Tryptophan operon

Tryptophan operon
Trp operon adalah contoh operon biosintesis yang ekspresinya diatur oleh sebuah effector:

operon terdiri dari 5 gen struktural bahwa kode untuk tiga enzim yang diperlukan untuk mengkonversi asam chorismic ke triptofan:
y

Anthranilate synthetase Anthranilate sintetase component I - encoded by trpE Komponen I - dikode oleh trpE component II - encoded by trpD Komponen II - dikode oleh trpD N-(5'-phosphoribosyl)-anthranilate isomerase/Indole-3-glycerol phosphate synthase - encoded by trpC N-(5'-phosphoribosyl)-anthranilate synthase fosfat isomerase/Indole-3-glycerol - dikode oleh trpC Tryptophan synthase Tryptophan synthase F -subunit - encoded by trpB FWYFYRMX - dikode oleh trpB E -subunit - encoded by trpA EWYFYRMX - dikode oleh trpA

y

y

operon ini juga mengandung gen penyandi oligopeptide pendek (trpL) yang fungsi dalam redaman (di bawah). Ekspresi diatur oleh TRP represor protein yang dikodekan oleh gen trpR. Tidak seperti operon lac, trpR tidak berdekatan dengan operon. Gen-gen struktural yang berlokasi di 28 menit pada E. coli peta; trpR terletak pada 100 menit. Represor TrpR sebenarnya mengatur ekspresi dari dua operon yang lain di samping operon trp.

yaitu tRNA TRP dibebankan dengan triptofan. Namun. maka represor TRP akan memblokir lebih lanjut transkripsi operon dan. Selama ada cukup triptofan dalam sel. gen trpL trpL kode untuk oligopeptide 14 aa pendek. maka tRNA akan diisi dan peptida pemimpin akan diterjemahkan tanpa masalah. Daerah ini berisi beberapa pelengkap diri yang dapat membentuk berbagai struktur stem-loop sebagai berikut: . sebagai hasilnya. Jika suplai yang baik. Jika pasokan cukup memadai. Atenuasi Sebuah prediksi langsung dari model ekspresi gen operon diterapkan pada kasus operon trp adalah ekspresi dari operon dalam mutan trpR harus sensitif terhadap triptofan ditambahkan. Bagaimana hal ini mempengaruhi transkripsi operon trp? penjelasan ini berasal dari pengamatan bahwa wilayah mRNA trpL dapat mengadopsi sejumlah konformasi yang berbeda.protein TrpR tidak mampu untuk mengikat ke operator dengan sendirinya. Ini mengandung dua kodon trp berturut-turut dan karena itu berfungsi sebagai ukuran pasokan triptofan dalam sel.. Penelitian lebih lanjut membuktikan bahwa tingkat kedua kontrol triptofan melibatkan dua komponen: y y tRNA. maka tRNA tidak akan dikenakan biaya. harus ada pengaruh. khususnya tryptophanyl-tRNA TRP. Jika tidak ada represssor mempengaruhi transkripsi. setelah tingkat tryptophan membangun. maka sejak itu represor yang merasakan kehadiran triptofan. sintesis tiga enzim akan menurun. dan terjemahan akan kios di kodon trp. Tapi ada! Ekspresi trpEDCBA dikurangi dengan penambahan trypophan di mutan trpR. ia akan tetap begitu.

Sekarang. Pembentukan terminator-anti mencegah pembentukan terminator tersebut. jika ada suplai triptofan. terminator transkripsi khas bakteri dapat terbentuk sebagai akibat dari pasangan antara daerah 3 (kotak hijau) & 4 (kotak kuning). maka ribosom mengikuti tepat di belakang RNA polimerase sampai dihentikan oleh kodon berhenti. dan ribosom akan warung menunggu tRNA cocok untuk dibawa ke situs A: Karena warung ribosom. Ini berarti bahwa ribosom akan melampirkan mRNA dan mampu mempengaruhi pembentukan struktur sekunder oleh mRNA. maka tRNA TRP tidak akan dikenakan biaya dengan triptofan. terminator tersebut dilarang karena membentuk 3 daerah kini dipasangkan dengan wilayah 2 (kotak ungu) membentuk struktur alternatif. wilayah 2 (ungu) sekarang dapat dasar-pasangan dengan wilayah 3 (hijau) segera setelah kedua ditranskripsi.Dalam satu konformasi. apa yang mengatur pembentukan terminator atau anti-terminator? Ingat bahwa transkripsi dan translasi dapat terjadi secara simultan pada bakteri. Perhatikan kodon UGA berhenti di bagian bawah wilayah 1 di urutan diagram di atas. di kanan. Dalam konformasi lain. . Dalam kasus mRNA trpL. Jika pasokan triptofan rendah. Hal ini memungkinkan pembentukan terminator batang-loop yang akan menyebabkan RNA polimerase untuk memisahkan. ditampilkan di sebelah kiri.

seperti campuran glukosa dan xilosa . y Lac operon terdiri dari tiga gen struktural . dan katabolit protein aktivator (CAP). dan operator . Ketiga gen struktural: lacZ. Sel dapat menggunakan laktosa sebagai sumber energi dengan menghasilkan enzim -galaktosidase untuk mencerna laktosa yang menjadi glukosa . dll mekanisme kontrol genetik yang mendasari pola-pola pertumbuhan tersebut diauxic dikenal sebagai xyl operon dan ara operon . atau glukosa dan arabinosa . Regulasi gen dari operon lac adalah mekanisme genetik kompleks peraturan pertama yang harus ditetapkan dan merupakan salah satu contoh terkemuka prokariotik regulasi gen . dan promotor . Operon lac menggunakan-bagian pengendali mekanisme dua untuk memastikan bahwa sel mengeluarkan energi yang memproduksi -galaktosidase . akan tidak efisien untuk menghasilkan enzim bila tidak ada laktosa tersedia. lacY. Namun. atau jika ada sumber energi yang tersedia lebih mudah tersedia seperti glukosa. yang membantu dalam produksi tanpa adanya glukosa. dll Struktur operon lac Struktur laktosa dan produk dari belahan dada nya. sebuah terminator . Operon lac diatur oleh beberapa faktor termasuk ketersediaan glukosa dan laktosa . Ini terdiri dari tiga berdekatan gen struktural . sebuah promotor . dan operator . Diauxic pola pertumbuhan serupa telah diamati dalam pertumbuhan bakteri pada campuran lain gula juga. -galactoside permease dan transasetilase thiogalactoside (juga dikenal sebagai O-asetiltransferase galactoside) hanya bila diperlukan. operon lac memungkinkan untuk pencernaan efektif laktosa. regulator . Mekanisme kontrol ini menyebabkan pemanfaatan dual sekuensial glukosa dan laktosa dalam dua tahap pertumbuhan yang berbeda.Operon lac adalah operon diperlukan untuk transportasi dan metabolisme dari laktosa dalam Escherichia coli dan beberapa lainnya bakteri enterik . Dalam lingkungan alam. dan lacA. yang menghentikan produksi karena tidak adanya laktosa. sebuah terminator . yang dikenal sebagai diauxie . Ini mencapai ini dengan represor lac . .

the lacZYA mRN . metabolit disebut laktosa alolaktosa . memungkinkan sel untuk hydrolyse (mencerna) laktosa dan galaktosa dan glukosa rilis. Gen lac diatur menjadi operon . Mekanisme kontrol yang kedua adalah tanggapan terhadap glukosa.. sebuah enzim yang mentransfer sebuah grup asetil dari asetil-KoA untuk -galactosides . Diagram di bawah ini merangkum laporan. Dengan tidak adanya glukosa. promotor. yang menggunakan protein aktivator katabolit (CAP) untuk lebih meningkatkan produksi -galaktosidase dengan tidak adanya glukosa. . mereka berorientasi pada arah yang sama langsung yang berdekatan di kromosom dan co-ditranskripsi menjadi satu polisistronik molekul mRNA. kontrol khusus dari gen lac tergantung pada ketersediaan substrat untuk bakteri laktosa. sebuah intraselular enzim yang melekat pada disakarida laktosa menjadi glukosa dan galaktosa . yang membantu RNAP dalam mengikat DNA. represor sangat erat mengikat urutan DNA pendek hanya hilir dari promotor dekat awal lacZ disebut operator lac. dan karena itu lacZ mRNA encoding dan Lacy hanya dibuat pada tingkat yang sangat rendah. menyebabkan perubahan dalam bentuk. lacA encode -galactoside transasetilase (LacA). yang merupakan kombinasi glukosa dan galaktosa. yang menggunakan sebuah protein intraselular peraturan disebut represor laktosa untuk menghambat produksi galaktosidase tanpa adanya laktosa.. yang mengikat protein DNA . yang mengikat DNA spesifik ke situs pengikatan. siklik adenosine monophosphate (cAMP) adalah molekul sinyal yang prevalensi berbanding terbalik dengan yang glukosa. . dan gen lacI tersedia dari GenBank (tampilan) . represor yang mengikat operator mengganggu pengikatan RNAP ke promotor. Jika laktosa yang hilang dari medium pertumbuhan. memungkinkan RNAP untuk mentranskripsikan gen lac dan dengan demikian yang mengarah ke tingkat tinggi dari protein yang disandikan. Mekanisme kontrol pertama adalah respons peraturan untuk laktosa. . cAMP konsentrasi tinggi dan mengikat CAP-cAMP untuk DNA secara signifikan meningkatkan produksi -galaktosidase . Protein yang tidak diproduksi oleh bakteri ketika laktosa tidak tersedia sebagai sumber karbon. LacI gen coding untuk represor terletak dekat operon lac dan selalu disajikan (konstitutif). . yaitu. . yang pada gilirannya memungkinkan CAP untuk mengikat ke situs CAP mengikat (16 pb DNA hulu promotor di sebelah kiri pada diagram di bawah). yang lacZYA mRNA .. sebuah membran transpor protein yang terikat-pompa laktosa ke dalam sel. lacY menyandikan -galactoside permease (Lacy).Dari posisi ini RNAP hasil untuk mencatat semua tiga gen (lacZYA) ke dalam mRNA. mengikat represor. segera hulu dari gen. Jadi diubah. Ketika sel-sel yang tumbuh dengan adanya laktosa Namun. coli lac operon . Hanya lacZ dan lacY tampaknya perlu untuk laktosa katabolisme . Ia mengikat ke CAP. . Urutan DNA dari E. lacZ menyandikan -galaktosidase (lacZ). represor tidak mampu untuk mengikat ke operator.y y y . Transkripsi dari semua gen dimulai dengan pengikatan enzim polimerase RNA (RNAP).

Nya (kemampuan untuk mensintesis asam amino histidin) Mot (motilitas berenang) y Sm R (response to the antibiotic streptomycin) Sm R (respon terhadap antibiotik streptomisin) Dalam kasus Lac. Tiga huruf yang sama biasanya digunakan (huruf kecil. sementara Lac . Contohnya termasuk: y y Lac (kemampuan untuk menggunakan laktosa). dicetak miring) untuk label gen terlibat dalam fenotipe tertentu.Turunan mutan tidak dapat menggunakan laktosa. sel tipe liar Lac + dan dapat menggunakan laktosa sebagai sumber karbon dan energi. coli. coli .lac operon terinci Tatanama Genetik Tiga huruf singkatan yang digunakan untuk menggambarkan fenotipe pada bakteri termasuk E. .

lacY. Yakub dikembangkan suatu sistem dimana salinan kedua gen lac (lacI dengan promotor.. kemudian diuji untuk fenotipe peraturan. karena alasan historis. Jacob menggunakan analogi dari seorang pembom yang akan rilis kargo mematikan perusahaan setelah menerima transmisi radio khusus atau sinyal. dan lacZYA dengan promotor dan operator) dapat diperkenalkan ke dalam sel tunggal. lacZ adalah produk protein dari gen lacZ. Lancar memperluas penggunaan nomenklatur fenotipik untuk diterapkan ke protein: demikian. . Secara khusus. itu ditentukan apakah lacZ dan Lacy dibuat bahkan dalam ketiadaan IPTG. pertimbangkan pembom dengan penerima rusak. Sebuah terobosan konseptual Yakub dan Monod [4] adalah untuk mengenali perbedaan antara substansi peraturan dan situs mana mereka bertindak untuk mengubah ekspresi gen. pengkodean represor laktosa-"Aku" singkatan inducibility. disebut uji komplementasi . di mana gen atau kelompok gen diuji berpasangan. Gen lac keempat adalah lacI. anggaplah bahwa pemancar biasa rusak. Sistem ini dapat dibuat untuk bekerja dengan penerapan suatu pemancar. o lac. Sebuah sistem bekerja membutuhkan kedua pemancar tanah dan penerima dalam pesawat.di mana setiap gen yang berbeda adalah tambahan dibedakan dengan surat ekstra.Sekarang. Percobaan ini. Untuk menganalisis mutan regulasi operon lac. -galaktosidase. pesawat kedua. Gen lac pengkodean enzim adalah lacZ. termasuk promotor lac. Budaya bakteri tersebut. lac p. Berbagai urutan pendek yang tidak gen juga mempengaruhi ekspresi gen. kedua fungsional. dan lacA. Perilaku pembom ini tidak dapat diubah dengan pengenalan fungsional.Sebaliknya. dan operator lac. mutasi mempengaruhi lac o disebut sebagai c o lac. katanya. Walaupun tidak secara ketat penggunaan standar. yang diploid untuk gen lac tapi dinyatakan normal.

Jika salah satu salinan gen lac membawa mutasi di lacI. Pada bagian (e) uji komplementasi untuk represor ditampilkan.Tes ini diilustrasikan pada gambar (lacA dihilangkan untuk kesederhanaan). tidak mengizinkan pengikatan represor untuk menghambat transkripsi gen struktural . masing-masing. dan (c) dan (d) menunjukkan pengaruh mutasi ke gen lacI atau operator. Panel (a) menunjukkan penindasan. dan ini dijelaskan oleh fakta bahwa represor merupakan protein kecil yang dapat menyebar di dalam sel . Mutasi mempengaruhi represor dikatakan resesif untuk mengetik liar (dan yang wild type dominan). namun salinan kedua jenis liar untuk lacI. (b) menunjukkan induksi oleh IPTG.tetapi lacZ diungkapkan ketika terkena inducer IPTG. karena situs operator yang rusak. Sebuah versi yang lebih canggih dari percobaan ini menggunakan ditandai operon untuk membedakan antara dua salinan gen lac dan menunjukkan bahwa gen yang tidak diatur (s) . Jika eksperimen yang sama dilakukan dengan menggunakan operator mutasi. kehadiran situs fungsional kedua dalam sel yang sama tidak ada bedanya ekspresi gen dikontrol oleh situs mutan. hasil yang berbeda diperoleh (panel (f)). Pertama. negara haploid tertentu yang ditampilkan (yaitu sel hanya membawa satu salinan dari gen lac). Salinan operon lac berdekatan dengan gen lacI rusak secara efektif mematikan oleh protein yang dihasilkan dari copy kedua lacI. Fenotipe dari sel membawa satu mutan dan satu jenis situs operator liar adalah bahwa lacZ dan Lacy diproduksi bahkan dalam tidak adanya IPTG inducer. fenotipe yang dihasilkan adalah normal --. Ketika situs operator mana represor harus mengikat dirusak oleh mutasi.

[3] Dalam LB piring berisi X-gadis. dan percobaan adalah model khusus untuk menguji model.adalah orang-orang di sebelah operator mutan (panel (g). mutasi dari satu salinan dari operator menganugerahkan fenotipe mutan karena dominan untuk salinan. Penggunaan dalam biologi molekular Gen lac dan turunannya yang setuju untuk digunakan sebagai gen reporter di sejumlah pilihan berdasarkan teknik-bakteri seperti dua hibrida analisis. Jika mutan peraturan dipilih dari budaya wild type menggunakan fenil-Gal. seperti dijelaskan di atas. dan kemudian dirancang tes komplementasi mereka untuk acara ini. hanya salinan operon lac yang berdekatan dengan operator mutan diungkapkan tanpa IPTG. Dominasi mutan operator juga menyarankan sebuah prosedur untuk memilih mereka secara khusus. perubahan warna dari koloni putih ke warna biru. Penjelasan ini menyesatkan dalam arti penting. sedangkan laktosa tetrazolium dan media laktosa MacConkey memiliki kisaran 1100 unit. Sejak laktosa MacConkey dan laktosa media tetrazolium baik mengandalkan produk mengalami gangguan laktosa. jenis kedua liar. Fusi teknik lac banyak yang hanya mencakup gen lacZ demikian sesuai dengan piring-cewek X atau ONPG kaldu cair . Kami mengatakan bahwa mutasi operator cis-dominan. kedua gen tipe liar lacI menganugerahkan jenis liar fenotipe. Jacob dan Monod pertama membayangkan bahwa harus ada sebuah situs di DNA dengan sifat-sifat operator. mereka membutuhkan keberadaan kedua lacZ dan lacY gen. Sebaliknya. mutasi represor (yang masih terjadi) tidak sembuh karena komplementasi oleh. di mana berhasil mengikat dari aktivator transkripsi ke urutan promotor spesifik harus ditentukan. sering benar bahwa model datang pertama. Sebagai contoh. yang paling sensitif dalam bagian-bagian yang tinggi dan rendah dari rentang masingmasing. Dalam versi ini. Namun pada kenyataannya. sedangkan yang kedua membawa salinan mutasi yang mempengaruhi lacY dan hanya bisa menghasilkan lacZ. sesuai dengan sekitar 2-10 unit galaktosidase. karena hasil dari deskripsi percobaan dan kemudian menjelaskan hasil dalam hal model. operator mutasi jarang terjadi dibandingkan dengan mutan represor karena target-ukuran sangat kecil. anggaplah bahwa satu salinan ditandai oleh mutasi menonaktifkan lacZ sehingga hanya bisa menghasilkan protein Lacy. adalah yang dominan dengan jenis liar namun hanya mempengaruhi salinan operon yang berbatasan langsung dengan itu. Tapi kalau bukan kita mulai dengan suatu galur yang membawa dua salinan dari seluruh wilayah lac (yang diploid untuk lac).

Sign up to vote on this title
UsefulNot useful