. Tempat (wadah) untuk menjamin proses fermentasi berlangsung dengan optimal.

protein dan urea. 7. a. d. Komponen . nucleo acid. seperti nitrogen. protein. lipids. 4. Hal tersebut dikarenakan ke-dua komponen tadi merupakan kebutuhan dasar yang harus terpenuhi oleh setiap jenis mikroorganisme untuk kelangsungan hidupnya. Selain itu sumber nitrogen organik lainnya yaitu berupa asam amino. Nitrogen organic didapatkan dari berbagai kombinasi hasil samping pertanian. karbohidrat.1. 2. Berdasarkan data pada tabel di atas dapat dilihat bahwa komposisi bagi masing-masing mikroorganisme ( bacteria. 3. c. yeast. 1. 8. seperti kacang kedelai dan ampas biji kapas. yeast. b. Dengan kebutuhan nitrogen bagi mikroorganisme yang harus disuplai pad media fermentasi yaitu sekitar 10-15% dari berat kering sel bakteri. 6. 9. Nitrogen organik Nitrogen merupakan nitrogen yang berasal dari berbagai macam sumber zat organic. kebutuhan dasar lain dari mikroorganisme yaitu air. Dalam hal ini sumber 133 . maupun molds) memiliki prosentase yang berbeda-beda untuk setiap komponen penyusunnya. Namun untuk kandungan karbon dan mineral yang dibutuhkan oleh ke-tiga mikroorganisme tersebut cenderung sama prosentasenya.2 Sumber Nitrogen Fungsi sumber nitrogen dalam media fermentasi yaitu untuk mempercepat pertumbuhan mikroorganisme selama proses fermentasi berlangsung. Sumber : The Internet Journal of Microbiology ISSN: 1937-8289 II. oleh karena nya kebutuhan akan air sebagai sumber nutrisi bagi mikroorganisme sangat penting. dan ash. Selain ke-dua komponen tadi. yaitu nitrogen organik dan nitrogen anorganik. Dimana air merupakan komponen terbesar dalam tubuh organisme yaitu sekitar 80-90%. molds). Sumber nitrogen dapat dibedakan menjadi 2. Hal tersebut dikarenakan mikroorganisme tersebut memiliki sifat fisiologis yang berbeda-beda sehingga kebutuhan akan nutrisinya juga berbeda. 5.komponen penyusun media fermentasi adalah sebagai berikut : Sumber nitrogen Air dan mineral Vitamin Faktor pertumbuhan Prekursor dan Induser Elisitor Inhibitor Modifikasi permeabilitas sel Oksigen Antifoams Animal Colture Media Plant Culture Media Culture Maintance Media Gambar 1 : Tabel Komposisi rata-rata mikroorganisme (bakteri.

Sedangkan yang paling cocok digunakan sebagai sumber nitrogen adalah amonium sulfat dan diamonium hidrogen phosphate (DAHP) karena mudah didapat dan harganya cenderung murah. Untuk komposisi yang tepat dari Corn steep Liqour tergantung pada kualitas jagung sebagai sumber nya serta kondisi pengolahan. gas amonia. roti. bir dan makanan lainnya. Amonium phosphat yang terdapat di pasaran terdapat dua jenis yaitu monobasis dan dibasis. serta mempunyai kelarutan yang tinggi dan mempunyai sifat yang stabil dalam penanganan penyimpanannya. Dalam proses industri. Batas maksimum penggunaan amonium phosphat menurut Peraturan Menteri Kesehatan Republik Indonesia nomor 235/Men. peptones dan soya bean meal.2 – 4. Hal tersebut dikarenakan ke-dua sumber nitrogen tersebut harganya relatif murah dan mudah mendapatkannya. dan tekanan. Hal ini bertujuan untuk meminimalisasikan keracunan dan hal-hal yang buruk bagi pengosumsi. meliputi pH.4.Kes. Seperti contohnya yaitu ketika melakukan proses fermentasi yoghurt. 2. maupun amonium hidroksida.25 bagian untuk setiap 100 bagian berdasarkan berat. Sedangkan Matz (1972) menyatakan bahwa penggunaan amonium phosphat pada pembuatan roti tawar tidak boleh lebih dari 0. Sumber nitrogen yang dapat digunakan dalam proses fermentasi adalah amonium sulfat. Pada proses fermentasi. Corn steep Liqour digunakan untuk produksi antibiotik penisilin pada tahun 1940-an. suhu. ekstrak ragi. vitamin dan mineral. Komposisi pada Corn steep Liqour umumnya mengandung sekitar 4% (b / v) nitrogen. maka nitrogen anorganik tersebut akan mengontrol agar pH selama proses fermentasi berlangsung berkisar antara 4. Corn steep Liqour Corn steep Liqour adalah produk samping yang dihasilkan dari ekstraksi pati dengan menggunakan jagung sebagai komponen pokok. Sedangkan amonium phosphat dibasis atau disebut juga diamonium hidrogen phosphat mempunyai rumus kimia (NH4)2HPO4. Dalam hal ini sumber nitrogen akan membantu proses pertumbuhan dari mikroorganisme yang berperan (jamur) sehingga dapat menjalankan fungsinya secara optimum. Tujuan pengontrolan pH yaitu agar mikroorganisme yang berperan (Lactobacillus bulgaricus dan Streptococcus thermophilus) dapat bekerja secara optimum karena pada pH demikian kerja mikroorganisme tersebut dapat optimum. Sementara nitrogen anorganik dapat bersumber dari amonium sulfat. Amonium phosphat mempunyai kandungan nutrien yang tinggi yaitu fosfor (P) dan nitrogen (N). Amonium phosphat monobasis disebut juga sebagai amonium dihidrogen phosphat yang mempunyai rumus kimia NH4H2PO4. ekstrak khamir dan pepton.nitrogen organic yang paling banyak digunakan yaitu jenis urea dan asam amino. Selain itu dengan penambahan nitrogen anorganik pada medium fermentasi juga berfungsi sebagai pengatur pH pada proses fermentasi. Dalam hal ini nitrogen anorganik bersifat sebagai suplemen untuk mikroorganisme pada proses fermentasi./Per/VI/79 adalah secukupnya untuk jenis makanan soda kue. 1. sumber nitrogen tersebut dapat diproses sehingga menghasilkan produk seperti corn steep liquor. dalam hal ini sudah termasuk berbagai asam amino. Dimana setiap sisa gula yang dihasilkan biasanya dikonversi menjadi asam laktat 134 .

Oleh karena itu dalam formulasi media fermentasi harus dapat diketahui terlebih dahulu 135 . bahan pada dinding sel ragi rusak dan menjadi puing-puing dan dihilangkan melalui Sumber : Waites. sehingga ekstrak yang dihasilkanakan akan terkonsentrasi dengan cepat. Akibatnya bahan.Gambar 3 : Tabel kandungan protein dan vitamin pada ekstrak ragi. Suhu dan pH harus dikendalikan untuk memastikan proses autolisis optimal dan standar. pasta kental atau bubuk kering. Berdasarkan hal di atas diketahui bahwa komposisi pepton berbeda-beda berdasarkan sumber protein penyusunnya. biji bunga matahari. Dalam hal ini komposisi dari pepton bervariasi tergantung pada sumber protein awalnya. vitamin larut air (Tabel 3). dll. Dalam industri pangan. ekstrak yang terbentuk berupa cairan yang mengandung padatan sekitar 50-65%. Misalnya peptones yang berasal dari gelatin. gelatin luas dipakai sebagai salah satu bahan baku dari permen lunak. sehingga dapat menyebabkan sel-sel dalam ragi (yeast) tersebut mati tanpa menonaktifkan enzim. 2. Ekstrak Ragi Ekstrak ragi dapat didapatkan dari Gambar 2 : Tabel komposisi Corn Steep Liquor limbah Sumber : Anon. 1975 toko roti maupun ragi. Dalam hal ini selama proses autolisis harus dapat mengontrol suhu dan tekanan osmotik. dalam hal ini beripa autolysis. atau dapat juga bersumber dari strain seperti Saccaromyches cerevisiae serta strain alternative lainnya yaitu Kluyveromyces marxianus. Corn steep Liqour kadang-kadang dapat digantikan oleh minuman keras yang sama.sebanyak 9-20%. yang ditanamkan pada ragi untuk kemudian dibudidayakan (dikulturkan) menggunakan etanol. Pada proses autolysis ini menggunakan enzim endogen sel. jeli. Peptone Peptone biasanya terlalu mahal digunakan untuk industri fermentasi skala besar. Selain itu ekstrak ragi juga dapat ditemukan sebagai limbah dari kayu dan pengolahan kertas. Selain itu kontrol suhu sangat penting untuk mencegah hilangnya vitamin dari proses autolysis ini. Sedangkan peptones dengan sumber keratin kaya akan kedua-nya. Hal tersebut dikarenakan bahan penyusun pada pepton terdiri atas asam atau hidrolisis enzim dari bahan protein tinggi. Proses autolisis bekerja pada rentang suhu pada 50-55⁰C selama beberapa jam sebelum suhu dinaikkan hingga 75⁰C untuk mengaktifkan enzim. dan beberapa glukosa yang berasal dari karbohidrat yang tersimpan dalam ragi (trehalosa dan glikogen). keratin. gelatin. Ekstrak tersebut mengandung asam amino. namun hampir tanpa kandungan belerang yang mengandung asam amino. kedelai makan. memiliki kandungan prolin dan hidroksiprolin yang sangat besar. sel-sel dalam ragi tersebut akan terganggu oleh adanya proses plasmolisis atau gangguan mekanis lainnya pada proses autolysis ini. 3. Peptone dari sumber tanaman selalu mengandung jumlah karbohidrat yang relatif besar. seperti yang berasal dari produksi tepung kentang. b/ v oleh mikroorganisme yang mengkontaminasinya. Proses mendapatkan ekstrak ragi yaitu melalui proses hidrolisi. yaitu prolin dan sistein. peptida. dan es krim. 1995 penyaringan atau sentrifugasi. namun kekurangan lisin. Ekstrak tersebut digunakan dalam formulasi media fermentasi biasanya berupa garam bebas dengan konsentrasi komponen yang larut dalam hidrolisis sel ragi. seperti : daging.05% (b / v) tidak dapat digunakan dalam proses fermentasi karena memiliki potensial menyebabkan masalah korosi. kacang. Dalam hal ini. Sehingga pada akhirnya. Ekstrak ragi dengan konsentrasi natrium klorida lebih besar dari 0. biasanya tanpa perlu enzim hidrolitik tambahan lainnya. yaitu apabila dia terhidrolis dengan air maka akan menyebabkan asam yang bersifat korosif.

Hal tersebut dikarenakan komponen nya hanya secara perlahan-lahan dilakukan proses metabolisme. urea. 4. 8% senyawa non-protein nitrogen. Gambar 4 : Garfik hasil β-Glukan yang dihasilkan dengan menggunakan medium : pepton. asam glutamate. yang kemudian digunakan untuk mengekstrak sebagian besar minyak. Soya Bean Meal Soya Bean Meal merupakan residu yang tersisa setelah kacang kedelai selesai di proses. dan 136 . sehingga dapat memilih sumber pepton yang sesuai terhadap kebutuhan mikroorganisme nya. Komposisi dari soya bean meal yaitu terdiri dari protein sebanyak 50%. sehingga dapat digunakan untuk menghilangkan kemungkinan represi dari pembentukan produk. II. soya bean meal digunakan dalam proses fermentasi antibiotic. 30% karbohidrat dan minyak sebesar 1%.1 Aplikasi penerapan media dengan komponen sumber Nitrogen dalam industry Pegaplikasinua yaitu dalam proses : Produksi β-Glukan dengan menggunakan mikroorganisme berupa Saccharomyces cervisiae dalam media dengan sumber nitrogen berbeda pada Air-Lift Fermentor.2. Pada proses fermentasi.karakteristik jenis pepton yang dibutuhkan oleh mikroorganisme yang akan digunakan selama proses fermentasi.

termasuk : saat pembelahan dan pertumbuhan sel.3. sulfur dan ion klorida terlalu rendah untuk memenuhi persyaratan ini sehingga dapat ditambahkan sebagai garam yang spesifik.3. mangan. yaitu menambahkan butiran karbon aktif yang berfungsi sebagi filtrate air sehingga antara air dan kolod tersebut dapat terpisah sehingga menghasilkan air yang bebas koloid untuk proses formulasi media fermentasi. Dengan alat yang digunakan untuk sterilisasi adalah autoclave. FeSO4. Hal ini dikarenakan air merupakan komponen dasar yang dibutuhkan mikroorganisme untuk tumbuh selama proses fermentasi berlangsung. Fungsi pemberian mineral dalam media fermentasi yaitu untuk fisiologi mikroorganisme tersebut. Dan untuk medium urea dan DAHP βGlukan yang dihasilkan sama yaitu 733 mg. II. memerlukan air dalam jumlah yang besar. Proses sterilisasi bisa dengan meggunakan cara filtrasi maupun pemanasan. sehingga dapat menggunakan alternative urea yang jauh lebih murah sementara produksi β-Glukan tidak jauh berbeda dengan β-Glukan yang dihasilkan oleh pepton.Hasil yang diperoleh yaitu : 137 . besi. Misalnya. kadar kalsium.Air digunakan untuk proses pembersih (sterilisasi) dalam proses fermentasi. II. Hal ini dapat meminimalkan biaya dalam penggunaan air dan mengurangi volume limbah yang membutuhkan pengolahan air. struktur dan fungsi mitokondria.1 Aplikasi dari penggunaan mineral dalam industri Pengaplikasi dapat dijelaskan dalam Proses Fermentasi menggunakan Residu Mango sebagai Sumber Karbon untuk Produksi Bioetanol dengan menggunakan garam mineral MnSO4. magnesium. Selain itu air tidak hanya digunakan sebagai komponen utama dari semua media fermentasi. kalium. Sehingga dapat disimpulkan bahwa sumber nitrogen terbaik untuk proses fermentasi (produksi β-Glukan) adalah menggunakan pepton. dan dengan injeksi steam dengan tekanan yang tinggi. dan kotoran dalam bahan media lainnya.2 Mineral Mineral – mineral yang sering terdapat dalam medium fermentasi yaitu seperti berikut : kobalt. Dalam hal ini car menghilangkan koloid maupun suspensi tadi adalah dengan menggunakan teknik GAC (Granulated Carbon Active). molibdenum. maka dilakukan pemanasan pada kolom chamber dengan suhu 121⁰C selama minimal 15 menit untuk memastikan medium sudah tersterilisasi sempurna. Kadang-kadang.3 Air dan Mineral II. MgSO4. Dalam hal ini air yang akan digunakan untuk formulasi media fermentasi harus dipastikan bebas dari kandungan padatan tersuspensi maupun koloid seperti klorin. yaitu sekitar 833 mg. KH2PO4. Dalam banyak kasus juga menyediakan elemen mineral dalam media fermentasi. kecuali solid-substrat fermentasi.Grafik diatas menerangkan bahwa produksi β-Glukan terbanyak pada akhir fermentasi (84 jam) adalah pada medium dengan menggunakan sumber nitrogen pepton. sehingga banyak perusahaan yang melakukan proses pendaur ulangan / penggunaan kembali dari air. fosfor. magnesium. copper.3. cornsteep liquor mengandung berbagai mineral yang biasanya akan memenuhi kebutuhan mineral minor. ferum.2. Namun sayangnya pepton harganya relative mahal. Sementara dengan menggunakan urea produksi β-Glukanpaling sedikit yaitu 633 mg.1 Air Semua proses fermentasi. II. Dalam hal ini media yang akan disterilisasi dimasukkan dalam chamber. Respiro-fermentasi metabolisme dan respon terhadap stres lingkungan. maupun garam mineral seperti kalsium karbonat. Saat ini air menjadi semakin mahal. namun juga penting untuk peralatan pendukung dan pembersihan (sterilisasi). dan seng yang hadir dalam pasokan air.

Mn2+ berperan dalam produksi metabolit. Fe2+ adalah ion yang dibutuhkan untuk proses fermentasi Ragi alkohol. dalam bentuk ekstrak dengan tujuan untuk menekan biaya operasi fermentasi karena harganya yang lebih murah dalam bentuk ekstrak. karena perannya sebagai konstituen dehidrogenase laktat. Oleh karena itu. Selain itu contoh lain dari penambahan precursor yaitu D-treonin digunakan sebagai precursor dalam produksi L-isoleusin oleh Serratia marcescens.1. Faktor pertumbuhan biasanya ditambahkan pada sumber karbon maupun sumber nitrogen pada saat formulasi media pertumbuhan. dimana precursor tadi akan berikatan dengan rantai samping molekul penisilin.4 Vitamin Pada proses fermentasi. Contoh precursor yang ditambahkan dalam media fermentasi yaitu penggunaan phenylacetic acid atau phenilacetamida pada fermentasi antibiotic penisilin oleh Penicilliumchrysogenum.Ion K+ sangat diperlukan untuk pertumbuhan mikroorganise. II. Sementara untuk mikroorganisme lainnya. 1. Aplikasi dari penggunaan prekursor dalam industry dapat terlihat pada proses pengaruh penambahan urasil dalam media fermentasi terhadap hasil β-glukan dari dua strain Agrobacteriumradiobacter A1. Dalam hal ini factor pertumbuhan yang ditambahkan pada media fermentasi dapat berupa : prekursor. Bro 1. maupun inhibitor.Gambar 5 : Garfik laju produksi bioethanol pada produk yang mengandung mineral MgSO4 or KH2PO4 Berdasarkan kedua kurva di atas dapat dilihat bahwa penambahan mineral dalam medium fermentasi sangat penting dalam proses fermentasi. K+. II. nukleotida. Tetapi factor pertumbuhan ini tidak dapat dapat dibuat sendiri oleh mikroorganisme tersebut sehingga perlu ditambahkan dari pihak luar. maka harus ditambahkan vitamin sebagai suplemen untuk formulasi media fermentasi. Mg2+.2. 138 . dimana ditambahkan baik dalam bentuk murni atapun. Mg2+ berperan penting untuk produksi enzim sehingga alkohol dapat terbentuk. Prekursor Prekursor adalah senyawa kimia yang ditambahkan ke medium fermentasi dimana selama proses fermentasi berlangsung akan dapat berikatan dengan molekul produk untuk menghasilkan produk dari proses metabolit sekunder. dalam hal ini magnesium bertindak sebagai penggerak beberapa enzim (fosfatidilkolin transferase dan dekarboksilase). dan asam antranilat ditambahkan pada produksi L-triptofan oleh khamir Hansenula anomala.5 Faktor Pertumbuhan Faktor pertumbuhan dalam media fermentasi didefinisikan sebagai persenyawaan organik yang harus terdapat dalam sel mikroorganisme agar mikroorganisme tersebut dapat tumbuh dan menjalankan fungsinya selama proses fermentasi berlangsung. asam lemak dan sterol. inducer. Vitamin dapat ditemukan dalam produk-produk yang banyak mengandung sumber karbon dan sumber nitrogen sebagai kontaminan ringan. vitamin berperan untuk mengaktifkan enzim-enzim yang digunakan selama proses fermentasi. vitamin disintesis oleh banyak bakteri dan digunakan sebagai unsur-unsur dasar penyusun media fermentasi. Sementara Fe2+ dapat merangsang pernapasan dan perkembangan mikroorganisme.5 dan Agrobacterium sp. seperti jamur dan ragi berserabut. Dalam medium fermentasi. Contoh vitamin yang digunakan dalam formulasi media fermentasi yaitu pengunaan kalsium pantotenat dalam produksi vinegar dan biotin dalam produksi asam glutamate. elicitor. Pada fermentasi membutuhkan suplemen precursor yang spesifik ditambahkan dalam jumlah terkontrol dan dalam bentuk relatif murni. Contoh faktor-faktor pertumbuhan yang diperlukan dan ditambahkan dalam media fermentasi yaitu seperti : asam amino. disimpulkan bahwa Mn2+.

maka harus dimasukkan ke dalam media fermentasi atau ditambahkan pada suatu titik tertentu selama fermentasi. dapat dipicu dengan menambahkan elisitor. Dalam hal ini dilakukan proses isolasi untuk produk target dari berbagai mikroorganisme. Dalam proses kultur sel tanaman produksi metabolit sekunder. dan pemberian selulosa sebagai induser untuk produksi selulase oleh Trichoderma viride .Pada grafik samping dapat diamati bahwa produksi β-glukan dengan menggunakan medium yang diberi precursor urasil akan jauh lebih tinggi dibanding medium yang tanpa pemberian precursor. Dalam hal ini inducer diberikan secara terus menerus dalam konsentrasi yang rendah. Contoh pemberian induser dalam medium fementasi yaitu penggunaan starch untuk produksi amilase oleh kultur Aspergillus spp. 3. Elisitor Elisitor yaitu senyawa yang dihasilkan oleh mikroorganisme yang berperan dalam proses fermentasi untuk membantu mengsekresikan produk target dari sel tumbuhan. Hal ini dikarenakan pertumbuhan GMMs dapat terganggu ketika gen cloning 'dihidupkan'. Dalam hal ini kultur yang digunakan adalah Catharanthus roseusdengan elisiator berupa S. Selain elisator. cerevisiae 139 . inducer adalah senyawa yang Gambar 6 : Grafik produksi βbersifat menginduksi sistem biosintesis produksi enzim yang berguna glukan dengan menggunakan selama proses fermentasi.1 untuk fase logarigtmik (24 jam) maupun fase stasioner (46 jam). Dalam hal ini aplikasi penggunaan elisiator dalam medium fermentasi adalah pada proses peningkatan produksi katarantin melalui teknik elisitasi pada kultur agregat sel catharanthus roseus. Dalam hal ini inducible enzyme hanya medium yang diberi precursor disintesis untuk merespon adanya inducer di lingkungannya. karena tingkat transkripsi dan translasi yang sangat tinggi. pemberian induser maltosa oleh Bacillus subtilis. Bro 1. Elisitasi adalah suatu metode untuk meningkatkan fitoaleksin dan metabolit sekunder lainnya dengan menambahkan berbagai elisitor biotik maupun abiotic.2. Agar enzim tetap disintesis selama fermentasi. dimana gen kloning kemudian dapat 'dihidupkan' oleh penambahan elisitor kimia tertentu. substrat inducer harus selalu ada dalam medium fermentasi. khususnya patogen tumbuhan. reagen juga sering diperlukan dalam fermentasi mikroorganisme hasil rekayasa genetika (GMMs). Akibatnya. baik dengan menggunakan kultur Agrobacteriumradiobacter A1. Soja Jika pembentukan produk tergantung pada kehadiran senyawa elisitor tertentu atau analog struktural. sistem untuk gen kloning digabungkan yang memungkinkan maksimalisasi awal pertumbuhan untuk membangun kepadatan biomassa yang tinggi. Contoh : dihasilkannya isoflavonoid pada kultur sel kedelei oleh senyawa elisitor Pms yg dihasilkan oleh fungi patogen Phytophthoramegasperma var. Inducer Dalam proses fermentasi. 2.5 maupun Agrobacterium sp. yaitu urasil biasanya berupa substrat enzim atau senyawa yang memiliki struktur berdekatan. seperti flavonoid dan trepenoids.

Inhibitor nonkompetitif merupakan senyawa kimia yang tidak mirip dengan subtrat den berikatan pada sisi selain sisi aktif enzim. cerevisiae(A) dan medium(B) sebelum (control) dan sesudah elisitasi. yang digunakan dalam produksi gliserol oleh S. Oleh sebab itu. Hal tersebut dikarenakan karena adanya perubahan pH pada medium setelah elisitasi. Inhibitor Irreversibel. Inhibitor Reversibel. Gambar 8 : cara kerja inhibitor kompetitif ii. Sebuah contoh dari penghambat khusus digunakan untuk mengarahkan metabolisme natrium bisulfit. Contoh : penggunaan penisilin dlm produksi asam glutamat oleh Micrococcus glutamicus. Inhibitor reversibel dibedakan menjadi inhibitor kompetitif dan nonkompetitif.cerevisiae maupun pada medium akan lebih banyak dihasilkan dengan yang diberi perlakuan pemberian elisitor. Enzim menjadi tidak aktif dan tidak dapat kembali seperti semula. cerevisiae. Dengan kata lain inhibitor digunakan untuk mengarahkan metabolisme terhadap produk target dan mengurangi pembentukan produk yang tidak diinginkan. Inhibitor dibedakan menjadi dua kelompok. penghambat ini dapat dibalikkan. Inhibitor kompetitif menghambat kerja enzim dengan menempati sisi aktif enzim sehingga substrat tidak dapat masuk. Modifikasi sel permeabilitas 140 . yaitu penghambat yang tidak berikatan secara kuat dengan enzim. Ikatan ini menyebabkan perubahan bentuk enzim sehingga sisi aktif enzim tidak sesuai lagi dengan substratnya. Inhibitor Inhibitor adalah molekul atau senyawa kimia yang bersifat mengalihkan reaksi metabolism sehingga bisa dihasikan produk yang lebih spesifik. i. merupakan penghambat yang berikatan dengan sisi aktif enzim secara kuat sehinga tidak dapat terlepas. Selain itu dapat diamati pula bahwa pada produksi katarantin pada medium menunjukkan pola yang selalu naik setiap pertambahan waktu dalam proses fermentasi. inhibitor menghentikan jalur pada titik tertentu untuk mencegah metabolisme lebih lanjut dari produk target. Pada grafik di atas dapat disimpulkan bahwa kandungan katarantin baik pada sel S. 5. Jadi. yaitu proses dimana satu fungsi di halangi oeh fungsi lainnya. Hal ini dikarenakan terinduksinya serangkaian proses yang mengarah pada akumulasi katarantin. Pada inhibitor terjadi proses inhibisi.Gambar 7: Garfik kandungan karantin dalam sel S. Gambar 9 : Cara kerja inhibitor nonkompetitif b. 4. yaitu: a. Selain itu fungsi dari inhibitor adalah untuk mempengaruhi struktur dinding sel sehingga meningkatkan permeabilitas dinding sel untuk melepaskan metabolit. Contohnya adalah diisopropil-fluorofosfat (DFT) yang menghambat kerja asetilkolinestirase (enzim penting dalam transmisi implus saraf) yang dapat menyebabkan kekejagan otot. Inhibitor ini bersaing dengan substrat untuk berikatan dengan sisi aktif enzim.

sehingga meningkatnya pelepasan produk intraseluler dari media fermentasi.manusia tau hewan Memiliki biaya yang rendah Antifoams alam termasuk minyak tanaman(misalnya kedelai.hal itu dapat diberikan dalam udara yang mengandung sekitar 21% (v/v) oksigen.6 Oksigen Penggunaan oksigen pada fermentasi bergantung pada jumlah okisgen yag dibutuhkan oleh organisme. Busa ini terjadi terbentuk disebabkan ole media potein yang melekat pada permukaan air-broth dimana mereka mengubah sifat busa yang stabil. Jika tidak dikontrol. II. seperti media kultur yang mengandung glukosa. Daftar Pertayaan 141 . yang mengakibatkan hilangnya kondisi aseptik. mineral garam. alkohol poli dan glikolteralkilasi. vitamin dan asam amino. Berdasarkan kebutuhan akan oksigen. 2. Senyawa yang digunakan untuk tujuan ini termasuk penisilin dan surfaktan. bunga matahari). Media ini dirancang untuk mempertahankan kelangsungan hidup sel yang baik dan memnimalisirkan segala kemungkinan berkembangnya variasi generic. sehingga fermentor menjadi tercemari mikroorganisme yang dilepaskan ke limgkunagn.8 Animal Cell Culture Media Animal cell culture media biasanya didasarkan pada media yang kompleks. busa dapat menghalangi udara. LAMPIRAN I. Mereka sering ditambahkan ke fermentasi asam amino. II. II. Para antifoam sintetissebagian besar adalah silikon minyak miyak. sumber nitrogen. yang digunakan untuk palnt culture media hanyasenyawa kimia tretentu. Mereka mengandung sumber karbon organic. namun sering juga di tambahkan garam ammonium. fermentasi dibagi menjadi aerob (membutuhkan oksigen) dan anaerob (tidak membutuhkan oksigen).1. penggunaan pemutus busa mekanik dan penambahan antifoams kimia.minyak mineral dan dan lemak. Nitrat adalah sumber nitrogen. Ada tiga pendekatan yang memungkinkan untuk mengendalikan produksi foam: modifikasi komposisi media. minyak ikan. Hal ini di lakukan untuk meningkatkan permeabilitas sel dengan memodifikasi dinding sel dan membran. Yang penting adalah kebutuhan untuk freeborad dalam fermentor untuk memberikan rang bagi busa yang dihasilkan. Namun beberapa spesies memerlukan garam organic dalam bentuk asam amino. sdangkan fermentasi yang tidak membutuhkan oksigen adalh fermentasi asam laktat. Fermentasi yang mengunakan oksigen salah satu nya adalah fermenasi asam cuka. II.7 Antifoams Antifoams diperlukan untuk mengurangi pembentukan busa selama fermentasi. 3. Antifoam yang ideal harus memiliki sifat sebagai berikut: Mudah dan cepat tersebar dengan tindakan yang cepat Aktivitas tinggi pada konsentrasi rendah Tidak beracun untuk microorganisme fermentasi.kombinasi dan konsentrasi hormone tanaman diberika tergantung padafermentasi tretentu.9 Plant cell Culture Media Berbeda dengan anmal cultre media. Antifoams kimia bahan aktif yang dapat mengurangi tegangan yang mengikat busa bersama-sama. 4. II. termasuk proses untuk memproduksi L-glutamicacid menggunakan anggota Brevibacterium Corynebacteriumand genera.10 Culture maintance media Media ini digunakan untukmenyimpan dan subkuktur sektir utama industry. mineral garam dan hormone pertumbuhan.

seperti nitrogen. nucleo acid. Afida K ( Bagaimana cara menangani kandungan bahan pengotor pada air agar dihasilkan air yang murni untuk penyusun formulasi media fermentasi ? 142 . 2. 2. 4. dan ash. konsentrasi juga merupakan salah satu factor pada prose fermentasi. Dian Nita Citra ( Apakah kondisi dan perlakuan setiap bakteri walaupun dengan strain yag berbeda itu sama? Jawab: iya. Gula adalah bahan yang umum digunakan dalam fermentasi. Pertanyaan Lisan 1. Hal tersebut dikarenakan mikroorganisme tersebut memiliki sifat fisiologis yang berbeda-beda sehingga kebutuhan akan nutrisinya juga berbeda. anggur dan minuman beralkohol lainnya. asam laktat. Jadi tiap-tipa bekteri memeliki spesifikasi sifat yang berbeda-beda karena juga memiliki karakter untuk menghasilkan produk yang berbedbeda juga. namun memiliki spesifikasi sifat yang berbeda. Pertanyaan Tertulis 1. sehingga kultur ini dipilih untuk membantu proses fermentasi ini. protein. karbohidrat. Akan tetapi beberapa komponen lain dapat juga dihasilkan dari fermentasi seperti asam butirat dan aseton. yeast. dan hidrogen. Namun untuk kandungan karbon. dapat dikategorikan sebagai bentuk fermentasi yang menghasilkan asam laktat sebagai produk sampingannya. dan air yang dibutuhkan oleh ke-tiga mikroorganisme tersebut cenderung sama prosentasenya. Sehingga dapat menyebabkan kerugian. Maratus S ( Selain bahan yang mengandung gula. apa saja yang bisa difermentasi oleh bakteri ? Jawab : Fermentasi merupakan suatu proses produksi energi dalam sel dalam keadaan anaerobik (tanpa oksigen). lipids. Beberapa contoh hasil fermentasi adalah etanol. meskipun bakteri dalam strain yang sama. mineral. maupun molds) memiliki prosentase yang berbeda-beda untuk setiap komponen penyusunnya. Ridhani R ( Bagaimana dengan penggunaan kultur lain selain saccaromyches dalam aplikasi penggunaan medium fermentasi sumber nitrogen terhadap hasi β-Glukan yang dihasilkan ? Jawab: Dalam hal ini penggunaan kultur jenis lain selain saccaromyches akan menyebabkan produksi β-Glukan berbeda. Dalam hal ini kultur saccaromyches dapat menjalankan fungsinya secara optimum dalam produksi β-Glukan. 3. Hal tersebut dikarenakan ke-dua komponen tadi merupakan kebutuhan dasar yang harus terpenuhi oleh setiap jenis mikroorganisme untuk kelangsungan hidupnya. Respirasi anaerobik dalam otot mamalia selama kerja yang keras (yang tidak memiliki akseptor elektron eksternal). Ragi dikenal sebagai bahan yang umum digunakan dalam fermentasi untuk menghasilkan etanol dalam bir.A.Sisca ( Apakah efek apabila konsentrasi pada komponen tidak sesuai? Jawab: Efek yag terjadi apabila konsentrasi komponen fermentasi tidak sesuai dapat menyebabkan hasil yang diinginkan tidak sesuai dengan target. Dewi Nugrahani ( Apa yang menyebabkan komposisi masing-masing mikroorganisme berbeda ? Jawab : Kebutuhan nutrisi bagi masing-masing mikroorganisme ( bacteria.Alfondsina ( Mengapa garam yang berlebih dapat menyebabkan korosi? Jawab: B. 3. Sebab. Hal tersebut dikarenakan fungsi yang dimiliki oleh masing-masing mikroorganisme berbeda-beda setiap jenisnya.

Prinsip. protein. sebuah mikroorganisme memulai dari prekursor sederhana seperti molekul. Sintesis asam nukleat memungkinkan organisme untuk menyimpan dan mengutarakan tambahan dari perbendaharaan informasi genetiknya.prinsip pengaturan biosintesis Sebuah sel mikroba mengandung sejumlah besar protein.materi baku biosintesis dan energy. Hasil.Protein yang berbeda memiliki 143 . metabolism secara hati. materi. dan polisakarida yang tergabung dalam makromolekul atau molekul besar yang terdiri dari polimer-polimer kecil yang tergabung bersama.molekul anorganik dan monomer. ATP merupakan sumber energi bagi semua aktifitas anabolik didalam sel. Selama biosintesis. Anabolisme adalah sintesis dari makromolekul seperti protein.hati meregulasinya sehingga kecepatan dari biosintesis kira.bahan ini berlangsung lebih cepat dari perombakannnya maka organism akan tumbuh.zat pada kedua sisi dari persamaan itu dan beberapa jalur anabolik menggunakan enzim yang juga digunakan dalam jalur katabolic yang serupa.hasil anabolisme berguna dalam sejumlah fungsi yang esensial. polisakarida dan asam nukleat dari bahan. Energi bebas diperlukan untuk biosintesis pada selsel dewasa dalam ukuran yang konstan karena molekul. istilah biosintesis berarti pembentukan senyawa alami oleh organisme hidup. Enzim. yaitu dengan cara menambahkan butiran karbon aktif sebagai filtrate air sehingga antara air dan bahan suspen maupun koloid akan terpisah. Protein. dikatalis oleh enzim.zat lainnya untuk dilepaskan ke lingkungan. BAB II ISI ANABOLISME: Penggunaan energi dalam Biosintesisi Pengetahuan tentang metabolisme yang sifatnya fundamental dan vital bagi makhluk hidup telah mengantarkan kita ke suatu tingkat pemahaman yang mendalam tentang proses-proses yang berkaitan. Proses sintesis demikian tidak dapat berlangsung tanpa adanya masukan energi. Anabolisme merupakan suatu proses pembentukan molekul alami dari molekul lain yang kurang rumit strukturnya. Hal ini bisa disebut dengan istilah biosintesis. Banyak dari energi ini digunakan dalam biosintesis atau anabolisme.kira setimbang dengan katabolisme. asam nukleat. Bila sintesis bahan.sel terbentuk. Walaupun pergantian atau turnover dari unsure-unsur pokok suatu sel berkesinambungan. Molekul protein. Glikogen.enzim yang berperan dalam katabolisme dapat pula berperan dalam anabolisme dengan suatu tindakan sederhana seperti merubah konsentrasi nisbi zat.organela baru dan sel. Semua transformasi anabolik seperti halnya dengan semua reaksi katabolic.monomer yang kemudian menjadi molekulmolekul yang lebih kompleks sampai menjadi organela. Reaksi yang memerlukan energi dalam bentuk panas disebut reaksi endergonik atau reaksi endoterm Mikroorganisme dapat memperoleh energi dalam berbagai cara.bahan kecil. Proses ini disebut dengan turnover atau pergantian.karbohidrat dan protein-lipid merupakan komponen structural yang esensial dari organism. Karena anabolisme merupakan proses sintesis molekul kompleks dari beberapa molekul sederhana maka memerlukan sejumlah energi untuk biosintesisnya. bentuk dan fungsinya dibuat dari 20 asam amino terikat oleh ikatan peptide. apapun ukuran. Energi yang telah dihabiskan pada proses perggantian molekul untuk banyak sel yang tidak berkembang menggunakan energinya untuk mensintesis enzim dan zat. Pembuatan molekul komplek yang besar dimulai dari unit struktur sederhana yang disebut monomer dimana menyimpan kapasitas ruang genetic. lemak dan protein berguna sebagai bahan bakar cadangan untuk katabolisme. Proses Anabolisme biasanya banyak membutuhkan energi sehingga reaksinya dapat berlangsung cepat dan efisien.Jawab : Cara yang paling umum digunakan yaitu metode GAC (Granulated Active Carbon).molekul seluler akan secara berkesinambungan terdegradasi dan disintesis. 1. baik ekstra sel maupun intrasel.

jalur anabolik harus beroperasi ireversibel ke arah reaksi biosintesis untuk pemecahan ATP dan trifosfat nukleosida lainnya. Jalur anabolik dan katabolik sering menggunakan kofaktor berbeda. Mikroorganisme fotosintetik memperoleh energi untuk mengubah CO2 menjadi bahan sel berasal dari cahaya. biosintesis asam lemak terjadi dalam matriks sitoplasma. FIKSASI CO2 Sebagian besar mikroorganisme dapat menggabungkan dan memfiksasi CO2. amoniak. ketika elektron donor dibutuhkan selama biosintesis. ribosom merupakan kumpulan besar proton banyak dan molekul ribonukleikasid namun mereka muncul dengan pembentukan komponen mereka tanpa keterlibatan. Kegunaan beberapa monomer yang terhubung bersama oleh ikatan kovalen membuat sintesis makromolekul memiliki proses yang efisien. Sel mebutuhkan enzim untuk membuat dua kali lipat asam amino(atau menyediakan asam amino ekstra ). enzim dan asam amino. Untuk contoh. Hanya mikroorganisme autotrof yang menggunakan CO2 sebagai satu-satunya sumber karbon bagi sintesis selnya. Sel sering menyimpan penambahan materi dan energy dengan menggunakan enzim yang sama untuk proses katabolisme dan anabolisme. Untuk mensintesis secara efisien suatu molekul.rangkaian asam amino yang berbeda pula. Biasanya oksidasi katabolik menghasilkan substrat NADH untuk transpor elektron. Potensial yang terjadi diubah menjadi ikatan fosfat berenergi tinggi jika proton memasuki sel kembali melewati saluran proton. dan yang lainnya membalik proses pengubahan. Hampir semua struktur sel terbuat dari 30 prekursor-prekursor kecil. 5. Pembagian ruang memudahkan jalur untuk beroperasi secara simultan namun independen 6. tetapi mikroorganisme autotrof memperoleh energi dari oksidasi kimia. Seperti misalnya. Gen akan membutuhkan enzyme ekstra dan sel harus menanamkan materi-materi baku dalam sintesis atas penambahan gen. sama dengan mikroorganisme fotosintetik. 4. energi bebas yang dibuat tersedia selama perombakan trifosfat nukleosida yang mendorong reaksi biosintesis sampai selesai. enzim glikolisis yang terlibat dalam sintesis dan degradasi glukosa. Jika sebuah protein disusun oleh 40 asam amino yang berbeda yang terbagi menjadi dua puluh. Kedua jenis jalur dapat diatur dengan produk akhir mereka serta oleh konsentrasi ATP. Walaupun banyak enzim dalam jalur amphiobolik terlibat dalam aktivitas katabolisme dan anabolisme . Kegunaan enzim yang terpisah untuk dua reaksi dalam satu tahap memungkinkan regulasi independen dari katabolisme dan anabolisme. Jalur anabolisme dan katabolisme tidak pernah sama walaupun banyak enzim digunakan bersama. dan NAD +. 3. mereka dirakit menjadi lebih besar. 144 . 2. beberapa tahapnya dikatalisis oleh enzim yang berbeda. struktur yang lebih kompleks seperti sistem supramolekul dan organel. AMP. Dalam jalur biosintesis mikroorganisme eukariotik sering terletak di ruang selular yang berbeda dari jalur yang berhubungan secara katabolik. Makromolekul biasanya berisi informasi yang diperlukan untuk membentuk spontan dalam proses yang dikenal sebagai self-kumpulan. NADPH daripada NADH biasanya berfungsi sebagai donor Setelah makromolekul telah dibangun dari prekursor sederhana. sedangkan oksidasi asam lemak terjadi di dalam mitokondria. seperti misalnya elektron yang dibebaskan dari oksidasi belerang. dan lainnya disalurkan melewati rantai-rantai transpor elektron yang menyebabkan proton menyembul dari membran. Misalnya. Regulasi anabolisme adalah bentuk yang agak berbeda dengan katabolisme. Mikroorganisme autotrof mendapatkan energi dari oksidasi senyawa anorganik tetapi proses penangkapan energi sama dengan fosforilasi oksidatif. A. ADP. ketika dua proses yang digabungkan. Satu enzim mengkatalisis reaksi dalam katabolisme. Sebaliknya.

6RuBP+6CO2 → 12PGA → 6RuBP+Fruktosa 6-P Pengubahan CO2 menjadi materi organik membutuhkan 3 ATP dan 2NADP. Sulfate Reducer. sulfolobus. reduksi. Melalui jalur asetil-koA pada methanogen.Mikroorganisme autotrof merupakan satu kelompok besar mikroorganisme yang mempunyai kemampuan untuk mengubah senyawa anorganik menjadi senyawa organik seperti protein. lemak. dan bakteri yang membentuk asetat dari CO2 selama fermentasi (Acetogen). regenerasi. merupakan tempat fiksasi CO2 atau penyimpanan karboksilase dan protein. Senyawa sulfur tereduksi. FOTOSINTESIS 1. asam nukleat. tersusun dari bacteriochlorophyll dan bacteriopheophytins dan sebuah ETS. memiliki tiga komponen pertama. Walau demikian. dan vitamin. hydrogen molekuler.protein lain. Hal ini merupakan suatu kelebihan yang sangat tidak mungkin terjadi pada organisme tingkat tinggi. dari siklus Calvin adalah pembentukan kembali RuBP dan dihasilkannya karbohidrat seperti gliseraldehid 3-fosfat. Siklus ini selesai ketika fosforibulokinase membentuk kembali RuBP.molekul anorganik secara kemoautotrof. PGA Tereduksi menjadi gliseraldehid 3-fosfat. . Siklus harus beroperasi enam kali untuk menghasilkan heksosa dan membentuk kembali 6 molekul-molekul RuBP. Siklus Calvin terjadi di stroma pada kloroplas mikroba autotrof eukariotik . Pembagian dari siklus ini mirip dengan jalur pentose fosfat dan melibatkan reaksi transketolase dan transaldolase. gliseraldehid 3-fosfat dehidroginase berbeda dengan enzim pada glikolisis dalam penggunakan NADP+. Pembentukan glukosa dari CO2 dapat dituliskan sebagai berikut 6CO2+18ATP+12NADPH+12H++12H2O → Glukosa+18ADP+18Pi+12NADP+ ATP dan NADPH dihasilkan dari reaksi terang fotosintesis dengan mengoksidasi molekul. Terdapat polyhedral yang mengandung enzim ribolusa-1. Untuk mensintesis fruktosa 6-fosfat atau glukosa 6-fosfat dari CO2. siklus calvin diketemukan pada fotosintesis eukariotik dan pada sebagian besar fotosintesis prokariotik (tidak untuk Archaea.5-bifosfat karboksilase atau ribolosa difosfat karboksilase yang dikatalisis dengan penambahan CO2 menjadi ribolosa 1. B. beberapa bakteri obligat anaerobic dan beberapa bakteri mikroaerofilik). Fase Regenerasi Fase ketiga. dilakukan oleh dua enzyme. membentuk dua molekule 3-fosfogliserat (PGA) Fase Reduksi Setelah PGA terbentuk melalui karboksilase.molekul yang diperlukan lainnya. dan glukosa. Fotosintesis Anoksiganik Bakteri Unit Fotosintesis dalam unit bakteri berbeda dengan siano bakteri. Pengumpulan cahaya (mengandung dan tambahan pigmen) sebuah reaksi pusat. Reduksi. Fase Karboksilasi Fiksasi karbon dioksida dilakukan oleh enzim ribolosa-1. Hampir semua mikroorganisme autotrof menggabungkan CO2 melalui jalur metabolik yang disebut siklus calvin. siklus calvin-Benson atau siklus reduktivitas pentose phospat. Dibagi menjadi tiga fase yakni karboksilasi. Mikroorganisme ini biasanya menggunakan satu dari dua jalur. Oksigen tidak terbentuk 145 . Gula yang terbentuk dalam siklus Calvin dapat digunakan untuk mensintesis molekul. dan merupakan proses pembalikan dari proses glikolisis. dan senyawa organic yang digunakan sebagai donor electron terakhir.) dan beberapa bakteri seperi Chlorobium dan desulfobacter). beberapa bakteri nitrifikasi pemasukan thiobacilli carboxysomes . Walaupun begitu.5-bifosfat karboksilase.5-bifosfat (RuBP). Jalur reduktif asam trikarboksilik yang digunakan untuk beberapa Archaea (Thermoproteus. Cyanobacteria. fruktosa.

+ 2H++ H2O ATP juga dapat dihasilkan dari electron yang terbentuk melalui fotosistem I. alga dan tanaman tingkat tinggi mempunyai dua fotosintesis (I dan II) terhubung melalui pembawa electron. Fotosintesis oksigenik bakteri Ganggang hijau dan sianobakteri di lingkungan lautan menghasilkan sekitar 70% oksigen bebas yang dihasilkan di bumi. Inilah proses oksigenenik. Tiga tahap glikolisis yang terjadi dalam sel dan bersifat irreversible 1. Pengubahan fosfoenolpiruvat menjadi piruvat 2. setiap electron berpindah. Selam proses ini ATP disentesis melalui siklus fosforilasi. kembali pada reaksi pusat bacteriochlorophyll. Fotolisis air H2O + Cahaya Matahari → 2e. jalur glukonigenesis berbeda dengan jalur glikolisis. fruktosa bifosfatase yang mana secara 146 . Seperti contohnya fruktosa 1. Walaupun sama-sama menggunakan tujuh enzim.6 bifosfat dari fruktosa 6-fosfat 3. Proses ini dinamakan fotofosforilasi. System ini bertanggung jawab atas pembentukan ATP dan NADPH.6 bifosfat dengan fosfofruktokinase yang dibalikkan oleh enzim. sebuah electron diberikan kepada bacteriopheophytin. yang dibutuhkan bersama ATP untuk fiksasi nitrogen. Fotosistem I selesai dan tidak sanggup untuk memberikan electron lagi. Sintesis glukosa dari prekursorprekursor nonkarbohidrat disebut glukoneogenesis.molekul organic gula yang tereduksi dari CO2. Electron yang diberikan ke fotosistem I melalui system transport electron adalah untuk mempertahankan proses operasi. Dilakukan dengan fotolisis air dan hasilnya adalah oksigen. Bakteri ini melewati sebuah quinine dan melalui berbagai sitokrom. Pemberian NADP+ tidak bergantung pada cahaya ATP tersintesis melalui siklus fosforilasi yang dibutuhkan untuk memaksa electron dari reduktor lemah untuk bergerak kemudian mereduksi NADP+ (Pembalikan transfor electron) . Fosforilasi glukosa Tahap. Pembentukan fruktosa-1. sebuah electron tereduksi dibutuhkan yakni H2S atau H2. jika tidak digunakan dalam produksi NADPH .tahap ini dilewati ketika proses terjadi secara biosintetis.Pembalikan transfor electron juga digunakan litotrof untuk mengatasi masalah yang sama. Aseptor electron utama dari fotosistem I dapat melewatkan electron melalui sitokrom dapat kembali melakukann siklus untuk reaksi pusat pada fotosistem I. Fotosintesis Sianobakteri 6CO2 + 6H2O → C6H12O6 + 6O2 C. Ketika bateriochlorophyll melalui dalam reaksi pusat ditangkap oleh cahaya. ATP tersintesis. Electron berpindah dari reaksi pusat fotosistem I ketika ditangkap cahaya menuju ferredoksin kemudian menuju NADP+ untuk membentuk NADPH. Fotosintesis bakteri ungu non belerang CO2 + 2CH3CHOHCH3 → (CH2O) + H2O + 2CH3COCH3 Fotosintesis bakteri hijau belerang CO2 + 2H2S → (CH2O) + H2O + 2S 2. SINTESIS GULA DAN POLISAKARIDA Mikroorganisme yang tidak bisa melakukan fotosintesis dan mikroorganisme Heterotrof harus mensintesis molekul. sedangkan sisanya dihasilkan oleh tumbuhan daratan.selama fotosintesis. Dalam pembentukan NADH. Sianobakteria. Selama siklus ini.

Katabolisme glikogen dan pati atau Starch mengolah tidak hanya melalui hidrolisis untuk membentuk gula bebas dengan penambahan fosfat pada polimer ini dengan produksi glukosa 1-fosfat. Gula Nukleosida difosfat memiliki peran pusat dalam sintesis polisakarida seperti kanji (Starch) dan glikogen. UDP-galaktosa disintesis dari UDPG melalui penyusunan ulang dari satu kelompok hidroksil. Paling tidak dua enzim terlibat dalam pengubahan piruvat menjadi fosfoenolpiruvat. Seperti misalnya mannose yang secara langsung dapat terbentuk dari fruktosa melalui perombakan sederhana. Glukosa teraktivasi melalui penyisipan pada pirpfosfat pada uridin melalui reaksi dengan uridin difosfat.hidrolisis memindahkan fosfat dari fruktosa bifosfat. Ketika glukosa dan fruktosa telah terbentuk. 147 . gula adenosine difosfat terbentuk dari glukosa 1-fosfat dan kemudian memberikan glukosa pada akhir rantai glukosa dan pati. ATP+glukosa 1-fosfat → ADP-glukosa + Pi (Glukosa)n + ADP-glukosa→(glukosa)n+1 + ADP Nukleosida difosfat juga ikut terlibat dalam sintesis molekul komplek pada dinding sel bakteri. Berbeda selama sintesis gula dan kanji pada bakteri dan alga. Seperti yang dikatakan sebelumnya biosintesis bukanlah proses pembalikan yang sederhana dari proses katabolisme. Enzim yang berbeda mengkatalisis sintesis UDP-asam glukorin melalui proses oksidasi UDPG. Pembagian UDP oleh UPGD dikenali enzim dan membawa glukosa di sekitar sel untuk terlibat dalam reaksi enzim seperti ADP yang memecah fosfat dalam pembentukan ATP. Gula nukleosida difosfat paling penting adalah uridin difosfat glukosa (UDPG). Fruktosa 6-fosfat ↔ mannose-6 fosfat Beberapa gula tersintesis sambil tersisip menuju nukleosida difosfat. gula pada umumnya juga akan terbentuk. Gula nukleosida difosfat tidak terlibat.

bakteri menggabungkan hidrogen sulfida dengan O-acetylserine (proses 2) (1) H2s+serin → sistein + H2O (2) Serin asetil-koA O-Asetilserin H2S Asetat sistein Setelah terbentuk. Fosfat anorganik terbentuk melalui pembentukan ATP dalam tiga cara yakni : fotofosforilasi.phosphosulfat yang kemudian diikuti dengan reduksi sulfat. Sumber fosfor paling utama fosfat anorganik dan ester fosfat organic. Asimilasi Sulfur Sulfur diperlukan dalam sintesis asam amino (sistein dan mesionin) dan beberapa enzim (koenzin A dan iotin) . koenzim seperti NADP. Banyak organisme yang menggunakan sistein dan mesionin .3 Bifosfogliserat + ADP→3-Fosfogliserat+ATP Mikroorganisme memperoleh fosfat dari lingkungan disekitarnya yang larut maupun terbentuk. sistein dapat juga digunakan sebagai sintesis sulfur yang mengandung senyawa organic 2. fosfolipid. Gram negative. yang selanjutnya digunakan dalam sintesis ATP. dan nitrogen dalam jumlah banyak untuk biosintesis.bacteria mempunyai phosphatases di ruang periplasmic antara dinding sel dan membrane sel yang mengambil fosfat setelah dihasilkan. termasuk protein. Nitrogen adalah komponen utama dalam semua asam amino. sehingga sulfat harus direduksi sebelum proses asimilasi. Walaupun gas 148 . Protozoa secara langsung menggunakan fosfat organic setelah ingesti atau hidrolisis di lisosom dan membentuk fosfat 1. Phospatases sering menghidrolisis ester fosfat organic untuk menghasilkan fosfat anorganik.3-bifosfogliserat+NADH+H+ 1. Glikolisis memberikan contoh pada proses ketiga. Nitrogen juga hadir di basis pembentuk asam nukleat. yang nantinya dimasukkan ke dalam protein. Gliseradehid 3-P+Pi+NAD+→1. Proses yang disebut dengan reduksi asimilasi sulfat ini dimaksudkan untuk dapat dibedakan dengan reduksi dissimilasi sulfat yang terjadi ketika sulfat berperan sebagai aseptor electron selama proses anaerobic berlangsung. protein. fosforisasi level substrat. kemampuan sel untuk mengasimilasi nitrogen anorganik adalah penting. DAN NITROGEN ANORGANIK Di samping karbon dan oksigen. Atom sulfur pada sulfat akan lebih teroksidasi daripada pada sistein dan molekulmolekul organic lainnya. karena keduanya merupakan sumber eksraselular dan tempat penyimpanan intraselular asam amino. seperti DNA dan RNA yang nantinya membawa hereditas Karena nitrogen merupakan komponen penting dari protein. Asimilasi fosfor Fosfor ditemukan pada asam nukleida. Proses ini merupakan proses yang kompleks dimana sulfat pertama direduksi menjadi sulfit (SO32-) kemudian menjadi hidrogen sulfida.ATP. ( Harley. Asimilasi nitrogen Nitrogen adalah unsur yang diperlukan untuk membentuk senyawa penting di dalam sel. Sistein dapat disintesis dari hidrogen sulfida dengan dua cara. sulfat dapat menghasilkan sulfur untuk proses biosintesis. protein adalah zat yang sangat kita butuhkan dalam pertumbuhan. koenzim dan unsure-unsur pokok banyak sel lainnya. asam nukleat.3-bifosfogliserat. Jamur berperan untuk mengkombinasikan hidrogen sulfide dengan serin untuk membentuk sistein (proses 1) dimana banyak bakteri. Fosfat terlibat dengan gliseraldehid 3. DNA dan RNA. ASIMILASI FOSFOR SULFUR. sulfur. mikroorganisme menbutuhkan fosfor.fosfat membentuk 1.masing diasimilasi atau dibentuk menjadi molekul. 2005) D.molekul organic melalui rute yang berbeda.fosforilasi oksidatif. Reduksi asimilasi sulfat melibatkan proses pengaktifan sulfat melalui pembentukan phosphoadenosine 5. Masing.Gambar glukeneogenesis.

Enzim yang lain dalam asimilasi amonia. Salah satu contoh enzim ini adalah aspartate aminotransferase (AAT) yang mengkatalis reaksi 149 . dan dalam produk antara dekomposisi bahan organik atau humus dibangun. Enzim yang berperan dalam hal ini secara umum dikenal sebagai aminotransferase. namun berbagai bukti menunjukkan bahwa GDH bukanlah untuk menggantikan GS dan GOGAT namun lebih banyak berperan sebagai mekanisme untuk memisahkan amina (de-aminasi) dari glutamat. sebagai contoh. amonifikasi. Proses siklus nitrogen mengubah nitrogen dari satu bentuk kimia lain. Sel-sel mati ini bersama dengan sisa tanaman/hewan akan menjadi bahan organic yang siap didekomposisikan dan melalui serangkaian proses mineralisasi (aminisasi. nitrit (NO2-). Banyak proses yang dilakukan oleh mikroba baik untuk menghasilkan energi atau menumpuk nitrogen dalam bentuk yang dibutuhkan untuk pertumbuhan a. nitrogen kemudian diinkorporasikan menjadi asam amino lain melalui reaksi transaminasi. Glutamine synthetase mempunyai suatu gaya affinitas sangat tinggi untuk amonia dengan begitu mampu untuk memasuki amonia sekalipun konsentrasinya sangat rendah. nitrat (NO3-). mengkatalisasi perpindahan kelompok amida (-NH2) dari glutamine ke 2-oxoglutarate. Banyak bakteri dan jamur menggunakan glutamat dehidroginase ketika konsentrasi amoniak tinggi. glutamate synthase (GOGAT). Pembentukan amonia Nitrogen Amoniak dapat dibentuk menjadi materi organic dengan relative mudah dan langsung karena mudah tereduksi daripada nitrogen anorganik dalam bentuk lain .  Jalur alternatif untuk asimilasi amonia Glutamate dehidrogenase (GDH) mengkatalisis reaksi dua arah untuk membentuk glutamat atau membuang gugus amina dari glutamat . dan gas nitrogen (N2). α-Ketoglutarat + NH4++NADPH (NADH) +H+↔glutamat+NADP+(NAD+)+H2O Perbedaan kemampuan dalam penggunaan NADPH dan NADH sebagai agen pereduksi adalah pada sintesis glutamate. dan nitrifikasi) akan melepaskan N-mineral (NH4+ dan NO3-) yang kemudian di immobilisasi oleh tanaman atau mikrobia Nitrogen hadir di lingkungan dalam berbagai bentuk kimia termasuk nitrogen organik. atau humus. Dalam jalur ini asam amino glutamate bertindak sebagai akseptor untuk amonia. Setelah terasimilasi menjadi glutamin dan glutamat. amonium + (NH4 ). dan satu molekul glutamine meninggalkan siklus itu. kedua-duanya molekul glutamate dapat bertindak sebagai suatu akseptor amonia. Sebagian besar dipakai untuk pembentukan ammonia atau nitrat Siklus nitrogen dari fiksasi N2-atmosfer secara fisik/kimiawi yang menyuplai tanah bersama presipitasi. 2-oxoglutarate + NH4+ + NAD(P)H glutamate + H2O + NADP+ Meskipun reaksi diatas nampak seperti asimilasi amonium menjadi glutamat. beberapa mikroorganisme membentuk alanin asam amino dalam reaksi aminasi reduktif yang dikatalis oleh alanin dehidroginase Piruvat +NH4+NADH (NADPH)+H+↔L-alanin + NAD+ (NADP+)+H2O Rute utama untuk pembentukan amoniak adalah pembentukan glutamat dari α-Ketoglutarat (sebuah siklus TCA intermediet). yang belakangan adalah produk dari siklus asam trikarboksilik (Gambar 7-4).nitrogen melimpah di atmosfer. Untuk reaksi ini baik ferredoxin yang direduksi (dari photosystem) atau NADPH (dari respirasi) diperlukan untuk pemeliharaan siklus asimilasi amonia dan yang selebihnya dapat digunakan untuk biosynthesis protein. Ini diaktifkan oleh pH tinggi dan konsentrasi ATP dan magnesium yang tinggi. dan oleh mikroorganisme baik secara simbiotik maupun nonsimbiotik yang menyuplai tanah baik melaliu inangnya maupun setelah mati. Sebagai suatu alternatif. beberapa mikroorganisme dapat mereduksi gas dan menggunakan menjadi sumber nitrogen. manakala pemberian amonia besar. Nitrogen organik dapat berupa organisme hidup. dan amida glutamine dibentuk.

sehingga mendorong asimilasi N 150 . ( Foster. Gambar Struktur dan lintasan senyawa terkait dengan metabolisme amonium. glioksisom. Enzim biosintesis asam amino karena daun tanaman atau kloroplas yang diisolasi jika dipajankan pada CO 2 diberi label radiokatif akan segera menggabungkan C berlabel menjadi glutamat. namun sebagi senyawa kunci untuk transport dan penyimpanan nitrogen karena stabilitasnya dan tingginya rasio nitrogen:karbon (2N:4C untuk asparagin vs. Aminotransferase ditemukan dalam sitoplasma. Amonium dapat diasimilasi melalui kombinasi dengan glutamat untuk membentuk glutamin (Glutamin sintetase) atau dengan aminasi reduktis 2-oxoglurata yang menghasilkan glutamat (glutamat dehidrogenase). menghambat AS. bob. 2010)  Nitrogen ditransfer dari glutamin atau glutamat menjadi asam amino lain melalui reaksi transaminasi Semua reaksi transaminasi memerlukan kofaktor pyridoxal phosphate (vitamin B6).Glutamate + oxaloacetate aspartate + 2-oxoglutarate Dimana gugus amina dari glutamat ditransfer menuju atom C-2 asam keto. yang diisolasi dari asparagus pada awal 1806. kondisi yang merangsang aktivitas glutamine synthetase (GS) dan Fd-glutamate synthase (Fd-GOGAT). 2N:5C untuk glutamin atau 1N:5C untuk glutamat). alanin. Intensitas cahaya dan kandungan karbohidrat yang tinggi. Dua glutamat dihasilkan dari glutamin dan 2-oxoglutarat (glutamat sintase). merupakan bentuk amida pertama yang teridentifikasi. Donor elektron (kofaktor tereduksi) diperlukan dalam reaksi tersebut: feredoksin pada daun hijau dan NADH pada jaringan non-fotosintetik.  Peran asparagin dan glutamin sebagai jembatan antara metabolisme N dan C Asparagin. serin. Jalur utama sintesis asparagin mencakup transfer amida nitrogen dari glutamin ke aspartat (Gambar 7-4 bawah): Glutamine + aspartate + ATP asparagine + glutamate + AMP + PPi Reaksi tersebut dikatalis oleh asparagine synthetase (AS). menghambat ekspresi gen dan aktivitas asparagine synthetase (AS). dan glisin. Kondisi cukup energi (cahaya dan karbohidrat tinggi) menstimulir GS dan GOGAT. mitokondria. yang banyak ditemukan pada sitoplasma daun dan akar dan dalam nodul pemfiksasi N. dan peroksisom. Fungsinya bukan sebagai prekursor protein. asapartat. dan dalam transport karbon dari sel mesofil menuju sel seludang pembuluh (bundle sheath) pada fiksasi karbon c4. kloroplas. Aspartate adalah asam amino yang berpartisipasi dalam malate-aspartate shuttle dari mitokondria dan kloroplas menuju sitoplasma.

NADPH adalah sumber elektron. sebaliknya pada tanah yang lembab/basah ammonia terlarut dalam air dan membentuk ion ammonium (NH4+ ). asam amino yang sudah terbentuk dikonversi menjadi ammonia (NH3) dan proses ini disebut amonifikasi. pada tanah yang kering mudah menguap. Hidroxylamine mungkin sebuah internediet ( antara) amonia kemudian dibentuk menjadi asam amino.molekul nitrogen menjadi amonia adalah cukup eksergonik. Reduksi nitrogen membutuhkan pelepasan ATP dalam jumlah yang besar yakni 8 elektron dan 16 molekul ATP. Walaupun ikatan enzim intermediet dalam proses ini masih belum diketahui. Jika tumbuhan atau hewan mati. dimana ini terjadi selama pernafasan anaerobik reduksi dissimilasi nitrat. Karena amoniadan nitrat berada dalam jumlah yang sedikit dan hanya beberapa organisme prokariotik yang dapat melakukan fiksasi nitrogen (sel. c. Clostridium. Bakteri yang hidup bersimbiosis tanaman Legumes seperti Rhizobium 3. NO3. Fiksasi nitrogen terjadi pada 1.+ NADPH + H+→NO2-+NADP++H2O Nitrit selanjutnya direduksi menjadi amoniak dengan penambahan dua elektron yang dikatalisis oleh oleh nitrite reductase dan mungkin enzim lainnya. Nitrogen direduksi oleh penambahan dua elektron. keterbatasan energi menghambat GS dan GOGAT. senyawa yang kaya akan karbon dan berpartisipasi dalam sintesis. nitrogen organik diubah menjadi amonium (NH4+) oleh bakteri dan jamur. menstimulir AS. Proses selanjutnya. dan Methanococcus 2. Fiksasi Nitrogen Reduksi gas nitrogen pada atmosfer menjadi ammonia dinamakan fiksasi nitrogen. Reduksi molekul. laju dari proses ini terbatas pada pertumbuhan tanaman. Nitrat pertama kali direduksi menjadi amoniak sebelum nitrogen dapat dikonversikan menjadi bentuk organik.alga. Sianobakteri seperti (Nostoc dan Anabaena) Reduksi nitrogen menjadi amonia dikatalisis oleh enzim nitrogenase.sel eukariotik memiliki keterbatasan kemampuan dalam melakukan ini). fungi. Proses reduksi nitrat ini dinamakan reduksi asimilasi nitrat. Bakteri yang hidup bebas seperti azetobacter Klebsiella. b. Organisme yang sudah mati diuraikan melalui proses hidrolisis yang menyebabkan protein terurai menjadi asam amino. tetapi reaksi ini memiliki energi aktivasi yang tinggi karena molekul. senyawa yang kaya nitrogen dan cukup stabil untuk transport jarak jauh atau untuk disimpan dalam jangka waktu lama (asparagine is stable for long-distance transport or long-term storage). Sebaliknya. Sebagian besar keberadaan N2 di dalam tanah dalam bentuk molekul anorganik. 4 pasang ATP dan elektron dibutuhkan N2+8H++8e-+16ATP→2NH3+H2+16ADP+16Pi 151 . Amonia merupakan senyawa dalam bentuk gas.molekul nitrogen adalah gas tidak reaktif dengan tiga ikatan diantara dua atom nitrogen. Reduksi asimilasi nitrat pada bakteri terjadi di kritoplasma. nitrat dibentuk menjadi materi organik dan tidak ikut dalam pembentukan energi. sehingga mendorong asimilasi N menuju asparagin. Proses ini disebut deaminasi.menjadi glutamin dan glitamat. Langkah pertama dalam asimilasi nitrat adalah reduksi menjadi nitrit oleh nitrate reductase. Pada asimiasi nitrat. Proses ini terjadi pada bakteri. Selanjutnya ion amonium dapat digunakan oleh bakteri dan tumbuhan untuk sintesa asam amino. Reduksi asimilasi nitrat Nitrogen dalam nitrat (NO3-) lebih mudah teroksidasi daripada dalam amoniak. Amonifikasi dibantu oleh beberapa mikroorganisme seperti bakteri dan jamur. enzim yang mengandung dan molibdenum.

Pada simbiosis dengan pemfiksasi nitrogen Rhizobium memunculkan difusi amonia keluar sel bakteri dan mengasimilasi sel legume sekitar. Akan tetapi. dan energi. HCΞCH + 2H++2e-→H2C=CH2 Laju reduksi dari asitilena menjadi etilena digunakan dalam estimasi aktivasi nitrogenase. proses respirasi pada pemfiksasi nitrogen aerobik atau fermentasi pada bakteri anaerob seperti misalnya clostridium pasteurianum (bakteri anaerob) mereduksi ferredoksin selama oksidasi piruvat dimana Azetobacter aerob menggunakan elektron dari NADPH untuk mereduksi feredoksin. Nitrogenesa cukup sensitif dengan O2 dan harus dilindungi dari pentidakaktifan O2 didalam sel. (asetilena. Pengikatan gugus amin langsung terdapat pada proses sintesis glutamat dari -ketoglutarat . Reaksi H2 dengan diimin (HN=NH) untuk membentuk N2 dan H2. Reaksi ini memerlukan glutamat dehidrogenase. Pada dasarnya sintesis asam amino merupakan reaksi aminasi (pengikatan gugus amin) karboksilat. Nitrogenase dapat mereduksi bermacam molekul yang mengandung ikatan rangkap tiga. E. 152 . Walaupun jalur sintesis asam amino tidak dijelaskan secara rinci sebuah survey mengenai pola umum biosintesis asam amino mungkin diketemukan dalam textbook pengenalan biokimia. SINTESIS ASAM AMINO Sintesis asam amino membutuhkan susunan dari kerangka karbon yang cocok dan ini melalui proses komplek yang melibatkan banyak tahap. protein MoFe mengandung 2 atom molibdenum dan 28 sampai 32 atom besi. Untuk memaksimalkan efisiensi dan ekonomi. ATP dihidrolisis ketika terjadi transfer elektron. jalur pentose phosphate. dan azide). Gugus amin biasanya berasal dari amonia. Seluruh proses ini membutuhkan paling tidak 8 elektron dan 16 ATP sebab nitrogenase juga mereduksi proton pada menjadi H2. fotosintesis pada sianobakteri. protein Fe mengandung 4 atom besi. Molekul nitrogen yang tereduksi menjadi amonia. karbon. Dalam banyak sianobakteri.Elektron diperoleh dari ferredoksin yang telah tereduksi dengan berbagai macam cara .000mw) . Rute utama asimilasi amonia adalah sintesis glutamin oleh sistem glutamin syinthetase-glutamat synthetase. Karena kebutuhan untuk memelihara nitrogen. Simbiosis nitogen-bakteri dapat menghabiskan hampir 20% ATP yang dihasilkan oleh tanaman. 6 elektron yang ditransfer membutuhkan 12 ATP setiap N2 direduksi. Ikatan ATP menyesuaikan dengan protein Fe dan memperendah potensialnya. Skeleton asam amino diperoleh dari asetil koA dan dari intermediet (antara) siklus TCA. Walupun begitu.000mw) yang diikuti satu atau dua protein Fe (64. prekursor untuk biosintesis asam amino diperoleh dari beberapa jalur utama ampiobolik. Protein Fe pertama direduksi oleh feredoksin kemudian mengikat ATP. setiap tahap membutuhkan sebuah pasangan elektron. pengikatan gugus amin ke karboksilat dapat langsung (1 tahap) atau tidak langsung (2 tahap). proteksi melawan oksigen dilakukan oleh struktur istimewa yang dinamakan heterokis. protein MoFe (220. Nitrogenase adalah sistem komplek yang mencakup dua komponen protein utama. Protein MoFe yang telah tereduksi memberikan elektron pada atom nitrogen. zat seperti turunan purin alantoin dan alantoik juga disintesis dan digunakan untuk transfer nitrogen menjadi bagian lain tanaman. Glikolisis. amonia dapat terbentuk menjadi senyawa organik. jalur sintesis asam amino biasanya teregulasi secara rumit oleh allosteric dan mekanisme umpan balik. sianida. ikatan ATPNdihilangkan untuk mereduksi protein MoFe. Reduksi N2 menjadi NH3 terjadi dalam tiga tahap.

Pada reaksi ini gugus amin lebih dulu diinkorporasi ke glutamat menghasilkan glutamin (dikatalisis glutamin sintase/GS). Sintesis asam amino lainnya memerlukan glutamat sebagai sumber nitrogen (gugus amin) ke karboksilat. Dari kedua tipe reaksi di atas (GH dan GS-GOGAT) tampaknya reaksi GS-GOGAT merupakan reaksi yang paling mungkin terjadi di alam.Gambar 813 Reaksi glutamat dehidrogenase (Kimball. menjadi glutamat. Gugus amin ditransfer ke -ketoglutarat menghasilkan glutamat (dikatalisis glutamin -oksoglutarat transaminase atau GOGAT).1993) Gambar Reaksi GS-GOGAT (anonim. Glutamin yang kehilangan amida. Reaksi ini merupakan proses transaminasi. 153 . sedangkan reaksi GS-GOGAT memerlukan sedikit amonia di habitatnya. Hal ini karena reaksi GH memerlukan kadar amonia yang tinggi di habitatnya. sehingga enzimnya disebut transaminase. 2010) Pengikatan gugus amin tidak langsung terjadi pada proses sintesis glutamat dari -ketoglutarat dan memerlukan glutamat lainnya.

timin. Banyak dari jalur biosintetis F.konstituen penting dari beberapa koenzim. maka polimer tersebut dinamakan nukleosida. Jika tanpa fosfat. 154 . 1993) Banyak mikroorganisme dapat mensintesis purine dan pirimidin mereka sendiri. dan memiliki peran penting dalam aktivasi dan transfer gula. dan fosfat. Dua molekul purin penyusun nukleotida adalah guanin dan adenin dan nama nukleosidanya adalah guanosin dan adenosin.mula dari asam orotik. Nukleotida adalah building blocks dari DNA atau deoxribunucleic acid dan RNA atau ribonucleic Acid. SINTESIS PURIN. dan komponen dinding sel. dan urasil dan nama nukleosidanya adalah sitidin. dan CO2 yang berasal dari karbonat. asam amino. ribosa atau deoksiribosa. oksaloasetat. pirimidin disintesis dari aspartat. amonia yang berasal dari glutamin.Rangkaiam cabang asam amino dari rute pusat. Tiga molekul pirimidin penyusun nukleotida adalah sitosin. dan NUKLEOTIDA Nukleotida adalah polimer molekul purin atau pirimidin. sebuah kondensasi produk dari carbomyl phosphates dengan asam aspartic. skeleton purin diperoleh dari beberapa komponen dimana pirimidin mula. alanin. PIRIMIDIN. dan uridin. Sintesis purin sangatlah komplek. timidin. Biosintesis Pirimidin Berdasarkan asal atom karbon dan nitrogen. G gambar Monomer nukleotida Gambar Molekul purin (atas) dan pirimidin (bawah) (Kimball. Jadi nukleotida adalah nukleosida fosfat. juga merupakan konstituen. aspartat glutamate akan ditransminasi secara langsung dari piruvat. dan ketoglutarat.

2009) Sintesis nukleotida pirimidin dimulai dari fosforilasi aminasi karbonat. Reaksi ini dikatalisis dihidroorotat dehidrogenase. Gambar Biosintesis pirimidin (Kimball. Reaksi ini dikatalisis karbamoil fosfat sintetase. Selanjutnya. sehingga menghasilkan karbamoil aspartat (melepaskan fosfat). Aminasi dan fosforilasi karbonat menjadi karbamoil fosfat. Reaksi ini dikatalisis orotat fosforibosil transferase. Terikatnya 5-fosforibosil pirofosfat (disintesis dari fosforilasi ribosa 5-fosfat) pada atom nitrogen dari orotat. aspartat terikat pada karbamoil.vlsm.Prekursor pirimidin (kiri) dan purin (kanan) (http://free. Reaksi ini dikatalisis aspartat transkarbamoilase. Dehidrogenasi (oksidasi) dihidroorotat menjadi orotat.org. Hidrasi karbamoil aspartat menjadi Reaksi dihidroorotat.1993) dikatalisis dihidroorotase. sehingga menghasilkan orotidin monofosfat (melepaskan pirofosfat). Dekarboksilasi orotidin monofosfat menjadi uridin monofosfat 155 .

Terikatnya aspartat pada asam 5-fosforibosil 5-aminoimidazol 4-karboksilat. Terikatnya amonia pada uridin trifosfat menghasilkan sitidin trifosfat (CTP). Terlepasnya 4 karbon yang semula berasal dari aspartat dari reaksi sebelumnya (Jadi aspartat akhirnya hanya menyumbang nitrogen saja). Pengikatan gugus NH2 dari glutamin. dan karbon dioksida. Karboksilasi 5fosforibosil 5-aminoimidazol. Biosintesis Purin Atom karbon dari purin berasal dari format atau serin. glisin. Atom nitrogen dari purin berasal dari aspartat. Reaksi ini dikatalisis nukleosidadifosfat kinase. Uridin trifosfat merupakan prekursor uridin. Reaksi ini dikatalisis orotidin fosfat dekarboksilase. Reaksi ini memerlukan energi (ATP) dan dikatalisis fosforibosil glisinamida sintetase. Fosforilasi uridin monofosfat menjadi uridin difosfat (UDP).(UMP). Reaksi ini memerlukan energi/ATP. Reaksi ini dikatalisis fosforibosil pirofosfat amidotransferase. sehingga menghasilkan asam 5-fosforibosil 4-N suksinokarboksamida 5aminoimidazol. Tersisipnya glisin ke 5-fosforibosilamin. sehingga menghasilkan 5fosforibosil 5-aminoimidazol. dan glutamin Sintesis cincin purin dimulai dari terikatnya atom nitrogen glutamin pada fosforibosil (berasal dari fosforibosil pirofosfat) menghasilkan 5-fosforibosilamin. sehingga menghasilkan 5-fosforibosil 4-karboksamida 5-amidoimidazol. Terikatnya formil pada fosforibosil glisinamida. Reaksi ini dikatalisis nukleosidamonofosfat kinase. sehingga menghasilkan 5-fosforibosil N formilglisinamida. Fosforilasi uridin difosfat menjadi uridin trifosfat (UTP). 156 . Reaksi ini dikatalisis fosforibosil aminoimidazol sintetase. Reaksi ini dikatalisis fosforibosil aminoamidazol karboksilase. Pembentukan struktur cincin pada fosforibosil N formilglisinamidin.sehingga menghasilkan 5-fosforibosil N formilglisinamidin. sehingga menghasilkan asam 5-fosforibosil 5-aminoimidazol 4-karboksilat. Timidin disintesis dari metilasi UTP. Reaksi ini dikatalisis fosforibosil formilglisinamida sintetase. Reaksi ini dikatalisis fosforibosil formilglisinamidin sintetase dan memerlukan energi. Reaksi ini dikatalisis fosforibosilaminoamidazol suksinokarboksamida sintetase. glisin. Sitidin trifosfat merupakan prekursor sitidin. sehingga menghasilkan 5-fosforibosil glisinamida.

1993) Reaksi ini dikatalisis adenilosuksinat liase. Pembentukan cincin (kedua) dari 5fosforibosil 4-karboksamida 5-formamidoimidazol. Asam nukleat dari makanan akan dikatabolisme menjadi asam urat (purin)dan β-alaninatau β-amino isobutirat (pirimidin)dan CO2. NH3. Semua sel dalam tubuh dapat mensin-tesa purin dan pirimidin. 2009) 157 . IMP merupakan prekursor dari semua nukleotida purin. sehingga menghasilkan inosinat monofosfat (IMP).Gambar Biosintesis purin (Kimball. Reaksi ini dikatalisis fosforibosil amidoimidazol karboksamida formiltransferase. sehingga menghasilkan 5-fosforibosil 4-karboksamida 5-formamidoimidazol. Terikatnya formil ke 5-fosforibosil 4-karboksamida 5amidoimidazol.Tidak ada purin atau pirimidin dari makanan yang digabung dgn asam nukleat jaringan Purin Pirimidin Nukleotida (masterprima. Reaksi ini melepaskan air dan dikatalisis inosinat siklohidrolase.

komponen utama membrane sel. biosintesis fatty acid. Jalur anaerobic terjadi pada beberapa (gram-negative bacteria) seperi Escherichia Coli dan Salmonella typhimurium. Pertama. Turunan CDP akan bereaksi dengan serine untuk membentuk fosfolipid fosfatidilserin dan dekarboksilasi yang menghasilkan phosphatidylathanolamine.ACP memberikan atom karbon pada rantai. Sebagian besar mengandung fatty acid atau turunannya.. Bakteri anaerobic dan beberapa bakteri aerobic membuat ikatan rangkap selama sintesis fatty acid dengan meng-dehidrasi hidroksi fatty acids. Fatty acid tak jenuh disentesis dengan dua cara. Sintesis ini biasanya diproses dengan jalan phosphatidic acid. Banyak dari mikrobia fatty acid merupakan rantai lurus.macam lipid ditemukan pada mikroorganisme terutama pada membrane sel. Pada jalan ini. Gram negative bacteria mempunyai fatty acid siklopropana (fatty acid dengan satu atau lebih cincin siklopropana pada rantainya) Sintesis fatty acid dikatalisis oleh fatty acid synthetase komplek dengan asetil koA dan Malonyl-koA sebagai substratnya dan NADPH sebagai donor electron. β-keto yang berasal dari reaksi kondensasi awal dipindahkan dengan proses tiga langkah yang melibatkan dua reduksidan senuah dehidrasi. Beberapa diantaranya tidak jenuh (mempunyai satu atau lebih ikatan rangkap). bakteri sintesis phosphatidylethanolamine. Dehidroksiaseton phosphate mejadi gliserol 3-phosphate. protein kecil yang membawa rantai fatty acid yang berkembang selama sintesis. Sebuah CDP (Cytidine diphosphate) yang mempunyai peran sama seperti adenosine difosfat. (gram-positive Bacteria) seperti Lactobacillus plantarum dan clostridium pasterianum ) dan sianobakteria. Malonyl-ACP bereaksi dengan fatty acid-ACP untuk menghasilkan CO2 dan fatty acid –ACP yang lebih lama. Sintesis terjadi setelah asetat dan malonat ditransfer dari koenzim A ke grup sulfyhydril dari ACP (Accetyl Carrier Protein). Fosfolipid adalah komponen utama dari membrane sel eukariotik dan prokariotik. Fatty acid disiapkan untuk penambahan dua atau lebih atom karbon. Fatty acid adalah asam monokarbolik dengan rantai alkil panjang yang mempunyai serangkaian atom. Bakteri eukariotik dan aerobic seperti bacillus megaterium membangun sebuah jalur aerobic menggunakan NADPH dan O2. 158 . Dua asam nukleat berbeda dalam gula berbeda dalam nukleitida yakni deoksiribosa dan ribose. dan biosintesis asam amino. CO2 tersebut hilang ketika Malonyl. O O _ + R (CH2)9-C-SCoA + NADPH + H +O2→ R-CH=CH-(CH2)7-C-SCoA+NADPH++2H2O Sebuah ikatan rangkap terbentuk diantara karbon 9 dan 10 dan O2 tereduksi menjadi air dengan dengan electron yang diberikan oleh fatty acid dan NADPH. kedua. Oksigen tidak diperluakan untuk sintesis ikatan rangkap dua pada jalur ini.Seperti yang dijelaskan sebelumnya ada dua tipe asam nukleat yakni DNA dan RNA yang disusun oleh building blocks nukleotida. Walaupun begitu. komponen. ATP digunakan untuk menambahkan CO2 ke Asetil-koA.atom karbon. sebuah membrane lipid yang komplek terbentuk dari hasil glikolisis. tetapi beberapa ada yang bercabang. melalui pembentukan awal CDP-diacylglyserol. beberapa mikroorganisme membutuhkan CO2 demi pertumbuhan yang baik tetapi itu tidak dapat dilakukan tanpa kehadiran fatty acid seperti oleic acid (fatty acid rantai 18 tak jenuh . fosfat adalah hidrolisis dari phospatidic acid oleh diacylglycerol dan fatty acid ketiga diberikan oleh hasil triagliserol. Katalisator sintesis menambahkan dua atom karbon pada rantai terakhir faaty acid dalam dua proses. Mikroorganisme eukariotik seringkali menyimpan karbon dan energi sebagai triacylgliserol. G. gliserol teresterifikasi tiga fatty acid. Carbon dioksida sangat diperlukan dalam sintesis fatty acid tetatpi tidak secara permanen terbentuk. Sintesis Lipid Bermacam. Kehilangan CO2 membuat reaksi ini berkesudahan. Malonil-koA berasal dari karboksilasi ATP dari asetil koA. Gliserol berasal dari reduksi glikolitik intermediet. yang mana kemudian akan teresterifikasi dengan dua fatty acid menjadi asam phosphatidik. membentuk Malonyl-koA. Polimer keduanya dibuat dari formasi ikatan kovalen antar gula dan fosfat.

Rintangan atau hambatan pada setiap tahap pada sintesis memperlemah dinding sel dan bisa mengakibatkan osmotic lisis. 2. menghasilkan residu D-alanin. Fosfat dihasilkan selama proses. Jika interbridges (jembatan dalam) pentaglisin diperlukan. Asam amino ditambahkan secara berurutan menjadi UDP-NAM untuk membentuk rantai pentapeptida (dua terminal D-alanin ditambahkan sebagai dipeptida) Energi ATP digunakan untuk membuat ikatan peptide tetapi tRNA dan ribosom tidak terlibat. Alfonsina AAT (115061100111027) “ apakah dalam siklus glukeogenesis yang merupakan proses pembalikan glikolisis. Seperti misalnya penisilin menyerang reaksi transpeptidasi dan basitrasin yang menghalangi defosforilasi bactoprenol rophosphate. Unit pengulang Peptidoglikan NAM-NAG yang sudah sempurna diangkut menyeberangi membrane menuju permukaan luar oleh pembawa bactoprenol pyrophosphate 6. 8. glisin ditambahkan menggunakan Molekul glisil-tRNA bukan ribosom 5. Sintesis peptidoglican adalah sintesis dengan proses multi step. LAMPIRAN Pertanyaan dan jawaban Pertanyaan lisan 1.komponen peptodoglican melalui membrane hidrofobik. Sintesis peptidoglikan mudah diserang dan mengalami gangguan oleh agen antimikroba. Dua partisipan carrier yakni UDP (Uridin Difosfat)dan baktoprenol. NAM-Peptida ditrnasfer dari UDP menuju baktoprenol fosfat pada permukaan membrane. Rantai polisakarida akan saling berhubungan melalui pentapeptida atau jembatandalam (interbridges) Sebuah struktur yang rumit (berkelit-kelit atau berseluk beluk ) membutuhkan proses biosintesis yang rumit juga.Coli. Hanya aka nada sebuah kelompok yang bereaksi dengan subterminal D-alanin. Pada E. 4. karena reaksi sintesis terjadi di dalam dan di luar membrane sel. ATP digunakan untuk membentuk terminal ikatan peptide didalam membrane.H. Unit Peptidoglikan diletakkan pada akhir rantai peptodoglican untuk memperpanjang oleh unit pengulang. Peptide cross-link rantai peptidoglikan terbentuk oleh transpeptidado. UDP-NAG menambahkan NAG ke NAM untuk membentuk unit pengulang peptidoglikan. Proses yang sama terjadi kepada interbridges terlibat. Sintesis peptidoglican terjadi dalam delapan tahap : 1. Energi atp tidak lagi dibutuhkan ketika transpeptidasi yang terjadi di luar. Naktoprenol ialah karbon-55 alkohol yamh terletak pada NAM oleh pirofosfat dan memindahkan komponen. asam amino yang bebas dari asam diaminopimelik menyerang subterminal D-alanin. Turunan UDP dari (N-acetylmuramic acid dan N-acetylglucosamine) di sintesis kritoplasma. Hal ini terjadi pada gram positive bacteria yakni (staphylococcus aureus). Sintesis peptidoglikan Dinding sel bakteri mengandung mengandung molekul komplek peptidoglican yang mencakup rantai polisakarida panjang yang terbuat dari pertukaran asam N-asetilmuramik (NAM) dan residu Nasetilglukosamin (NAG). 7. Pembawa bactoprenol kembali kedalam membrane. dapatkah kedua siklus berjalan secara bersama-sama?” 159 . Rantai Pentapeptida terletak pada NAM. 3.

Freshsya Zatalini (115061100111003) “ Apakah persyaratan dari asimilasi bagi mikroba? Bagaimana bakteri yang tidak punya klorofil melakukan asimilasi? Jawaban 160 . pigmen karatenoid. tapi berdasarkan prinsip. karena pada konsentrasi yang tinggi akan menjadi racun . AMP menghambat sintesis adenilosuksinat dari inosinat. lalu maksud kotak kecil ditengah itu apa? (menunjuk gambar) ” Jawaban “ gambar di tengah itu penjelasan dari proses awal sintesis purin yakni dimulai terikatnya atom nitrogen glutamine pada fosforibossil (berasal dari fosforibosil pirofosfat) menghasilkan 5. Berdasarkan bakteriaklorofil yang dimiliki oleh anoksegenik. Bakteri-bakteri ini dapat melakukan berbagai macam metabolisme. seperti bakteri dari genus Rhodobacter. dan Heliobacteria(white. Bakterioklorofil yang dimiliki bakteri ini dapat digunakan sebagai salah satu ciri morfologi dengan melihat spektra maksimumnya. Pertanyaan Tertulis 1. Karena pada dasarnya regulasinya berbeda” Alberus Ardika (115061101111005) “ tadi dijelaskan dalam presentasi siklus sintesis purin prosesnya. bakteri fotosintetik purple (sulfur dan non sulfur). dan fermentasi.prinsip biosintesis dijelaskan bahwa jalur anabolisme dan katabolisme (dalam hal ini merupakan glikolisis dan glukeogenesis) tidak pernah berjalan bersama walaupun banyak enzim yang digunakan bersama. Sebagian besar bakteri fotosintetik ungu non sulfur anoksegenik.fosforibosilamin. meraka ini dikenal dengan nama kelompok bakteri fotosintetik anoksigenik. dan bakterioklorofil. sedang GMP menghambat perubahan substrat dari sintesis AMP. bakteri fotosintetik hijau (sulfur dan non sulfur).” 3. organisme-organisme ini pada umumnya merupakan penambat nitrogen yang hidup bebas. maka kelompok ini bibagi menjadi .2. lalu senyawa-senyawa yang dihasilkan itu untuk apa?” “ Reaksinya adalah seperti ini • Fotosintesis bakteri ungu non belerang • CO2 + 2CH3CHOHCH3 → (CH2O) + H2O + 2CH3COCH3 • Fotosintesis bakteri hijau belerang • CO2 + 2H2S → (CH2O) + H2O + 2S Berdasar pada sumber yang saya baca pada keadaan anaerob tidak diproduksi oksigen. pada umumnya menujukkan resistensi yang tinggi terhadap oksianion logam tanah jarang. bakteri ini telah diketahui sejak awal abad ke-20 ketika pertama kalinya diisolasi oleh Hans Molisch. oleh karena itu penambahan larutan oksianion (biasanya K2TeO3) memungkinkan isolasi kelompok bakteri tersebut secara selektif. Jawaban “ walaupun siklus glukeogenesis reversible. Reinanto pandu (115061107111009) “ dalam fotosintesis anoksigenik kan ada reaksinya. respirasi anerobik. seperti TeO3-2 dan SeO3-2. konsentrasi sulfid harus benar-benar ditekan serendah mungkin. Ada beberapa mikroorganisme yang mampu melakukan fotofosforilasi dalam keadaan anaerob. Reaksi ini dikatalisis fosforibosil pirofosfat amidotransferase . fotoautrotop atau fotoheterotrop pada kondisi anaerobik. Kemampuan bakteri ini untuk melakukan fotofosforilasi karena adanya piranti fotosintesis dalam selnya yang berupa pigmen fotosintesis. Selain itu.itu menghasilkan AMP dan GMP. antara lain .1995) Pada bakteri fotosintetik ungu non sulfur anoksigenik.

5. sulfur. tidak terbatas bakteri yang mempunyai klorofil ataupun tidak. Mekanismenya masing.2. dan nitrogen dalam jumlah banyak untuk biosintesis. Dalam presentasi dan makalah kami dijelaskan tentang asimilasi sulfur. eukariotik ataupun prokariotik itu bisa asalnkan memiliki klorofil. Gregorius Bagas (115061105111005) 161 . karena mikroba membutuhkan asimilasi (fosfor. Sedangkan sintesis Peptidoglikan terjadi pada dinding sel bakteri. Begitu pula dengan sintesis peptidoglikan akan terjadi pada setiap kondisi karena dinding sel bakteri mengandung kompleks peptidoglikan” 3. Yakni merupakan jenis basa yang disintesis dalam bentuk nukleotida untuk membentuk DNA dan RNA. Golongan pirimidin itu ada pada DNA yang terdiri dari timin dan sitosin. Rintangan atau hambatan pada setiap tahap pada sintesis memperlemah dinding sel dan bisa mengakibatkan osmotic lisis. fosfor dan nitrogen. Ridhani Ridha R (115061100111009) “ Pada siklus tersebut kalau tidak salah namanya siklus purimidin kenapa hasilnya tidak purimidin? Mungkin dari siklus yang lain ada seperti itu?” Jawaban : “ sintesis purimidin atau sintesis pirimidin itu sama. Tapi untuk mekanisme dan regulasi sintesisnya sama” Maratus Sholihah (115061100111019) “ apakah benar dari apa yang anda jelaskan bahwa fotosintesis hanya terjadi pada mikroorganisme prokariotik? Kemudian bagaimana untuk yang eukariotik?” Jawaban : “ fotosintesis itu terjadi pada mikroorganisme yang mempunyai klorofil dan dibagi menjadi anoksiganik (tidak menghasilkan O2) dan oksigenik (menghasilkan O2).masing diasimilasi atau dibentuk menjadi molekul – molekul organic melalui rute yang berbeda (tergantung apa yang diasimilasi) Sharfina W (115061105111003) “ Sintesis Purin dan Peptodoglikan terjadi saat kondisi apa? Di bagian mana kedua sintesis itu dapat terjadi?” Jawaban: “ purin adalah jenis basa yang disintesis dalam bentuk nukleotida dan terjadi dalam tingkat sel bakteri karena nukleotida ini akan membentuk building blok dari DNA dan RNA. sedangkan golongan purimidin itu ada pada RNA yang terdiri dari urasil dan sitosin. karena dinding sel bakteri mengandung molekul kompleks peptidoglikan yang mencakup rantai polisakarida panjang yang terbuat dari pertukaran NAM (asan N-asetilmuramik) dan residu NAG (N-asetilglukosamin)” “ sintesis purin terjadi pada bakteri karena basa dari nukleotida akan digunakan untuk membentuk materi pembawa genetic RNA dan DNA. Jadi tidak ada persyaratan. Seperti misalnya penisilin yang menyerang reaksi transpeptidasi dan basitrasin yang menghalangi defosforilasi bactoprenol rophosphate” 6.nitrogen) disamping karbon dan oksigen” “ asimilasi dilakukan oleh semua mikroorganisme yang membutuhkan. bukan pengertian. “ Apakah dalam suatu sintesis itu mengalami hambatan? Jika iya apa?” Jawaban : “ pada sintesis Peptidoglikan mudah diserang dan mengalami gangguan oleh agen mikroba. Penjelasan mikroorganisme prokariotik pada slide adalah sebagai tambahan. “ Asimilasi adalah pembentukan molekul kompleks dari molekul sederhana yang membutuhkan energy yang tinggi. sulfur.” Adit Iqbal (115061105111005) 4. Perlu ditekankan bahwa asimilasi dilakukan mikroorganisme karena mikroorganisme itu sendiri membutuhkan fosfor.

Pada fiksasi nitrogen inilah. Perlu penjelasan lebih bagaimana fotosintesis aerob dan anaerob serta senyawa-senyawa yang dihasilkan 162 . Perlu editing(pendandanan) 3. Tetapi fiksasi nitrogen terjadi pada beberapa bakteri yakni bakteri yang hidup bebas seperti azetobacter klebsiella. bakteri Rhizobium memunculkan sifat amoniak keluar sel bakteri dan mengasimilasi sel legume sekitar. dijelaskan tentang bakteri yang terlibat dalam prosesnya.Anabolisme dan Katabolisme dan memang benar kedua proses tersebut tidak pernah berjalan bersamaan Komentar : 1. Perlu sitasi yang jelas(dituliskan) 2. reduksi asimilasi nitrat dan fiksasi nitrogen. dan Sianobakteri “ Kesimpulan : 1. sel. nitrogen dimanfaatkan untuk tiga hal yakni pembentukan ammonia.“ Pada sintesis nitrogen .sel eukariotik memiliki keterbatasan dalam melakukan ini. bakteri yang hidup bersibiosis tanama legumes seperti Rhizobium. Bakteri apa itu dan perannya apa?” Jawaban : “ Pada asimilasi nitrogen. Telah dijelaskan . dan Methanococcus. clostridium. Proses metabolisme adalah proses yang spesifik dan merupakan proses dasar 2.

Sign up to vote on this title
UsefulNot useful