P. 1
Biokimia 1 A

Biokimia 1 A

|Views: 468|Likes:

More info:

Published by: Yayat Cumbritz Dacil on Oct 18, 2010
Copyright:Attribution Non-commercial

Availability:

Read on Scribd mobile: iPhone, iPad and Android.
download as PPTX, PDF, TXT or read online from Scribd
See more
See less

11/11/2012

pdf

text

original

Pendahuluan
Biokimia adalah ilmu yang mempelajari mengenai berbagai molekul di dalam sel hidup dan organisme hidup, termasuk juga reaksi kimia yang terjadi. Secara lebih formal, Murray dkk. (2003) mendefinisikan biokimia sebagai ilmu pengetahuan yang mempelajari dasar kimia kehidupan . Dalam hal ini, menurut Bahasa Yunani, bios berarti kehidupan.

Sel sebagai pusat perhatian dalam biokimia .

mengingat sel merupakan unit struktural kehidupan. . maka biokimia memiliki definisi fungsional yaitu ilmu pengetahuan yang mempelajari unsur-unsur kimia pembentuk sel hidup dan dengan reaksi serta proses yang dijalaninya.

natrium (Na). sulfur (S).Unsur-unsur penyusun tubuh Unsur-unsur utama penyusun tubuh adalah karbon (C). fosfor (P). Rincian dari unsurunsur tersebut tercantum pada Tabel berikut : . oksigen (O) dan nitrogen (N). besi (Fe). klor (Cl). mangan (Mn) dan iodium (I). kalium (K). magnesium (Mg). Selain itu masih terdapat beberapa unsur lain yaitu: kalsium (Ca). hidrogen (H).

4 0.01 0.Tabel Perkiraan Komposisi Dasar Tubuh Manusia (Berdasarkan Berat Kering) No 1 2 3 4 5 6 7 Unsur Karbon Oksigen Hidrogen Nitrogen Kalsium Fosfor Kalium Persentase 50 20 10 8.001 0.5 4 2.8 0.00005 .5 1 No 8 9 10 11 12 13 14 Unsur Sulfur natrium Klor Magnesium Besi Mangan iodium Persentase 0.4 0.1 0.

seperti terinci pada Tabel berikut . polisakarida dan lipid. Di antara biomolekulbiomolekul kompleks tersebut yang merupakan biomolekul kompleks utama adalah DNA. RNA. Biomolekul kompleks tersusun atas molekul-molekul sederhana. protein.Biomolekul-biomolekul kompleks utama penyusun tubuh Unsur-unsur penyusun tubuh sebagaimana disebutkan di atas banyak yang membentuk molekul-molekul besar yang kompleks di dalam tubuh.

umumnya menjadi bagian dari sel yang melangsungkan kerja (enzim.Tabel Biomolekul-Biomolekul Utama di dalam Tubuh Manusia No Biomolekul 1 2 3 DNA RNA Protein Molekul Pembangun Deoksiribonukleotida Fungsi utama Materi genetik Ribonukleotida Asam amino Sistesis Protein Sangat banyak. 4 5 Polisakarida berupa glikogen Glukosa Asam Lemak Lipid . komponen membran sel. misalnya simpanan energi jangka panjang.) Simpanan energi jangka pendek Sangat banyak. dll. unsur kontraktilitas dll.

mineral serta karbohidrat. Rincian komponen tersebut tertera pada Tabel berikut . lemak. protein.Komponen utama penyusun tubuh komponen-komponen utama penyusun tubuh terdiri atas air.

1 1.0 13.6 17.8 6.Tabel Komposisi Kimiawi Normal (Pria dengan Berat Badan 65 kg) No 1 2 3 4 5 Komponen Air Protein Lemak Mineral karbohidrat Berat (kg) 40 11 9 4 1 persentase 61.5 .

Ikatan kimia Molekul di dalam tubuh baik yang sederhana sampai dengan yang kompleks dapat terbentuk karena adanya ikatan kimia. Selanjutnya ikatan non kovalen terdiri atas ikatan ionik. . Ikatan kimia digolongkan menjadi 2 yaitu ikatan kovalen dan ikatan non kovalen. ikatan hidrogen dan ikatan Van Der Waals.

Anda dapat mempelajari lagi tentang valensi dengan membaca buku-buku kimia umum.Ikatan kovalen Ikatan kovalen adalah ikatan yang terbentuk oleh valensi dari masing-masing atom. . atau pelajaran kimia di SMA. Contoh dari ikatan kovalen adalah CO2. Dalam hal ini valensi C adalah 4 dan valensi O adalah 2.

Ikatan kovalen antara sebuah atom C yang bervalensi 4 dan empat buah atom H yang masing-masing bervalensi 1 membentuk CH4 (metana) .

Gugus bermuatan negatif pada substrat Gugus bermuatan positif pada enzim Gambar Ikatan ionik antara gugus karboksil bermuatan negatif pada substrat dan gugus amina bermuatan positif pada enzim . Jarak optimal ikatan ini adalah 28 Angstrom. Contohnya adalah ikatan antara substrat dan enzim.Ikatan ionik Ikatan ionik adalah ikatan antara dua gugus dengan muatan berlawanan.

Ikatan hidrogen Ikatan hidrogen adalah pengikatan satu atom hidrogen oleh dua atom lain yang berbeda. Atom yang mengikat hidrogen lebih kuat disebut donor hidrogen sedang lainnya dinamakan akseptor hidrogen. Ikatan ini dapat dibentuk di antara molekul-molekul tidak bermuatan maupun molekul-molekul bermuatan. .

.Gambar Ikatan hidrogen antar molekul-molekul air (H2O). Perhatikan atom oksigen pada kutub negatif berikatan dengan atom hidrogen pada kutub posif air.

. yang berperan pada saat dua atom berjarak 3-4 Angstrom.Ikatan Van Der Waals Ikatan Van Der Waals adalah daya tarik non spesifik.

Dalam reaksi-reaksi metabolik. Air juga menjadi pelarut biologis yang ideal. air berfungsi sebagai reaktan tetapi juga sebagai produk.Air Air merupakan produk akhir utama dari metabolisme oksidatif makanan. .

.Air sangat mempengaruhi semua interaksi molekuler dalam sistem biologi. Air mempunyai 2 sifat penting secara biologis yaitu sifat polar dan sifat kohesif.

sementara elektron-elektron yang tidak dipakai bersama pada kedua orbital terhibridasi sp3 menempati 2 sudut sisanya. .Air merupakan molekul polar Secara tiga dimensi. Dua buah ikatan dengan hidrogen diarahkan ke dua sudut tetrahedron. air merupakan molekul tetrahedron tak beraturan dengan oksigen pada bagian pusatnya.

Sisi oksigen yang berlawanan dengan dua atom hidrogen cenderung bermuatan negatif karena mengandung lebih banyak elektron. Sisi oksigen adalah kutub negatif dan sisi hidrogen adalah kutub positif. Sedangkan disisi hidrogen cenderung bermuatan negatif. .Molekul air membentuk molekul bipolar (dua kutub). Gambar Molekul air.

Daerah bermuatan positif dan satu molekul air cenderung akan mengarahkan diri kepada daerah bermuatan negatif pada salah satu molekul didekatnya. .Air bersifat sangat kohesif Molekul-molekul air yang berdekatan memiliki afinitas yang tinggi satu sama lainnya. Air beku mempunyai struktur kristal yang sangat teratur di mana seluruh ikatan hidrogen potensial memang terbentuk.

Air cair mempunyai struktur yang setengah teratur dengan kelompok-kelompok molekul berikatan hidrogen yang secara terus menerus terbentuk dan terpecah. Gambar Afinitas yang tinggi antar molekul air .

Atom-atom hidrogen air mengantikan atom hidrogen amida (-NH) sebagai donor ikatan hidrogen.Air merupakan pelarut yang sangat baik bagi molekulmolekul polar. Maka ikatan hidrogen yang kuat antara NH dan CO terjadi jika tidak ada air. . dan atom oksigen air menggantikan atom oksigen karbonil (-CO) sebagai akseptor. Air sangat memperlemah iakatan ionik dan ikatan hidrogen antara molekul-molekul polar dengan cara bersaing daya tarik.

sehingga menjadi pelarut yang baik .Gambar Air bersaing dalam pembentukan hidrogen.

pH merupakan LOG negatif dari konsentrasi ion hidrogen Istilah pH diperkenalkan pada tahun 1909 oleh Sorensen.log [H ] . yang mendefinisikan pH sebagai log negatif konsentrasi ion hidrogen : pH = .

.Definisi ini cukup memadai bagi sebagian besar keperluan biokimia. [H ]. 3. 2. Untuk menghitung pH suatu larutan : 1. Hitung logaritma 10 dasar dari [H ]. pH merupakan negatif dari nilai yang didapat pada langkah 2. Hitung konsentrasi ion hidrogen.

Contoh : pH=-log (H+)=-log 10-7=-(-7)=7.0 Nilai pH yang rendah bersesuaian dengan konsentrasi H yang tinggi. dan nilai pH yang tinggi bersesuaian dengan konsentrasi H yang rendah. .

TERIMA KASIH .

You're Reading a Free Preview

Download
scribd
/*********** DO NOT ALTER ANYTHING BELOW THIS LINE ! ************/ var s_code=s.t();if(s_code)document.write(s_code)//-->