1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9.

2.1 Strain Industri 2.1.1 Pengertian Strain industri adalah koloni mikrobia (atau hasil biakannya) dengan sifat-sifat fisiologi yang sama sebagai hasil proses isolasi atau rekayasa lainnya untuk memurnikan sifat tersebut. 2.1.2 Syarat Terlepas dari asal-usul suatu mikroorganisme industri, idealnya harus menunjukkan : Stabilitas genetik Efisiensi produksi produk sasaran di mana rute biosintesis harus ditandai dengan baik Terbatas atau tidak ada kebutuhan akan vitamin dan faktor pertumbuhan tambahan Pemanfaatan berbagai karbon rendah biaya dan ketersediaan sumber karbon Dapat dimanipulasi secara genetik Aman, bukan patogen dan tidak menghasilkan produk beracun kecuali jika produk beracun tersebut adalah produk sasaran Siap dipanen dari fermentasi Siap rusak jika produk sasaran adalah intraselular Produksi terbatas oleh produk sebagai produk sampingan untuk meringankan masalah pemurnian selanjutnya Fitur lain yang dapat dimanfaatkan adalah sifat thermofilik atau halofilik yang dapat berguna dalam lingkungan fermentasi. Juga, khususnya untuk sel yang tumbuh dalam suspensi, mereka harus tumbuh dengan baik dalam bioreaktor konvensional sehingga industri dapat meminimalisir kewajiban untuk mengembangkan sistem alternatif. 2.2 Pemurnian Galur (Strain Improvement) 2.2.1 Pengertian Pemurnian galur adalah bagian vital dari pengembangan proses di industri fermentasi. Hal ini dapat mengurangi harga produksi, meningkatkan produktivitas produk yang lebih unggul. Pada beberapa kasus pemurnian galur dapat dilakukan menggunakan metode alami, yaitu rekombinasi genetik yang menyatukan elemen genetik dari dua genom yang berbeda menjadi satu membentuk genotip baru. Strategi lain melalui mutagenesis. Rekombinan dan mutan dipilih dan diseleksi untuk mendapatkan strain yang memiliki karakteristik lebih spesifik untuk proses industri fermentasi. Namun strain seperti ini tidak mungkin bertahan di alam karena gen mereka telah dimanipulasi sehingga tercipta ketidaksetimbangan metabolik. Akibatnya, strain tersebut harus dipertahankan pada media spesifik agar mampu tumbuh. 2.2.2 Tujuan Tujuan dari pemurnian galur ini adalah untuk meningkatkan produktivitas mikroorganisme, untuk mengubah produk metabolisme yang tidak terpakai, untuk memperbarui sumber karbon dan nitrogen sebagai nutrisi bagi mikroorganisme, dan memperbaiki morfologi sel menjadi sel yang lebih baik sehingga dapat memisahkan sel dan produk yang dihasilkan. 2.2.3 Rekombinasi Alami DNA bakteri umumnya dalam bentuk kromosom tunggal dan plasmid; belakangan ini DNA dapat mereplikasi dirinya sendiri. Tiap plasmid membawa hingga beberapa ratus gen tambahan dan ada sebanyak 1000 kopi plasmid per sel. Plasmid tersebut mengandung kode informasi genetik tambahan untuk ciri-ciri yang tidak ditemukan di kromosom DNA bakteri. Tidak seperti organisme eukariotik, bakteri tidak mempunyai bentuk reproduksi seksual. Namun, bakteri itu mampu bertukar beberapa materi genetik melalui proses konjugasi, transduksi, transformasi dan pembelahan biner. KONJUGASI melibatkan kontak antar sel satu dengan sel yang lain, di mana pendonor kontak dengan resipien melalui struktur protein filamen yang dinamakan pilus seks yang menghubungkan 2 sel tersebut berdekatan. Pendonor menyalin semua bagian dari plasmid atau kromosom DNAnya dan dibagikan melalui pilus ke resipien.

Pada TRANSDUKSI, bakteri yang mengandung virus (bakteriofage) berperan sebagai vektor dalam mentransfer gen antar bakteri. Bakteriofage menempel ke sel bakteri dan memasukkan DNA-nya ke inang untuk menggabungkan DNA bakteriofage ke kromosom inangnya. Selama replikasi, bakteriofage memperoleh potongan dari DNA inang. Jika fage-fage tesebut terus memasuki inang-inang baru, mereka mampu menggabungkan DNA asli dan gen-gen yang diambil dari inang sebelumnya ke dalam kromosom inang baru. Bakteriofage, seperti plasmid, juga memperoleh transposon (bagian dari DNA yang memiliki kemampuan untuk berpindah-pindah dari tempat yang satu ke tempat yang lain, dalam kromosom yang sama ataupun yang berbeda); misalnya, dari plasmid ke kromosom dan sebaliknya. Bakteriofage dapat membawa transposon ke dalam sel bakteri inang baru di mana mereka dapat meloncat ke dalam plasmid atau kromosom DNA inang. TRANSFORMASI melibatkan serapan selular bagian DNA dari medium sekitar yang kemudian menjadi tergabung di dalam sel. Pada lingkungan alami, transformasi merupakan proses acak, fragmen DNA tersedia untuk penyerapan yang berasal dari sel yang segaris. Pada eukariot, rekombinasi genetik secara alami terjadi selama reproduksi seksual. Genotif baru dihasilkan dari kombinasi kromosom parental dan sebagai akibat dari peristiwa crossing-over selama meiosis. Belakangan ini melibatkan kerusakan bagian kromosom DNA dan perubahan dari segmen antar kromosom homolog untuk membentuk kombinasi baru. Beberapa fungi yang berperan penting dalam industri, meliputi Penicillium dan Aspergillus, tidak mempunyai fase seksual yang sebenarnya. Namun, siklus paraseksual telah menyediakan rute sehingga strain baru dapat diproduksi. Hal ini dikembangkan saat dua strain haploid yang berbeda secara genetik tumbuh bersama, membolehkan fusi hifa mereka. Peristiwa ini akibat dari pembentukan heterokarion, inti yang mengandung miselium yang berasal dari masing-masing strain. Pembentukan herokarion secara langsung dapat dilakukan secara in vitro dengan menggabungkan protoplas yang dinding selnya telah dihilangkan. Juga, eukariot tertentu termasuk beberapa kapang dan jamur berfilamen, memiliki plasmid autonomous, seperti 2μm plasmid Saccharomyces cerevisiae yang terbukti berguna sebagai vektor dalam rekayasa genetika. 2.2.4 Mutasi Mutasi didapatkan dari perubahan fisik DNA sel, seperti delesi, insersi, duplikasi, inversi dan translokasi dari sepotong DNA, atau perubahan dalam jumlah salinan dari seluruh gen atau kromosom. Penaklukan mikroorganisme untuk mengulangi siklus mutagenesis, diikuti oleh seleksi yang sesuai dan pemilihan organisme yang dapat bertahan, merupakan cara efektif dalam banyak mikroorganisme industri. Mutan dapat muncul secara alami atau juga diinduksi, mereka dianggap sebagai produk dari peristiwa alami. Akibatnya, ada beberapa masalah dalam memperoleh persetujuan dari berwenang ketika teknologi rekombinasi DNA digunakan untuk mengembangkan mikroorganisme untuk industri. Laju mutasi spontan lambat; misalnya pada banyak gen bakteri, laju diperkirakan 10 -10 per generasi per gen. Laju mutasi dapat ditingkatkan dengan menggunakan mutagaen, yang dapat dibedakan menjadi 2 jenis. Mutagen fisik meliputi ultraviolet, radiasi γ dan X; mutagen kimia adalah senyawa seperti EMS, NTG, asam nitrit dan acridine mustards. Mutan terbentuk saat mutagen menginduksi modifikasi dari urutan basa DNA yang hasilnya dalam substitusi sepasang basa, mutasi frame-shift atau delesi besar kemudian menjadi tidak sepasang. Mutagenesis dapat juga diinduksi menggunakan transposon yang dikirimkan menggunakan vektor yang cocok. Mereka memproduksi mutan penginsersi yang rangkaian nukleotida normalnya disela oleh rangkaian transposon. Metode tradisional ini telah berhasil digunakan pada pemindahan warna kuning dari penyiapan penisilin dikarenakan chrysogenin, pigmen kuning dihasilkan oleh Penicillium chrysogenum. Program mutagenesis memiliki keefektifan yang besar dalam meningkatkan produksi penisilin di strain industri pada organisme yang sama.
2

Baru-baru ini, metode yang dikembangkan untuk meningkatkan baik keseluruhan kemampuan mutasi dan laju mutasi dari gen spesifik agar mendapatkan frekuensi maksimum dari tipe mutan yang diinginkan. Mutagenesis langsung ini dengan jelas membutuhkan pengetahuan tentang gen yang mengontrol target produk dan sering gambaran genetik dari organisme. Sebagai tambahan, mutagenesis in vitro sekarang digunakan dalam kombinasi dengan rekayasa genetik untuk memodifikasi gen terisolasi atau bagian dari gen. 2.2.4 Rekayasa Genetika Selama 20 tahun, perkembangan dari teknologi rekombinasi DNA dan metode fusi sel, seperti pembentukan hybridoma untuk produksi antibodi monoklonal memiliki pengaruh besar dalam mikrobiologi industri. Berbeda dengan proses rekombinasi alami, teknologi modern rekombinasi DNA menyediakan banyak kesempatan tidak terbatas untuk memproduksi gen kombinasi baru. Metode ini juga secara spesifik dan terkontrol dan memiliki berbagai macam informasi genetik yang tersedia dari beberapa makhluk hidup dan bahkan organisme yang punah. Teknologi rekombinasi DNA memungkinkan rangkaian gen spesifik dipindah dari satu organisme ke organisme lain dan memungkinkan metode tambahan diperkenalkan ke perbaikan strain. Metode ini dapat digunakan untuk meningkatkan produk dengan menghapuskan kemacetan metabolik di bagian tertentu dan memperbesar atau memperbaiki langkah spesifik metabolisme. Secara keseluruhan, prosedur rekayasa genetika memperbolehkan sifat baru ditambahkan ke kemampuan mikroorganisme industri. Mikroorganisme dapat dimanipulasi untuk mensintesis dan meningkatkan rentangan enzim yang dapat memproduksi senyawa baru atau substrat kompleks yang lebih murah. Karena tidak ada pembatasan untuk gen alami yang ditampilkan mikroorganisme, produksi protein tanaman dan hewan dimungkinkan. Produk berharga yang diproduksi termasuk pertumbuhan hormon manusia, insulin dan interferon. Namun begitu, metode ini tidak secara total menggantikan metode mutagenesis tradisional dan pendekatan kepada kedua metode harus diperhatikan untuk menghasilkan strain improvement yang lebih banyak. Strategi Rekayasa Genetika Untuk Bakteri Rekayasa genetika melibatkan manipulasi DNA. Hal ini memerlukan isolasi awal dan pemulihan gen yang diinginkan dari genom organisme donor. Rangkaian DNA yang terisolasi kemudian dimodifikasi dan pengaturan ekspresi gen mereka diubah, sebelum dimasukkan ke dalam organisme inang melalui sistem vektor termanipulasi yang cocok. Langkah pertama membutuhkan ekstraksi DNA total dari organisme pendonor yang kemudian dipotong dalam urutan yang lebih kecil menggunakan endonuklease restriksi spesifik. Banyak dari enzim restriksi ditemukan pada beberapa spesies bakteri, membuat potongan DNA beruntai ganda yang memiliki urutan spesifik (palindrom) menjadi urutan tunggal. Bagian kecil dari DNA (fragmen restriksi) kemudian dapat bergabung atau disambung ke molekul DNA vektor yang telah dipotong dengan enzim restriksi yang sejenis. Penyambungan dilakukan oleh enzim DNA ligase, dan menciptakan sebuah molekul DNA sintesis. Plasmid dan bakteriofag adalah kloning vektor yang paling berguna. Mereka memainkan peran penting sebagai pengirim sistem untuk memperkenalkan molekul rekombinan ke sel inang melalui transduksi ataupun transformasi. Setelah masuk, mereka mampu mereplikasi diri sendiri sehingga dapat mempertahankan DNA rekombinan dalam sel inang. Pengenalan plasmid rekombinan dalam sel bakteri dapat dicapai setelah treatment kalsium klorida yang membuat membran sel lebih permeabel terhadap DNA. Setelah pengenalan, plasmid mereplikasi dirinya. Dalam beberapa kasus, banyak sekali salinan diproduksi dalam sel inang untuk meningkatkan jumlah DNA rekombinan per sel. Plasmid dapat dirancang untuk mengandung penanda genetik yang baik, seperti resistensi antibiotik, kebutuhan vitamin, dll. Penanda dapat digunakan untuk memilih sel inang yang telah memasukkan plasmid selama transformasi. Bakteriofag adalah vektor kloning yang sangat berguna. Setengah dari genom bakteriofag dapat dihilangkan dan diganti dengan DNA asing. Hal ini dilakukan secara in vitro menggunakan enzim restriksi
3

Masalah umum lainnya pada ekspresi protein heterolog yang juga dapat ditemui dengan beberapa host eukariotik termasuk : 1. hal ini dapat diterima dengan menggunakan dinding sel bakteri.yang mirip dengan cara manipulasi plasmid. aktivitas enzim dapat dideteksi. klon diperbolehkan untuk membentuk koloni pada media padat selektif. Gen asing idealnya harus dihubungkan dengan promotor kuat yang memiliki afinitas tinggi untuk polimerase RNA dan mRNA tertranskripsi harus diterjemahkan secara efisien. gen sintesis dapat disintesis. yang mampu menginfeksi inang Fragmen DNA yang sesuai kemudian dikumpulkan menjadi partikel fag. Gen eukariot mengandung area non-coding. Masalah ini dapat ditangani menggunakan vektor pengekspresi di mana gen asing dimasukkan dalam konfigurasi di bawah kontrol inang. Namun. jika urutan nukleotida gen atau urutan asam amino dari protein produk diketahui. Fragmen DNA yang sesuai kemudian dikumpulkan menjadi partikel fag. dan 3. sekresi lebih sering ke ruang periplasmic daripada ke medium secara langsung. 4 . tujuan utama dari kloning gen adalah mendapatkana jumlah banyak dari suatu produk. Kadang-kadang. bakteri gram negatif mampu untuk mengekspresikan gen dari bakteri gram positif. Akibatnya. Di mana sekresi dalam media dibutuhkan. Atau jika protein rekombinan adalah enzim yang tidak diproduksi oleh inang. kesulitan dalam mencapai pasca-translasi modifikasi protein. Coli. yang akan menimbulkan masalah jika gen langsung ditransfer ke sistem prokariotik. 2. Gen tidak dapat diekspresikan jika Escherchia coli digunakan sebagai inang dan gen yang dimasukkan pada inang bukan dari bentuk strain E. Jika gen asing berhasil mengekspresikan bakteri inang dan membuat protein heterolog. ini mungkin bermanfaat seperti dalam proses downstream. mRNA eukariot dapat digunakan utnuk mensintesis gen yang dapat berfungsi dalam sebuah prokariot. salah lipat dari polipeptida yang menghasilkan sebuah aktif molekul. Untuk beberapa tujuan. menguntungkan bagi ekspresi gen kloning untuk dimanipulasi dengan menempatkan Secara umum. digunakan untuk transformasi atau mentranduksi sel inang. Ini memerlukan penggunaa reverse transcriptase untuk menghasilkan salinan pelengkap DNA atau cDNA dari RNA. Pada tahap ini. Namun. vektor pengekspresi harus mereplikasi hingga jumlah salinan tinggi dan stabil. menyebabkan degradasi cepat mereka dengan protease. yang mungkin terakumulasi membentuk inklusi tubuh di dalam sel. Coli. Pembatasan Inang Prokariot Seringkali. mewakili seluruh urutan DNA / gen dari genom donor. sehingga bakteri gram negatif tidak bisa mudah melintasi membran luar. misalnya gen heterolog. glikosilasi atau amidasi. klon spesifik yang berisi molekul DNA rekombinan yang diinginkan dapat diidentifikasi. deteksi dapat dicapai dengan penggunaan reaksi antibodi spesifik dengan protein. Selain itu. keberadaan tantangan lebih lanjut pada beberapa organisme mengeluarkan lebih efisien dari yang lain. Sekresi protein rekombinan sering disukai untuk stabilitas produk dan membuat proses downstream memulihkan produk yang kurang bermasalah. Pada bakteri gram negatif. Hal ini menghasilkan perpustakaan DNA yang terdiri dari individu klon yang mengandung molekul DNA rekombinan yang berbeda. Setelah itu. untuk memaksimalkan produksi proetin asing. Perbedaan antara ekspresi gen prokariot dan eukariot harus diperhitungkan. Urutan sinyal dari 20-25 asam amino membantu jalan protein melewati membran sel. seperti pembelahan. intron. Namun. tidak mudah untuk diekspresikan. Sekresi protein lebih sulit dari faktanya karena harus disintesis dengan ekstra urutan asam amina pada terminal akhir N. yang mampu menginfeksi inang yang dipilih. Atau. setelah dikumpulkan dalam fag atau plasmid. jika dari bakteri gen negatif ke positif. intron dipotong selama proses RNA normal. Tambahan masalah juga muncul jika tujuannya adalah untuk mengkloning dan mengekspresikan gen seperti E. Campuran dari fragmen restriksi yang berasal dari ekstrak DNA utuh. ketidakstabilan produk gen tertentu dalam host mikroorganisme.

fisiologi. 2. relatif cepat laju pertumbuhannya dan mudah mengalami manipulasi genetik. Angusta seringkali lebih baik untuk aplikasi industri karena memiliki versatilitas yang lebih baik. tapi tidak seperti eukariot yang lebih tinggi tingkatannya (seperti sel hewan dan tumbuhan). atau menghilangkan plasmid. Strain ditransformasi oleh plasmid harus dipertahankan di bawah seleksi terus-menerus untuk memastikan bahwa stabilitas plasmid. Awalnya. khususnya methylotroph. Protein individiual dapat direkayasa dengan mengubah beberapa komponen asam amino untuk memodifikasi sifat dan memiliki peluang untuk fitur pembangun dalam membantuk proses downstream. kerjanya pada proses industri farmasi.3 Stabilitas Strain Faktor utama dalam perkembangan strain baru adalah stabilitas strain. Aspek penting dari stabilitas strain adalah pemeliharaan dan penyimpanan stok kultur sehingga mereka atirbut mereka yang dengan hatihati dipilih tidak hilang. dan Pichia pastoris yang memiliki beberapa keuntungan dibanding S. Sebagai akibatnya. urutan lengkap dari genom mikroba. Perkembangan teknologi rekombinasi DNA maju dengan cepat dan kloning gen pada sel hewan dan tumbuhan sekarang diproduksi secara rutin. Namun. Beberapa protein heterolog eukariotik telah sukses diproduksi secara massa dari S. Hal ini melibatkan penyimpanan dalam larutan nitrogen atau lyophilization. retroviruses dan virus simian 40 digunakan untuk stabil mentransformasi sel mamalia. tetapi jika kehilangan sel akan mengekspresikan gen mematikan. A. tumefaciens menginduksi tumor yang melibatkan plasmid Ti dan A. cerevisiae. Sebagai contoh. yang dimediasi oleh plasmid Ri. rhizogenes. enzim phytase sebagai umpan tambahan dan antitrombotic hirudin. yang leibh baik sebagi struktural ketidakstabilan. Mereka memiliki promotor induksi yang kuat dan mampu untuk menghasilkan modifikasi protein post-translasion mirip dengan yang dilakukan oleh sel manusia. Pichia angusta. integrasi gen ke kromosom normalnya adalah solusi terbaik untuk mengatasi banyak masalah ketidakstablitasan. Saccharomyces cerevisiae banyak dipilih karena aman dan mengandung jumlah informasi luas yang telah terakumulasi dari genetikanya. sel bebas-plasmid mati dan tidak boleh diakumulasikan di kultur. Proses downstream juga memiliki masalah yang sedikit karena jamur tersebut tidak mensekresikan banyak protein mereka sendiri ke dalam media. contohnya dalam produksi heterolog dari jamur termasuk vasin hepatitis B. P. vektor berdasarkan virus. 5 . jaringan metabolis dalam mikroorganisme dapat direstrukturisasi dan rekayasa metabolik yang luas memiliki implikasi utama dalam mikrobiologi industri. Rhizogenes menginduksi pembentukan rambut akar. Sebagai tambahan. Transformasi dari sel tumbuhan dikotil dapat ditunjukkan menggunakan plasmid yang berasal dari bakteri tanah Agrobacterium tumefaciens and A. Relatif kecil rekayasa genetika telah diimpelementasikan untuk memperbaiki produksi dari metabolit yang ada.Pembatasan Inang Eukariot Strategi lain yang lebih baik untuk mengekspresikan gen heterolog eukariotik sering mempergunakan inang eukariot yang sesuai yang akan menunjukkan semua kebutuhan modifikasi protein post-translasi dan sekresi. Sel mengekspresikan repressor selama mereka memiliki plasmid. memberikan kegiatan katabolik baru dan memperbaiki kinerja fermentasi. Jamur lain dapat pula menjadi inang yang baik. Pada in vivo. Strain tersebut dibangun dengan penanda “lethal” di kromosom dan repressor dari penanda ini terletak di plasmid. Juga. Namun. Beberapa masalah dapat diatasi dengan menmbangun plasmid dengan hati-hati dan penempatan gen penting dalam plasmid. termasuk organisme “food grade” menstimulasi kemajuan lebih jauh dalam rekayasa metabolik. Ketidakstabilan segregasi dapat pula diatasi dengan membangun strain pembunuh yang membutuhkan penanda spesifik pada plasmid untuk bertahan hidup. Namun. seperti virus bovine papiloma. disebut stabilitas segregasi. cerevisiae. jamur ini dengan mudah dan murah tumbuh pada skala industri. produk jamur relatif sedikit yaitu 1-5% dari total protein dan beberapa protein disimpan dalam periplasma. Ketidakstabilan dihasilkan dari penghapusan dan penyusunan ulang plasmid rekombinan.

Hal ini terjadi karena pada proses transduksi. Ayu Indah Wibowo (115061100111011) Dijawab : Gregorius Bagas Bagaimana bisa bakteri mengalami transformasi? Apakah terjadi pada kondisi yang khusus? Atau terjadi pada bakteri tertentu? . Kontak antar sel bakteri 2. Albertus Ardika (115061101111005) Dijawab : Alfonsina Pada proses transduksi.Mikroorganisme (bakteri) yang ditempati sebagai media berkembang biak bagi virus akan mati. (Budiyanto. pecahnya dinding bakteri inang sehingga virus-virus baru akan terbebas. tetapi virus ikut membelah bersama bakteri. (Old and Primrose. lisis. pembelahan virus ada lisis dan lisogenik.Yang menyebabkan pecah adalah kondisi virus yang berada di dalam mikroorganisme sudah “matang” sehingga virus siap keluar dengan cara memcah dinding dari bakteri inang (fase lisis). Tahap eklifase. DNA virus masuk ke sel inang dan menghancurkan dinding sel bakteri menggunakan enzim lisosom. Sedangkan pada daur lisogenik. virus mengalami daur litik. Apakah memang mikroorganisme tersebut hilang dan menjadi apa waktu mikroorganisme tersebut hilang? Jelaskan! . 1986) 4. 2010) 2. stelah mencapai dinding dari mikroorganisme tersebut. penetrasi. Adanya proses modifikasi dalam inang 4. perakitan virus dalam jumlah besar. (Old and Primrose. Tahap pertama adalah adsorpsi yaitu fase di mana virus menempel dan menginfeksi bagian tertentu dari dinding bakteri hospes. 1989) 3. Kondisi morfologi (kemampuan untuk membentuk rambut getar / fili) 5. Sehingga pada daur lisogenik ini. virus akan menghancurkan dinding bakteri inang dan menyebabkan bakteri mati. (115061102111001) Dijawab : Gregorius Bagas Pada video proses transduksi. Apa yang menyebabkan pecah? . mikroorganisme yang ditempati virus itu waktu virus keluar dari mikroorganisme tersebut hilang. metode apa yang digunakan virus untuk menginjeksi agar menjadi banyak jumlahnya? Setau saya. Pandu Rahmat Pinasthiko (115061107111001) Dijawab : Gregorius Bagas Pada saat di video transduksi.Transformasi terjadi karena : 1. Tahap kedua. virus tidak memecahkan dinding bakteri dan keluar dari bakteri. Tahap sintesis. virus hanya mengalami tiga tahap. virus merusak dan mengendalikan DNA bakteri hospesnya. Homologi DNA bakteri yang bersangkutan 3. ada yang pecah pada saat proses konjugasi. yang mana? Apakah salah satu atau keduanya? .LAMPIRAN PERTANYAAN 1. Teza Nur F. yaitu penginfeksian virus ke bakteri inangnya. Dewi Ariesi R (115061105111007) 6 . Tahap terakhir. Pada fase lisis. Perlunya gen khusus seperti gen TRA untuk proses konjugas (Brown. menggabungkan DNA virus ke DNA bakteri inang untuk membentuk calon virus baru dan ikut membelah bersama bakteri. 1989) 5.Metode replikasi virus (reproduksi virus) untuk memperbanyak diri yang digunakan pada proses transduksi adalah daur litik.

1. dan pendonor? Jelaskan spesifikasi bakteri untuk setiap kemampuannya tersebut! Apakah mungkin satu bakteri mengalami lebih dari satu kemampuan? Bakteri yang dapat melakukan transduksi adalah bakteriofag. yaitu bakteri penerima DNA / bakteri yang tidak memiliki faktor F (F-). 2. Bakteriofag adalah bakteri yang diinjeksi oleh virus. yang satu memberikan potongan DNAnya ke bakteri yang lain. untuk membantu proses pernafasan. hanya pada kondisi-kondisi tertentu seperti yang telah dijelaskan di jawaban point pertama. - Dijawab : Alfonsina Bakteri yang seperti apa yang dapat melakukan transduksi. Meskipun demikian. transformasi ataupun konjugasi) namun kemampuan tersebut tidak terjadi secara bersamaan. hasilnya dapat diwariskan pada keturunannya. Strain yang stabil. Pembentukan Media Pada umumnya fermentasi membutuhkan media cair.- - 6. - - 7. 2005). Bisa saja. satu spesies bakteri dapat memiliki lebih dari satu kemampuan (transduksi. Bakteri yang dapat melakukan transformasi adalah bakteri sejenis yang memiliki potongan DNA yang sejenis pula. dirusak kesetimbangannya dengan masuknya virus ke strain sehingga virus dapat mengambil alih kerja DNA strain dan terjadi mutasi yang tidak diinginkan pada strain. 2006) Dhanang (115061101111007) Dijawab : Adit Iqbal Dampak dari mutagenesis itu apa saja? Tolong dijelaskan? Mutia Dhana F. Nutrisi mikroorganisme harus terbentuk/ terformulasikan untuk mendukung proses sintesis dalam membentuk produk yang diinginkan begitu juga biomassa sel dan metabolik tertentu (Waites. 8. Bakteri pendonor adalah bakteri yang memiliki faktor F+ (bahan genetik. bisakah strain tersebut mengalami ketidakseimbangan? Mengapa? Strain dapat mengalami ketidaksetimbangan jika terdapat faktor pengganggu. transformasi. (Schaum. Media fermentasi harus memenuhi kebutuhan nutrisi mikroorganisme dan mendukung proses teknik perlakuan objek. dan dilakukan oleh manusia. 2005) 2. 7 . apa yang membuat nitrogen cair tersebut berfungsi untuk penyimpanan galur? Winda Fauzi Istiqomah (115061101111003) Dijawab : Alfonsina Kunci dari stabilitas strain adalah menjaga kesetimbangan strain tersebut. Transduksi terjadi saat virus mengalami fase litik (keluarnya virus dari tubuh bakteriofag). 9. 2006) Sharfina Widyaningrum (11506110511103) Dijawab : Alfonsina Kapan terjadi perpindahan secara konjugasi. DNA) yang memiliki tonjolan pada dinding tubuhnya yang berfungsi untuk menempel dan mendonorkan DNAnya ke tubuh bakteri resipien. apa syarat-syarat tersebut? Pada slide stabilitas strain. (115061100111007) Dijawab : Adit Iqbal Apakah syarat menjadi bakteri pendonor? Jika ada. (Walyo. transformasi dan transduksi pada mikroba? Syarat apa saja untuk melakukan mutasi buatan? Konjugasi terjadi saat bakteri pendonor (bakteri yang memiliki faktor F+ (bahan genetik. Salah satu contoh faktor pengganggu adalah virus. fermentasi substrat padat juga banyak digunakan. 1. dkk. Transformasi terjadi saat bakteri dengan spesies sama. (Schaum. DNA)) bertemu dengan bakteri resipien (bakteri tanpa faktor F (F-)) dan mendonorkan DNA bakteri pendonor melalui tonjolan sitoplasma. Syarat untuk melakukan mutasi buatan adalah adanya perubahan materi genetik / DNA.

karena produk yang dihasilkan tidak mahal. Zn dam Mo (hidayat. 2006) Umumnya yang disebut makronutrien adalah yang dibutuhkan dalam jumlah yang besar seperti C. dalam proporsi yang serupa dengan dengan adanya sel pada mikroba (Waites. Kebutuhan media secara umum termasuk didalamnya adalah sumber karbon. 0. Penyusun beberapa enzim Berat kering (%) 8 20 50 14 1 3 0. misalnya biji-bijian. produk bernilai lebih mahal sehingga penggunaan substrat dapat dipilih yang lebih dominan agar dihasilkan produk yang lebih banyak. Tabel 1. asam nukleat dan koenzim Penyusun protein dan beberapa koenzim Penyusun asam nukleat. 2006) Pada fermentasi antibiotika. Kebanyakan fermentasi. bahan baku yang digunakan tidak boleh mahal.03 Molybdeum (sumber: Hidayat. fosfolipid dan koenzim Kofaktor pada sejumlah reaksi enzim (ATP) Kofaktor pada beberapa enzim Kofaktor pada beberapa enzim (protease) Penyusun sitokrom.2 Kobalt 0. H.Suatu strain yang mampu memberikan hasil yang tinggi dari produk yang diinginkan saat dikembangkan dalam laboratorium belum tentu memberikan hasil yang sama ketika diaplikasikan dalam skala industry. sulfur dan unsur lain yang diperlukan dalam jumlah yang sangat sedikit 8 . O dan N. dkk. daging. yang mana sebenarnya semua industri fermentasi menghasilkan energi dan unit karbon untuk biosintesis. 2006).dkk. prosesing serat dan sebagainya. umumnya dipakai bahan baku yang tidak mahal. dan sumber nitrogen. Dalam bidang industri yang diperlukan adalah medium yang cocok secara ekonomi. protein non-heme dan kofaktor pada beberapa enzim Penyusun vitamin B12 Seng.1 0.5 0. Cu. Mesonutrien dibutuhkan dalam jumlah yang lebih sedikit seperti Mg. P. membutuhkan jumlah air yang banyak dalam pembentukan media. kecuali keterlibatan substrat padat. 2006). 2005). Dalam perkembangan produk bioteknologi dibutuhkan medium yang mahal seperti untuk pertumbuhan sel mamalia dan tanaman (hidayat.5 0. S dan mikronutrien dibutuhkan dalam jumlah yang sangat sedikit seperti Fe. Medium kultur harus mengandung semua elemen yang dibutuhkan untuk pertumbuhan mikroba. Namun pada produksi steroid. Dalam fermentasi konvensional. dkk. sumber fosfor. dkk. Medium tersebut dapat berupa padat atau cair (Hidayat.03 Tembaga. dkk. Unsur-unsur yang ada pada mikroba Unsur Fungsi fisiologi Hidrogen Oksigen Karbon Nitrogen Sulfur Fosfor Magnesium Mangan Kalsium Besi Penyusun senyawa organik Penyusun senyawa organik Penyusun senyawa organik Penyusunan protein.

ini penting untuk diketahui. 2. dkk. Kesehatan dan keselamatan untuk semua. Percobaan skala kecil. Panas tidak hanya mengurangi komposisi spesifik/ tertentu. begitu juga ongkos penyimpanan misalnya memerlukan pengontrolan suhu. Misalnya. khususnya untuk menguji adanya tabrakan yield produk dan tahap pemulihan produk (Waites. Meskipun demikian. Fermentasi Media Cair 9 . 2005). dan agent antibusa yang mungkin dibutuhkan. Pengendaliannya mudah untuk bentuk padatan ataupun cairan. namun juga membentuk inhibitor by produk (penghalang) yang dapat menjadi pengganggu pada proses downstream (waites. Hal mungkin tidak sebagai keinginan utama. pencampuran. Fermentasi aerobik tergantung pada oksigen yang berkelanjutan sedangkan fermentasi anaerob membutuhkan aerasi awal dari media. Kebutuhan sterilisasi dan potensi masalah perubahan sifat. Pengaruh variasi batch-to-batch harus ditentukan. dimana sumber karbon dan nitrogen hampir tidak dapat ditegaskan dengan jelas. namun perubahan morfologi dapat mempengaruhi produk dan sifat fermentasi yang lain. sering juga menggunakan by produk dari industry lainnya dengan divariasikan komposisi variabel. Ongkos dan pendapatan. 7. dan beberapa mikroorganisme membutuhkan penambahan vitamin. bahan haruslah tidak mahal dan tidak perlu ditanya kualitasnya dan setiap tahun/ sepanjang tahun bahan tersebut dapat didapatkan. sempurnanya. Saat kebutuhan unsur mikroorganisme sudah ditetapkan. Nutrisi media tertentu atau kondisi lingkungan dapat mempengaruhi tidak hanya fisiologi dan biokimia tetapi juga morfologi dari mikroorganisme tersebut. 2. Di dalam beberapa yeast. Sifat fisika dan kimia dalam medium yang terbentuk dapat mempengaruhi operasi sterilisasi. biasanya dipertunjukkan dengan setiap batch baru untuk substrat.1. Fermentasi skala industri pada dasarnya menggunakan pembagian kompleks untuk mendapatkan harga ongkos yang efektif. dkk.1. senyawa induksi atau inhibitor dikenalkan pada tingat/ taraf tertentu dari fermentasi (waites. pendahuluan. namun jika tingkat ketidakmurnian dari substrat tinggi. 4. Level dan range ketidakmurnian dan muncul dan berkembangan produk yang tidak diinginkan selama proses berlangsung. 2005). mempercepat metabolism dapat menekan pembentukan produk. masalah potensial dapat timbul ketika menggunakan senyawa tertentu. Selain itu juga membutuhkan purifikasi pada downstream dan bisa juga meningkatkan biaya penanganan limbahnya. media menggabungkan buffer atau pengontrol pH dengan penambahan asam ataupun basa. Bahan mentah substrat harus disesuaikan dengan ekonominya. Faktor utama yang mempengaruhi pilihan akhir bahan baku tersendiri yang diikuti/ digunakan (waites. misalnya fermentasi bir. Perlakuan ini dapat diangkat untuk memelihara konsentrasi zat (yang mengganggu pembentukan produk) sehingga relatif rendah agar tidak lagi bersifat menekan. 2005). sumber nutrisi yang cocok dapat digabungkan kedalam media untuk memenuhi permintaan ini. Pembentukan. 3. 6. 2005). 5. seperti biotin dan riboflavin. Medium yang mudah disterilkan dengan panas yang relatif rendah adalah yang sangat penting. filament jamur dapat membentuk lempengan. dkk. dilakukan penambahan medium segar secara berkala ataupun kontinyu. maka tidak menutup kemungkinan akan membutuhkan ongkos lebih dan pemulihan yang kompleks. Kebanyakan didapat dari material alami seperti hewan dan tumbuhan. juga harus tersedia. Biasanya. sel tunggal dapat berkembang ke dalam pseudo-miycelium atau flocculate. Konsentrasi produk target yang dicapai. Untuk menagani masalah ini. dan yield per gram substrat yang digunakan.1. pengompleksan sifat viskositas yang mungkin mempengaruhi pergerakan dan aerasi selama fermentasi dan proses tingkat downstream. dkk. Pada beberapa proses. kecepatan pembentukannya.

Temperatur: temperatur berpengaruh pada laju reaksi biokimia selama proses fermentasi Pertukaran gas: pertukaran gas antara fase gas dengan substrat padat mempengaruhi proses fermentasi. yogurt dan kefir (Dharma. 1992). Fermentasi substrat padat dengan kapang mempunyai keuntungan yaitu: (Dharma. kecap. Fermentasi cair dengan teknik tradisional tidak dilakukan pengadukan. Pada kultur labu yang dikocok.5 – 5. Jenis fermentasi ini dan mekanisme pengambilan substrat dengan yang kedua kecuali substrat bersifat cair. Juga tidak dilakukan sterilisasi. aerasi. Proses fermentasi cair modern dapat dikontrol lebih baik dan hasil uniform dan dapat diprediksi. fermentasi asam cuka. pengatur suhu (pendingin atau pemanasan) dan pengaturan pH. Fermentasi media (substrat) padat mempunyai kandungan nutrien per volume jauh lebih pekat sehingga hasil per volume dapat lebih besar. 1992). 3. 2. . 1992) Kadar air: kadar optimum tergantung pada substrat. organisme. Fermentasi media cair diartikan sebagai fermentasi yang melibatkan air sebagai fase kontinyu dari sistem pertumbuhan sel yang bersangkutan atau substrat baik sumber karbon maupun mineral terlarut atau tersuspensi sebagai partikel-partikel dalam fase cair. Produk dari fermentasi media padat misalnya oncom. Fermenatasi yang tidak diagitasi dimana substratnya larut dalam fasa cair. Garam dan zat hara lain mungkin terlarut dalam air. 1992).1. Jenis fermentasi ini dikerjakan dalam suatu labu atau gelas yang cocok atau yang lebih modern dengan menggunakan fermentor dimana substratnya larut sempurna dalam air. difusi oksigen.0 cm untuk produksi yang sangat tinggi. pertukaran gas. namun mengandung air yang cukup sekalipun tidak mengalir bebas. Adapun faktor yang mempengaruhi fermentasi media padat diantaranya: (Dharma. perebusan dan pengukusan mematikan banyak mikroba competitor (Dharma. 2.2. 1992) Fermentasi yang diagitasi dimana substratnya larut dalam air. Pada fermentasi ini substrat larut dalam air tetapi medianya tidak diagitasi atau dikocok. berbeda dengan fermentasi teknik fermentasi cair modern melibatkan fermentor yang dilengkapi dengan: pengaduk agar medium tetap homogen. 1992) Medium yang digunakan relative sederhana 10 1. Pengambilan substrat melalui fase cair. Fermentasi cair meliputi minuman anggur dan alkohol. Medium didistribusikan berupa larutan yang dangkal dalam suatu baki atau dalam suatu wadah yang mempunyai permukaan yang luas dan dalamnya media biasanya 2. Fermentasi yang diagitasi dimana zat yang tak larut dalam air tersuspensi dalam fasa cair. 3. Fermentasi yang diagitasi dimana zat cair yang tak larut dalam air tersuspensi dalam fase cair. agitasi dilakukan dengan bantuan alat pengocok (shaker). tetapi meningkatkan resiko kontaminasi dengan bakteri. Konsentrasi substrat dalam media dapat bervariasi mulai dari satu persen sampai pada suatu keadaan yang menyerupai bubur. Pengambilan substrat oleh mikriba biasanya disertai dengan produksi suatu faktor yang dapat melarutkan yang mungkin sifatnya ekstraseluler atau terletak didalam dinding dalam air sehingga partikel substrat tersipresi secara merata dalam medium yang mengandung air agar terjadi kontak dengan mikroba secara maksimum. Jenis-jenis fermentasi media cair yang dapat dilakukan adalah sebagai berikut: (Dharma.1. 1. Fermentasi media padat Fermentasi media padat merupakan proses fermentasi yang berlangsung dalam substrat tidak terlarut. Pada fermentor agitasi dikerjakan dengan pengaduk yang dijalankan oleh motor dan dapat dibantu oleh aerasi (gelembung udara). Pada fermentasi ini substrat zat padat tidak larut dalam air tetapi dalam bubuk-bubuk halus yang tersuspensi dalam sejumlah air yang banyak. Kisaran kadar air yang optimal adalah 50-75%. Pengambilan substrat oleh mikroba melalui fase larutan dalam air. dan tape (Dharma. dan tipe produk akhir. Kadar air yang tinggi akan mengakibatkan penurunan porositas. 4. namun pemanasan. 2. volume gas.

nilai yang didapatkan dapat menceritakan pada kondisi yang spesifik dengan memvariasi pH dan temperatur.11 Escherchia coli 0.43 Pseudomonas aeruginosa 0. sehingga Y dapat ditentukan. Kondisi medium tempat pertumbuhan fungi mendekati kondisi habitat alaminya. 2005) - 11 . Pertumbuhan yield (Ycarbon) pada medium minimum dengan variasi sumber karbon dan energy Yglucosa Yethanol Ymethanol Yoktana Pertumbuhan aerob Aspergilus nidulans 0.56 0. dkk.54 1. Konsentrasi nitrogen bervariasi dari 3-15 %. yang dapat merubah nilai Y. Tabel 2. Meskipun demikian.36 Penicillium chrysogenum 0.07 Saccharomyces cereviceae 0. Selain itu juga untuk biosintesa.52 Phicia angusta 0. dkk.68 Escherchia coli 0. Oleh karena itu karbon merupakan bahan yang paling besar dalam medium kultur (hidayat. Inokulum dapat disiapkan secara sederhana. 2006). Ruang yang diperlukan untuk peralatan fermentasi relative kecil. pembentukan produk. 2005) Ycarbon (g/g) = Pada fermentasi komersial perhitungan koefisien yield untuk semua nutrisi biasanya menjadi dasar. Dengan memvariasi konsentrasi awal dari substrat pembatas pertumbuhan yang kemudian diplotkan dengan total pertumbuhan pada konsentrasi disetiap batch. 4. Berdasarkan berat mikroba. dan pemeliharaan sel.51 0. 3. 6.63 Pertombuhan anaerob Moorella thermacetica 0. Kebutuhan karbon dapat ditentukan dari koefisien hasil biomasa (Y) maka: (waites. Setiap nutrient dapat dihitung melalui rangkaian perlakuan pada percobaan batch-culture dimana substrat yang spesifik hanya menjadi media pembatas pertumbuhan dan nutrient yang lain sebagai excess.2. sekitar 50% berat mikroba adalah karbon.2. Aerasi dihasilkan dengan mudah karena ada ruang udara diantara tiap partikel substrat.13 Klebsiella pneumonia 0. 5. Sumber Karbon Dengan mengecualikan alga dan bakteri autotrof yang menggunakan karbondioksida sebagai sumber karbon. mikroba yang digunakan dalam industri membutuhkan senyawa organik sebagai sumber karbon dan energi.61 Candida utilis 0.12 (Sumber: Waites.43 Pseudomonas species 0. 2. Produk yang dihasilkan dapat dipanen dengan mudah.12 Saccharomyces cereviceae 0. karena air yang digunakan sedikit. dkk. Karbon merupakan unsure yang paling penting. Jenis/ variasi organisme juga dapat menujukkan perbedaan koefisien yield (Y) pada substrat yang sama.

Kapang tertentu tidak dapat menggunakan sukrosa. Jumlah molekul ATP yang dibentuk dari sumber karbon dan energi dalam medium dapat dihitung berdasarkan berat kering yang diperoleh sebagai fungsi ATP yang dihasilkan selama katabolisme sumber energi (hidayat. Beberapa jasad dapat menggunakan lebih dari satu sumber karbon. Fosforilasi oksidatif Dalam kasus ini energi diubah selama pemindahan electron dalam rantai respirasi. seperti manitol (hidayat. Biomassa ini diasumsikan mengandung 50 % karbon dan mikrobia mampu mengubah 50% karbon pada substrat menjadi karbon pada substrat menjadi biomassa secara aerob. Sebagai contoh penelitian mula-mula menggunakan medium yang mengandung substrat berlebihan dan ini memungkinkan diperoleh berat kering sel bakteri maksimum perliter (misalnya 40 g). Senyawa karbon yang digunakan dapat berasal dari senyawa C2 sederhana (asam asetat. etanol) sampai senyawa kompleks (polisakarida. dkk. Sebagian besar mikroba dapat menggunakan berbagai tipe nutrisi yang telah diketahui. karena mikroba tersebut tidak menggunakan banyak substrat untuk memperoleh energi. Molase 12 . dkk. dkk. protein) dan senyawa aromatik. tergantung harga. misalnya Rhizopus dan Sordaria. Jika 12 pasang electron dapat digunakan dari tiap molekul glukosa yang dimetabolisme melalui glikolisis pada siklus kreb maka akan diperoleh 36 molekul ATP. fluktuasi pasar dalam menggunakan surplus (hidayat. Jadi metabolism aerob menghasilkan (36+2)/2 = 19 kali lebih tinggi dari pada ATP secara anaerob.56 dan 0. Fosforilasi substrat Oksidasi substrtat adalah hilangnya electron disertai oleh sintesis fosfat kaya energy yang akan dipindah lewat ADP dengan membentuk ATP. Industri fermentasi dapat memilih antara beberapa bahan utama. 2006) Gula murni seperti glukosa dan sukrosa umumnya mahal bila digunakan dalam industri dan biasanya dicari sumber karbon yang murah. Sebagai contoh adalah Methylomonas dan Methylococcus yang hanya menggunakan metana dan methanol sebagai sumber karbon dan energi (waites. Kebanyakan kapang menggunakan glukosa sebagai sumber karbonnya. mikroba mendapatkan dua molekul ATP dari tiap molekul glukosa.1. dkk. Misalnya S. Tiga molekul ATP diperoleh dari tiap pasang electron yang dipindah dari NADH ke oksigen. ceriviciae. dkk. dkk. 2006). Hal yang menarik adalah penggunaan limbah pertanian atau industri. Jadi selama glikolisis.Perbedaan dapat juga tetrjadi pada satu individu misalnya Saccharomyces cereviceae tumbuh pada glukosa yang menpunyai koefisien biomasa (Y) 0. Secara umum. laktosa didegradasi menjadi glukosa dan galaktosa. 2006) 1. Ada pula mikroba yang hanya dapat menggunakan substrat terbatas. Pada sumber karbon lain tidak dapat tumbuh dengan baik. 2. 2. Energi diperoleh terutama melalui 2 jalan: (hidayat. 2005).2. 2005).12 g/g pada kondisi aerob dan anaerob (waites. 2006). Ini memungkinkan untuk menghitung jumlah minimum substrat karbon yang dibutuhkan dalam medium untuk memperoleh biomassa. dkk. 2006). sehingga medium harus mengandung: 40 x (100/50) x (50/100) = 40 g karbon/L Jika sumber karbon adalah glukosa maka jumlah yang harus ditambahkan dalam medium: (40 x 180)/72 = 100 g glukosa/L (hidayat. mikroba aerob mengubah substrat karbon dalam jumlah lebih besar (±50 %) menjadi biomassa dibanding mikroba anaerob. Pertumbuhan yang terjadi disebut pertumbuhan diauksi. Kebanyakan kapang tidak dapat tumbuh pada gula alcohol.

dkk.2. Sebaliknya karbohidrat dalam molase siap untuk difermentasi tanpa perlakuan pendahuluan karena berbentuk gula (hidayat. Pati Polisakarida ini tidak siap untuk digunakan seperti monoskarida dan disakarida. Komposisi dari ekstrak gandum biasanya mengandung 90% karbohidrat dalam basis kering. tergantung pada mikroorganismenya. 2006) 2. asam amino dan protein dengan kelompok karbonil dari penurunan gula. Komposisi molase Komponen Persentase Air 17-25 Sukrosa 30-40 Dektrosa 4-9 Fruktosa 5-12 Gula reduksi lain 1-5 Karbohidrat lain 2-5 Abu 7-15 Senyawa nitrogen 2-6 Asam-asam non nitrogen 2-8 Lilin. 13 . Komposisi molase dapat dilihat pada tabel 3. Persiapan ekstrak pada dasarnya sama dengan pemasakan bir. Molase tebu kaya akan biotin. Sterilisasi media yang mengandung ekstrak gandum harus dikontrol dengan hati-hati untuk mencegah pemanasan berlebih. Molase adalah limbah industri gula yang tentunya lebih murah. 2. Mengandung 62% gula yang terdiri dari sukrosa 32%. dkk. Ekstrak gandum juga mengandung beberapa vitamin dan kira-kira 5% substansi nitrogen. 2005). maltosa atau maltotriosa (waites. yang mana mungkin atau tidak mengalami metabolism. dkk. asam pantotenat. Ekstrak gandum Ekstrak cair dari gandum dapat dibentuk seperti sirup yang secara khusus digunakan untuk sumber karbon yang biasanya untuk pembentukan filament pada jamur. protein. 2006). dan 10 % maltotriosa sebuah trisakarida. fosfor dan sulfur. dkk. keton dan aldehid. Dimana terdiri dari 20 % heksosa (glukosa dan sedikit fruktosa).2. tiamin. 2005). produksi ini mengandung dekstrin bercabang dan tidak bercabang (15-20%). 55% disakarida (umumnya maltose dan sedikit sukrosa).3.2. dikarenakan faktor biaya (waites. ragi dan actinomycetes. Molase berbeda dengan bahan baku yang umum digunakan dalam produksi alkohol seperti jagung dan kentang. dkk.- Glukosa dan sukrosa murni jarang digunakan dalam fermentasi skala industri. sterol dan fosfolipid 0. Muncullah produk kondensat berwarna coklat hasil dari reaksi kelompok amino dari amin. dkk. Bahan ini mengandung karbohidrat yang disimpan sebagai pati sehingga harus mengalami perlakuan awal dengan memasaknya dan membutuhkan kerja enzim untuk menghidrolisis pati menjadi gula yang dapat difermentasi.1-1 (sumber: Hidayat. dkk. namun dapat secara langsung mengalami metabolism dengan produksi amylase oleh miroorganisme. Unsur yang menurukan gula dan asam amino cenderung menghasilkan produk reaksi maillard ketika dipanaskan pada pH yang rendah. glukosa 14% dan fruktosa 16% (hidayat. 2005). khususnya pembentukan filament jamur. enzim ekstra seluler menghidrolisis substansi yang merupakan campuran dari glukosa. Kandungan nitrogen organik sedikit. 2005). Tabel 3. 2006). peptide dan asam amino (waites. Tidak hanya karena warnanya yang berubah tetapi juga hasil hilangnya materi yang menyebabkan fermentasi dan produk beberapa reaksi yang menghalangi pertumbuhan mikroorganisme (waites. Lagi pula.

2006). 2011) Dalam dunia industri.4. Walaupun demikian ini dapat berpotensi tinggi yaitu sebagai sumber yang dapat diperbarui dari fermentasi gula saat dihidrolisis khususnya pada biokonversi menjadi etanol (waites. Asam sulfat dengan konsentrasi 0. komposisi SWL tergantung kayu yang digunakan. dkk. Selulosa biasanya dihidrolisis sebelum dapat digunakan sebagai substrat. Sedikit mikroorganisme yang dapat langsung digunakan. Untuk diperbolekannya dalam fermentasi. Angiospermae memberikan Sulphite Liquor yang mengandung 3% gula yang 70 %-nya adalah pentosa (terutama silosa). Gambar 1. yang mengandung paling banyak glukosa. 1998). Jamur berfilamen (Tricoderma viridae) dan bakteri (cellulomonas sp) merupakan mikroba yang sering digunakan. sedangkan gymnospermae menghasilkan liquor yang mengandung gula 2% dengan 75%-nya adalah heksosa (terutama manosa). 2. namun ini dapat juga didapatkan dari cereal yang lain atau potongan akar. proses perombakan atau pemecahan ikatan pada selulosa adalah proses hidrolisis enzimatik pada lignoselulosa (Mooney et al. 2005). dkk.Pati jagung adalah yang paling banyak dipakai. hutan. lapisan lignin dan memberikan area sempit untuk enzim menyerang.2.5. yang mana terbentuk dari 3 polimer yaitu: selulosa. Sulphite Waste Liquor Sulphite Waste Liquor (SWL) dari industri kertas mengandung gula dari hidrolisis hemiselulosa dalam kayu.5% biasanya digunakan pada 150o-185oC. 2006). tetapi penggunaan mikroba selulolitik memungkinkan diperolehnya protein mikroba secara langsung dari limbah selulosa tanpa perlakuan. dkk. pati biasanya dikonversi menjadi sirup gula. Berikut merupakan gambar lignoselulosa. Ini umumnya digunakan pada fermentasi substrat padat untuk memproduksi jamur yang bervariasi. Ada 2 cara pretreatment yang biasa digunakan 14 .4. dkk. hemiselulosa dan lignin. terjadi proses kontinyu (proses symba) dikembangkan di Swedia untuk produksi biomassa menggunakan khamir Endomycopsis fibulinger untuk menghidrolisis pati menjadi gula yang dapat difermentasi. Setelah dihidrolisis meggunakan enzim tanaman atau amylase mikroba. Struktur lignoselulosa dan pre-treatmen (sumber: Anonymous. Ini pertama-tama berubah menjadi agar-agar kemudian dihidrolisis dengan mengencerkan asam atau enzim amilolitik (waites. 2. Beberapa hidrolisis asam dikembangkan selama perang dunia ke II. ini sama sulitnya dengan menghidrolisis. Hidrolisis asam pada pada selulosa kayu itu sendiri memberikan 65-85% gula yang dapat difermentasi. 2005). Lignoselulosa tersedia dari pertanian. Dalam proses kontinyu kemungkinan didapat dari sirup bubuk gergaji yang mengandung 4-5% gula pereduksi (campuran glukosa dan pentosa) dengan hasil 45-55% (hidayat. Candida utilis akan menggunakan gula ini untuk pertumbuhannya (hidayat. limbah industri maupun domestik. Komponen dari selulosa adalah bagian kristalin. selulosa Selulosa paling dominan ditemukan sebagai lignoselulosa dalam dinding sel tumbuhan.

dkk.5 1-2 6-8 63-70 2. bahan diperkaya dengan isoparafin. Nocardia. vitamuin B12 dan asam giberelik (waites.4. protein sel tunggal. Disakarida ini secara pembentukannya digunakan dalam fermentasi penicillin dan ini juga dapat digunakan dalam fermentasi alcohol. Acinetobacter (A.2 juta ton protein susu. sedangkan pada proses organosolv lignin dalam bentuk cairan organic dapat didegradasi dengan menggunakan katalis inorganic seperti asam sulfat H2SO4 atau HCl (Aziz and Sarkanen. Sepanjang tahun produksi whey di dunia lebih dari 80 juta ton. Oleh karena itu laktosa pekat sering disiapkan untuk fermentasi selanjutnya dari penguapan whey disertai dengan pemindahan protein susu yang digunakan sebagai misalnya. asam laktat. Whey Whey adalah by produk cair dari suatu indutri harian (industri keju). 2005).4.untuk menghilangkan lignin yaitu dengan delignifikasi oksidatif dan proses organosolv (Sun and Cheng. yaitu sebagai protein sel tunggal (PST). Bahan ini cukup mahal untuk dijual. Hidrokarbon mempunyai rumus CnH2n+2 dapat berbentuk lurus ataupun rantai bercabang (iso) yang sukar didegradasi oleh semua mikroba. 2. Bacillus. lipolytica secara ekonomis memberikan hasil yang baik (hidayat. dkk.7. Sejumlah bakteri mampu tumbuh pada hidrokarbon. 2006). dan dari famili Enterobacteriaceae. Candida lipolytica hanya memetabolisme normal parafin. 15 . 2002). dkk. Dalam fraksi petroleum seperti bahan bakar mungkin mengandung hidrokarbon lain (parafin siklik atau aromatis) yang biasanya kurang tersedia untuk dimetabolisme. Strain dari genus Pseudomonas. seperti untuk terjadinya metabolism hanya sedikit mikroornaisme yang dapat melakukannya. dkk. Setelah tumbuh pada fraksi minyak petroleum. Beberapa bakteri dapat mengasimilasi normal parafin (n-alkana) dan normal olefin (n-alkena). 2006). Crypococcaceae mampu menggunakan hidrokarbon. sering digunakan untuk pakan babi (Hidayat. Merupakan hasil samping keju yang merupakan protein yang sulit menggumpal seperti kasein pada keju. mengandung lebih dari 1 juta ton laktosadan 0. Hidrokarbon sangat sesuai sebagai sumber karbon dan energi untuk pertumbuhan mikroba. 2006) Tabel 4. Whey susu diperoleh dari limbah pembuatan keju dengan komposisi seperti tabel 4. tidak memfermentasi laktosa. Micobacterium (M.6. S. Laktosa pada umumnya kurang berguna sebagai umpan awal pada fermentasi dibandingkan sukrosa. corynebacterium. 1989). alkana dan alcohol Minyak (fraksi kasar minyak petroleum) mengandung C10-C18 10-25% hidrokarbon parafin yang sangat mudah digunakan mikrobia. Sejumlah khamir. dkk. 1989). Calcoaceticus). Ini untuk proses penyempurnaan (hidayat. cerevisiae contohnya. 2006) - Jumlah (g/ L) 45-50 7-9 1. Smegmatis). Cladosporium resinae mengasimilasi bahan bakar minyak dan menyebabkan korosi pada tanki bahan bakar. Isoparafin mempunyai sifat yang mirip dengan bahan bakar. suplemen makanan. Komposisi Whey susu (g/L) Komponen Laktosa Protein Senyawa nitrogen terlarut Lipid Garam-garam mineral Berat kering (sumber : Hidayat. Pada proses delignifikasi oksidasi ini lignin dapat didegradasi dengan menggunakan katallis enzim peroksida H2O2 (Azzam. Spesies dari genus Candida seperti C.

Cincin aromatik pertama mengalami hidrosilasi kemudian dihidrogenasi menjadi senyawa dihidroksi yang terbuka. 2005).2 C5H9NO4 + 4. Hidrokarbin siklik dan paraffin rantai pendek biasanya bersifat racun pada konsentrasi tinggi sehingga yang dikembangkan adalah membuatnya pada konsentrasi rendah (hidayat.5 kali (10. dkk. namun proses ini tidak ekonomis (waites.Khamir tidak mengasimilasi alkana yang lebih pendek dari C9. asam amino. 2006) 1. Beberapa strain Pseudomonas dapat tumbuh pada heksana. Penggunaan hidrokarbon membutuhkan oksigen lebih banyak daripada karbohidrat. Kemungkinan pembentukan biomasssa: (hidayat. dkk. dkk. dan oktana sebagai sumber karbon dan energi. Hidrokarbon alifatik bukanlah satusatunya yang dapat digunakan untuk metabolisme. Walaupun demikian. Oksigen yang dibutuhkan 3 kali lipat dan panas yang dihasilkan 3. tetapi ini akan lebih bermasalah ketika berkembang pada alkana. 2006). kebutuhan oksigen dan panas fermentasinya tinggi. Namun ini akan terlalu mahal jika dipakai sebagai sumber karbon umum. 2005) Etanol lebih rendah sifat toksiknya dibandungkan methanol dan digunakan satu-satunya oleh banyak mikroorganisme. Metana digunakan sebagai sumber karbon pada sebagian kecil mikroorganisme. industr menggunakan tergantung pada harga petroleum yang berlaku. Kemurnian methanol siap didapatkan dan ini sangat larut dalam air. biomassa optimum yang diperoleh pada C16-C20.1 O2 + NH3  1.1 H2O (hasilnya adalah 320 % atau 208 % berdasarkan berat secara molekuler tetapi dengan kebutuhan oksigen 4 kali lebih besar) Dalam produksi asam glutamate. dkk. biotransformasi ke asam asetat dengan menggunakan bakteri sisa fermentasi utama (waites. sedang alkana C11 dan C18 adalah yang paling banyak diasimilasi. dan sikloheksana). termasuk di dalamnya sebagian besar antibiotik dan produk-produk fermentasi anaerob. dengan 1 atau lebih kemungkinan jalan melalui oksigenasi. heksadekana digunakan untuk menggantikan glukosa. Katabolisme normal parafin terjadi melalui oksigenase. Glukosa C6H12O6 + 2. Sejumlah produk fermentasi dapat diperoleh dari hidrokarbon. senyawa tunggal biasaya yang banyak cocok untuk fermentasi mikoba. Pencampuran. tidak dapat dihasilkan oleh hidrokarbon tersebut. n-alkana dari panjang ikatan C10-C20 dapat dimetobolisasikan oleh mikroorganisme tertentu. Lemak dan minyak 16 .4 H2O (Hasilnya adalah 120 % . Walaupun demikian.8. asam laktat. Sebagai contohnya adalah pembentukan biomassa (komposisi global C5H9NO4). Namun banyak senyawa. Methanol mempunyai persentase karbon yang cukup besar dan relatif murah. vitamin. Jadi kultur Methylomonas methanica mengoksidasi propane menghasilkan campuran asam propionate dan aceton (hidayat. Metabolism hidrokarbon harus melalui pembukaan cincin. styerene naphtalena.2 C5H9NO4 + 5. namun konversi produk metanol lebih disukai untuk industri fermentasi dengan masalah teknis yang cukup sedikit.73 kkal/g dari glukosa). heptana. dan pigmen karatenoid) dapat diperoleh dari hidrokarbon sama baiknya dengan sumber karbon konvensional seperi karbohidrat. Oksigen dapat bereaksi dengan C1 dan C2. 1. Selama fermentasi methanol. Kemungkinan alkana dengan berat molekul rendah adalah racun.2.98% berdasarkan berat secara molekuler) 2. Heksadekana C16H35 + 8. toluene. Beberapa perusahaan menggunakan methanol dan produksi protein mikroba pada tahun 1970an dan awal 1980an.45 O2 + NH3  3.35 kkal/ g asam glutamate yang dibentuk heksadekana sebanding dengan 2 kali denagn 2. dkk. Meskipun hanya sedikit mikroorganisme yang dapat merombaknya. 2006). Sejumlah produk (asam lemak. Sejumlah hidrokarbon siklik komersia dapat pula digunakan ( benzene. karena mampu larut dalam lemak sehingga mampu merusak fosfolipid pada membrane sel.

Dimana seperti yang kita ketahui bahwa jika produksi keju meningkat. dan kedelai. pada fermentasi alkohol dari glukosa. whey ini dapat membentuk emulsi. minyak dapat berguna secara khusus dalam operasi fed-batch. LAMPIRAN Pertanyaan 1 (Nanang Adi) Mengapa kontaminasi media fermentasi perlu dimasalahkan? Padahal kita mengetahui bahwa fermentasi pada dasarnya juga menggunakan bakteri. whey ini merupakan protein yang sukar menggumpal. Bakteri saccaromyces dapat memproduksi alkohol jika kondisi pada keadaan anaerob. palm. jarang digunakan dalam fermentasi. Namun seiring berkembangnya ilmu pengetahuan. maka orang lama-kelamaan mengetahui bahwa sesungguhnya whey ternyata masih bisa digunakan sebagai bahan baku. Jika dalam medium fermentasi terdapat bakteri lain yang tidak ikut andil dalam pembentukan produk. Minyak mengandung energi lebih per unit berat dibanding karbohidrat. yang mana menurut kandungannya yang ternyata didalamnya masih mengandung nutrisi penting. untuk membuat keju. maka dalam proses fermentasi. Hanya saja. Minyak nabati dan minyak ikan biasanya digunakan sebagai sumber karbon primer atau suplementer. Karbohidrat menempati volume yang paling besar. Misalnya. jagung. Minyak nabati kebanyakan tersusun atas asam oleic dan asam linoleic. dkk. Pertanyaan 2 (Lilis Triyowati) Mengapa whey itu harganya mahal? Padahal whey merupakan hasil produk sampingan pembuatan keju. dimana ada sumber karbon. nah oleh karena itu. Apa bakteri lain dapat hidup di dalam media tersebut (glukosa)? Jawabannya adalah iya. maka bakteri yang hanya (harus) hidup hanyalah bakteri saccaromyces cerreviceae. Karbohidrat biasanya disiapkan pada larutan encer dengan konsentrasi tidak lebih dari 50% (w/w). buah zaitun. dengan kapasitas cadangan dibutuhkan utuk memuat penambahan ke sumber karbon (waites. Pertanyaan 3 (Ridhani Rida) Bagaimana proses fermentasi pada bakteri yang mempunyai 2 keadaan yang berbeda. Jawab: Maksud kontaminasi bakteri pada kasus ini adalah kontaminasi oleh bakteri lain. terdapat bakteri tertentu yang dapat mengalami proses fernentasi dalam keadaan aerob ataupun anaerob. Nah ternyata. Namun jika fermentasi ini dilanjutkan dengan keadaan aerob maka fermentasi alkohol oleh bakteri saccaromyces menghasilkan asam cuka. 2005). contohnya dapat diaplikasikan pada pembuatan eskrim. otomatis produksi whey juga meningkat? Lalu apa contoh penggunaan whey? Jawab: Memang dulu whey itu harganya murah. maka keberadaan bakteri tersebut merupakan salah satu bentuk kontaminasi. berbeda dengan protein pada keju (kasein) yang mudah menggumpal. khususnya produksi antibiotic. hanya ada bakteri yang mendukung proses pembentukan produknya. yaitu anaerob dan aerob? Yang tentunya dari pengertiannya saja berbeda dari sumber kebutuhan oksigennya? Jawab: Memang. maka bakteri juga akan bertumbuh dan berkembang didalamnya.Lemak kasar hewani yang kebanyakan tersusun atas gliserida. seperti yang telah dijelaskan pada makalah ini yaitu bakteri saccaromyces. Pertanyaan 4 (Febrika Larasati) 17 . Minyak nabati umumnya terbuat dari biji kapas. Bakteri saccaromyces dapat mengalami metabolism dalam dua keadaan. dan asam stearat. oleh karena itu.

Merupakan suatu bakteri saccaromyces yang sudah dalam bentuk kering. dapatkah dari berbagai sumber misalnya Whey + molase + pati dicampur? Jelaskan! Jawab: Untuk campuran dari berbagai sumber. Pertanyaan 8 (Gregorius Bagas) Tadi dijelaskan bahwa nilai Whey cukup mahal. 1989). mengapa? jika Tidak. Pertanyaan 7 (Alfonsina A. Jadi untuk menghitung kebutuhan karbon yang menyertakan massa dari ragi tersebut. bagaimana proses pre-treatment tersebut? Dan siapa yang melakukan proses tersebut? Jawab: Dalam dunia industri. karena jika kita menghitungnya tidak dalam keadaan bakteri kering. maka yang bersifat membasahinya merupakan suatu media (air). sedangkan pada proses organosolv lignin dalam bentuk cairan organic dapat didegradasi dengan menggunakan katalis inorganic seperti asam sulfat H2SO4 atau HCl (Aziz and Sarkanen. 1989). bukan pada kejunya. Pada proses delignifikasi oksidasi ini lignin dapat didegradasi dengan menggunakan katallis enzim peroksida H2O2 (Azzam. 1998). apa dalam kebutuhan karbon. sebenarnya hal ini bergantung juga dengan produk apa yang ingin kita capai. karena protein pada whey merupakan protein yang sulit untuk digumpalkan. Mengapa? Karena kita memberikan bakteri itu sudah dalam bentuk kering. Seperti industri etanol di brazil yang konsentrasi pada ethanol bukan gula (tebu)? Jawab: Seperti yang telah dijelaskan pada makalah ini. Pertanyaan 6 (Dian Nita) Dari sumber karbon yang sudah dijelaskan. bakteri wajib dikeringkan dahulu? Jawab: Jawabanya iya. bakteri yang basah tidak bisa dikatakan bahwa ia adalah pure bakteri. maka tentunya. proses perombakan atau pemecahan ikatan pada selulosa adalah proses hidrolisis enzimatik pada lignoselulosa (Mooney et al.Pada sumber energi untuk fermentasi yang berupa selulosa dikatakan bahwa perlu dilakukukan proses pretreatment terlebuh dahulu. 2002). bagaimana caranya whey yang sebagai produk sampingan diubah menjadi produk utama? Agar industri berkonsentrasi pada wheynya. tidak seperti kasein yang terdapat pada keju. Misalnya. tidaklah perlu dikhawatirkan.A Torimtubun) Apakah bisa suatu mikroba ditempatkan pada 2 media yang digabung menjadi 1 misalnya media cair (molasses atau yang lain) dicampur dengan media padat (pati atau yang lain) agar mendapat sumber karbon yang banyak? jika bisa. Untuk membuat suatu medium kan kebutuhan karbonnya dihitung. bahwa whey merupakan hasil samping dari pembuatan keju. Ada 2 cara pretreatment yang biasa digunakan untuk menghilangkan lignin yaitu dengan delignifikasi oksidatif dan proses organosolv (Sun and Cheng. Nah untuk menghitung karbon yang memakai perhitungan mikroba dalam keadaan kering. ragi tape. Ini disebut dengan medium semi padat. Pertanyaan 5 (Dianita Citra Dewi) 1). mengapa? Jawab: Untuk pencampuran 2 medium dengan fase yang berbeda dapat dilakukan misalnya pada pembuatan asam sitrat dari ampas singkong dimana media tersebut dicampur dengan media cair (air). 18 . Jika susu tidak difermentasi dengan bakteri (lactobacillus casei) untuk pembuatan keju. kita tidak perlu untuk mengeringkannya terlebih dahulu. dapat langsung dihitung (dengan kita mengetahui massa ragi itu sendiri).

Metanogen Archaebacteria ini dinamai sesuai dengan metabolism energinya yang khas. diproses buat apa? Jawab: Dahulu. maka lama kelamaan orang di dunia mengetahui sebenarnya dalam whey ternyata masih terdapat nutrisi yang masih berguna. dkk. ORGANISME PROKARIOTIK Organisme prokariotik telah dipisahkan menjadi dua kelompok yang berbeda atas dasar studi filogenetik (evolusi) hubungan. A. dalam pengolahan kotoran yang berasal dari sampah dan hewan. mengapa hasilnya dipakai lagi dan harganya mahal? Jika digunakan. ganggang dan tanaman lainnya. khususnya hewan yang memakan 19 . Pada dasarnya molasses masih mengandung gugus gula. Semua sel diisi dengan matriks cairan dan dikelilingi oleh membran sitoplasma. yaitu : (Karmana. 2001). Mereka adalah Archaebacteria atau archaea (bakteri „kuno‟) dan Eubacteria (bakteri „sesungguhnya‟). yang memungkinkan spesialisasi sel. Spesies metanogen lainnya hidup di lingkungan anaerobik di dalam perut hewan. Seperti yang dijelaskan pada jawaban dari pertanyaan febrika larasati. Mereka juga mengandung asam nukleat. dkk. Pertanyaan 10 (Adit Iqbal I) Whey itu dulu dibuang. susu bubuk. Bakteri dari kelompok ini memiliki cirri hidup dalam kondisi lingkungan yang cukup ekstrim. memang whey itu dibuang. Pertanyaan 9 (adit Iqbal I) Pada selulosa bagaimana cara memisah sel pada ikatannya? Jawab: Untuk memisah/ memecah ikatan pada selulosa adalah dengan cara hidrolisis enzimatik. Misalnya. Archaebacteria disebut juga bakteri purba (archae = purba). Banyak diantaranya yang merupakan uniseluler dan lainnya berupa multiseluler. serta hewan yang tergolong sel eukariotik (Waites. eskrim. kemudian diubah menjadi metana yang dijadikan bahan bakar.maka whey pun tidak dapat diproduksi. Namun seiring berkembangan ilmu pengetahuan. Dan berdasarkan lingkungan hidupnya tersebut. Sel adalah unit dasar dari semua organisme hidup. 2001). Archae kelompok ini hidup di lumpur dan rawa tempat mikroorganisme lain yang telah menghabiskan semua oksigen. protozoa. (Waites. Contoh bakteri golongan ini adalah Methanococcus jannaschii. dimana gugus gula tersebut langsung dapat difermentasi. 2008) a. yaitu H₂ digunakan untuk mereduksi CO₂ menjadi (CH)₄. Whey sekarang digunakan untuk bahan pembuatan permen. yang berarti Archaebacteria ini akan teracuni bila terdapat oksigen. Pertanyaan 11 (Freshsya Zatalini) Dapatkah Anda memberikan contoh produk fermentasi yang menggunakan media molase? Jawab: Salah satu produk fermentasi molasses adalah etanol. Metanogen memiliki peranan sebagai pengurai yang penting. Sel dibagi menjadi dua kategori: Archaebacteria dan Eubacteria yang merupakan sel prokariotik. Sehingga produksi whey sejalan dengan produksi keju. tanpa pemasakan terlebih dahulu (oleh enzim) seperti pada jagung dan kentang. pembawa fisik dari informasi genetik. Archaebacteria dibagi kedalam 3 kelompok utama. Metanogen merupakan Archaebacteria yang tergolong anaerob strict (tidak dapat mentolerir keberadaan oksigen). Karena pembentukan whey juga tergentung pada pembentukan keju (karena whey merupakan hasil samping keju). Archaebacteria Archaebacteria merupakan kelompok bakteri yang pertama muncul di Bumi. 1. dan makanan bayi. sedangkan sel-sel jamur. bersama dengan ribosom yang mengambil bagian dalam sintesis protein. terutama terdiri dari lipid dan protein. atau hanya sebagai bahan pakan babi.

Pigmen ini tertanam dalam membrane plasma. (Waites. Inti dan organelnya tidak memiliki membran. bakteri menjadi tidak aktif. Halofil Archaebacteria kelompok ini memiliki cirri hidup di tempat-tempat yang memiliki salinitas tinggi (halo = garam. 1) 2) 3) 4) 5) 6) tumbuhan. Contoh : Pediococcus cerevisiae Sarcina. Contoh : Staphylococcus aureus (penyebab penyakit radang paru-paru) 20 . Archaebacteria halofil memiliki arti pecinta garam atau hidup di tempat yang memiliki salinitas (kadar garam) cukup tinggi. yaitu berupa sel bakteri kokus tunggal. Namun. Sulfolobus yang menempati mata air panas sulfur di Yellowstone National Park. yaitu berupa delapan sel bakteri kokus berdempetan membentuk kubus. Contoh : Streptococcus mutans (penyebab gigi berlubang) Staphylococcus. dkk. Misalnya di danau air asin dan di laut mati. 2. Bakteri yang terkecil. Eubacteria adalah kelompok yang sangat beragam yang dapat dibagi menjadi beberapa kelompok. Spirillium volutans. Pada suatu larutan yang dipenuhi oleh koloni halofil. dkk. (Karmana. yaitu : (Aryulina. a. bakteri pun baru dapat diamati di bawah mikroskop. yaitu berupa dua sel bakteri kokus berdempetan (tergabung secara berpasangan dua-dua). Contoh dari Archaebacteria kelompok ini adalah Halobacterium salinatrium. c. Archaebacteria kelompok ini berperan penting dalam proses pembentukan nutrisi di hewanhewan tersebut. Dialister pneumosintes. terutama yang mengandalkan makanan berselulosa. Dari asal bahasa tersebut. dan philos = pecinta). serta mempunyai dinding sel yang tersusun dari peptidoglikon. USA.b. yaitu berupa lebih dari empat sel bakteri kokus berdempetan secara bergerombol membentuk rantai. yaitu Bakteri Gram Positif dan Bakteri Gram Negatif. yaitu berupa empat sel bakteri kokus berdempetan membentuk rantai.15 . 2001) Ukuran dan Bentuk Bakteri Bakteri merupakan organism mikroskopis dan rata-rata berdiameter 1. Contohnya. Bakteri aktif bergerak pada kondisi lembap. Pada kondisi kekurangan air. Aktivitas tertinggi bakteri terjadi pada kelmbapan 90%. Contoh : Thiosarcina rosea (bakteri belerang) Streptococcus. 1. bersifat uniseluler. Walau berukuran lebih besar dari virus. bahkan dapat menyebabkan kematian. 2006) Bentuk dasar sel bakteri beranekaragam. 2006) Bentuk Bulat (Coccus) Berdasarkan koloninya dibagi menjadi: Monococcus. Contoh : Chlamydia trachomatis (penyebab penyakit mata) Diplococcus. Adapun bakteri yang terbesar. Contoh : Diplococcus pneumonia (penyebab penyakit pneumonia) Tetracoccus. Bakteri ini hidup dengan mengoksidasi sulfur. Archaebacteria ini dapat bertahan hidup dalam lingkungan panas dengan suhu optimum 60⁰C sampai 80⁰C.25 . Eubacteria (Bakteri) Eubacteria adalah bakteri yang bersifat prokariot. bersifat mikroskopik. yaitu berupa lebih dari empat sel bakteri kokus berdempetan secara bergerombol membentuk seperti buah anggur. Termofil Archaebacteria ini memiliki cirri-ciri hidup pada suhu ekstrim (panas). akan membentuk buih berwarna merah ungu yang dihasilkan oleh bakteri orhodopsin. mempunyai panjang tubuh 0. hampir semua bakteri yang terkandung dalam industri hanya dua. panjang tubuhnya . Bakteri orhodopsin merupakan suatu pigmen yang menangkap energy cahaya. Beberapa sepesies memerlukan suatu lingkungan yang salinitasnya sepuluh kali lebih asin dari air laut untuk tumbuh.

2009 21 . yaitu bentuk sel bergelombang. lihat tabel berikut ini : Kistinnah dan Lestari. yaitu berupa dua sel bakteri basil berdempetan. Bentuk Batang (Bacillus) Berdasarkan koloninya dibagi menjadi: 1) Monobacillus. Contoh : Thiospirillopsis floridana (bakteri belerang) 2) Spirocheta. Contoh : Vibrio cholera (penyebab penyakit kolera) Untuk lebih jelasnya. yaitu bentuk sel seperti tanda baca koma.b. Contoh : Treponema pallidum (penyebab penyakit kelamin sifilis) 3) Vibrio. Contoh : Escherichia coli (bakteri usus besar manusia) 2) Diplobacillus. Contoh : Azotobacter (bakteri tanah yang mengikat nitrogen) c. Bentuk Spiral (Spirillium) Berdasarkan bentuknya dibagi menjadi: 1) Spirillum. yaitu berupa sel bakteri basil tunggal. Contoh : Salmonella typhosa (bakteri penyebab penyakit tifus) 3) Streptobacillus. yaitu bentuk sel seperti sekrup. yaitu berupa beberapa sel bakteri basil berdempetan membentuk rantai. 2009 2. Struktur Bakteri Kistinnah dan Lestari.

2006) Struktur tubuh bakteri dibedakan menjadi struktur utama di luar dinding sel dan struktur di sebelah dalam dinding sel seperti berikut ini : (Kistinnah dan Lestari. dkk. Bakteri ini akan berwarna ungu jika diwarnai dengan pewarnaan Gram. bakteri dibedakan menjadi dua. kapsul ini berfungsi untuk menginfeksi inangnya (daya virulensi). juga berfungsi untuk melindungi isi sel. dan Escheria coli. Contohnya : Propionibacterium acnes. ∞ Bakteri gram negatif adalah bakteri yang memiliki dinding sel dengan lapisan peptidoglikan yang tipis. dan Bacillus subtilis. mencuat menembus dinding sel. dapat diamati bahwa stuktur sel bakteri masih sangat sederhana yang tersusun atas dinding sel dan isi sel. Treponema pallidum. tetapi diameternya jauh lebih kecil dari diameter selnya. Perlu kita ketahui bahwa ada beberapa bakteri yang tidak memiliki flagelum yang disebut atrik. monotorik (memiliki satu flagelum pada salah satu ujung sel bakteri). Akan tetapi untuk bakteri penyebab penyakit. dan kapsul.4 tersebut. dkk. (Kistinnah dan Lestari. pili. 1) Flagelum (jamak: Flagela) Bentuk flagela seperti rambut yang teramat tipis. Vibrio cholera. Berdasarkan letak dan jumlahnya. Berdasarkan ketebalan lapisan peptidoglikan dinding sel. jika diwarnai dengan pewarnaan Gram. Untuk lebih jelasnya. struktur seperti kait. Adapun pada lapisan di dalamnya terdapat dinding sel yang sangat kaku sehingga bisa memberikan bentuk dari bakteri itu sendiri. terdapat empat macam bakteri. Permukaan paling luar dilindungi oleh kapsul berupa lapisan lendir yang juga berfungsi sebagai cadangan makanan. Flagela terdiri atas tiga bagian. yaitu : 1. 22 . Bakteri ini akan berwarna merah muda atau merah. Contohnya : Neisseria gonorrhoeae. dan fungsinya untuk pergerakan pada sel bakteri. Struktur Utama di Luar Dinding Struktur utama di luar dinding adalah flagela. yaitu : (Aryulina. Staphylococcus aureus. 2009) Dinding sel bakteri tersusun dari peptidoglikan. 2006) ∞ Bakteri gram positif adalah bakteri yang memiliki dinding sel dengan lapisan peptidoglikan yang tebal. dan sehelai filament panjang di luar dinding sel. yaitu tubuh dasar. 2009) a.Dengan melihat Gambar 4. Panjangnya beberapa kali lebih panjang dari selnya. perhatikan gambar kenampakan bakteri berdasarkan pewarnaan Gram di bawah ini : (Aryulina. yaitu gabungan protein dan polisakarida. Streptococcus mutans.

Pili ini tidak berfungsi untuk pergerakan. Diduga mesosom bisa berfungsi dalam sintesis dinding sel dan pembelahan nukleus. tetapi berfungsi sebagai pintu gerbang masuknya bahan genetik selama berlangsungnya perkawinan antarbakteri. juga berfungsi sebagai tempat perlekatan flagelum. banyak terdapat pada bakteri gram negatif. Sex pilus. Selain itu. asam amino. yaitu sebagai alat untuk melekatkan pada berbagai permukaan jaringan hewan atau tumbuhan yang merupakan nutriennya. Bagi bakteri. dan lebih banyak dari flagela. lebih pendek. 23 . dapat pula menambah kemampuan bakteri untuk menginfeksi. b) Daerah nukleus. Ukurannya dipengaruhi oleh medium tempat tumbuhnya. dan 4. Membran sitoplasma merupakan membran plasma yang membungkus sitoplasma beserta isinya. peritrik (memiliki flagela di seluruh permukaan sel bakteri). Contohnya. lopotrik (memiliki dua/lebih flagela pada salah satu ujung sel bakteri). Kapsul bakteri mempunyai arti penting bagi bakteri maupun organisme lain. dijumpai pada semua sel. Mesosom ini selalu bersambungan dengan membran sitoplasma. 3) Sitoplasma dan Struktur-Struktur di Dalamnya Sitoplasma merupakan cairan yang bersifat koloid dan berisi semua zat yang diperlukan untuk kehidupan sel. pili juga mempunyai fungsi lain. 3. 3) Kapsul Kapsul merupakan suatu bahan kental berupa lapisan lendir. 2) Mesosom Apabila membran sitoplasma mengalami pelipatan ke arah dalam/ invaginasi. mineral. Untuk lebih jelasnya. Ukurannya lebih kecil. b. Selain itu.2. kapsul merupakan penutup atau pelindung dan juga sebagai gudang makanan cadangan. Ribosom ini merupakan biosintesis protein. dalam jumlah yang sesuai dan membuang kelebihan nutrien atau produk-produk buangannya. Selain itu. perhatikan gambar berikut : Kistinnah dan Lestari. bahan nukleus/DNA di dalam sel bakteri menempati posisi dekat pusat sel dan terikat pada mesosom sitoplasma. baik eukariotik atau prokariotik. amfitrik (memiliki dua ataulebih flagella di kedua ujung sel bakteri). tetapi bukan flagela. berisi partikel-partikel RNA protein (ribosom). Bahan ini sebagai alat genetik yang terdiri atas kromosom. Struktur di Sebelah Dalam Dinding Sel Struktur paling umum yang terdapat di dalam dinding sel bakteri adalah sebagai berikut : 1) Membran Sitoplasma Membran ini amatlah penting karena berfungsi mengendalikan keluar masuknya substansi kimiawi dalam larutan sel. 2009 2) Pili (Fimbriae) Bentuknya seperti filamen. Bahan sel yang dikandungnya antara lain seperti berikut. a) Daerah sitoplasma. maka akan menghasilkan suatu struktur yang disebut mesosom. yaitu mampu mengambil dan menahan nutrien seperti gula.

yaitu bakteri yang bersifat kemoautotrof dan bakteri yang bersifat fotoatotrof. mengandung nutrien terlarut yang terbentuk sebagai tubuh inklusi. pembentukannya terjadi di dalam sel bakteri. Penularan penyakit yang disebabkan oleh bakteri dapat melalui makanan. Bakteri kemoautotrof adalah bakteri yang membuat makanannya dengan bantuan energi yang berasal dari reaksi-reaksi kimia. bakteri Escherichia coli yang berperan sebagai pembusuk sisa makanan dalam usus besar dan bakteri Lactobacillus garicus yang berperan dalam pembuatan yogurt. Klorosom mengandung pigmen klorofil dan pigmen lainnya untuk proses fotosintesis. bakteri belerang dengan mengoksidkan senyawa belerang. contohnya Chlorobium (bakteri hijau). bakteri nitrit dengan mengoksidkan NH₃. bakteri tersebut akan membentuk endospora. Dengan demikian. Sama halnya dengan plasmid dalam keadaan lingkungan yang jelek. Vakuola gas memungkinkan bakteri mengapung di air untuk memperoleh cahaya matahari. dan pati. 6) Vakuola gas Vakuola gas terdapat pada bakteri yang hidup di air dan melakukan fotosintesis. 2) Bakteri Autotrof Bakteri autotrof adalah bakteri yang dapat membuat makanannya sendiri. bangkai. Bakteri ini sering disebut sebagai bakteri pembersih karena dapat menguraikan sampahsampah organik sehingga menguntungkan bagi manusia. Endospora ini sebenarnya adalah spora/struktur yang berdinding tebal. Bakteri ini biasanya bersifat merugikan makhluk hidup yang ditumpanginya karena dapat menimbulkan penyakit. pernapasan. 4) Plasmid dan Endospora Pada umumnya bakteri memiliki plasmid berbentuk seperti cincin yang terdapat di dalam sitoplasma. Berdasarkan asal energi yang digunakan. proses oksidasi senyawa tertentu. Pada bagian tubuh ini terdiri atas lipid. Bakteri parasit adalah bakteri yang hidup menumpang pada makhluk hidup lain.c) Bagian zat alir. TBC disebabkan oleh bakteri Mycobacterium tuberculosis. bakteri autotrof dapat dibedakan menjadi dua. dan Nitrobacter. Jika kondisi telah membaik. ataupun kontak langsung dengan penderita. Endospora ini tahan terhadap panas dengan batas sekitar 120° C. kolera disebabkan oleh bakteri Vibrio cholerae. misalnya. maka endospora akan bisa tumbuh menjadi bakteri seperti semula. 24 . misalnya. Contohnya. bakteri nitrat dengan mengoksidkan HNO₂. Bakteri ini dapat hidup secara saprofit dan parasit. baik secara langsung maupun tidak langsung. polifosfat. disentri disebabkan oleh bakteri Shigella dysenterriae. bakteri Thiobacillus thioparus yang menumpuk sejumlah besar sulfur yang tampak seperti granul. dan radang paruparu (pneumoniae) disebabkan oleh bakteri Diplococcus pneumoniae. glikogen. fotosintesis dapat terjadi. sampah. Contoh penyakit yang disebabkan oleh bakteri ini. Klorosom hanya terdapat pada bakteri yang melakukan fotosintesis. atau kotoran. Berdasarkan Cara Memperoleh Makanannya 1) Bakteri Heterotrof Bakteri heterotrof adalah bakteri yang hidup dan memperoleh makanan dari lingkungannya karena tidak dapat membuat makanan sendiri. antara lain. Nitosococcus. 5) Klorosom Klorosom adalah struktur yang berada tepat di bawah membrane plasma. 3. minuman. Fungsinya untuk pertahanan sel bakteri terhadap lingkungan yang tidak menguntungkan. sifilis disebabkan oleh bakteri Treponema pallidum. Jika materi materi ini menumpuk maka akan membentuk granul/globul di dalam sitoplasma. Penggolongan bakteri a. Contohnya. contohnya. Bakteri saprofit adalah bakteri yang hidup pada jasad yang sudah mati.

dari golongan Thiorhodaceae (bakteri belerang berzat warna). bakteri Nitrosomonas. dan energi. Pembelahan biner melintang adalah pembelahan yang diawali dengan terbentuknya dinding melintang yang memisahkan satu sel bakteri menjadi dua sel anak. Faktor lingkungan ini adalah cahaya matahari yang terus-menerus. Dalam satu jam bakteri dapat berkembang biak menjadi berjutajuta sel. kekeringan. Misalnya. misalnya. spora akan tumbuh kembali menjadi satu sel bakteri. bakteri Lactobacillus bulgaricus. dan berbentuk rantai (streptococus). Dua sel bakteri ini mempunyai bentuk dan ukuran sama (identik). bakteri itu disebut bakteri anaerob fakultatif. bakteri yang terdiri dari sepasang sel (diplococcus). antara lain. Pada keadaan optimal. Contohnya bakteri-bakteri yang mempunyai zat warna. sel-sel bakteri dapat mempertahankan diri dengan pembentukan spora. Dalam keadaan normal. Proses pembelahan diri pada bakteri terjadi secara biner melintang. CO₂. Keadaan tersebut juga menunjukkan bahwa meskipun populasi bakteri sangat besar. Akan tetapi. Bakteri ini adalah bakteri yang mengandung zat warna hijau sehingga dapat melakukan fotosintesis. b. Pada kondisi yang kurang menguntungkan. Akan tetapi. Bakteri aerob secara obligat adalah bakteri yang mutlak memerlukan oksigen bebas dalam hidupnya. bakteri asam susu. bakteri dapat dibedakan menjadi bakteri aerob dan bakteri anaerob. 1 ) Bakteri Aerob Bakteri aerob adalah bakteri yang hidupnya memerlukan oksigen bebas. tetap saja dapat dikendalikan oleh faktor-faktor penghambat sehingga peranan bakteri di alam sebagai salah satu pengurai dapat seimbang dengan makhluk hidup produsen dan konsumen. 2) Bakteri Anaerob Bakteri anaerob adalah bakteri yang dapat hidup tanpa oksigen bebas. dan Clostridium tetani. 4. Reproduksi bakteri dapat berlangsung dengan sangat cepat. Bakteri yang hidup secara aerob dapat memecah gula menjadi air. delapan sel membentuk kubus (sarcina). jika bakteri tersebut dapat hidup tanpa kebutuhan oksigen secara mutlak atau dapat hidup tanpa adanya oksigen. Reproduksi bakteri Bakteri dapat berkembang biak secara aseksual dengan membelah diri pada lingkungan yang tepat atau sesuai. yaitu dengan pembelahan biner : 25 .Bakteri fotoautotrof adalah bakteri yang membuat makanannya dengan bantuan energi yang berasal dari cahaya matahari. beberapa jenis bakteri dapat membelah setiap 20 menit. misalnya. Berdasarkan Kebutuhan Oksigennya Berdasarkan kebutuhan oksigennya. kenaikan suhu. Sel anakan hasil pembelahan ini akan membentuk suatu koloni yang dapat dijadikan satu tanda pengenal untuk jenis bakteri. Berikut adalah gambar yang menunjukkan perkembangbiakan bakteri secara aseksual. ada pula jenis bakteri yang akan mati karena perubahan faktor lingkungan. dan adanya zat-zat penghambat dan pembunuh bakteri. seperti tumbuhan hijau. seperti antibiotika dan desinfektan.

bakteri juga melakukan reproduksi 2006) seksual. Konjugasi adalah penggabungan antara DNA pemberi dan DNA penerima melalui kontak langsung. Dalam hal ini. Jadi. Transduksi adalah pemindahan DNA dari sel pemberi ke sel penerima dengan perantaraan virus. c. dkk. a.(Aryulina. Perkembangbiakan parasekual bakteri dapat terjadi dengan tiga cara. 2006) 26 . pada bakteri terjadi pertukaran materi genetik dengan sel pasangannya. dan transduksi. harus terjadi hubungan langsung. Untuk lebih jelasnya. Transformasi adalah pemindahan potongan materi genetik atau DNA dari luar ke sel bakteri penerima. perhatikan gambar di bawah ini : (Aryulina. dkk. perkembangbiakan bakteri yang terjadi dengan cara ini disebut perkembangbiakan paraseksual. secara Selain reproduksi secara aseksual. konjugasi. yaitu transformasi. Dalam proses ini. b. Meskipun demikian. protein virus yang berfungsi sebagai cangkang digunakan untuk pembungkus dan membawa DNA bakteri pemberi menuju sel penerima. Oleh karena itu. tidak terjadi kontak langsung antara bakteri pemberi DNA dan penerima. seperti yang terjadi pada makhluk hidup eukariot. karena bakteri tidak mengalami penyatuan sel kelamin. untuk memasukkan DNA dari sel pemberi ke sel penerima. Bakteri tidak melakukan pembiakan seksual yang sebenarnya.

(Aryulina. atau lumpur. yaitu mengikat nitrogen (mengubah N₂ di atmosfer menjadi senyawa nitrogen yang dapat digunakan tumbuhan). Pada kondisi lingkungan yang buruk. Contoh proteobacteria kemoheterotrof adalah Escherichia coli dan Salmonella. Disebut ganggang lendir karena pada bagian luar dinding selnya terdapat lapisan lendir. Pada Cyanobacteria bentuk benang. Koloni Cyanobacteria dapat berbentuk benang. Reproduksi Cyanobacteria adalah secara aseksual sengan cara membelah diri (pembelahan biner). misalnya Anabaena. Sedangkan baeosit adalah sel-sel bulat kecil hasil reproduksi. Pada beberapa jenis Cyanobacteria. Cyanobacteria. Cyanobacteia tidak memliki alat gerak dan dapat melakukan fotosintesis. Contoh proteobacteria kemoautotrof adalah Rhizobium. Tubuh Cyanobacteria juga memiliki vakuola gas yang memungkinkannya mengapung dekat permukaan air. Spirochetes. Proteobacteria dikelompokkan menjadi bakteri ungu yang bersifat fotoautotrof atau fotoheterotrof. Proteobacteria kemoautotrof hidup bebas atau bersimbiosis dengan makhluk hidup lain. 2) Cyanobacteria Cyanobacteria sering disebut juga ganggang hijau-biru atau ganggang lendir. 1) Proteobacteria Proteobacteria merupakan kelompok terbesar bakteri. yang memiliki intensitas cahaya matahari yang tinggi. Heterokista merupakan sel berdinding tebal yang berguna untuk mengikat nitrogen. Cyanobacteia berukuran Cyanobacteria hidup soliter atau berkoloni. ungu. dan beberapa ion anorganik lainnya. Sebagian besar bakteri ungu anaerob obligat dan hidup di endapan kolam. dan baeosit. fragmentasi bagian dari filamen (hormogonia). Baeosit juga berfungsi untuk melakukan fotosintesis. proteobacteria kemoautotrof. Disebut ganggan hijaubiru karena Cyanobacteria memiliki klorofil seperti halnya ganggang hijau. atau bola berongga. lapisan lendir dapat membantu gerakan secara meluncur. dan proteobacteria kemoheterotrof.5. terdapat tiga macam sel utama. Contoh bakteri ungu adalah Chromatium. Perbedaan Cyanobacteria dengan bakteri fotoautotrof adalah Cyanobacteria menghasilkan O₂ dalam proses fotosintesisnya sedangkan bakteri fotoautotrof tidak menghasilkan O₂. dkk. Cyanobacteria membutuhkan cahaya matahari untuk proses fotosintesis. akinet. dan pigmen tambahan. yaitu: Proteobacteria. Sebagian besar bakteri dalam kelompok ini berbentuk batang dan anaerob fakultatif. Pembelahan biner dilakukan oleh Cyanobacteria bersel satu. akinet terbentuk agar 27 . Klasifikasi Eubacteria Eubacteria dikelompokkan menjadi lima filum. sampai kehitaman. dan pembentukan akinet (spora). sedangkan fragmentasi pada bagian hormogonia dilakukan oleh Cyanobacteria yang berbentuk benang. Pigmen tambahan berupa fikosianin yang berwarna biru dan fikoeritrin yang berwarna merah. dan bakteri Gram-Positif. Berbeda dengan kelompok bakteri yang lain. Chlamydias. Bakteri ungu mengandung klorofil yang terdapat pada membran plasma. Membran fotosintetiknya (membran tilakoid) mengandung pigmen klorofil. karoten. yaitu heterokista. Beberapa jeis bakteri ungu memiliki flagella. Proteobacteria kemoheterotrof meliputi bakteri yang hidup dalam saluran pencernaan manusia dan hewan. Beberapa jenis berperan penting dalam siklus biogeokimia di dalam suatu ekosistem. Rhizobium hidup bersimbiosis dalam akar tanaman kacangkacangan. Pigmen-pigmen tersebut yang menyebabkan warna Cyanobacteria beraneka ragam dari hijau. Cyanobacteria hidup secara fotoautotrof dengan mengasimilasi senyawa sederhana misalnya CO₂. danau. Akinet adalah sel berdinding tebal yang berfungsi untuk pertahanan diri. lembaran. Sitoplasma Cyanobacteria tidak memiliki banyak organel serta tidak memiliki membran inti (prokariot). ion nitrat atau ammonium. merah. 2006).

di dalam selubung terluar. Nostoc hidup bersama dengan jamur membentuk lumut kerak (Lichen) Peltigera. Endospora dibentuk ketika lingkungan miskin akan zat makanan. Simbiosis antara Cyanobacteria dengan organisme lain saling member keuntungan. Contoh Chlamydias adalah Chlamydia psittaci (penyebab penyakit mata. Kelompok bakteri ini merupakan prokariot yang unik karena memiliki dua bentuk sel dalam siklus hidupnya. suhu rendah. 28 . misalnya pantai berpasir atau gurun. Ada yang hidup bebas di lumpur atau air. 4) Chlamydias Chlamydias merupakan kelompok bakteri yang memiliki ukuran paling kecil ( ). Cyanobacteria dapat ditemukan pada berbagai lingkungan. Pada saat tertentu. misalnya : danau. serta hidup di akar tumbuhan paku Cycas. Badan inisial tumbuh dan membelah diri. Dormansi endospora dapat bertahan lebih dari seribu tahun. Bentuk tubuh Chlamydias tidak beraturan. misalnya suhu tinggi. keberadaan Spirocheta mempengaruhi kehidupan manusia karena beberapa jenis menyebabkan penyakit. Salah satu Cyanobacteria. Filamen aksial berfungsi untuk membuat gerakan berputar. Badan inisial membentuk badan dasar kembali dan dilepaskan dari sel inang yang disertai pecahnya sel inang. sebagai parasit dalam tubuh manusia. Namun. Beberapa jenis Cyanobacteria yang dapat mengikat nitrogen berperan sebagai tumbuhan perintis pada habitat miskin nutrisi (makanan). Kedua bentuk sel tersebut yaitu badan dasar (elementary body) dan badan inisial (initial body). endospora menjadi aktif dan membelah diri. 3) Spirochetes Spirocheta bukan merupakan kelompok yang besar dari Eubacteria. Filamen aksial merupakan semacam serabut di sepanjang tubuh. Contoh bakteri gram-positif yang dapat membentuk endospora adalah Bacillus dan Clostridium. 5) Bakteri Gram-Positif Beberapa bakteri gram-positif membentuk endospora (struktur dormansi yang bersifat tahan terhadap panas). akinet dapat membentuk filamen baru. merah. membentuk sel-sel seperti induknya. Cyanobacteria terutama berperan dalam memberikan nutrisi organik pada organisme simbiotiknya. Badan dasar masuk ke dalam sel inang dan berkembang menjadi badan inisial. beberapa jenis Treponema lain yang hidup dalam lambung hewan memamah biak. laut. atau kekeringan. dan beberapa jenis penyakit pneumonia).. Spirocheta memiliki suatu struktur unik yang disebut filament aksial. Sedangkan organisme simbiotiknya memberikan kelembaban dan nutrisi anorganik pada Cyanobacteria.0) dan temperatur tinggi (70⁰C). Contohnya Cyanobacteria berwarna hijau-biru (Anabaena) membuat air sawah tampak kehijauan dan Cyanobacteria berwarna merah (Oscillatoria rubescens) membuat laut di daerah Timur Tengah berwarna merah sehingga disebut Laut Merah. Synechococcus lividus dapat hidup di habitat yang ekstrim. penyakit menular seksual. Anabaena azollae hidup di daun tumbuhan paku air Azolla piñata. atau hidup dalam lambung hewan memamah biak. Contoh Spirocheta antara lain Treponema pallidum (penyebab penyakit sifilis pada manusia). Cyanobacteria dapat terlihat dengan mata telanjang berupa lapisan tipis berwarna hijau-biru. Habitat Spirocheta bervariasi. atau ungu kehitaman. dan rawa. misalnya Nostoc dan Anabaena azollae. Sedangkan jenis lainnya ada yang hidup bersimbiosis dengan organisme lain. Reproduksi secara seksual belum diketahui.Cyanobacteria dapat bertahan hifup. Cyanobacteria yang hidup di air muncul berlimpah sehingga menyebabkan air tampak berwarna seperti warna Cyanobacteria tersebut. batu. Endospora dapat bertahan dalam keadaan lingkungan yang ekstrim. sungai. Sel induk pecah dan endospora dilepaskan. Spirocheta berbentuk spiral dengan panjang Spirocheta merupakan bakteri gram-negatif. dan Leptospira interrogans (penyebab penyakit leptospirosis). Pada kondisi lingkungan yang membaik. tetapi di luar dinding sel. tanah. Jika lingkungan telah membaik. misalnya habitat dengan tingkat keasaman tinggi (pH 4. Chlamydias hanya dapat hidup sebagai parasit dalam sel-sel makhluk hidup lain.

virus tidak dapat bergerak maupun melakukan aktivitas metabolisme sendiri. vius dapat dibiakkan pada telur ayam yang berisi embrio hidup. tetapi beberapa jenis memiliki struktur yang mengeras di luar membran plasma. isi tubuh. Selanjutnya. Virus ini mempunyai ciri-ciri tidak dimiliki oleh organisme lain. Actinomycetes berbentuk filament bercabang yang menyerupai jamur. Tubuh virus terdiri atas kepala.(Waluyo. filamen tersebut membelah diri. 3. Virus tidak dapat diendapkan dengan sentrifugasi biasa. Virus berukuran aseluler (tidak mempunyai sel). Virus hanya dapat berkembang biak di sel-sel hidup lain (sifat virus parasit obligat) karenanya. Actinomycetes yang tidak membentuk spora berkembang biak dengan cara memutuskan ujung filamen dalam bentuk bulat atau batang.20 Anatomi virus(Waluyo. Contoh Actinomycetes adalah Mycobacterium tuberculosis (penyebab penyakit TBC) dan Streptomyces (penghasil antibiotik streptomisin). 2. Beberapa Mycoplasma berukuran lebih kecil dibandingkan Chlamydias. dan serabut ekor.4. kulit(selubung atau kapsid). Untuk bereproduksi virus hanya memerlukan asam nukleat saja.  Gambar. jauh lebih kecil daripada bakteri. tetapi dapat dikristalkan. Contohnya Mycoplasma gallisepticum (dikenal sebagai bakteri terkecil). Ciri lainnya. Actinomycetes berkembang biak dengan membentuk rantai spora di ujung filamen. Mycoplasma tidak memiliki dinding sel. Selain itu irus tidak dapat membelah diri. Virus berukuran amat kecil. 29 . Virus umumnya berupa semacam hablur (kristal) dan bentuknya sangat bervariasi 5.2004) Morfologi virus 1. 4. Virus hanya memiliki sala satu macam asam nukleat (RNA atau DNA). B.Contoh lain bakteri gram-positif adalah kelompok Actinomycetes dan Mycoplasma.2004) Anatomi virus Kepala Kepala virus berisi DNA dan bagian luarnya diselubungi kapsid. VIRUS Virus merupakan salah satu jenis mikroorganisme parasit.

protein.(Winami.2004) Reproduksi virus Untuk berkembang biak virus memerlukan tempat atau lingkungan yang hidup.  Virus yang isi tubuhnya RNA. disebut nukleokapsid. yang masing-masing terdiri dari rantai polipeptida. sintesis. virus akan menghancurkan sel induk setelah berhasil melakukan reproduksi.  Virus yag isi tubuhnya tediri atas RNA. virus radang mulut. virus menginfeksi sel bakteri.2007) 30 .virus tidak menghancurkan sel bakteri tetapi virus berintregasi dengan DNA sel bakteri. Ekor virus terdiri atas tabung bersumbat yang dilengkapi benang atau serabut. contohnya sebagai berikut:  Virus yang isi tubuhnya RNA dan bentuknya menyerupai kubus antara lain. contohnya virus cacar. Pada prinsipnya cara perkembangbiakan virus pada hewan maupun pada tumbuhan mirip dengan yang berlangsung pada bakteriofag. sehingga jika bakteri membelah atau berkembang biak virus pun ikut membelah. dan polisakarida. Kapsid Kapsid adalah selubung yang berupa protein. protein. lipida. yaitu secara litik an secara lisogeni.(waluyo.Pada virus dijumpai asam nukleat yang diselubungi kapsid. Ada dua macam cara virus menginfeksi bakteri.20 Gambar Reproduksi Virus(Winami. Kapsid juga dapat terdiri atas proten-protein monomer identik. yaitu melalui fase adsorpsi. Pada infeksi secara litik. sel hewan. contohnya paramixovirus.  Ekor  Ekor virus merupakan alat penancap ketubuh organisme yang diserangnya. Kapsid terdiri atas bagian-bagian yang disebut kapsomer.  Isi tubuh Isi tubuh yang disebut viorin adalah bahan genetik yakni asam nukleat (DNA atau RNA). sedangkan pada infeksi secara lisogenik.2007) Gambar 4. atau sel tumbuhan untuk bereproduksi. Oleh karena itu. dan banyak lipida. dan lisis.

atau sebaliknya? (Rahma Yulia Rusmo dan Ayu Indah Wibowo) Jawab : 2. 1). Dengan demikian. Dinding Sel . 3. Selain itu. fotosintesis dapat terjadi. terdapat klorosom di dalam selnya. Bagaimana proses bakteri memperoleh makanan? (Gregorious Bagas) Jawab : Jalannya proses dimana bakteri memperoleh makanan adalah dari dinding sel. Membran sitoplasma juga menyediakan peralatan 31 . Membran Plasma – Berfungsi sebagai pelindung molekuler sel terhadap lingkungan di sekirnya. dengan jalan mengatur lalu lintas molekul dan ion-ion dari dalam. ke membran plasma. 2). menjaga keseimbangan nutrien yang terdapat didalam sel. Klorosom mengandung pigmen klorofil dan pigmen lainnya untuk proses fotosintesis. Organel apa yang ada pada eukariotik tapi tidak ada di prokariotik. Membran plasma sangat berguna bagi kehidupan sel karena berfungsi untuk lalu-lalangnya substansi kimiawi dalam larutan atau keluar masuk dari dalam sel.Pada dinding sel terdapat pori-pori sebagai jalan keluar masuknya molekul-molekul.DAFTAR PERTANYAAN BESERTA JAWABAN 1. Klorosom adalah struktur yang berada tepat di bawah membrane plasma. dan kemudian masuk ke dalam sitoplasma. terdapat vakuola gas pada bakteri yang hidup di air dan melakukan fotosintesis. Vakuola gas memungkinkan bakteri mengapung di air untuk memperoleh cahaya matahari. Bagaimana proses fotosintesis pada bakteri? (Vivi Anita) Jawab : Pada bakteri yang melakukan fotosintesis.

maka konsentrasi nutrien akan turun. dan kondisi lingkungannya. Sel memanjang dan terjadi replikasi DNA 2. Karena banyaknya jumlah mikroba yang bisa dihasilkan selama beberapa waktu. 2001). Beberapa spesies bakteri bereproduksi dengan cara membentuk tunas (budding). reproduksi yang diperhatikan hanyalah reproduksi dengan pembelahan biner.  Batch Culture Mikroba jika dikembangbiakkan pada satu medium tertentu. b. elektron. lalu ia memisah. Waktu generasi (generation time) adalah waktu yang dibutuhkan sel untuk membelah (dan populasinya untuk menggandakan diri). 32 . Bakteri pada umumnya bereproduksi dengan cara pembelahan biner. Mikroba membentuk suatu tunas yang terus membesar hingga ukurannya mendekati ukuran sel induknya. PERTUMBUHAN KULTUR MIKROBA Pertumbuhan di sini yang dimaksud adalah peningkatan jumlah bakteri. Sitoplasma . gula.Berfungsi untuk mencerna makanan secara ekstraselular untuk melakukan metabolisme sel. 3). Beberapa bakteri berbentuk filamen bereproduksi dengan menghasilkan rantai konidiospora pada ujung filamen. Pertumbuhan mikroorganisme yang bereproduksi secara biner bisa diplot kurva sebagai jumlah sel yang ada versus masa inkubasi. Pemindahan substansi-substansi tersebut dilakukan dengan cara: a. Kebanyakan bakteri memiliki waktu generasi 1-3 jam. bukan peningkatan ukuran tiap individu. mineral. dan konsentrasi limbah akan meningkat. A. di mana kebanyakan bakteri melakukan reproduksi dengan metode ini. Difusi pasif (osmosis) yaitu pemindahan substansi yang berkonsentrasi tinggi menuju konsentrasi rendah. Angkutan aktif yaitu kemampuan menghimpun nutrien secara selektif untuk kepentingan sel dalam pertumbuhan dan perkembangannya. mereka biasanya akan tumbuh sebagai batch culture atau closed system. ada pula yang lebih dari 24 jam per generasi. Tahapan-tahapan pembelahan biner yaitu: 1. serta metabolit-metabolit lain melintasi membran. asam-asam amino. Sel pun memisah. Jika pada masa inkubasi tidak ada penyediaan medium baru yang segar. Dinding sel yang baru terbentuk di antara kedua DNA 4. dipengaruhi jenis organisme. maka untuk mempermudah perhitungan biasanya dipakai skala logaritmik (Tortora. dkk. Untuk menghitung waktu generasi dari bakteri. Dinding sel dan membran plasma mulai melakukan pembelahan 3. dan fragmen yang terbentuk lalu memulai pertumbuhan sel baru (Tortora. 2001). Waktu generasi bervariasi.biokimiawi yang berguna untuk memindahkan ion ion. Kurva yang terbentuk memiliki 6 fase yang berbeda. Ada pula beberapa spesies yang melakukan fragmentasi. dkk.

1) Kurva-kurva tersebut adalah: 1) Lag phase Lag phase adalah fase di ketika mikroorganisme dimasukkan ke dalam medium kultur yang masih segar. Industrial Microbiology: An Introduction. dkk. . mikroba mengalami pertumbuhan dan membelah dengan kecepatan semaksimal mungkin yang mungkin dicapai. ini dikarenakan enzim yang baru dibutuhkan untuk mengolah nutrien yang baru. maka fase eksponensial pun dimulai (Waites. 3) Exponential phase / Log phase Pada fase eksponensial.Medium kemungkinan berbeda dengan medium yang ditempati mikroorganisme itu sebelumnya. 2001).Kemungkinan mikroba mengalami kerusakan dan membutuhkan waktu untuk memulihkan dirinya (Tortora. Namun fase ini juga bisa saja berlangsung cepat apabila kultur yang digunakan adalah kultur yang masih muda dan berada pada fase eksponensial ditempatkan pada medium yang masih segar dan dalam komposisi yang sesuai (Tortora. Kecepatan pertumbuhan mikroba adalah konstan. namun pada fase ini sel melakukan sintesis komponen-komponen baru. Pertumbuhan ini menghasilkan kurva naik yang 33 . kofaktor. dkk. Pembentukan komponen-komponen baru ini bisa disebabkan karena hal-hal berikut: . 2001). maupun ribosom. Jika laju maksimum.Sel yang bersangkutan mungkin saja telah tua dan memiliki keterbatasan dalam jumlah ATP. Lag phase bervariasi waktunya untuk setiap kondisi mikroba dan suasana dari medium yang bersangkutan. Sel harus menyintesis bahan-bahan tersebut sebelum pertumbuhan mikroorganisme dapat dilakukan. dan kondisi pada saat mereka tumbuh. . 2) Acceleration phase Fase ini merupakan fase di mana pembelahan sel dimulai dan lajunya semakin meningkat hingga mencapai laju maksimum. tergantung pada potensial genetik. atau inokulasi suatu kultur yang ditempatkan pada medium yang berbeda secara kimiawi. medium. Fase ini bisa saja berlangsung lama apabila inokulumnya berasal dari kultur yang sudah tua.Gambar 1: Pertumbuhan Mikroorganisme pada Batch Culture (Waites. kultur yang baru saja didinginkan. dkk. sehingga mikroorganisme tersebut harus beradaptasi. Meskipun tidak ada pembelahan sel maupun peningkatan massa. 2001). Fig 2. dkk. Biasanya pada fase ini tidak ada penambahan jumlah sel. kalaupun ada penambahannya dalam jumlah yang sangat sedikit.

dan kecepatan pertumbuhan tidak akan meningkat lagi (Tortora. Pembelahan sel dan replikasi DNA tetap terjadi. Saat seperti ini disebut dengan fase stasioner. Pada konsentrasi nutrien yang sangat tinggi. 5) Stationary phase Pertumbuhan pada suatu saat akan berhenti dan kurva pertumbuhan membentuk garis horizontal. sistem transpor pada mikroba sudah jenuh. Ini lalu diikuti dengan peningkatan jumlah sintesis protein dan DNA. Mulusnya kurva ini disebabkan tiap individu mikroba membelah berkali-kali dalam interval waktu yang sangat singkat. dkk. sehingga tidak menghasilkan kurva diskret (Tortora. atau memang karena populasi benar-benar berhenti melakukan pembelahan namun masih aktif melakukan metabolisme (Tortora. tipe mikroorganisme yang dikembangkan. dkk. Jika nutrien mulai mengalami keterbatasan. sel akan mulamula membentuk ribosom baru untuk meningkatkan kapasitas mereka dalam membentuk protein. Kemudian pertumbuhan yang seimbang dapat dimulai lagi dan kultur memasuki fase eksponensial (Tortora. dkk. Jika mikroba dipindahkan dari medium kaya nutrisi ke medium miskin nutrisi. Jumlah maksimum populasi yang dapat dicapai ditentukan oleh banyak faktor. 2001). Sel akan menjadi lebih kecil dan melakukan reorganisasi secara metabolik hingga mereka dapat tumbuh kembali. Jika mikroba dipindahkan dari medium bernutrisi rendah ke medium yang lebih kaya nutrisi. menghasilkan suatu kurva yang lebih kompleks. Oksigen tidak terlalu bersifat larut dan bisa habis dalam waktu yang cukup cepat. Pada kondisi ini. 2001). berarti sudah memasuki fase stasioner (Waites. kecuali jika kultur diguncang atau diaerasi (Tortora. Pada fase stasioner jumlah mikroorganisme konstan. 34 . dkk. akan terjadi pertumbuhan tidak seimbang (unbalanced growth). dkk. Namun jika level nutrien atau suasana lingkungan berubah. sehingga menghasilkan kurva yang cenderung menuju datar. 4) Deceleration phase Nutrien yang dikonsumsi mikroba lama-kelamaan pasti akan mengalami keterbatasan. semua komponen sel dihasilkan dengan kecepatan yang sama antara satu komponen dengan yang lain. 2001). Populasi mikroba bisa memasuki fase stasioner bisa disebabkan karena beberapa hal. 2001). sedangkan algae dan protozoa mencapainya pada level populasi sekitar 106 sel per mL. Pada akhirnya.mulus. dan sebagainya (Tortora. Organisme aerobik seringkali mengalami keterbatasan O2. Pada kondisi ini. maka laju pertumbuhan pun akan mulai melambat. kecepatan sintesis dari komponen-komponen sel bervariasi antara komponen satu dengan yang lain. dkk. dkk. Bakteria pada umumnya mencapai fase stasioner pada level populasi sekitar 109 sel per mL. 2001). 2001). namun pembentukan protein dan sintesis RNA melambat. Jika nutrien jumlahnya semakin terbatas. 2001). Pertumbuhan eksponensial termasuk dalam jenis pertumbuhan seimbang (balanced growth). dkk. Sel yang berada di bawahnya tidak dapat melakukan pertumbuhan. dkk. Kecepatan pertumbuhan juga meningkat seiring dengan konsentrasi nutrien. 2001). mikroba pun melakukan reproduksi (Tortora. sehingga hanya bagian permukaan kultur saja yang mendapatkan cukup oksigen dan melakukan pertumbuhan. Kurva itu juga sekaligus menggambarkan jumlah nutrien yang mampu dimanfaatkan oleh mikroba. mikroba akan membutuhkan waktu untuk membuat enzim baru. pertumbuhan akan melambat. Ini dapat disebabkan oleh seimbangnya jumlah sel yang mati dan yang membelah. Jika kurva sudah benar-benar datar (di mana tidak ada laju pertumbuhan mikroba). 2001). Salah satunya adalah karena keterbatasan nutrien. dan ini terjadi hingga keseimbangan yang baru telah tercapai (Tortora. misalnya saja nutrien yang tersedia.

di mana kondisi lingkungan mikroorganisme tetap dipertahankan dengan cara pemberian nutrien dan pembuangan limbah secara kontinu. streptococci juga bisa memasuki fase stasioner akibat kehabisan gula (Tortora. Matinya mikroba biasanya berbentuk logaritmik pada kurva (Tortora. Ini dikarenakan ada beberapa sel yang resisten dan tahan terhadap lingkungan yang tidak mendukung. Ini dapat menyebabkan medium menjadi asam dan menghambat pertumbuhan. 2001). Banyak kultur anaerobik mengalami masalah ini. 2001). Mati di sini diartikan sebagai kehilangan kemampuan untuk bereproduksi (Tortora. dkk. dkk. berarti dia dinyatakan mati. yang menandakan terjadinya fase mati (death phase). Ini mengakibatkan kurva kematian terkadang bisa menjadi kompleks (Tortora. Sistem ini disebut dengan sistem kultur kontinu (continuous culture system). Sehingga fase eksponensial hanya berlangsung selama beberapa saat saja (Tortora. dkk. mikroorganisme bisa ditumbuhkan di dalam suatu sistem terbuka. Cara untuk memastikan apakah suatu sel bakteri hidup atau tidak adalah dengan menempatkannya di medium yang masih segar. Contohnya. Jika ia tidak tumbuh dan bereproduksi. seperti habisnya nutrien atau menumpuknya sisa metabolisme menyebabkan menurunnya jumlah populasi mikroba. populasi mikroba dapat dipertahankan pada fase eksponensialnya untuk jangka waktu yang lebih lama (Tortora. 6) Death phase Memburuknya suasana lingkungan. 2001).  Continuous Culture Pada penjabaran di sebelumnya. Gambar 2: Peralatan untuk Continuous Culture (Waites.Pertumbuhan populasi juga bisa terhambat akibat akumulasi sisa metabolisme yang bersifat racun. pengkulturan mikroba dilakukan secara batch di mana persediaan nutrien tidak diperbarui dan limbah tidak dibuang. dkk. streptococci dapat memproduksi asam laktat dan asamasam organik lain dalam jumlah yang besar hasil dari fermentasi gula. laju kematian bisa saja mengalami penurunan drastis. Meskipun kebanyakan populasi mikroba mati dengan pola logaritmik.4) 35 . Industrial Microbiology: An Introduction. 2001). dkk. Selain itu. dkk. Fig 2. 2001). Selain metode batch. 2001). Pada sistem ini. dkk.

Pada metode ini. Jika laju pengenceran lebih cepat dari laju pertumbuhan mikroba. Fig 2. 36 . dkk. dkk. Selain itu. Counting Chamber / Direct Microscope Method Cara paling umum untuk menentukan jumlah mikroba adalah dengan menghitungnya langsung menggunakan counting chamber. dan juga memberikan informasi mengenai ukuran dan morfologi mokroorganisme. Gambar 3: Pertumbuhan Mikroorganisme dalam Kultur Kontinu (Waites. sulit dibedakan antara sel yang hidup dan mati jika menggunakan counting chamber tanpa teknik khusus (Prescott. 2002). 2001). Sel prokariot lebih mudah dihitung dengan counting chamber apabila sel-sel itu diberi warna. Kondisi steady-state dapat dipertahankan. dkk. karena yang digunakan sebagai sampel hanyalah volume yang sangat kecil. B. namun pada fase eksponensialnya nutrien diberikan secara kontinu untuk memperpanjang fase eksponensialnya. Maka kontrol pada continuous culture sangatlah penting (Waites. 2002). sedangkan hemocytometer digunakan untuk menghitung baik sel prokariot maupun eukariot. di mana laju pertumbuhan mikroba sama dengan jumlah mikroba yang dikeluarkan (Waites. Volume dari fermenter dibuat konstan dengan cara mengontrol antara jumlah medium kultur yang masuk dengan jumlah sel dan hasil metabolismenya yang dikeluarkan. Ada beberapa kelemahan metode ini. Menggunakan counting chamber merupakan cara yang mudah. Namun jika laju pengencerannya lambat. Populasi mikroba harus cukup besar. namun juga laju pengenceran. Industrial Microbiology: An Introduction.5) Laju pertumbuhan mikroba bisa dikontrol laju volumetrik medium yang masuk. cepat. dkk. mikroba pada mulanya ditumbuhkan secara batch. konsentrasi substrat yang dihasilkan juga lebih rendah. 2001). Petroff-Hauser counting chamber bisa digunakan untuk menghitung sel prokariot. semakin banyak substrat yang dihasilkan oleh mikroba. mikroba akan terbuang dari fermentor sebelum sempat melakukan pembelahan. 1. dkk. Semakin mendekati nilai laju pertumbuhan maksimum. murah. MENGUKUR PERTUMBUHAN MIKROBA  Metode penghitungan langsung (Direct Method) Metode ini dilakukan dengan menghitung pertambahan jumlah dari sel. atau menggunakan mikroskop fase-kontras atau mikroskop fluorescence (Prescott.

Selain itu. sehingga mudah dihitung (Prescott. hanya beberapa koloni saja yang dapat ditumbuhkan dalam satu plate. sehingga mampu menangkap bakteri. Jika coloni terlalu banyak. Perhitungan pun bisa dilakukan (Prescott.2. algae. Plate Count: Pour Plates dan Spread Plates Plate Count adalah suatu metode untuk menghitung mikroba yang terdapat pada plate. Coulter Counter Mikroorganisme berukuran besar seperti protozoa. 2002). Oleh karena itu. dkk. Tiap kali sel mikroba melalui lubang. dkk. Namun asumsi ini tidak selamanya benar. dkk. Coulter Counter kurang cocok digunakan untuk menghitung bakteri. dkk. dan ragi nonfilamen bisa dihitung menggunakan alat hitung elektronik seperti Coulter Counter. Selain metode di atas. karena satu koloni bisa saja dibentuk tidak hanya oleh 1 bakteri. hambatan listrik terbentuk dan sel pun dihitung (Prescott. 3. maka pada inokulum yang jumlah mikrobanya banyak perlu dilakukan pengenceran (Prescott. 2002). koloni yang terbentuk di dalam medium agar bisa saja tidak terlalu kelihatan. karena bakteri tersebut bisa mengalami kerusakan dan tidak bisa melakukan reproduksi. dkk. Ketika agar memadat. Bakteri yang telah tersebar tadi kemudian membentuk koloni-koloni yang tersebar. Plate count bisa dilakukan baik dengan cara pour plates maupun spread plates. Biasanya plate yang digunakan adalah plate dengan 25-250 koloni. 4. dkk.1 mL. Arus listrik dialirkan melalui lubang. bisa saja sejumlah bakteri yang melakukannya.1 mL inokulum dituangkan ke dalam cawan. sehingga mempengaruhi perhitungan (Prescott. Jumlah koloni yang terbentuk merupakan jumlah mikroorganisme yang tersaring pada filter. Teknik ini berguna khususnya dalam menganalisa sampel akuatik (Prescott. Selain itu metode ini tidak bisa membedakan antara sel hidup dan sel mati (Prescott. Prosedur pour plates yaitu mula-mula suspensi bakteri yang telah diencerkan dimasukkan ke dalam cawan Petri sebanyak 1 mL atau 0. Agar koloni berada dalam range ini. filter membran juga bisa digunakan untuk menghitung mikroba secara langsung. 2002). 2002). Kelemahan dari pour plate ini adalah tidak cocok digunakan pada bakteri yang tidak tahan panas ketika medium agar dituangkan ke dalam wadah. dan elektrode dipasang di kedua sisi lubang untuk mengukur hambatan listrik. maka beberapa sel tidak dapat tumbuh. Teknik Filter Membran Pada teknik ini. Filter lalu ditempatkan pada medium agar atau pada suatu tempat yang telah diberi media liquid dan diinkubasi hingga tiap sel membentuk koloni-koloni yang berbeda. Pada teknik ini 0. Media-media tertentu dapat digunakan agar mikroorganisme yang dihitung bisa spesifik. 2002). sehingga jumlah mikroba mula-mula sama dengan jumlah koloni yang ada saat ini. Sampel mula-mula disaring melalui membran polikarbonat hitam untuk memberikan background yang 37 . dan sebagainya. Inokulum disebar secara uniform dengan menggunakan glass rod yang steril. Lalu medium agar dituangkan ke dalam cawan dan diaduk dengan merata. Untuk menghindari masalah-masalah itu. Suspensi mikroba dipaksa masuk melalui sebuah lubang kecil. Metode ini mengasumsikan bahwa satu individu mikroba mampu bereproduksi dan membentuk koloni. karena adanya kemungkinan terganggu oleh partikel kecil. Filter ini memiliki lubang pori yang kecil. hasil perhitungan plate count biasanya dinyatakan sebagai colony-forming unit (CFU) (Prescott. dkk. biasanya digunakan teknik spread plates. Kelemahannya adalah. suatu sampel yang mengandung mikroba dilewatkan pada filter membran. Jika plate count dilakukan. cawan kemudian diinkubasi. koloni akan tumbuh di dalam atau di permukaan nutrien agar. dkk. 2002). 2002). Dengan teknik ini. pembentukan filamen. 2002).

Teknik ini sangat cocok untuk menentukan jumlah fungi. Contohnya. dkk. lalu dicuci. Kelemahannya metode ini adalah terlalu memakan waktu dan tidak terlalu sensitif. dkk. dan sebagainya. dkk. maka total jumlah substansi itu berhubungan langsung dengan massa sel mikroba. Selain itu. dkk. penentuan klorofil dapat digunakan untuk menghitung populasi algae. 2002). 2002).  Metode penghitungan tidak langsung (Indirect Method) Selain pertambahan jumlah. maka semakin keruh penampakannya dan semakin sedikit sinar yang diteruskan olehnya. Secara teori. dkk. 2001). Mikroba harus dipisahkan sejauh mungkin agar koloni yang tumbuh bisa terpisah secara jelas antara satu dengan yang lain (Tortora. sampel dari suatu sel yang didapatkan dari suatu medium dengan volume tertentu dapat dianalisa dengan menghitung jumlah protein atau nitrogennya. makanan. Kelemahan teknik ini adalah tidak dapat dibedakan antara sel hidup dan sel mati. 1. mengandung tidak hanya satu jenis mikroba. MENDAPATKAN KULTUR MURNI Kebanyakan sampel yang diambil dari alam. 3. Begitu pola terbentuk. air. Besarnya pantulan sinar sebanding dengan massa sel yang dikenai sinar. dan jumlah ATP dapat digunakan untuk menghitung massa mikroba hidup (Prescott. dan ditimbang. Pada absorbansi rendah hubungannya dengan konsentrasi mikroba hampir linear. Metode isolasi yang seringkali digunakan untuk mendapatkan kultur murni adalah metode streak plate. Turbidimetri dan Spektrofotometri Metode lain yaitu dengan memanfaatkan fakta bahwa sel mikroba menyebarkan sinar yang mengenainya. mikroba akan lepas dari jerat dan masuk ke medium. dikeringkan di oven. Sel yang tumbuh di medium liquid dikumpulkan dengan sentrifugasi. Semakin besar konsentrasi mikroba. suatu jerat inokulasi yang steril dicelupkan ke dalam kultur yang mengandung lebih dari satu jenis kultur.bagus untuk menentukan objek fluorescent. sehingga perlu sentrifugasi kultur dalam jumlah yang cukup besar (Prescott. lalu jerat ini digosokkan pada medium nutrien membentuk pola. Jika material-material tersebut ditumbuhkan mikrobanya pada suatu medium solid. Namun sekarang terdapat reaagen fluorescent yang mampu membedakan antara sel hidup dan sel mati. asalkan populasi mikroba terdapat dalam jumlah yang cukup untuk memberikan turbiditas yang dapat dideteksi (Prescott. 2002). Kebanyakan dari pekerjaan bidang mikrobiologi membutuhkan kultur yang murni. Metode Berat Kering (Dry Weight) Salah satu metode yang sering digunakan adalah dengan penentuan berat kering mikroba (microbial dry weight). Tingkat sebaran sinar itu bisa ditentukan dengan spektrofotometer. Mikroba lalu diberi warna dengan suatu fluorescent. suatu koloni yang tumbuh berasal dari satu sel atau spora. Koloni mikroba seringkali memiliki penampilan yang bisa dibedakan antara satu dengan yang lain. Pada metode ini. 2002). maka koloni-koloni akan tumbuh persis sama dengan organisme induknya. seperti tanah. Menghitung Jumlah Substansi Tertentu Jika jumlah substansi dalam tiap sel sama antara satu dengan yang lain. misalnya acridine orange dan dihitung dengan mikroskop epifluorescence. Sel terakhir yang lepas dari jerat jarajnya cukup jauh dari mikroba yang lainnya 38 . Sehingga pertumbuhan populasi dapat diukur dengan mudah dengan spektrofotometer. 2. pertumbuhan populasi juga ditandai dengan pertambahan massa total sel. sehingga kelemahan tadi dapat teratasi (Prescott. C.

2001). dkk. Meskipun demikian. biasanya sekitar pH 5-6 (Waites. Sebaliknya apabila suhu turun. memiliki pH optimum antara 8. Jika terlalu sedikit. kompenen sel menjadi tidak aktif dan rusak. Berdasarkan hal tersebut. maka kecepatan metabolisme akan menurun dan pertumbuhan diperlambat. 2001). Sebagai contoh. seperti asinan kubis.5 dan 7. Metode sterak plate cocok digunakan ketika jumlah organisme yang akan diisolasi jumlahnya banyak. sehingga sel-sel menjadi mati (Waites. bakteri dapat tumbuh dengan baik pada ph normal antara ph 6.11. (Disebut juga suhu inkubasi). 2. contohnya Bacillus dan Micrococcus. Suhu maksimum yaitu suhu yang apabila berada di atasnya maka pertumbuhan tidak terjadi (Waites. Suhu optimum yaitu suhu dimana pertumbuhan berlangsung paling cepat dan optimum. 2001). Apabila suhu naik maka kecepatan metabolisme naik dan pertumbuhan dipercepat. hal ini menyebabkan mengapa sejumlah makanan. Ragi akan tumbuh selama rentang ph lebih besar dari bakteri. 2. salah satu jenis bakteri chemoautotrophic.5 .  Suhu / Temperatur Suhu merupakan salah satu faktor penting di dalam mempengaruhi dan pertumbuhan mikroorganisme. Apabila suhu naik atau turun secara drastis. Koloni yang terbentuk lalu bisa dipindahkan ke dalam test tube yang berisi nutrien untuk menumbuhkan kultur yang murni (Tortora. Suhu minimum yaitu suhu yang apabila berada di bawahnya maka pertumbuhan terhenti. dkk. Suhu dapat mempengaruhi mikroba dalam dua cara yang berlawanan: 1. ada beberapa bakteri yang disebut acidophiles yang sangat toleran terhadap keasaman.5. maka mikroba jumlahnya harus ditingkatkan dengan pengayaan nutrien sebelum dilakukan metode streak plate (Tortora.untuk membentuk koloni murni. Bakteri alkalophiles. acar dan keju . 2001). banyak diawetkan dari pembusukan oleh asam yang dihasilkan oleh bakteri fermentasi (Waites. 3. dkk. dkk. yaitu : 1. dkk. yang ditemukan dalam air drainase dari tambang batubara dan mengoksidasi sulfur untuk membentuk asam sulfat dapat bertahan pada nilai pH kurang dari 1 (Waites. tingkat pertumbuhan akan terhenti. dkk. Bakteri sangat sedikit tumbuh pada ph asam dibawah 4. dkk. maka suhu yang berkaitan dengan pertumbuhan mikroba digolongkan menjadi tiga. 39 . EFEK DARI KONDISI LINGKUNGAN PADA PERTUMBUHAN MIKROBA  pH ph mengacu pada keasaman atau alkalinitas dari solusi.5 (Waites. 2001) D. 2001). 2001). dkk. 2001). akan tetapi pH optimum dari jamur dan ragi umumnya di bawah bakteri.

Molekul ini tetap berbentuk cair pada temperatur rendah di mana membranmembran lain yang mengandung lemak jenuh tidak dapat berfungsi lagi (Waites. Mereka tumbuh dengan optimum pada temperatur di atas 20°C. dkk. Ia memiliki pelapis spora yang tebal dan aktifitas air yang rendah (Waites. Psikrofil biasanya memiliki temperatur optimum di bawah 15°C dan organisme ini biasanya mati pada temperatur ruang. dkk. Pyrolobus fumarii memiliki temperatur optimum 106°C dan terus tumbuh hingga 113°C (Waites. 2001). Termofil ekstrim (hiper-termofil) bisa tumbuh pada temperatur 100°C ataupun lebih. hanya dapat tumbuh apabila tidak ada oksigen bebas / tanpa adanya oksigen 3) Anaerob fakultatif: dapat tumbuh baik dengan atau tanpa oksigen bebas. Spora mikroba umunya tahan terhadap panas. dkk. Ini menyebabkan ikatan hidrogen semakin banyak yang mendukung kestabilan DNA (Waites. 2001). namun masih mampu melakukan pertumbuhan dengan lambat pada temperatur sekitar 0°C. Namun. Mereka mampu hidup pada temperatur rendah karena membran mereka mengandung banyak lemak tak jenuh. Termofil adalah organisme yang memiliki temperatur optimum di atas 50°C. 2001). dan rusaknya DNA. ribosom dari termofil bekerja dengan baik pada temperatur tinggi.Gambar 4: Range Temperatur Pertumbuhan Mikroba (Waites. Enzim termofil juga memiliki sifat stabil pada temperatur tinggi. hanya dapat tumbuh apabila ada oksigen bebas. 2001).  Oksigen Mikroorganisme memiliki karakteristik sendiri-sendiri Mikroorganisme dalam hal ini digolongkan menjadi : 1) Aerobik obligat: 2) Anaerob obligat: di dalam kebutuhannya akan oksigen. Sebagai contoh. denaturasi enzim. Fig 2. Beberapa jenis algae. protozoa. 2001). dkk. dan beberapa bakteri termofil ekstrim memiliki DNA dengan rasio guanin-sitosin yang tinggi. rusaknya ribosom. dkk. 2001). dkk. 2001). dkk. Beberapa mikroba jenis ini bertanggung jawab pada pembusukan produk-produk yang didinginkan (Waites. Akan tetapi mereka tumbuh lebih baik apabila ada oxygen. DNA mereka juga tetap terintegritas pada temperatur tinggi. dkk. Industrial Microbiology: An Introduction. dan fungi memiliki temperatur maksimum hingga 55°C (Waites. 40 . Psikotrop bisa disebut psikrofil fakultatif.6) Mesofil memiliki temperatur optimum pada range 20-45°C dan temperatur minimum sekitar 15-20°C (Waites. Bakteri non-termofil apabila dikenakan temperatur tinggi biasanya menyebabkan kerusakan pada membran sitoplasma.

dkk. Jika mikroba dengan dinding sel yang kaku ditempatkan di larutan hipotonik. 2001) Bakteri-bakteri aerobik dan organisme lain yang mampu menoleransi oksigen memiliki superoksida dismutase. dan beta-karoten juga membantu menghilangkan radikal bebas secara non-enzimatis. Mereka bisa tumbuh pada level oksigen 2-10%. namun dapat tumbuh dengan baik meskipun ada atau tidak ada oksigen (Waites. katalase. hidrogen peroksida (H2O2) dan radikal hidroksil (OH). Aw= Psolution / Pwater (Waites. dkk. Jika tidak didetoksifikasi. dkk. 2001) 41 . yaitu superoksida dismutase. Terdapat 3 enzim yang mampu menetralisir produk-produk di atas. dkk. Jika kontak dengan oksigen. 2001). dan menjadi bengkak. vitamin E. dkk. Ketersediaan air bagi mikroorganisme diistilahkan dengan aktivitas air (water activity). dkk. Aktifitas air adalah rasio dari tekanan uap dari air dalam larutan dengan tekanan uap dari air murni (Waites. ataupun kalau ada dalam jumlah yang sangat sedikit (Waites. dkk. Mikroba yang tidak memiliki dinding akan terus mengembang dan pecah pada akhirnya (Waites. dan peroksidase: Superoksida dismutase superoksida (2O2-) + 2H+ hidrogen peroksida (2H2O2) glutathione peroksidase katalase O2 + H2O2 O2 + 2H2O H2O2 + 2GSH glutathione 2H2O + GSSG glutathione teroksidasi (Waites. 2001). Sel yang ditempatkan di larutan hipertonik akan kehilangan air akibat osmosis dan pertumbuhan sel pun terhambat (Waites. mereka akan menyerap air. namun jumlahnya cukup sedikit.  Water activity Kebanyakan mikroorganisme mengandung 70-80% air dan membutuhkan sejumlah air bebas untuk melangsungkan beberapa aktifitas metabolik (Waites. Lingkungan hipertonik mungkin mengandung air. 2001). sebagian besar organisme akan menghasilkan senyawa-senyawa yang sangat beracun. 2001). Kebanyakan bakteri aerob. Pada konstentrasi oksigen di atmosfer (21%) mereka tidak dapat tumbuh. namun bukan aerotolerant juga memiliki katalase.Mikroaerofil: dapat tumbuh apabila ada oksigen dalam jumlah kecil. 2001). Adanya asam aksorbat. yaitu superoksida (O2-). dkk. Aerotolerant: Biasanya mengabaikan oxygen. 2001). produk-produk ini mampu bereaksi dengan molekul-molekul organik dan menghancurkannya. Bakteri anaerob oligat tidak memiliki superoksida dismutase dan katalase.

dkk. Contohnya mikroorganisme laut adalah termasuk barotolerant.9. seperti kesehatan. H. 2001). banyak mikroorganisme yang tidak pernah diberi tekanan hingga lebih dari 1 atm. semakin sulit populasi itu untuk dimusnahkan. Ada pula mikroorganisme yang mampu memperbaiki DNA mereka yang rusak akibat radiasi (Waites. misalkan saja pada Deinococcus radiodurans memiliki kemampuan alami untuk tahan terhadap radiasi. maupun kondisi fisiologisnya. Beberapa mikroorganisme. dkk. morfologi. Namun ada beberapa mikroorganisme yang bersifat barotoleran. dan hydrated elektron. 2001). OH.98) dan memiliki enzim yang mampu mengolah ion-ion sodium. dkk. KONTROL PERTUMBUHAN MIKROBA Pencegahan pertumbuhan mikroorganisme sangat diperlukan di banyak bidang. seperti Halobacterium halobium tidak dapat tumbuh di tempat yang konsentrasi garamnya kurang dari 3mol/L (Waites. 2001) E. True halofilik.  Radiasi Sinar UV. serta merusak DNA (Waites. 2001). viskositas medium. Beberapa spesies ini tidak tumbuh pada lingkungan di mana terdapat air dalam jumlah besar (Waites. dkk. Mikroorganisme tidak dapat dimusnahkan secara langsung sekaligus. 2001). Beberapa bakteri juga memiliki pigmen yang dapat mengabsorpsi radiasi. o Periode paparan agen pengontrol terhadap mikroba. dkk. o Komposisi populasi Tiap mikroorganisme memiliki sensitivitas yang berbeda-beda. dkk. 2001). konsentrasi nutrien) (Waites. o Konsentrasi dari agen anti mikrobial dan intensitas treatment. bahkan hingga ratusan atm (Waites. Radikal bebas ini dapat merusak ikatan hidrogen. oksidasi bahan-bahan kimia. Kontrol dapat dilakukan. food processing. 42 . Kebanyakan fungi yang menyebabkan biodeterioration merupakan xerotoleran (dapat tumbuh pada kelembaban rendah).  Tekanan hidrostatik Di alam. Beberapa hal yang mempengaruhi mudah tidaknya pengontrolan jumlah mikroba: o Ukuran populasi Semakin besar ukuran populasi. Dan keefektifan pengontrolan dapat dipengaruhi oleh umur mikroba. 2001). yaitu dengan membunuh mikroba maupun mencegah pertumbuhan mikroba (Waites. dan pengawetan berbagai macam benda. 2001). misalkan saja sinar gamma yang dihasilkan dari eksitasi 60Co mampu menghasilkan radikal bebas. Radiasi ionisasi. dkk. di mana mereka terkena tekanan tinggi. dkk. o Kondisi lingkungan (pH. o Temperatur Pada umunya semakin tinggi temperatur akan meningkatkan efektifitas dari agen pengontrol. Populasi mikroba akan menurun secara eksponensial (Waites.6. yang cukup berbahaya pada 260 nm mampu menyebabkan kerusakan pada DNA. Beberapa fungi filamentous xerofilik dan ragi osmofilik bisa hidup pada lingkungan di mana Aw bisa mencapai 0. Bakteri laut teradaptasi pada air laut yang berkonsentrasi tinggi (aw = 0. khususnya pada pembentukan dimer thymine.Spesies mikroba memiliki toleransi yang berbeda-beda terhadap kondisi kering dan tekanan osmosis tinggi. Kebanyakan baktri tidak dapat tumbuh dengan Aw di bawah 0. dan tekanan yang lebih tinggi dapat menghambat pertumbuhan mikroorganisme.

 Moist heat Metode ini dilakukan dengan mengalirkan uap dalam tekanan tinggi untuk mencapai temperatur 121°C selama 15 menit. 43 . sesudah direbus. Kontrol pertumbuhan mikroba dengan panas bisa dicapai dengan cara:  Insinerasi Pembakaran dengan metode ini bisa mencapai temperatur 500°C dan mampu menghancurkan mikroorganisme. serta media kultur. dkk. serta bisa menghancurkan beberapa vitamin (Waites. dkk. Bisa digunakan pada benda-benda gelas. dan gamma dapat digunakan untuk memusnahkan mikroorganisme. 2001). Ia memang mampu membunuh sel. bahkan buah dan sayuran. Electric field treatment Metode ini dilakukan dengan cara memberi aliran listrik 15-20 kV/cm pada bahan yang akan disterilisasi hanya selama beberapa milidetik atau bahkan kurang dari itu. Untuk membunuh endospora. dkk. Mekanisme dari penonaktifan sel dengan metode ini belum diketahui. Biasanya digunakan pada pengolahan limbah padat. diikuti dengan perebusan kedua untuk membunuh sel-sel tersebut (Waites. baik temperatur pemanasan maupun waktunya harus benar-benar diperhatikan. 2001). namun mayoritas tidak dapat tumbuh atau tumbuh dengan amat sangat lambat pada temperatur di bawah 5°C (Waites. 2.  Dry heat Dilakukan pada hot air oven pada 160°C selama 2 jam. namun diduga listrik mampu merusak membran melalui elektroporasi (pembentukan pori dalam membran) (Waites. Proses ini cukup mahal. Radiasi UV cukup efektif. Pendinginan Dengan pendinginan atau pembekuan. namun ia tidak mampu menembus gelas. bubuk. logam. 5. 2001). 3. dan bahan-bahan lain. dkk. Radiasi digunakan secara luas untuk mensterilisasi benda-benda seperti cawan Petri. dan sebagainya. yaitu secara fisik dan kimia:  Kontrol pertumbuhan mikroba secara fisik 1. Sehingga yang sering digunakan adalah sinar X dan gamma. 2001). Diterapkan pada proses fermentasi untuk sterilisasi wadah. dan tidak semua organisme bisa terbunuh (akibat sifat dari bahan itu dan dosis yang diberikan). X. Perebusan air atau pemanasan benda padat dalam air mendidih pada 100°C selama 30 menit tidak menjamin sterilitas. 4.Kontrol pertumbuhan mikroba ada 2 cara. benda yang akan disterilisasi diinkubasi pada 37°C untuk memberi kesempatan pada endospora untuk tumbuh menjadi sel. 2001). karena tiap jenis mikroba memiliki ketahanan sendiri-sendiri. air. Bahan-bahan makanan bisa diberi radiasi untuk meningkatkan masa penyimpanannya hingga 500% dengan menghancurkan mikroorganisme pembusuk. Pengurangan kadar air Metode ini dilakukan dengan menghilangkan kandungan air dari suatu bahan dengan cara pemanasan. UV. namun tidak bisa membunuh semua endospora. pipa penghubung. freeze-drying. penambahan gula ataupun garam (Waites. Radiasi Gelombang microwave. organisme biasanya tidak terbunuh. Panas Jika panas digunakan untuk mengontrol pertumbuhan mikroba. dkk.

propionat. yaitu ia harus mampu menghambat atau membunuh mikroorganisme patogen. dan sebagainya. asam amino. dan senyawa amonium kuartener (Waites. Metode ini diterapkan pada sterilisasi antibiotik dan obat-obatan lain.  Pengawetan antimikroba untuk makanan dan produk-produk terkait Senyawa yang digunakan kebanyakan agen statik. 2001). karena antara sel bakteri (prokariot) dan sel inangnya (eukariot) terdapat perbedaan yang cukup jauh. 44 . dkk. dkk. Namun. 2001). dkk. senyawa klorin.2 atau 0. di mana mikroorganisme tidak dapat lewat. Agen ini lebih mudah digunakan pada penyakit yang disebabkan oleh bakteri. Tidak cocok digunakan pada jaringan hidup. namun tidak membunuh sporanya.  High efficiency particulate air (HEPA) Biasanya digunakan pada containment room untuk mensterilisasi udara yang terdapat di dalam ruangan itu (Waites. vitamin. alkohol. entrapment. 2001). dan sebagainya). biasanya 0. dan sebagainya) o Substansi yang diklasifikasikan sebagai GRAS (generally regarded as safe).  Kontrol pertumbuhan mikroba secara kimia Agen kimia antimikroba dapat digunakan untuk membunuh mikroorganisme atau menghambat pertumbuhannya. terdiri dari asam organik lainnya (benzoat. Hal paling penting dari agen antimikroba yang akan digunakan adalah selektifitasnya.4 µm. hipoklorit. namun tidak bisa dimakan. sehingga ultrafiltrasi dibutuhkan untuk menghilangkan virus (Waites.  Antiseptik dan disinfektan Antiseptik adalah pencegahan infeksi jaringan hidup.6. yaitu agen yang digunakan untuk menghambat pertumbuhan mikroorganisme pada produk-produk yang mungkin ditelan. namun tidak memberikan dampak terhadap inangnya.  Antimicrobial chemotherapy Antimicrobial chemotherapy adalah metode untuk mengontrol atau memusnahkan mikroorganisme penyebab penyakit di dalam jaringan hidup. dkk. Ini dapat dicapai dengan menggunakan agen antiseptik microbiocidal. o Senyawa-senyawa lain yang aman bagi manusia dan hewan yang tidak dapat dimasukkan dalam kategori di atas (Waites. dkk. Ada 3 kategori untuk bahan pengawet tambahan. 2001). Contohnya adalah larutan iodine. Ada 3 tipe filtrasi:  Depth filter Yaitu filter dengan serat-serat tebal atau bergranula yang menghilangkan mikroorganisme dengan screening fisik. ester dari para-hydrobenzoic acid). dan adsorpsi. dan SO2. Filtrasi Filtrasi digunakan untuk menghilangkan mikroba dari liquid atau gas. sehingga selektifitas agennya menjadi lebih efektif (Waites. 2001). yaitu agen yang tidak membahayakan kulit dan membran mukus. berdasarkan FDA.  Membrane filter Filter tipis dengan ukuran pori tertentu. Terdiri dari: o Asam organik alami (laktat. dan fenol (Waites. hasil yang diperoleh mungkin saja tidak bebas virus. 2001). dkk. sitrat. Disinfektan adalah agen yang membunuh mikroba. Contohnya adalah klorin.

Penghambat membran sel Pada bakteri. Contohnya adalah rifamisin dari spesies Streptomyces (Waites. kanamisin. 2001). dkk. sehingga selektifitas agen bisa dicapai. seperti eritromisin dan oleandomisin bekerja dengan cara menghambat translokasi dari ribosom (Waites. dkk. membran sangat penting untuk transpor nutrien dan produksi energi. Contohnya adalah sulfonamida. Penghambat sintesis protein Antibiotik tipe ini mampu menyerang dengan berbagai cara.Antimicrobial chemotherapy terdiri dari: o Bahan kimia sintetis Agen chemotherapy sintesis adalah inhibitor kompetitif. Senyawa ini mampu menghambat pembentukan tetrahydrofolic acid (THF) yang cukup penting untuk bakteri. 2001). Salah satu contohnya adalah penisilin yang dihasilkan oleh Penicillium (Waites. Contohnya adalah penisilin. Golongan makrolida. sehingga fungsi membran terganggu (Waites. o Antibiotik Antibiotik adalah obat yang dihasilkan oleh mikroorganisme untuk mengatasi infeksi mikroba. Membran terluar dari bakteri Gram negatif juga berperan sebagai pelindung. Akibatnya mikroba menjadi rentan terhadap tekanan osmosis yang dapat membunuh mikroba itu (Waites. dkk. Akibatnya. manakah yang merupakan cara yang paling efektif? Cara-cara yang sudah disebutkan sebelumnya merupakan cara-cara menghambat pertumbuhan mikroorganisme dalam kondisi-kondisi tertentu. b. 2001). biasa disebut antimetabolit. Serangan terhadap asam nukleat Beberapa antibiotik mampu menghambat pertumbuhan sel dengan cara mengganggu sintesis DNA atau RNA. LAMPIRAN PERTANYAAN 1. 2001). Namun. 2001). dkk. salah satunya menyerang ribosom pada saat translasi RNA. Penisilin menghambat sintesis peptidoglikan yang berujung pada tidak terbentuknya dinding sel dari mikroba yang diserang. Polymyxin adalah satu-satunya senyawa yang mampu menyerang hanya membran bakteri. dan produk-produk dari Streptomyces bekerja dengan cara menghambat inisiasi sintesis protein. Ia bisa berperan sebagai pembunuh atau penghambat patogen. pertumbuhan mikroba terhambat (Waites. masing-masing memiliki penerapan sendiri-sendiri…… 45 . seperti streptomisin. Jika membran rusak. dkk. Menghambat sintesis dinding sel Penghambat pembentukan dinding sel biasanya menyerang mikroba pada saat pembentukan peptidoglikan. dkk. c. Jadi dari semua cara itu. Sulfonamida berperan sebagai substrat untuk enzim yang seharusnya digunakan untuk menyintesis THF. Struktur ribosom antara prokariot dan eukariot berbeda. sehingga agen kimia tipe ini sulit untuk dibuat secara spesifik menyerang mikroba. maka mikroba akan terbunuh. 2001). Golongan aminoglikosida. d. Antibiotik bekerja dengan 4 cara: a. Cara kerjanya adalah polymyxin mengikatkan dirinya dengan membran mikroba. Renanto Pandu Wirawan (115061107111009) Di antara cara-cara menghambat pertumbuhan mikroba. membran eubakterial dan eukariot memiliki struktur yang sama.

3. produk metabolisme. Semakin banyak zat terlarut. Dengan adanya nutrisi secara kontinu itu. yaitu 0. Apakah mungkin. 46 . untuk mengatasinya maka pada fermentor diberi suatu saluran dimana jika terjadi overflow pada fermentor. Febrika Larasati (115061101111001) Pada water activity. Oleh karena itu. Menghitungnya ini mamakai mikroskop. Jika mikroba terus-menerus diberikan nutrisi. Tujuan dari pemberian garis itu adalah untuk mempermudah penghitungan mikroba. namun itu adalah garis tipis-tipis yang jajraknya berdekatan.2. bakteri disensor saat melewati electrode. dan apakah hal tersebut mengurangi keakuratan perhitungan bakteri? Jawab: Pada coulter counter. Nutrisi diberikan secara terukur supaya fase pertumbuhan mikroba bisa dibuat optimal. terdapat garis-garis yang tebal dan yang tipis. Itu apa perbedaannya? Jawab: Itu bukan garis yang tebal. Hal ini berakibat pada semakin pekatnya larutan itu. Sedangkan garisgaris tipis yang saya sebutkan tadi itu lebarnya 0. 1 bakteri melewati sensor lebih dari 1 kali. maka mikroba tidak akan mungkin bisa masuk kembali ke dalam lubang itu jika sudah melewatinya. saluran tersebut dapat membuang kelebihan mikroba. maka suatu saat akan terjadi overload pada fermentor. mikroba dapat melakukan pertumbuhan dan melakukan metabolisme dengan terus-menerus. sehingga ukuran kotak-kotaknya pun harus sangat kecil. yaitu dengan cara mempertahankan fase eksponensialnya. mikroba ditempatkan ke dalam suatu wadah yang disebut fermentor. Dengan cara inilah maka pertumbuhan mikroba dapat dijaga pada fase eksponensialnya. maka semakin kecil vapor pressure dari larutan itu. Kotak-kotak besar yang berada di bagian terluar berukuran 1x1 mm. 5. dan nutrisi pada fermentor.Tolong jelaskan lagi pertumbuhan mikroba pada proses continuous culture! Terutama proses yang terjadi pada fermenter. sehingga akan mengurangi water activity larutan itu. sehingga terlihat seperti garis tebal. Rizka Dwi Octaria (115061101111017) . suspensi bakteri yang akan dihitung dipaksa masuk ke dalam lubang dengan cara memberi hembusan angin atau aliran fluida melalui lubang itu. Dobita Amanda Feliciana (115061100111021) Pada gambar counting chamber yang telah ditunjukkan. Inggit Kresna Maharsih (115061100111005) Pada proses perhitungan coulter counter. Di dalam wadah itu mikroba diberi nutrisi secara terukur dan kontinu. Jawab: Pada continuous culture. Dengan aliran ini.05 mm kalau pada counting chamber ini. apa saja yang mempengaruhi kepekatan air? Jawab: Yang mempengaruhi kepekatan air adalah jumlah zat terlarut di dalamnya. 4.05 mm.

Jika mikroba selain jenis alkalophiles ditempatkan pada pH ini. Jika makanan sudah dibusukkan semuanya. Freshsya Zatalini (115061100111003) Dalam kehidupan sehari-hari kapan kita menggunakan cara menumbuhkan mikroba scara batch culture maupun continuous culture? Jawab: Untuk batch culture. ini menandakan mikroba itu masih dalam lag phase. Lubang yang digunakan untuk melewatkan mikroba ukurannya sangat kecil. Arus listrik yang sekecil ini kebanyakan tidak dapat membunuh bakteri. Bahan kimia itu mampu memberi warna yang berbeda antara mikroba hidup dan mati. Mar‟atus Sholihah (115061100111019) Pada metode coulter counter digunakan arus listrik untuk menghitung jumlah mikroba. tetapi apakah arus listrik yang digunakan itu tidak menghambat pertumbukan mikroba? Kemudian bagaimana agar cara penghitungan ini tidak menghambat pertumbuhan mikroba? Jawab: Arus listrik yang digunakan pada coulter counter ini kecil sekali. menandakan death phase. hanya beberapa mV saja. 7.5-11. mikroba dapat diberi warna dengan fluorescent. 6. yang paling akurat adalah metode filter membran. sehingga aman digunakan untuk perhitungan. berarti mikroba sudah mulai aktif dan memasuki exponential phase. maka mikroba tersebut dapat melakukan pertumbuhan dan metabolisme secara normal (secara normal yang dimaksud adalah. Ridhani Rida Ramadhan (115061100111007) Dari cara menghitung mikroba tersebut. maka mikroba kehabisan nutrisi dan lambat laun akan mati.- Bagaimana pertumbuhan mikroba pada pH 8.5. sehingga pertumbuhan mikroba pun terhambat dan memasuki stationery phase. Jika makanan mulai membusuk. Ini dikarenakan metode ini merupakan direct counting method. Contohnya yaitu Bacillus dan Micrococcus. maka ia tidak akan tahan sehingga ia akan mati. Jika ada makanan yang tidak diawetkan kita biarkan begitu saja.5-11. Suatu saat jumlah makanan yang dibusukkan sudah agak banyak. dan juga mampu membedakan antara mikroba yang mati dengan mikroba yang masih hidup. Contoh yang paling sering kita jumpai adalah pembusukan makanan. sehingga kita tidak menjumpainya secara alami. apa contohnya? Jawab: Mikroba yang dapat tumbuh pada pH 8. 47 . Pada filter membran. yaitu mulai dari stationery phase hingga death phase). 8. Jika mikroba jenis ini ditempatkan pada kisaran pH seperti di atas. ia mula-mula masih dalam kondisi baik. kita banyak sekali menjumpainya dalam kehidupan sehari-hari. sehingga arus listrik yang dibutuhkan juga kecil. yang berarti tahan basa. lebih akurat memakai metode apa? Dan yang paling sering digunakan metode apa? Jawab: Dari cara-cara menghitung mikroba tersebut.5 disebut sebagai bakteri alkalophiles. bakteri ini melakukan pertumbuhan seperti biasanya. Untuk continuous culture kita sulit menjumpainya dalam kehidupan sehari-hari. karena pertumbuhan ini adalah pertumbuhan yang sebelumnya sudah dikondisikan oleh manusia untuk tujuan tertentu (misalnya industri).

Oleh karena itulah pada grafik dituliskan bahwa idiophase hanya ada pada mikroorganisme tertentu. selain dengan memberinya bahan kimia lain bisa pula dengan memberikan perlakuan fisik (dipanaskan. Alfonsina Abat Amelenan Torimtubun (115061100111027) Bagaimana cara mengatasi penghambatan mikroba agar tidak mengganggu (misal pemberian bahan kimia untuk makanan. Adakah ciri-ciri mikroba yang kekurangan atau kelebihan oksigen? Jawab: Cara kontrol kebutuhan oksigen yang paling mudah adalah dengan menggunakan regulator udara. Jadi dari penampilannya. Mutia Dhana F. Sitanggang (115061100111015) Apa beda paling konkrit antara depth filter dan membrane filter? Jawab: Depth filter dan membrane filter sama-sama merupakan alat untuk menyaring mikroba. 11. maka satu-satunya cara untuk mengatasinya adalah dengan membuat bahan kimia lain atau antibiotik yang mampu membunuh mikroba tersebut. pertumbuhan mikroba akan mengalami hambatan. Apa yang dimaksud dengan idiophase? Dan kenapa hanya berlaku pada beberapa organisme? Jawab: Pada grafik di atas. dsb). Bedanya. diasinkan. Queen G. Untuk mikroba non-patogen (misalnya mikroba pada makanan) jika ia resisten terhadap bahan kimia tertentu. yaitu tropophase dan idiophase. dan hal ini dapat diketahui menggunakan metode-metode perhitungan mikroba seperti yang telah diuraikan di atas. yaitu produk metabolisme yang dihasilkan spesifik tiap jenis mikroorganisme. selain lag phase hingga death phase. 12. grafik pertumbuhan juga dibagi menjadi dua.9. Sedangkan idiophase adalah fase di mana mikroorganisme menghasilkan metabolit sekunder. Suatu mikroba kekurangan atau kelebihan oksigen dapat dilihat dari pertumbuhannya. Jika oksigennya tidak sesuai dengan kebutuhannya. (115061100111007) Pada slide grafik pertumbuhan mikroba disebutkan idiophase. Tropophase adalah fase di mana mikroorganisme menghasilkan metabolit primer. kemudian makanan tersebut disterilkan dari mikroba) jika mikroba tersebut telah mengalami evolusi sehingga resisten terhadap bahan kimia tersebut? Jawab: Untuk mikroba patogen yang telah resisten terhadap bahan kimia tertentu. 48 . sedangkan membrane filter bentuknya berupa lempengan yang memiliki lubang-lubang mikro. 10.G. depth filter bentuknya lebih tebal daripada yang membran. kalau depth filter bentuknya berupa serabut-serabut. Dian Nita Citra Dewi (115061101111013) Jelaskan tentang cara kontrol kebutuhan oksigen pada jenis-jenis mikroba.

Meskipun mediumnya terus dipindahkan ketika overflow. namun suatu saat nanti jumlah metabolit yang terakumulasi pada medium akan menjadi jenuh. Apakah penyataan tersebut benar? Jawab: Cahaya adalah salah satu bentuk dari radiasi yang berada dalam panjang gelombang cahaya tampak. Afida Khofsoh (115061100111031) Bagaimana tentang kebutuhan cahaya bagi pertumbuhan mikroorganisme? Misalnya saya pernah dengar bahwa pasien yang mengalami infeksi tetanus sebaiknya/harus ditempatkan pada tempat gelap/kurang cahaya agar bakteri yang menyebabkan penyakit tetanus tersebut agar tidak tumbuh lagi. atau ada bakteri yang resisten. tekanan. Winda Fauzi Istiqomah (115061101111003) Kapankah suatu pembelahan sel berhenti pada fermentor? Jawab: Pembelahan sel terjadi pada saat mikroba dalam fermentor brada dalam fase eksponensial. 14. 16. kondisi lingkungan yang memburuk. Kelemahan dan kelebihan metode menghitung mikroba? Dan yang mana yang lebih cepat dan akurat. naik. Jadi bukan bakterinya yang tidak tahan cahaya. Teza Nur F. karena pada continuous culture fungsinya hanyalah memperpanjang fase eksponensial selama kurun waktu tertentu. sehingga pasien menjadi sensitif terhadap berbagai macam rangsangan. pasien ditempatkan dalam ruangan yang gelap. namun bisa menjadi datar.13. sehingga akan menghentikan fase eksponensial. karena racun yang dikeluarkan bakteri tetanus menyerang sistem saraf. Jika nutrisi ataupun lingkungan ini dapat diperbaiki atau dikembalikan ke kondisi semula. serta yang paling ekonomis? 49 . atau berfluktuasi. maka otomatis akan menghentikan pertumbuhan mikroba. namun suatu saat nanti jumlah metabolit yang terakumulasi pada medium akan menjadi jenuh. (115061105111007) . 15. Jika fase eksponensial terhenti. (115061102111001) Apakah pada continuous culture tidak ada death phase? Jawab: Tentu saja ada. sehingga akan menghentikan fase eksponensial yang bisa berujung pada death phase. salah satunya cahaya.Bagaimana penanggulangan lingkungan yang buruk agar pada death phase kurva menjadi kompleks? Jawab: Pada umumnya death phase terjadi akibat kehabisan nutrisi. Cara menanggulangi lingkungan yang buruk agar kurva death phase tidak terus menurun adalah memberikan nutrisi yang sesuai dengan mikroba itu dan mengatur kondisi (temperatur. maka kurva death phase tidak akan menurun lagi. Meskipun mediumnya terus dipindahkan ketika overflow. Dewi Ariesi R. Berbagai jenis mikroorganisme memiliki sensitivitas sendiri-sendiri terhadap radiasi. dsb) yang disukai mikroba itu. Mengenai tetanus sendiri.

tidak bisa membedakan antara mikroba dan benda mati Kelebihan: mudah dan cepat dilakukan Plate count dan membrane filter Kelemahan: tidak bisa membedakan mikroba hidup dan mati. tidak bisa membedakan antara mikroba dan benda mati Kelebihan: cepat. dan cepat Coulter counter Kelemahan: tidak bisa membedakan mikroba hidup dan mati. A. murah.o   o   o   o   o   o   Counting chamber Kelemahan: tidak bisa membedakan mikroba hidup dan mati Kelebihan: mudah. membutuhkan mikroba dalam jumlah besar. Sejarah yang memicu perkembangan pemanfaatan mikroorganisme berawal dari proses fermentasi sederhana yang dahulu terlibat dalam produksi susu fermentasi dan minuman beralkohol (anggur) yang berkembang ribuan tahun lalu. tidak bisa membedakan mikroba hidup dan mati. fermentor yang menggunakan bakteri aerob diberi saluran atau lubang untuk pertukaran udara. Bakteri anaerob dapat ditemui pada sungai yang keruh. dan murah dilakukan Dry weight Kelemahan: membutuhkan waktu lama. 2001). dan industri-industri lain yang proses produksinya membutuhkan mikroba. namun. Saluran itu bisa diberi regulator jika oksigen yang diberikan harus terukur. industri tape. 50 . Sejarah Awal Perkembangan Mikroorganisme Industri Kebanyakan mikroorganisme digunakan secara ekstensif untuk membantu menghasilkan produk dan jasa. mempunyai kecepatan tumbuh tinggi. sampah. dan bahan-bahan organik non-xenobiotik lainnya semuanya dilakukan oleh bakteri aerob. mudah dilakukan Menghitung substansi tertentu Kelemahan: sulit dilakukan Kelebihan: hasilnya akurat 17. sulit dilakukan Kelebihan: murah Turbidimetri dan spektrofotometri Kelemahan: tidak bisa membedakan mikroba hidup dan mati. Saluran tempat pertukaran udara bisa diberi suatu regulator yang mencegah udara memasuki fermentor. tidak bisa langsung dilakukan perhitungan Kelebihan: mudah. pembusukan makanan. baru sekitar kurang dari 150 tahun lalu dasar ilmiah dari proses tersebut diperiksa.. Untuk fermentor bakteri anaerob harus dikondisikan agar tidak ada oksigen yang masuk ke dalam fermentor. Mereka terbukti berguna karena mereka relative mudah untuk dibudidayakan. Sharfina Widyaningrum (115061105111003) Aplikasi bakteri aerob dan anaerob dalam kehidupan sehari-hari apa? Penanganan khusus bakteri aerob dan anaerob dalam industri bagaimana? Jawab: Bakteri aerob dapat ditemui dengan mudah dalam kehidupan sehari-hari. koloni yang terbentuk belum tentu berasal dari satu sel. dapat menggunakan substrat yang murah (yang dalam banyak kasus adalah limbah) dan keragaman produknya cukup berpotensi (Waites. Untuk penanganannya. dan Kelahiran dari mikrobiologi industri sebagian besar dimulai dari studi Pasteur.

Hasilnya menunjukkan bahwa anggur yang dihasilkan memiliki kualitas yang baik dan tidak mengalami perubahan aroma selama disimpan. pada tahun 1857 akhirnya Pasteur menunjukkan bahwa fermentasi alcohol dalam produksi bir dan anggur adalah hasil dari aktivitas mikroba. Perkembangan Pemanfaatan Mikroorganisme bagi Industri Dalam kebanyakan kasus.1 (Saccharomyces carlsbergensis) yang sekarang diklasifikasikan sebagai strain Saccharomyces cerevisiae. jika sebelumnya dipanasi dulu selama beberapa menit pada suhu 50-60oC. dan beberapa fermentasi adalah aerobic. sedangkan yang lain sudah anaerobik (Waites. Namun. obat dan kosmetik oleh FDA ( Food and Drug Administration) Amerika.Pasteur berkeyakinan bahwa produk fermentasi anggur merupakan hasil mikroorganisme yang ada. Fermentasi industry biasanya lebih memilih menggunakan mikroorganisme GRAS ( generally regarded as safe). yang melibatkan pemilihan secara acak ( random screening) dari banyak mikroorganisme yang telah diisolasi. karena akibat dari modifikasi oleh peningkatan strain secara konvensional dengan salah satu cara yaitu mutagenesis. Selain itu Pasteur juga mencatat bahwa organisme tertentu dapat merusak bir dan anggur. Berikut ini merupakan contoh mikroorganime untuk industry yang telah diklasifikasikan sebagai GRAS (bahan tambahan yang dianggap aman) : 51 . 2007). Dengan meneliti anggur yang baik dan anggur yang kurang bagus. Sehingga disimpulkan bahwa mikroorganisme pertama kali diisolasi dari proses fermentasi sebagai kultur alami kemudian dipilih sesuai dengan strain yang berguna (Waites. B. Jadi bahan yang telah masuk dalam GRAS adalah bahan yang telah diteliti dan diakui aman oleh para ahli dari badan FDA tersebut. Setelah adanya publikasi dari Pasteur. Pasteur memecahkan masalah yang timbul di Industri anggur. Penggunaan kultur murni untuk fermentasi pertama kali dilakukan tahun 1883 dengan menggunakan ragi yang telah diisolasi oleh Hansen. Dia menyimpulkan bahwa pemilihan mikroorganime yang sesuai akan menghasilkan produk yang bagus. Pasteur menemukan mikroorganisme yang berbeda. muncul beberapa kemajuan penting seperti adanya teknik pengembangan kultur murni oleh Hansen di Brewery Carlsberg. Mikroorganisme tertentu mendominasi anggur yang bagus sementara mikroorganisme tipe lain mendominasi anggur yang kurang bagus. 2001). Pada tahun 1950. khususnya untuk pembuatan produk makanan. sebagai ragi Carlsberg No. atau dapat juga mendapatkan mikroorganisme yang cocok dengan koleksi kultur (cultur collection). Hal tersebut dilakukan untuk memenuhi kebutuhan akan mikroorganisme bagi kepentingan industry. Denmark. Sehingga. sebagian besar mikroorganisme terlepas dari asal-usul mereka. pertimbangan regulasi merupakan hal yang paling utama ketika memilih mikroorganisme untuk keperluan industri. Proses ini dikenal dengan pasteurisasi ( proses pengawetan) yang digunakan secara luas dibidang industri makanan. Untuk itu dia memusnahkan mikroba yang telah ada dalam sari buah anggur dengan cara memanaskannya. yang ditandai dengan banyaknya industri strain yang didirikan. mikroorganisme spesifik sering diisolasi dari lingkungan alam. Sejak 80 tahun pertama pada abad ke 20. GRAS ( generally regarded as safe) merupakan kategori bagi bahan yang ditambahkan ke dalam makanan. 2001 dan Okafor. Beberapa proses telah dikembangakan selama 20 tahun terakhir yaitu melibatkan rekombinan mikroorganisme dan teknologi rekayasa genetika. bukan fermentasi yang menghasilkan mikroorganisme sebagaimana yang dipercaya pada waktu tersebut. setelah dingin kedalam sari buah tersebut diinokulasi dengan anggur yang berkualitas baik yang mengandung mikroorganime yang diinginkan.

Strategi yang diadopsi untuk mengisolasi mikroorganisme industry yang cocok dari lingkungan dapat dibagi menjadi 2 tipe yaitu pendekatan „shotgun’ dan pendekatan „objective’ ( Waites. Jadi ketika industry memilih menggunakan mikroorganisme yang baru. sewage. Hasil dari isolasi ini kemudian dipilih untuk mendapatkan sifat mikroorganisme yang diinginkan (Waites. biasanya tidak memerlukan pengujian yang terlalu lama jika kondisi budidaya yang digunakan dapat diterima.2001). Kultur murni ialah kultur yang selsel mikrobanya berasal dari pembelahan satu sel tunggal (Pelczar. juga terdapat contoh beberapa mikroorganisme industry beserta produk fermentasi yang dihasilkan. tanah. dan khususnya berasal dari habitat alam atau habitat buatan manusia. Pendekatan ‘shotgun’ Pada pendekatan ini. ( sumber : Waites. 1986). Metode Isolasi Mikroorganisme dari Lingkungan Isolasi merupakan salah satu cara untuk memisahkan atau memindahkan mikroba tertentu dari lingkungan tertentu. (Lihat lampiran). 2001). sampel dari mikroorganisme bebas atau kelompok mikroorganisme lainnya dikoleksi dari berbagai habitat seperti materi tanaman. 2001) Mikroorganisme kategori diatas. a) a) b) c) 52 .Tabel 4. C. membutuhkan persyaratan untuk proses dan persetujuan untuk produk. air dan aliran limbah. sehingga diperoleh kultur murni atau biakan murni. sehingga hal tersebut lebih ketat terkait biaya yang jauh lebih tinggi. Selain itu. hewan.2 Mikroorganisme kategori GRAS.

Kelompok semacam ini dapat menjadi lebih efisien. Hasil dari perbandingan ini dapat dianalisa secara laborat melalui perhitungan atau lebih mudah dengan 53 . Setelah isolasi sebagai kultur murni pada media pertumbuhan padat termasuk pemilihan atau pengembangan media seleksi dan kondisi pertumbuhan yang tepat. Klasifikasi merupakan pengelompokan mikroba kedalam kelompok. Namun. Menyuburkan (menumbuhkan) kultur kemungkinan dapat dilakukan dengan sistem kultur batch. Setelah mendapatkan sampel mikroorganisme. khususnya meliputi kemampuan untuk mendegradasi senyawa bandel yang kompleks (Waites. Ketika suatu organism tidak dapat diidentifikasi atau seperti spesies asing. masing-masing harus diseleksi berdasarkan properti yang diinginkan. kita dapat menduga mungkin kultur tersebut tidak murni. Namun. tetapi pada hasil dari uji tersebut. Namun.2001). Langkah awal seringkali membunuh atau menekan proliferasi organism umum dan mendorong pertumbuhan mikroorganisme yang langka. Sebagai contoh. mode pemilihan ini hanya cocok untuk kasus dimana sifat yang diinginkan dari mikroorganisme. Identifikasi karakteristik suatu organism dapat dilakukan dengan 2 metode pendekatan yaitu konvensional (mikrobiologis) dan pendekatan molekuler. Prosedur isolasi dan pemilihan ini lebih mudah diaplikasikan untuk mencari mikroorganisme tunggal. seperti stabilitas. Perbedaan antara karakterisasi untuk klasifikasi dan identifikasi tidak teretak pada banyaknya uji yang dilakukan.1988). Karakterisasi terbagi dalam beberapa tahap yaitu klasifikasi dan identifikasi. Hal ini mendorong pertumbuhan dari organisme-organisme dengan sifat (ciri-ciri) yang diinginkan dan meningkatkan kuantitas dari organisme target sebelum diisolasi dan diseleksi (screening). Penetapan nama ilmiah Internasional yang tepat terhadap mikroba didasarkan pada sistem penamaan „Binomial Nomenklatur’ Carolus Linoleus ( Ketchum. Tingkat keakuratan dari identifikasi bergantung pada ketelitian kerga preparasi seperti pembuatan media. pertama-tama sampel ditumbuhkan di media pertumbuhan yang sesuai dan kondisi kultivasi (budidaya) harus disesuaikan untuk mengisolasi mikroorganisme target. karena pengembangan strain dapat dengan normal digunakan untuk pengembangan secara luas.Contoh habitat untuk pendekatan shotgun : a) tanah. atau seringkali lebih cocok dalam sistem kontinu. dll. Kondisi ini dipilih ketika mikroorganisme mempunyai kemampuan untuk melakukan metabolisme dari suatu senyawa (Waites. Hubungan antara strain dapat dihitung dan diekspresikan sebagai kemiripan dari karakter positif atau dengan menjumlahkan antara ciri-ciri yang positif dan yang negative. produksi dari enzim-enzim spesifik. pada tahap ini. mengamati dan mencatat berbagai uji.masing karakter atau ciri. tempat sampel yang dipilih adalah tempat (bahan) yang telah diketahui terkontaminasi organism ini. memberikan sebuah keuntungan bagi organisme itu sendiri.2001). senyawa inhibitor. tingkat aktivitas atau konsentrasi dari target produk per se bukan merupakan perhatian utama. hal ini lebih sulit dilakukan untuk isolasi consortia yang sama-sama memiliki kemampuan/karakteristik yang dicari dan komposisi yang bervariasi seiring waktu. Pernyataan ini benar. karena kebanyakan taksonomi saat ini mendukung konsep yang menyatakan bahwa untuk klasifikasi bobot yang sama harus diberikan terhadap masing. Teori identifikasi bakteri merupakan perbandingan antara yang tidak diketahui dan yang diketahui. pembuatan reagen dan pewarnaan serta ketelitian dalam melakukan. c) aliran air b) Pendekatan ‘objective‟ Pada pendekatan ini. ketika mencoba mengisolasi organism yang dapat menurunkan (mendegradasi) atau mendetoksifikasi suatu senyawa spesifik. dan juga tidak beracun (Waites. b)sewage. Isolasi yang dipilih juga harus diseleksi bagi ciri-ciri yang penting lainnya. 2001). pengambilan sampel diarahkan pada tempat yang spesifik yang sesuai untuk kehidupan mikroorganisme tertentu atau berasal dari komponen yang kemungkinan mengandung mikroorganisme yang diinginkan. atau kita sudah membuat kesalahan (error) dalam observasi dan pencatatan.

Ini dapat dilakukan dengan meningkatkan temperatur. atau bahkan tidak sama sekali untuk karakter tertentu (Ketchum. dengan cara kimia. teknik streak plate. Ada beberapa teknik yang dapat digunakan untuk mengisolasi. dan bekerja dengan cepat serta efisien untuk meminimalisir adanya kontaminan. Untuk memastikan kemurnian dari spesies bakteri tersebut. Dalam teknik ini. dan pour plate menjadi teknik yang sangat diperlukan. memutar plate dan membuat goresan tambahan. Kultur murni pertama kali dilakukan sekitar tahun 1870. untuk tujuan identifikasi kita memberikan bobot yang tinggi untuk beberapa karakter karena mempunyai nilai perbedaan yang sangat besar dan memberikan bobot yang kecil untuk yang lain. Teknik goresan dapat bekerja dengan baik ketika bakteri yang diisolasi berada dalam jumlah yang besar. Kawat yang telah diberi nyala api kemudian digunakan untuk membuat goresan kedua yang berfungsi untuk memperkecil populasi bakteri. Hal ini mempelopori ahli bakteriologi dari Jerman. Maka dari itu. sel bakteri dari sampel menyebar ke bagian-bagian ujung. Metodenya dapat digunakan dalam menghasilkan kultur untuk jamur tetapi tidak cocok untuk bakteri. Ini dilakukan dengan membersihkan dan memberikan desifektan pada area kerja untuk mengurangi jumlah kontaminan. material yang mengandung bakteri disebar di atas permukaan dari medium agar yang padat. air. seperti menumbuhkan jamur pada media padatan yang ia tambahkan dengan gelatin pada media cair. tidak ada metode yang dapat digunakan untuk seluruh mikroorganisme. dan plate yang mengandung medium diputar sekitar 90°. tiap mikroorganisme menggunakan metode yang berbeda. Dalam teknik ini. Dengan cara ini. Pengenceran lebih lanjut dari material yang diuji dilakukan dengan membakar kembali kawat nikrom.  Isolasi Mikroorganisme Sampel dari tanah. Anton de Bary dan O Brefeld.1988). Masing-masing teknik memiliki keuntungan dan kekurangan sendiri-sendiri. Namun. D. garis-garis pada permukaan media hanya digoreskan sekali. Di antara prosedur yang digunakan. 54 . Kultur murni diperoleh ketika hanya satu jenis bakteri yang tumbuh pada plate. Teknik Streak Plate. Robert Koch dan asistennya yang akhirnya mengembangkan kultur murni untuk bakteri. Kultur murni awalnya digunakan saat meneliti jamur. mendeteksi. jika bakteri yang diisolasi berada dalam jumlah yang kecil. tingkat pertumbuhannya harus ditingkatkan dengan menyuburkan bakteri tersebut sebelum isolasi menggunakan teknik goresan. Tokoh yang mendukung penggunaan kultur murni ini adalah dua orang ahli ilmu jamur. Kemudian. Namun. Brefeld memperkenalkan cara mengisolasi sel tunggal. Merupakan metode klasik untuk isolasi bakteri. yaitu dengan memisahkan mereka pada medium padat dan membiarkannya berkembang membentuk koloni. dan menghitung kehadiran bakteri dalam sampel dengan efektif. inokulum bakteri disebarkan dengan menggunakan kawat nikrom pada permukaan media. Teknik Isolasi Kultur Murni Kultur murni didefinisikan sebagai turunan (cloning) dari suatu mikroba. dengan memanaskan media inokulasi. Pemisahan mikroorganisme yang tidak diinginkan perlu dilakukan untuk membuat sebuah kultur murni dari mikroorganisme. atau dengan radiasi untuk membunuh mikroorganisme. Setelah digores. Sel bakteri kemudian berkembang membentuk koloni. kawat nikrom diberi nyala api untuk menghilangkan bakteri-bakteri yang tersisa. Berbagai macam teknik telah dikembangkan untuk isolasi kultur murni. spread plate. atau makanan mengandung jenis-jenis bakteri yang berbeda. Isolasi kultur dilakukan dengan teknik aseptic.menggunakan komputerisasi. plate diinkubasi pada temperature yang tepat untuk membiarkan bakteri tumbuh. perlu dilakukan pengulangan proses goresan pada plate baru lainnya. Teknik aseptik ialah suatu cara menghilangkan kontak dari kultur murni dan membuat medium pertumbuhan menjadi steril dari kontaminan. Pertama-tama.

Setelah inkubasi pada temperature yang tepat. teknik sebaran dapat digunakan untuk menentukan jumlah bakteri dari jenis tertentu yang ada pada sampel.1 ml dari sampel yang telah diencerkan ditempatkan pada bagian tengah dari agar dan disebarkan ke permukaan agar menggunakan batang kaca penyebar. batang yang telah steril digunakan untuk menyebarkan sampel pada bagian permukaan dari media. Bakteri dan agar cair yang telah tercampur dengan baik dituangkan dengan segera ke dalam cawan Petri menggunakan teknik aseptik dan 55 . Ketika suspense menyebar. Metode ini juga digunakan untuk isolasi bakteri. Pour Plate Technique. Teknik ini digunakan secara luas untuk isolasi bakteri. bakteri yang tersebar berkembang menjadi koloni-koloni yang terisolasi. batang kaca penyebar disterilkan dengan cara dicelupkan dalam alkohol kemudian dibakar dalam nyala api.Gambar: Teknik streak plate (Sumbali. Isolasi koloni ini diambil dan digoreskan pada medium yang telah dipastikan kemurniannya. Tidak seperti teknik goresan. 2009) volume yang diketahui dari sampel dipipet secara aseptic pada permukaan medium agar cawan Petri. sel bakteri terpisah dan tertanam pada tempat yang berbeda-beda. sampel diencerkan dan kemudian diencerkan dan ditambahkan sejumlah kecil suspensi mikroba ke dalam tabung yang berisi agar cair pada suhu sekitar 45 °C. (a) (b) (c) (d) Gambar: Teknik spread plate untuk isolasi bakteri (Sumbali. Dalam metode ini. sekitar 0. 2009) (a – d) prosedur urutan goresan untuk mendapatkan koloni terisolasi (e) kultur streak plate yang menunjukkan koloni-koloni yang diisolasi Spread Plate Technique. koloni dari hasil isolasi tampak setelah diinkubasi. Dalam teknik agar tuang (pour plate).

Kebanyakan laboratorium mikrobiologi memelihara sejumlah besar strain. tetapi semua spesies memiliki metodenya sendiri-sendiri. koloni-koloni tersebar dengan merata dalam medium padat.kemudian dibiarkan mengeras dan diinkubasi. hal berikunya yang penting dilakukan adalah menjaga kultur yang telah tumbuh dari adanya kontaminasi. tidak membutuhkan 56 E. Teknik pour plate juga membantu dalam menghitung jumlah bakteri yang dapat hidup. Metode yang digunakan juga bergantung pada jumlah kultur yang akan dipelihara. Kenyataannya. Setelah kultur dibuat. organisme yang tidak terkontaminasi. uji hayati. Sebagai contoh. Pemeliharaan kultur dilakukan dalam kondisi yang semirip mungkin dengan isolasi alaminya. Nutrient ini berasal dari potongan-potongan sayuran atau tanaman. 2009) Pemeliharaan dan Pelestarian Stok Kultur Setelah mikroorganisme diisolasi dan tumbuh dalam kultur murni. mereka disimpan pada suhu 5-8 °C. garam mineral serta sumber karbohidrat. Beberapa metode yang umum digunakan dalam koleksi kultur mikroba ialah:  Subculturing (Agar Slants or Microgardening) Metode pemeliharaan bakteri dan jamur yang paling tradisional dan paling sederhana adalah menumbuhkannya pada nutrient agar slants yang dibuat dalam tabung-tabung atau botol-botol. beberapa strain dari spesies yang sama memberikan hasil yang sama dengan prosedur yang sama. rebusan sayur. keberadaan media penyimpanan. Gambar: Teknik pour plate (Sumbali. industri. dan perlu dipindahkan secara periodik ke medium yang lebih segar untuk menumbuhkan dan memastikan keberlangsungan hidup dari stok kultur. Metode ini memberikan keuntungan yaitu murah. dan umur dari kultur saat dipelihara. dan iklim dari tempat di mana proses tersebut berlangsung. Dalam prosedur ini. atau untuk tujuan-tujuan lainnya. Teknik ini memiliki satu kekurangan yaitu medium cair perlu diperhatikan karena temperature tinggi dari medium cair dapat membunuh beberapa spesies bakteri. Seperti metode lainnya. ketersediaan alat. Keberhasilan atau kegagalan dari metode pemeliharaan juga bergantung pada penggunaan media yang tepat. Kultur-kultur ini seringkali dibutuhkan dalam bidang pendidikan. . penelitian. prosedur kultivasi. Ada beberapa metode pemeliharaan koleksi kultur mikroba. koloni-koloni tunggal kemudian diambil dan digoreskan ke plate lainnya untuk dimurnikan. keahlian para pekerja laboratorium. dan tanpa terjadi mutasi. metode pour plate tidak cocok bagi isolasi bakteri psychrophilic. yang biasa disebut dengan koleksi stok kultur. waktu. Tujuan utama dari pelestarian kultur adalah untuk memelihara organisme hidup. Media yang kecil biasanya diperlukan untuk memproduksi subkultur karena mereka membuat laju metabolisme organism menurun.

Jumlah minyak dalam tabung atau botol-botol kecil harus diperiksa secara periodik dan ditambah jika perlu. yaitu dengan dicelupkan dalam minyak mineral steril dengan kedalaman 10 mm di atas permukaan agar. Sejumlah besar spesies bakteri dan jamur berhasil disimpan menggunakan metode ini selama bertahun-tahun. endapan spora dalam air ditambahkan ke tanah yang steril dan dibiarkan tumbuh pada 57 . tidak membutuhkan waktu yang lama. Kultur minyak ini dapat disimpan dalam suhu ruang atau pada temperatur rendah (15 °C). Gambar: Agar slants menunjukkan pertumbuhan jamur (Sumbali. Metode ini pertama kali digagas oleh Castallani (1939). 2009)  Penyimpanan menggunakan mineral oil Kultur dengan kondisi baik disimpan dengan ditutupi oleh minyak mineral dan akan bertahan dalam jangka waktu yang lama. Kerugian dari metode ini adalah dapat menyebabkan perubahan genetic (mutasi) dan adanya bahaya kontaminasi spora. serta mudah unutk digunakan. Metode alternative untuk sporulasi jamur meliputi inokulasi agar slants yang kemudian diinkubasi pada suhu 25 °C. dan koleksi kultur dapat bertahan selama beberapa tahun. Bubur ini kemudian dipindahkan ke botol kaca kecil. Dalam metode ini. Metode pemeliharaan ini sangat berguna di daerah dengan iklim tropis karena dapat mencegah hilangnya kandungan air dari kultur. murah. Uap yang terjebak dihilangkan dengan memanaskan cairan dalam oven pengering pada 180 °C selama 1-2 jam. Askomikota. Pertumbuhan yang subur menunjukkan media pertumbuhan yang baik. Penutupnya kemudian dieratkan dan disimpan pada suhu 25 °C. tetapi plate dengan pertumbuha koloni yang sedikit menunjukkan media pertumbuhan yang buruk sehingga diperlukan stok yang baru. Metode ini telah berhasil digunakan untuk memelihara Oomikota. Dalam metode ini. Kultur ditumbuhkan pada slant agar hingga mencapai pertumbuhan yang baik dan spora yang didapat dilindungi menggunakan teknik yang steril. jamur pathogen.peralatan yang khusus. Untuk mendapatkan kembali kultur dari minyak mineral. Basidiomikota. Air suling (sekitar 5 ml) ditambahkan ke kultur secara aseptik. Hipomikota. dan yeasts. tidak membutuhkan peralatan dan keahlian khusus. dan bagian permukaan dari kultur dihilangkan dengan lembut untuk menghasilkan spora dan bubur miselium. cocok bagi koleksi berukuran kecil. minyak mineral disterilkan di autoclave selama 2 jam.  Penyimpanan menggunakan tanah Tanah yang steril dapat digunakan untuk menumbuhkan dan menyimpan mikroorganisme.  Penyimpanan menggunakan air Ini adalah metode pemeliharaan yang tidak sulit dan murah yang berfungsi untuk menyimpan kultur dari beberapa jamur. sejumlah kecil bagian yang tumbuh diambil dan dibersihkan dari minyak dengan menggunakan potongan kertas dan kemudian digoreskan pada agar plate yang mengandung media pertumbuhan yang cocok.

sorbitol. Ini adalah metode yang singkat. mannitol. Umumnya. dan zat non penetrasi seperti sukrosa. yang mencegah kerusakan sel selama proses pembekuan. pembekuan ini tidak disarankan bagi pemeliharaan kultur karena proses pembekuan dapat merusak sel-sel mikroba. dan bakteriofag. menggunakan teknik ini dan menghilangkan kemampuan perkembangan mikroorganisme selama 40 tahun. yaitu pada akhir fasa logaritmik atau awal fasa stasioner. Setelah mikroorganime tumbuh. Metode ini terbukti berhasil diaplikasikan pada beberapa jenis jamur. Lyophilisation bertujuan untuk mempertahankan mikroba agar tidak berubah dari bentuk aslinya. Penanaman kultur mikroba dilakukan saat berada pada stabilitas maksimum. Cryoprotectant terdiri dari dua macam: zat penetrasi seperti gliserol dan DMSO. Pada kondisi ini. hal ini memungkinkan pelestarian mikroorganisme untuk beberapa saat.suhu 20-25 °C selama sekitar 10 hari. Batol-botol kecil kemudian dihubungkan dengan mesin pengering vakum dan dikeringkan sekitar 12 hingga 17 jam hingga menyisakan sekitar 1-2% kandungan air. yang dapat dengan mudah melewati membrane sel dan melindungi intrasel dan ekstrasel. Spora atau sel kemudian disuspensi dalam berbagai jenis zat cryoprotectif seperti gliserol atau DMSO yang dapat membantu menghilangkan kerusakan akibat pembekuan.  Freeze-Drying (Lyophilization) Ini adalah salah satu metode yang efektif dan ekonomis untuk pemeliharaan mikroorganisme dalam jangka waktu yang lama. Selama proses lyophilisation. kultur dibekukan pada temperature yang sangat rendah dan ditempatkan pada tekanan vakum. dextran. air dan sel mikroba dalam kultur akan langsung berubah dari keadaan beku menjadi gas (sublimasi) sehingga sel menjadi kering. Banyak fisiologis telah berhasil memelihara jamur.  Ordinary Freezing Pemeliharaan mikroba dalam ruang pembeku atau dalam pendingin dengan temperature berkisar 0– -20 °C akan mendapatkan hasil yang bervariasi. kultur kehilangan kemampuannya selama beberapa saat. sel mikroba disuspensi dalam agen krioprotektif dalam botol kecil menggunakan teknik yang steril dan dibekukan pada suhu -60 hingga -70 °C dengan menggunakan campuran etil asetat dan es kering. Keberhasilan lyophilisation bergantung pada keadaan sel mikroba yang digunakan pada kondisi optimum dari media yang dipilih. Dengan menurunkan suhu atau menghilangkan kandungan air. kultur tanah kemudian disimpan dalam sebuah pendingin (4-7 °C). yang menggunakan efek protektif mereka pada membrane sel. Botol-botol ini kemudian disimpan dalam kondisi vakum pada suhu 2 hingga 8 °C.  Deep Freezing Ini adalah metode dengan jangka waktu yang pendek dalam memelihara mikroba yang dilakukan pada temperatur -70 °C dalam sebuah mesin pembeku. 58 . laktosa. Umur kultur dapat diperpanjang ketika kultur disimpan pada suhu -30 hingga -70 °C dalam mesin pembeku. dan polyvinyl-pyrolidone. Dalam lyophilization. glukosa. Kultur lyophilize dapat dihidupkan kembali dengan membuka botol-botol kecil tersebut dan ditambahkan udara steril kemudian memindahkan kultur ke medium pertumbuhan yang tepat. Zat cryoprotectif adalah senyawa kimia yang memiliki sifat tertentu seperti non-toxic dan mampu menetrasi membrane sel dengan mudah. yang dapat digunakan untuk memelihara bakteri selama 6 bulan hingga 2 tahun. Freeze drying akan lebih baik dilakukan pada suhu -20 °C karena dapat membekukan suspensi mikroba dengan adanya zat cryoprotective seperti gliserol atau dimetyl sulfoksida (DMSO). kelangsungan hidup mikroba dibatasi dengan mengaturnya dalam keadaan dorman. dan keberhasilannya bergantung pada spesies dari mikroba. spesies bakteri. Dengan cara ini.

Kerugian dari teknik ini adalah harga peralatan yang mahal dan nitrogen cair yang harus diisi ulang dalam interval waktu tertentu karena mengalami peristiwa evaporasi.Gambar: Laboratorium freeze–drying (Lyophilization) (Sumbali. Pada metode ini.com) F. termasuk yang tidak dapat dilakukan dengan cara lyophilisation. Suspensi sel disegel dalam botol-botol kecil dan dibekukan pada suhu -150 °C. tetapi gliserol dan DMSO dapat digunakan secara efektif dalam upaya pemeliharaan sejumlah besar mikroba. Koleksi Kultur (Culture Collection) 59 . Tabung-tabung kecil kemudian disimpan dalam pendingin nitrogen cair (tangki vakum yang besar dan dindingnya diisolasi) baik dengan perendaman dalam nitrogen cair (-195 °C) atau disimpan dalam fasa gas oleh nitrogen cair (-150 °C). Kebanyakan mikroba dapat kehilangan kemampuannya dalam kondisi ini selama 10 hingga 30 tahun atau bahkan dapat lebih lama pada bakteri. dan perlindungan kultur dari kontaminasi. pemilihan zat cryoprotectan seringkali bervariasi berdasarkan organisme yang dipelihara. 2009)  Penyimpanan menggunakan cairan nitrogen Penyimpanan dalam cairan nitrogen adalah cara pemeliharaan mikroorganisme jangka panjang yang efektif. Keuntungan dari penyimpanan menggunakan nitrogen cair meliputi pencegahan peningkatan variasi genetik stok kultur. Ini menjadikan mikroorganisme berada dalam bentuk dorman sehingga organisme tidak mengalami perubahan genetik. Gambar: Liquid nitrogen vapor storage (biomedicalmarketing. penghematan waktu.

khamir. fisiologi. Mereka terbagi menjadi institusi-institusi dan cenderung dikhususkan pada bakteri. menerbitkan daftar katalog bagi organisasi industri dan akademis. Penggunaan mikroorganisme yang dipilih dari sebuah koleksi kultur dengan jelas memberikan penghematan biaya yang signifikan dibandingkan dengan isolasi lingkungan dan memiliki keuntungan bahwa beberapa karakteristik dari mikroorganisme telah terbentuk. National Culture Collection (UKNCC) membuat beberapa koleksi. kerugiannya adalah bahwa kompetitor memiliki akses ke mikroorganisme yang sama. menyediakan sampelsampel kultur dari masing-masing organisme. beserta metode penyimpanan miniatur. Koleksi-koleksi nasional lainnya.2001) : 60 . kebanyakan dari mereka berukuran kecil. kultur murni harus diisolasi dan dikarakteristikkan. atau alga. dari kepentingan lain di bidang industri atau medis. Berikut ini adalah contoh perusahaan yang menyediakan koleksi kultur untuk kebutuhan mikrobiologi bagi industry (Waites. American Type Cultur Collection (ATCC). bebas dari mikroorganisme yang tak diinginkan. dan potensi perhatian yang akan datang. kapang. yang berasal dari zaman dahulu. Kultur dihasilkan dari koleksi yang murni. saat ini. untuk meneruskan mengumpulkan strain-strain baru dan memberikan biakan yang murni. sedangkan isolasi yang berasal dari alam harus dimurnikan terlebih dahulu. Namun. Fungsi utama dari koleksi kultur adalah untuk memelihara koleksi-koleksi yang telah ada. koleksi-koleksi menyediakan kultur atau servis berdasarkan bagiannya tersendiri. dan bentuk morfologi. sedangkan di Amerika terdapat pusat koleksi utama. Sebagai contoh di Inggris. Masalah-masalah dari pemeliharaan kultur telah diatasi dengan pengembangan dan penggunaan dari teknik cryopreservation dan freeze-drying (lyophilization). yang menangani semua tipe mikroorganisme (Waites 2001). dan karakteristik biokimia dasar mereka telah diketahui.Koleksi kultur mikroba memberikan sumber yang kaya akan mikroorganisme. Ada hampir 500 koleksi kultur di seluruh dunia.

LAMPIRAN Contoh Produk Industry Fermentasi dan Mikroorganisme yang Memproduksinya (Waites. 61 . 2001).

62 .

ujung kawat berbentuk lingkaran (loop) atau yang berbentuk lurus disebut inoculating needle. atau larutan Linger. Cara sterilisasi tanah: 1. Pada teknik ini. terdapat beberapa bentuk bagian ujung dari kawat yang digunakan. Kawat dengan bahan ini dapat berpijar saat dipanaskan sehingga dapat dengan mudah disterilkan. waktu pembahasan penyimpanan media tanah. (115061101111015) Pertanyaan : Pada saat pembekuan. Tanah steril itu seperti apa? Bagaimana kita tahu bahwa tanah tersebut steril atau tidak? Kalau memang ada cara tersendiri untuk mensterilkan tanah. 63 . pekerja kultur tidak akan mendapatkan kultur murni yang diharapkan. bagaimana caranya? Jawaban : Tanah steril adalah tanah yang tidak mengandung kuman dan mikroorganisme pathogen. AFIDA KHOFSOH ( 115061100111031) Pertanyaan : Apa saja syarat yang harus diperhatikan oleh pekerja pada saat mengulturkan mikroba? Jawaban : Pekerja yang akan mengkultur mikroorganisme haruslah steril . dikeringanginkan dan diayak untuk memisahkan partikel tanah yang agak besar dan membuang sisa-sisa tanaman. DEWI ARIESI R.Tabel 4.1 Produk fermentasi industry dan organisme yang memproduksinya. (115061105111007) Pertanyaan : Pada teknik streak plate kenapa menggunakan kawat nikrom? Apakah ada kawat lain selain kawat nikrom? Apa karakteristik kawat yang bisa digunakan pada teknik ini? Jawaban : kawat yang digunakan pada teknik streak plate biasanya merupakan kawat nikrom yang merupakan campuran dari nikel dan kromium atau kawat platinum. Hal tersebut dilakukan untuk menghindari kontaminan – kontaminan pengganggu untuk mikroorganisme. mikroba tidak mengalami perkembangan karena mikroba tersebut akan berada pada fasa dorman/beristirahat dan mikroba ini masih dalam keadaan hidup. steril yang dimaksud adalah meliputi kebersihan dari pakaian dan alat yang digunakan pekerja selain itu juga sebaiknya dihindari pengkulturan di tempat yang terbuka. DEWI NUGRAHANI (115061100111001) Pertanyaan : Pada slide. larutan garam fisiologi (NaCl 0. karena apabila mikroorganisme terkontaminasi. apa larutan yang digunakan untuk mengencerkan? Jawaban : Larutan yang digunakan pada saat pengenceran dapat berupa larutan fosfat buffer. 2001 Lampiran II PERTANYAAN DAN JAWABAN 1. WINDA FAUZI ISTIQOMAH (115061101111003) Pertanyaan : Pada teknik pour plate. Diambil tanah yang agak liat. dikatakan bahwa tanah harus steril. SISCA DWI A. Sumber : Waites. apakah mikroba tetap hidup? Jawaban : Saat dibekukan.85%).

botol dapat dicelupkan dengan tali. 4. 5. Ayu Indah Wibowo (115061101111011) Pertanyaan : Bagaimana bisa terjadi biakan murni. bakteri dapat diambil dari lingkungan dengan beberapa pendekatan misalnya pendekatan shotgun. suhu tinggi digunakan pada teknik pour plate. Dari isolasi tersebut keadaan lingkungan (suhu) dan mediumnya disesuaikan dengan bakteri target.karena bakteri mempunyai kemampuan berkembang biak ( seperti berkembang biak dengan membelah diri. selanjutnya bakteri diisolasi. FRESHSYA ZATALINI (115061100111003) Pertanyaan : Bagaimana cara kontrol temperatur pada proses spread plate agar suhunya tidak tinggi sehingga tidak mematikan bakteri? Jawaban : Pada teknik spread plate tidak menggunakan suhu yang tinggi. Tanah yang sudah dikeringaninkan dan diayak dimasukkan ke dalam tabung atau botol dengan tutup berukuran 25 ml hingga 1 cm dari permukaan tutup. Selanjutnya.2. hal ini mudah dilakukan yaitu dengan mengontrol terlebih dahulu suhu lingkungan dimana akan dilakukan teknik ini. apakah membelah diri ? Jawaban : Pada saat setelah pengambilan bakteri dari medium tertentu. teknik isolasi yang digunakan juga terdiri dari 3 macam misalnya kita memakai teknik pour plate dan penyimpanannya misalkan dengan metode freeze-drying. Jika berasal dari air sungai yang mengalir maka botol dicelupkan miring dengan bibir botol melawan arus air. 3. Mikroba yang akan dikultur menggunakan teknik ini merupakan mikroba yang dapat bertahan pada suhu tinggi. pembentukan tunas dll) Dhanang Edy P (115061101111007) Pertanyaan : Jika kita mengambil mikroba dari alam. 1. Bilamana diperlukan. misalkan pengambilan bakteri dari air. dan setelah dingin disimpan di dalam desikator hingga digunakan. dan setelah itu diambil 1 bakteri ( yang telah dipilih. (Desikator adalah suatu wadah yang terbuat dari bahan kaca yang kedap udara dan mengandung desikan yang berfungsi menghilangkan air dari kristal hasil pemurnian). Pengambilan sampel air bergantung kepada keadaan air itu sendiri. botol dioven kering pada suhu 105 ºC selama satu jam. Bila pengambilan sampel dilakukan pada air yang tenang. Namun. jika ingin 64 . Untuk kontrol suhu agar tidak tinggi ( lebih dari 45 oC). dan diteliti morfologinya) dan ditanam dimedium yang cocok agar bakteri dapat melakukan metabolisme dan perkembang biakan. lalu disimpan untuk digunakan seanjutnya. kemudian diautoklaf pada suhu 121 ºC tiga kali berturut-turut selama 3 hari masingmasing selama satu jam. Jawaban : Dari uraian materi diatas. sterilitas tanah diuji dengan menumbuhkan contoh tanah pada medium agar. dari sinilah akan terbentuk koloni kultur murni. Tabung atau botol yang berisi tanah diberi aquadest steril hingga kebasahan 50% kapasitas lapang. Jika suhu tidak melebihi 45oC maka masih dianggap aman untuk melakukan teknik ini. bagaimanakah alur prosesnya mulai dari pengambilan sampai penyimpanan.

2.

3.

4. 5. 6. 7.

mengambil sampel dari air keran maka sebelumya keran dialirkan dulu beberapa saat dan mulut kran dibakar. jika air sampel mengandung padatan maka harus diencerkan dahulu menjadi suspensi dengan aquades steril, fungsi dari tahap ini adalah untuk memisahkan mikroba dari medium padatnya. Selanjutnya teknik penanaman sampel dari cairan diatas, metode yang digunakan missal pour plate. pertama – tama menyiapkan cawan steril, tabung pengenceran yang akan ditanam dan media padat yang masih cair (>45oC). Diteteskan 1 ml secara aseptis, suspensi sel kedalam cawan kosong dan setelah itu Tuangkan media yang masih cair ke cawan kemudian putar cawan untuk menghomogenkan suspensi bakteri dan media, kemudian diinkubasi (pada temperature kamar). Setelah 24-48 jam inkubasi, amati bentuk koloni bakteri yang tumbuh di permukaan dan di dalam agar, apakah koloni-koloni bakteri terpisah merata atau masih menyatu dengan bakteri lain membentuk spreader. Diperhatikan koloni yang tumbuh pada media baik yang dipermukaan, tengah atau dasar medium. lalu dicatat semua koloni berdasarkan warna, bentuk, ukuran dan konsistensi koloni. Dari hasil pengamatan, maka dipilih bakteri yang di inginkan, setelah itu dipindahkan inokulan tersebut dan dijadikan biakan murni ke medium yang baru. Dilakukan penyimpanan misalkan dengan metode freeze-drying. 9. Teza Nur F (11506110211100) Pertanyaan : Mikroorganisme dapat disimpan menggunakan media nitrogen cair, adakah media lain yang bagus untuk media penyimpanan mikroorganisme, metode apa yang paling baik ? Jawaban : Dari hasil literature yang kami dapatkan, media pendingin selain nitrogen cair belum ada namun seperti yang telah dijelaskan masih banyak media lain yang dapat digunakan seperti media air steril dan media tanah steril (penggunaan media biasanya bergantung pada jenis mikroba yang akan disimpan dan jangka waktu penyimpanan yang diinginkan) . Untuk metode yang efektif menurut Ilyas adalah metode penyimpanan freeze- Drying karena dapat memelihara mikroorganisme dengan jangka waktu lebih lama daripada metode lainnya.

I.

Fermentor control dan Monitoring Kontrol fermentor dan monitoring berfungsi untuk mendeteksi ketika suatu proses fermentasi berlangsung tidak sesuai dengan yang diinginkan sehingga membuat proses itu berjalan sesuai dengan design fermentor yang digunakan. Kebanyakan sistem fermentasi dibuat mendekati dengan kondisi natural atau kondisi sebenarnya agar menghasilkan produk yang sesuai dengan prosesnya. Sistem fermentasi bergantung pada pengaruh berbagai sumber dari luar fermentor, sehingga diharapkan terjadi proses yang menyebar keseluruh media di fermentor secara natural. Untuk mempersempit variasi kualitas produk, proses operasi harus dimodifikasi untuk memperhitungkan pencegahan variasi kualitas produk yang akan dihasilkan dari fermentasi itu sendiri. Metode kontrol dan monitoring efektif untuk mendeteksi penyimpangan dan mengimbangi proses fermentasi, sehingga sangat penting untuk mengatur efisiensi proses dalam fermentor. Dan, memaksimalkan performa ekonomik atau biaya yang dibutuhkan yang biasanya hanya bisa dikendalikan dengan mengimprofisasi kontrol fermentor.

65

( Gary montauge,1997) Sistem fermentasi harus dikontrol secara efisien untuk mengoptimalkan produktivitas dan produk hasil, dan memastikan reproduktifitasnya. Sebagian besar parameter kimia dan fisika yang terlibat tergantung pada bioreaktor, model operasi, dan mikroorganisme yang digunakan. Parameter tersebut terutama aerasi, pencampuran, temperatur, pH, dan kontrol busa. Kontrol dan pemeliharaan pada tingkat optimum di dalam reaktor dioperasikandengna sensor elektroda, sistem kontrol yang cocok dan data logging. 1. Temperatur Temperatur fermenter harus dikontrol dengan baik, dengan ketelitian lebih kurang 0,10C. Pada industri skala besar, pendingin untuk menjaga suhu biasanya dibuat dari jaket air atau kumparan pipa sehingga pemanasan akan jarang dilakukan. Jika fermentor didesign untuk produktivitas yang rendah atau biomassa dengan konsentrasi rendah tetapi fermentor tersebut digunakan untuk produktivitas tinggi atau fermentasi biomassa dengan konsentrasi tinggi, sehingga akan terjadi penambahan panas dalam proses dan akan dibutuhkan penambahan air untuk mengatur suhu dalam fermentor. Pada fermenter berskala kecil, kemampuan pendingin dan pemanas dibutuhkan tetapi temperatur kontrol juga harus diperhatikan. 2. Aliran gas laju aliran gas biasanya diatur dengan menggunakan katup, karena aliran tergantung tekanan, baik kompensasi feedforward dari posisi katup untuk perubahan tekanan yang dikendalikan atau keduanya, tekanan dan aliran gas yang dikendalikan. 3. Liquid flow Regulasi aliran bisa didapat pada skala kecil dengan menggunakan pompa meter. Sedangkan peristaltic pompa sering digunakan pada skala laboratorium. Pendekatan lain yang digunakan adalah dosing pot, katup bertekanan rendah diatas fermentor dengan katup isolasi. Dengan mengetahui tekanan katup tersebut maka volume penembakan dapat ditentukan.

66

( Gary montauge,1997) 4. pH pH biasa dinyatakan dengan kaca elektroda, dimana biasanya elektroda terbuat dari perak atau perak klorida atau mercury/mercurious chloride dengan potassium chloride sebagai elektrolit. Elektroda mampu bertahan pada kondisi sterilisasi ( 1210C) tetapi pengulangan sterilisasi membuat penurunan performa sepanjang waktu. Pengontrolan pH dapat diraih dengan penambahan asam atau alkali pada fermentor. Pada fermentasi skala kecil, kebanyakan liquid ditambahkan menggunakan pompa peristaltic. Pada skala besar, penambahan gas ammonia lebih dipilih daripada ammonia hydroxide untuk masuk menuju aliran udara pada fermentor. Pada kultur sel hewan, penambahan karbon dioksida pada media digunakan untuk meregulasi pH selama periode pertumbuhan. 5. Pressure Tekanan perlu dikontrol untuk proses sterilisasi dan memenuhi kebutuhan keamanan. Tekanan dapat dikontrol dengan menggunakan katup regulasi. Itu adalah standart alat yang secara hukum harus diinstal pada fermentor untuk melepas tekanan diatas batas tekanan yang sudah ditentukan
67

Respon yang didapat dari analisa polarografi lebih cepat. atau iridium dan hasil yang didapat dari elektroda diindikasikan pada analisa pH yaitu perak atau perak klorida. Keduanya mengukur parsial DO dan membandingkannya dengan kejenuhan udara. biasanya hanya membutuhkan waktu beberapa detik. b. Alat ini menggunakan anoda perak dengan polarisasi negatif terhadap katoda platinum atau emas dengan menggunakan kalium klorida cair sebagai elektrolit. c. Dua buffer dengan konsentrasi karbon dioksida yang diketahui digunakan sebagai bahan kalibrasi. emas. Hasil perubahan konsetrasi karbon dioksida terlarut didapat dari variasi pH larutan yang dianalisa pada membrane yang bisa diketahui dengan elektroda pH. Analisa galvani menggunakan anoda timbal dan seng. Sehingga dapat digunakan pemecah busa . Sedangkan proses fermentasi skala besar menggunakan analisa elektroda polarografi . Analisa galvani digunakan untuk fermentor skala kecil karena peralatannya yang padat dan arena disebabkan oleh biaya yang rendah. 8. Biaya untuk analisa ini lima kali lebih mahal daripada galvani tetapi biaya untuk pemeliharaan cenderung lebih rendah. 9. Pengontrolan DO dengan mengganti komposisi gas yang dimasukkan akan lebih mahal karena membutuhakan gas yang telah dipurifikasi. Kesetimbangan akan terbentuk antara konsentrasi karbon dioksida di sisi lain membran. d. Dissolved Oxygen Tipe penganalisa DO pada bioreactor ada dua. 68 . Control untuk DO pada skala kecil biasanya menggunakan empat cara: Merubah kecepatan pengaduk Variasi pada aliran udara Modifikasi komposisi pada gas yang masuk Variasi pada tekanan yang berlebihan a. Pengukuran dilakukan dengan menggunakan elektroda platinum. 7. Foam Masalah saat membentukan busa dapat diatasi dengan pemberian antibusa tetapi antibusa ini dapat mengakibatkan racun bagi mikroorganisme dan mengurangi laju aliran. yang mengukur tekanan dengan mendeteksi perubahan elektrik Kristal asimetri 6. Dissolved Carbon Dioxide Dissolved carbon dioxide bisa diukur dengan menggunakan hydrophobic membrane. katoda perak dan potassium hydroxide. Potensial redoks Redoks ialah ukuran untuk oksidasi atau reduksi pada system biologi. yaitu galvani dan polarografi. Pengukuran redoks ini digunakan pada fermentasi anaerob dan fermentasi sel hewan dimana terdapat perubahan jumlah sel atau perubahan kondisi fisiologis. Metode ini biasanya digunakan pada kultur sel hewan karena disana terdapat spesifikasi komposisi gas yang dimasukkan.Metode elektrik pada pengukuran tekanan didasarkan pada penggunaan pembentukan kembali tranducer piezoelectric.

Jika tidak dikontrol. Waites. Data atau informasi yang didapat dari kontrol sistem dapat digunakan untuk membuat model proses dan dapat digunakan untuk pengembangan sistem fermentasi. Tingkat O2 dan CO2 terlarut ditentukan dengan elektroda O2 dan CO2. Sensor ini digunakan untuk mengukur dan mencatat kondisi pada bioreaktor. pH dalam fermentor dapat terjaga dengan cara penambahan asam atau basa secara otomatis jika pH yang ditangkap oleh sensor tidak sesuai. sistem kontrol kondisi fermentasi membutuhkan kalibrasi secara teratur saat pemasangan pertama kali dan di cek secara berkala. Produksi busa pada bioreaktor adalah masalah utama. alat pemecah busa. busa ini bisa memicu kontaminan dan pemblokiran filter udara. lemak. 69 . yang juga dapat berperan sebagai sumber nitrogen. Kontrol sistem fermentasi secara keseluruhan dapat dilakukan secara manual atau otomatis. Banyak proses fermentasi memproduksi asam dan pengaturan pH dapat berlangsung dengan menggunakan amonium oksida. Pengontrolan pH adalah faktor. karbohidrat dan substrat atau hasil metabolisme yang lain. RNA. atau penambahan agen antibusa. Ada tiga cara untuk mencegah pembentukan busa. Media fermentasi banyak mengandung garam buffer.(Michael J. Pembentuka busabusa tersebut disebabkan oleh hadirnya protein yang dapat membentuk busa. Pemantauan suhu melalui termometer resistensi dan termistor yang terhubung dengan pemanas otomatis ataupun dengan sistem pendingin.2001) Sampel dapat diambil secara acak untuk berbagai analisis seperti perhitungan sel dan penentuan DNA. karena produk fermentasi bisa berubah disebabkan adanya perubahan pH dalam media fermentasi. tetapi kapasitas fosfat untuk mengontrol pH dapat berlebihan sehingga dibutuhkan penambahan asam atau alkali. Ketika terdapat kondisi yang tidak sesuai dengan kondisi yang diinginkan maka akan muncul tanda peringatan dan sistem pengkoreksi akan teraktifikasi sehingga memberikan kontrol yang lebih intens pada sistem fermentasi. terutama pada fermentasi aerasi. spesifik protein. biasanya fosfat. yaitu modifikasi media. Meskipun begitu. Prinsip dasar pengontrolan sistem melibatkan sistem sensor yang terhubung dengan sistem kontrol dan feedback loop.

disterilkan. Pada fermentasi batch. pengisian dan pendinginan setelah sterilisasi. Ketika produk sudah dihasilkan dan dipanen. Proses fermentasi yang lain yaitu fed-batch yang banyak digunakan dalam memproduksi ragi roti dan penicilin. Kelemahan lain sistem batch yaitu keragaman produk. serta proses pengolahan air buangan. Yaitu sistem tertutup yang tidak ada inokulasi (penyuntikan) ataupun tambahan asam atau basa untuk kontrol pH pemakaian udara untuk fermentasi aerob. Selain itu. Sistem fermentasi batch telah telah sukses digunakan untuk menghasilkan banyak produk fermentasi tradisional dan untuk memproduksi metabolit sekunder seperti antibiotik. Hanya sebagian kecil dari siklus fermentasi batch yang dapat dikatakan produktif. enzim. perlu ditambahkan nutrisi ekstra selama proses fermentasi untuk menambah volume fermentasi. sesekali. fed-batch. Contoh proses ini yaitu meliputi produksi minuman berakhohol. Untuk model operasi ini. Bagaimanapun. banyak dari pembuatan asam amino. Operasi fed-batch dapat memperpanjang fase pembentukan produk dan dapat mengatasi masalah yang terkait dengan penggunaan substrat yang banyak. Model fermentasi ini juga berguna saat substrat mengalami masalah viskositas atau racun ketika konsentrasi terlalu tinggi. Keuntungan dari sistem batch adalah bahwa pengeluaran modal lebih rendah dan jika terjadi kontaminasi maka relatif cukup mudah untuk dihentikan dan dapat memulai proses fermentasi lagi. ditambah meningkatnya fase non produktif downtime yang melibatkan proses pembersihan. fermentor harus dibersihkan sebelum proses fermentasi dimulai lagi. sterilisasi.II. Peningkatan frekuensi sterilisasi juga dapat menyebabkan stres yang lebih besar pada instrumen pengontrol. Proses yang banyak digunakan adalah proses batch. fase non produktif ini disebut sebagai “down-time”. dimana sel-sel pertama tumbuh melampaui fase pertumbuhan yang cepat sebelum akumulasi metabolit. atau asam organil. dan diinokulasi sehingga organisme tumbuh berdasarkan profil yang khas. Penambahan nutrisi ekstra dapat dilakukan terus menerus. Fed-batch dengan menggunakan sel daur ulang ( biomassa) juga dapat digunakan untuk tujuan tertentu seperti fermentasi beberapa etanol. serta metabolisme yang berlangsung secara cepat. Fermentor disiapkan. 70 . Karena terdapat lag period yang cukup besar dan pada tahap selanjutnya dari fase eksponensial dengan banyaknya jumlah produk yang dihasilkan. fermentasi batch secara teoritis kurang efektif untuk produksi biomassa dan produk metabolit primer. dan lain-lain. Mode Operasi Industri fermentasi berlangsung secara batch. atau sesering mungkin sebagai satu suplementasi ketika kultur mendekati akhir fase pertumbuhan. semua kondisi sudah ditentukan dan dipastikan pada awal dan akhir proses. atau kontinu.

Sistem kontinu mengurangi down-time dan mengurangi biaya operasi yang lebih rendah. Meskipun begitu. Masalah yang terkait dengan proses fermentasi kontinu selain masalah pengeluaran air buangan.1997) 71 . ( Gary montauge. 1996) Kultur kontinu adalah sistem terbuka dimana medium akan ditambahkan secara kontinu dan kultur secara serempak dipindahkan pada tingkat yang sama. (Vogel. Akibatnya. sistem tersebut lebih produktif daripada sistem batch. Fermentasi kontinu sangat cocok untuk produksi biomassa dan pertumbuhan yang berkaitan dengan metabolit primer. Dalam sistem kontinu. sehingga sistem bekerja pada volume yang sama. dan umumnya dibutuhkan lebih banyak personil untuk mengoperasikan sistem batch. Namun sistem ini membutuhkan modal yang cukup tinggi. masalah ini dapat diatasi dengan GMP dan praktek mikrobiologi yang benar. kondisi operasi menyebabkan membentuk mutan yang lebih banyak pada hasil dengan kualitas yang lebih rendah daripada hasil asli. sel-sel tumbuh secara eksponensial (membelah) untuk waktu lama yang ditentukan dalam laju pertumbuhan spesifik.biaya yang dibutuhkan lebih besar untuk mempersiapkan dan memelihara stok kultur. Namun. sterilitas harus dipertahankan dan media harus disuplai secara terus menerus dengan komposisi konstan. termasuk fakta bahwa sepanjang pengoperasian 20-50 hari atau lebih. Selain itu sistem ini memiliki sifat untuk mencapai stady state dimana konsentrasi nutrisi dan jumlah sel sudah tidak bervariasi terhadap waktu.

Untuk skala industry fermentasi. Jika kontaminan adalah bakteriofag. mereka harus benar-benar disterilkan. dapat melisiskan kultur. kondisi aseptik harus dipertahankan (Waites. kontaminan yang dapat berkembang dengan cepat dapat tumbuh dan dapat menghilangkan nutrisi. sebelum proses fermentasi dilakukan. Wadah atau vessel – nya lalu dimasuki media steril. Penghancuran sel terjadi pada saat pemanasan (T=121 oC) dan pendinginan. beberapa industry fermentasi tidak aseptis. Konsekuensinya. yang disiapkan di dalam pemasak medium batch atau continous yang dapat mengoperasikan beberapa fermentasi. Gambar : filter membrane berserat 3. Oleh karena itu. Istilah ini banyak digunakan dalam industri fermentasi. tujuannya adalah untuk memberikan kondisi sterilisasi yang memberikan probabilitas kontaminasi dari 0. semakin besar waktu sterilisasi diperlukan. Umumnya. Namun. Kontaminan dapat memproduksi produk yang berbahaya bagi organisme. Maka dari itu factor Del nya dapat dinyatakan sebagai berikut: 72 . Sebagai kemungkinan lain. dibutuhkan sterilisasi secara ketat. 2008). Jika tidak.1% (1 dalam 10000). jika jumlah sel mikroba diketahui (No).penyuplaian udara dibutuhkan secara kontinu.MEDIA AND VESSEL STERILIZATION Untuk skala industry fermentasi aseptis fermenter dapat di sterilkan pada saat kosong. 3. 2001). Oleh karena itu. Selain itu. fermenter diisi dengan media yang sudah terformulasi. factor Del (▽=ln No/Nt)dapat dihitung (selengkapnya ligat chapter 2). Kontaminasi mikroorganisme juga dapat memetabolisme produk target.1. STERILIZATION Kebanyakan industri fermentasi menggunakan kultur murni dimana pertumbuhan terjadi pada strain yang terpilih. Faktor del sendiri adalah jumlah organisme pada awal sterilisasi dan Nt adalah jumlah yang tersisa setelah waktu t. lalu kedua medium tersebut dapat di sterilkan bersamaan. Teknik pensterilan udara yang paling efektif adalah dengan menggunakan filter membrane berserat (Dutta. yang melibatkan peningkatan suhu atau waktu sterilisasi . produksi organisme harus bersaing dengan kontaminan untuk nutrisi yang terbatas. Jjika terdapat mikroorganisme asing pada media atau pada peralatan. maka. semakin besar faktor del.0 vvm (air volume per liquid volume per minute). faktor del adalah ukuran pengurangan pecahan dalam jumlah organisme yang layak diproduksi oleh panas tertentu dan rezim waktu. Laju aerasi untuk tipikal fermentasi aerob adalah 0. memproduksi senyawa beracun atau produk sekresi yang dapat memblokir filter dan mengganggu pengolahan hilir atau downstream process.2. atau pemanasan untuk membunuh mikroba spesifik tanpa memberikan efek yang berarti. Oleh karena itu. Ini membutuhkan jumlah udara yang sangat besar. dengan kata lain.AIR STERILIZATION Pada fermentasi aerob.III. tidak hanya media saja yang harus steril namun udara yang digunakan juga. seperti yang terjadi pada fermentasi yang melibatkan bakteri asam laktat. media dan seluruh alat yang akan digunakan harus bebas dari kontaminasi.5 – 1. tetapi kontaminasi mikroba tetap terjadi dalam jumlah yang dapat ditoleransi dengan cara pasteurization.

1. memerlukan sedikit tenaga kerja.g. konstituen media tertentu yang bersifat rapuh akan dirusak oleh panas yang berlebihan. Ini biasanya merupakan operasi continuous di mana waktu holding dikendalikan oleh laju aliran melalui sterilisasi dan material tersebut kemudian dengan cepat didinginkan dalam heat exchanger. Uap juga dapat diinjeksikan secara langsung ke dalam ruang di atas media fermentasi. (Waites. 2001) 3. Memberikan kondisi yang mudah dalam menghasilkan produk. vitamin dan media kultur sel hewan. Beberapa juga dapat disterilisasi dengan panas namun untuk meminimalisir kerusaka digunakan suhu tinggi untuk waktu yang sangat singkat. Ini dapat membantu sterilisasi. Bahan yang bersifat sensitive terhadap panas tadi sebelumnya disterilisasi dengan cara filter sterilization yang menggunakan filter membrane dimana pori – pori nya berukuran 0. memerlukan sedikit air pendingin. 140oC dengan lama waktu pemanasan hanya 50 detik. 2. 73 . sehingga memungkinkan maximum utilisasi pabrik dan meminimalisir penundaan atau keterlambatan produksi.dan cooling.2 m yang akan secara efektif menyaring kontaminan microorganism. Namun. Holding section atau ▽holding merupakan pemanasan media yang biasanya terdiri dari tabung panjang. sterilisasi uap melibatkan pemberian uap dibawah tekanan kedalam selimut bejan atau kumparan internal. Metode injeksi uap secara langsunglebih efektif daripada pemanasan secara tidak langsung karena tidak ada penghalang antara media dan sumber panas.3.▽total = ▽heating + ▽holding + ▽cooling Pada prakteknya. suhu dapat diasumsikan konstan. Kelebihan sterilisasi uap adalah proses yang murah dan efektif dibandingkan sterilisasi panas kering. Holding section dipertahankan dalam kondisi adiabatik. Akibatnya. Proses sterilisasi kontinu terdiri dari tiga bagian utama: heating. 5. 4.g. e. e. Dapat beroperasi pada suhu tinggi (T = 140oC). Sterilisasi kontinu memiliki beberapa kelebihan yaitu : Menyederhanakan strategi perencanaan produksi atau production planning.CONTINUOUS STERILIZATION Proses sterilisasi dapat dilakukan dengan cara kontinu. glukosa. 3. Heating section : Metode pemanasan dapat dikategorikan menjadi dua yaitu (1) injeksi uap secara langsung. Uap yang dibutuhkan untuk memulihkan panas dari media steril jauh lebih sedikit. dengan demikian. tetapi dapat mengakibatkan perubahan volume media. sehingga waktu sterilisasi dapat dipersingkat. holding. Jika panas yang hilang di bagian diabaikan. Lebih mudah dalam pengotomatisasi proses. (2) pemanasan secara tidak langsung di heat exchanger.

Adapun kekurangan dan kelebihan fermentasi substrat-padat yang dapat dilihat pada tabel dibahawah ini: 74 . sehingga dapat diabaikan (Dutta. 2008) IV.Holding section : merupakan pemanasan media yang biasanya terdiri dari tabung panjang. holding. biasanya organic. kondisi yang diinginkan sulit dicapai.4. Pada proses fermentasi substrat-padat biasanya enzim. Teknik lain adalah dengan menyuntikkan media panas melalui katup ekspansi keruang hampa. FERMENTASI SUBSTRAT-PADAT Fermentasi substrat-padat telah digunakan untuk memproduksi berbagai macam makanan fermentasi terutama di Asia selama beribu tahun lamanya. Cooling : Untuk bagian pendingin. Holding section dipertahankan dalam kondisi adiabatik. suhu dapat diasumsikan konstan. Kedua teknik pendinginan ini membutuhkan waktu yang sangat singkat. yang dikenal sebagai flash cooling. asam organic dan etanol di produksi. Fermentasi substrat-padat melibatkan penumbuhan mikroorganisme pada padatan.BATCH STERILIZATION Media sterilisasi di dalam fermenter dapat dilakukan secara batch dengan penyebaran uap menggunakan pemanas elektrik atau sirkulasi tekanan konstan kondensasi uap melalui koil pemanas. Penggunaan fermentasi substrat-padat sering terhambat dengan kurangnya control daripada kondisi didalam bioreactor. khususnya mempertahankan suhu dan kelembaban optimal. leguminosa. kulit padi. namun metode ini jarang digunakan di Eropa dan Amerika Utara. dan cooling. Jika panas yang hilang di bagian diabaikan. pengurangan kapasitan panas dengan menggunakan quench cooler secara efektif. 2008) 3. dsb. material dengan kadar air yang sangat kecil atau tampa air sana sekali. Substrat yang sering digunakan seperti butiran gandum. Sirkulasi sterilisasi terdiri dari heating. Fermentasi substrat-padat tidak memiliki mekanisme kontrol canggih yang biasanya berhubungan dengan fermentasi submerge. (Dutta.

e.g. 2.Bioreactor yang digunakan pada fermentasi substrat-padat Kebanyakan fermentasi substrat-padat merupakan proses batch. penurunkan laju difusi oksigen. Alhasil. seperti yang dijelaskan sebelumnya.2. Jika level kelembaban terlalu rendah. 3. serta penurunan pertukaran gas. Dual kultur. Aw Air yang hilang pada proses fermentasi pada umumnya melalui evaporasi dan aktivitas metabolisme. proses ini tidak membutuhkan agitasi dan aerasi. jika level kelembaban terlalu tinggi akan terjadi penurunan porositas substrat.2001) 4. yang biasanya membutukan proses kimiawi ataupun biologis. protein & polysakarida.1. Ini biasanya diganti dengan pelembaban atau penambahan air secara berkala. e. AERASI Kebanyakan fermentasi substrat-padat bersifat aerob. Mikroorganisme – mikroorganisme ini dapt berbentuk : 1. Agaricus bisporus. (Waites. Namun. Beberapa proses tidak membutuhkan bioreactor. 3. Bagaimanapun juga. (Waites. Metode ini berhasil digunakan dalam memproduksi spora Coniothyrium minitans untuk bio kontrol terhadap jenis bakteri tanaman jamur. dapat mengganggu transfer oksigen.g. Akan tetapi. seperti yang digunakan dalam composting (pembuatan pupuk kompos).ENVIRONMENTAL PARAMETERS THAT INFLUENCE SOLID-SUBSTRATE FERMENTATIONS WATER ACTIVITY. Sporulasi biasanya tercapai pada fermentasi substrat-padat.g. 4. Proses fermentasi subtrat-padat merupakan multistep process yang melibatkan: Pretreatment substrat. Aw = 0. Mikroorganisme yang terdapat pada fermentasi substrat-padat.1. seperti yang ada pada produksi jamur. Kultur campuran. e. adalah jenis yang dapat menoleransi water activity yang rendah. namun adanya kebutuhan oksigen tergantung pada jenis mikroorganisme yang dipakai dan jenis proses. jika air di dalam ruang kosong berlebih.7. Suhu sebagian besar dikontrol menggunakan aerasi dan/atau agitasi pada substrat. mereka cukup melibatkan penyebaran substrat ke dasar. 2. Hidrolysis polimer substrat. ketika oksigen terlarut dalam film air di sekitar partikel substrat. Bioreactor yang dipakai seperti yang terdapat pada gamabr dibawah ini: 75 . CO2 dan senyawa volatile yang dapat mengganggu. dan Pemisahan dan pemurnian produk akhir. straw bioconversion yang menggunakan Chaetomium cellulilytic dan Candida tropicalis. Sclerotinia sclerotiorum. substrat menjadi sulit untuk diterima sehingga terjadi penurunan pertumbuhan mikroba. Laju transfer oksigen terpengaruh dengan ukuran partikel substrat yang juga menyatakan ruang kosong. kebanyakan fermentasi aerob membutuhkan aerasi dan agitasi. laju degradasi substrat menurun dan resiko kontaminasi mikroba menaik. SUHU Panas yang dihasilkan dapat menjadi masalah serta merupakan pengaruh besar pada kelembaban relatif dalam fermentasi. Penggunaan atau pemanfaatan produk daripada hydrolysis. Monokultur.2001) 4. Beberapa proses anaerob. Laju aerasi yang disediakan berhubungan dengan penghilangan panas. seperti proses produksi silage. Transfer oksigen di dalam ruang kosong ini berhubungan dengan level kelembaban.

packed bed. solid state. Namun dalam scale up terdapat kerugian – kerugian seperti menurunnya hasil produksi. terdiri dari alas substrat yang kedalamannya mencapai 1 m.2001) 4. Fluidized bed reactor Bioreactor jenis ini menyediakan agitasi secara kontinu dengan udara yang dipakasa masuk untuk mencegah adhesi dan agregasi partikel substrat. continuous. Factor utama yang mempengaruhi hasil atau yield pada saat proses scale up : 1. dimana substrat padat dikemas dengan selimut yang berfungsi sebagai control suhu. etc. Bioreactor ini digunakan untuk memproduksi asam organic. Fermenter ini digunakan pada produksi enzim dan biomassa mikroba. fed-batch. Column bioreactor Terdiri dari kolom yang terbuat dari kaca atau plastic. etc. a. lalu dimasukkan ke dalam chamber yang di alirkan udara lembab. Jika mikroorganisme dikatakan cocok maka akan dilakukan scale up. Substrat di tambahkan dengan ketinggian beberapa cm pada setiap tray. hal ini disebabkan oleh kondisi dalam fermenter skala besar tidak identik dengan yang di praktekkan dalam laboraturium. System ini berguna untuk memproduksi pakan ternak. Prosedur propagasi inokulum yang diadopsi. (Waites.) formulasi media system fermentasi (stirred tank. serta kualitas dan kuantitas inokulum yang digunakan untuk memulai fermentasi. dimana udara lembab di alirkan secara kontinu.3. etanol dan biomassa.Rotating drum fermenter Terdiri dari bejana silinder yang berkapasitas 100 L dan terdapat roller yang berfungsi untuk menegakkan dan memutar bejana. Kerugian utama dari pada unit ini adalah hanya dapat diisi 30% dari kapasitas total. d. penelitian terhadap kinerja mikroorganisme dilakukan dengan mempertimbangkan berbagai hal seperti: pH optimum strategi pemberian nutrisi ( batch. c. 76 . jika tidak pengadukan akan tidak efisien. hollow fibre. Bed system Seperti yang digunakan dalam produksi sake. airlift.) suhu optimum oksigen terlarut produksi busa - Penelitian dilakukan menggunakan fermenter skala laboratrium yaitu 1-10L fermenter.Fermentation process development Setelah mikroorganisme telah dipilih sebagai produser organism untuk proses tertentu . b. System ini membutuhkan sejumlah tray dan runag inkubasi yang luas dengan kapasitas volume mencapai 150 m3 . Tray fermenter Bioreactor jenis ini sering digunakan untuk produksi makanan fermentasi dan enzim.

maka laju aliran dalam fermentor akan otomatis menjadi berkurang. Pada mode operasi batch. ph. Saat pH naik atau turun. dan oksigen. ketika katup mendeteksi tekanan dalam fermentor mengalami penyimpangan maka katu akan memberikan sinyal kepada controller untuk mengoreksi fermentor 2. 4.2. mudah dihentikan. gradien suhu. Protokol sterilisasi skala industri dapat menyebabkan degradasi yang lebih besar dari senyawa yang tidak stabil. Bagaimana anti busa dapat mengurangi laju aliran dalam fermentor? Apa perbedaan antara penambahan antibusa dan tidak adanya penambahan antibusa pada kondisi fisik cairan dalam fermentor?  Fungsi antibusa adalah untuk memecah busa sedangkan busa dihasilkan karena laju aliran yang ada dalam fermentor. 3. Batch akan mudah mencapai fase datar( stasioner) 10. b. (Waites. Pada keadaan bagaimana uap langsung dipakai 6. Bagaimana cara kerja katup dalam proses fermentasi dalam mengatur tekanan dalam fermentor?  Katup yang dipasang dalam fermentor memiliki sensor yang dapat mendeteksi tekanan dalam fermentor. Pada proses fermentasi pasti akan menghasilkan limbah. metabolit primer bekerja pada fase eksponensial yang membutuhkan penambahan terus 9. Substrat yang seperti apa?  Substrat yang dimasukkan dalam fermentor adalah substrat yang dibutuhkan dalam proses fermentasi. Vivi anita aprilia (115061107111005) a. yang mempengaruhi kualitas akhir dari medium. Pada fed batch substrat digunakan untuk controller. 5. maka asam atau basa dimasukkan. gaya geser dan laju penghapusan karbon dioksida. Pemilihan media. yang tidak dilakukan dalam skala kecil. Terjemahan 2.. Apakah limbah tersebut berpotensi untuk mencemari lingkungan? 77 .2001) Komentar: 1. Konsentrasi asam atau basa ditentukan tergantung pada proses fermentasi 4. Semakin besar laju aliran. Control proses dan monitoring pada fermentasi anaerob 5. Febrika Larasati (115061101111001) a. Untuk klasifikasi substrat yang dimasukkan bergantung pada macam fermentasi dan macam produk yang akan dihasilkan b. Ketika busa ditekan pembentukannya. Fermentasi harus digunakan pada fermentasi awal 3. maka akan semakin banyak protein yang dihasilkan dan busa yang terbentuk juga semakin banyak. Fermentor yang besar sering dikenakan perkembangan gizi. Batch tidak untuk pembuatan metabolit primer. sedangkan pada kontinu penghentian akan berdampak kerugian yang besar 8. Keuntungan fermentasi substrat-padat Prtanyaan: 1. sumber nutrisi yang lebih murah sering digunakan untuk operasi skala besar karena kendala biaya. Scale up juga dapat merubah generasi busa. Foam terbentuk karena ada gas-gas yang menarik protein keatas 7.

Untuk limbah-limbah ini biasanya digunakan untuk bahan baku proses lainnya.  4. PFR Untuk reaksi heterogen. Misalkan metode fermentasi kontinu digunakan untuk memproduksi vinegar atau cuka. yaitu kerja kimia. Molekul dan ion ditransportasi melewati sel membran melawan gradien elektro-kimia. Sel hidup memiliki tiga tipe kerja utama. G. Intan Nuroniyah (115061101111001) Bagaimana cara menganalisa karbon dioksida terlarut? Diukur dengan menggunakan hydrophobic membrane.  6. sebuah molekul bisa bergerak ke 78 . 3. Sharfina W. misalnya antara bahan baku gas dengan katalis padat menggunakan model PFR.  7. dan kerja mekanik. dan lain-lain.  5. Afida khofsoh (1150611011110031) Kapan metode fermentasi tertentu dapat digunakan? Tergantung hasil produk apa yang diinginkan. kerja transport. reaksi termal. Kerja kimia termasuk sintesis molekul biologi kompleks yang diperlukan oleh sel. Hasil perubahan konsetrasi karbon dioksida terlarut didapat dari variasi pH larutan yang dianalisa pada membrane yang bisa diketahui dengan elektroda pH. Sedangkan pada metode Polarografi menggunakan anoda perak dengan polarisasi negative terhadap katoda platinum/emas dengan menggunakan kalium klorida sebagai elektrolit. Ketiganya penting untuk proses hidup. biasanya limbah yang dihasilkan yaitu gas keluaran mikroorganisme yaitu gas CO2. Dobita Amanda Feliciana (1150611001110021) Apa yang membedakan metode Galvani dan Polarografi pada kontrol proses? Pada proses Galvanisasi elektroda yang digunakan adalah anoda timbal atau seng dan katoda perak. Sitanggang (1150611001110015) Apa perbedaan CSTR & PFR? CSTR adalah reaktor model berupa tangki berpengaduk dan diasumsikan pengaduk yang bekerja dalam tanki sangat sempurna sehingga konsentrasi tiap komponen dalam reaktor seragam sebesar konsentrasi aliran yang keluar dari reaktor. ENERGI DAN ENZIM Energi dapat didefinisikan sebagai kapasitas untuk melakukan kerja atau untuk melakukan suatu pergerakan. Limbah fermentasi biasanya tidak mencemari lingkungan Winda Fauzi Istiqomah (115061101111003) Apa yang mendasari kondisi aliran pada proses? Jenis mikroorganisme yang digunakan dan produk yang akan dihasilkan dari proses fermentasi itu sendiri. atau reaksi antara cair dan gas dengan katalis cair. Sebagai contoh. Semua proses fisika dan kimia merupakan hasil aplikasi atau perpindahan dari energi.  Pada proses fermentasi. (1150611005111003) Professor Chandra pernah menyebutka tentang Reaktor Plug Flow? Adalah suatu alat yang digunakan untuk mereaksikan suatu reaktan dalam hal ini fluida dan mengubahnya menjadi produk dengan cara mengalirkan fluida tersebut dalam pipa secara berkelanjutan (continuous). Biasanya reaktor ini dipakai untuk mempelajari berbagai proses kimia yang penting seperti perubahan kimia senyawa. Asumsi yang digunakan adalah tidak ada perbedaan konsentrasi tiap komponen yang terlibat di sepanjang arah jari-jari pipa. Model ini biasanya digunakan pada reaksi homogen di mana semua bahan baku dan katalisnya berfasa cair. Katalis diletakkan pada suatu pipa lalu dari sela-sela katalis dilewatkan bahan baku seperti air melewati sela-sela pasir pada saringan. limbah lainnya yaitu zat-zat yang merupakan hasil samping dalam fermentasi. • 8. PFR mirip saringan air dari pasir. Queen G. energi dibutuhkan untuk menambah kompleksitas molekular dari sel. Kesetimbangan akan terbentuk antara konsentrasi karbon dioksida di sisi lain membran. Dua buffer dengan konsentrasi karbon dioksida yang diketahui digunakan sebagai bahan kalibrasi.

dalam sel meskipun konsentrasi di dalam sel lebih tinggi daripada konsentrasi di luar sel. Sama dengan larutan yang dapat keluar dari sel dengan melawan gradien konsentrasi. Proses ini disebut kerja transport dan membutuhkan energi agar dapat mengambil nutrisi, membuang kotoran, dan menjaga keseimbangan ion. Tipe ketiga adalah kerja mekanik. Energi dibutuhkan untuk mengubah lokasi fisik dari organisme, sel, dan struktur di dalam sel. Sumber energi pokok dari semua energi biologi adalah sinar matahari. Energi tersebut ditangkap oleh phototrops (organisme) selama fotosintesis, dimana ia diserap oleh klorofil dan pigmen lainnya, dan dikonversi menjadi energi kimia. Kemolithoautotrophs memeperoleh energi melalaui oksidasi komponen inorganik daripada melalui sinar matahari. Energi kimia dari fotosintesis dan kemolithotrofi dapat digunakan oleh fotolithoautotrophs dan chemolithoautotrophs untuk mengubah CO2 menjadi molekul biologi seperti glukosa. Molekul kompleks yang dihasilkan oleh organisme autotrophic (tanaman maupun produsen mikroba) bertindak sebagai sumber karbon untuk kemoheterotrophs dan konsumen lain yang menggunakan molekul organik kompleks sebagai sumber material dan energi untuk membangun struktur selulernya (autotrophs menggunakan molekul organik kompleks). Kemoheterotrophs selalu menggunakan O2 sebagai akseptor elektron ketika oksidasi glukosa dan molekul organik lain menjadi CO2. Proses ini, ketika O2 berperan sebagai akseptor elektron final dan O2 direduksi menjadi H2O, disebut respirasi aerobik. Banyak energi yang dihasilkan dalam proses ini. Jadi pada ekosistem, energi ditangkap oleh photoautotrophs dan kemolithoautotrophs; beberapa energi ini kemudian mengalir ke kemoheterotrophs ketika mereka memakai nutrisi yang didapat dari autotrophs. Produksi CO2 selama respirasi aerobik dapat digabungkan kembali ke dalam molekul organik kompleks selama fotosintesis dankemolithoautotrophy. Pada ekosistem, aliran karbon dan energi sangat berhubungan. Tabel mikroorganisme dan sumber energinya:

Sel-sel harus dengan efisien mentransfer energy dari produksi energy. Sel-sel harus memiliki bentuk yang sederhana dari energy, agar. Dalam kehidupan, kebanyakan organisme memiliki energi yang berupa adenosine 5‟ tripospat (ATP). Ketika ATP memecah diri menjadi adenosin dipospat (ADP)dan orthopospat (Pi), energi yang dihasilkan dapat digunakan untuk melakukan kerja. Kemudian, energi dari fotositesis,
79

respirasi aerobik, respirasi anaerobik, dan fermentasi digunakan untuk menyintesis ulang ATP dari ADP dan Pi. Siklus energi ini terjadi di dalam sel. Siklus energy dibuat dalam sel. Enzim adalah protein katalis yang memiliki spesivitas untuk reaksi. Katalis adalah substan yang mempercepat reaksi kimia tanpa ikut dalam proses reaksi tersebut. Enzim mempercepat reaksi seluler. Molekul yang bereaksi disebut substrat, substan yang terbentuk disebut produk. Banyak enzim yang merupakan protein murni, contohnya apoenzim, dan juga komponen nonprotein, yaitu kofaktor, yang dibutuhkan untuk aktivitas katalitik. Enzim lengkap terdiri dari apoenzim dan kofaktornya, yang disebut holoenzim. Jika kofaktor melekat pada apoenzim, ini disebut prosthetic group. Meskipun enzim berjumlah banyak dan jenisnya bermacam-macam, namun enzim dikelompokkan menjadi tujuh kelas umum. Pengelompokkan ini berdasarkan reaksi katalis yang dihasilkan oleh enzim. Enzim biasanya memiliki nama yang mirip dengan substrat yang akan direaksikan dan tipe reaksi katalis. Sebagai contoh, laktat dehidrogenase fungsinya adalah menghilangkan hidrogen dari laktat. Biasanya ditambah akhiran –ase. Klasifikasi enzim: Mekanisme reaksi enzim Enzim menambah kecepatan reaksi, tetapi tidak menjaga kesetimbangan secara konstan. Pada reaksi endergonik, enzim tidak melakukan kesetimbangan agar banyak produk terbentuk. Enzim mempercepat laju reaksi, agar laju reaksi melanjutkan kesetimbangan finalnya. Pada reaksi eksergonik, enzim akan menurunkan energi aktivasi. Energi aktivasi adalah energi yang dibutuhkan agar molekul reaktan dapat bereaksi bersama dan membentuk produk.

A B A tidak akan dikonversi menjadi B jika tidak disuplai oleh energi aktivasi. Enzim mengakselerasi reaksi dengan menurunkan energi aktivasi, sehingga banyak molekul yang memiliki cukup energi untuk membentuk produk. Enzim membawa substrat dengan bagian tertentu yang disebut sisi aktif atau katabolis aktif. Enzim dapat berinteraksi dengan substrat melalui dua cara, yaitu lock and key dan induced fit model. Pada lock and key, enzim dan substrat bergabung bersama membentuk kompleks, seperti kunci yang masuk dalam gembok. Di dalam kompleks, substrat dapat bereaksi dengan energi aktivasi yang rendah. Setelah bereaksi, kompleks lepas dan melepaskan produk serta membebaskan enzim. Ukuran molekul enzim > ukuran molekul substrat. Sementara itu pada induced fit model, sisi aktif enzim merupakan bentuk yang fleksibel. Ketika substrat
80

memasuki sisi aktif enzim, bentuk sisi aktif termodifikasi melingkupi substrat membentuk kompleks. Ketika produk sudah terlepas dari kompleks, enzim tidak aktif menjadi bentuk yang lepas. Sehingga, substrat yang lain kembali bereaksi dengan enzim tersebut. Contohnya adalah enzim heksokinase. Perubahan pH dan suhu mempengaruhi kerja enzim. Setiap enzim memiliki pH dan suhu optimum yang berbeda antara satu dengan yang lain. METABOLISME Metabolisme mencakup semua reaksi enzim-katalis dari sel, dan dapat dibagi menjadi proses primer dan sekunder. Jalur metabolisme primer umumnya digunakan oleh sebagian besar organisme. Terdapat dua jenismetabolisme, disebut sebagai katabolisme dan anabolisme, yang memanfaatkan energi dalam biosintesis komponen seluler untuk pertumbuhan dan perkembangan. Untuk mempermudah pemahaman, katabolisme dan anabolisme dianggap sebagai proses yang berbeda, tetapipada faktanya kedua jenis metabolisme tersebut sangat terintegrasi. Produk dari metabolisme primer yang penting untuk industri tertentu adalah alkohol, asam amino, asam organik, nukleotida, enzim dan mikroba sel (biomassa). Beberapa mikroorganisme juga melakukan metabolisme sekunder, yang melibatkan jalur yang tidak digunakan selama pertumbuhan yang cepat. Metabolisme, seringkali menghasilkan produk akhir yang spesifi. Metabolit sekunder yang penting untuk industri adalah alkaloid, antibiotik, racun dan beberapa pigmen. Metabolit sekunder tertentu dapat memberikan suatu keuntungan ekologi, sedangkan yang lain tidak memiliki nilai nyata untuk organisme produser. KATABOLISME Semua sel mikroba vegetatif memerlukan pasokan energi kontinyu untuk proses yang terkait dengan pertumbuhan,transportasi, gerakan, dan perkembangan. Dalam mikroorganismekemoheterotrophic, sumber energi organikdiperoleh dari lingkungan dan kemudianditransformasikan oleh serangkaian reaksi enzim yang dikendalikandalam jalur metabolik tertentu. Metabolisme ini (katabolisme) mengarah ke pembentukanenergi potensial dalam bentuk adenosine 5 ¢-trifosfat (ATP) dan koenzim tereduksi, sepertisebagai nikotinamida adenin dinukleotida (NADH), nicotinamideadenin dinukleotida fosfat (NADPH)dan flavin adenin dinukleotida (FADH2), dan panas. Sebagian besar mikroorganisme dapat memanfaatkan karbohidrat,yang dapat bertindak sebagai sumber karbon dan energy yang baik.Glukosa adalah substrat yang disukai banyak mikroorganisme danada sangat sedikit organisme yang tidak bisa menggunakannya. Di alam, glukosa bebas biasanya tidak tersedia, tetapi dapat diperoleh melalui berbagai bentuk. Ini mungkin berasal dari interkonversi heksosa lainnya, hidrolisis disakarida, oligosakarida dan polisakarida dari lingkungan, atau dari bahan sel penyimpanan, seperti pati, glikogen dan trehalosa. Pembentukan energi dari glukosa didahului oleh fosforilasi, awalnya diikuti oleh oksidasi melalui sebagian besar piruvat (C3). Metabolisme glukosa untuk piruvat disebut glikolisis yang menyediakan ATP, prekursor dan mengurangi daya (terutama NADH). Namun, hanya ATP dalam jumlah terbatas yang diproduksi, yang dibentuk melalui substrat-tingkat fosforilasi. Maksimal dua molekul ATP yang dihasilkan untuk setiap unit glukosa teroksidasi ke titik ini. Proses ini menghasilkan piruvat yang menempati posisi penting dalam metabolisme perantara dan merupakan titik awal untuk katabolisme lanjut. JALUR GLIKOLISIS 1. Embden-Meyerhof-Parnas (EMP)Pathway EMP merupakan rute yang paling umum dan ditemukan di semua kelompok utama organisme, termasuk flagelata, jamur, ragi dan bakteri. Jalur ini dapat beroperasi di bawah kondisi anaerobik atau aerobik dan terdiri dari reaksi 10 enzim-katalis yang terletak di dalam matriks sitoplasma. Kunci ketiga regulasi enzim dari jalur (heksokinase, fosfofruktokinase dan kinase piruvat) bertindak irreversibel. Semua langkah lainnya terjadi secara reversibel, yang penting untuk peran biosintesis dari jalur selama sintesis glukosa.

81

dan lainnya biosintesis intermediet. dan fosfat dihidroksiaseton (DAP). Dalam ragi. jamur berfilamen. yang merupakan hasil energi yang lebih rendah daripada jalur EMP. piruvat. Mayoritas katabolisme bakteri. 3. 82 . Xanthomonas dan Zymomonas.Ini melibatkan hilangnya satu karbon sebagai CO2 danpembentukan dua NADPH. seperti di jalur PP. ribulosa5-fosfat (Rump). sedangkan pada prokariota mereka berada di sitoplasma.dapat menghasilkan dua molekul piruvat. seperti di jalur PP. terutama ribosa untuk biosintesis asam nukleat. Fosfat pentosa (PP) Pathway Jalur monofosfat ditemukan di banyak bakteri dan sebagian besar organisme eukariotik. dan GAP. Jalur PP adalah siklik dan seperti semua jalur glikolitik. Dekarboksilasi oksidatif piruvat dilibatkan untuk membentuk unit C2 asetil koenzim A (asetil KoA). Pseudomonas.Tahap awal dari pemecahan glukosa membutuhkandua molekul ATP dalam pembentukan tiga-tahap fruktosa1. Molekul ini kemudian dipecahmelalui aldolase untuk membentuk triose fosfat(C3). Molekul enam-karbon dibelah oleh aldolase untuk membentuk dua senyawa C3. dari piruvat dibawah kondisi aerobic dengan menggunakan siklus Asam Trikarboksilat (TCA). untuk membentuk 2-okso-3-deoksi-6-phosphogluconate. pentosa. The Entner-Doudoroff (ED) Pathway Relatif digunakan oleh sedikit mikroorganisme yang tidak memiliki jalur EMP. dan yang terakhir juga dapat dikonversi menjadi piruvat. dan sisanya dikatabolisasi melalui jalur EMP. Jalur ini dimulai dengan oksidasi dua langkah oksidasi glukosa6-fosfat (G6P) ke fosfat pentosa(C5). ragi. enzimnya terletakdi matriks sitoplasma. terutama spesies Lactobacillus dan Leuconostoc. Namun. ribulosa 5-fosfat mengalami penataan ulang dalam serangkaianduakarbon dan tiga-karbon pertukaran fragmen. bukan teroksidasi. GAP dapat dioksidasi menjadi piruvat dengan enzim pada jalur EMPatau juga dapat dikembalikan ke jalur awal melalui konversi dari dua GAP satu G6P. 2. terutama untuk digunakan dalam langkah reduktif dalam proses anabolik. Jalur PP di bawah kondisi aerobik atau anaerobik. dihasilkan satuGAP.Untuk proses setiap tiga unit glukosa. 10-20% glukosa (lebih selama pertumbuhan pesat) terdegradasi melalui jalur PP. Ini melibatkan oksidasi dan dekarboksilasi glukosa 6-fosfat ke RuMP. enam NADPH dan dua fruktosa 6-fosfat (F6P). Gula pentosa seperti xylose juga dapat dikatabolisasi melalui rute ini. melalui 6-phosphoglukonat.GAP secara langsung diproses di jalur ini dan DAP akan diisomer untuk GAP sebelum dapat digunakan.dikatalisis oleh enzimtransketolase dan transaldolase. Yang pertama pada akhirnya dikonversi ke laktat dan yang kedua ke etanol. terutama erythrose-4-fosfat. intermediet untuk sintesis asam amino aromatik. Siklus enzim TCA terletak dalam matriks mitokondria pada bakteri eukariotik. Jalur ini seringkali beroperasi pada waktu yang sama dengan jalur EMP. 4. satu ATP. Untuk setiap molekul glukosa dioksidasi menjadi dua molekul piruvat. Phosphoketolase (PK) Pathway Jalur ini juga sering disebut sebagai jalur Warburg-Dickens yang dioperasikan oleh beberapa asam laktat bakteri. dan memiliki peran katabolik dan anabolik yang baik. Secara keseluruhan.6-bifosfat. Rhizobium. misalnya. Jalur ini sangat penting dalam penyediaan NADPH. kemudian mengalami dehidrasi. gliseraldehida 3-fosfat(GAP). RuMP yang diisomerisasi untuk xylulose fosfat 5-(C5) dan kemudian dibelah oleh phosphoketolase untuk GAP (C3) dan asetil fosfat (C2). Jalur dimulai dengan pembentukan 6-phosphogluconate. tapi jarang dalam jamur. Setelah fase oksidatif ini. dari setiap molekul glukosa dimetabolisasi. satu NADH dan satu NADPH. Jalur ini menghasilkan hanya setengah hasil ATP dibandingkan dengan jalur EMP. termasuk spesies Azotobacter. ganggang dan protozoa. Oksidasimolekul resultan GAP dua piruvat menghasilkanenergi dalam bentuk empat molekul ATP melalui reaksi fosforilasi duasubstrat. Molekul F6P dikonversikembali ke G6P untuk mempertahankan operasi dari siklus. Kebanyakan bakteri gram-negatif.

seperti dalam beberapa prokariota anaerob fakultatif dan obligate. senyawa C4 dan C5. senyawa lain atau ion yang memiliki potensial redoks rendah. ( Waites at all. namun juga menyediakan intermediet. Fasilitas ini untuk menghasilkan biosintetik intermediet juga hadir dalam mikroorganisme lainnya yang tidak memiliki siklus TCA lengkap. asam purin dan pirimidin. Respirasi mengarah ke pembentukanlebih banyak ATP dari oksidasi NADH dan FADH2. sebagai perantara beberapa masih diperlukan untuk biosintesis. siklus TCA melengkapi oksidasi piruvat menjadi CO2. Siklus yang tepat dimulai dengan kondensasi senyawa dua-karbon dengan oksaloasetat (C4) untuk membentuk sitrat (C6). untuk bertindak sebagai akseptor elektron terminal. Selama delapan langkah berikut dari sikluslengkap TCA. Hal ini membutuhkan oksigen . beroperasi sebagai bercabang biosintesis jalur. Dalam kondisi anaerobik tidak berfungsi sebagai siklus. Siklus TCA tidak hanya sebuah jalur katabolik. 2001) RESPIRASI Semua formasi ATP dari oksidasi glukosa memilikitelah dibentuk melalui substrat-tingkat fosforilasi. dan mereduksi elektron pembawa untuk menghasilkan NADH dan FADH2. piruvatdehidrogenase. dua fragmen karbon teroksidasi menjadi dua molekul CO2 dan oksaloasetat adalah diregenerasi untuk menerima unit dua-karbon lebih lanjut. karena memiliki potensi redoks rendah dan direduksi menjadi air. 83 . koenzim ini tereduksi kemudian dapat digunakan untuk sintesis ATP dalam respirasi dan yang lebih penting. Tiga reaksi dalam hasil siklus dalam pembentukan NADH dan satu menghasilkan FADH2. sedangkan beberapa dari produk akhir respirasi anaerob yang beracun. Asetil KoA juga dapat dibentuk melalui pemecahan lipid dan beberapa asam amino. Namun. dan dai oksidasi alkana. dan molekul ATP tunggal dibentuk langsung oleh fosforilasi tingkat-substrat.dikatalisis oleh multienzim yang kompleks. Oksigen sangat ideal untuk ini. misalnya nitrat direduksi menjadi nitrit. untuk biosintesis amino. yang mana mikroorganisme dapat memanfaatkan. Hasilnya adalah sebagai berikut: Asetil KoA (C2) + 3NAD+ + FAD + ADP  2 CO2 + 3NADH + 3H+ + FADH2 + ATP Dalam hal katabolisme.

ETS dalam membran sitoplasmik memiliki pembawa yang agak berbeda. mereka tidak bisa lewat kembali dan gradien proton didirikan. Gradien proton Ini digunakan untuk mengankut pembentukan ATP oleh oksidatif kemiosmotik fosforilasi mekanisme. yang mendorong sintesis ATP melalui kemiosmotik fosforilasi. Rangkaian reaksi yang terlibat dapat digabungkan ke kebutuhan energi proses. muatan negatif tetap berada di dalam. energi dilepaskan selama aliran elektron digunakan untuk membuat gradien proton untuk melintasi membran. membentuk air. Pasti anaerobic 84 . mereka yang direoksidasi untuk digunakan lebih lanjut dalam metabolisme. sedangkan proton pindah dari dalam ke luar membran. Oleh karena itu. dan terdiri dari berikut rantai pembawa elektron: NADH  flavoprotein  iron shulphur protein  quinone  cytochrome b  cytochrome c  cytochrome a  cytochrome a3 oxygen Dalam bakteri prokariotik. akan dibentuh per NADH jika eneginya dikonversi 100% secara efisien. seperti transportasi terlarut.ETS Eukariota terletak di membran mitokondria. elektron tersebut kemudian melewati serangkaian dari pembawa dalam membran. b562. Karena membran pada dasarnya kedap proton. Dalam proses ini. sedangkan di bagian dalam membrann mendekati 8. atau untuk produksi ATP melalui oksidatif fosforilasi. Electron memasuki ETS dari pembawa. melalui serangkaian redoks atau reduksi-oksidasi reaksi. 2001) Sebuah molekul NADH teridiri atas sekitar 218 kJ dari energy potensial dan itu diambil sekitar 30kJ untuk membentuk satu molekul ATP. sebagian besar dalam bentuk hidroksil (OH-) ion. ( Waites at all. dalam teori. Ini merupakan energi potensial disimpan sebagai gradien proton atau proton-kekuatan pendorong. dengan rantai pemendek yang tidak lengkap pembentukannya sehingga hanya satu atau dua molekul ATP setiap NADH yang terbentuk. sedangkan pada prokariota itu terikat dalam membran sitoplasma. Elektron yang berasal dari oksidasi substrat yang berasal dari NADH atau FADH2. pH luar membran bisa mencapai 5. d. Cythochromic yang terlibat meliputi : b558. ke terminal akseptor. Meskipun system ini hanya sampai 40% dan oleh karena itu produk maksimum hanya 3 molekul ATP per NADH. Respirasi aerobik dilakukan oleh bakteri aerob dan fakultatif anaerob dengan bantuan oksigen. Ketika operator menyumbangkan elektron.5. sebagai positif biaya yang dikeluarkan dari dalam membran. terutama NADH atau FADH2. Akibatnya. seperti yang dijelaskan di atas. Hipotesis kemiosmotik diusulkan oleh Mitchell (1961) menjelaskan proses sebagai berikut: sebagai aliran elektron melalui sistem transportasi. Proton akhirnya melekat menjadi oksigen. ETS dalam membran mitokondria menghasilkan tiga ATP molekul per NADH.5. dimediasi oleh sintase ATP (ADP + Pi ÆATP). dan o. Pada eukariota. tujuh ATP maksimum didapat. proton (H+) yang dipindahkan dari dalam ke luar membran (ekskresi).

fakultatif seperti Eshcerichia coli, setidaknya memiliki dua system respirasi, masing-masing berbeda afinitas oksigennya. Oleh karena itu, mereka dapat beradaptasi dengan konsentrasi oksigen yang bervariasi, dilanjutkan untuk menggunakan oksigen sebagai aseptor electron meskipun pada tingkat oksigen yang rendah. Beberapa bakteri anaerobic fakultatif atau anaerobic obligat melakukan respirasi anaerob. Keterlibatan ini serupa ETS, tetapi memiliki aseptor electron selain oksigen. Contoh dari respirasi anaerobic mencakup : 1. Respirasi Nitrogen, dilakukan oleh bakteri anaerobic fakultatif. Potensial redok dari nitrat adalah +0,42 volt, dibandingkan dengan +0,82 volt untuk oksigen. Oleh karena itu, lebih sedikit energy didapatkan kemudian oksigen sebagai electron aseptor dan molekul ATP dapat terbentuk. Prosesnya memiliki beberapa langkah, dimana nitrat direduksi melalui nitrat dan nitous oksida akhirnya menjadi dinitrogen, yangmana merujuk sebagai disimilator reduksi nitrat atau denitifikasi. Denitrifikasi meliputi spesies dari Pseudomonas, Paracoccus denitrificans, and Thiobacillius denitrificans.Bakterianaerob fakultativ yang lain meliputi E. coli dan relative, hanya mengurangi nitrat atau nitrit, dan tanggungjawab enzim, reduktase nitrat , dengan tingakt keberadaan oksigen yang terbatas. 2. Respirasi Sulfat, dipraktekan oleh kelompok kecil dari bakteri heterotrof, yang mana semuanya anaerobic obligat, misalnya spesies Desulfovibro. Mereka memproduksi hydrogen sulfide, yang berasal melalui beberapa kali intermediet. 3. Respirasi Karbon, dilakukan oleh archaeans seperti Methanococcus and Methanobacterium. Keduanya anaerob obligat yang mereduksi CO2 dan beberapa karbon monoksida menjadi metana. Bakteri metanogen ini biasanya menggunakan hydrogen sebagai sumber energy merekadan untuk mendapatkan anoksik lingkungan yang rendah nitrat dan sulfat. CO2 + 4H2 CH4 + 2H2O Dalam penambahan nitrat, sulfat, dan karbondioksida, Besi (Fe3+), magnesium (Mn4+) dan beberapa komponen organic (dimetil sulfoksida, fumarat,glisin, dan trimetilamin oksida )dapat digunakan sebagai aseptor pada respirasi anaerobic pada bakteri. FERMENTASI Ketika respirasi bukan sebuah pilihan, organisme harus menggunakan mekanisme alternative untuk regenerasi suplai coenzim yang terbatas, direduksi selama oksidasi glukosa menjadi piruvat. Jika NAD(P)H tidak dioksidasi kembali menjadi NAD(P)+, selanjutnya metabolisme akan berhenti. Oleh karena itu, sebuah aseptor electron yang cocok harus di dapatkan untuk membawa electron. Fermentasi digunakan oleh molekul organik, piruvat atau derivative, sebagai aseptor elektron akhir, dengan cara demikian pembentukan NAD(P)+ dan katabolisme akan berlanjut. Ini adalah hasil dari pembentukan reduksi produk limbah , seperti alkohol dan asam, yang kemudian dikeluarkan dari sel. Meskipun, ini sangat boros dalam ketentuan dari pemulihan energy potensial dari glukosa, sebagai sedikit atau tidak ada ATP lebih lanjut dibentuk. Sebaliknya, oksidasi yang lengkap menghasilkan CO2, dalam hubungan dengan oksidasi posporilasi selama respirasi akan dapat membentuk 36 molekul ATP bahkan lebih per molekul glukosa. Fermentasi alkohol dilakukan oleh ragi, filamen jamur tertentu dan bakteri. Ini adalah suatu penerusan proses, di mana piruvat dari jalur EMP, atau melalui jalur ED dalam kasus Zymomonas, adalah dekarboksilasipertama menjadi asetaldehida, NAD+ kemudian dibentuk kembali selama reduksi asetaldehida menjadi etanol. Fermentasi asam laktat dilakukan oleh sejumlah bakteri, termasuk Streptococcus, Lactobacillus, Lactococcus dan Leuconostoc, bersama dengan beberapa jamur, alga dan protozoa. Berikut piruvat, bukan turunan piruvat, adalah akseptor elektron dan bentuk laktat. Ada dua bentuk fermentasi ini: 1. Fermentasi Homolaktik yang dioperasikan oleh bakteri seperti Lactobacillus acidiophilus and Lactobacillus casei, yang mana mengurangi hampir semua piruvat yang dibentuk oleh glikolisis asam laktik.
85

2. Fermentasi heterofermentatif menghasilkan produk lainnya bersama dengan asam laktat. Organisme yang melakukan itu termasuk Leuconostoc mesenteroides dan Lactobacillus brevis, yang mengoperasikan jalur PK. Mereka membentuk laktat dari piruvat dan etanol dari fosfat asetil, dan dalam kasus tertentu asetat beberapa mungkin diproduksi. Fermentasi asam campuran yang dilakukan oleh E. coli dan terkait fakultatif anaerob. Produk meliputi laktat, asetat, jumlah kecil dari etanol dan format. Beberapa organisme memiliki kemampuan untuk mengurangi formate menjadi hidrogen dan CO2. Fermentasi 2,3-Butanediol dilakukan oleh Enterobacter, Erwinia, Klebsiella dan Serratia. Hal ini mirip dengan fermentasi campuran asam, namun menghasilkan butanadiol, bersama dengan etanol dan asam. Fermentasi asam propionat dilakukan oleh beberapa usus bakteri, seperti Propionibacterium spesies, beberapa yang terlibat dalam produksi komersial tertentu jenis kejuSwiss dan vitamin B12 (cobalamin). Propionat yang terbentuk dari piruvat melaluiCoA, di mana piruvat adalah terkarboksilasi oleh oksaloasetat, dan kemudian dikurangi menjadi propionat melalui malat, fumarat dan suksinat.Proses ini membutuhkan kofaktor, biotin, CoA dan CoB12. Fermentasi asam butirat dilakukan oleh spesies Clostridium. Spesies ini adalah pembentuk spora anaerobik yang juga memproduksi aseton, butanol, propanol, alkohol danasam lainnya. Mereka juga fermentasi asam amino, nitrogen dan senyawa lainnya, serta karbohidrat. KATABOLISME LIPID DAN PROTEIN Karbon merupakan sumber karbohidrat,sebelum karbon digunakan dalam katabolisme, seperti lipid sebagai digliserida dan trigliserida dihidrolisis oleh lipase untuk menghasilkan asam lemak bebas dan gliserol. Asam lemak kemudian dapat dipecah oleh jalur b-oksidasi. Berikut FAD dan NAD+ yang digunakan untuk menerima elektron, dan duaunitkarbon berhasil dihapus, dalam bentuk asetil CoA, yang kemudian dapat memberi makan langsung ke siklus TCA. Gliserol dapat terfosforilasi untuk fosfat gliserol, diikuti oleh oksidasi terhadap DAP dan isomerisasi untuk GAP. Unit C3 kemudian bisa masuk jalur EMP. Protein ekstraseluler yang dihidrolisis oleh protease untuk menghasilkan asam amino bebas, yang dapat diangkut ke sel. Katabolisme asam amino awalnya melibatkan penghapusan kelompok amino mereka. Hal ini biasanya dicapai melalui transaminasi, di mana kelompok amino yang disumbangkan ke host keto, misalnya aminasi piruvat untuk membentuk alanin. Asam keto yang dihasilkan dari transaminasi kemudian dapat dioksidasi dalam siklus TCA. Kelebihan gugus amino dapat terakumulasi dan sering diekskresikan sebagai ion amonium, yang menyumbang untuk meningkatkan pH media selama pertumbuhan beberapa bakteri. PENYIMPANAN ENERGI Ketika kelebihan gizi yang tersedia, mikroorganisme biasanya mensintesis senyawa yang dapat disimpan untuk kemudian gunakan selama periode kekurangan nutrisi. Penyimpanan karbohidrat termasuk polisakarida, glikogen dan pati, dan trehalosa disakarida, yang semuanya bertindak sebagai sumber karbon dan energi. Trehalosa diproduksi oleh jamur berfilamen, ragi dan beberapa bakteri, dan glikogen merupakan penyimpanan utama karbohidrat di banyak kelompok mikroorganisme. Bila diperlukan, cadangan polimer yang dihidrolisis oleh phosphorylases, membentuk glukosa 1-fosfat, yang secara langsung dapat masuk katabolisme. Banyak mikroorganisme menyimpan energi yang kaya lipid. Poli b-hidroksibutirat umumnya ditemukan pada bakteri, namun tidak diproduksi oleh eukariota. Jamur berfilamen dan ragi sering menyimpan lipid netral (trigliserida) dalam vakuola. Volutin butiran, terdiri dari polymetaphosphates, juga disimpan oleh beberapa prokariota dan eukariota, yang bertindak baik sebagai fosfat dan cadangan energi. Bakteri Sulphur dapat mengakumulasi butiran belerang oleh oksidasi H2S. Ketika tidak ada media lanjut pasokan sulfida yang tersedia, ini toko belerang teroksidasi untuk sulfat, menyediakan setara mengurangi CO2 untuk fiksasi atau fosforilasi oksidatif.
86

Pertanyaan: 1. Bagaimana proses pembentukan enzim? (Pandu Rahmat Pinasthiko/115061107111001). Pembentukan enzim memerlukan bahan baku asam amino, sehingga pembentukannya identik dengan sintesis protein. Sintesis protein dilakukan oleh RNA berdasarkan transkip kode dari DNA. Sintesis ini dilakukan di dalam ribosom (Sumardjo, 2006). 2. Mengapa pada siklus asam trikarboksilik, terdapat materi yang berubah-ubah? (Lilis Triyowati A./115061101111009) Pada siklus trikarboksilik, diperlukan enzim yang membantu untuk mengkatalis reaksi, enzim yang dibutuhkan tersebut berbeda-beda jenisnya dan nantinya akan keluar dari siklus membentuk enzim yang sama. 3. Pada proses respirasi sulfur anaerob, apa maksud intermediet yang menghasilkan hidrogen sulfida? (Ayu Indah W./115061101111011) Intermediet adalah molekul-molekul yang terbentuk dari reaksi sebelumnya. 4. Apa faktor-faktor yang mempengaruhi siklus krebs? (Dian Nita Citra D./115061101) Faktor yang mempengaruhi silus kreb adalah ketersediaannya glukosa sebagai material utama yang dipecah. 5. Dimana energi disimpan pada mikroorganisme? (Dwi Chandra P./115061107111003) Energi disimpan dengan berbagai macam cara, setiap mikroorganisme memiliki cara yang berbeda, salah satunya adalah di dalam vakuola. 6. Dimana siklus trikarboksilik terjadi? (Dhanang Edy P./115061101111). Siklus trikarboksilik terjadi di matriks mitokondria (Campbell, dkk., 2002). 7. Perubahan NAD+ menjadi NADH, FADH menjadi FADH2 atau sebaliknya dibantu dengan apa ? Lalu saat kapan dan dimana proses tersebut terjadi ? Jelaskan ! (Sharfina Widyaningrum/1150611051110) Penjelasan : NAD+ adalah hasil reduksi dari NADH. NADH bersama piruvat dan H+bereaksi dan membentuk NAD+ dan laktat, seperti reaksi berikut :

Piruvat tersebut berasal dari proses glikolisis yang terjadi pada mikroba. (John F, 1986). Sedangkan pembentukan FADH2 terjadi seperti digambarkan pada reaksi berikut :

(Kenneth B,2004) 8. Mikroorganisme terdiri dari berbagai macam jenis. Apakah energy yang disimpan oleh tiap-tiap mikroorganisme sama? (Febrika Larasati/115061101111001) Energi yang disimpan oleh tiap-tiap organisme berbeda, sebagai contoh, penyimpanan karbohidrat termasuk polisakarida, glikogen dan pati, dan trehalosa disakarida, yang semuanya bertindak sebagai sumber karbon
87

dan energi. Trehalosa diproduksi oleh jamur berfilamen, ragi dan beberapa bakteri, dan glikogen merupakan penyimpanan utama karbohidrat di banyak kelompok mikroorganisme. 9. Hasil dari respirasi nitrat, sulfat, dan karbohidrat tersebut digunakan untuk apa? (Mutia Dhana F./11506110011100) Hasil dari reaksi anaerob menyebabkan lingkungan tercemar, jadi adanya hasil respirasi anaerob dapat dijadikan indikator kesehatan lingkungan. 10. Pada siklus asam trikarboksilik, mengapa CoASH harus masuk dan keluar lagi dalam siklus ? fungsi dari CoASH itu apa ? Dan apakah ada bedanya CoASH yang masuk dan keluar (komposisi) ?(Freshsya Zatalini/115061100111003) CoASH adalah koenzim A yang fungsinya adalah sebagai enzim yang mengkatalis reaksi, sehingga CoASH yang masuk ke dalam siklus sama dengan yang keluar, tidak ada perbedaan dari segi komposisi karena sifat enzim tidak ikut bereaksi. 11. Pada respirasi sulfat tidak memerlukan oksigen, apakah itu benar? Padahal semua organisme itu selalu membutuhkan oksigen. (Mar‟atus Sholihah/11506110011100) Respirasi sulfat tidak memerlukan oksigen karena respirasi sulfat membutuhkan sufat yang direduksi, dalam peristiwa, oksigen tidak dibutuhkan

88

Cu2+. Beberapa bakteri autotropik dapat mengoksidasinya menjadi sulfat (SO42-). tembaga dan kobalt untuk pertumbuhannya yang normal. seperti gula dan karbohidrat lain. Kebanyakan mikroorganisme dapat menggunakan sulfat sebagai sumber belerang. besi. Mo2+.Beberapa bentuk kehidupanseperti tumbuhan hijau dapat menggunakan energi pancaran atau cahaya dan dinamakan fotoautotrof. Organisme yang membutuhkan senyawa-senyawa organik lain sebagai sumber karbonnya disebut organisme heterotrof . Tumbuhan. Sedangkan persayaratan akan sulfur pada tumbuhan secara khas dipenuhi melalui senyawa-senyawa anorganik. Belerang membentuk bagian struktur beberapa koenzim dan ditemukan dalam rantai samping cisteinil dan merionil protein. Semua organisme hidup membutuhkan belerang (sulfur) dan fosfor Persyaratan akan zat sulfur pada hewan secara khas dipenuhi oleh senyawa-senyawa sulfur organik. Semua organisme yang hidup memerlukan nitrogen Tumbuhan menggunakan nitrogen dalam bentuk garam nitrogen anorganik seperti kalium nitrat (KNO3)sedangkan hewan membutuhkan senyawa nitrogen organik seperti protein dan produk-produk hasil peruraiannya yaitu peptida dan asam-asam amino tertentu. mereduksi sulfat menjadi hidrogen sulfida (H2S). kalsium. Semua organisme hidup membutuhkan beberapa unsur logam. Dalam memformulasikan medium untuk pembiakan sebagian besar mikroorganisme. hal yang perlu dilakukan yaitu menyediakan sumber potassium.2009) PERSYARATAN Persyaratan nutrisi bagi organisme secara umum adalah sebagai berikut:( Plezar. Semua organisme membutuhkan karbon Semua organisme hidup membutuhkan karbon dioksida walaupun dalam jumlah yang sedikit tetapi kebanyakan diantaranya juga membutuhkan beberapa senyawa karbon organik. dan Fe2+). . Seluruh organisme hidup memerlukan oksigen 89 3. Mg2+. Semua organisme hidup membutuhkan air untuk fungsi-fungsi metabolisme danpertumbuhannya. 7. Ditinjau dari segi nutrisi.PENGERTIAN NUTRISI DAN NUTRIEN Nutrisi adalah apa yang dimakan seseorang dan bagamaina tubuh menggunakannya sedangkan nutrien adalah zat organik. dan bila memperoleh energinya dengan cara mengoksidasi senyawa kimia. magnesium. kalium. 5. dan besi. kalsium.Belerang adalah komponen dari banyak substansi organik sel. Co2+. 2.(Berman dkk. natrium.Beberapa mikroorganisme dapat mengasimilasi H2S secara langsung dari medium pertumbuhan tetapi senyawa ini dapat menjadi racun bagi banyak organisme. biasanya dalam bentuk ionion (K+. Banyak mineral lainnya sepertiMn2+. alga dan beberapa kuman berklorofil membutuhkan karbon dioksida dan mengubahnya menjadi karbohidrat melalui proses fotosintesis. magnesium.butuhkan untuk fungsi tubuh. mangan. Fosfor biasanya diberikan sebagai fosfat yaitu garam-garam fosfat. 6. semua organisme yang disebutkan diatas adalah organism autotrof.2006) Nutrisi sebagai sumber energi NUTRISI 1. seng. Semua organisme hidup membutuhkan sumber energi. 4. zat nonorganik dan zat yang memproduksi energi yang ditemukan dalam makanan dan di. Bila mereka memperoleh energinya dari cahaya maka disebut organisme fotoautotrof. dan Zn2+ dibutuhkan dan mineral ini seringkali terdapat dalam air kran atau sebagai kontaminan dari kandungan medium lainnya. Mikroorganisme yang lain tidak dapat menggunakan karbon dioksida sebagai sumber karbon dan hidupnya bergantung pada organisme ototrof untuk memproduksi karbohidrat dan senyawa-senyawa organik lain yang digunakan sebagai makanan. maka disebut organisme kemoautotrof. Ca2+.

Nutrient diklasifikasikan berdasarkan elemen yang mereka suplai yaitu : (Rusdimin. Sumber Nitrogen dan Belerang Nitrogen merupakan komponen utama protein dan asam nukleat. sumber karbon. Bahan makanan yang digunakan oleh jasad hidup dapat berfungsi sebagai sumber energi. bahan pembangun sel. Heterotrof membutuhkan karbon organik untuk pertumbuhannya dan karbon organik tersebut harus dalam bentuk yang dapat diasimilasi.Organisme ini termasuk kelompok autotrof.Selain itu masih banyak organisme yang tergantung dari molekuloksigen (O2 atau dioksigen).Contohnya naphthalene dapat menyediakan semua karbon dan energi yang dibutuhkan untuk pertumbuhan respirasi heterotropik. faktor tumbuh. beberapa mikroba mampu mensintesis seluruh kebutuhan vitaminnya.Mikroorganisme anaerob fakultatif tumbuh dengan adanya O2 udara.Untuk organisme ini O2 bersifat toksik.Hasil akhir dari seluruh jenis asimilasi nitrogen adalah bentuk paling tereduksi yaitu ion ammonium (NH4+). Kebanyakan vitamin berfungsi membentuk subsansi yangmengaktifkan enzim. 1. Organisme anaerob obligat hanya dapat hidup dalam lingkungan bebas oksigen.Substrat pertumbuhan disuplai pada tingkatan yang cocok untuk galur mikroba yang akan ditumbuhkan. yaitu ±10 % dari berat kering sel bakteri. Karbondioksida dibutuhkan pada sejumlah reaksi biosintesis. sumber aseptor elektron.Nitrogen mungkin disuplai dalam bentuk yang berbedadan mikroorganisme beragam kemampuannya untuk mengasimilasi nitrogen.2003) Sumber Karbon Tumbuhan-tumbuhan dan beberapa bakteri mampu mengunakan energyfotosintetik untuk mereduksi karbondioksida pada penggunaan air. dapat membantu pertumbuhan fermentatif atau respirasi dari banyak organisme. tetapi sangat sedikit organisme yang memiliki jalur metabolik yang perlu untuk asimilasi naphthalene. dan sebagai aseptor atau donor elektron.Selanjutnya oksigen juga terdapat dalam CO2 dan dalam bentuk senyawa organik.Sebaliknya. Untuk sel. Banyak organisme respiratif menghasilkan lebih dari cukup karbondioksida untuk memenuhi kebutuhannya.Jalur asimilasi ini berbeda dengan jalur dissimilasi nitrat dan nitrit.Jalur dissimilasi digunakan oleh organisme yang menggunakan ion ini sebagai 90 2. Dalam aspek nutrisi akan vitamin pada bakteri menunjukkan pola yang beragam. Organisme dibedakan menjadi tiga yaitu organisme aerob obligat yang mampu menghasilkan energi hanya melalui respirasi dan dengan demikian tergantung pada oksigen. JENIS NUTRIENT Nutrien dalam media perbenihan harus mengandung seluruh elemen yang penting untuk sintesis biologik organisme baru.Secara garis besar bahan makanan dibagi menjadi tujuh golongan yaitu air. tetapi yang lain membutuhkan sumber karbondioksida pada medium pertumbuhannya. glukosa. oksigen tersedia dalam bentuk air. makhluk hidup yang tidak membutuhkan nutrien organik untuk pertumbuhannya. jadi bersifat aerotoleran tetapi organisme ini tidak dapat memanfaatkan O2tetapi memperoleh energi semata-mata dari peragian. Meskipun bakteri membutuhkan vitamin didalam proses metaboliknya yang normal. sumber energi. dan sumber nitrogen. sumber mineral. Oksigen yang berasal dari molekul oksigen hanya akan diinkorporasi ke dalam substansi sel sebagai sumber karbon yang digunakan metana atau hidrokarbon aromatik yang berantai panjang. Autotrof lain adalah khemolitotrof yaitu organisme yang menggunakan substrat anorganik seperti hidrogen atau thiosulfat sebagai reduktan dan karbondioksida sebagai sumber karbon. .8. Semua organisme hidup membutuhkan vitamin Vitamin adalah senyawa organik khusus yang penting untuk pertumbuhan. Banyak mikroorganisme memiliki kemampuan untuk mengasimilasi nitrat (NO3) dan nitrit (NO2) secara reduksi dengan mengubahnya menjadi amoniak (NH3).

Berdasarkan jumlah yang digunakan nutrient juga dibedakan menjadi dua yaitu makronutrient(digunakan dalam jumlah besar) dan micronutrient(digunakan dalam jumlah kecil). 3. kalsium. Tabel 2. Cu2+.Dalam memformulasikan medium untuk pembiakan mikroorganisme.Hal yang perlu dilakukan yaitu menyediakan sumber potassium. Co2+. banyak metabolit. oksigen molekular merupakan racun. Banyak mineral lainnya (seperti Mn2+.Fungsi air adalah sebagai sumber oksigen untuk bahan organik sel pada respirasi. Selain itu. beberapa polisakarida kapsul dan beberapa protein adalah bergugus fosfat. dan hasilnya adalah gas nitrogen (N2). lipid A). maka organisme semacam iini disebut aerob obligat. dan Fe2+). Mo2+. komponen dinding sel (teichoic acid). Sumber Oksigen Oksigen adalah komponen universal pada sel dan selalu terdapat dalam jumlah yang besar pada zat gizi yang utama yaitu air.1 Nutrisi Makronutrien Bakteri Elemen % Berat Kering Sumber Fungsi Makronutrien Karbon 50 Senyawa organik Konstituen utama atau CO2 dari bahan material sel Oksigen 20 H2O. Air Air merupakan komponen utama sel mikroba dan medium. magnesium.elektron penerima terminal dalam respirasi. Proses tersebut membutuhkan sejumlah besar energi metabolik dan tidak dapat aktif dengan adanya oksigen. asam nukleat dan sejumlah koenzim seperti NAD. Ca2+. lipid (fosfolipid. NADP dan flavin. Mg2+. Kemampuan fiksasi nitrogen ditemukan pada beragam bakteri yang berevolusi sangat berbeda dalam strategi biokimia untuk melindungi enzim fixing-nitrogen nya dari oksigen. proses ini dikenal sebagai denitrifikasi. Sumber Phospor Fosfat (PO43-) dibutuhkan sebagai komponen ATP. 6. dan besi. Beberapa mikroorganisme yang dapat tumbuh baik dengan maupun tanpa oksigen molekular adalah anaerob fakultatif. biasanya dalam bentuk ion-ion (K+. O2 91 4. 5. Organisme semacam ini adalah anaerob obligat. CO2 dan bahan material sel O2 dan cairan sel. Fosfat selalu diasimilasi sebagai fosfat anorganik bebas (Pi). . yang dikeluarkan ke atmosfer. Pada ekstrem faali yang lain terdapat mikroorganisme yang mendapat energi dari reaksi yang tidak menyertakan pemanfaatan oksigen molekular dan bentuk kimia unsur ini bukanlah zat gizi. Sumber Mineral Sebagian besar mineral dibutuhkan untuk fungsi enzim. dan Zn2+) dapat ditemukan dalam air kran atau sebagai kontaminan dari kandungan medium lainnya. Organisme ini bergantung pada respirasi aerobik untuk memenuhi kebutuhan energi dan oksigen molekular berfungsi sebagai perantara yang mengoksidasi.Selain itu air berfungsi sebagai pelarut dan alat pengangkut dalam metabolism. senyawa Konstituen dalam organik. Bagi banyak golongan faali. Banyak organisme yang memerlukan oksigen molekular(O2). Kemampuan untuk mengasimilasi N2 secara reduksi melalui NH3 disebut fiksasi nitrogenadalah sifat untuk prokariota dan relatif sedikit bakteri yang memiliki kemampuan metabolisme ini. baik membunuhnya maupun menghambat pertumbuhannya.

2003 SUMBER ENERGI 92 . kofaktor untuk enzim tertentu. Senyawa Konstituen dalam organik.coli dalam fase pertumbuhan eksponensial.Nitrogen 14 Hidrogen 8 Fosforus 3 adalah akseptor dalam respirasi aerobik NH3. S. senyawa Konstituen dari organik. dan salah satu komponen endospora Besi 0. N2 asam amino. fosfolipid Sumber : Rusdimin. nukleotida. Juga penting bagi pembentukan sebagai proton.5 Garam kalsium Kation sel.5 Garam magneesium Kation sel dan kofaktor untuk beberapa reaksi enzim tertentu Kalsium 0. Fosfat(PO4) Konstituen asam nukleat. H2S.2 Nutrisi Mikronutrien Bakteri Elemen % Berat Kering Makronutrien Sulfur 1 Sumber SO2. asam nukleat dan koenzim H2O. H2 senyawa organik dan cairan sel.2 Garam besi Komponen sitokrom dan protein lain serta salah satu kofaktor untuk beberapa reaksi enzim Ket : % berat kering tersebut untuk sel E.2003 Tabel 2. Senyawa sulfur organik Garam kalium Fungsi Konstituen dari senyawa ionik dan beberapa koenzim Kalium 1 Kation selular utama dan kofaktor untuk enzim-enzim tertentu Magnesium 0. Sumber : Rusdimin. NO3.

3 Perbedaan jasad berdasarkan sumber energi Jasad Sumber Karbon Fotoautotrof Zat anorganik Fotoheterotrof Zat organik Khemoautotrof Zat anorganik khemoheterotrof Zat organik Sumber Energi Cahaya matahari Cahaya matahari Oksidasi zat anorganik Oksidasi zat organik Sumber :Stanier Roger. jika menggunakan energi cahaya. base purin dan pirimidinsebagai penyusun asam nukleat. fotoheterotrof.Pada mikrobia yang dapat berfungsi sebagai aseptor elektron ialah O2. 2. CO2. misalnya CO2 dan senyawa karbonat. Jakarta. senyawa organik. N2O. maka harus ada suatu zat yang dapat menangkap elektron tersebut. 1982. Perbedaan dari keempat jasad tersebut sbb: Tabel 2. dan Fe3+.Berdasarkan sumber karbon Berdasarkan atas kebutuhan karbon dibedakan menjadi autototrof dan heterotrof. 1982) 1. jika menggunakan energi dari reaksi kimia. Heterotrof ialah jasad yang memerlukan sumber karbon dalam bentuk senyawa organik.( Schlegel.Jika didasarkan atas sumber energi dan karbonnya. Jasad parasit ialah jasad yang hidup di dalam jasad hidup lain dan menggunakan bahan dari jasad inang nya. 93 .Aseptor elektron ialah agen pengoksidasi. PENGGOLONGAN MIKROBA BERDASARKAN NUTRISI DAN OKSIGEN Mikroba berdasarkan nutrisi dan oksigen dibedakan menjadi :( Stanier Roger dkk. Jasad parasit yang dapat menyebabkan penyakit pada inangnya disebut jasad patogen.Ada beberapa sumber energi untuk mikroba yaitu senyawa organik atau anorganik yang dapat dioksidasi dan cahaya terutama cahaya matahari. NO3-. Dunia Mikroba 1. Berdasarkan sumber energi Berdasarkan atas sumber energi jasad dibedakan menjadi jasad fototrof. dan khemotrof. faktor tumbuh digolongkan menjadi asam aminosebagai penyusun protein. 2.Faktor tumbuh sering juga disebut zat tumbuh dan hanya diperlukan dalam jumlah sangat sedikit. khemoautotrof dan khemoheterotrof.1994) 1.Penangkap elektron ini disebut aseptor elektron.Berdasarkan struktur dan fungsinya dalam metabolisme.Autotrof ialah jasad yang memerlukan sumber karbon dalam bentuk anorganik. 3. dan vitamin sebagai gugus prostetis atau bagian aktif dari enzim. Karena elektron dalam sel tidak berada dalam bentuk bebas. NO2-. Heterotrof dibedakan lagi menjadi jasad saprofit dan parasit. Sumber aseptor elektron Proses oksidasi biologi merupakan proses pengambilan dan pemindahan elektron dari substrat. Faktor tumbuh Faktor tumbuh ialah senyawa organik yang sangat diperlukan untuk pertumbuhan (penyusun bahan sel) dan senyawa ini tidak dapat disintesis dari sumber karbon yang sederhana. Jasad saprofit ialah jasad yang dapat menggunakan bahan organik yang berasal dari sisa jasad hidup atau sisa jasad yang telah mati. Bharata Karya Aksara. maka dikenal jasad fotoautotrof. Edward Alderberg dan John Ingraham. Fungsi Unsur Nutrisi untuk Mikroba Setiap unsur nutrisi mempunyai peran tersendiri dalam fisiologi sel unsur tersebut di berikan kepada medium sebagai kation garam anornagilik yang jumlahnya berbeda-beda tergantung pada keperluannya.

pH (Kemasaman) 94 . Jasad mikroaerob ialah jasad yang hanya memerlukan oksigen dalam jumlah yang sangat sedikit. Berdasarkan sumber energi dan donor elektron Berdasarkan atas sumber energi dan sumber donor elektron jasad dapat digolongkan menjadi jasad fotolitotrof.3. 5. anaerob. Bharata Karya Aksara. dan S. Edward Alderberg dan John Ingraham.pH(keasaman) dan tekanan osmotik. Jasa anaerob. dan khemoorganotrof. Beberapa bakteri mesofil dapat tumbuh (tetapi tidak optimal) pada suhu tinggi atau suhu yang lebih rendah. Berdasarkan sumber donor elektron Berdasarkan atas sumber donor elektron jasad digolongkan manjadi jasad litotrof dan organotrof.Jasad litotrof ialah jasad yang dapat menggunakan donor elektron dalam bentuk senyawa anorganik seperti H2. 3. fotoorganotrof. NH3. anaerob fakultatif. H2S.Jasad ini juga bersifat anaerob toleran.4 Perbedaan jasad berdasarkan sumber enegidan donor elektron Jasad Sumber Energi Sumber Donor Contoh Elektron Fotolitotrof Cahaya Zat anorganik Tumbuhan tingkat Fotoorganotrof Cahaya Zat organik tinggi. Jasad organotrof ialah jasad yang menggunakan donor elektron dalam bentuk senyawa organik. Pertumbuhan mikroba di dalam media cair dapat menunjukkan sifat berdasarkan kebutuhan oksigen. Obligat aerob Fakultatif. dan masih dapat tumbuh pada suhu 0oC. mikroba yang tumbuh pada suhu 20-40oC. jasad dapat digolongkan dalam jasad aerob. bakteri nitrifikasi Jasad heterotrof Sumber : Stanier Roger. mikroaerob. sering disebut anaerob obligat atau anaerob 100% ialah jasad yang tidak dapat menggunakan oksigen bebas sebagai aseptor hidrogen terakhir dalam proses respirasinya. Mesofil. mikroba juga dibedakan berdasarkan kondisi lingkungan yaitu suhu.( Cotty. anaerob Obligat . 4. Termofil. khemolitotrof. mikroba dapat dikategorikan menjadi beberapa yaitu: 1. mikroba ini tumbuh optimum pada suhu di atas 45oC. 1982. Selain mikroba dibedakan berdasarkan nutrisi dan oksigen. bahkan ada yang di atas 100 oC (ekstrim). Perbedaan keempat golongan jasad tersebut sbb: Tabel 2. 2. alga Khemolitotrof Oksidasi zat anorganik Zat anorganik Bakteri belerang Khemoorganotrof Oksidasi zat organik Zat organik fotosintetik Bakteri besi. Dunia Mikroba 1. 1988) Suhu Berdasarkan ketahanannya terhadap suhu.Jasad kapnofil ialah jasad yang memerlukan kadar oksigen rendah dan kadar CO2 tinggi. dan kapnofil. bakteri hidrogen.Jasad aerob fakultatif ialah jasad yang dapat hidup dalam keadaan anaerob maupun aerob. Psikrofil. mikroba yang tumbuh dengan baik pada suhu di bawah 20oC. Berdasarkan kebutuhan oksigen Berdasarkan akan kebutuhan oksigen. Jakarta.anaerob Aerotoleran/Anaerob Mikroaerofil Jasad aerob ialah jasad yang menggunakan oksigen bebas (O2) sebagai satusatunya aseptor hidrogen yang terakhir dalam proses respirasinya.

( Suriawiria. Mikroba yang dapat mensintesis bahan selnya dari senyawa organik sederhana dalam medium. S. Asidofil. INTERAKSI ANTAR JASAD DALAM MENGGUNAKAN NUTRIEN Jika dua atau lebih jasad yang berbeda ditumbuhkan bersama-sama dalam suatu medium. mikroba yang hidup optimum pada pH netral (6-8). Adanya ekskresi tersebut memungkinkan tumbuhnya mikroba lain. Alkalofil. Fenomena ini merupakan hasil interaksi metabolisme atau interaksi dalam penggunaan nutrisi yang dikenal sebagai sintropik atau sintropisme atau sinergitik. Tekanan Osmotik Perbedaan tekanan osmotik dapat memecahkan sel mikroba. akan mengekskresikan berbagai vitamin atau asam amino yang sangat penting untuk mikroba lainnya. tidak dapat hidup pada pH di bawah 4 dan di atas 9. maka aktivitas metabolismenya secara kualitatif maupun kuantitatif akan berbeda jika dibandingkan dengan jumlah aktivitas masing-masing jasad yang ditumbuhkan dalam medium yang sama tetapi terpisah. Beberapa arkhaeobakteri hanya dapat tumbuh pada konsentrasi elektrolit (biasanya NaCl). 1999) Medium yang digunakan untuk menumbuhkan dan mengembangbiakkan mikroorganisme tersebut harus sesuai susunanya dengan kebutuhan jenis-jenis mikroorganisme yang bersangkutan. Koloni satelit hanya dapat tumbuh kalau ada ekskresi dari mikroba lain yang menghasilkan faktor tumbuh eseniil bagi mikroba tersebut. 3. tinggi. Sebagai contoh ialah bakteri penghasil metan yang anaerob obligat tidak dapat menggunakan glukosa sebagai substrat. Contoh lain ialah biakan campuran yang terdiri atas dua jenis mikroba atau lebih sering tidak memerlukan faktor tumbuh untuk pertumbuhannya. mikroba yang tumbuh optimum pada pH di bawah 5. Bakteri yang tahan pada kadar garam yang relatif tinggi disebut bakteri Halofil yang bersifat halotoleran. tetapi bakteri tersebut akan segera tumbuh oleh adanya hasil metabolisme bakteri anaerob lain yang dapat menggunakan glukosa. Untuk menumbuhkan mikroorganisme yang kita inginkan. Contoh: fungi. 2008) MEDIA SEBAGAI SUMBER NUTRISI MIKROBA Media pertumbuhan mikroorganisme adalah suatu bahan yang terdiri dari campuran zat-zat makanan (nutrisi) yang di perlukan mikroorganisme untuk pertumbuhan.Mikroorganisme memanfaatkan nutrisi media berupa molekul-melekul kecil yang dirakit untuk menyusun komponen sel. mikroba yang tumbuh optimum pada pH di atas 9. 1999) 95 . bakteri Thiobacillus yang hidup pada pH 2-3.T. mikroba dapat dikategorikan menjadi beberapa yaitu: 1. yang pertama harus dilakukan adalah memahami kebutuhan dasarnya kemudian memformulasikan suatu medium atau bahan yang akan digunakan.( Suriawiria. karena kedua jasad tersebut saling memerlukanm faktor tumbuh esensiil yang diekskresikan oleh masing-masing jasad.Berdasarkan ketahanannya terhadap pH. Kenyataan ini dapat menimbulkan koloni satelit yang dapat dilihat pada medium padat.( Tryana. Dalam interaksi ini pertumbuhan jasad yang satu tergantung pada pertumbuhan jasad lainnya. 2. Neutrofil. Bentuk interaksi lain adalah cross feeding yang merupakan bentuk sederhana dari simbiose mutualistik. Dengan media pertumbuhan dapat dilakukan isolate mikroorganisme menjadi kultur murni dan juga memanipulasi komponen media pertumbuhannya.5.

fruktosa.5-1%. manitol. H. galaktosa. kasein.Jenis karbohidrat yang umumnya digunakan adalah amilum. limpa. Glatin juga memiliki fungsi yang sama seperti agar. semi-padat dan cair. dan asam organic. Jika dicampur dengan air dingin. mengandung basa organic terbuat dari otak. unsur-unsur logam. Yeast extract. glukosa. Mg dan unsur pelekat/trace element. sulfur. Vitamin-vitamin. Agar. MEDIUM KULTUR Medium kultur adalah material nutrien yang disiapkan untuk pertumbuhan mikroorganisme di laboratorium. laktobumin. agar tidak akan larut. Air (H2O) sebagai pelarut b. Sumber nitrogen mencakup asam amino. lemak. 96 .Bahan dasar a. yaitu bahan yang mengandung natrium silikat. protein. 2. Agar sulit di degradasi oleh mikroorganisme pada umunya dan mencair pada suhu 450C.Media biakan yang digunakan untuk menumbuhkan bakteri terdapat dalam bentuk padat. unsur mikro seperti Fe.Media biakan harus berisi zat hara dan mempunyai keadaan fisik yang sesuai pertumbuhan bakteri. protein atau senyawa bernitrogen lain.Kekurangannya adalah lebih banyak jemis mikroba yang mampu menguraikan dibandingkan agar. b. Peptone. vitamin dan air. ditambahkan untuk memperkaya asam amino dan gas dari karbohidrat. Bahan yang sering digunakan dalam pembuatan media a. d. terbuat dari ragi pengembang roti atau pembuat alcohol.Silica gel khususnya digunakan untuk memadatkan media bagi mikroorganisme autotrof abligat. msalnya phenol red (indicator asam basa) ditambahkan untuk indicator perbahan pH akibat produksi asam organic hasil metabolisme. fasfor. susu. Kegunaannya adalah sebagai pemadat (gelling). karbon. darah. sintesis sel. dan kedelai. liver. dan lain-lain. Media harus mengandung unsur-unsur yang diperlukan untuk metabolisme sel yaitu berupa unsur malro seperti C. Sumber karbon dan energi yang dapat di peroleh berupa semyawa organic atau anorganik sesuai dengan sifat mikrobanya. Fungsinya juga sebagai pemadat media. Jasad heterotrof memerlukan sumber karbon organik antara lain dari karbohidrat. P. adalah produk hidrolisis protein hewani aau nabati seperti otot. d. c.Bahan tambahan Bahan-bahan tambahan yaitu bahan yang ditambahkan ke dalam medium dengan tujuan tertentu. Yeast extract mengandung asam amino yang lengkap dan vitamin (B complex). dan bahkan ada yang tidak dapat tumbuh sama sekali dalam medium buatan. keperluan energi dalam metabolisme dan pergerakan. Sejumlah mikroba dapat menggunakan sumber N anorganik seperti urea. Glatin adalah polimer asam aminio yang diproduksi dari kologen. Konsentrasi yang ditambahkan untuk analisis fermentasi adalah 0. 3. Silica gel. granula atau bubuk dan terbuat dari rumput laut. dapat diperoleh dalam bentuk batangan.Nutrisi atau zat makanan a. namun ada pula yang membutuhkan media khusus. dan daging sapi. Bahan-bahan media biakan: ( Suriawiria. O. untuk melarutkannya harus diasuk dan dipanasi. N. Agar (dari rumput laut) yang berfungsi sebagai pemadat media.Pada umumnya nutrisi atau kandungan unsure dalam media biakan yang dibutuhkan oleh bakteri adalah sumber energi. Meat extract. Karbohidrat. Beberapa mikroorganisme dapat umbuh pada berbagai media.Nutrisi yang berbeda di dalam media biakan di gunakan untuk pertumbuhan. d. c. plasenta. gelatin. sukrosa. nitrogen. b. c. 1999) 1.

sulfur. karbon. Beberapa mikroorganisme juga bisa dimanfaatkan untuk melakukan microbiological assay. nitrogen. Supaya tetap cair.0 g Air 1 liter 97 bel 1: . suatu agen pemadat (solidifying agent) perlu ditambahkan ke dalam medium.2002)  Chemically Defined Media Untuk mendukung pertumbuhan mikroba. yaitu menentukan konsentrasi vitamin dalam suatu substansi. yang terdiri dari sejumlah nutrien seperti ekstrak dari ragi. Kemudian medium. ia disebut inokulum. dan sejenisnya. Medium dengan bahan kimia yang ditentukan adalah medium yang dapat diketahui dengan pasti komposisi kimianya. dan bahan-bahan lain yang tidak dapat disintesis oleh mikroba dalam medium itu. fosfor.Kultur harus diinkubasi pada temperatur yang tepat. Begitu agar memadat. glukosa dimasukkan dalam medium untuk menumbuhkan mikroba kemoheterotrof E. Salah satu contohnya adalah Lactobacillus. Ada beberapa kriteria medium kultur agar dapat menumbuhkan suatu kultur: (Prescott dkk.Mengandung nutrien yang tepat untuk mikroorganisme yang ingin ditumbuhkan. agar disimpan dalam air pada temperatur 50°C. . maupun digest dari protein. medium bisa diinkubasi bahkan hingga temperatur mendekati 100°C (agar mencair pada 100°C) sehingga bisa digunakan untuk menumbuhkan bakteri termofilik. contohnya adalah Neisseria. Ada beberapa jenis medium. Untuk menumbuhkan mikroba kemoheterotrof. Agar biasa digunakan dalam makanan seperti jeli dan es krim. suatu senyawa polisakarida kompleks yang berasal dari alga di lautan. Komposisi Nutrient Agar. Organisme yang membutuhkan banyak bahan-bahan faktor pertumbuhan disebut “fastidious”. yaitu bahan yang mengandung karbon dan energi. kecuali vitamin yang akan ditentukan konsentrasinya. suatu medium harus menyediakan energi.2002) .  Media kompleks (Complex Media) Hampir semua bakteri heterotropik dan fungi ditumbuhkan dalam media kompleks.0 g Ekstrak daging sapi 3. Pada kisaran temperatur ini masih aman bagi bakteri ketika agar dituangkan pada mereka. Agen pemadat yang paling sering digunakan adalah agar.0 g Agar 15. tanaman. Komposisi kimianya sedikit bervariasi dari batch satu dan batch lain. coli. dan mikroba digabungkan. yaitu: (Prescott dkk. Jika dibutuhkan suatu medium solid untuk menumbuhkan bakteri. .Medium harus steril (tidak ada kehidupan lain di dalamnya) sehingga kultur hanya mengandung mikroba yang diinginkan. medium harus mengandung bahan organik yang dibutuhkan mikroba untuk tumbuh. daging.Ketika mikroba pertama kali dimasukkan ke dalam medium kultur untuk memulai perkembangbiakan.0 g NaCl 8. Mikroba yang tumbuh dan berkembangbiak dalam medium kultur disebut dengan kultur. Untuk melakukannya. akan sebanding dengan jumlah vitamin dalam substansi. Sebagai contoh. medium pertumbuhan yang mengandung semua bahan yang dibutuhkan untuk pertumbuhan mikroorganisme disiapkan terlebih dahulu. Pertumbuhan bakteri. Suatu Medium Kompleks untuk Pertumbuhan Bakteri Heterotrof Konstituen Jumlah Pepton 5. substansi yang akan dites. Tabel berikut menunjukkan resep yang umum digunakan. yang bisa dilihat dari jumlah asam laktat yang dihasilkan.

5% NaCl. lalu oksigen dihilangkan dengan cara memberi air pada sodium bikarbonat dan sodium borohidrat yang sudah ada dalam wadah. dan ia juga dapat memfermentasi manitol untuk membentuk asam. Misalnya saja pemberian agar bismuth sulfite. Mereka hanya bisa tumbuh dalam sel hidup. Saat ini konsentrasi CO2 bisa diatur lewat alat elektronik. sehingga jika terkena oksigen ia akan mati. Agar garam manitol mengandung 7. yaitu dengan candle jar. Bismuth sulfite mampu menghambat bakteri gram-positif dan kebanyakan bakteri gram-negatif pada saluran pencernaan (kecuali S. Selain itu. sehingga perlu penanganan khusus untuk menumbuhkannya. yang temperatur tubuhnya sesuai dengan yang dibutuhkan bakteri itu. Wadah kemudian ditutup rapat. nitrogen. H2 dan O2 di dalam wadah bereaksi membentuk air. Ini menjadi masalah dalam kultivasi bakteri anaerobik. diperlukan suatu wadah khusus anaerobik. Cawan dimasukkan ke dalam wadah itu. Mycobacterium leprae hanya bisa ditimbuhkan di dalam armadillo. Streptococcus pyogenes. lalu diuapkan airnya sehingga bahan-bahan yang larut tadi akan terkonsentrasi.  Media pertumbuhan anaerobik (Anaerobic Growth Media) Bakteri anaerobik merupakan bakteri yang tidak tahan oksigen.  Teknik kultur khusus Ada beberapa jenis bakteri yang tidak pernah bisa ditumbuhkan dalam media buatan. Kandungan NaCl mampu menghambat 98 . medium disebut nutrient agar. Ada beberapa bakteri aerobik yang membutuhkan CO2 dalam jumlah lebih besar daripada yang ada di atmosfer. dan sulfur untuk pertumbuhan mikroba disediakan oleh digest protein. kultur dimasukkan ke dalam wadah yang di dalamnya terdapat lilin yang menyala. Kondisi di mana O 2 sedikit dan CO2 banyak adalah merupakan representasi dari kondisi dalam sistem pencernaan dan sistem pernafasan. Media ini mengandung bahan seperti sodium thioglycolate yang mampu mengikat oksigen terlarut dan menghilangkan oksigen dalam media kultur. Jika agar ditambahkan. Pada umumnya. Medium ini merupakan medium yang cocok untuk mengisolasi bakteri gram-negatif Salmonella typhi dari feses. Terkadang media selektif dan diferensiasi dijadikan satu dalam sebuah medium. Dengan bantuan katalis paladium. Vitamin dan mineral dari daging atau ragi dilarutkan. Staphylococcus aureus mampu menoleransi NaCl dalam konsentrasi tinggi. karbon. Pada metode ini. Jika kultur ternyata harus ditumbuhkan di cawan Petri. Reaksi yang terjadi menghasilkan H2 dan CO2. Wadah lalu ditutup rapat. Suatu media khusus yang disebut media pereduksi (reducing media) digunakan untuk bakteri anaerobik. ada cara yang lebih sederhana. bakteri yang menyebabkan sakit tenggorokan membentuk suatu cincin di sekitar koloninya di mana mereka menghancurkan eritrosit di sekitarnya. Media diferensiasi adalah media yang mampu mempermudah untuk membedakan koloni mikroba yang diinginkan dengan koloni-koloni lain yang tumbuh pada tempat yang sama. yaitu pepton. kebutuhan energi. Vitamin dan bahan-bahan organik lain disediakan oleh ekstrak daging maupun ragi. seperti Rickettsias dan Chlamydias tidak dapat tumbuh dalam media buatan. Jika medium kompleks dalam bentuk cair disebut nutrient broth.  Media selektif dan media diferensiasi Media selektif adalah media yang didesain untuk menekan pertumbuhan mikroba yang tidak diinginkan dan mendukung pertumbuhan mikroba yang diinginkan. Test tube yang digunakan untuk menumbuhkan bakteri ini haruslah tertutup rapat dan dipanaskan sebelum digunakan untuk menghilangkan O2. Agar darah (mengandung eritrosit) adalah media yang digunakan untuk mengidentifikasi spesies bakteri yang menghancurkan sel darah merah.Dalam media kompleks. Lilin akan berhenti menyala ketika konsentrasi O2 dalam wadah menjadi sedikit (tapi masih cukup untuk pertumbuhan mikroba). bakteri obligat intraseluler. Typhi).

aureus.pertumbuhan mikroba-mikroba lain dan mendukung pertumbuhan S. yang dapat menghambat pertumbuhan kebanyakan bakteria selainStreptococcus. EMB (Eosin Methylene Blue) EMB merupakan media diferensial berbentuk padat dapat digunakan untuk menggantikan Mac Conkey agar dan untuk mengadakan isolasi serta mendeteksi Enterobacteriaceae dan campuran spesiesspesies bakteri yangberbentuk batang koliform. Mannitol Salt Agar Mannitol salt agar merupakan medium yang mengandung 7. 3. 2. Bakteri dapat juga dibedakan berdasarkan kemampuannya untuk mengadakan hemolisis pada sel-sel darah. 4.5% NaCl. Endo agar Endo agar adalah media padat (solid plating media). Medium ini juga mengandung indikator pH yang berubah warna ketika manitol dalam medium difermentasi menjadi asam oleh S. Eosin dan methylene blue berfungsi untuk menghambat pertumbuhan bakteri Gram positif dan bakteri Gram negatif. aureus. Bakteri hemolitik a dapat menghasilkan suatu zona yang menghijau di sekelilingkoloni. Berikut ini contoh media selektif dan media diferensial yang sering digunakan di dalam Laboratorium Mikrobiologi : (Tryana. sedangkan bakteri hemolitik b. digunakan untuk menumbuhkan bakteri yang hidup di usus. sehingga kelihatan berwarna coklat kemerahmerahan dan digunakan untuk menyediakan faktor penumbuh yang diperlukan oleh bakteri patogen.T. Asam yang dihasilkan dari perombakan laktosa dapat dideteksi dengan asetaldehida dan natrium sulfit. Agar-darah (Blood agar) Agar darah merupakan media differensial yang digunakan untuk perbedaan beberapa bakteri patogen. misalnya Streptococcus. 5. fenol merah sebagai indikator pH. Medium ini juga mengandung mannitol. Eosin dan methylene blue ini dapat juga berperan sebagai indikator produksi asam. digunakan untuk seleksi dan penumbuh Enterobacteriaceae dan bakteri Gram negatif yang berbentuk batang. S. 2008) 1. berguna untuk mendeteksi adanya asam yang dihasilkan 99 . Mac Conkey Agar Media ini merupakan media padat dan media differensial. Media ini mengandung natrium sulfit dan “basic fuchsin” yang dapat menghambat pertumbuhan bakteri Gram positif. menghasilkan suatu zona yang cerah di sekeliling koloni. Garam-garam empedu dan kristal-kristal violet di dalam media ini dapat menghambat pertumbuhan bakteri Gram positif dan bakteri Gram negatif. Media ini dibubuhi darah.

untuk membawa stok kultur.Mikroorganisme dapat tumbuh sesuai dengan medium yang digunakan. 1994). Metode ini hampir sama dengan medium selektif. sedangkan yang tidak dapat memfermentasikan manitol tidak akan menimbulkan perubahan warna. Pada pembuatan medium NA ini ditambahkan pepton agar mikroba cepat tumbuh. pepton. Agar yang digunakan dalam proses ini untuk mengentalkan medium sama halnya dengan yang digunakan pada medium PDA yang juga 100 . Misalkan kita ingin mengisolasi mikroba dari tanah yang bisa tumbuh dengan fenol. untuk pertumbuhan sampel pada uji bakteri. Na merupakan salah satu media yang umum digunakan dalam prosedur bakteriologi seperti uji biasa dari air. Sodium Selenite dapat merupakan inhibitor terhadap Eschericia coli dan beberapa spesies dariShigella. namun ini didesain untuk meningkatkan jumlah mikroba yang ada dalam jumlah sangat kecil hingga mencapai level yang dapat dideteksi. terutama ketika bakteri spesies lain terdapat dalam jumlah besar.Media ini merupakan media sederhana yang dibuat dari ekstrak beef. produk pangan.  Kultur yang diperkaya (Enrichment culture) Terkadang suatu bakteri terdapat dalam jumlah yang sangat kecil terabaikan. 6. sewage. populasi yang tersisa itu adalah bakteri yang mampu mengolah fenol. dalam artian mikroorganisme heterotrof. namun tidak untuk mikroba-mikroba lain. Jika sampel tanah ditempatkan dalam medium cair kaya fenol (di mana fenol di sini sebagai sumber satu-satunya sumber karbon dan energi).2007) Nutrien Agar(NA) Gambar:Nutrien Agar Sumber : (wikipedia. karena mengandung banyak N2 (Dwidjoseputro. Selenite Broth Media ini digunakan untuk mengadakan isolasi spesies Salmonella dari spesimen-spesimen seperti urin dan feses. namun jumlahnya sangat sedikit dibandingkan mikroba lain. Setelah beberapa kali transfer. Berikut adalah berbagai medium yang sering digunakan :( Buckle. MEDIUM YANG SERING DIGUNAKAN Medium untuk menumbuhkan mikroorganisme ada berbagai macam. sehingga digunakanlah enrichment culture. dan untuk mengisolasi organisme dalam kultur murni. lalu sebagian dari mikroba ditempatkan pada wadah lain yang berisi medium yang sama. Biasanya digunakan pada sampel tanah.oleh Staphylococcus yang memfermentasi mannitol dapat menghasilkan zona berwarna kuning di sekitar pertumbuhannya. maka mikroba yang tidak bisa mengolah fenol tidak akan bisa tumbuh.NA juga digunakan untuk  pertumbuhan mayoritas dari mikroorganisme yang tidak selektif. dan agar.org/wiki/Nutrient_agar) Nutrien agar adalah medium umum untuk uji air dan produk dairy. Medium kultur diinkubasi beberapa hari. Medium yang digunakan untuk memperkaya kultur minoritas tadi biasanya berbentuk cair dan menyediakan nutrien dan suasana yang mendukung pertumbuhan mikroba minoritas.

org) PDA digunakan untuk menumbuhkan atau mengidentifikasi yeast dan kapang.berperan sebagai media tumbuh yang ideal bagi mikroba (Schlegel. Kemudian siapkan wadah sesuai yang dibutuhkan. Setelah sterilisasi warna medium menjadi agak coklat  Potato Dextrose Agar (PDA) Gambar : Fusarium roseum on Potato Dextrose Agar (PDA)  (Sumber : forestryimages.).setelah disterilisasi dalam autoklaf medium berwarna kecoklatan dan didapat endapan berwarna putih.2. Tetapi pada praktikum kali ini PDA dilarutkan pada 50mL air dengan perhitungan : 39×50 = 1000x x = 1.95gr jadi PDA yang digunakan untuk 50 ml aquades adalah 1. Dinginkan hingga suhu 40-45°C dan tuang dalam cawan petri dengan pH akhir 5. dan setelah dilarutkan dalam aquades berubah menjadi kekuning-kuningan dan terdapat endapan. Agar dilarutkan dengan komposisi lain dan disterilisasi dengan autoklaf pada 121°C selama 15 menit. Jadi untuk menghilangkan endapan tersebut maka dipanaskan dalam penangas air dengan tabung Erlenmeyer disumbat dengan alat penyumbat. Dalam percobaan warna NA sebelum dilarutkan dalam aquades adalah coklat. Didihkan selama 1 menit untuk melarutkan media secara sempurna. Plate Count Agar (PCA) Gambar : Listeria monocytogenes pada PCA 101 . Cara membuat PDA adalah mensuspensikan 39 g media dalam 1 liter air yang telah didestilasi.Sterilisasi pada suhu 121°C selama 15 menit.serbuk dicampur dan dipanaskan serta aduk. Serbuk PDA berwarna kuning karena merupakan ekstrak kentang yang pada dasarnya berarna kuning.95gr. 1993).Dapat juga digunakan untuk enumerasi yeast dan kapang dalam suatu sampel atau produk makanan.6+0. PDA mengandung sumber karbohidrat dalam jumlah cukup yaitu terdiri dari 20% ekstrak kentang dan 2% glukosa sehingga baik untuk pertumbuhan kapang dan khamir tetapi kurang baik untuk pertumbuhan bakteri. medium dapat ditanami bakteri . Setelah didinginkan.

5% pepton. dextrose.(Sumber: mikrobiyoloji.edu) Lactose broth digunakan sebagai media untuk mendeteksi kehadiran koliform dalam air. sebagai kaldu pemerkaya (pre-enrichment broth) untuk Salmonellae dan dalam mempelajari fermentasi laktosa oleh bakteri pada umumnya.  Nutrient Broth (NB) Gambar : media nutrient agar (NA) yang telah ditanam dari biakan media nutrient broth (NB) Sumber: mulyadiveterinary.Produksi gas ditunjukkan oleh akumulasi dalam tabung Durham (panah).3% ekstrak beef.2007) Lactose Broth  Gambar : Kaldu hasil laktosa (Sumber: marietta. 102 .Jika laktosa tidak difermentasi media tetap merah.wordpress. agar) hingga membentuk suspensi 22.Pertumbuhan dengan pembentukan gas adalah presumptive test untuk koliform.Laktosa menyediakan sumber karbohidrat yang dapat difermentasi untuk organisme koliform. yeast extract. Lactose broth dibuat dengan komposisi 0. dan produk susu.com Nutrient broth merupakan media untuk mikroorganisme yang berbentuk cair.5 g/L kemudian disterilisasi pada autoklaf (15 menit pada suhu 121°C). makanan. MEDIUM LAINNYA Selain medium di atas masih terdapat medium lain yang juga memiliki fungsi untuk menumbuhkan kultur mikroorganisme. Intinya sama dengan nutrient agar. Media PCA ini baik untuk pertumbuhan total mikroba (semua jenis mikroba) karena di dalamnya mengandung komposisi casein enzymic hydrolisate yang menyediakan asam amino dan substansi nitrogen komplek lainnya serta ekstrak yeast mensuplai vitamin B kompleks. dan 0.5% laktosa. yaitu :( Buckle. Nutrient broth dibuat dengan cara sebagai berikut.org) PCA digunakan sebagai medium untuk mikroba aerobik dengan inokulasi di atas permukaan. Pepton dan ekstrak beef menyediakan nutrien esensial untuk memetabolisme bakteri. PCA dibuat dengan melarutkan semua bahan (casein enzymic hydrolisate. Fermentasi laktosa menyebabkan produksi asam dan perubahan dalam indikator pH ke warna kuning. 0.

kvl. 2.0 g/L 4. Bagaiamanapun media ini sangat baik untuk mengkonfirmasi bahwa kontaminan tersebut adalah E. Aerugenosa dan Salmonella sp dapat menimbulkan keraguan. Protein dari kasein 10 g/L 2. dan Salmonella.Mikroba yang memfermentasi laktosa menghasilkan koloni dengan inti berwarna gelap dengan kilap logam. dan mangan yang diketahui untuk beraksi/bertindak sebagai faktor pertumbuhan bagi Lactobacillus. jika media ini digunakan pada tahap awal karena kuman lain juga tumbuh terutama P. Sterilisasi dengan autoklaf  EMBA (Eosin Methylene Blue Agar) dibuat pada langkah pertama. Agar EMB (levine) merupakan media padat yang dapat digunakan untuk menentukan jenis bakteri coli dengan memberikan hasil positif dalam tabung. Ekstrak ragi 4. asetat. 4. Namun demikian.Medium tersebut mengandung sukrosa karena kemempuan bakteri koli yang lebih cepat meragikan sukrosa daripada laktosa.dk)  MRSA (deMann Rogosa Sharpe Agar) MRSA merupakan media yang diperkenalkan oleh De Mann. dan mengisolasi jenis Lactobacillus dari seluruh jenis bahan. MRS agar mengandung: 1. menumbuhkan. D (+) glukosa 20 g/L 5. sehingga ada kemungkinan Pediococcus dan jenis Leuconostoc serta jenis bakteri lain dapat tumbuh.coli. Rogosa. Media Eosin Methylene Blue mempunyai keistimewaan mengandung laktosa dan berfungsi untuk memilah mikroba yang memfermentasikan laktosa seperti S. Untuk mengetahui jumlah bakteri coli umumnya digunakan tabel Hopkins yang lebih dikenal dengan nama MPN (most probable number) atau tabel JPT (jumlah perkiraan terdekat). tabel tersebut dapat digunakan untuk memperkirakan jumlah bakteri coli dalam 100 ml dan 0.1. Adanya eosin dan metilen blue membantu mempertajam perbedaan tersebut. Larutkan 3 g ekstrak daging dalam larutan yang 3. Gambar : Salmonella enteritidis tumbuh di EMB Agar (Sumber : microbiologyatlas. magnesium. EMB yang menggunakan eosin dan metilin bklue sebagai indikator memberikan perbedaan yang nyata antara koloni yang meragikan laktosa dan yang tidak.000 ml. Ekstrak daging 8. Larutkan 5 g pepton dalam 850 ml air distilasi/akuades. Atur pH sampai 7. aureus. dan Shape (1960) untuk memperkaya. sebaik nutrien diperkaya MRS agar tidak sangat selektif. MRS agar mengandung polysorbat. aerugenosa.2 g/L 103 . Magnesium sulfat 0. Beri air distilasi sebanyak 1. 5.1 ml contoh air.0 g/L 3. Sedangkan mikroba lain yang dapat tumbuh koloninya tidak berwarna. P.0.

Yeast ekstrak menyediakan vitamin B-kompleks yang mendukung pertumbuhan bakteri. Agar-agar 14 g/L 7. Tween 80 1. Media ini banyak digunakan untuk isolasi bakteri dari spesimen laboratorium dan akan mendukung pertumbuhan mayoritas bakteri patogen. Pada APDA jadi ini juga ditambah asam tartarat. Campuran garam bile dan kristal violet menghambat bakteri gram positif.Panaskan hingga mendidih sampai larut sempurna.Dinginkan hingga 50-60°C. TSB adalah media broth diperkaya untuk tujuan umum. 6. untuk isolasi.Neutral red sebagai indikator pH. sedangkan sel mikroba bersifat asam.4. Mangan sulfat 0. dipotassium hidrogen phosphate 2 g/L 8. glukosa.0 g/L 9.Dekstrosa adalah sumber energi dan natrium klorida mempertahankan kesetimbangan osmotik. empedu. Laktosa merupakan sumber karbohidrat.coli. NaCl. Natrium asetat 5 g/L 11. Campurkan ekstrak kentang dalam agar lalu ditambahkan glukosa dan diaduk rata.Dikalium fosfat ditambahkan sebagai buffer untuk mempertahankan pH. Bahan-bahan tersebut kemudian dicampur dengan 1 liter air yang telah didestilasi. pepton. agar). agar dilelehkan dalam 500 ml air.com) Setelah 24 jam.04 g/L MRSB merupakan media yang serupa dengan MRSA yang berbentuk cair/broth Trypticase Soy Broth (TSB)  (Sumber : totallyfreeimages. Diamonium hidrogen sitrat 2 g/L 10. kristal violet. Media TSB mengandung kasein dan pepton kedelai yang menyediakan asam amino dan substansi nitrogen lainnya yang membuatnya menjadi media bernutrisi untuk bermacam mikroorganisme. Agar VRBA mengandung violet kristal yang bersifat basa.Agar merupakan agen pemadat. menunjukkan pertumbuhan kolonial kasar. APDA Media APDA berfungsi untuk menumbuhkan dan menghitung jumlah khamir dan yeast yang terdapat dalam suatu sampel. Bila kondisi terlalu basa maka sel akan mati. Khamir dan yeast akan tumbuh dengan optimal pada media yang sesuai. Dengan VRBA dapat dihitung jumlah bakteri E. dan halus pada bakteri Enterobacter cloacae. 104  . Bahan-bahan yang dibutuhkan untuk membuat VRBA adalah yeast ekstrak. Adanya asam tartarat dan pH rendah maka pertumbuhan bakteri terhambat. APDA dibuat dengan merebus kentang selama 1 jam/45 menit. Pindahkan dalam tabung sesuai kebutuhan. dan penumbuhan bermacam mikroorganisme. neutral red. pH akhir adalah 7. VRBA (Violet Red Bile Agar) VRBA dapat digunakan untuk perhitungan kelompok bakteri Enterobactericeae.

Pompa Na dengan binding site (3 untuk Na+. PGYA Media ini berfungsi untuk isolasi. Ion Na dilepaskan 7. Ion Na terikat 4. Glikosida digitalis menghambat pompa dengan berikatan pada 1 tempat K+ 9. Konformasi ini menunjukkan afinitas yang lebih rendah terhadap Na+ dibanding K+ 6. 2. Untuk membuatnya. semua bahan dicampur dengan ditambah CaCO3 terlebih dahulu sebanyak 0. Binding site sekarang terbuka ke dalam. yang menyebabkan perubahan konformasi ATPase sehingga binding site terbuka ke arah luar. Dewi N (115061100111001) Bagaimana cara memisahkan mikroba dengan agar pada industri? Metode apa yang digunakan? Jawaban : Metode yang digunakan untuk memisahkan agar dan mikroba merupakan metode yang sederhana yaitu hanya dengan menggunakan pinset yang steril sehingga mikroba tidak tercemar oleh zat-zat lain. Ion K terikat 8. dan menumbuhkan sel khamir. Ion K dilepaskan dan kembali ke konformasi awal 105 . 2 untuk K+) dengan posisi terbuka pada sisi sitoplasma 2. PGYA dapat digunakan untuk mengidentifikasi mikroba terutama sel khamir. enumerasi.ATP terikat dan memfosforilasi permukaan sitoplasma dari pompa. 5. Nanang(11506110111025) Bagaimana cara kerja pompa Na? Jawaban : Kerja Pompa Na adalah sebagai berikut 1. LAMPIRAN II (TANYA-JAWAB) 1. dengan afinitas lebih rendah terhadap K+ dibanding Na+ 11. Kemudian dimasukkan dalam erlenmeyer dan disumbat dengan kapas lalu disterilisasi pada suhu 121°C selama 15 menit. mengubah konformasi ATPase 10. Dengan adanya dekstrosa yang terkandung dalam media ini.5 g lalu dilarutkan dengan akuades. Konformasi menunjukkan afinitas yang lebih tinggi terhadap Na+ dibanding K+ 3. Defosforilasi terjadi.

meium anorganik. Winda(115061101111003) Semua organisme membutuhkan belerang(sulfur) apa bahayannya jika sulfur menjadi sulfit? Jawaban : Tidak berbahaya karena perpindahan sulfat terjadi melalui proses rantai makanan lalu semua makhluk hidup yang mati akan diuraikan komponen organiknya oleh bakteri. 4. besi. 6. dalam industri memakai media agar.spesifik. mangan. sulfat dan karbon dioksida. microaerophil adalah mikroba yang selama hidupnya hanya membutuhkan oksigen dalam jumlah yang sedikit.Dll 5.tempat kecil dan tempat tersebut harus dalm jumlah banyak 8. Kemudian H2S digunakan bakteri fotoautotrof naerob seperti Chromatium dan melepaskan sulfur dan oksigen. semi padat – berdasarkan fungsi yaitu diperkaya.perhitungan penguji dan khusus. Pandu R(115061107111001) Tadi dikatakan bahwa kapasitol itu membutuhkan oksigen yang sedikit nah apa bedanya dengan microaerophil? Jawaban: Kapnofil adalah mikroba yang memerlukan CO2 dalam konsentrasi yang tinggi. lalu bagaimana aseptor untuk mikroorganisme anaerob yang tidak menyukai O2? Jawaban: Yang tidak menyukai O2 pada mikroba anaerobik terjadi pemanfaatan berbagai akseptor elektron seperti nitrat. Dian Nita Citra Dewi(115061101111013) Apa di dalam industri juga menggunakan media agar dalam skala besar? Jawaban : Dalam industri juga menggunakan agar tetapi agar tersebut di letakkan di tempat. antara lain Desulfomaculum dan Desulfibrio yang akan tereduksi sulfat menjadi sulfida dalam bentuk hidrogen sulfida(H2S). Ayu Indah Wibowo(115061101111011) Bagaimana cara mengendalikan nutrient untuk mikroba agar tidak berlebihan? Jawaban : Dengan cara cleaning. Mutia Dhana (115061100111007) Syarat-syarat apa yang digunakan untuk untuk memilih medium yang cocok untuk mikroba yang kita gunakan? Jawaban : berdasarkan susunan kimianya. Ada media lain selain agar yaitu media cair seperti kaldu tetapi sangat jarang digunakan karena keefektifannya lebih rendah jika dibandingkan dengan media agar. yaitu medium organik.medium sintetik dan medium nonsintetik -berdasarkan konsistensi medium separti medium cair.3. Beberapa jenis bakteri terlibat dalam daur sulfur. padat. Proses tersebut tergantung pada ketersediaan akseptor dan kondisi lingkungan 106 . desinfeksi.sterlisasi.aniseptis. 9. 7. Vivi Anita Aprilia(115061107111005) Aseptor yang digunakan oleh mikroba aalah O2. Dewi Ariesi (115061105111007) Apakah di industri juga menggunakan agar dalam pemberian nutrient? Apakah ada media selain agar? Jawaban : Iya.

yang dapat melaksanakan kehidupan. mitokondria yang terdapat di dalam sel berfungsi sebagai penghasil energy. Sel disebut satuan struktural makhluk hidup. perombakan. 1994) Struktur Sel Struktur sel dibagi menjadi struktuk sel prokariotik dan sel eukariotik. sedangkan lisosom berfungsi sebagai pencerna. Pengertian Sel Sel berasal dari kata latin cella yang berarti ruangan kecil. tetapi ada bakteri anaerob itu bagaimana? Dan bagaimana cara kerja aseptor elektron serta bagaimana mikroba menggunakannya? Jawaban: Bakteri anaerobik untuk memenuhi syarat nutrisinya dengan cara aseptor elektron. ukuran sel bermacam-macam dan bentuk sel juga bermacam-macam . Organisme bersel satu mengadakan pembelahan secara langsung sedangkan sel-sel pada organisme bersel banyak mengalami pembelahan secara mitosis. Mariatus Sholihah(115061100111019) Pada syarat nutrisi dijelaskan bahwa semua mikroorganisme membutuhkan oksigen. Ridhani Rida Ramadhan(115061100111009) Sisa sisa metabolisme dari bakteri bis dijadikan sebagai media pertumbuhan mikroba atau tidak? Dan tolong jelaskan medium pengaya dengan diperkaya? Jawaban: Sisa-sisa metebolisme bakteri tidak bisa dijadikan sebagai media pertumbuhan mikoba. sifat makhluk hidup dapat diwariskan kepada keturunannya. Sel disebut sebagai unit terkecil karena sudah tidak bisa dibagi-bagi lagi menjadi bagian yang lebih kecil yang berdiri sendiri. penyusunan. Dengan adanya materi genetik. dan terhadap rangsangan. strukturnya sangat rumit dan masing-masing bagian sel memiliki fungsi khusus.  Struktur sel prokariotik 107 . Dhanang Edy Pratama(115061101111007) Ada berapa mikroba yng benar benar tida bisa ditumbuhkan dalam medium buatan.10. misalnya. seperti mikrobkteriel leprae yang hanya bisa di tumbuhkan dalam tubuh armadillo. Nutrisi tersebut dapat diambil dari lingkungan maupun dari tubuh armadillo 11. Bagaimana cara mengontrol asupan nutrisi pada mikroba seperti itu? Jawaban: Jawaban : Asupan pada mikrobakterium lepre berasal dari gula.yaitu materi penentun sifat-sifat makhluk hidup. Sel merupakan unit terkecil dari makhluk hidup. Sel dapat melakukan proses kehidupan seperti melakukan respirasi. Sel juga disebut sebagai satuan fungsional makhluk hidup. hidrokarbon dan asam amino sebagai sumber karbon dan nitrogen mikroba. Pembelahan sel dilakukan baik oleh organisme bersel satu maupun organisme bersel banyak. Sel mengandung materi genetic. (Alberts B. Cara kerja aseptor elektron yaitu dengan membuat ATP dengan menggunakan reaksi anaerobik yaitu fermentasi. reproduksi melalui pembelahan sel. Perkembangbiakan dilakukan melalui pembelahan sel. meskipun ukuran sel sangat kecil. karena media pertumbuhan harus steril sedangkan pada sisa sisa metabolisme tidak steril Medium pengaya medium yang kaya akan nutrient tertentu sehingga vdapat menumbuhkan dan memperbanyak sel 12.

dan sitoplasma yang mengandung ribosom. bersifat semi/selektif permeabel. (Yunus. eukariotik memiliki sistem endomembran. namun mempunyai struktur yang berfungsi sama. Membran sel Lipid Fosfolipid merupakan komponen utama dari membran sel. The bilayer lipid adalah semipermeabel. lipid dapat membuat mana saja dari 20 sampai 80 persen dari membran. berfungsi mengatur pemasukan dan pengeluaran zat ke dalam dan ke luar sel dengan cara difusi. sel prokariotik tidak memiliki membram inti. Mereka membentuk bilayer lipid di mana mereka hidrofilik (menarik air) di daerah kepala spontan mengatur untuk menghadapi sitosol berair dan cairan ekstraselular. dan lisosom. A. adapun sel eukariotik meliputi sebagai berikut: (Yunus. 2009) 1. protein memantau dan memelihara iklim kimia sel dan membantu dalam transfer molekul melintasi membran. Sementara lipid membantu memberikan fleksibilitas membran mereka. yakni memiliki organelorganel bermembram seperti retikulum endoplasma. sehingga hanya molekul tertentu untuk meredakan melintasi membran. dengan sisanya menjadi protein. komplek Golgi. Membran sel terutama terdiri dari campuran protein dan lipid . sepert reticulum endoplasma dan komplek golgi. dan transport aktif. selain itu.Semua sel prokariotik mempunyai membram plasma. mitokondria. sel eukariotik juga memiliki sentriol. osmosis. nukleoid (berupa DNA dan RNA). yaitu mesosom dan kromatofor. Ciri lain dari sel prokariotik adalah tidak memiliki sistem endomembran (membran dalam). 2009)  Struktur sel eukariotik Perbedaan pokok antara sel prokariotik dan eukariotik adalah sel eukariotik memiliki membran inti. sedangkan hidrofobik mereka (ditolak oleh air) daerah ekor wajah jauh dari cairan sitosol dan ekstraseluler. sel prokariotik juga tidak memiliki mitokondria dan kloropas. A. Karena tidak mempunyai membran inti maka bahan inti yang berada di dalam sel mengadakan kontak langsung dengan protoplasma. 108 . Tergantung pada lokasi membran dan peran dalam tubuh. sedangkan sel prokariotik tidak. Membran plasma Membran plasma membatasi sel dengan lingkungan luar. sedangkan sel prokariotik tidak. selain itu sel.

asam lemak. molekul transportasi melintasi membran sel melalui difusi difasilitasi . Sitoskeleton menyediakan kerangka kerja struktural penting untuk: a. Ini composes 54% dari total volume sel. sitoskeleton menentukan bentuk sel. neurotransmitter dan molekul sinyal lainnya. Nukleus berdiameter 10 mikrometer. Sitoplasma adalah materi yang mengisi antara inti dan selaput plasma. Selama replikasi. Sitosol berisi ribuan enzim yang bertanggung jawab untuk catalyzation dari glikolisis dan glukoneogenesis dan untuk biosintesis gula. seperti protein globular. sitoskeleton dapat membantu dalam pergerakan sel. terdiri atas air dan zat-zat yang terlarut serta berbagai macam organel sel hidup. Struktur ini memberikan sel bentuk dan memungkinkan untuk mengatur banyak reaksi kimia yang terjadi di sitoplasma. Pesan dari dalam perjalanan inti melalui pori-pori di amplop nuklir untuk memasuki sitoplasma. Sel bentuk. Selain itu. Sitoplasma berisi sisa organel seperti retikulum endoplasma dan mitokondria. Sitoskleton Merupakan rangka sel yang tersusun atas tiga jenis serabut yaitu mikrofilamen. masing-masing diperlukan untuk reproduksi sel dan kelangsungan hidup. 3. Sitoplasma Sitoplasma merupakan cairan sel yang berada di luar inti. Mereka membantu sel untuk mengenali sel-sel tubuh lainnya. Kolesterol sebagian melumpuhkan ekor asam lemak membuat membran kurang fleksibel dan dengan demikian kurang permeabel untuk molekul yang lebih kecil. Membran sel Protein Protein struktural membantu memberikan dukungan sel dan bentuk. Mereka tertanam dalam membran sel dan membantu dalam sel untuk komunikasi sel dan transportasi molekul melintasi membran. Di dalam inti. dan asam amino. Inti bertanggung jawab untuk berkomunikasi dengan organel lain dalam sitoplasma (ruang seperti gel yang mengelilingi inti). Informasi genetik dikelilingi oleh amplop dua-lapisan nuklir dan umumnya ditemukan di tengah sel. Kadang-kadang konten adalah setinggi satu molekul kolesterol per satu molekul fosfolipid. Untuk sel tanpa dinding sel. Yang berperan penting pada sel sebagai pengendali kegiatan sel. Glikolipid yang terletak pada permukaan membran sel dan memiliki karbohidrat rantai gula yang melekat pada mereka. DNA terikat oleh protein histon dan disusun dalam kromatin. Ini adalah salah satu fungsi dari filamen intermediate. Nucleolus adalah di mana ribosom dirakit. disebut nucleoplasm. Protein transport. Nukleus Inti sel atau nukleus merupakan organel terbesar yang berada di dalam sel. mikrotubulus dan filamen intermediar. Sitosol adalah struktur terbesar dalam sel. Kolesterol merupakan komponen penting dari membran plasma hewan. Selain informasi genetik. inti sebagian besar juga mengandung satu atau lebih bola berbentuk organel yang disebut nukleolus. 109 .Kolesterol merupakan komponen lipid dari membran sel. 2. chromatins dikondensasikan untuk membentuk struktur yang sangat terorganisir yang disebut kromosom . Protein membran sel reseptor membantu sel berkomunikasi dengan lingkungan eksternal mereka melalui penggunaan hormon.Glikoprotein memiliki rantai karbohidrat yang menyertainya. 4. Nukleus biasanya terletak di tengah sel dan berbentuk bulat dan oval. Daerah sitoplasma di luar organel individu disebut sitosol.

Audesirk dan Audesirk memberikan contoh sel darah putih "merangkak" dan perubahan migrasi dan bentuk sel selama perkembangan organisme multicelled. Selama pembelahan sel. RE halus berfungsi dalam beberapa proses metabolisme yaitu sintesis lipid. cincin mikrofilamen membantu membagi sel mengembangkan dua oleh konstriksi wilayah tengah antara sel-sel. sementara RE sarkoplasmik menyimpan dan memompa ion kalsium. atau pada membran inti sel. Organel gerakan. Sentriol adalah struktur yang ditemukan dalam sel-sel hewan eukariotik.Pada fase tertentu dalam daur hidupnya sentriol memiliki silia atau flagela. terdapat bintik-bintik yang merupakan ribosom. RE sarkoplasmik RE sarkoplasmik adalah jenis khusus dari RE halus. RE sarkoplasmik berperan dalam pemicuan kontraksi otot. sehingga kekuatan yang menggerakkan sel. Dalam kasusendositosis ketika vesikula terbentuk untuk menelan beberapa partikel dari luar sel. RE halus Berbeda dari RE kasar. Ada juga dapat geser gerakan struktur ini. metabolisme karbohidrat dan konsentrasi kalsium. Kata ribosom didapat dari penggabungan kata yaitu ribonucleic acid dan kosakata Yunani. Pembagian ribosom berdasarkan subunit besar dan subunit kecil. yang artinya tubuh. Gerakan sel. Ini adalah bagian dari sel. Retikulum Endoplasma (RE) merupakan labirin membran yang demikian banyak sehingga retikulum endoplasma meliputi separuh lebih dari total membran dalam sel-sel eukariotik. Ribosom ini berperan dalam sintesis protein. maupun manusia. Retikulum Endoplasma Adalah organel yang dapat ditemukan di seluruh sel hewan eukariotik. Ribosom merupakan organel terkecil dalam sel yang berbentuk bulat padat dengan diameter sekitar 20 sampai 25 nm. sedangkan yang besar mengikat tRNA (transport RNA). hewan. dan diperkirakan bahwa pergerakan vesikel dipandu oleh sitoskeleton. d. soma. yang merupakan komponen sitoskeleton. yang bertindak sebagai pusat mikrotubulus memproduksi. tergantung pada jenisnya. Ribosom Ribosom merupakan salah satu bagian penting dalam tubuh makhluk hidup karena dapat mengendalikan cara kerja tubuh tumbuh-tumbuhan. Retikulum endoplasma memiliki struktur yang menyerupai kantung berlapis-lapis. . RE halus mensintesis molekul. mikrotubulus mencapai gerakan chromosones ke inti putri. fungsi utama RE kasar adalah sebagai tempat sintesis protein. Koleksi dinamis mikrofilamen dan microtubles dapat terus dalam proses perakitan dan pembongkaran. (kata endoplasmik berarti “di dalam sitoplasma” dan retikulum diturunkan dari bahasa latin yang berarti “jaringan”). c. Kantung ini disebut cisternae. 5. Tanaman sel dan jamur tidak mengandung sentriol. Pembelahan sel. Perbandingan keduanya yaitu 65% rRNA dan 35% RNP. dan tempat melekatnya reseptor pada protein membran sel. 7. Ribosom tersuspensi dalam sitosol atau terikat pada retikulum endoplasma kasar. Fungsi retikulum endoplasma bervariasi. Mikrotubulus dan mikrofilamen dapat membantu organel bergerak dari satu tempat ke tempat dalam sel. Struktur Ribosom Susunan ribosom merupakan susunan yang rumit antara RNA ribosom (rRNA) dan protein ribosom (disebut Ribonukleoprotein atau RNP). 110 6. Subunit kecil mengikat mRNA (messeger RNA). mikrofilamen menempel vesikel dan menariknya ke dalam sel. Kemudian untuk sel-sel hewan. RE sarkoplasmik ini ditemukan pada otot licin dan otot lurik. Maka.b. detoksifikasi obat-obatan. RE halus tidak memiliki bintik-bintik ribosom di permukaannya.Sebagian besar sintesis kompleks dan fungsi distribusi dari retikulum endoplasma dan kompleks Golgi memanfaatkan vescicles transportasi. Ada tiga jenis retikulum endoplasma: RE kasar Di permukaan RE kasar. Sentriol Sentriol merupakan organel yang dapat dilihat ketika sel mengadakan pembelahan. Yang membedakan RE sarkoplasmik dari RE halus adalah kandungan proteinnya.

untuk pembungkusan dalam organel tertentu seperti lisosom atau dikirim ke luar sel.Fungsi ribosom Ribosom memiliki fungsi untuk mensintesis protein. Proses pembentukan protein Ada tiga tahap proses pembentukan protein. informasi pada gen digandakan satu per satu (basa per basa) dari sebuah rantai DNA menjadi rantai RNA pembawa pesan (mRNA). misalnya ginjal.sama berpasangan dengan adenine. antara lain replikasi DNA. Transkripsi adalah penyalinan informasi dari gen ke dalam molekul RNA. Sel yang memiliki laju sintesis protein yang tinggi secara khusus memiliki jumlah ribosom yang sangat banyak. Ribosom akan membaca urutan basa RNA dan menterjemahkan (translate) menjadi urutan asam amino tertentu sesuai dengan resep yang dibawa mRNA. Badan Golgi pada tumbuhan biasanya disebut diktiosom. Terdapat tiga unsur yang terlibat dalam proses translasi yaitu adalah mRNA. Sedang ribosom terikat umumnya membuat protein yang dimasukkan ke dalam membran. Setiap sel hewan memiliki 10 hingga 20 badan Golgi. • Transkripsi Transkripsi adalah proses penggandaan DNA menjadi RNA.      . Pada produksi awal protein. kompleks Golgi atau diktiosom) adalah organel yang dikaitkan dengan fungsi ekskresi sel. Membentuk membran plasma. Sebagian besar protein dibuat oleh ribosom bebas akan berfungsi di dalam sitosol. sel hati manusia memiliki beberapa juta ribosom. Pada tahap transkripsi basa timin pada DNA digantikan oleh urasil pada RNA namun keduanya sama. Misal. • Replikasi DNA Replikasi adalah pencetakan dan penggandaan DNA dengan membelah dan membentuk sel yang baru yang urutan A-C-G-T nya sama. sedangkan sel tumbuhan memiliki hingga ratusan badan Golgi. Tempat untuk memodifikasi protein 111 8. tRNA. dan struktur ini dapat dilihat dengan menggunakan mikroskop cahaya biasa. Ribosom berperan sebagai tempat pertemuan mRNA dengan tRNA serta penterjemahan kodon serta reaksi perangkaian asamamino. transkrpsi dan translasi. Kantung yang dilepaskan dapat menjadi bagian dari membran plasma. Terjadi terutama pada sel-sel kelenjar kantung kecil tersebut. yang dalam pelaksanaannya adalah berupa penyusunan basa-basa pada rantai RNA dengan menggunakan runtunan basa DNA gen sebagai modelnya. Pada saat sintesis protein ribosom mengelompok menjadi poliribosom (polisom). Kantung atau membran golgi sama seperti membran plasma. berisi enzim dan bahan-bahan lain. Membentuk dinding sel tumbuhan Fungsi lain ialah dapat membentuk akrosom pada spermatozoa yang berisi enzim untuk memecah dinding sel telur dan pembentukan lisosom. dan rRNA. • Translasi Pada tahap ini mRNA hasil transkripsi dibaca oleh ribosom dan diproses lebih lanjut oleh ribosom. Di sinilah asam-asam amino itu dirakit sesuai urutan yang diresepkan gen (DNA) dan kemudian melipat membentuk struktur tiga dimensi yang fungsional. beberapa fungsi badan golgi antara lain : Membentuk kantung (vesikula) untuk sekresi. Tidak mengejutkan jika sel yang aktif dalam mensintesis protein juga memiliki nukleus yang terlihat jelas. Kompleks golgi Badan Golgi (disebut juga aparatus Golgi. Organel ini terdapat hampir di semua sel eukariotik dan banyak dijumpai pada organ tubuh yang melaksanakan fungsi ekskresi.

Mitokondria Mitokondria adalah tempat di mana fungsi respirasi pada makhluk hidup berlangsung. lipase. Setelah itu. Endositosis ialah pemasukan makromolekul dari luar sel ke dalam sel melalui mekanisme endositosis. membran luar juga mengandung enzim yang terlibat dalam biosintesis lipid dan enzim yang berperan dalam proses transpor lipid ke matriks untuk menjalani ?-oksidasi menghasilkan Asetil KoA. Di endosom lanjut. fosfatase. dan embrio manusia. Proses autofagi digunakan untuk pembuangan dan degradasi bagian sel sendiri. Di dalamnya. Semua enzim tersebut aktif pada pH 5. misalnya sel otot jantung. 10. Selain itu. organel ini memiliki 40 jenis enzim hidrolitik asam seperti protease. Membran dalam mengandung protein yang terlibat dalam reaksi fosforilasi 112   .Badan mikro terdiri atas peroksisom dan glioksisom serta berisi enzim katalase. Pertama. Membran ini merupakan tempat utama pembentukan ATP. ruang antar membran. Luas permukaan ini meningkat sangat tinggi diakibatkan banyaknya lipatan yang menonjol ke dalam matriks. Fungsi utama lisosom adalah endositosis. bagian dari retikulum endoplasma kasar menyelubungi organel dan membentuk autofagosom. materi tersebut bertemu pertama kali dengan enzim hidrolitik.0 µm.3-1. dan autofagi. Mula-mula. fagosom akan berfusi dengan enzim hidrolitik dari trans Golgi dan berkembang menjadi lisosom (endosom lanjut). Dengan demikian. fosfolipase. Mitokondria berbentuk elips dengan diameter 0.5 µm dan panjang 0. membran luar mitokondria menyerupai membran luar bakteri gram-negatif. seperti organel yang tidak berfungsi lagi. Respirasi merupakan proses perombakan atau katabolisme untuk menghasilkan energi atau tenaga bagi berlangsungnya proses hidup. pH sekitar 6.5 – 1. Proses ini berguna pada sel hati. Lisosom ditemukan pada tahun 1950 oleh Christian de Duve dan ditemukan pada semua sel eukariotik. Fagositosis merupakan proses pemasukan partikel berukuran besar dan mikroorganisme seperti bakteri dan virus ke dalam sel.Untuk menyortir dan memaket molekul-molekul untuk sekresi sel Untuk membentuk lisosom 9. yang tidak dibawa ke endosom lanjut. membran akan membungkus partikel atau mikroorganisme dan membentuk fagosom. mitokondria adalah “pembangkit tenaga” bagi sel. ataupun sulfatase. Membran luar terdiri dari protein dan lipid dengan perbandingan yang sama serta mengandung protein porin yang menyebabkan membran ini bersifat permeabel terhadap molekul-molekul kecil yang berukuran 6000 Dalton. transformasi berudu menjadi katak. yang kemudian materi-materi ini akan dibawa ke vesikel kecil dan tidak beraturan. Jumlah dan bentuk mitokondria bisa berbeda-beda untuk setiap sel. Lisosom Lisosom adalah organel sel berupa kantong terikat membran yang berisi enzim hidrolitik yang berguna untuk mengontrol pencernaan intraseluler pada berbagai keadaan. Mitokondria banyak terdapat pada sel yang memilki aktivitas metabolisme tinggi dan memerlukan banyak ATP dalam jumlah banyak. Kemudian. autofagosom berfusi dengan enzim hidrolitik dari trans Golgi dan berkembang menjadi lisosom (atau endosom lanjut). Stuktur krista ini meningkatkan luas permukaan membran dalam sehingga meningkatkan kemampuannya dalam memproduksi ATP. membran dalam. nuklease. Struktur mitokondria terdiri dari empat bagian utama. Terjadi penurunan pH (5) pada endosom lanjut sehingga terjadi pematangan dan membentuk lisosom.5 mikro meter . disebut krista [Lodish. Di dalam endosom awal. glikosidase. yaitu membran luar. Beberapa materi tersebut dipilah dan ada yang digunakan kembali (dibuang ke sitoplasma). 2001]. Badan Mikro Badan mikro disebut karena ukurannya yang kecil . hanya bergaris tengah 0. 2000]. fagositosis. 11. Dalam hal ini. Membran dalam yang kurang permeabel dibandingkan membran luar terdiri dari 20% lipid dan 80% protein. dan matriks yang terletak di bagian dalam membran [Cooper. yang disebut endosom awal.

Saat sel membelah. (Syamsuri I & Suliestijono. 12. seperti siklus Krebs.Diameter mikrofilamen hanya 5 nm. yang dikenal dengan DNA mitkondria (mtDNA).tipis yang memanjang. filamen intermediat. Serat dalam sel memberikan kerangka struktur kaku. Sebagian besar sel eukariotik juga mengandung selaput dalam.1997) Dalam sitoplasma eukariotik ada sejumlah protein struktural yang membentuk jaringan.M. fosfat inorganik serta ion-ion seperti magnesium. Inti dikelilingi oleh dua selaput. ribosom. ATP. 113 . R.  Fungi.Tabung tabung kecil itu tersusun atas protein yang dikenal sebagai tubulin. (Schleif. Retikulum Endoplasma adalah selaput lain yang ditemukan dalam sel eukariotik. kalsium dan kalium. Dalam tiap siklus sel. serta protein transpor yang mengatur keluar masuknya metabolit dari matriks melewati membran dalam. namun terselubung dalam selaput inti. DNA sendiri terkekang erat dengan sejenis protein yang disebut histon. Organel ini berbentuk benangbenang halus . (Schleif. Retikulum Endoplasma berdampingan dengan selaput inti luar namun membentang di seluruh sitoplasma dalam banyak tipe sel dan terlibat dengan sintesis dan transpor protein selaput. kloroplas juga mengandung DNA dan ribosom yang berbeda dari struktur yang analog di daerah lain sel tersebut. reaksi oksidasi asam amino. dibutuhkan untuk menarik kromosom ke sel-sel anakan. (Abercrombie. aktin. Mikrotubulus dan Mikrofilamen Mikrotubulus merupakan organel berbentuk tabung atau pipa . Mereka juga mengikat mayoritas ribosom. dan terdiri dari sebagian mikrotubula. dan berpartisipasi dalam mengubah bentuk sel sehingga ia dapat bergerak.Mikroorganisme yang termasuk jenis Eukariotik. dan reaksi ?-oksidasi asam lemak. 1993). 2006) DNA sel eukariotik tidak mencampur bebas dengan sitoplasma.yang juga berperan dalam gerakan sel adalah mikrofilamen.yaitu aktin dan miosin. sebuah alat khusus bernama spindel. Ruang antar membran yang terletak diantara membran luar dan membran dalam merupakan tempat berlangsungnya reaksi-reaksi yang penting bagi sel. berpartisipasi dalam gerakan vesikel dan kromosom. Secara normal. selaput inti meluruh. yang panjangnya 2. (Prawirohartono S & Suhargono H. biasanya dalam bentuk kromosom melingkar seperti yang ditemukan juga pada E. 1993). Ia terlibat dengan modifikasi protein untuk transpornya ke organel sel lain atau untuk ekspor ke luar sel. dan filamen tipis membentuk empat kategori serat yang ditemukan dalam sel eukariotik. Di dalam matriks mitokondria juga terdapat materi genetik. Dalam banyak hal. Mikrotubula.1996) Kloroplas melakukan fotosintesis pada sel tanaman.oksidatif. Selain mikrotubulus .dan juga membentuk rangka dalam pada sel.5 mikrometer dengan diameter 25 nm. Mereka mengandung DNA.1996) Sel eukariotik juga mengandung organel khusus seperti mitokondria. yang fungsi utamanya tampaknya membantu DNA mempertahankan keadaan kakunya. hanya protein kecil dengan berat molekul kurang dari 20 hingga 40 ribu dapat bebas memasuki inti lewat selaput inti. Ini adalah struktur besar yang secara aktif mentranspor protein atau RNA ke dalam atau ke luar inti. Golgi adalah struktur lain yang mengandung selaput. ATP sintase yang berfungsi membentuk ATP pada matriks mitokondria. ADP. (Prawirohartono S & Suhargono H. mitokondria mirip dengan bakteri dan kenyataannya tampaknya berevolusi dari bakteri.Mikrofilamen tersusun atas dua macam protein . dan kemudian menggumpal kembali. yang melakukan fosforilasi oksidatif untuk membangkitkan energi kimia yang dibutuhkan sel. Seperti mitokondria.Mikrofilamen banyak terdapat pada sel-sel otot .coli dan ribosom yang berada di sitoplasma sel eukariotik. dan merupakan tipe organel khusus lainnya yang ditemukan dalam beberapa jenis sel eukariotik. R.

pertumbuhan. Hifa adalah struktur menyerupai benang yang tersusun dari dinding berbentuk pipa. Slamet. Septa mempunyai pori besar yang cukup untuk dilewati ribosom. Struktur jamur. Parasit Parasit obligat merupakan sifat jamur yang hanya sedangkan di luar inangnya tidak dapat carinii (khamir yang menginfeksi paru-paru penderita AIDS). Jamur pada umumnya multiseluler (bersel banyak). hidup. (Prawirohartono. Oleh karena jamur merupakan konsumen maka jamur bergantung pada substrat yang menyediakan karbohidrat. Sitoplasmanya mengandung organel eukariotik. struktur tubuh. Kebanyakan hifa dibatasi oleh dinding melintang atau septa. Tubuh jamur tersusun dari komponen dasar yang disebut hifa. a. ada pula jamur yang multiseluler membentuk tubuh buah besar yang ukurannya mencapai satu meter. yaitu jamur yang hidup di akar tanaman kacang-kacangan atau pada liken. hifa dapat juga langsung menyerap bahanbaha organik dalam bentuk sederhana yang dikeluarkan oleh inangnya. Simbiosis mutualisme jamur dengan tanaman dapat dilihat pada mikoriza. Cara hidup jamur lainnya adalah melakukan simbiosis mutualisme. kemudian menyimpannya dalam bentuk glikogen. Hifa pada jamur yang bersifat parasit biasanya mengalami modifikasi menjadi haustoria yang merupakan organ penyerap makanan dari substrat. jamur dapat bersifat parasit obligat. haustoria dapat menembus jaringan substrat. Ada jamur yang satu sel. Pneumonia adalah jamur yang bersifat saprofit bersifat jika parasit tidak fakultatif jika mendapatkan inang yang mendapatkan inang yang c. 2003) 1. beberapa jamur 114 . Parasit Parasit fakultatif sesuai. Selain itu. Cara makan dan Habitat jamur Semua jenis jamur bersifat heterotrof. selain menyerap makanan dari organisme lain juga menghasilkan zat tertentu yang bermanfaat bagi simbionnya. Struktur hifa senositik dihasilkan oleh pembelahan inti sel berkali-kali yang tidak diikuti dengan pembelahan sitoplasma. Misalnya. b. vitamin. misalnyo khamir. obligat dapat hidup pada inangnya. Ciri-ciri jamur berbeda dengan organisme lainnya dalam hal cara makan.Jamur merupakan kelompok organisme eukariotik yang membentuk dunia jamur atau regnum fungi. jamur menyerap zat organik dari lingkungan melalui hifa dan miseliumnya. Jamur yang hidup bersimbiosis. Dinding ini menyelubungi membran plasma dan sitoplasma hifa. berbeda dengan organisme lainnya. Miselium menyusun jalinan-jalinan semu menjadi tubuh buah. 2. Semua zat itu diperoleh dari lingkungannya. jamur tidak memangsa dan mencernakan makanan. dan senyawa kimia lainnya. adapula hifa yang tidak bersepta atau hifa senositik. contohnyojamur kayu. protein. tetapi cocok. Jamur berhabitat pada bermacammacam lingkungan dan berasosiasi dengan banyak organisme. Sebagian besar jamur saprofit mengeluar-kan enzim hidrolase pada substrat makanan untuk mendekomposisi molekul kompleks menjadi molekul sederhana sehingga mudah diserap oleh hifa. Meskipun kebanyakan hidup di darat. parasit fakultatif. mitokondria. dan reproduksinya. Saprofit Saprofit merupakan jamur pelapuk dan pengubah susunan zat organik yang mati. Hifa membentuk jaringan yang disebutmiselium. Clntuk memperoleh makanan. Sebagai makhluk heterotrof. Jamur saprofit menyerap makanannya dari organisme yang telah mati seperti kayu tumbang dan buah jatuh. Akan tetapi. dan kadangkala inti sel yang mengalir dari sel ke sel. atau saprofit. Namun. Struktur tubuh jamur tergantung pada jenisnya.

dan kebanyakan dari kelas Oomycetes. H. Torulla (koloni berwarna merah / orange). Yeast Merupakan jamur uniselluler yang berbentuk oval / lonjong dengan diameter 3 – 15 mikron. Secara makroskopik (pada media padat SGA) koloni jamur bentuk yeast tampak Smooth. (Schlegel. b. Rhizopus.G. and K. Karbon diperoleh sebagian besar dari gula heksosa.G. Coccidioides immitis. Volvariella volvacea (jamur merang) berguna sebagai bahan pangan berprotein tinggi. c. Hifa yang berada didalam media disebut Hifa Vegetatif berfungsi sebagai alat untuk menyerap makanan. H. Berbentuk Yeast jika berada di dalam inang / host atau pada suhu inkubasi 37 derajat C. Epidermophy ton. roti. yaitu dalam pembuatan tempe dan oncom. 1994) c. Yeast like merupakan jamur uniselluler yang mampu membentuk pseudohifa. Yeast ada dua yaitu : Yeast murni merupakan jamur uniselluler yang tidak mampu membentuk pseudohifa/ klamidospora. (Schlegel. Blastomyces dermatidis. Higroporus dan Lycoperdon perlatum berguna sebagai dekomposer. Rhizopus dan Mucor berguna dalam industri bahan makanan. Schmitdt. Peranan Jamur Peranan jamur dalam kehidupan manusia sangat banyak. 1991) 115 . Untuk identifikasi. Spesies ragi baik memerlukan oksigen untuk respirasi seluler aerobik (aerob obligat) atau anaerobik. Contoh: Aspergillus. MORFOLOGI Bentuk jamur secara garis besar ada 3 bentuk yaitu : a. cembung bau seperti ragi. Cryptococcus neoformans. seperti glukosa dan fruktosa. Hifa yang dibentuk ada yang bersekat maupun tak bersekat. Ragi tumbuh terbaik di lingkungan pH netral atau sedikit asam. d. Hifa yang berada di atas permukaan media disebut Hifa aerial yang berfungsi sebagai alat perkembangbiakan. tetapi juga memiliki metode aerobik dari produksi energi (fakultatif anaerob). dan berbentuk mold jika berada diluar inangnya atau pada suhu inkubasi suhu ruang. Schmitdt. a. Mucor. Microsporum. 1994) Mold / Kapang Merupakan jamur multiselluler (mempunyai inti lebih dari satu) yang membentuk benang-benang hifa / filament. (Starr. 3. Dimorfik Merupakan jamur yang mempunyai dua bentuk yaitu : Yeast dan Mold. Contoh : Histoplasma capsulatum. 1994) b. Jamur yang hidup di air biasanya bersifat parasit atau saprofit. Cecie. (Schlegel. and K. hasil mikroskopik dan makroskopik merupakan dasar identifikasi. Jamur yang menguntungkan meliputi berbagai jenis antara lain sebagai berikut. Contoh : Candida sp. Ragi adalah chemoorganotrophs. and K. Candida albicans. warna krem. e. dan bir. atau disakarida seperti sukrosa dan maltosa. Khamir Saccharomyces berguna sebagai fermentor dalam industri keju. Tidak seperti bakteri. H.ada yang hidup di air dan berasosiasi dengan organisme air. tidak ada spesies ragi diketahui bahwa tumbuh hanya anaerob (anaerob obligat). Secara makroskopik (pada media SGA) jamur yang berbentuk Mold membentuk koloni yang berserabut / granuler koloninya tampak kasar (Rought). karena mereka menggunakan senyawa organik sebagai sumber energi dan tidak membutuhkan sinar matahari untuk tumbuh. berkembang biak dengan cara membelah diri (asexual) membentuk tunas atau budding cell. baik peran yang merugikan maupun yang menguntungkan. kumpulan dari hifa disebut miselium yang membentuk suatu anyaman. Schmitdt. Trichophyton. Penicellium. Penicillium notatum berguna sebagai penghasil antibiotik.G.

Protista biasanya ditemukan di dalam air. Isogami terjadi jika antara sel betina dan sel kelamin jantan mempunyai ukuran yang sama dan sulit dibedakan. f.Di samping peranan yang menguntungkan. seperti dinding tembok kamar mandi. c. Pada kenyataannya. 1991)  Protista Protista sendiri berasal dari bahasa yunani. akan terjadi pembuahan yang menghasilkan zigot.Protista memiliki flagela atau cilia dalam hidupnya dan dapat berkembang secara aseksual atau seksual. heterotropik. dan berbentuk seperti benang-benang halus.Umumnya. dapat berupa planktonyang melayanglayang di dalam air atau melekat di dasar sungai. ada yang bersifat uniseluler dan ada yang multiseluler. Ganggang dapat hidup di air tawar dan di air laut.Secara seksual dilakukan dengan cara isogami dan oogami. Protista dapat pula hidup di dalam tanah dan di tempattempatyang lembap. menyerupai tumbuhan. Hanya dikatakan menyerupai tumbuhan karena ganggang tidak mempunyai akar. atap rumah.Ganggang dapat berbentuk benang. Karena ganggang merupakan Protista yang mengandung klorofil dan dapat berfotosintesis untuk memenuhi kebutuhan makanannya sendiri maka disebut protista mirip tumbuhan. dibandingkan dengan monera. tetapi hanya mempunyai sifat yang menyerupai hewan. atau keduanya. dan daun sejati seperti yang dimiliki oleh tumbuhan.Reproduksi ganggang dapat dilakukan secara seksual dan aseksual.. yaitu sebagai berikut. yaitu ganggang cokelat 116 . yaitumemiliki membran inti. Protista bukan merupakan hewan ataupun tumbuhan. atau koloni sel. beberapa jamur juga mempunyai peranan yang merugikan. penyebab keputihan dan sariawan pada manusia. Protista tersebut dapat melakukan fotosintesis (dapat membuat makanan sendiri).Pada kondisi yang kurang menguntungkan. (Starr. dan ksitos artinya menyusun. (Syamsuri. Nutrisi yang diperoleh dari fotosintesis Protista tersebut dapat bersifat fototropik. Protista dapat membentuk kistae. lembaran. tetapi ada pulayang hidup di tempat-tempat yang lembap. yaitu protos yang berarti pertama atau mula-mula. batu-batuan. Zigot akan terusmberkembang menjadi individu baru. berwarna hijau. Cecie. a. sertadapat pula hidup bersimbiosis dengan organisme lainnya. protista sudah jauh lebih maju karena sel-selnya sudah memiliki membran inti atau eukariota. Candida sp. Maka kingdom ini beranggotakan makhluk bersel satu atau bersel banyak yang tersusun sederhana. Dari peleburan dua sel kelamin tersebut. Albugo merupakan parasit pada tanaman pertanian. kelompok Protista yang menyerupai hewan adalah Protozoa. Meskipun begitu. Semua makhluk hidup eukariotik yang bukan merupakan hewan dan tumbuhan masuk dalam kelompok Protista. Protista bersifat aerobik dan menggunakan mitokondriauntuk respirasi. batang. Protista Menyerupai Tumbuhan (Ganggang atau Algae) Ganggang adalah Protista yang menyerupai tumbuhan. Phytium sebagai hama bibit tanaman yang menyebabkan penyakit rebah semai. ada Protista yang dapat berlaku sebagai produsen. ataupun menyerupai jamur. baik sebagai parasit maupun sebagai saprofit. b. Secara taksonomis. sedangkan kelompok Protista yang menyerupai jamur adalah jamur lendir dan jamur air.Oogami terjadi jika antara sel kelamin jantan dan sel kelamin betina mempunyai bentuk dan ukuran yang berbeda dan mudah dibedakan. Ganggang dapat dikelompokkan menurut pigmen yang dimilikinya menjadi beberapa golongan.Ganggang juga memiliki ciri lain yang sama dengan Protista. atau kulit-kulit pohon.atau danau. Pneumonia carinii menyebabkan penyakit pneumonia pada paru-paru manusia. d. e. Phythophthora inf'estan menyebabkan penyakit pada daun tanaman kentang. Saprolegnia sebagai parasit pada tubuh organisme air. antara lain sebagai berikut. laut.Protista dapat dikelompokkan menjadi tiga kelompok. 2004) A. Kelompok makhluk hidup Protista yang menyerupai tumbuhan adalah ganggang (Algae).

ganggang ini hidup di air tawar. 2006) a . Chlorophyta (ganggang hijau) merupakan plankton yang hidup melayang-layang di air tawar atau laut. ganggang hijau (Chlorophyta). sawah. (Syamsuri I & Suliestijono. seperti air kolam. Oksigen adalah gas yang dihasilkan dalam proses fotosintesis. (Syamsuri I & Suliestijono. Sel mengandung kloroplas yang berisi klorofil a. Jika kalian perhatikan dengan baik. sungai. Euglena viridis. tidak berdinding sel. air kolam. Ganggang hijau dapat berbentuk benang. Volvox sp. Selain berfotosintesis. dan sitoplasma. filamen. Ciri-ciri Chlorophyta Ganggang hijau (Chlorophyta) mempunyai ciri-ciri sebagai berikut: 1) tubuhnya mengandung klorofil dan berwarna hijau. (Syamsuri I & Suliestijono. 4) dari mulutnya muncul satu flagela (cambuk) yang berfungsi sebagai alat gerak. ganggang yang terkena cahaya matahari akan mengeluarkan gas berupa gelembung-gelembung kecil yang menempel pada pinggir-pinggir kolam. atau danau akan berwarna hijau karena adanya jenis ganggang hijau di dalamnya. Setiap sel anak mempunyai inti sel. 2) sel berbentuk oval memanjang.(Phaeophyta). Plankton disebut sebagai produsen. air danau. Dengan bantuan cahaya matahari. (Syamsuri.. ataupun air sungai. makhluk hidup ini dapat pula memasukkan bahan makanan melalui mulut sel yang dimilikinya sehingga Euglena dapat disebut sebagai organisme fotoautotrof dan organisme heterotrof. Makhluk hidup ini juga mempunyai ciri-ciri yang menyerupai hewan karena dapat bergerak aktif. Dari pembelahan ini akan dihasilkan dua sel anak. dan 5) mempunyai bintik mata yang terletak di dekat mulut sel yang berfungsi untuk membedakan antara gelap dan terang. 2004) a . ataupun berkoloni. (Syamsuri. dan berfotosintesis sehingga dimasukkan ke dalam dalam kelompok makhluk hidup yang menyerupai tumbuhan. 3) di salah satu ujungnya terdapat mulut sel. sungai. Euglena biasa hidup di air tawar. berklorofil. 2004) 1. Biasanya.b. misalnya. Filum Euglenophyta Euglenophyta merupakan ganggang bersel satu. membran sel. Spirogyra sp. ganggang merah (Rhodophyta). dan ganggang Euglenophyta. karoten dan xantofil. Filum Ganggang Hijau (Chlorophyta) Chlorophyta adalah ganggang yang mengandung klorofil dan karotin berwarna kuning sehingga warnanya menjadi hijau kekuningan. Chlorophyta dapat melakukan fotosintesis. cara memasukkan makanan melalui mulut sel. atau parit. 2006) c . Dengan bantuan cahaya matahari. gas itu adalah oksigen. antara lain. ganggang pirang (Chrysophyta). dan Ulothrix sp. Cara Euglena Memperoleh Makanan Sebagai organisme yang menyerupai tumbuhan. contohnya.. Contoh ganggang hijau. Cara Euglena Bereproduksi Reproduksi Euglena dilakukan dengan membelah diri. Makhluk hidup ini berwarna hijau. 117 . dan mempunyai bintik mata sehingga Euglena ini merupakan makhluk hidup yang menyerupai hewan dan sekaligus juga merupakan makhluk hidup yang menyerupai tumbuhan. 2006) 2. Plankton ini merupakan sumber makanan utama bagi hewan-hewan yang hidup di dalamnya. Euglena dapat membuat makanan sendiri dengan melakukan fotosintesis. Bagaimana kalian tahu jika Chlorophyta sedang melakukan fotosintesis? Amati dan perhatikan kolam ikan air tawar pada siang hari. 2006) b . Ciri-Ciri Euglena Euglena mempunyai ciri-ciri sebagai berikut: 1) berwarna hijau karena mengandung klorofil. Air kolam. makhluk hidup ini dapat mengubah klorofil menjadi energi. (Syamsuri I & Suliestijono.

Bintik mata dan pirenoid terletak di dalam mangkuk yang berfungsi sebagai tempat pembentukan zat tepung. sedangkan secara seksual dengan konjugasi. Chlorella dapat dimanfaatkan sebagai obat. Alat gerak berupa dua flagel. 3) Spirogyra dan Oedogonium adalah sel yang membentuk benang atau untaian memanjang seperti benang dan bersifat mikroskopis. 118 . berkembang biak secara aseksual dengan spora yang menghasilkan Ulva haploi (n). Selnya berbentuk bulat telur. Chlamydomonas dapat berkembang biak dengan dua cara. Di perairan tersebut. mempunyai ruas-ruas yang mengandung nukula dan globula. Hasil peleburan tersebut adalah zigot yang dapat tumbuh menjadi individu baru. dan hidup sebagai zoospora pada Chlorococcum hingga terbentuk satu sel dewasa. Reproduksi seksual dilakukan dengan cara peleburan sel kelamin jantan dan betina serta ada juga yang secara konjugasi. Ulva haploid (n) akan berkembang biak secara seksual menghasilkan Ulva diploid (2n). Ulva adalah ganggang yang hidup di air laut. Spirogyra mempunyai sel yang mengandung kloroplas berbentuk pita spiral dan dalam satu sel mengandung satu inti. memiliki kromosom diploid (2n). Oedogonium mempunyai kloroplas berbentuk jala dan dalam satu sel mengandung satu inti serta dapat berkembang biak dengan zoospora dan peleburan spermatozoid (anteridium) dengan ovum (oogonium) yang dihasilkan oleh benang yang berbeda. 5) cadangan makanan disimpan di suatu rongga yang berbentuk bulat. ganggang hijau disebut sebagai produsen. Globula mengandung anteridium penghasil spermatozoid. Reproduksi secara aseksual dilakukan dengan fragmentasi. Chlorella dapat berkembang biak dengan pembelahan sel. bahkan sekarang sedang dikembangkan untuk obat yang dikemas dalam bentuk kapsul. Banyak terdapat di air tawar dan bentuk koloninya seperti jala. 4) telah memiliki dinding sel. 4) Chara dan Ulva merupakan Chlorophyta yang berbentuk lembaran. Rongga ini terletak di dekat kloroplas yang disebut pirenoid. (Syamsuri. Pembuahan ovum oleh spermatozoid akan menghasilkan zigospora yang selanjutnya akan berkembang menjadi individu baru. dan berkoloni. (Syamsuri. 2004) b . Cara Mendapatkan Makanan Ganggang hijau mengandung klorofil dan dapat melakukan fotosintesis untuk mendapatkan makanannya. yaitu secara seksual dan secara aseksual. 2004) c . lembaran. merupakan salah satu kelompok plankton air tawar. 3) merupakan makhluk hidup bersel satu yang berbentuk benang. Kloroplasnya berbentuk mangkuk. berukuran mikroskopis. Contoh-Contoh Chlorophyta Beberapa contoh ganggang hijau yang sering dijumpai adalah sebagai berikut : 1) Chlorococcum dan Chlorella merupakan Chlorophyta bersel satu yang tidak dapat bergerak dan bersifat mikroskopis. 5) Hydrodictyon merupakan Chlorophyta yang berbentuk koloni tak bergerak. fragmentasi (ganggang berbentuk benang dan berkoloni). Ganggang hijau berperan sebagai pemasok bahan makanan utama bagi hewan-hewan yang ada di perairan tersebut. serta pembentukan zoospora (spora kembara). yaitu dengan pembentukan zoosprora dan konjugasi. dapat berkembang biak secara fragmentasi dan konjugasi. Nukula mengandung arkegonium penghasil ovum. Reproduksi secara aseksual dilakukan tanpaadanya peleburan sel jantan dan betina. dan kloroplas. Kloroplas berbentuk mangkuk. satu vakuola. Cara Chlorophyta Bereproduksi Reproduksi Chlorophyta dapat dilakukan dengan dua cara. 2) Chlamydomonas merupakan Chlorophyta bersel satu yang dapat bergerak dan bersifat mikroskopis. Chlorococcum dan Chlorella dapat berkembang biak secara aseksual dengan membentuk zoospora yang bergerak dengan dua flagella.2) hidup melayang-layang di air tawar atau air laut. Berkembang biak secara aseksual dengan spora dan fragmentasi. (Syamsuri. Chara merupakan ganggang yang hidup di air tawar. Spirogyra dan Oedogonium banyak hidup di air tawar. Sel Chlamydomonas mengandung satu inti. 2004) d . tetapi dilakukan dengan pembelahan biner (ganggang bersel satu).

obat-obatan. Pinnularia sp. Selanjutnya. Contoh ganggang ini adalah Diatom. (Prawirohartono. dapat bergerak aktif. Filum Ganggang Api (Pyrrhophyta) Ganggang api sering disebut dengan Dinoflagelata. bercabang tidak bersekat. Euchema spinosum dan Gellidium yang digunakan manusia untuk bahan agar-agar. Dinding sel Diatom mengandung zat kersik sehingga ganggang pirang sering disebut juga ganggang kersik. Ganggang cokelat berkembang biak secara aseksual dengan fragmentasi. Filum Ganggang Pirang atau Keemasan (Chrysophyta) Chrysophyta ada yang berwarna kuning kecokelatan. juga mengandung zat warna merah (fikoeritrin). bersel satu (Ochromonas). Vaucheria yang mempunyai ciri berbentuk seperti benang. zigot akan tumbuh menjadi individu baru. antara lain. serta pengelmusi lemak dan cokelat batangan. 2004) 4. pengeras es krim.000 buah. sedangkan secara seksual dengan konjugasi. secara seksual dengan peleburan sperma dan ovum yang menghasilkan zigot. dan berkoloni (Synura). berklorofil. Berkembang biak secara seksual dengan peleburan sperma dan ovum yang menghasilkan zigot. hijau kekuningan. Pembuahan sperma dan ovum menghasilkan zigot.6) Volvox merupakan Chlorophyta yang berbentuk koloni dan bergerak. dan bersifat mikroskopis. Contohnya. sebagai bahan penggosok dan bahan isolasi. 2004) B. Reproduksi aseksual dilakukan dengan cara membelah diri. (Syamsuri. Contohnya adalah Peridinium. Volvox hidup di air tawar dan tiap sel mempunyai dua flagel dan stigma. bersel banyak. dan benang berinti banyak (senosit). Cyclotella. Chrysophyta yang disebut diatom (Bacillariophyceae) berbentuk seperti kotak yang saling menutupi dan dapat hidup di tempat yang basah. dan kuning keemasan (diatom). batang. memiliki bentuk seperti rumput maka sering disebut rumput laut (sea weed) dan bersel banyak (berbentuk seperti lembaran). mempunyai tubuh yang multiseluler.dan bahan cat. dinding sel berupa lempengan selulosa yang rapat. di luar sel terdapat celah dan alur yang masing-masing dilengkapi dengan satu flagel. Chrysophyta ada yang bersel satu. Chrysophyta merupakan penyusun plankton yang terbesar. maupun air laut. Contoh ganggang cokelat adalah Fucus. (Syamsuri. Ganggang ini hidup di air laut. sedangkan secara seksual dilakukan dengan cara pembentukan konseptakel jantan yang mengandung anteridium penghasil spermatozoid dan konseptakel betina yang mengandung oogonium penghasil ovum. serta sering digunakan sebagai bahan pakan ternak. Ganggang merah dapat dimanfaatkan oleh manusia sebagai bahan makanan dan kosmetika. Zat kersik ini sangat berguna bagi industri. kosmetik. air payau. obat. Selain untuk bahan makanan. pelapis daging kaleng. Chrysophyta kuning kecokelatan (Chrysophyceae) mengandung klorofil dan karoten (pigmen keemasan). berbentuk seperti lembaran atau tumbuhan tinggi (memiliki alat. bentuk koloni seperti bola dengan jumlah sel 500 – 50. Filum Ganggang Merah (Rhodophyta) Ganggang merah merupakan makhluk hidup bersel banyak. 2004) 3. dan Sargasum. dan daun). Sebagian besar hidup di laut dan ada juga yang hidup di air tawar. Ganggang ini hidup di laut. 2004) 6. seperti akar. dan berkembang biak dengan cara membelah diri. Chrysophyta hijau kekuningan (Xanthophyceae) mengandung klorofil dan pigmen kuning (xentofil). Ganggang ini mempunyai ciri tubuhnya bersel satu. Reproduksi aseksual dilakukan dengan membentuk zoospora. bersel banyak. agar-agar juga dimanfaatkan sebagai medium kultur mikroorganisme. baik air tawar. mengandung pigmen kuning kecokelatan. Protista yang Menyerupai Hewan (Protozoa) 119 . Tulbilaria. (Syamsuri. Navicula. Berwarna merah tua karena selain mengandung klorofil. (Syamsuri. Contoh ganggang merah yang digunakan sebagai bahan makanan. misalnya. dan Pinnularia.Laminaria. Reproduksi secara aseksual dilakukan dengan cara fragmentasi. 2003) 3. Filum Ganggang Cokelat (Phaeophyta) Ganggang cokelat berwarna cokelat karena selain mengandung klorofil juga memiliki zat warna cokelat (fukosantin).

mungkin tidak ditutup. Flagellata merupakan nenek moyang dari hewan dan tumbuhan.Bersatunya kedua ujung membran plasma membentuk vakuola. dan Sporozoa (penghasil spora). dan penangkap rangsang yang berasal dari luar tubuhnya. Flagellata dapat hidup bebas di dalam air atau sebagai parasit pada makhluk hidup lain. Mula-mula kaki semu (pseudopoda) dijulurkan ke arah makanan lalu mengelilingi makanan tersebut. dan mengandung makanan. bahkan dapat mencapai hati. membran plasma bergerak mendekati dan mengikuti kaki semu mengelilingi makanan. Selain Amoeba. Makanan dicerna di dalam vakuola makanan. Akan tetapi. Flagellata atau Mastigophora (bercambuk). Actinopoda. Segala aktivitas hidup terjadi di dalam sel itu sendiri. Entamoeba hystolytica masuk ke dalam usus melalui makanan yang tidak higienis. dan waduk). berparasit dalam usus manusia. gosoklah gigi setelah selesai makan dan sebelum tidur. dan di dalam tubuh makhluk hidup lain atau di dalam jasad yang mati. Pada keadaan yang tidak menguntungkan. pertukaran gas. Ciliata (berambut getar). Misalnya. Dengan kaki semunya. hindarilah memakan makanan yang tidak bersih dan tidak ditutup. Selain Entamoeba histolytica. Foraminifera. Pembelahan dimulai dari membelahnya inti sel menjadi dua. dan seterusnya. Ada Amoeba yang dapat hidup bebas dan ada pula yang hidup sebagai parasit pada hewan atau manusia. yaitu Rhizopoda atau Sarcodina (berkaki semu). atau dihinggapi lalat. Amoeba dapat menangkap dan mengambil makanan. (Syamsuri. Sisa makanan yang berupa cairan dikeluarkan melalui vakuola berdenyut. Untuk mencegah diare. dan sebuah inti sel. Keduanya merupakan Rhizopoda yang diselimuti oleh cangkang. ada beberapa Protozoa yang termasuk dalam Rhizopoda. enam belas sel. pengeluaran. Kelompok Flagellata atau Mastigophora (Bercambuk) Flagellata adalah Protozoa yang mempunyai alat gerak berupa bulu cambuk (flagela). Trypanosoma gambiense dan 120 . Sel berisi sitoplasma yang terdiri dari sitoplasma bagian luar yang kental (ektoplasma). terkena debu. Penyakit yang disebabkan oleh Entamoeba histolytica adalah diare. alat gerak. rendaman jerami. berair. Jika keadaan luar telah membaik. sitoplasma bagian dalam yang encer (endoplasma). Protozoa dibagi menjadi enam filum.Protozoa merupakan makhluk hidup yang menyerupai hewan. lalu diikuti oleh pembelahan sitoplasma. Protozoa dapat membentuk dirinya menjadi kista. 2004) 1. Rhizopoda atau Sarcodina (Berkaki Semu) Rhizopoda adalah Protozoa yang mempunyai alat gerak berupa kaki semu (pseudopodia). Amoeba yang hidup sebagai parasit ini biasa disebut dengan Entamoeba. Dari sini. air laut. (Syamsuri. seperti Trypanosoma dan Trichomonas. seperti Entamoeba histolytica. Amoeba dapat membentuk dirinya menjadi kista. sari makanan diedarkan ke seluruh tubuh. Ia bersel satu dan hidup bebas di tempattempat yang becek. Kedua sel anak ini akan mengalami pembelahan biner sehingga menjadi empat sel. Entamoeba ginggivalis ini dapat hidup di sela-sela gigi yang kotor. kista Amoeba akan pecah dan Amoeba akan keluar untuk memulai kembali hidupnya. permukaan tanah yang lembap. Entamoeba yang menyebabkan penyakit. Protozoa merupakan makhluk hidup bersel satu yang bersifat mikroskopis. Pembelahan inti tersebut menimbulkan lekukan yang sangat dalam yang lama-lama akan putus sehingga terjadilah dua sel anak Amoeba. kista Amoeba mungkin saja tertinggal di dalam tubuh. Amoeba Bentuk tubuh Amoeba dapat berubah-ubah. delapan sel. Protozoa dapat berkembang biak dengan cara aseksual dan seksual. yaitu Foraminifera dan Arcella. sungai. Kemudian. Salah satu contoh Rhizopoda adalah Amoeba sp. Agar tidak sampai terserang. ada Entamoeba ginggivalis yang hidup sebagai parasit di dalam rongga mulut yang dapat menyebabkan penyakit radang dan gusi berdarah. yang dibahas dalam bab ini hanya empat filum. Protozoa hidup di air tawar (selokan. 2004) 2. yaitu sebagai berikut. secara aseksual dilakukan dengan membelah diri dan secara seksual dengan konjugasi. Pada keadaan tertentu. Isi sel telah dilindungi oleh membran sel dan membran plasma yang sekaligus berfungsi sebagai pengatur pertukaran zat. Amoeba dapat berkembang biak dengan pembelahan biner tanpa melalui tahap-tahap mitosis. Kita harus berhati-hati terhadap penyakit ini karena meskipun sudah sembuh. parit.

Didinium (hidup di perairan yang mengandung Protozoa). Sel berisi dua inti sel yang terdiri atas inti kecil (mikronukleus) dan inti besar (makronukleus). Contoh lainnya adalah Babesia dan Theileria. Mereka biasa hidup di rawa. tetapi tidak dapat dikelompokkan dalam kingdom Fungi karena gerakan pada fase aseksualnya lebih mirip dengan Amoeba. Protista Menyerupai Jamur Protista yang menyerupai jamur ini mempunyai struktur tubuh dan cara reproduksi yang tidak sama dengan kelompok Fungi. terjadilah aliran keluar masuk air pada mulut sel. Kelompok Ciliata (Berambut Getar) Ciliata adalah Protozoa yang mempunyai alat gerak berupa rambut getar (cilia). Penularan malaria terjadi melalui gigitan nyamuk Anopheles betina. 2004) C. Rambut getar ini adalah bulu-bulu halus yang melekat pada membran sel. (Syamsuri. dan tempat-tempat berair yang banyak mengandung bahan organik. 2004) 4. (Syamsuri. lalat juga mengeluarkan air liur yang mengandung Trypanosoma untuk mencegah pembekuan darah. yaitu Stylonichia (hidup di perairan yang banyak mengandung sampah organik). Penyerapan sari makanan terjadi di dalam sitoplasma. sitoplasma. Makanan yang terkumpul akan masuk dalam sitofaring (kerongkongan sel) lalu masuk ke dalam vakuola makanan untuk dicerna dan diedarkan ke seluruh tubuhnya. Contoh makhluk hidup yang termasuk dalam Sporozoa adalah Plasmodium malariae dan Plasmodium vivax. 121 . hidupnya menumpang di usus kecoa. (Syamsuri. Pada Trichomonas terdapat tiga flagel atau lebih. Gerakan cilia sulit diamati oleh mikroskop karena gerakannya sangat cepat. vakuola makanan (pencerna makanan). Trichomonas vaginalis yang menyerang vagina dapat menyebabkan keputihan. Dengan menggunakan rambut getar. tidak berubah-ubah. Konjugasi didahului dengan pertukaran inti antara dua individu lalu berpisah dan masing-masing membelah menjadi dua individu. Paramaecium caudatum Paramaecium caudatum adalah Ciliata yang hidup bebas. Makanannya adalah sel darah merah. Paramaecium caudatum dapat berkembang biak secara aseksual dengan membelah diri menjadi dua anak sel (pembelahan biner) dan secara seksual dengan konjugasi.. dan Vorticella. T. Ciliata mendapatkan makanan dengan mulut sel. Babesia bigemina menyebabkan penyakit demam Texas dan Theileria parva menyebabkan penyakit demam Pantai Timur (Afrika). mempunyai sitostom (celah mulut) pada membran plasma. sawah. Ciliata. Bentuk selnya seperti sandal. Contoh Ciliata yang hidup bebas adalah Paramaecium sp. ukuran kira-kira 250 mikron. Ketika lalat menggigit. T. makhluk hidup dapat bergerak bebas ke segala arah di dalam air. sedangkan yang hidup berparasit adalah Nyctoterus ovalis. Gerakan Paramaecium caudatum dilakukan dengan menggetarkan cilianya. Cara reproduksi jamur lendir hampir sama dengan Fungi.Trypanosoma rhodiense menyebabkan penyakit tidur yang disebarkan oleh gigitan lalat Tse-tse. Evansi merupakan penyebab penyakit sura pada hewan. dan selnya diselubungi oleh pelikel. dan Flagellata yang telah mempunyai alat gerak. Pada saat bergetar. Ada juga Ciliata yang hidup di air tawar. sedangkan sisa makanan berupa cairan dikeluarkan melalui vakuola berdenyut yang terletak di kedua ujungnya. serta vakuola kontraktil (pengeluaran zat sisa). Stentor (hidup di perairan sawah yang mengandung bahan organik). Plasmodium berkembang biak secara aseksual dengan pembentukan spora terjadi di dalam tubuh manusia dan berkembang biak secara seksual dengan pembentukan gamet. cruzi merupakan penyebab penyakit nagana pada sapi dan kerbau. rambut di sekitar mulut sel akan bergetar pula. Peleburan gamet jantan dan gamet betina terjadi di dalam tubuh nyamuk Anopheles. Pada saat ini. Kelompok Sporozoa (Penghasil Spora) Tidak seperti Rhizopoda. Sporozoa tidak memiliki alat gerak. Sisa makanan padat dikeluarkan melalui membran plasma. Bentuk tubuh Ciliata adalah oval. 2004) 3. Air yang masuk dan keluar mulut sel banyak mengandung bakteri atau bahan organik atau bahan makanan lainnya yang tertambat atau terkumpul di dalam mulut sel. Plasmodium hidup sebagai parasit pada tubuh manusia yang menyebabkan penyakit malaria. Sporozoa hidup sebagai parasit pada makhluk hidup lain.

biasa hidup di hutan-hutan basah. bersel satu atau bersel banyak. 1982) a. (Timotius. dan Pythium. Zoospora ini dilengkapi dengan alat berenang berupa dua buah flagel. Jamur yang hidup secara parasit. c. Jamur lendir hidup di batang kayu yang membusuk. H. Jamur lendir dapat berkembang biak dengan cara vegetatif dan generatif. Pada tingkat dewasa. P. tanah lembap. b. (Prawirohartono. berbentuk seperti lendir (plasmodium). K. batang kayu yang membusuk. atau sampah basah. e. spora yang tertinggal akan membentuk Amoeba baru dan siklus akan berulang. 1982) b. Fase vegetatif Plasmodium bergerak amoeboid mengelilingi dan menelan makanan berupa bahan organik. 2003) Jamur lendir (Mycomycota) dibedakan menjadi dua tipe. 2003) 2. Phytophthora adalah jamur karat putih yang dapat hidup secara saprofit atau parasit. b. dan dapat bergerak bebas. Makanan dicerna dalam vakuola makanan. tetapi cara berkembang biaknya menyerupai Fungi. sampah basah. Saprholegnia mempunyai miselium dan hifa sebagai alat reproduksi. Contoh Oomycota adalah Phytophthora. hanya saja tidak mengandung klorofil. tanah lembap. Plasmodium akan bergerak ke arah cahaya. berkembang biak secara aseksual dan seksual. (Timotius. Saphrolegnia. Pada saat ada makanan. Jamur ini merupakan saprofit pada hewan air yang telah mati. dan c. Filum Jamur Air (Oomycota) Oomycota dapat hidup di air atau tempat-tempat lembap dan mempunyai oospora sebagai penghasil spora. Myxomycota (Jamur Lendir Tidak Bersekat) Myxomycota merupakan jamur lendir yang tidak bersekat. Spora yang berkecambah akan membentuk sel gamet yang menyerupai Amoeba. (Prawirohartono.Semetara itu. Jamur ini berinti banyak. P. Spora yang dihasilkan oleh zigot berdinding tebal yang berfungsi sebagai pelindung. infestans (kentang). (Prawirohartono. Plasmodium akan membentuk kotak spora seperti pada Fungi. bersifat uniseluler ataupun multiseluler. kayu lapuk. Jamur ini memiliki ciriciri sebagai berikut: a. dan P. Nicotin (tembakau). jamur air lebih menyerupai ganggang pada struktur molekulnya. Sporangium yang masak 122 . Sel-sel gamet ini bersifat haploid dan akan melakukan singami atau peleburan dua gamet dengan ukuran yang sama dan tidak dapat dibedakan antara sel jantan dan betina yang akan menghasilkan zigot. misalnya. Sisa yang tidak dicerna ditinggal sewaktu plasmodium bergerak. K. Setelah matang. bentuk tubuh seperti lendir (plasmodium) yang merupakan massa protoplasma tidak berdinding. setiap intinya tidak dipisahkan oleh adanya sekat. Jika telah dewasa. Pada saat Plasmodium membesar dan inti sel membelah sel individu tetap terpisah saat bergabung membentuk pseudoplasmodium. . kotak spora ini akan pecah dan mengeluarkan spora. palmifera (kelapa). 2003) 1. Pada saat kondisi menguntungkan. Pada kondisi tertentu. struktur tubuh vegetatif menyerupai Amoeba. yaitu Acrasiomycota dan Myxomycota. dinding sel berupa selulosa. Jamur ini dikatakan mempunyai spora kembara dimorf. Plasmodium membentuk sporangium (kotak spora). berkembang biak secara aseksual dengan pembentukan zoospora. spora akan tumbuh menjadi hifa baru. kayu lapuk. Acrasiomycota (Jamur Lendir Bersekat) Acrasiomycota dinamakan juga jamur lendir bersekat. Plasmodium akan berhenti bergerak dan membentuk tubuhnya yang mengandung spora reproduksi. H. Saat makanan berkurang zat kimia yang dikeluarkan oleh Amoeba akan bergabung membentuk Plasmodium. d. berinti banyak. Filum Jamur Lendir (Mycomycota) Ciri-ciri jamur lendir adalah sebagai berikut: a. Pencernaan makanan yang dilakukan pada fase vegetatif (aseksual) dilakukan menyerupai Amoeba. mempunyai banyak inti yang terdapat dalam benang-benang hifa yang tidak bersekat. dan di hutan basah.

(waites. mengacu pada kuantitas pertumbuhan besar sel aerobik atau anaerobik. di daun. sel-sel individu tetap terpisah saat mereka bergabung membentuk pseudoplasmodium atau massa multiseluler. Jenis – Jenis Fermentor 123 .akan pecah dan spora tersebar dengan bantuan angin. Meskipun media dalam bentuk padat sering digunakan tetapi kebanyakan fermentasi menggunakan media cair. transfer oksigen.2001) Alat yang biasa digunakan adalah fermentor (bioreactor) yaitu suatu unit alat yang digunakan untuk melangsungkan proses biokimia dari suatu bahan baku menjadi produk yang diinginkan. Sistem fermentasi ini mungkin terlihat mudah tetapi dalam kenyataanya fermentasi menggunakan nutrisi dan oksigen bisa dikembangkan. Pertama dalam metabolisme. Myxomycota yang sedang bergerak dapat seukuran buah anggur. Spora yang berkecambah akan membentuk sel gamet yang bersifat haploid.2001) Pada penundaan pertumbuhan mikroorganisme. Fermentor yang digunakan berdasarkan kapasitasnya dibagi menjadi dua. (waites.tetapi tidak dapat dibagi menjadi beberapa sel-sel terpisah. Sebaliknya. Hasil peleburan berupa zigot dan zigot tumbuh dewasa. massa berinti banyak yang disebut Plasmodium (jangan dikacaukan dengan plasmodium penyebab malaria). bergerakberpindah tempat di tanah atau sepanjang dasar hutan. Fermentor merupakan system tertutup untuk reaksi biologis dari proses bioteknologi. 1982) FERMENTATION SYSTEMS Fermentasi pada mikrobiologi memilki dua arti yang berbeda. yaitu skala laboratorium dan skala industry. Pada Myxomycota. Saat Plasmodium membesar. . dimana yang penting untuk banyak proses fermentasi yang ingin dilakukan. intinya membelah. yaitu pada sel vegetatif dan spora. (Timotius. DESAIN DAN KONSTRUKSI FERMENTOR Fermentor kebanyakan didesain untuk menjaga konsentrasi biomass tetap tinggi. yaitu laju agitasi. Dalam skala laboratorium digunakan dalam botol erlenmeyer (volume 50-2000 ml dengan pengisian maksimum 20 %). dalam sebuah alat biasanya sebagai fermentor atau bioreaktor. kontrol apa yang akan dilakukan bergantung pada proses tertentu. K. dimana prosesnya dilakukan oleh enzim-enzim dalam mikroba atau enzim murni yang diisolasi. Plasmodium mempunyai banyak inti. Singami adalah peleburan dua gamet yang bentuk dan ukurannya sama (yang tidak dapat dibedakan jantan dan betinanya). Fermentasi juga diklasifikasikan sebagai proses dalam fasa biologi. dan objek yang lebih spesifik untuk dihasilkan. dalam konteks industrial mikrobiologi. dan bahan baku.  Bioreaktor sebaiknya memiliki instrumentasi untuk pemeriksaan agar terjadi pengawasan proses optimum.2001) Fungsi utama bioreaktor adalah memberikan lingkungan terkontrol bagi pertumbuhan mikroorganisme atau campuran tertentu mikroorganisme untuk memperoleh produk yang diinginkan. pH. Selain dari penggunaannya untuk budidaya sel. pada Acrasiomycota.  Bioreaktor hendaknya mencegah kontaminasi produksi dari lingkungan pada kultur sambil mencegah pelepasan kultur ke lingkungan. kemudian sel gamet ini melakukan singami. kayubusuk untuk memakan bakteri. Kedua. (waites. sel – sel yang ada berpencar dengan bebas dalam media dan berinteraksi sebagai bentuk tersendiri. Pada fermentor ada parameter yang harus dikontrol. fermentasi mengacu pada energi yang menghasilkan senyawa organik di mana bertindak sebagai pendonor elektron dan akseptor. H. suhu.

Bioreaktor tangki adukan ( stirres tank bioreactor) 2. mamalia. Merupakan reaktor kolom di mana percampuran dan sirkulasi diinduksi dengan alat-alat tertentu. Bioreaktor kolom gelembung (Bubble column bioreactor) udara dialirkan melalui sparger di dasar bejana. PERANCANGAN FERMENTOR Rancangan dan kontroksi bioreaktor perlu diperhatikan tentang bejana harus dapat dioperasikan dalam jangka waktu lama. Jet loop reactor . Bubble column bioreactor. Kinetika pertumbuhan sel dan pembentukan produk. Bioreaktor dengan pancaran udara (Airlift bioreactor) terdiri dari dua kolum yang dimasukkan ke dalam kolum yang lain.Menurut Pujaningsih (2005). fermentor ini dikelompokkan atas tiga jenis: a. (waites. Air lift loop reactor . Berdasarkan proses penyebaran organisme dan media dalam bejana mengelompokkan jenis fermentor ke dalam 3 grup : 1. 3. Karakteristik hidrodinamik bioreaktor. Bioreaktor terkemas padat diisi dengan bahan padatan yang dapat menjaring mikrobia masuk kedalamnya. Karakteristik stabilitas genetis dr sistem sel Desain peralatan yg aseptis Pengawasan lingkungan bioreaktor (makro dan mikro) Implikasi desain bioreaktor pada pemisahan produk menghilir Modal dan biaya operasi bioreactor Potensi pengembangan desain bioreactor 124 . Udara dipaksa masuk melewati pipa sehingga udara dapat terpancar keatas dan medium ikut terbawa. Pro peller‟loop reactor. pH dan penambahan nutrien. sistem kontrol suhu. Merupakan bioreaktor paling sederhana. Terdiri dari tabung panjang dengan beberapa sparger di bagian dasarnya. Merupakan biorekator yang paling lazim digunakan di berbagai industri fermentasi. c. 2. Loop reactor. bahan kontruksi murah dan evaporasi diusahakan tidak terlalu besar. bejana harus dapat dicuci dan disterilisasi fasilitas sampling harus ada konsumsi tenaga serendah mungkin. Reaktor dengan agitasi internal.Kriteria Dasar Dalam Desain Bioreaktor:           Karakteristik mikrobiologi dan biokimia dr sistem sel (mikrobia.2001) A. Grup ini termasuk stirred tank reactor. 3. macam-macam reactor adalah sebagai berikut : 1. serasi dan afitasi memadai untuk kelangsungan proses metabolik mirkobia. Berdasarkan penggunaan alat tersebut. Menurut Andhiko (2008). Karakteristik massa dan panas bioreaktor. tumbuhan). b.

Bahan fermentor harus tidak beracun & tidak mudah terlarut.B. Fermentor aerobik memerlukan alat untuk mengaduk dan memberikan aerasi cukup. Aerasi dan agitasi cukup memadai untuk kelangsungan proses metabolik mikrobia.  Tekanan dalam fermentor harus tetap positif sehingga kalau ada kebocoran akan mengarah ke luar. Apapun yang keluar ataupun masuk pada proses 125 . C. Sistem stirer dari fermenter & lubang pemasukannya cukup. pH harus ada. E. Evaporasi diusahakan tidak terlalu besar.  Hindari ruang-ruang perangkap serta bentuk leher. tertutup di bagian atas atau bawah. dan memungkinkan kontaminasi. sehingga tidak mengalami stress mekanik akibat terlampau rapat. shg tdk menghambat pertumbuhan mikroba. Fasilitas untuk sampling harus ada. Konstruksi Fermentor.  Gunakan katup-katup yang mudah dibersihkan maupun disterilkan.  Setiap hubungan/kelep ke bejana harus dapat disterilkan dengan uap. dilengkapi pipa-pipa. Sistim kontrol temperatur. Syarat Fermentor adalah sebagai berikut :  Tidak boleh ada hubungan antara bagian sistem yang steril dengan non-steril.  Dikonstruksi dari bahan yang murah. mempunyai geometri yang sama baik untuk laboratorium maupun skala industri.  Bila mungkin seluruh konstruksi alat dilas. Desain Bioreaktor Harus Memperhatikan Beberapa Hal Yaitu :        Bejana dapat dioperasikan dalam keadaan aseptis untuk jangka waktu lama. KONTROL KIMIA DAN KONDISI FISIK Konsep dasar dari Bioreaktor adalah untuk pemisahan.  Semua bagian sistem harus dapat disterilisasi secara tersendiri. Berupa silinder besar.     Fermentor anaerobik memerlukan alat khusus kecuali untuk menghilangkan panas. Karakteristik Fermenter. Konstruksi fermentor aerobic Tebuat dari baja anti karat.     Bahan fermentor dibuat tahan karat untuk mencegah kontaminasi logam/ion selama proses. dengan menggunakan pembatas antara lingkungan dalam fermentasi dengan lingkungan luar. Konsumsi tenaga serendah mungkin. misalnya katup bola atau diafragma. karena ruangan seperti itu sulit untuk dibersihkan.  Pemeriksaan secara visual dari medium & kultur hrs tersedia. D. Bejana harus dapat dicuci. dibersihkan dan mudah dipelihara. dibuat dari bahan transparan. Bahan fermentor harus kuat utk sterilisasi berulang kali pd tekanan uap tinggi. karena bentuk demikian dapat mengendur akibat dari gerakan/fibrasi alat dan kenaikan suhu.  Hindari kelep-kelep / penghubung bentuk gelangan.

konsentrasi. dan input yang lebih jauh berguna untuk fermentasi.2001) Agitasi fermentor membutuhkan input energi dan ada 3 prinsip mekanisme yang biasanya digunakan. Pada fermentasi ada bagian yang intensif. Sistem ini harus menyediakan alat analitik yang baik. . Dengan informasi yang didapat dapat digunakan untuk perhitungan matematik dan pemodelan pada computer yang kemungkinan bisa digunakan pada computer dan kontrol fermentasi selanjutnya. 1. . entropi dan energy dapat diseimbangkan.Agitasi memperkecil tebal lapisan film pada permukaan antar fase gas dan cairan karena sifat alir fluida yang menjadi tubulen. Pada fasa cair terkandung larutan nutrisi dan metabolit. apalagi ketika digabungkan dengan penetapan pada termodinamik ( perpindahan panas. Proses pencampuran seharusnya terjadi pada kondisi produksi secara homogen dan meningkatkan fungsi nutrisi. hasilnya didapatkan air dengan temperature (bagian intensif) adalah 30ºC dan bukan 60ºC. 126 . tekanan dan panas yang tepat. dan semuanya dikalkulasi pada akhir proses. Agitasi sangat membantu proses transfer oksigen di dalam fermentor dengan cara sebagai berikut: .Agitasi menyebabkan ukuran gelembung udara menjadi lebih kecil sehingga luas permukaan untuk terjadinya transfer oksigen menjadi lebih besar. Perubahan fasa dari gas menjadi fasa cair meningkat dengan agitasi. (waites. Beberapa upaya telah dilakukan untuk mencari hubungan-hubungan antara konsumsi tenaga yang diperlukan dengan KLa. gas dan perpindahan panas.Agitasi mencegah bergabungnya kembali gelembung-gelembung udara yang sudah ada. Normalnya pelat baffle dipasang 4 -6 buah pada dinding wadah untuk membantu proses pencampuran dan perpindahan panas secara turbulen. sehingga dengan hubungan-hubungan yang diperoleh tersebut dapat digunakan untuk memperkirakan tenaga yang dibutuhkan dalam desain dan scale-up. tetapi berat dari air (bagian extrinsif) adalah additive pada 45 gr. volum. Contohnya jika 10gr air dengan suhu 30ºC ditambahkan pada 35 gr air dengan suhu 30ºC.(waites. (waites.fermentasi dapat dimonitor.2001) Tingkat agitasi mempunyai pengaruh yang nyata terhadap efisiensi transfer oksigen di dalam fermentasi dengan pengadukan mekanik. Baffle selalu berupa pelat datar dipasang secara vertical dengan ketebalan 1 -10 diameter.2001) Kunci pada bagian exrinsif adalah adalah pada energy dan massa. hal ini diakibatkan karena jumlah atom karbon.2001) Agitasi Agitasi pada fermentasi sel tersuspensi adalah proses yang dilakukan dengan keinginan untuk mencampur 3 fasa yang berbeda dengan menggunakan fermentor. Bagian ini memiliki jumlah tersendiri pada system fermentasi. . Perpindahan panas sangat diperlukan pada proses sterilisasi dan penjagaan temperatur selama operasi terjadi. Pada fasa gas di dominasi oleh oksigen dan karbon dioksida. karena sebagai mikroorganisme hanya dapat mengambil oksigen pada saat fasa cair. agar tidak terjadi formasi vortex dan mengurangi “dead space”. rheologi dan temperature) dan laju reaksi (produksi biomass). (waites. Pencampuran yang efisien sangat penting untuk perpindahan oksigen pada fermentasi aerob. densitas. oksigen dan energi yang ada di sistem pada saat awal operasi. Stirred Tank Reactors(STRs) STRs secara mekanis menggerakkan agitator atau impeller dalam sebuah wadah silinder baffle.Agitasi menyebabkan waktu tinggal gelembung udara di medium menjadi lebih lama. Fasa padat dibuat oleh sel dan kemungkinan terdapat substrat padat. yaitu temperature. nitrogen. Ada bagian extrinsif seperti massa. Tingkat agitasi dapat diukur berdasarkan tenaga yang dikonsumsi oleh motor yang menggerakkannya.

Untuk menghindari adanya kontaminasi. Keefektifan dari agitasi tergantung pada desain dari pisau impeller.Tidak ada tindakan geser .(waites. impeller dipasang pada motor external dimana sebagai pengendali pada sistem pengadukan.Pada wadah. Pada perakitan agitator yang juga terdapat sebuah pelindung.Metode kompak konstruksi 127 .2001) Keuntungan: . Sebagai contohnya. Dalam hal ini. tetapi ini juga menghasilkan kekuatan potong yang besar yang dapat merusak beberapa sel. yang secara signifikan meningkatkan sirkulasi di dalam reaktor dengan mengorganisir konsentrasi oksigen terlarut dan substrat yang dapat disesuaikan sepanjang silinder gerakan agar tidak mengganggu pertumbuhan mikroba karena oksigen tidak mencukupi dan kelebihan gula. STRs harus dibuat pada turbulen yang tinggi untuk menjaga kecepatan dari perpindahan. Hal ini didasarkan pada proses yang dirancang setelah penelitian intensif dan pengembangan. banyal sel hewan dan tumbuhan mudah terpotong dan pengadukan berlebihan mebuat hasil sel menjadi kacau. STRs tidak mungkin cocok tanpa dimodifikasi dan pancaran udara kemungkinan besar diperlukan.Pengurangan konsumsi energi .Sebagai bagian dari perlindungan lingkungan .(waites. Cairan-dinamis kondisi dalam cairan fermentasi sangat homogen. Airlift Fermenter Sistem ini sangat cocok untuk proses aerobik seperti produksi biomassa mikroba. kecepatan dari proses agitasi dan kedalaman dari cairan. dan melepaskan mikroorganisme serta hasilnya ke lingkungan.2001) 2. sebuah batang pemisah dipasang pada fermenter sampai pada pelindung aseptik.Produktivitas yang lebih tinggi . ini biasanya sebagai jalur yang potensial untuk kontaminasi. Untuk proses fermentasi tertentu. Kebanyakan STRs memiliki ratio ketinggian dan diameter 3 : 1 atau 4 : 1. dibutuhkan 2 atau 3 pelindung untuk meminimalkan adanya kontaminasi.

Walaupun demikian. Penyisihan besi dan mangan. Penyisihan besi dan mangan dapat dilakukan dengan proses oksidasi. Pengontrol otomatis temperature selama fermentasi berhasil terjadi dengan penginjeksi air panas/dingin menuju jaket terluar dan atau gulungan dalam.2001) Aerasi Aerasi merupakan salah satu proses dari transfer gas yang lebih dikhususkan pada transfer oksigen dari fase gas ke fase cair. mereduksi kandungan ammonia dalam air dan untuk meningkatkan kandungan oksigen terlarut agar air terasa lebih segar. (waites. Hydrodynamic mechanism (Deep-jet Fermenter) Mekanisme hidrodinamik menggunakan energy kinetik cairan untuk pencampuran pada fermentor yang diterima menggunakan menggunakan pompa cairan diluar proses sirkulasi dan diinjeksi ulang. Pola aliran pada fluida di tangki pengadukan dapat menjadi 2 tipe. Kontak tidak langsung antara sistem pendingin/pemanas dengan media fermentasi.Cepat pembersihan tanpa masalah . (waites. pada kenyataannya kondisi yang tidak seragam terdapat pada wadah dengan kapasitas lebih dari 500 Liter. dan banyaknya kekuatan yang digunakan pada sistem. Hal tersebut dipengaruhi oleh densitas dari medium dan rheologi. Fungsi utama aerasi dalam pengolahan air adalah melarutkan oksigen ke dalam air untuk meningkatkan kadar oksigen terlarut dalam air dan melepaskan kandungan gas-gas yang terlarut dalam air. (waites. Pencampuran gizi dan penukaran gas dengan fermentor sangatlah kompleks. aerasi dalam aplikasi ini akan menghasilkan endapan dan meningkatkan konsentrasi 128 .(waites.2001) Perpindahan Massa Pada perpindahan nutrisi dari fasa larutan menjadi sel – sel microbial selama fermentasi secara relatif tanpa kesulitan sebagagai nutriri biasanya tersedia di kelbihannya. Proses ini biasanya digunakan pada air tanah yang kebanyakan mempunyai kandungan oksigen terlarut yang rendah. Oleh karena itu. menggunakan injeksi penguap tekanan. efisiensi dari perpindahan panas sangat penting pada kontrol temperatur selama operasi penyeterilan dan mempertahankan temperature tetap selama proses fermentasi berlangsung.2001) Aerasi dipergunakan pula untuk menghilangkan kandungan gas-gas terlarut. yaitu aliran laminar dan turbulen. perpindahan oksigen pada fermentasi aerob lebih kompleks. Aplikasi aerasi dalam proses ini dapat memberikan cukup banyak oksigen untuk berlangsungnya reaksi. Panas terkonduksi masuk melewati dinding wadah. Perpindahan panas utamanya dicapai menggunakan jaket luar di sekitar fasa internal atau menggunakan gulungan internal. gulungan dan baffle.2001) Perpindahan Panas Pada desain fermentor. Terbentuknya panas pada fermentasi terutama akibat dari aktivitas metabolis mikroorganisme dan proses mekanisme agitasi. ukuran dan geometri wadah. Sistem tersebut juga digunakan untuk sterilisasi wadah dan konten sebelum inokulasi. serta membantu pengadukan air..aliran laminar dan turbulen berkarakteristik dengan tinggi dan rendahnya reynold number. Bagaimanapun. STRs memiliki agitator dengan impeller berlipat agar memberikan pencampuran yang baik pada lingkungan yang homogen.Waktu amortisasi Sangat singkat 3. oksidasi kandungan besi dan mangan dalam air.

Tujuan pre-asidifikasi adalah untuk mendisosiasi ammonium dalam bentuk garam.(%) 129 .5 dapat memperbesar oksidasi mangan. Peningkatan pH sampai 8. Pre-asidifikasi dilakukan dengan menambahkan asam kuat seperti asam sulfat sehingga dicapai pH 5.5 ambien 5-15 90-96 Kandungan S2-awal (g/L) Suhu (oC) Kandungan S2. Penyisihan senyawa organic volatile. Hal tersebut sejalan dengan koefisien hukum Henry dimana koefisian akan meningkat seiring dengan meningkatnya suhu. maka proses stripping akan semakin mudah dilakukan.akhir (g/L) Efisiensi removal S2. Hidrogen sulfide adalah senyawa utama penyebab rasa dan bau yang dapat diolah cukup efektif dengan aerasi. Telah disebutkan diawal bahwa semakin tinggi kostanta Henry. Penyisihan hydrogen sulfide. Proses ini biasanya diterapkan pada pelunakan air tanah yang umumnya mempunyai kandungan karbondioksida yang tinggi. Tingginya konsentrasi karbondioksida dalam air dapat meningkatkan pemakaian bahan kimia untuk keperluan pelunakan. Kombinasi gas H2S dengan asam lemah akan memungkin suhu proses stripping dapat diturunkan hingga suhu dibawah 80 oC. Mangan sering kali tidak dapat teroksidasi pada pH normal. 1995) Tabel 1. (Berne dan Cordonnier. Mekanisme pengolahannya adalah terjadi oksidasi hydrogen sulfide menghasilkan air dan belerang bebas. Senyawa organic yang bersifat mudah menguap (volatile) dapat disisihkan dengan cara aerasi. Proses pemisahan gas NH3 secara cepat umumnya dilakukan pada suhu 105 oC. Proses pemisahan (stripping) lebih mudah dilakukan pada suhu tinggi. Kondisi Proses Air Strippping Proses Air stripping 0. Ammonia merupakan polutan yang dapat dipisahkan dari suatu limbah cair walaupun seringkali memerlukan pengaturan pH terlebih dahulu.oksigen terlarut. 2 HSNH4 + H2SO4 à (NH4)2SO4 + 2 H2S / Gas H2S bersifat lebih volatile dibandingkan dengan gas NH3. sedangkan kombinasi gas NH3 dengan asam lemah akan menghasilkan konstanta Henry 15 MPa. Karbondioksida mempunyai kelarutan yang rendah dalam air.5-6.2-0. Kondisi proses stripping yang dapat dijadikan acuan diperlihatkan pada Tabel 1. 1995) AIR STRIPPING Proses air stripping biasanya diawali dengan proses pre-asidifikasi. Hal tersebut didasari hasil percobaan bahwa kombinasi gas H2S dengan asam lemah akan menghasilkan konstanta Henry 150 MPa. Proses yang terjadi adalah digambarkan seperti persamaan berikut. sehingga aerasi sangat efisien dalam penyisihannya. (Berne dan Cordonnier. Penyisihan karbondioksida. khususnya jika digunakan menara aerator. Karbondioksida dapat cepat dihilangkan dengan cara aerasi.

tapi ada fermentasi anaerobik itu ada pemasukan udara atau tidak?Kalau prosesnya anaerobik. Pencampuran gizi dan penukaran gas dengan fermentor sangatlah kompleks. Walaupun demikian. ukuran dan geometri wadah. prosesnya itu aerobik atau anaerobik? Yang dijelaskan tadi pada fermentor ada pemasukan udara. Kesulitan pada deep jet adalah desain alat yang rumit sehingga untuk cara pembersihannya lebih sulit dari alat yang lain.aliran laminar dan turbulen berkarakteristik dengan tinggi dan rendahnya reynold number. STR itu fermentor untuk fermentasi aerob atau anaerob? Kalau bisa digunakan untuk keduanya. banyal sel hewan dan tumbuhan mudah terpotong dan pengadukan berlebihan mebuat hasil sel menjadi kacau. STRs harus dibuat pada turbulen yang tinggi untuk menjaga kecepatan dari perpindahan. m2) Sumber: Berne dan Cordonnier. 2. lalu bagaimana peran sparger dan sterile air pada fermentasi anaerob? Fermentasi anaerob kan tidak 130 30-40 . itu maksudnya apa? Memang fermentor lainnya ada masalah dalam pembersihan? Padahal proses fermentasi tadi dikatakan steril. Sebagai contohnya. (Winda Fauzi Istiqomah 115061101111003) Jawab: fermentor airlift ini wadahnya mudah dibuka serta didalamnya tidak terlalu banyak alat seperti pada STRs yang didalamnya ada alat pengaduk. STRs tidak mungkin cocok tanpa dimodifikasi dan pancaran udara kemungkinan besar diperlukan. Dalam hal ini. mikroba dikatakan akan keracunan bila mendapat oksigen. 4. Apa pengaruhnya aliran kultur yang terlalu cepat dalam fermentor proses agitasi? (Queen Sitanggang 115061100111015) Jawab: Keefektifan dari agitasi tergantung pada desain dari pisau impeller. tetapi ini juga menghasilkan kekuatan potong yang besar yang dapat merusak beberapa sel. dan banyaknya kekuatan yang digunakan pada sistem. Kebanyakan STRs memiliki ratio ketinggian dan diameter 3 : 1 atau 4 : 1. Pola aliran pada fluida di tangki pengadukan dapat menjadi 2 tipe. 3. kecepatan dari proses agitasi dan kedalaman dari cairan. Hal tersebut dipengaruhi oleh densitas dari medium dan rheologi. sebelumnya telah dijelaskan oleh kelompok sebelumnya bahwa bakteri anaerob tidak memerlukan oksigen untuk berespirasi sehingga saat proses fermentasi menggunakan bakteri anaerob tidak dialiri oksigen. Tadi dijelaskan pada airlift fermentor mempunyai keuntungan cepat pembersihan tanpa masalah. STRs memiliki agitator dengan impeller berlipat agar memberikan pencampuran yang baik pada lingkungan yang homogen. yaitu aliran laminar dan turbulen. Tolong dijelaskan proses yang terjadi dalam deep-jet fermentor! (Rizka Dwi Octaria 115061101111017) Jawab: Mekanisme hidrodinamik menggunakan energy kinetik cairan untuk pencampuran pada fermentor yang diterima menggunakan menggunakan pompa cairan diluar proses sirkulasi dan diinjeksi ulang. 1995 DAFTAR PERTANYAAN BESERTA JAWABAN 1. 5. pada kenyataannya kondisi yang tidak seragam terdapat pada wadah dengan kapasitas lebih dari 500 Liter. Pada proses fermentasi. Jadi apakah mikroba tidak bernafas? (Maratus 115061100111019) Jawab: Pada proses fermentasi yang dijelaskan adalah aerob.40-80 V udara / V air 2-3 Tinggi kolom packing (m) Percolation velocity (m3/ jam.

Normalnya pelat baffle dipasang 4 -6 buah pada dinding wadah untuk membantu proses pencampuran dan perpindahan panas 10. atau sebagainya. Mikroba aerob mungkin akan tetap bisa hidup jika udara tersebut mengandung oksigen.membutuhkan oksigen? Tapi kalau STR digunakan hanya untuk fermentasi aerob. untuk adanya kontaminan bisa dilakukan sterilisasi pada alat menggunakan udara bertekanan. feed batch. Diketahui bahwa mikroba berespirasi secara aerob atau anaerob dan dijelaskan pada diagram stirred tank reactor ada udara steril yang masuk. 12. Untuk fermentor anaerob itu sendiri contohnya pada pembuatan etanol.Jelaskan! (Vivi Anita Aprilia 115061107111005) Jawab: Pada prinsipnya STR adalah fermentor aerob. Buffle terbuat dari bahan apa? Apakah ada spesifikasi tertentu tentang bahan-bahan yang digunakan untuk buffle? Misalnya harus kuat. akan tetapi bagaimana untuk mikroba anaerob yang notabene tidak dapat hidup jika ada oksigen. 11. apa tujuannya aliran secara turbulen? Kenapa jenis alirannya berbeda dengan fermentor lain? (Alfonsina 115061100111027) Jawab: Deep jet fermentor adalah salah satu alat dengan menggunakan mekanisme hidrodinamik. Udara seperti apa yang digunakan pada sparger?serta pada perpindahan massa nutrisi seperti apa yang digunakan?makro apa mikro? (Lilis Triyowati 115061101111009) Jawab: Udara yang digunakan pada STR berupa udara yang steril yang bebas dari kontaminan dan masuk melalui sparger yang dihubungkan dengan selang. 7. feed batch. Secara umum. (Inggit Kresna Maharsih 115061100111003) Jawab: Baffle selalu berupa pelat datar dipasang secara vertical dengan ketebalan 1 -10 diameter. 8. maupun continous karena telah dijelaskan dikelompok selanjutnya. Kalau mikroba anaerobic desain fermentornya bagaimana? Apa perbedaanya dengan desain fermentor untuk aerob? (Dhanang Edy Pratama 115061101111007) Jawab: Proses anaerobic yang terjadi dilakukan di dalam bioreactor anaerob dengan tipe Up-Flow anaerobic filter dengan volume 500L. Bagaimana cara menentukan kapan kita menggunakan fermentor dengan system batch. Nutrisi yang digunakan meliputi makro dan mikro karena 131 . 6. BagaimPada deep-jet bagaimana cara menghilangkan kontaminan pada system penggeraknya? Menggunakan apa? (Sharfina Widyaningrum 115061105111003) Jawab: pada deep jet ini ada pompa untuk mengalirkan hasil fermentasinya. deep jet fermentor juga menggunakan aliran laminar dimana harus disesuaikan dengan reynould number. Pada deep-jet fermentor. terdapat definisi yang lebih jelas yang mendefinisikan fermentasi sebagai respirasi dalam lingkungan anaerobic dengan tanpa akseptor elektron eksternal. jadi dapat dinyatakan bahwa mikroba anaerob benar akan mati bila masuk ke dalamnya. lalu fermentor seperti apa yang biasa digunakan untuk fermentasi anaerob? (Dewi Nugrahani 115061100111001) Jawab: STR digunakam untuk aerob sedangkan Fermentor yang digunakan dalam produksi etanol dengan bahan baku gula biasanya mengunakan fermentor anaerob. maupun continous? Dan apa dampak dari produk yang dihasilkan? (Freshsya Zatalini 115061100111003) Jawab: Kelompok kami tidak membahas fermentor dengan system baych. reactor tersebut menggunakan media sponge filter yang berfungsi sebagai tempat melekatnya mikroorganisme. 9.

Fermentasi merupakan suatu cara untuk mengubah substrat menjadi produk tertentu yang dikehendaki dengan menggunakan bantuan mikroba.1 Medium Fermentasi Istilah fermentasi berasal dari bahasa latin fervare yang berarti mendidih. 132 . BAB II TINJAUAN PUSTAKA II. Kenapa deep-jet fermentor jarang digunakan? Apa kekurangan dan kelebihannya? ( Pandu Rahmat 115061107111001) Jawab: Deep-jet fermentor jarang digunakan karena pada fermentor ini mekanisme hidrodinamik menggunakan energy kinetik cairan untuk pencampuran pada fermentor yang diterima menggunakan menggunakan pompa cairan diluar proses sirkulasi dan diinjeksi ulang. Istilah ini digunakan untuk menggambarkan aksi dari ragi dalam ekstrak buah atau biji-bijian yang menghasilkan gelembunggelembung gas karbondioksida sebagai akibat dari proses katabolisme anaerob dari gula yang terdapat dalam ekstrak. 3. Dalam suatu proses fermentasi memerlukan: 1. Oleh karena itu. Apa pengertian amortisasi? dan apa yang dimaksud sebagai bagian dari perlindungan lingkungan? (Ridhani 115061100111009) Jawab: alat dipasang ataupun dibuat dari bahan yang murah harganya dan ramah lingkungan. Produk-produk tersebut biasanya dimanfatkan sebagai produk minuman atau makanan. Tempat (wadah) untuk menjamin proses fermentasi berlangsung dengan optimal. suatu medium fermentasi harus mengandung komponen-komponen yang diperlukan oleh mikroorganisme dalam proses fermentasi. Amortisasi adalah penyusutan secara berangsur – angsur pada proses fermentasi. 13. Jadi dapat dikatakan pompa tersebut membuat kinerja dari fermentor ini kurang efisien karena harus menggunakan tenaga untuk melakukannya. Berikut ini terdapat tabel yang menjelaskan menganai kebutuhan nutrisi bagi 3 jenis mikroorganisme yang berbeda-beda. Sehingga melalui media fermentasi. 14. karena setiap alat harus ada pengawasannya terhadap lingkungan.mikroorganisme adalah makhluk hidup dan pada dasarnya semua makhluk hidup butuh nutrisi baik makro maupun mikro. Substrat sebagai tempat tumbuh (medium) dan sumber nutrisi bagi mikroba Medium fermentasi memiliki fungsi yaitu untuk menyediakan semua nutrisi yang dibutuhkan oleh mikroorganisme selama proses fermentasi berlangsung. mikroorganisme tersebut dapat memperoleh sumber nutrisi yang dapat digunakan untuk memperoleh energy dalam rangka pembentukan sel serta melakukan proses biosintesis untuk menghasilkan produk-produk metabolit. Mikroba sebagai inoculum 2. Idealnya suatu medium fermentasi harus mengandung komponen-komponen yang dapat berperan sebagai pensuplai nutrisi bagi mikroorganisme selama proses fermentasi berlangsung agar mikroorganisme tersebut dapat bekerja secara optimum selama proses fermentasi.

6. Dalam hal ini sumber 133 . seperti nitrogen. maupun molds) memiliki prosentase yang berbeda-beda untuk setiap komponen penyusunnya. Namun untuk kandungan karbon dan mineral yang dibutuhkan oleh ke-tiga mikroorganisme tersebut cenderung sama prosentasenya. kebutuhan dasar lain dari mikroorganisme yaitu air. c. dan ash. 7. nucleo acid. karbohidrat. 5. yeast. Komponen . 3.2 Sumber Nitrogen Fungsi sumber nitrogen dalam media fermentasi yaitu untuk mempercepat pertumbuhan mikroorganisme selama proses fermentasi berlangsung. Berdasarkan data pada tabel di atas dapat dilihat bahwa komposisi bagi masing-masing mikroorganisme ( bacteria. 9. 4.1. Dimana air merupakan komponen terbesar dalam tubuh organisme yaitu sekitar 80-90%. yeast. 1. Selain ke-dua komponen tadi. Nitrogen organic didapatkan dari berbagai kombinasi hasil samping pertanian.komponen penyusun media fermentasi adalah sebagai berikut : Sumber nitrogen Air dan mineral Vitamin Faktor pertumbuhan Prekursor dan Induser Elisitor Inhibitor Modifikasi permeabilitas sel Oksigen Antifoams Animal Colture Media Plant Culture Media Culture Maintance Media Gambar 1 : Tabel Komposisi rata-rata mikroorganisme (bakteri. 2. seperti kacang kedelai dan ampas biji kapas. Nitrogen organik Nitrogen merupakan nitrogen yang berasal dari berbagai macam sumber zat organic. protein. lipids. yaitu nitrogen organik dan nitrogen anorganik. d. Hal tersebut dikarenakan ke-dua komponen tadi merupakan kebutuhan dasar yang harus terpenuhi oleh setiap jenis mikroorganisme untuk kelangsungan hidupnya. protein dan urea. a. Sumber : The Internet Journal of Microbiology ISSN: 1937-8289 II. b. Hal tersebut dikarenakan mikroorganisme tersebut memiliki sifat fisiologis yang berbeda-beda sehingga kebutuhan akan nutrisinya juga berbeda. 8. Dengan kebutuhan nitrogen bagi mikroorganisme yang harus disuplai pad media fermentasi yaitu sekitar 10-15% dari berat kering sel bakteri. oleh karena nya kebutuhan akan air sebagai sumber nutrisi bagi mikroorganisme sangat penting. Selain itu sumber nitrogen organik lainnya yaitu berupa asam amino. molds). Sumber nitrogen dapat dibedakan menjadi 2.

gas amonia. maka nitrogen anorganik tersebut akan mengontrol agar pH selama proses fermentasi berlangsung berkisar antara 4. maupun amonium hidroksida. suhu. Seperti contohnya yaitu ketika melakukan proses fermentasi yoghurt. Komposisi pada Corn steep Liqour umumnya mengandung sekitar 4% (b / v) nitrogen. Corn steep Liqour Corn steep Liqour adalah produk samping yang dihasilkan dari ekstraksi pati dengan menggunakan jagung sebagai komponen pokok. Dalam hal ini sumber nitrogen akan membantu proses pertumbuhan dari mikroorganisme yang berperan (jamur) sehingga dapat menjalankan fungsinya secara optimum.4. Amonium phosphat mempunyai kandungan nutrien yang tinggi yaitu fosfor (P) dan nitrogen (N). dan tekanan. serta mempunyai kelarutan yang tinggi dan mempunyai sifat yang stabil dalam penanganan penyimpanannya. Amonium phosphat monobasis disebut juga sebagai amonium dihidrogen phosphat yang mempunyai rumus kimia NH4H2PO4.nitrogen organic yang paling banyak digunakan yaitu jenis urea dan asam amino. Amonium phosphat yang terdapat di pasaran terdapat dua jenis yaitu monobasis dan dibasis. meliputi pH. Corn steep Liqour digunakan untuk produksi antibiotik penisilin pada tahun 1940-an. Batas maksimum penggunaan amonium phosphat menurut Peraturan Menteri Kesehatan Republik Indonesia nomor 235/Men. Dimana setiap sisa gula yang dihasilkan biasanya dikonversi menjadi asam laktat 134 . Sedangkan amonium phosphat dibasis atau disebut juga diamonium hidrogen phosphat mempunyai rumus kimia (NH4)2HPO4. ekstrak khamir dan pepton. 1.2 – 4. Dalam hal ini nitrogen anorganik bersifat sebagai suplemen untuk mikroorganisme pada proses fermentasi. peptones dan soya bean meal. 2. Sedangkan yang paling cocok digunakan sebagai sumber nitrogen adalah amonium sulfat dan diamonium hidrogen phosphate (DAHP) karena mudah didapat dan harganya cenderung murah.25 bagian untuk setiap 100 bagian berdasarkan berat. Pada proses fermentasi. sumber nitrogen tersebut dapat diproses sehingga menghasilkan produk seperti corn steep liquor. Untuk komposisi yang tepat dari Corn steep Liqour tergantung pada kualitas jagung sebagai sumber nya serta kondisi pengolahan. Dalam proses industri. vitamin dan mineral. Hal ini bertujuan untuk meminimalisasikan keracunan dan hal-hal yang buruk bagi pengosumsi. Sedangkan Matz (1972) menyatakan bahwa penggunaan amonium phosphat pada pembuatan roti tawar tidak boleh lebih dari 0. roti./Per/VI/79 adalah secukupnya untuk jenis makanan soda kue. Sementara nitrogen anorganik dapat bersumber dari amonium sulfat. Selain itu dengan penambahan nitrogen anorganik pada medium fermentasi juga berfungsi sebagai pengatur pH pada proses fermentasi.Kes. Hal tersebut dikarenakan ke-dua sumber nitrogen tersebut harganya relatif murah dan mudah mendapatkannya. Tujuan pengontrolan pH yaitu agar mikroorganisme yang berperan (Lactobacillus bulgaricus dan Streptococcus thermophilus) dapat bekerja secara optimum karena pada pH demikian kerja mikroorganisme tersebut dapat optimum. bir dan makanan lainnya. ekstrak ragi. Sumber nitrogen yang dapat digunakan dalam proses fermentasi adalah amonium sulfat. dalam hal ini sudah termasuk berbagai asam amino.

Berdasarkan hal di atas diketahui bahwa komposisi pepton berbeda-beda berdasarkan sumber protein penyusunnya. namun kekurangan lisin. 3. ekstrak yang terbentuk berupa cairan yang mengandung padatan sekitar 50-65%. atau dapat juga bersumber dari strain seperti Saccaromyches cerevisiae serta strain alternative lainnya yaitu Kluyveromyces marxianus.05% (b / v) tidak dapat digunakan dalam proses fermentasi karena memiliki potensial menyebabkan masalah korosi. pasta kental atau bubuk kering. biji bunga matahari. dalam hal ini beripa autolysis. Peptone dari sumber tanaman selalu mengandung jumlah karbohidrat yang relatif besar. Proses mendapatkan ekstrak ragi yaitu melalui proses hidrolisi. dan beberapa glukosa yang berasal dari karbohidrat yang tersimpan dalam ragi (trehalosa dan glikogen). Selain itu ekstrak ragi juga dapat ditemukan sebagai limbah dari kayu dan pengolahan kertas. Dalam industri pangan. Misalnya peptones yang berasal dari gelatin. sehingga ekstrak yang dihasilkanakan akan terkonsentrasi dengan cepat. kedelai makan. Oleh karena itu dalam formulasi media fermentasi harus dapat diketahui terlebih dahulu 135 . Hal tersebut dikarenakan bahan penyusun pada pepton terdiri atas asam atau hidrolisis enzim dari bahan protein tinggi. memiliki kandungan prolin dan hidroksiprolin yang sangat besar. yaitu apabila dia terhidrolis dengan air maka akan menyebabkan asam yang bersifat korosif. Akibatnya bahan. biasanya tanpa perlu enzim hidrolitik tambahan lainnya. 1995 penyaringan atau sentrifugasi. sehingga dapat menyebabkan sel-sel dalam ragi (yeast) tersebut mati tanpa menonaktifkan enzim. Suhu dan pH harus dikendalikan untuk memastikan proses autolisis optimal dan standar. namun hampir tanpa kandungan belerang yang mengandung asam amino. dan es krim. bahan pada dinding sel ragi rusak dan menjadi puing-puing dan dihilangkan melalui Sumber : Waites. Ekstrak ragi dengan konsentrasi natrium klorida lebih besar dari 0. Sehingga pada akhirnya.sebanyak 9-20%. Dalam hal ini. vitamin larut air (Tabel 3). sel-sel dalam ragi tersebut akan terganggu oleh adanya proses plasmolisis atau gangguan mekanis lainnya pada proses autolysis ini. Dalam hal ini selama proses autolisis harus dapat mengontrol suhu dan tekanan osmotik. Ekstrak tersebut digunakan dalam formulasi media fermentasi biasanya berupa garam bebas dengan konsentrasi komponen yang larut dalam hidrolisis sel ragi. seperti : daging. peptida. 1975 toko roti maupun ragi. Pada proses autolysis ini menggunakan enzim endogen sel. yang ditanamkan pada ragi untuk kemudian dibudidayakan (dikulturkan) menggunakan etanol. jeli. 2. gelatin luas dipakai sebagai salah satu bahan baku dari permen lunak. Selain itu kontrol suhu sangat penting untuk mencegah hilangnya vitamin dari proses autolysis ini. keratin. Sedangkan peptones dengan sumber keratin kaya akan kedua-nya. seperti yang berasal dari produksi tepung kentang. Ekstrak tersebut mengandung asam amino. Proses autolisis bekerja pada rentang suhu pada 50-55⁰C selama beberapa jam sebelum suhu dinaikkan hingga 75⁰C untuk mengaktifkan enzim. Corn steep Liqour kadang-kadang dapat digantikan oleh minuman keras yang sama. yaitu prolin dan sistein. Peptone Peptone biasanya terlalu mahal digunakan untuk industri fermentasi skala besar.Gambar 3 : Tabel kandungan protein dan vitamin pada ekstrak ragi. Ekstrak Ragi Ekstrak ragi dapat didapatkan dari Gambar 2 : Tabel komposisi Corn Steep Liquor limbah Sumber : Anon. dll. b/ v oleh mikroorganisme yang mengkontaminasinya. gelatin. Dalam hal ini komposisi dari pepton bervariasi tergantung pada sumber protein awalnya. kacang.

sehingga dapat memilih sumber pepton yang sesuai terhadap kebutuhan mikroorganisme nya. yang kemudian digunakan untuk mengekstrak sebagian besar minyak. 4.1 Aplikasi penerapan media dengan komponen sumber Nitrogen dalam industry Pegaplikasinua yaitu dalam proses : Produksi β-Glukan dengan menggunakan mikroorganisme berupa Saccharomyces cervisiae dalam media dengan sumber nitrogen berbeda pada Air-Lift Fermentor. dan 136 . Pada proses fermentasi. Komposisi dari soya bean meal yaitu terdiri dari protein sebanyak 50%. asam glutamate. Hal tersebut dikarenakan komponen nya hanya secara perlahan-lahan dilakukan proses metabolisme. II. Gambar 4 : Garfik hasil β-Glukan yang dihasilkan dengan menggunakan medium : pepton. 30% karbohidrat dan minyak sebesar 1%. sehingga dapat digunakan untuk menghilangkan kemungkinan represi dari pembentukan produk. soya bean meal digunakan dalam proses fermentasi antibiotic.2.karakteristik jenis pepton yang dibutuhkan oleh mikroorganisme yang akan digunakan selama proses fermentasi. urea. Soya Bean Meal Soya Bean Meal merupakan residu yang tersisa setelah kacang kedelai selesai di proses. 8% senyawa non-protein nitrogen.

1 Aplikasi dari penggunaan mineral dalam industri Pengaplikasi dapat dijelaskan dalam Proses Fermentasi menggunakan Residu Mango sebagai Sumber Karbon untuk Produksi Bioetanol dengan menggunakan garam mineral MnSO4. Hal ini dapat meminimalkan biaya dalam penggunaan air dan mengurangi volume limbah yang membutuhkan pengolahan air. ferum. molibdenum. mangan. II.3. namun juga penting untuk peralatan pendukung dan pembersihan (sterilisasi).2 Mineral Mineral – mineral yang sering terdapat dalam medium fermentasi yaitu seperti berikut : kobalt.3 Air dan Mineral II. fosfor. FeSO4.3. memerlukan air dalam jumlah yang besar. Kadang-kadang. KH2PO4. Sehingga dapat disimpulkan bahwa sumber nitrogen terbaik untuk proses fermentasi (produksi β-Glukan) adalah menggunakan pepton. Dalam hal ini car menghilangkan koloid maupun suspensi tadi adalah dengan menggunakan teknik GAC (Granulated Carbon Active).Grafik diatas menerangkan bahwa produksi β-Glukan terbanyak pada akhir fermentasi (84 jam) adalah pada medium dengan menggunakan sumber nitrogen pepton. yaitu menambahkan butiran karbon aktif yang berfungsi sebagi filtrate air sehingga antara air dan kolod tersebut dapat terpisah sehingga menghasilkan air yang bebas koloid untuk proses formulasi media fermentasi. Dalam banyak kasus juga menyediakan elemen mineral dalam media fermentasi. Hal ini dikarenakan air merupakan komponen dasar yang dibutuhkan mikroorganisme untuk tumbuh selama proses fermentasi berlangsung.1 Air Semua proses fermentasi. Misalnya. Dan untuk medium urea dan DAHP βGlukan yang dihasilkan sama yaitu 733 mg. maka dilakukan pemanasan pada kolom chamber dengan suhu 121⁰C selama minimal 15 menit untuk memastikan medium sudah tersterilisasi sempurna. kalium. Proses sterilisasi bisa dengan meggunakan cara filtrasi maupun pemanasan. yaitu sekitar 833 mg. dan kotoran dalam bahan media lainnya. kecuali solid-substrat fermentasi. copper. cornsteep liquor mengandung berbagai mineral yang biasanya akan memenuhi kebutuhan mineral minor.Hasil yang diperoleh yaitu : 137 . Dengan alat yang digunakan untuk sterilisasi adalah autoclave. II. maupun garam mineral seperti kalsium karbonat. MgSO4.2. Saat ini air menjadi semakin mahal.3. magnesium. Namun sayangnya pepton harganya relative mahal. sehingga dapat menggunakan alternative urea yang jauh lebih murah sementara produksi β-Glukan tidak jauh berbeda dengan β-Glukan yang dihasilkan oleh pepton. struktur dan fungsi mitokondria.Air digunakan untuk proses pembersih (sterilisasi) dalam proses fermentasi. sulfur dan ion klorida terlalu rendah untuk memenuhi persyaratan ini sehingga dapat ditambahkan sebagai garam yang spesifik. dan seng yang hadir dalam pasokan air. Selain itu air tidak hanya digunakan sebagai komponen utama dari semua media fermentasi. magnesium. II. Respiro-fermentasi metabolisme dan respon terhadap stres lingkungan. dan dengan injeksi steam dengan tekanan yang tinggi. besi. kadar kalsium. sehingga banyak perusahaan yang melakukan proses pendaur ulangan / penggunaan kembali dari air. Sementara dengan menggunakan urea produksi β-Glukanpaling sedikit yaitu 633 mg. termasuk : saat pembelahan dan pertumbuhan sel. Fungsi pemberian mineral dalam media fermentasi yaitu untuk fisiologi mikroorganisme tersebut. Dalam hal ini air yang akan digunakan untuk formulasi media fermentasi harus dipastikan bebas dari kandungan padatan tersuspensi maupun koloid seperti klorin. Dalam hal ini media yang akan disterilisasi dimasukkan dalam chamber.

II. Pada fermentasi membutuhkan suplemen precursor yang spesifik ditambahkan dalam jumlah terkontrol dan dalam bentuk relatif murni. Selain itu contoh lain dari penambahan precursor yaitu D-treonin digunakan sebagai precursor dalam produksi L-isoleusin oleh Serratia marcescens. dalam bentuk ekstrak dengan tujuan untuk menekan biaya operasi fermentasi karena harganya yang lebih murah dalam bentuk ekstrak.2. Dalam medium fermentasi. Sementara untuk mikroorganisme lainnya. Bro 1.4 Vitamin Pada proses fermentasi. Oleh karena itu. dimana precursor tadi akan berikatan dengan rantai samping molekul penisilin.5 dan Agrobacterium sp. vitamin berperan untuk mengaktifkan enzim-enzim yang digunakan selama proses fermentasi. Vitamin dapat ditemukan dalam produk-produk yang banyak mengandung sumber karbon dan sumber nitrogen sebagai kontaminan ringan. Mn2+ berperan dalam produksi metabolit. Contoh faktor-faktor pertumbuhan yang diperlukan dan ditambahkan dalam media fermentasi yaitu seperti : asam amino. inducer. nukleotida.5 Faktor Pertumbuhan Faktor pertumbuhan dalam media fermentasi didefinisikan sebagai persenyawaan organik yang harus terdapat dalam sel mikroorganisme agar mikroorganisme tersebut dapat tumbuh dan menjalankan fungsinya selama proses fermentasi berlangsung. dimana ditambahkan baik dalam bentuk murni atapun. Sementara Fe2+ dapat merangsang pernapasan dan perkembangan mikroorganisme. dalam hal ini magnesium bertindak sebagai penggerak beberapa enzim (fosfatidilkolin transferase dan dekarboksilase). maupun inhibitor.Gambar 5 : Garfik laju produksi bioethanol pada produk yang mengandung mineral MgSO4 or KH2PO4 Berdasarkan kedua kurva di atas dapat dilihat bahwa penambahan mineral dalam medium fermentasi sangat penting dalam proses fermentasi. Contoh vitamin yang digunakan dalam formulasi media fermentasi yaitu pengunaan kalsium pantotenat dalam produksi vinegar dan biotin dalam produksi asam glutamate.Ion K+ sangat diperlukan untuk pertumbuhan mikroorganise. 1. Mg2+. Fe2+ adalah ion yang dibutuhkan untuk proses fermentasi Ragi alkohol. vitamin disintesis oleh banyak bakteri dan digunakan sebagai unsur-unsur dasar penyusun media fermentasi. II. maka harus ditambahkan vitamin sebagai suplemen untuk formulasi media fermentasi. disimpulkan bahwa Mn2+. Prekursor Prekursor adalah senyawa kimia yang ditambahkan ke medium fermentasi dimana selama proses fermentasi berlangsung akan dapat berikatan dengan molekul produk untuk menghasilkan produk dari proses metabolit sekunder. elicitor. 138 . Faktor pertumbuhan biasanya ditambahkan pada sumber karbon maupun sumber nitrogen pada saat formulasi media pertumbuhan. Aplikasi dari penggunaan prekursor dalam industry dapat terlihat pada proses pengaruh penambahan urasil dalam media fermentasi terhadap hasil β-glukan dari dua strain Agrobacteriumradiobacter A1. K+.1. seperti jamur dan ragi berserabut. Dalam hal ini factor pertumbuhan yang ditambahkan pada media fermentasi dapat berupa : prekursor. Tetapi factor pertumbuhan ini tidak dapat dapat dibuat sendiri oleh mikroorganisme tersebut sehingga perlu ditambahkan dari pihak luar. dan asam antranilat ditambahkan pada produksi L-triptofan oleh khamir Hansenula anomala. asam lemak dan sterol. Contoh precursor yang ditambahkan dalam media fermentasi yaitu penggunaan phenylacetic acid atau phenilacetamida pada fermentasi antibiotic penisilin oleh Penicilliumchrysogenum. karena perannya sebagai konstituen dehidrogenase laktat. Mg2+ berperan penting untuk produksi enzim sehingga alkohol dapat terbentuk.

maka harus dimasukkan ke dalam media fermentasi atau ditambahkan pada suatu titik tertentu selama fermentasi.5 maupun Agrobacterium sp. substrat inducer harus selalu ada dalam medium fermentasi. reagen juga sering diperlukan dalam fermentasi mikroorganisme hasil rekayasa genetika (GMMs). pemberian induser maltosa oleh Bacillus subtilis. Hal ini dikarenakan pertumbuhan GMMs dapat terganggu ketika gen cloning 'dihidupkan'. yaitu urasil biasanya berupa substrat enzim atau senyawa yang memiliki struktur berdekatan. Dalam hal ini inducible enzyme hanya medium yang diberi precursor disintesis untuk merespon adanya inducer di lingkungannya. karena tingkat transkripsi dan translasi yang sangat tinggi. sistem untuk gen kloning digabungkan yang memungkinkan maksimalisasi awal pertumbuhan untuk membangun kepadatan biomassa yang tinggi. seperti flavonoid dan trepenoids. Akibatnya. Inducer Dalam proses fermentasi.Pada grafik samping dapat diamati bahwa produksi β-glukan dengan menggunakan medium yang diberi precursor urasil akan jauh lebih tinggi dibanding medium yang tanpa pemberian precursor. Dalam hal ini dilakukan proses isolasi untuk produk target dari berbagai mikroorganisme. Agar enzim tetap disintesis selama fermentasi. khususnya patogen tumbuhan. Contoh : dihasilkannya isoflavonoid pada kultur sel kedelei oleh senyawa elisitor Pms yg dihasilkan oleh fungi patogen Phytophthoramegasperma var. 3. Dalam proses kultur sel tanaman produksi metabolit sekunder. Dalam hal ini aplikasi penggunaan elisiator dalam medium fermentasi adalah pada proses peningkatan produksi katarantin melalui teknik elisitasi pada kultur agregat sel catharanthus roseus.2. dan pemberian selulosa sebagai induser untuk produksi selulase oleh Trichoderma viride . Dalam hal ini inducer diberikan secara terus menerus dalam konsentrasi yang rendah. dapat dipicu dengan menambahkan elisitor. Selain elisator. inducer adalah senyawa yang Gambar 6 : Grafik produksi βbersifat menginduksi sistem biosintesis produksi enzim yang berguna glukan dengan menggunakan selama proses fermentasi. Dalam hal ini kultur yang digunakan adalah Catharanthus roseusdengan elisiator berupa S.1 untuk fase logarigtmik (24 jam) maupun fase stasioner (46 jam). Soja Jika pembentukan produk tergantung pada kehadiran senyawa elisitor tertentu atau analog struktural. Elisitor Elisitor yaitu senyawa yang dihasilkan oleh mikroorganisme yang berperan dalam proses fermentasi untuk membantu mengsekresikan produk target dari sel tumbuhan. Bro 1. dimana gen kloning kemudian dapat 'dihidupkan' oleh penambahan elisitor kimia tertentu. Elisitasi adalah suatu metode untuk meningkatkan fitoaleksin dan metabolit sekunder lainnya dengan menambahkan berbagai elisitor biotik maupun abiotic. Contoh pemberian induser dalam medium fementasi yaitu penggunaan starch untuk produksi amilase oleh kultur Aspergillus spp. baik dengan menggunakan kultur Agrobacteriumradiobacter A1. 2. cerevisiae 139 .

4. Ikatan ini menyebabkan perubahan bentuk enzim sehingga sisi aktif enzim tidak sesuai lagi dengan substratnya. Gambar 9 : Cara kerja inhibitor nonkompetitif b. Sebuah contoh dari penghambat khusus digunakan untuk mengarahkan metabolisme natrium bisulfit. cerevisiae(A) dan medium(B) sebelum (control) dan sesudah elisitasi. penghambat ini dapat dibalikkan. Inhibitor nonkompetitif merupakan senyawa kimia yang tidak mirip dengan subtrat den berikatan pada sisi selain sisi aktif enzim. inhibitor menghentikan jalur pada titik tertentu untuk mencegah metabolisme lebih lanjut dari produk target. Contohnya adalah diisopropil-fluorofosfat (DFT) yang menghambat kerja asetilkolinestirase (enzim penting dalam transmisi implus saraf) yang dapat menyebabkan kekejagan otot.Gambar 7: Garfik kandungan karantin dalam sel S. Gambar 8 : cara kerja inhibitor kompetitif ii. Inhibitor kompetitif menghambat kerja enzim dengan menempati sisi aktif enzim sehingga substrat tidak dapat masuk. Modifikasi sel permeabilitas 140 . Selain itu fungsi dari inhibitor adalah untuk mempengaruhi struktur dinding sel sehingga meningkatkan permeabilitas dinding sel untuk melepaskan metabolit. Selain itu dapat diamati pula bahwa pada produksi katarantin pada medium menunjukkan pola yang selalu naik setiap pertambahan waktu dalam proses fermentasi. Inhibitor Reversibel. yaitu proses dimana satu fungsi di halangi oeh fungsi lainnya. Inhibitor Inhibitor adalah molekul atau senyawa kimia yang bersifat mengalihkan reaksi metabolism sehingga bisa dihasikan produk yang lebih spesifik. Inhibitor reversibel dibedakan menjadi inhibitor kompetitif dan nonkompetitif. Pada grafik di atas dapat disimpulkan bahwa kandungan katarantin baik pada sel S. Contoh : penggunaan penisilin dlm produksi asam glutamat oleh Micrococcus glutamicus. i. 5. Oleh sebab itu. merupakan penghambat yang berikatan dengan sisi aktif enzim secara kuat sehinga tidak dapat terlepas.cerevisiae maupun pada medium akan lebih banyak dihasilkan dengan yang diberi perlakuan pemberian elisitor. Jadi. Inhibitor ini bersaing dengan substrat untuk berikatan dengan sisi aktif enzim. yaitu: a. yaitu penghambat yang tidak berikatan secara kuat dengan enzim. Hal ini dikarenakan terinduksinya serangkaian proses yang mengarah pada akumulasi katarantin. Hal tersebut dikarenakan karena adanya perubahan pH pada medium setelah elisitasi. yang digunakan dalam produksi gliserol oleh S. cerevisiae. Dengan kata lain inhibitor digunakan untuk mengarahkan metabolisme terhadap produk target dan mengurangi pembentukan produk yang tidak diinginkan. Pada inhibitor terjadi proses inhibisi. Inhibitor Irreversibel. Inhibitor dibedakan menjadi dua kelompok. Enzim menjadi tidak aktif dan tidak dapat kembali seperti semula.

Media ini dirancang untuk mempertahankan kelangsungan hidup sel yang baik dan memnimalisirkan segala kemungkinan berkembangnya variasi generic. sehingga meningkatnya pelepasan produk intraseluler dari media fermentasi. yang mengakibatkan hilangnya kondisi aseptik. Yang penting adalah kebutuhan untuk freeborad dalam fermentor untuk memberikan rang bagi busa yang dihasilkan. Antifoam yang ideal harus memiliki sifat sebagai berikut: Mudah dan cepat tersebar dengan tindakan yang cepat Aktivitas tinggi pada konsentrasi rendah Tidak beracun untuk microorganisme fermentasi. Ada tiga pendekatan yang memungkinkan untuk mengendalikan produksi foam: modifikasi komposisi media. fermentasi dibagi menjadi aerob (membutuhkan oksigen) dan anaerob (tidak membutuhkan oksigen). LAMPIRAN I. Jika tidak dikontrol.hal itu dapat diberikan dalam udara yang mengandung sekitar 21% (v/v) oksigen.6 Oksigen Penggunaan oksigen pada fermentasi bergantung pada jumlah okisgen yag dibutuhkan oleh organisme. busa dapat menghalangi udara. penggunaan pemutus busa mekanik dan penambahan antifoams kimia. Fermentasi yang mengunakan oksigen salah satu nya adalah fermenasi asam cuka. minyak ikan. vitamin dan asam amino. II. 2. 4. Nitrat adalah sumber nitrogen. II. sehingga fermentor menjadi tercemari mikroorganisme yang dilepaskan ke limgkunagn.7 Antifoams Antifoams diperlukan untuk mengurangi pembentukan busa selama fermentasi. II.minyak mineral dan dan lemak. Senyawa yang digunakan untuk tujuan ini termasuk penisilin dan surfaktan.9 Plant cell Culture Media Berbeda dengan anmal cultre media. Mereka sering ditambahkan ke fermentasi asam amino. seperti media kultur yang mengandung glukosa. alkohol poli dan glikolteralkilasi. 3. namun sering juga di tambahkan garam ammonium. Daftar Pertayaan 141 . Busa ini terjadi terbentuk disebabkan ole media potein yang melekat pada permukaan air-broth dimana mereka mengubah sifat busa yang stabil. Hal ini di lakukan untuk meningkatkan permeabilitas sel dengan memodifikasi dinding sel dan membran. Namun beberapa spesies memerlukan garam organic dalam bentuk asam amino. mineral garam. sumber nitrogen.kombinasi dan konsentrasi hormone tanaman diberika tergantung padafermentasi tretentu. Para antifoam sintetissebagian besar adalah silikon minyak miyak. II. Berdasarkan kebutuhan akan oksigen. Antifoams kimia bahan aktif yang dapat mengurangi tegangan yang mengikat busa bersama-sama. Mereka mengandung sumber karbon organic. bunga matahari). sdangkan fermentasi yang tidak membutuhkan oksigen adalh fermentasi asam laktat.manusia tau hewan Memiliki biaya yang rendah Antifoams alam termasuk minyak tanaman(misalnya kedelai. termasuk proses untuk memproduksi L-glutamicacid menggunakan anggota Brevibacterium Corynebacteriumand genera.1. mineral garam dan hormone pertumbuhan. II.8 Animal Cell Culture Media Animal cell culture media biasanya didasarkan pada media yang kompleks.10 Culture maintance media Media ini digunakan untukmenyimpan dan subkuktur sektir utama industry. yang digunakan untuk palnt culture media hanyasenyawa kimia tretentu.

Sisca ( Apakah efek apabila konsentrasi pada komponen tidak sesuai? Jawab: Efek yag terjadi apabila konsentrasi komponen fermentasi tidak sesuai dapat menyebabkan hasil yang diinginkan tidak sesuai dengan target. dapat dikategorikan sebagai bentuk fermentasi yang menghasilkan asam laktat sebagai produk sampingannya. namun memiliki spesifikasi sifat yang berbeda. 4. Ridhani R ( Bagaimana dengan penggunaan kultur lain selain saccaromyches dalam aplikasi penggunaan medium fermentasi sumber nitrogen terhadap hasi β-Glukan yang dihasilkan ? Jawab: Dalam hal ini penggunaan kultur jenis lain selain saccaromyches akan menyebabkan produksi β-Glukan berbeda.A. Maratus S ( Selain bahan yang mengandung gula. Jadi tiap-tipa bekteri memeliki spesifikasi sifat yang berbeda-beda karena juga memiliki karakter untuk menghasilkan produk yang berbedbeda juga. meskipun bakteri dalam strain yang sama. dan ash. Afida K ( Bagaimana cara menangani kandungan bahan pengotor pada air agar dihasilkan air yang murni untuk penyusun formulasi media fermentasi ? 142 . protein. asam laktat. dan air yang dibutuhkan oleh ke-tiga mikroorganisme tersebut cenderung sama prosentasenya. Gula adalah bahan yang umum digunakan dalam fermentasi. Hal tersebut dikarenakan ke-dua komponen tadi merupakan kebutuhan dasar yang harus terpenuhi oleh setiap jenis mikroorganisme untuk kelangsungan hidupnya. lipids. apa saja yang bisa difermentasi oleh bakteri ? Jawab : Fermentasi merupakan suatu proses produksi energi dalam sel dalam keadaan anaerobik (tanpa oksigen). Dian Nita Citra ( Apakah kondisi dan perlakuan setiap bakteri walaupun dengan strain yag berbeda itu sama? Jawab: iya. Hal tersebut dikarenakan mikroorganisme tersebut memiliki sifat fisiologis yang berbeda-beda sehingga kebutuhan akan nutrisinya juga berbeda. maupun molds) memiliki prosentase yang berbeda-beda untuk setiap komponen penyusunnya. Namun untuk kandungan karbon. sehingga kultur ini dipilih untuk membantu proses fermentasi ini. Akan tetapi beberapa komponen lain dapat juga dihasilkan dari fermentasi seperti asam butirat dan aseton. anggur dan minuman beralkohol lainnya. Ragi dikenal sebagai bahan yang umum digunakan dalam fermentasi untuk menghasilkan etanol dalam bir. Beberapa contoh hasil fermentasi adalah etanol.Alfondsina ( Mengapa garam yang berlebih dapat menyebabkan korosi? Jawab: B. Hal tersebut dikarenakan fungsi yang dimiliki oleh masing-masing mikroorganisme berbeda-beda setiap jenisnya. 2. 2. karbohidrat. 3. Pertanyaan Lisan 1. seperti nitrogen. Pertanyaan Tertulis 1. Dalam hal ini kultur saccaromyches dapat menjalankan fungsinya secara optimum dalam produksi β-Glukan. Sehingga dapat menyebabkan kerugian. nucleo acid. Dewi Nugrahani ( Apa yang menyebabkan komposisi masing-masing mikroorganisme berbeda ? Jawab : Kebutuhan nutrisi bagi masing-masing mikroorganisme ( bacteria. 3. Sebab. yeast. mineral. dan hidrogen. Respirasi anaerobik dalam otot mamalia selama kerja yang keras (yang tidak memiliki akseptor elektron eksternal). konsentrasi juga merupakan salah satu factor pada prose fermentasi.

bentuk dan fungsinya dibuat dari 20 asam amino terikat oleh ikatan peptide. polisakarida dan asam nukleat dari bahan. Proses sintesis demikian tidak dapat berlangsung tanpa adanya masukan energi. dikatalis oleh enzim.hati meregulasinya sehingga kecepatan dari biosintesis kira. Energi bebas diperlukan untuk biosintesis pada selsel dewasa dalam ukuran yang konstan karena molekul. Proses ini disebut dengan turnover atau pergantian. materi.Protein yang berbeda memiliki 143 .organela baru dan sel. sebuah mikroorganisme memulai dari prekursor sederhana seperti molekul. 1.bahan ini berlangsung lebih cepat dari perombakannnya maka organism akan tumbuh. Proses Anabolisme biasanya banyak membutuhkan energi sehingga reaksinya dapat berlangsung cepat dan efisien. Enzim.kira setimbang dengan katabolisme. yaitu dengan cara menambahkan butiran karbon aktif sebagai filtrate air sehingga antara air dan bahan suspen maupun koloid akan terpisah.zat pada kedua sisi dari persamaan itu dan beberapa jalur anabolik menggunakan enzim yang juga digunakan dalam jalur katabolic yang serupa. Pembuatan molekul komplek yang besar dimulai dari unit struktur sederhana yang disebut monomer dimana menyimpan kapasitas ruang genetic.enzim yang berperan dalam katabolisme dapat pula berperan dalam anabolisme dengan suatu tindakan sederhana seperti merubah konsentrasi nisbi zat. baik ekstra sel maupun intrasel. Anabolisme merupakan suatu proses pembentukan molekul alami dari molekul lain yang kurang rumit strukturnya. Protein.hasil anabolisme berguna dalam sejumlah fungsi yang esensial. Glikogen. istilah biosintesis berarti pembentukan senyawa alami oleh organisme hidup.Jawab : Cara yang paling umum digunakan yaitu metode GAC (Granulated Active Carbon).bahan kecil.sel terbentuk.monomer yang kemudian menjadi molekulmolekul yang lebih kompleks sampai menjadi organela.molekul seluler akan secara berkesinambungan terdegradasi dan disintesis.zat lainnya untuk dilepaskan ke lingkungan. apapun ukuran. Selama biosintesis. Banyak dari energi ini digunakan dalam biosintesis atau anabolisme. Hasil. dan polisakarida yang tergabung dalam makromolekul atau molekul besar yang terdiri dari polimer-polimer kecil yang tergabung bersama. BAB II ISI ANABOLISME: Penggunaan energi dalam Biosintesisi Pengetahuan tentang metabolisme yang sifatnya fundamental dan vital bagi makhluk hidup telah mengantarkan kita ke suatu tingkat pemahaman yang mendalam tentang proses-proses yang berkaitan. protein. Energi yang telah dihabiskan pada proses perggantian molekul untuk banyak sel yang tidak berkembang menggunakan energinya untuk mensintesis enzim dan zat. Anabolisme adalah sintesis dari makromolekul seperti protein. lemak dan protein berguna sebagai bahan bakar cadangan untuk katabolisme.prinsip pengaturan biosintesis Sebuah sel mikroba mengandung sejumlah besar protein. Semua transformasi anabolik seperti halnya dengan semua reaksi katabolic. Molekul protein.molekul anorganik dan monomer. Bila sintesis bahan. metabolism secara hati. Reaksi yang memerlukan energi dalam bentuk panas disebut reaksi endergonik atau reaksi endoterm Mikroorganisme dapat memperoleh energi dalam berbagai cara. Walaupun pergantian atau turnover dari unsure-unsur pokok suatu sel berkesinambungan. Hal ini bisa disebut dengan istilah biosintesis.materi baku biosintesis dan energy. Sintesis asam nukleat memungkinkan organisme untuk menyimpan dan mengutarakan tambahan dari perbendaharaan informasi genetiknya.karbohidrat dan protein-lipid merupakan komponen structural yang esensial dari organism. asam nukleat. ATP merupakan sumber energi bagi semua aktifitas anabolik didalam sel. Prinsip. Karena anabolisme merupakan proses sintesis molekul kompleks dari beberapa molekul sederhana maka memerlukan sejumlah energi untuk biosintesisnya.

struktur yang lebih kompleks seperti sistem supramolekul dan organel. Untuk mensintesis secara efisien suatu molekul. Jika sebuah protein disusun oleh 40 asam amino yang berbeda yang terbagi menjadi dua puluh. tetapi mikroorganisme autotrof memperoleh energi dari oksidasi kimia. Sel sering menyimpan penambahan materi dan energy dengan menggunakan enzim yang sama untuk proses katabolisme dan anabolisme. seperti misalnya elektron yang dibebaskan dari oksidasi belerang. Hanya mikroorganisme autotrof yang menggunakan CO2 sebagai satu-satunya sumber karbon bagi sintesis selnya. sama dengan mikroorganisme fotosintetik. dan NAD +. biosintesis asam lemak terjadi dalam matriks sitoplasma. energi bebas yang dibuat tersedia selama perombakan trifosfat nukleosida yang mendorong reaksi biosintesis sampai selesai. dan lainnya disalurkan melewati rantai-rantai transpor elektron yang menyebabkan proton menyembul dari membran. 2.rangkaian asam amino yang berbeda pula. ADP. sedangkan oksidasi asam lemak terjadi di dalam mitokondria. 5. Walaupun banyak enzim dalam jalur amphiobolik terlibat dalam aktivitas katabolisme dan anabolisme . Potensial yang terjadi diubah menjadi ikatan fosfat berenergi tinggi jika proton memasuki sel kembali melewati saluran proton. Untuk contoh. Dalam jalur biosintesis mikroorganisme eukariotik sering terletak di ruang selular yang berbeda dari jalur yang berhubungan secara katabolik. Kedua jenis jalur dapat diatur dengan produk akhir mereka serta oleh konsentrasi ATP. dan yang lainnya membalik proses pengubahan. Satu enzim mengkatalisis reaksi dalam katabolisme. beberapa tahapnya dikatalisis oleh enzim yang berbeda. Gen akan membutuhkan enzyme ekstra dan sel harus menanamkan materi-materi baku dalam sintesis atas penambahan gen. NADPH daripada NADH biasanya berfungsi sebagai donor Setelah makromolekul telah dibangun dari prekursor sederhana. enzim glikolisis yang terlibat dalam sintesis dan degradasi glukosa. Regulasi anabolisme adalah bentuk yang agak berbeda dengan katabolisme. ribosom merupakan kumpulan besar proton banyak dan molekul ribonukleikasid namun mereka muncul dengan pembentukan komponen mereka tanpa keterlibatan. Mikroorganisme autotrof mendapatkan energi dari oksidasi senyawa anorganik tetapi proses penangkapan energi sama dengan fosforilasi oksidatif. 3. Misalnya. 144 . mereka dirakit menjadi lebih besar. Pembagian ruang memudahkan jalur untuk beroperasi secara simultan namun independen 6. 4. AMP. jalur anabolik harus beroperasi ireversibel ke arah reaksi biosintesis untuk pemecahan ATP dan trifosfat nukleosida lainnya. Kegunaan beberapa monomer yang terhubung bersama oleh ikatan kovalen membuat sintesis makromolekul memiliki proses yang efisien. Sebaliknya. Jalur anabolik dan katabolik sering menggunakan kofaktor berbeda. enzim dan asam amino. amoniak. Kegunaan enzim yang terpisah untuk dua reaksi dalam satu tahap memungkinkan regulasi independen dari katabolisme dan anabolisme. ketika dua proses yang digabungkan. FIKSASI CO2 Sebagian besar mikroorganisme dapat menggabungkan dan memfiksasi CO2. Sel mebutuhkan enzim untuk membuat dua kali lipat asam amino(atau menyediakan asam amino ekstra ). Hampir semua struktur sel terbuat dari 30 prekursor-prekursor kecil. Mikroorganisme fotosintetik memperoleh energi untuk mengubah CO2 menjadi bahan sel berasal dari cahaya. Jalur anabolisme dan katabolisme tidak pernah sama walaupun banyak enzim digunakan bersama. Makromolekul biasanya berisi informasi yang diperlukan untuk membentuk spontan dalam proses yang dikenal sebagai self-kumpulan. ketika elektron donor dibutuhkan selama biosintesis. Biasanya oksidasi katabolik menghasilkan substrat NADH untuk transpor elektron. Seperti misalnya. A.

Hal ini merupakan suatu kelebihan yang sangat tidak mungkin terjadi pada organisme tingkat tinggi. dan senyawa organic yang digunakan sebagai donor electron terakhir. membentuk dua molekule 3-fosfogliserat (PGA) Fase Reduksi Setelah PGA terbentuk melalui karboksilase. Cyanobacteria. Gula yang terbentuk dalam siklus Calvin dapat digunakan untuk mensintesis molekul. dan merupakan proses pembalikan dari proses glikolisis. Walau demikian. Fase Regenerasi Fase ketiga.molekul anorganik secara kemoautotrof. dan vitamin. Sulfate Reducer.protein lain.5-bifosfat karboksilase. Dibagi menjadi tiga fase yakni karboksilasi. hydrogen molekuler. siklus calvin diketemukan pada fotosintesis eukariotik dan pada sebagian besar fotosintesis prokariotik (tidak untuk Archaea. Jalur reduktif asam trikarboksilik yang digunakan untuk beberapa Archaea (Thermoproteus. Siklus Calvin terjadi di stroma pada kloroplas mikroba autotrof eukariotik . 6RuBP+6CO2 → 12PGA → 6RuBP+Fruktosa 6-P Pengubahan CO2 menjadi materi organik membutuhkan 3 ATP dan 2NADP. dari siklus Calvin adalah pembentukan kembali RuBP dan dihasilkannya karbohidrat seperti gliseraldehid 3-fosfat. Fotosintesis Anoksiganik Bakteri Unit Fotosintesis dalam unit bakteri berbeda dengan siano bakteri. Hampir semua mikroorganisme autotrof menggabungkan CO2 melalui jalur metabolik yang disebut siklus calvin. memiliki tiga komponen pertama. Melalui jalur asetil-koA pada methanogen. Pembagian dari siklus ini mirip dengan jalur pentose fosfat dan melibatkan reaksi transketolase dan transaldolase. Fase Karboksilasi Fiksasi karbon dioksida dilakukan oleh enzim ribolosa-1. Siklus harus beroperasi enam kali untuk menghasilkan heksosa dan membentuk kembali 6 molekul-molekul RuBP. Senyawa sulfur tereduksi.molekul yang diperlukan lainnya.5-bifosfat (RuBP). Mikroorganisme ini biasanya menggunakan satu dari dua jalur. Oksigen tidak terbentuk 145 . gliseraldehid 3-fosfat dehidroginase berbeda dengan enzim pada glikolisis dalam penggunakan NADP+. Reduksi. siklus calvin-Benson atau siklus reduktivitas pentose phospat. Pembentukan glukosa dari CO2 dapat dituliskan sebagai berikut 6CO2+18ATP+12NADPH+12H++12H2O → Glukosa+18ADP+18Pi+12NADP+ ATP dan NADPH dihasilkan dari reaksi terang fotosintesis dengan mengoksidasi molekul.) dan beberapa bakteri seperi Chlorobium dan desulfobacter). beberapa bakteri obligat anaerobic dan beberapa bakteri mikroaerofilik). beberapa bakteri nitrifikasi pemasukan thiobacilli carboxysomes . dilakukan oleh dua enzyme. . reduksi. dan bakteri yang membentuk asetat dari CO2 selama fermentasi (Acetogen). asam nukleat. Pengumpulan cahaya (mengandung dan tambahan pigmen) sebuah reaksi pusat. merupakan tempat fiksasi CO2 atau penyimpanan karboksilase dan protein. regenerasi. Untuk mensintesis fruktosa 6-fosfat atau glukosa 6-fosfat dari CO2. lemak. Walaupun begitu. FOTOSINTESIS 1. PGA Tereduksi menjadi gliseraldehid 3-fosfat. tersusun dari bacteriochlorophyll dan bacteriopheophytins dan sebuah ETS. fruktosa. dan glukosa. Siklus ini selesai ketika fosforibulokinase membentuk kembali RuBP. Terdapat polyhedral yang mengandung enzim ribolusa-1. B.Mikroorganisme autotrof merupakan satu kelompok besar mikroorganisme yang mempunyai kemampuan untuk mengubah senyawa anorganik menjadi senyawa organik seperti protein. sulfolobus.5-bifosfat karboksilase atau ribolosa difosfat karboksilase yang dikatalisis dengan penambahan CO2 menjadi ribolosa 1.

Fosforilasi glukosa Tahap. sedangkan sisanya dihasilkan oleh tumbuhan daratan.+ 2H++ H2O ATP juga dapat dihasilkan dari electron yang terbentuk melalui fotosistem I.6 bifosfat dengan fosfofruktokinase yang dibalikkan oleh enzim. SINTESIS GULA DAN POLISAKARIDA Mikroorganisme yang tidak bisa melakukan fotosintesis dan mikroorganisme Heterotrof harus mensintesis molekul. jika tidak digunakan dalam produksi NADPH .tahap ini dilewati ketika proses terjadi secara biosintetis. Selam proses ini ATP disentesis melalui siklus fosforilasi. Selama siklus ini. Bakteri ini melewati sebuah quinine dan melalui berbagai sitokrom. yang dibutuhkan bersama ATP untuk fiksasi nitrogen. Ketika bateriochlorophyll melalui dalam reaksi pusat ditangkap oleh cahaya. Fotosintesis Sianobakteri 6CO2 + 6H2O → C6H12O6 + 6O2 C. Pemberian NADP+ tidak bergantung pada cahaya ATP tersintesis melalui siklus fosforilasi yang dibutuhkan untuk memaksa electron dari reduktor lemah untuk bergerak kemudian mereduksi NADP+ (Pembalikan transfor electron) .Pembalikan transfor electron juga digunakan litotrof untuk mengatasi masalah yang sama. kembali pada reaksi pusat bacteriochlorophyll. Sintesis glukosa dari prekursorprekursor nonkarbohidrat disebut glukoneogenesis. Inilah proses oksigenenik. setiap electron berpindah. fruktosa bifosfatase yang mana secara 146 . jalur glukonigenesis berbeda dengan jalur glikolisis. Dilakukan dengan fotolisis air dan hasilnya adalah oksigen.molekul organic gula yang tereduksi dari CO2. Fotosintesis bakteri ungu non belerang CO2 + 2CH3CHOHCH3 → (CH2O) + H2O + 2CH3COCH3 Fotosintesis bakteri hijau belerang CO2 + 2H2S → (CH2O) + H2O + 2S 2. Electron yang diberikan ke fotosistem I melalui system transport electron adalah untuk mempertahankan proses operasi. Dalam pembentukan NADH. Pembentukan fruktosa-1. Walaupun sama-sama menggunakan tujuh enzim. Pengubahan fosfoenolpiruvat menjadi piruvat 2.selama fotosintesis. Fotolisis air H2O + Cahaya Matahari → 2e. Seperti contohnya fruktosa 1. Fotosistem I selesai dan tidak sanggup untuk memberikan electron lagi.6 bifosfat dari fruktosa 6-fosfat 3. Electron berpindah dari reaksi pusat fotosistem I ketika ditangkap cahaya menuju ferredoksin kemudian menuju NADP+ untuk membentuk NADPH. Fotosintesis oksigenik bakteri Ganggang hijau dan sianobakteri di lingkungan lautan menghasilkan sekitar 70% oksigen bebas yang dihasilkan di bumi. Proses ini dinamakan fotofosforilasi. Aseptor electron utama dari fotosistem I dapat melewatkan electron melalui sitokrom dapat kembali melakukann siklus untuk reaksi pusat pada fotosistem I. ATP tersintesis. Tiga tahap glikolisis yang terjadi dalam sel dan bersifat irreversible 1. sebuah electron diberikan kepada bacteriopheophytin. System ini bertanggung jawab atas pembentukan ATP dan NADPH. alga dan tanaman tingkat tinggi mempunyai dua fotosintesis (I dan II) terhubung melalui pembawa electron. sebuah electron tereduksi dibutuhkan yakni H2S atau H2. Sianobakteria.

Ketika glukosa dan fruktosa telah terbentuk. Berbeda selama sintesis gula dan kanji pada bakteri dan alga. Seperti yang dikatakan sebelumnya biosintesis bukanlah proses pembalikan yang sederhana dari proses katabolisme.hidrolisis memindahkan fosfat dari fruktosa bifosfat. Gula nukleosida difosfat paling penting adalah uridin difosfat glukosa (UDPG). Katabolisme glikogen dan pati atau Starch mengolah tidak hanya melalui hidrolisis untuk membentuk gula bebas dengan penambahan fosfat pada polimer ini dengan produksi glukosa 1-fosfat. ATP+glukosa 1-fosfat → ADP-glukosa + Pi (Glukosa)n + ADP-glukosa→(glukosa)n+1 + ADP Nukleosida difosfat juga ikut terlibat dalam sintesis molekul komplek pada dinding sel bakteri. Enzim yang berbeda mengkatalisis sintesis UDP-asam glukorin melalui proses oksidasi UDPG. Gula Nukleosida difosfat memiliki peran pusat dalam sintesis polisakarida seperti kanji (Starch) dan glikogen. Fruktosa 6-fosfat ↔ mannose-6 fosfat Beberapa gula tersintesis sambil tersisip menuju nukleosida difosfat. gula pada umumnya juga akan terbentuk. Paling tidak dua enzim terlibat dalam pengubahan piruvat menjadi fosfoenolpiruvat. Seperti misalnya mannose yang secara langsung dapat terbentuk dari fruktosa melalui perombakan sederhana. Gula nukleosida difosfat tidak terlibat. UDP-galaktosa disintesis dari UDPG melalui penyusunan ulang dari satu kelompok hidroksil. Pembagian UDP oleh UPGD dikenali enzim dan membawa glukosa di sekitar sel untuk terlibat dalam reaksi enzim seperti ADP yang memecah fosfat dalam pembentukan ATP. gula adenosine difosfat terbentuk dari glukosa 1-fosfat dan kemudian memberikan glukosa pada akhir rantai glukosa dan pati. 147 . Glukosa teraktivasi melalui penyisipan pada pirpfosfat pada uridin melalui reaksi dengan uridin difosfat.

masing diasimilasi atau dibentuk menjadi molekul.bakteri menggabungkan hidrogen sulfida dengan O-acetylserine (proses 2) (1) H2s+serin → sistein + H2O (2) Serin asetil-koA O-Asetilserin H2S Asetat sistein Setelah terbentuk.fosfat membentuk 1. Nitrogen adalah komponen utama dalam semua asam amino. Atom sulfur pada sulfat akan lebih teroksidasi daripada pada sistein dan molekulmolekul organic lainnya. sulfur. kemampuan sel untuk mengasimilasi nitrogen anorganik adalah penting. Glikolisis memberikan contoh pada proses ketiga. Reduksi asimilasi sulfat melibatkan proses pengaktifan sulfat melalui pembentukan phosphoadenosine 5. fosfolipid. Proses yang disebut dengan reduksi asimilasi sulfat ini dimaksudkan untuk dapat dibedakan dengan reduksi dissimilasi sulfat yang terjadi ketika sulfat berperan sebagai aseptor electron selama proses anaerobic berlangsung. Proses ini merupakan proses yang kompleks dimana sulfat pertama direduksi menjadi sulfit (SO32-) kemudian menjadi hidrogen sulfida. 2005) D. yang nantinya dimasukkan ke dalam protein. sehingga sulfat harus direduksi sebelum proses asimilasi. dan nitrogen dalam jumlah banyak untuk biosintesis. seperti DNA dan RNA yang nantinya membawa hereditas Karena nitrogen merupakan komponen penting dari protein. Nitrogen juga hadir di basis pembentuk asam nukleat. Jamur berperan untuk mengkombinasikan hidrogen sulfide dengan serin untuk membentuk sistein (proses 1) dimana banyak bakteri.molekul organic melalui rute yang berbeda. Asimilasi nitrogen Nitrogen adalah unsur yang diperlukan untuk membentuk senyawa penting di dalam sel. yang selanjutnya digunakan dalam sintesis ATP.3-bifosfogliserat. Gliseradehid 3-P+Pi+NAD+→1. Sistein dapat disintesis dari hidrogen sulfida dengan dua cara. termasuk protein. DNA dan RNA. Asimilasi Sulfur Sulfur diperlukan dalam sintesis asam amino (sistein dan mesionin) dan beberapa enzim (koenzin A dan iotin) . sulfat dapat menghasilkan sulfur untuk proses biosintesis.bacteria mempunyai phosphatases di ruang periplasmic antara dinding sel dan membrane sel yang mengambil fosfat setelah dihasilkan.Gambar glukeneogenesis. Phospatases sering menghidrolisis ester fosfat organic untuk menghasilkan fosfat anorganik. asam nukleat. DAN NITROGEN ANORGANIK Di samping karbon dan oksigen. Fosfat anorganik terbentuk melalui pembentukan ATP dalam tiga cara yakni : fotofosforilasi. ASIMILASI FOSFOR SULFUR. protein. fosforisasi level substrat. Gram negative.3-bifosfogliserat+NADH+H+ 1.fosforilasi oksidatif. koenzim dan unsure-unsur pokok banyak sel lainnya. Fosfat terlibat dengan gliseraldehid 3. Masing. sistein dapat juga digunakan sebagai sintesis sulfur yang mengandung senyawa organic 2. karena keduanya merupakan sumber eksraselular dan tempat penyimpanan intraselular asam amino. Asimilasi fosfor Fosfor ditemukan pada asam nukleida. Sumber fosfor paling utama fosfat anorganik dan ester fosfat organic.3 Bifosfogliserat + ADP→3-Fosfogliserat+ATP Mikroorganisme memperoleh fosfat dari lingkungan disekitarnya yang larut maupun terbentuk. mikroorganisme menbutuhkan fosfor.phosphosulfat yang kemudian diikuti dengan reduksi sulfat. ( Harley. Walaupun gas 148 . koenzim seperti NADP. protein adalah zat yang sangat kita butuhkan dalam pertumbuhan. Protozoa secara langsung menggunakan fosfat organic setelah ingesti atau hidrolisis di lisosom dan membentuk fosfat 1.ATP. Banyak organisme yang menggunakan sistein dan mesionin .

Enzim yang lain dalam asimilasi amonia. dan oleh mikroorganisme baik secara simbiotik maupun nonsimbiotik yang menyuplai tanah baik melaliu inangnya maupun setelah mati. amonium + (NH4 ). beberapa mikroorganisme dapat mereduksi gas dan menggunakan menjadi sumber nitrogen. glutamate synthase (GOGAT). nitrit (NO2-).  Jalur alternatif untuk asimilasi amonia Glutamate dehidrogenase (GDH) mengkatalisis reaksi dua arah untuk membentuk glutamat atau membuang gugus amina dari glutamat . Sebagian besar dipakai untuk pembentukan ammonia atau nitrat Siklus nitrogen dari fiksasi N2-atmosfer secara fisik/kimiawi yang menyuplai tanah bersama presipitasi.nitrogen melimpah di atmosfer. namun berbagai bukti menunjukkan bahwa GDH bukanlah untuk menggantikan GS dan GOGAT namun lebih banyak berperan sebagai mekanisme untuk memisahkan amina (de-aminasi) dari glutamat. Banyak proses yang dilakukan oleh mikroba baik untuk menghasilkan energi atau menumpuk nitrogen dalam bentuk yang dibutuhkan untuk pertumbuhan a. dan amida glutamine dibentuk. nitrat (NO3-). beberapa mikroorganisme membentuk alanin asam amino dalam reaksi aminasi reduktif yang dikatalis oleh alanin dehidroginase Piruvat +NH4+NADH (NADPH)+H+↔L-alanin + NAD+ (NADP+)+H2O Rute utama untuk pembentukan amoniak adalah pembentukan glutamat dari α-Ketoglutarat (sebuah siklus TCA intermediet). Untuk reaksi ini baik ferredoxin yang direduksi (dari photosystem) atau NADPH (dari respirasi) diperlukan untuk pemeliharaan siklus asimilasi amonia dan yang selebihnya dapat digunakan untuk biosynthesis protein. Dalam jalur ini asam amino glutamate bertindak sebagai akseptor untuk amonia. 2-oxoglutarate + NH4+ + NAD(P)H glutamate + H2O + NADP+ Meskipun reaksi diatas nampak seperti asimilasi amonium menjadi glutamat. Ini diaktifkan oleh pH tinggi dan konsentrasi ATP dan magnesium yang tinggi. dan gas nitrogen (N2). dan dalam produk antara dekomposisi bahan organik atau humus dibangun. Salah satu contoh enzim ini adalah aspartate aminotransferase (AAT) yang mengkatalis reaksi 149 . kedua-duanya molekul glutamate dapat bertindak sebagai suatu akseptor amonia. Sel-sel mati ini bersama dengan sisa tanaman/hewan akan menjadi bahan organic yang siap didekomposisikan dan melalui serangkaian proses mineralisasi (aminisasi. Setelah terasimilasi menjadi glutamin dan glutamat. Glutamine synthetase mempunyai suatu gaya affinitas sangat tinggi untuk amonia dengan begitu mampu untuk memasuki amonia sekalipun konsentrasinya sangat rendah. manakala pemberian amonia besar. dan nitrifikasi) akan melepaskan N-mineral (NH4+ dan NO3-) yang kemudian di immobilisasi oleh tanaman atau mikrobia Nitrogen hadir di lingkungan dalam berbagai bentuk kimia termasuk nitrogen organik. Banyak bakteri dan jamur menggunakan glutamat dehidroginase ketika konsentrasi amoniak tinggi. Nitrogen organik dapat berupa organisme hidup. yang belakangan adalah produk dari siklus asam trikarboksilik (Gambar 7-4). Proses siklus nitrogen mengubah nitrogen dari satu bentuk kimia lain. amonifikasi. α-Ketoglutarat + NH4++NADPH (NADH) +H+↔glutamat+NADP+(NAD+)+H2O Perbedaan kemampuan dalam penggunaan NADPH dan NADH sebagai agen pereduksi adalah pada sintesis glutamate. mengkatalisasi perpindahan kelompok amida (-NH2) dari glutamine ke 2-oxoglutarate. dan satu molekul glutamine meninggalkan siklus itu. atau humus. Pembentukan amonia Nitrogen Amoniak dapat dibentuk menjadi materi organic dengan relative mudah dan langsung karena mudah tereduksi daripada nitrogen anorganik dalam bentuk lain . Enzim yang berperan dalam hal ini secara umum dikenal sebagai aminotransferase. sebagai contoh. Sebagai suatu alternatif. nitrogen kemudian diinkorporasikan menjadi asam amino lain melalui reaksi transaminasi.

kloroplas. dan dalam transport karbon dari sel mesofil menuju sel seludang pembuluh (bundle sheath) pada fiksasi karbon c4. Aminotransferase ditemukan dalam sitoplasma. Intensitas cahaya dan kandungan karbohidrat yang tinggi. Amonium dapat diasimilasi melalui kombinasi dengan glutamat untuk membentuk glutamin (Glutamin sintetase) atau dengan aminasi reduktis 2-oxoglurata yang menghasilkan glutamat (glutamat dehidrogenase).  Peran asparagin dan glutamin sebagai jembatan antara metabolisme N dan C Asparagin. Fungsinya bukan sebagai prekursor protein. ( Foster. Jalur utama sintesis asparagin mencakup transfer amida nitrogen dari glutamin ke aspartat (Gambar 7-4 bawah): Glutamine + aspartate + ATP asparagine + glutamate + AMP + PPi Reaksi tersebut dikatalis oleh asparagine synthetase (AS). dan peroksisom. mitokondria. namun sebagi senyawa kunci untuk transport dan penyimpanan nitrogen karena stabilitasnya dan tingginya rasio nitrogen:karbon (2N:4C untuk asparagin vs. yang banyak ditemukan pada sitoplasma daun dan akar dan dalam nodul pemfiksasi N. Donor elektron (kofaktor tereduksi) diperlukan dalam reaksi tersebut: feredoksin pada daun hijau dan NADH pada jaringan non-fotosintetik. serin. alanin. 2010)  Nitrogen ditransfer dari glutamin atau glutamat menjadi asam amino lain melalui reaksi transaminasi Semua reaksi transaminasi memerlukan kofaktor pyridoxal phosphate (vitamin B6). Aspartate adalah asam amino yang berpartisipasi dalam malate-aspartate shuttle dari mitokondria dan kloroplas menuju sitoplasma. merupakan bentuk amida pertama yang teridentifikasi. Dua glutamat dihasilkan dari glutamin dan 2-oxoglutarat (glutamat sintase). sehingga mendorong asimilasi N 150 . yang diisolasi dari asparagus pada awal 1806. 2N:5C untuk glutamin atau 1N:5C untuk glutamat). glioksisom. Gambar Struktur dan lintasan senyawa terkait dengan metabolisme amonium. asapartat. kondisi yang merangsang aktivitas glutamine synthetase (GS) dan Fd-glutamate synthase (Fd-GOGAT). Enzim biosintesis asam amino karena daun tanaman atau kloroplas yang diisolasi jika dipajankan pada CO 2 diberi label radiokatif akan segera menggabungkan C berlabel menjadi glutamat. menghambat ekspresi gen dan aktivitas asparagine synthetase (AS). Kondisi cukup energi (cahaya dan karbohidrat tinggi) menstimulir GS dan GOGAT. dan glisin.Glutamate + oxaloacetate aspartate + 2-oxoglutarate Dimana gugus amina dari glutamat ditransfer menuju atom C-2 asam keto. menghambat AS. bob.

Sebagian besar keberadaan N2 di dalam tanah dalam bentuk molekul anorganik.sel eukariotik memiliki keterbatasan kemampuan dalam melakukan ini). Pada asimiasi nitrat. senyawa yang kaya nitrogen dan cukup stabil untuk transport jarak jauh atau untuk disimpan dalam jangka waktu lama (asparagine is stable for long-distance transport or long-term storage). Nitrat pertama kali direduksi menjadi amoniak sebelum nitrogen dapat dikonversikan menjadi bentuk organik. Organisme yang sudah mati diuraikan melalui proses hidrolisis yang menyebabkan protein terurai menjadi asam amino. keterbatasan energi menghambat GS dan GOGAT. Jika tumbuhan atau hewan mati. Reduksi asimilasi nitrat pada bakteri terjadi di kritoplasma. 4 pasang ATP dan elektron dibutuhkan N2+8H++8e-+16ATP→2NH3+H2+16ADP+16Pi 151 . Karena amoniadan nitrat berada dalam jumlah yang sedikit dan hanya beberapa organisme prokariotik yang dapat melakukan fiksasi nitrogen (sel. Reduksi nitrogen membutuhkan pelepasan ATP dalam jumlah yang besar yakni 8 elektron dan 16 molekul ATP. Proses ini disebut deaminasi. senyawa yang kaya akan karbon dan berpartisipasi dalam sintesis. Bakteri yang hidup bebas seperti azetobacter Klebsiella. sehingga mendorong asimilasi N menuju asparagin. fungi. dimana ini terjadi selama pernafasan anaerobik reduksi dissimilasi nitrat. dan Methanococcus 2. Proses ini terjadi pada bakteri. Amonifikasi dibantu oleh beberapa mikroorganisme seperti bakteri dan jamur.+ NADPH + H+→NO2-+NADP++H2O Nitrit selanjutnya direduksi menjadi amoniak dengan penambahan dua elektron yang dikatalisis oleh oleh nitrite reductase dan mungkin enzim lainnya. Langkah pertama dalam asimilasi nitrat adalah reduksi menjadi nitrit oleh nitrate reductase. NADPH adalah sumber elektron. c. Proses reduksi nitrat ini dinamakan reduksi asimilasi nitrat. nitrogen organik diubah menjadi amonium (NH4+) oleh bakteri dan jamur.alga. nitrat dibentuk menjadi materi organik dan tidak ikut dalam pembentukan energi. Sianobakteri seperti (Nostoc dan Anabaena) Reduksi nitrogen menjadi amonia dikatalisis oleh enzim nitrogenase. Clostridium.molekul nitrogen adalah gas tidak reaktif dengan tiga ikatan diantara dua atom nitrogen. Amonia merupakan senyawa dalam bentuk gas. Bakteri yang hidup bersimbiosis tanaman Legumes seperti Rhizobium 3. Fiksasi nitrogen terjadi pada 1. Sebaliknya. sebaliknya pada tanah yang lembab/basah ammonia terlarut dalam air dan membentuk ion ammonium (NH4+ ). Hidroxylamine mungkin sebuah internediet ( antara) amonia kemudian dibentuk menjadi asam amino. Reduksi asimilasi nitrat Nitrogen dalam nitrat (NO3-) lebih mudah teroksidasi daripada dalam amoniak. Walaupun ikatan enzim intermediet dalam proses ini masih belum diketahui. Proses selanjutnya. NO3. Nitrogen direduksi oleh penambahan dua elektron. laju dari proses ini terbatas pada pertumbuhan tanaman.molekul nitrogen menjadi amonia adalah cukup eksergonik. Reduksi molekul. menstimulir AS. Selanjutnya ion amonium dapat digunakan oleh bakteri dan tumbuhan untuk sintesa asam amino. enzim yang mengandung dan molibdenum. tetapi reaksi ini memiliki energi aktivasi yang tinggi karena molekul.menjadi glutamin dan glitamat. b. Fiksasi Nitrogen Reduksi gas nitrogen pada atmosfer menjadi ammonia dinamakan fiksasi nitrogen. asam amino yang sudah terbentuk dikonversi menjadi ammonia (NH3) dan proses ini disebut amonifikasi. pada tanah yang kering mudah menguap.

sianida. Reduksi N2 menjadi NH3 terjadi dalam tiga tahap. Walupun begitu. Karena kebutuhan untuk memelihara nitrogen. Simbiosis nitogen-bakteri dapat menghabiskan hampir 20% ATP yang dihasilkan oleh tanaman. Pada dasarnya sintesis asam amino merupakan reaksi aminasi (pengikatan gugus amin) karboksilat. Ikatan ATP menyesuaikan dengan protein Fe dan memperendah potensialnya. E. Untuk memaksimalkan efisiensi dan ekonomi. HCΞCH + 2H++2e-→H2C=CH2 Laju reduksi dari asitilena menjadi etilena digunakan dalam estimasi aktivasi nitrogenase. Gugus amin biasanya berasal dari amonia. fotosintesis pada sianobakteri. Rute utama asimilasi amonia adalah sintesis glutamin oleh sistem glutamin syinthetase-glutamat synthetase. pengikatan gugus amin ke karboksilat dapat langsung (1 tahap) atau tidak langsung (2 tahap). ikatan ATPNdihilangkan untuk mereduksi protein MoFe. jalur pentose phosphate. proses respirasi pada pemfiksasi nitrogen aerobik atau fermentasi pada bakteri anaerob seperti misalnya clostridium pasteurianum (bakteri anaerob) mereduksi ferredoksin selama oksidasi piruvat dimana Azetobacter aerob menggunakan elektron dari NADPH untuk mereduksi feredoksin.000mw) yang diikuti satu atau dua protein Fe (64. protein MoFe (220. Skeleton asam amino diperoleh dari asetil koA dan dari intermediet (antara) siklus TCA. proteksi melawan oksigen dilakukan oleh struktur istimewa yang dinamakan heterokis. 152 . protein Fe mengandung 4 atom besi. Pengikatan gugus amin langsung terdapat pada proses sintesis glutamat dari -ketoglutarat .000mw) . dan azide). Nitrogenesa cukup sensitif dengan O2 dan harus dilindungi dari pentidakaktifan O2 didalam sel. (asetilena. protein MoFe mengandung 2 atom molibdenum dan 28 sampai 32 atom besi. setiap tahap membutuhkan sebuah pasangan elektron. Protein Fe pertama direduksi oleh feredoksin kemudian mengikat ATP. Dalam banyak sianobakteri. karbon. Pada simbiosis dengan pemfiksasi nitrogen Rhizobium memunculkan difusi amonia keluar sel bakteri dan mengasimilasi sel legume sekitar. Reaksi H2 dengan diimin (HN=NH) untuk membentuk N2 dan H2. Protein MoFe yang telah tereduksi memberikan elektron pada atom nitrogen. Reaksi ini memerlukan glutamat dehidrogenase. Molekul nitrogen yang tereduksi menjadi amonia. prekursor untuk biosintesis asam amino diperoleh dari beberapa jalur utama ampiobolik. Seluruh proses ini membutuhkan paling tidak 8 elektron dan 16 ATP sebab nitrogenase juga mereduksi proton pada menjadi H2. zat seperti turunan purin alantoin dan alantoik juga disintesis dan digunakan untuk transfer nitrogen menjadi bagian lain tanaman. Akan tetapi. SINTESIS ASAM AMINO Sintesis asam amino membutuhkan susunan dari kerangka karbon yang cocok dan ini melalui proses komplek yang melibatkan banyak tahap. Walaupun jalur sintesis asam amino tidak dijelaskan secara rinci sebuah survey mengenai pola umum biosintesis asam amino mungkin diketemukan dalam textbook pengenalan biokimia. ATP dihidrolisis ketika terjadi transfer elektron. 6 elektron yang ditransfer membutuhkan 12 ATP setiap N2 direduksi.Elektron diperoleh dari ferredoksin yang telah tereduksi dengan berbagai macam cara . Nitrogenase adalah sistem komplek yang mencakup dua komponen protein utama. jalur sintesis asam amino biasanya teregulasi secara rumit oleh allosteric dan mekanisme umpan balik. Nitrogenase dapat mereduksi bermacam molekul yang mengandung ikatan rangkap tiga. dan energi. amonia dapat terbentuk menjadi senyawa organik. Glikolisis.

sehingga enzimnya disebut transaminase. Sintesis asam amino lainnya memerlukan glutamat sebagai sumber nitrogen (gugus amin) ke karboksilat. menjadi glutamat. Gugus amin ditransfer ke -ketoglutarat menghasilkan glutamat (dikatalisis glutamin -oksoglutarat transaminase atau GOGAT).1993) Gambar Reaksi GS-GOGAT (anonim. Pada reaksi ini gugus amin lebih dulu diinkorporasi ke glutamat menghasilkan glutamin (dikatalisis glutamin sintase/GS). Hal ini karena reaksi GH memerlukan kadar amonia yang tinggi di habitatnya. sedangkan reaksi GS-GOGAT memerlukan sedikit amonia di habitatnya. Reaksi ini merupakan proses transaminasi. Glutamin yang kehilangan amida.Gambar 813 Reaksi glutamat dehidrogenase (Kimball. 153 . 2010) Pengikatan gugus amin tidak langsung terjadi pada proses sintesis glutamat dari -ketoglutarat dan memerlukan glutamat lainnya. Dari kedua tipe reaksi di atas (GH dan GS-GOGAT) tampaknya reaksi GS-GOGAT merupakan reaksi yang paling mungkin terjadi di alam.

SINTESIS PURIN. dan urasil dan nama nukleosidanya adalah sitidin. Sintesis purin sangatlah komplek.konstituen penting dari beberapa koenzim. dan komponen dinding sel.mula dari asam orotik. Jika tanpa fosfat. dan ketoglutarat. Biosintesis Pirimidin Berdasarkan asal atom karbon dan nitrogen. Banyak dari jalur biosintetis F. skeleton purin diperoleh dari beberapa komponen dimana pirimidin mula. Jadi nukleotida adalah nukleosida fosfat. dan fosfat. oksaloasetat. 154 . dan NUKLEOTIDA Nukleotida adalah polimer molekul purin atau pirimidin. timidin. sebuah kondensasi produk dari carbomyl phosphates dengan asam aspartic. ribosa atau deoksiribosa. timin. aspartat glutamate akan ditransminasi secara langsung dari piruvat. PIRIMIDIN. Tiga molekul pirimidin penyusun nukleotida adalah sitosin. G gambar Monomer nukleotida Gambar Molekul purin (atas) dan pirimidin (bawah) (Kimball. amonia yang berasal dari glutamin. asam amino. dan uridin. dan CO2 yang berasal dari karbonat. pirimidin disintesis dari aspartat.Rangkaiam cabang asam amino dari rute pusat. Dua molekul purin penyusun nukleotida adalah guanin dan adenin dan nama nukleosidanya adalah guanosin dan adenosin. alanin. dan memiliki peran penting dalam aktivasi dan transfer gula. 1993) Banyak mikroorganisme dapat mensintesis purine dan pirimidin mereka sendiri. Nukleotida adalah building blocks dari DNA atau deoxribunucleic acid dan RNA atau ribonucleic Acid. maka polimer tersebut dinamakan nukleosida. juga merupakan konstituen.

Reaksi ini dikatalisis karbamoil fosfat sintetase.1993) dikatalisis dihidroorotase. Reaksi ini dikatalisis dihidroorotat dehidrogenase.vlsm. Hidrasi karbamoil aspartat menjadi Reaksi dihidroorotat. Reaksi ini dikatalisis aspartat transkarbamoilase.Prekursor pirimidin (kiri) dan purin (kanan) (http://free. sehingga menghasilkan orotidin monofosfat (melepaskan pirofosfat). Selanjutnya. Terikatnya 5-fosforibosil pirofosfat (disintesis dari fosforilasi ribosa 5-fosfat) pada atom nitrogen dari orotat. Reaksi ini dikatalisis orotat fosforibosil transferase. aspartat terikat pada karbamoil. Gambar Biosintesis pirimidin (Kimball.org.2009) Sintesis nukleotida pirimidin dimulai dari fosforilasi aminasi karbonat. Aminasi dan fosforilasi karbonat menjadi karbamoil fosfat. Dehidrogenasi (oksidasi) dihidroorotat menjadi orotat. sehingga menghasilkan karbamoil aspartat (melepaskan fosfat). Dekarboksilasi orotidin monofosfat menjadi uridin monofosfat 155 .

sehingga menghasilkan 5fosforibosil 5-aminoimidazol. Fosforilasi uridin monofosfat menjadi uridin difosfat (UDP). Reaksi ini dikatalisis orotidin fosfat dekarboksilase. Pembentukan struktur cincin pada fosforibosil N formilglisinamidin. Reaksi ini dikatalisis fosforibosil pirofosfat amidotransferase.sehingga menghasilkan 5-fosforibosil N formilglisinamidin. sehingga menghasilkan 5-fosforibosil N formilglisinamida. glisin. Terikatnya formil pada fosforibosil glisinamida. Reaksi ini dikatalisis nukleosidadifosfat kinase. Timidin disintesis dari metilasi UTP. sehingga menghasilkan 5-fosforibosil glisinamida. Fosforilasi uridin difosfat menjadi uridin trifosfat (UTP). glisin. Reaksi ini dikatalisis fosforibosil formilglisinamida sintetase. sehingga menghasilkan 5-fosforibosil 4-karboksamida 5-amidoimidazol. dan glutamin Sintesis cincin purin dimulai dari terikatnya atom nitrogen glutamin pada fosforibosil (berasal dari fosforibosil pirofosfat) menghasilkan 5-fosforibosilamin. Reaksi ini dikatalisis fosforibosil aminoimidazol sintetase. Biosintesis Purin Atom karbon dari purin berasal dari format atau serin. Reaksi ini dikatalisis nukleosidamonofosfat kinase. Reaksi ini dikatalisis fosforibosil aminoamidazol karboksilase. Tersisipnya glisin ke 5-fosforibosilamin. Atom nitrogen dari purin berasal dari aspartat. Terikatnya aspartat pada asam 5-fosforibosil 5-aminoimidazol 4-karboksilat. sehingga menghasilkan asam 5-fosforibosil 4-N suksinokarboksamida 5aminoimidazol. Reaksi ini dikatalisis fosforibosilaminoamidazol suksinokarboksamida sintetase. Reaksi ini dikatalisis fosforibosil formilglisinamidin sintetase dan memerlukan energi. sehingga menghasilkan asam 5-fosforibosil 5-aminoimidazol 4-karboksilat. Pengikatan gugus NH2 dari glutamin. Sitidin trifosfat merupakan prekursor sitidin. Uridin trifosfat merupakan prekursor uridin.(UMP). Reaksi ini memerlukan energi (ATP) dan dikatalisis fosforibosil glisinamida sintetase. Reaksi ini memerlukan energi/ATP. dan karbon dioksida. Terikatnya amonia pada uridin trifosfat menghasilkan sitidin trifosfat (CTP). Karboksilasi 5fosforibosil 5-aminoimidazol. Terlepasnya 4 karbon yang semula berasal dari aspartat dari reaksi sebelumnya (Jadi aspartat akhirnya hanya menyumbang nitrogen saja). 156 .

sehingga menghasilkan 5-fosforibosil 4-karboksamida 5-formamidoimidazol. NH3. IMP merupakan prekursor dari semua nukleotida purin. Asam nukleat dari makanan akan dikatabolisme menjadi asam urat (purin)dan β-alaninatau β-amino isobutirat (pirimidin)dan CO2. Terikatnya formil ke 5-fosforibosil 4-karboksamida 5amidoimidazol. Semua sel dalam tubuh dapat mensin-tesa purin dan pirimidin.1993) Reaksi ini dikatalisis adenilosuksinat liase. Pembentukan cincin (kedua) dari 5fosforibosil 4-karboksamida 5-formamidoimidazol. Reaksi ini melepaskan air dan dikatalisis inosinat siklohidrolase. Reaksi ini dikatalisis fosforibosil amidoimidazol karboksamida formiltransferase.Gambar Biosintesis purin (Kimball.Tidak ada purin atau pirimidin dari makanan yang digabung dgn asam nukleat jaringan Purin Pirimidin Nukleotida (masterprima. 2009) 157 . sehingga menghasilkan inosinat monofosfat (IMP).

Bakteri anaerobic dan beberapa bakteri aerobic membuat ikatan rangkap selama sintesis fatty acid dengan meng-dehidrasi hidroksi fatty acids. komponen.atom karbon. sebuah membrane lipid yang komplek terbentuk dari hasil glikolisis. Jalur anaerobic terjadi pada beberapa (gram-negative bacteria) seperi Escherichia Coli dan Salmonella typhimurium. biosintesis fatty acid. Dehidroksiaseton phosphate mejadi gliserol 3-phosphate. G. Walaupun begitu. Sebuah CDP (Cytidine diphosphate) yang mempunyai peran sama seperti adenosine difosfat. Sintesis terjadi setelah asetat dan malonat ditransfer dari koenzim A ke grup sulfyhydril dari ACP (Accetyl Carrier Protein). Turunan CDP akan bereaksi dengan serine untuk membentuk fosfolipid fosfatidilserin dan dekarboksilasi yang menghasilkan phosphatidylathanolamine. Malonyl-ACP bereaksi dengan fatty acid-ACP untuk menghasilkan CO2 dan fatty acid –ACP yang lebih lama. protein kecil yang membawa rantai fatty acid yang berkembang selama sintesis. Gliserol berasal dari reduksi glikolitik intermediet.macam lipid ditemukan pada mikroorganisme terutama pada membrane sel. CO2 tersebut hilang ketika Malonyl. Beberapa diantaranya tidak jenuh (mempunyai satu atau lebih ikatan rangkap). Kehilangan CO2 membuat reaksi ini berkesudahan. membentuk Malonyl-koA. (gram-positive Bacteria) seperti Lactobacillus plantarum dan clostridium pasterianum ) dan sianobakteria. Fosfolipid adalah komponen utama dari membrane sel eukariotik dan prokariotik. tetapi beberapa ada yang bercabang. Pada jalan ini. yang mana kemudian akan teresterifikasi dengan dua fatty acid menjadi asam phosphatidik. Pertama. Gram negative bacteria mempunyai fatty acid siklopropana (fatty acid dengan satu atau lebih cincin siklopropana pada rantainya) Sintesis fatty acid dikatalisis oleh fatty acid synthetase komplek dengan asetil koA dan Malonyl-koA sebagai substratnya dan NADPH sebagai donor electron. Sintesis ini biasanya diproses dengan jalan phosphatidic acid. Banyak dari mikrobia fatty acid merupakan rantai lurus. Mikroorganisme eukariotik seringkali menyimpan karbon dan energi sebagai triacylgliserol. Fatty acid tak jenuh disentesis dengan dua cara. Sintesis Lipid Bermacam. Bakteri eukariotik dan aerobic seperti bacillus megaterium membangun sebuah jalur aerobic menggunakan NADPH dan O2. Sebagian besar mengandung fatty acid atau turunannya. O O _ + R (CH2)9-C-SCoA + NADPH + H +O2→ R-CH=CH-(CH2)7-C-SCoA+NADPH++2H2O Sebuah ikatan rangkap terbentuk diantara karbon 9 dan 10 dan O2 tereduksi menjadi air dengan dengan electron yang diberikan oleh fatty acid dan NADPH. Fatty acid disiapkan untuk penambahan dua atau lebih atom karbon.ACP memberikan atom karbon pada rantai. kedua. β-keto yang berasal dari reaksi kondensasi awal dipindahkan dengan proses tiga langkah yang melibatkan dua reduksidan senuah dehidrasi. Katalisator sintesis menambahkan dua atom karbon pada rantai terakhir faaty acid dalam dua proses. dan biosintesis asam amino. fosfat adalah hidrolisis dari phospatidic acid oleh diacylglycerol dan fatty acid ketiga diberikan oleh hasil triagliserol.Seperti yang dijelaskan sebelumnya ada dua tipe asam nukleat yakni DNA dan RNA yang disusun oleh building blocks nukleotida. beberapa mikroorganisme membutuhkan CO2 demi pertumbuhan yang baik tetapi itu tidak dapat dilakukan tanpa kehadiran fatty acid seperti oleic acid (fatty acid rantai 18 tak jenuh . Carbon dioksida sangat diperlukan dalam sintesis fatty acid tetatpi tidak secara permanen terbentuk.. Fatty acid adalah asam monokarbolik dengan rantai alkil panjang yang mempunyai serangkaian atom. Polimer keduanya dibuat dari formasi ikatan kovalen antar gula dan fosfat. bakteri sintesis phosphatidylethanolamine. Malonil-koA berasal dari karboksilasi ATP dari asetil koA. Oksigen tidak diperluakan untuk sintesis ikatan rangkap dua pada jalur ini. melalui pembentukan awal CDP-diacylglyserol. gliserol teresterifikasi tiga fatty acid. Dua asam nukleat berbeda dalam gula berbeda dalam nukleitida yakni deoksiribosa dan ribose.komponen utama membrane sel. 158 . ATP digunakan untuk menambahkan CO2 ke Asetil-koA.

Hal ini terjadi pada gram positive bacteria yakni (staphylococcus aureus). 2. Jika interbridges (jembatan dalam) pentaglisin diperlukan.komponen peptodoglican melalui membrane hidrofobik. Unit pengulang Peptidoglikan NAM-NAG yang sudah sempurna diangkut menyeberangi membrane menuju permukaan luar oleh pembawa bactoprenol pyrophosphate 6. NAM-Peptida ditrnasfer dari UDP menuju baktoprenol fosfat pada permukaan membrane. karena reaksi sintesis terjadi di dalam dan di luar membrane sel. Hanya aka nada sebuah kelompok yang bereaksi dengan subterminal D-alanin. Naktoprenol ialah karbon-55 alkohol yamh terletak pada NAM oleh pirofosfat dan memindahkan komponen. Pada E.H. glisin ditambahkan menggunakan Molekul glisil-tRNA bukan ribosom 5. Sintesis peptidoglican terjadi dalam delapan tahap : 1. Proses yang sama terjadi kepada interbridges terlibat. Seperti misalnya penisilin menyerang reaksi transpeptidasi dan basitrasin yang menghalangi defosforilasi bactoprenol rophosphate. Pembawa bactoprenol kembali kedalam membrane. Rantai polisakarida akan saling berhubungan melalui pentapeptida atau jembatandalam (interbridges) Sebuah struktur yang rumit (berkelit-kelit atau berseluk beluk ) membutuhkan proses biosintesis yang rumit juga. Sintesis peptidoglikan Dinding sel bakteri mengandung mengandung molekul komplek peptidoglican yang mencakup rantai polisakarida panjang yang terbuat dari pertukaran asam N-asetilmuramik (NAM) dan residu Nasetilglukosamin (NAG). Turunan UDP dari (N-acetylmuramic acid dan N-acetylglucosamine) di sintesis kritoplasma. menghasilkan residu D-alanin. UDP-NAG menambahkan NAG ke NAM untuk membentuk unit pengulang peptidoglikan. Rintangan atau hambatan pada setiap tahap pada sintesis memperlemah dinding sel dan bisa mengakibatkan osmotic lisis. asam amino yang bebas dari asam diaminopimelik menyerang subterminal D-alanin. Alfonsina AAT (115061100111027) “ apakah dalam siklus glukeogenesis yang merupakan proses pembalikan glikolisis. 3. Fosfat dihasilkan selama proses. Unit Peptidoglikan diletakkan pada akhir rantai peptodoglican untuk memperpanjang oleh unit pengulang. Sintesis peptidoglikan mudah diserang dan mengalami gangguan oleh agen antimikroba. ATP digunakan untuk membentuk terminal ikatan peptide didalam membrane. 4.Coli. LAMPIRAN Pertanyaan dan jawaban Pertanyaan lisan 1. Asam amino ditambahkan secara berurutan menjadi UDP-NAM untuk membentuk rantai pentapeptida (dua terminal D-alanin ditambahkan sebagai dipeptida) Energi ATP digunakan untuk membuat ikatan peptide tetapi tRNA dan ribosom tidak terlibat. Peptide cross-link rantai peptidoglikan terbentuk oleh transpeptidado. Rantai Pentapeptida terletak pada NAM. Energi atp tidak lagi dibutuhkan ketika transpeptidasi yang terjadi di luar. 8. 7. dapatkah kedua siklus berjalan secara bersama-sama?” 159 . Dua partisipan carrier yakni UDP (Uridin Difosfat)dan baktoprenol. Sintesis peptidoglican adalah sintesis dengan proses multi step.

Reinanto pandu (115061107111009) “ dalam fotosintesis anoksigenik kan ada reaksinya. seperti TeO3-2 dan SeO3-2. Selain itu. Karena pada dasarnya regulasinya berbeda” Alberus Ardika (115061101111005) “ tadi dijelaskan dalam presentasi siklus sintesis purin prosesnya.1995) Pada bakteri fotosintetik ungu non sulfur anoksigenik. bakteri fotosintetik purple (sulfur dan non sulfur). Bakterioklorofil yang dimiliki bakteri ini dapat digunakan sebagai salah satu ciri morfologi dengan melihat spektra maksimumnya. pada umumnya menujukkan resistensi yang tinggi terhadap oksianion logam tanah jarang. lalu maksud kotak kecil ditengah itu apa? (menunjuk gambar) ” Jawaban “ gambar di tengah itu penjelasan dari proses awal sintesis purin yakni dimulai terikatnya atom nitrogen glutamine pada fosforibossil (berasal dari fosforibosil pirofosfat) menghasilkan 5.fosforibosilamin. Reaksi ini dikatalisis fosforibosil pirofosfat amidotransferase . pigmen karatenoid. respirasi anerobik. dan fermentasi. Pertanyaan Tertulis 1.2. bakteri ini telah diketahui sejak awal abad ke-20 ketika pertama kalinya diisolasi oleh Hans Molisch. tapi berdasarkan prinsip. oleh karena itu penambahan larutan oksianion (biasanya K2TeO3) memungkinkan isolasi kelompok bakteri tersebut secara selektif. lalu senyawa-senyawa yang dihasilkan itu untuk apa?” “ Reaksinya adalah seperti ini • Fotosintesis bakteri ungu non belerang • CO2 + 2CH3CHOHCH3 → (CH2O) + H2O + 2CH3COCH3 • Fotosintesis bakteri hijau belerang • CO2 + 2H2S → (CH2O) + H2O + 2S Berdasar pada sumber yang saya baca pada keadaan anaerob tidak diproduksi oksigen. meraka ini dikenal dengan nama kelompok bakteri fotosintetik anoksigenik. Sebagian besar bakteri fotosintetik ungu non sulfur anoksegenik. AMP menghambat sintesis adenilosuksinat dari inosinat. antara lain . sedang GMP menghambat perubahan substrat dari sintesis AMP. Freshsya Zatalini (115061100111003) “ Apakah persyaratan dari asimilasi bagi mikroba? Bagaimana bakteri yang tidak punya klorofil melakukan asimilasi? Jawaban 160 . organisme-organisme ini pada umumnya merupakan penambat nitrogen yang hidup bebas.itu menghasilkan AMP dan GMP. fotoautrotop atau fotoheterotrop pada kondisi anaerobik. Jawaban “ walaupun siklus glukeogenesis reversible. Ada beberapa mikroorganisme yang mampu melakukan fotofosforilasi dalam keadaan anaerob.” 3. maka kelompok ini bibagi menjadi . Kemampuan bakteri ini untuk melakukan fotofosforilasi karena adanya piranti fotosintesis dalam selnya yang berupa pigmen fotosintesis. bakteri fotosintetik hijau (sulfur dan non sulfur). Bakteri-bakteri ini dapat melakukan berbagai macam metabolisme. karena pada konsentrasi yang tinggi akan menjadi racun .prinsip biosintesis dijelaskan bahwa jalur anabolisme dan katabolisme (dalam hal ini merupakan glikolisis dan glukeogenesis) tidak pernah berjalan bersama walaupun banyak enzim yang digunakan bersama. konsentrasi sulfid harus benar-benar ditekan serendah mungkin. dan Heliobacteria(white. Berdasarkan bakteriaklorofil yang dimiliki oleh anoksegenik. seperti bakteri dari genus Rhodobacter. dan bakterioklorofil.

fosfor dan nitrogen.nitrogen) disamping karbon dan oksigen” “ asimilasi dilakukan oleh semua mikroorganisme yang membutuhkan. Begitu pula dengan sintesis peptidoglikan akan terjadi pada setiap kondisi karena dinding sel bakteri mengandung kompleks peptidoglikan” 3. “ Apakah dalam suatu sintesis itu mengalami hambatan? Jika iya apa?” Jawaban : “ pada sintesis Peptidoglikan mudah diserang dan mengalami gangguan oleh agen mikroba. bukan pengertian. Gregorius Bagas (115061105111005) 161 . karena dinding sel bakteri mengandung molekul kompleks peptidoglikan yang mencakup rantai polisakarida panjang yang terbuat dari pertukaran NAM (asan N-asetilmuramik) dan residu NAG (N-asetilglukosamin)” “ sintesis purin terjadi pada bakteri karena basa dari nukleotida akan digunakan untuk membentuk materi pembawa genetic RNA dan DNA. Ridhani Ridha R (115061100111009) “ Pada siklus tersebut kalau tidak salah namanya siklus purimidin kenapa hasilnya tidak purimidin? Mungkin dari siklus yang lain ada seperti itu?” Jawaban : “ sintesis purimidin atau sintesis pirimidin itu sama. Penjelasan mikroorganisme prokariotik pada slide adalah sebagai tambahan. karena mikroba membutuhkan asimilasi (fosfor. dan nitrogen dalam jumlah banyak untuk biosintesis. Dalam presentasi dan makalah kami dijelaskan tentang asimilasi sulfur.masing diasimilasi atau dibentuk menjadi molekul – molekul organic melalui rute yang berbeda (tergantung apa yang diasimilasi) Sharfina W (115061105111003) “ Sintesis Purin dan Peptodoglikan terjadi saat kondisi apa? Di bagian mana kedua sintesis itu dapat terjadi?” Jawaban: “ purin adalah jenis basa yang disintesis dalam bentuk nukleotida dan terjadi dalam tingkat sel bakteri karena nukleotida ini akan membentuk building blok dari DNA dan RNA. “ Asimilasi adalah pembentukan molekul kompleks dari molekul sederhana yang membutuhkan energy yang tinggi. sedangkan golongan purimidin itu ada pada RNA yang terdiri dari urasil dan sitosin. Golongan pirimidin itu ada pada DNA yang terdiri dari timin dan sitosin. sulfur. Rintangan atau hambatan pada setiap tahap pada sintesis memperlemah dinding sel dan bisa mengakibatkan osmotic lisis. tidak terbatas bakteri yang mempunyai klorofil ataupun tidak. Yakni merupakan jenis basa yang disintesis dalam bentuk nukleotida untuk membentuk DNA dan RNA. sulfur. Mekanismenya masing. Tapi untuk mekanisme dan regulasi sintesisnya sama” Maratus Sholihah (115061100111019) “ apakah benar dari apa yang anda jelaskan bahwa fotosintesis hanya terjadi pada mikroorganisme prokariotik? Kemudian bagaimana untuk yang eukariotik?” Jawaban : “ fotosintesis itu terjadi pada mikroorganisme yang mempunyai klorofil dan dibagi menjadi anoksiganik (tidak menghasilkan O2) dan oksigenik (menghasilkan O2). Jadi tidak ada persyaratan.” Adit Iqbal (115061105111005) 4. 5. Perlu ditekankan bahwa asimilasi dilakukan mikroorganisme karena mikroorganisme itu sendiri membutuhkan fosfor. Seperti misalnya penisilin yang menyerang reaksi transpeptidasi dan basitrasin yang menghalangi defosforilasi bactoprenol rophosphate” 6. eukariotik ataupun prokariotik itu bisa asalnkan memiliki klorofil. Sedangkan sintesis Peptidoglikan terjadi pada dinding sel bakteri.2.

Perlu editing(pendandanan) 3. nitrogen dimanfaatkan untuk tiga hal yakni pembentukan ammonia. Bakteri apa itu dan perannya apa?” Jawaban : “ Pada asimilasi nitrogen. dan Methanococcus. sel. Perlu sitasi yang jelas(dituliskan) 2. Proses metabolisme adalah proses yang spesifik dan merupakan proses dasar 2. Tetapi fiksasi nitrogen terjadi pada beberapa bakteri yakni bakteri yang hidup bebas seperti azetobacter klebsiella.sel eukariotik memiliki keterbatasan dalam melakukan ini.“ Pada sintesis nitrogen . reduksi asimilasi nitrat dan fiksasi nitrogen. dan Sianobakteri “ Kesimpulan : 1. bakteri Rhizobium memunculkan sifat amoniak keluar sel bakteri dan mengasimilasi sel legume sekitar. Perlu penjelasan lebih bagaimana fotosintesis aerob dan anaerob serta senyawa-senyawa yang dihasilkan 162 . bakteri yang hidup bersibiosis tanama legumes seperti Rhizobium. dijelaskan tentang bakteri yang terlibat dalam prosesnya. Telah dijelaskan . clostridium. Pada fiksasi nitrogen inilah.Anabolisme dan Katabolisme dan memang benar kedua proses tersebut tidak pernah berjalan bersamaan Komentar : 1.

Sign up to vote on this title
UsefulNot useful