P. 1
BIOKIMIA

BIOKIMIA

|Views: 422|Likes:
Published by Vea Capa Dimas

More info:

Published by: Vea Capa Dimas on May 20, 2011
Copyright:Attribution Non-commercial

Availability:

Read on Scribd mobile: iPhone, iPad and Android.
download as DOC, PDF, TXT or read online from Scribd
See more
See less

04/29/2013

pdf

text

original

BIOKIMIA

Semenjak tahun 1940 biokimia berkembang dengan pesatnya berkat pengembangan ilmu lain yang mampu menciptakan alat alat analitik yang sangat peka dan menghasilkan bahan-bahan pelacak isotopik sehingga memungkinkan para ahli unyuk lebih mendalami dan dapat menerangkan fenomena fenomena biologik. Tiga perkembangan yang menyebabkan biokimia diakui sebagai ilmu yang berdiri sendiri dan bukan ilmu yang merupakan cabang ilmu yang lain. Pertama adalah pengakuan tentang sistem multi enzim yang yang bertindak katalitik pada jalur metbolisme. Kedua ialah bahwa selama proses metabolesme terjadi pemindahan enersi dalam sel hidup. Ke tiga adalah sifat turun menurun merupakan suatu proses biologik yang dapat diterangkan secara molekular. Menurut para ahli sekurang kurangya ada tiga ciri ciri yang dapat diidentifikasi yaitu: 1 sangat terorganisasi dan sangat komplek 2 mempunyai kemampuan untuk mengextrak enersi dari sekelilingnya 3 dapat menurunkan sifat atau dapat mereplikasikan drinya sendiri dengan tepat dan terencana. Pertama yang akan dibahas adalah ciri hidup pertama yaitu bahwa jasad hidup itu sangat komplexs sangat terorganisasi dan mengorganisasi diri sendiri . makna organisasi adalah bahwa organ kesatuan aktivitas terkecil bahkan senyawa yang menyusun jasad hidup mempunyai fungsi khusus dan bersama sama melakukan tugasnya. Kemampuanuntuk menurunkan diri sendiri dengan tepat dan terencana dapat diterangkan sebagai berikut: seingat nenek moyang kita dan turun temurun secara terus menerus selalu menyatakan sapi tiada ubahnya. Hal itu berarti bahwa jasad hidup mempunyai kamempuan untuk menurunkan atau mereplikasi drinya sendiri dengan tepat BIOMOLEKUL DAN SEL HIDUP. Untuk mengetahui unsur apa saja yang ada dan menyusun jasad hidup maka perluadanya analisa. Komposisi kimia jasad hidup(dalam% berat) orang ayam jagung beras bayam ragi air 59 56 76 12 93 72 karbohidrat Sedikit Sedikit 0 80 03 13 protein 18 21 02 07 02 12 lemak 18,0 19,0 00,7 00,3 00,3 1. abu 4,0 3,0 1,3 0,4 1,5 2,0

sitoplasma.15% Satu hal lagi yang menarik adaah bahwa dalam rangka penyusunan polinmer seperti protein. ORGANISAI MOLEKULAR SEL HIDUP Dalam sel hidup senyawa dasar secara bertahap diubah ke dalam senyawa yang lebih kompleks baik fungsi maupun strukturnya. Dinding sel.000% 0.35% 0.kalau pada jasad hidup dikenal organ yang mempunyai kesatuan fungsional terbesar . Hasilnya disalurkan keluar sel setelah dipekatkan dan disimpan. mitokondria. Padahal jumlah jenis asam aminonya yang diisolasi ada sekitar seratus. Kebutuhan enersi untuk sintesa diperoleh dari mitokondria yang letaknya dekat dengan endoplasmik retikulum. kloroplas dan banyak lagi Organisasi struktural zarah zarah tersebut di dalam sel hampir tidak ada bedanya antara yukariotik dan prokariotik. Enzim sebagaimana protein pada umumnya disintesa peda permukaan endoplasmik retikulum. Akan tetapi yang diambil oleh jasad hidup hanyalah sekitar sebelas. ORGANEL DALAM SEL HIDUP Kesatuan fungsional terbesar yang ada dalam sel adalah organe.000% 18. vakuola. Molekuler sederhana terutama CO2. retikulum.Sebagaimana diketahui unsur unsur yang terdapat dalam kerak bumi lebih dari seratus.006% 0.000% 3. ribosom.50% 1. maka sel pun mempunyai kesatuan fungsional terbesar dalam sel yang disebut organel. Komposisi keunsuran jasad hidup Oksigen Karbon Hidrogen Nitrogen Khlor Besi Seng tembaga 65. Terahir ini bergabung melalui ikatan kovalen menjadi makromolekul yang selanjutnya membentuk molekul yang lebih besar lagi ialah supra molekular. Penggabungan senyawa dasar sehingga terbentuk supra molekulardan selanjutnya menjadi organel diatur dalam suatu sistem multi enzim.35% 0. H2O dan Nitrogen atmosferik diubah melalui senyawa dasar menjadi satuan penyusunan oleh jasad hidup. Atas dasar fungsinya maka benda benda sel itu dibedakan menjadi inti sel. yang dipergunakan sebagai bahan atau senyawa dasar hanyalah 20 jenis asam amino.200% 0. membran sel.003% 0.001% Kalsium Fosfor Kalium Belerang Natrium magnesium 1. .00% 0.000% 10.

tiga dan banyak untk mudahnya biasanya lalu dbagi mnjadi 3 golongan yaitu monosakarida.dari jumlah monomer yg menysun polimer itu. yg mempunyai rumus molekul umum(CH2O)n yg pertama lbh dikenal sbgai gol. 2. bilamana jmlah manometer yg menyusun brturut2 ADALAH : satu<dua.mngndung 2 smpai 10 manometer danpolisakarida.oligosakarida.trisakarida dan strusnya smpai polisakarida.KLASIFIKASI DAN TATANAMA Karbohidrat adalah polihidruksi aldehida dan polihidruksi keton. 3.n o 1 2 3 4 5 1 2 3 4 5 6 Nama organel PROKARIOTI K Dinding sel Daerah inti Ribosom Granula Sitosol YUKARIOTIK Pelindung sel membran Inti Mitokondria Badan golgi Endo[lasmik retikulum kloroplas Sifat fungsi KARBOHIDRAT 1.MONOSAKARIDA .maka krbohidrat dgolongkan menjadi : monosakarida.disakarida.FUNGSI Karbohidrat atau sakarida mempunyai dua fungsi yaitu sebagai bahan bakar dan sebagi bahan struktur sel¸contoh glukosa pati dan glikogen. Aldosa dan yg kadua gol.ketosa.

Dari data sdut ikatan . sedangkan rantai pokok brgugus reduksi.aldotetrosa. Perlu dicatat griseraldehida dan jg senyawa lain pd umumhya tdk terlatak pd suatu bdang datar. maka senyawa ini trdiri dari dua stuan monosakarida glukosa. yaitu trminal cabang dan trminal rantai pokok. Senyawa yg mempunyai dua satuan sakarida yg bnyak dibicarakan ialah maltosa.dari dret sepantaran gol aldosa dan ketosa tmpak bahwa di dpn nama senyawa dtuliskan huruf D(DEXTER). Perbedaanya ialah bahwa trminal tak brgugus reduksi. biomol pentranspor bahan.karena adanya prbedaan warna ion/garam yg yg mngandung ion trsebut maka pristiwa reduksi bsa diikuti dngn jelas. Sperti halnya dngan maltosa. Dapatlah dpastikan bahwa mkin pnjng rantai. SELLOBIOSA brasal dari hidrolis sellulosa.POLISAKARIDA Senyawa ini bnyak mngandung poli satuan2 monosakarida yg ikat mngikat melalui oksigen. Bilamana kmampuan senyawa memutar bdanf snar polarisasi itu dilhat dlm sbuah polarimeter. Bedanya dngan maltosa ialah bahwa macam ikatanya adalah 1.FUNGSI Fungsi protein diantaranya adalah biokatalisator (enzim).Monosakarida yg umum trdapat dlm alam ialah yg atom C nya brkisar antra 3 smpai 7. Sakarida gol aldosa dan ketosa mempunyai daya daya mereduksi.aldo pentrosa dan strusnya .KLASIFIKASI DAN TATANAN protein . sellobiosa. laktosa dan sukrosa. Contohnya ialah .4. Bila gugus OH brada disisi kanan maka senyawa bekonfigurasi D dan sbaliknya jika gugus yg dmaksud brada di sisi kiri maka senyawa trsebut trmasuk gol L(LEVO). cadangan . tanda lain yg djumpai adlah tanda (+) dan (-) yg mnyatakan kmampuan suatu senyawa dlm zat pelarut untk memeutar bdang snar polarisasi ke knan atau kekiri. maka senyawa yg satu memutr bdang polarisasi ke knan dan memutar ke kiri. amylum) dan glikogen.golongan monosakarida yg kdua adlah ketosa dngan nama2 barawalam keto. Oleh karena itulah maka maka snyawa2 tersbut dkenal sbagai gula pereduksi.pati umumnya trdiri dari dua fraksi yaitu amilosa dan amilupektin.kemungkinan adanya intraksi antr gugus yg ada dlm snyawa itu sndiri dan hsil analisis kimiawi. maka senyawa yg tdinya terbuka mnjadi tertutup. PATI(starch. Trutama bngun molekulyg diatas trlihat ada dua trminal.dari bngun molekul trsebut diatas dpatlah dketahui bahwa pati dan glikogen wlaupun trdiri dari bnyak glukosa akn tetepi daya mereduksinya sangatlah kecil klau tdk dpt dikatakan tdak ada. Mengingat bahwa sdut2 ikatan tdk 180 atau 90. Aldosa dngan nama aldo-triosa. dngan jmlah atom C sbagai pokok maka monosakarida ini trbagi mnjadi gol. stuktural dan protektif. PROTEIN 1. 5. 2.

(tdk ska air) 2. sedang golongan kdua ialah mioglobin. asam laktat. 5.DENATURASI Struktur primer protein di atas tdk mngalami prubahan. Protein yg bentuknya sperti bola. Scara umum denaturasi adalah pristiwa pnyimpangan dri sifat alamiah senyawa yg .R brmuatan positif Hidrofobik adalah sifat fobi trhadap air dan bilamana asam amino itu terdapat pd rantai polimer protein maka asam trsebut cenderung melipat dlm gumpalan protein itu.delapan hngga sepuluh diantaranya tergolong dalam asam amino esensial. gol. SIFAT DAN REAKSI ASAM AMINO Asam amino dapat membebentuk ester. ikatan peptida (dibatasi oleh kotak bergaris tebal) trletak dlm satu bdang datar. 4. bila direaksikan dngan alkohol dngan bantuan katalisator asam. Asam amino merupakan satuan pnyusun protein. Sedangkan contoh struktur tersier adalah protein globular. Globular. KLASIFIKASI ASAM AMINO Klasifikasi asam amino atas dasar gugus R-nya.ASAM AMINO Bilamana protein itu dihirolisis dngan bantuan asam maka hasilnya adalah asam amino. Untuk mngatahui adanya dan jenis asam amino terminal pd suatu rantai polipeptida.R tdk bermuatan tetapi polar 3. Asam amino yg satu dngan yg lainya ikat mngikat mlalui peptida. Contoh yg prtama ialah karatin dan kolagen. menjadi 4 golongan: 1.Bila ditinjau dari konfarmasinya maka protein bsa dbagi mnjadi dua golongan yaitu: bntul serabut atau benang (FIBROUS) dan globular. hidrofobik.STRUKTUR PROTEIN Polimer ini trdiri dari asam amino yg jumlahnya skitar seratus pada sitokrom C dan lbih dari seribu pd laktat dehidogrenase.untuk dapat mnggolongkan amino ke dlm bntuk L atau D. maka protein ini direaksikan dngan dinitrofluorobenzena. Ikatan antara N dan C karbonil tdak dpat mngadakan rotasi pada sumbunya. alanin. Brdasarkan rumus bngunnya asam amino dpat dpandang sbagai turunan asam karboksilat. yg satu atom hidrogen dgantikan oleh gugus amino(-NH2). Untuk lbih mngetahui noda asam amino yg trdapat pd kertas sering dgunakan zat warna antara lain ialah ninhidrin.Golongan asam amino dngan R yg tdk polar. Protein serabut/bnang dan gol. Kesimpulanya ialah bahwa slain molekul itu kompak. Berdasarkan hasil pnelitian. Jenis asam amino yg umum trdapat dlm alam ada 20. gugus R yg polar trletak di dibagian luar dan mngalami hidrasi. 3.R brmuatan negatif 4. maka perlulah ada satu senyawa pembanding yaitu gliseraldehida. Protein dapatdigolongkan atas dasar konformasinya mnjadi dua golongan yaitu.

alam linoleat dan asam linolenat. Senyawa ini trdiri dari gliserol dan tiga molekul asam lemak yg trikat scra ester. 2.lapisan pelindung dan 4.bahan bakar 3. Ada dua jenis sfingoglikolipida yg trdapat dalam alam yaitu yg netral dan asam. asam fosfatidat dinamakan gugus fosfatidil. LIPIDA 1.komponen struktural membran 2. 1 molekul asam lemak 1 kepala polar.vitamin dan hormon. 1 molekul spingosin. b) fosfolipida. Asam lemak jenuh adalah yg beratom C 16 dan 18 dan yg tdak jenuh adalah C 18. Senyawa ini trdiri dari “ ekor “ yg tdak bermuatan dan “ kepala”. Spingolipida terdiri dari 3 komponan yaitu .KLASIFIKASI DAN TATA NAMA Pada umumnya klasifikasi lipida didaarkan ats krangka dasarnya mnjadi lipida kompleks dan lipida sderhana 3. TRIASIL GLISEROL Nama lain dari golongan senyawa ini adalah lemak netral dan trigliseri-da. Oleh karena itu fosfogliserida pd umumnya disebut mnurut gugus induknya atau fosfatidiletanolamin dan fosfatidilkholin. Jenis asam lemak yg tdak jenuh adalah asam lemak beratom C sbanyak 18 yaitu asam oleat. Dngan intensitas dan jumlah dan jenis ikatan yg trputus sekurang2nya ada dua yaitu flokulasi dan koagulasi. c) sfingo lipida dan d) lilin.FUNGSI Lipida mempunyai beberapa fungsi diantaranya adalah 1. FOSFOLIPIDA Nama lain golongan ini ialah fosfogliserida atau gliserol fosfatida. Jenis yg kdua sfingolipida asam dkenal sbagai gangliosida mempunyai ekor saramida . Asam lemak yg ada dlm alam dpt dikelompokan ats dsar jumlah atom C.bersangkutan. Senyawa induk fosfolipida adalah asam fosfatidat. SPINGOLIPIDA DAN GLIKOSFINGOLIPIDA Senyawa ini berkerangka dasarsfingosin atau basa yg sejenis.LIPIDA KOMPLEKS Lipida ini dbagi mnjadi a) triasil gliserol. Spingolipida yg bnyak trdapat dlm alam ialah sfingomielin yg mngandung fosforiletanomalin atau fosforikolin sbgai kpla yg polar. Sbagai gugus. Senyawa ini trdiri dari gliserol -3-P sbagai kerangka dasarnya. dan trdapat dalam membran sel hewan dan saraf dan otak. Taraf denaturasi sehub. taraf kejenuhan dan tingkat esensealitasnya.

deoksi guanosin.Satuan penyusunannya disebut mononukleotida. 3. Polinukleotida prtama adalah asam deoksiribonukleat (singkatan teteap DNA) dan yg kdua adalah asam ribonukleat (RNA).FUNGSI Asam nukleat berfungsi sebagai penyimpan sifat keturunan . guanin dan sitosin. Lanolin ialah campuran aster asam lemak dan ianosterol yg trmasuk golngan sterol. sdangkan yg kdua adalah deoksi adenosin. . 4. 2. adenosin guanosin. dan sitosin.Steroida yang banyak terdapat dalam kehidupan adalah sterol .KLASIFIKASI DAN TATANAMA Senyawa ini adalah suatu polimer.RNA pd umumnya trdapat dlm sitoplasma. guanin. sebaliknya RNA sekurangnya ada tiga buah msing2 Bernama m-RNA. Tiga turunan pirimidin yg umum trdapat dlm nukleutida. urasil. deoksi sitidin. timin. LILIN Adalah senyawa yg brbentuk ester asam lemak dngan alkohol bkan gliserol. Nukleosida difosfat dan trifosfatnya trgolong snyawa energi tnggi. Perbedaan antara dua asam trsebut adalah bahwa DNA mngandung basa N-BASA N adenin. Nukleosida yg prtama ada bebrapa yaitu.penyimpan energi dan beberapa diantaranya bekerja sebagai ko-enzim. sitidin.suatu alkohol yang berintikan perhidrosiklopentano fenantren. Senyawa turunan purin yg umum trdapat adalah adenindan guanin.DI-DAN POLINUKLOTIDA Sesuai dngan namanya maka polimer itu mngandung dua atau lbih satuan pnyusun yg dikenal sbagai mononukleotida. yaitu urasil. gula yg beratom C sbanyak lima buah dan asam fosfat.Miko sterol adalah sterol yang terdapat dalam jamur dan ragi misalnya ergosterol yang merupakan bahan baku vitamin D. Berbeda dngan DNA yg trutama trdapat dlm inti sel.LIPIDA SEDERHANA Lipida yang dibicarakan diatas semuanya dapat dihidrolisis dengan alkali dalam keadaan panas yang selanjutnya menghasilkan sabun. 4.dan sitosin. semaua bagian dihasilkan dari hidrolisis mononukletida.Oleh karena itu asam nukleat juga dinamakan polinukleotida.MONONUKLEOTIDA DAN BAGIAN-BAGIANYA Bagian dari senyawa ini adalah basa nitrogen. deoksi timidin. ASAM NUKLEAT 1.dan berkepala oligosakaridayg mngandung bag. uridin. sdangkan RNA kandngan basa N-adalah adenin. DNA jenisnya hanya sebuah. timin.senyawa itu termasuk steroida dan terpena. asam fosfat yg trikat brikutnya adalah anhidrida. Yg brmuatan negatif yaitu asam sialat.Ada golongan lipida lain yang tidak dapat diubah menjadi sabun. r-RNA dan t-RNA.

Balitzur (uni soviet) dpat membuktikan bahwa ATP jg tmbul dari ADP dlam suatu proses yg dnamakan fosforilasi oksidatif. transpor aktif (kerja osmotik). oleh karena dapat mnyimpan energi yg bsar. kontraksi muskular (kerja mekanik) dan lain2nya dsebut enrgi bebas. Untuk mngetahuibsarnya perubahan potensial redoks suatu sistem maka dipergunakanlah sbuah pngukur. ENZIM 1. H.0 vol. Engelhardt dan M. Pengukur yg dmaksud pd umumnya ialah elektrode H. yg disingkat F. Kalkacar (denmark) dan V. Bila suatu sistem brbah dari satu ke lain keadaan maka trjadilahprubahan energi bebas yg akn mncapai minimum apabila sistem trsebut mncapai keseimbanganya. Pd prubahan itu trjadilah prubahan energi bebas yg bsarnya AF=FB-FA Dalam ilmu biokimia senyawa yg pnting di dlm sel hidup adalah senyawa fosfat organik. 3. 2. atau pd pembentukanya memerlukan energi yang bsar dinamakan senyawa energi yang tinggi.N. yaitu salah satu monomer dlm asam nukleat. SEJARAH . Otot. Oleh O. yg potensialnya redoksnya sama dngan 0. Senyawa sprti ATP. Kalau dlm suatu sistem atau suatu proses ada senyawa yg dioksidasi maka sebaliknya tntu ad senyawa yg tereduksi.LINGKARAN ADENOSIN TRIFOSFAT Adenosin tri-fosfat adalah senyawa yg trmasuk dalam golongan mononukleotida. Oleh karena dapat menyimpan . LYUBIMOVA mnjlaskan bahwa ATP dihidrolisis mnjadi ADP olh miosin dlm suatu proses yg membthkan enrgi.ENERGI BIOKIMIA DAN LINGKARAN ATP 1. Kedua proses itu sbenarnya tdk dpt dipisahkan satu sama lain. Waburg dan O. Frits lippman (pd tahun 1940) brhasil disusun sbuah lingkaran yg mnggambarkan prjalanan dan fungsi ATP dlm sel hidup. Mayerhof dinyatakan bahwa senyawa trsebut trbentuk pd proses pemecahan anerobik glukosa menjadi asam laktat dlm jar.ENERGI BEBAS Bagian energi dlm bhan makanan yg dpt dipergunakan untk mlakukan krja sprti biosintesa (kerja ilmiah). Oleh karena itulah maka proses itu dbri nama proses oksido-reduksi.REAKSI OKSIDO REDUKSI DAN AF Dalam ilmu biokimia bnyak dijumpai reaksi oksidasi dan reduksi.

4.vitamin yg tremasuk dalam B kompleks lain yg ikt aktif adalahn vitamin B1 atau dkenal sbgai tiamin. Biotin dkenal sbagai vtamin atau faktor tumbuh. yg bsa brupa senyawa organik dngan berat molekul ckup tnggi atau logam. Nama yang diberikan senyawa diatas tdak tepat karena mononukleotida yg satu bkan ribosa melainkan ribiol.Enzim adalah protein yg khusus disintesis oleh sel hidup untk mngkatalisis reaksi yg berlngsung di dlamnya. Oleh karena reaksi itu bnyak sekali maka biokatalisator yg dbentuk jmlah maupun jnisnya tak trhitung bnyaknya. biasa dsebut dngan karboksilasi. Sedangkan pada tahun 1872 E. Atas dasar jenis reaksinya maka enzim dbagi mnjadi 6 golongan yaitu Oksidoreduktasa.STUKTUR TIGA DIMENSI DAN SIFAT KATALITIK . liase. Pada tahun 1866 louis pasteur mndapatkan bahwa cairan anggur bergula dpt mngalami perubahan mnjadi alkohol dan CO2 oleh karena adanya ragi yg tmbuh didlmnya. 3.KOFAKATOR Uutuk aktifitasnya kadang2 enzim ini membthkan kofakator.KLASIFIKASI DAN TATANAMA Dasar untuk mngklasifikasi enzim ada beberapa yaitu ats dasar nama substrat yg dikatalisis. Senyawa inipun mnjadi bagian dari koenzim yg mngangkat CO2. nama jasad hdup yg mnghasilkan enzim dan jenis reaksi yg dikatalisa. Apabila enzim itu trdiri dari bgian sprti yg dterangkan di atas maka keseluruhan enzim itu dinamakan holo-enzim. Bagian proteinnya dnamakan apo-enzim dan bgian nir-proteinya dsebut koenzim. transferase. ligase. isomerase. Buchner dpt mngekstrak zat yg trdapat dlm ragi yg selanjutnya senyawa itu dpt mlangsungkan fermentasi alkohol tanpa brhubungan dng struktur sel ragi itu sendiri. 2. Koenzim lain yg mngandung vitamin yg bekerja pd reaksi oksidoreduksi adalah flavin adenin dinukleotida dan flavin monokleutida msing2 dsingkt dngan FAD dan FMN. hidrolase. Dari nama tersebut diketahui bhwa koenzim (lbih tepak disebut gugus protesis) ini adalahsebuah nukleutida.

You're Reading a Free Preview

Download
scribd
/*********** DO NOT ALTER ANYTHING BELOW THIS LINE ! ************/ var s_code=s.t();if(s_code)document.write(s_code)//-->