BIOKIMIA

Semenjak tahun 1940 biokimia berkembang dengan pesatnya berkat pengembangan ilmu lain yang mampu menciptakan alat alat analitik yang sangat peka dan menghasilkan bahan-bahan pelacak isotopik sehingga memungkinkan para ahli unyuk lebih mendalami dan dapat menerangkan fenomena fenomena biologik. Tiga perkembangan yang menyebabkan biokimia diakui sebagai ilmu yang berdiri sendiri dan bukan ilmu yang merupakan cabang ilmu yang lain. Pertama adalah pengakuan tentang sistem multi enzim yang yang bertindak katalitik pada jalur metbolisme. Kedua ialah bahwa selama proses metabolesme terjadi pemindahan enersi dalam sel hidup. Ke tiga adalah sifat turun menurun merupakan suatu proses biologik yang dapat diterangkan secara molekular. Menurut para ahli sekurang kurangya ada tiga ciri ciri yang dapat diidentifikasi yaitu: 1 sangat terorganisasi dan sangat komplek 2 mempunyai kemampuan untuk mengextrak enersi dari sekelilingnya 3 dapat menurunkan sifat atau dapat mereplikasikan drinya sendiri dengan tepat dan terencana. Pertama yang akan dibahas adalah ciri hidup pertama yaitu bahwa jasad hidup itu sangat komplexs sangat terorganisasi dan mengorganisasi diri sendiri . makna organisasi adalah bahwa organ kesatuan aktivitas terkecil bahkan senyawa yang menyusun jasad hidup mempunyai fungsi khusus dan bersama sama melakukan tugasnya. Kemampuanuntuk menurunkan diri sendiri dengan tepat dan terencana dapat diterangkan sebagai berikut: seingat nenek moyang kita dan turun temurun secara terus menerus selalu menyatakan sapi tiada ubahnya. Hal itu berarti bahwa jasad hidup mempunyai kamempuan untuk menurunkan atau mereplikasi drinya sendiri dengan tepat BIOMOLEKUL DAN SEL HIDUP. Untuk mengetahui unsur apa saja yang ada dan menyusun jasad hidup maka perluadanya analisa. Komposisi kimia jasad hidup(dalam% berat) orang ayam jagung beras bayam ragi air 59 56 76 12 93 72 karbohidrat Sedikit Sedikit 0 80 03 13 protein 18 21 02 07 02 12 lemak 18,0 19,0 00,7 00,3 00,3 1. abu 4,0 3,0 1,3 0,4 1,5 2,0

000% 0. .35% 0. yang dipergunakan sebagai bahan atau senyawa dasar hanyalah 20 jenis asam amino. membran sel.kalau pada jasad hidup dikenal organ yang mempunyai kesatuan fungsional terbesar . Padahal jumlah jenis asam aminonya yang diisolasi ada sekitar seratus.001% Kalsium Fosfor Kalium Belerang Natrium magnesium 1. sitoplasma. ORGANEL DALAM SEL HIDUP Kesatuan fungsional terbesar yang ada dalam sel adalah organe.15% Satu hal lagi yang menarik adaah bahwa dalam rangka penyusunan polinmer seperti protein. Atas dasar fungsinya maka benda benda sel itu dibedakan menjadi inti sel.50% 1. Komposisi keunsuran jasad hidup Oksigen Karbon Hidrogen Nitrogen Khlor Besi Seng tembaga 65.000% 18.003% 0.35% 0. H2O dan Nitrogen atmosferik diubah melalui senyawa dasar menjadi satuan penyusunan oleh jasad hidup. Hasilnya disalurkan keluar sel setelah dipekatkan dan disimpan. Terahir ini bergabung melalui ikatan kovalen menjadi makromolekul yang selanjutnya membentuk molekul yang lebih besar lagi ialah supra molekular. Penggabungan senyawa dasar sehingga terbentuk supra molekulardan selanjutnya menjadi organel diatur dalam suatu sistem multi enzim.200% 0. maka sel pun mempunyai kesatuan fungsional terbesar dalam sel yang disebut organel.000% 3.006% 0. kloroplas dan banyak lagi Organisasi struktural zarah zarah tersebut di dalam sel hampir tidak ada bedanya antara yukariotik dan prokariotik. Dinding sel. Kebutuhan enersi untuk sintesa diperoleh dari mitokondria yang letaknya dekat dengan endoplasmik retikulum. retikulum. ORGANISAI MOLEKULAR SEL HIDUP Dalam sel hidup senyawa dasar secara bertahap diubah ke dalam senyawa yang lebih kompleks baik fungsi maupun strukturnya. vakuola.Sebagaimana diketahui unsur unsur yang terdapat dalam kerak bumi lebih dari seratus. mitokondria. Enzim sebagaimana protein pada umumnya disintesa peda permukaan endoplasmik retikulum.00% 0. Akan tetapi yang diambil oleh jasad hidup hanyalah sekitar sebelas. Molekuler sederhana terutama CO2. ribosom.000% 10.

n o 1 2 3 4 5 1 2 3 4 5 6 Nama organel PROKARIOTI K Dinding sel Daerah inti Ribosom Granula Sitosol YUKARIOTIK Pelindung sel membran Inti Mitokondria Badan golgi Endo[lasmik retikulum kloroplas Sifat fungsi KARBOHIDRAT 1. 3.mngndung 2 smpai 10 manometer danpolisakarida. 2.tiga dan banyak untk mudahnya biasanya lalu dbagi mnjadi 3 golongan yaitu monosakarida.FUNGSI Karbohidrat atau sakarida mempunyai dua fungsi yaitu sebagai bahan bakar dan sebagi bahan struktur sel¸contoh glukosa pati dan glikogen. yg mempunyai rumus molekul umum(CH2O)n yg pertama lbh dikenal sbgai gol.disakarida.trisakarida dan strusnya smpai polisakarida.ketosa.maka krbohidrat dgolongkan menjadi : monosakarida.oligosakarida. bilamana jmlah manometer yg menyusun brturut2 ADALAH : satu<dua.KLASIFIKASI DAN TATANAMA Karbohidrat adalah polihidruksi aldehida dan polihidruksi keton.dari jumlah monomer yg menysun polimer itu.MONOSAKARIDA . Aldosa dan yg kadua gol.

POLISAKARIDA Senyawa ini bnyak mngandung poli satuan2 monosakarida yg ikat mngikat melalui oksigen. Dari data sdut ikatan .KLASIFIKASI DAN TATANAN protein .dari dret sepantaran gol aldosa dan ketosa tmpak bahwa di dpn nama senyawa dtuliskan huruf D(DEXTER). yaitu trminal cabang dan trminal rantai pokok. laktosa dan sukrosa. Perbedaanya ialah bahwa trminal tak brgugus reduksi. Mengingat bahwa sdut2 ikatan tdk 180 atau 90. Perlu dicatat griseraldehida dan jg senyawa lain pd umumhya tdk terlatak pd suatu bdang datar.dari bngun molekul trsebut diatas dpatlah dketahui bahwa pati dan glikogen wlaupun trdiri dari bnyak glukosa akn tetepi daya mereduksinya sangatlah kecil klau tdk dpt dikatakan tdak ada.aldo pentrosa dan strusnya . amylum) dan glikogen. PROTEIN 1.4. Bila gugus OH brada disisi kanan maka senyawa bekonfigurasi D dan sbaliknya jika gugus yg dmaksud brada di sisi kiri maka senyawa trsebut trmasuk gol L(LEVO). PATI(starch.Monosakarida yg umum trdapat dlm alam ialah yg atom C nya brkisar antra 3 smpai 7. Bilamana kmampuan senyawa memutar bdanf snar polarisasi itu dilhat dlm sbuah polarimeter. stuktural dan protektif. Aldosa dngan nama aldo-triosa. Senyawa yg mempunyai dua satuan sakarida yg bnyak dibicarakan ialah maltosa. dngan jmlah atom C sbagai pokok maka monosakarida ini trbagi mnjadi gol. Oleh karena itulah maka maka snyawa2 tersbut dkenal sbagai gula pereduksi.pati umumnya trdiri dari dua fraksi yaitu amilosa dan amilupektin.golongan monosakarida yg kdua adlah ketosa dngan nama2 barawalam keto. biomol pentranspor bahan. Sperti halnya dngan maltosa. maka senyawa ini trdiri dari dua stuan monosakarida glukosa. 2. sedangkan rantai pokok brgugus reduksi.aldotetrosa. maka senyawa yg tdinya terbuka mnjadi tertutup. Sakarida gol aldosa dan ketosa mempunyai daya daya mereduksi. Contohnya ialah . sellobiosa. maka senyawa yg satu memutr bdang polarisasi ke knan dan memutar ke kiri. Dapatlah dpastikan bahwa mkin pnjng rantai. SELLOBIOSA brasal dari hidrolis sellulosa.karena adanya prbedaan warna ion/garam yg yg mngandung ion trsebut maka pristiwa reduksi bsa diikuti dngn jelas. Bedanya dngan maltosa ialah bahwa macam ikatanya adalah 1.FUNGSI Fungsi protein diantaranya adalah biokatalisator (enzim).kemungkinan adanya intraksi antr gugus yg ada dlm snyawa itu sndiri dan hsil analisis kimiawi. tanda lain yg djumpai adlah tanda (+) dan (-) yg mnyatakan kmampuan suatu senyawa dlm zat pelarut untk memeutar bdang snar polarisasi ke knan atau kekiri. Trutama bngun molekulyg diatas trlihat ada dua trminal. 5. cadangan .

4. SIFAT DAN REAKSI ASAM AMINO Asam amino dapat membebentuk ester. 3.untuk dapat mnggolongkan amino ke dlm bntuk L atau D. Scara umum denaturasi adalah pristiwa pnyimpangan dri sifat alamiah senyawa yg . Protein dapatdigolongkan atas dasar konformasinya mnjadi dua golongan yaitu.delapan hngga sepuluh diantaranya tergolong dalam asam amino esensial. (tdk ska air) 2. maka perlulah ada satu senyawa pembanding yaitu gliseraldehida. Protein yg bentuknya sperti bola. sedang golongan kdua ialah mioglobin. Kesimpulanya ialah bahwa slain molekul itu kompak. menjadi 4 golongan: 1. ikatan peptida (dibatasi oleh kotak bergaris tebal) trletak dlm satu bdang datar. gugus R yg polar trletak di dibagian luar dan mngalami hidrasi. Asam amino yg satu dngan yg lainya ikat mngikat mlalui peptida.ASAM AMINO Bilamana protein itu dihirolisis dngan bantuan asam maka hasilnya adalah asam amino. Protein serabut/bnang dan gol. yg satu atom hidrogen dgantikan oleh gugus amino(-NH2). Asam amino merupakan satuan pnyusun protein.R tdk bermuatan tetapi polar 3. Sedangkan contoh struktur tersier adalah protein globular. Ikatan antara N dan C karbonil tdak dpat mngadakan rotasi pada sumbunya.R brmuatan negatif 4. Brdasarkan rumus bngunnya asam amino dpat dpandang sbagai turunan asam karboksilat. alanin. gol. Globular. Contoh yg prtama ialah karatin dan kolagen. maka protein ini direaksikan dngan dinitrofluorobenzena.Bila ditinjau dari konfarmasinya maka protein bsa dbagi mnjadi dua golongan yaitu: bntul serabut atau benang (FIBROUS) dan globular.R brmuatan positif Hidrofobik adalah sifat fobi trhadap air dan bilamana asam amino itu terdapat pd rantai polimer protein maka asam trsebut cenderung melipat dlm gumpalan protein itu.Golongan asam amino dngan R yg tdk polar. Untuk mngatahui adanya dan jenis asam amino terminal pd suatu rantai polipeptida. Berdasarkan hasil pnelitian. asam laktat. Jenis asam amino yg umum trdapat dlm alam ada 20. hidrofobik. Untuk lbih mngetahui noda asam amino yg trdapat pd kertas sering dgunakan zat warna antara lain ialah ninhidrin. 5.STRUKTUR PROTEIN Polimer ini trdiri dari asam amino yg jumlahnya skitar seratus pada sitokrom C dan lbih dari seribu pd laktat dehidogrenase.DENATURASI Struktur primer protein di atas tdk mngalami prubahan. bila direaksikan dngan alkohol dngan bantuan katalisator asam. KLASIFIKASI ASAM AMINO Klasifikasi asam amino atas dasar gugus R-nya.

1 molekul spingosin. taraf kejenuhan dan tingkat esensealitasnya.bersangkutan. dan trdapat dalam membran sel hewan dan saraf dan otak.lapisan pelindung dan 4. c) sfingo lipida dan d) lilin. Spingolipida terdiri dari 3 komponan yaitu . Senyawa ini trdiri dari gliserol -3-P sbagai kerangka dasarnya. Ada dua jenis sfingoglikolipida yg trdapat dalam alam yaitu yg netral dan asam. Oleh karena itu fosfogliserida pd umumnya disebut mnurut gugus induknya atau fosfatidiletanolamin dan fosfatidilkholin. SPINGOLIPIDA DAN GLIKOSFINGOLIPIDA Senyawa ini berkerangka dasarsfingosin atau basa yg sejenis. Asam lemak jenuh adalah yg beratom C 16 dan 18 dan yg tdak jenuh adalah C 18. Taraf denaturasi sehub. Dngan intensitas dan jumlah dan jenis ikatan yg trputus sekurang2nya ada dua yaitu flokulasi dan koagulasi. Sbagai gugus. Jenis yg kdua sfingolipida asam dkenal sbagai gangliosida mempunyai ekor saramida .bahan bakar 3.vitamin dan hormon. b) fosfolipida. alam linoleat dan asam linolenat. 2. Jenis asam lemak yg tdak jenuh adalah asam lemak beratom C sbanyak 18 yaitu asam oleat. Spingolipida yg bnyak trdapat dlm alam ialah sfingomielin yg mngandung fosforiletanomalin atau fosforikolin sbgai kpla yg polar. Senyawa ini trdiri dari gliserol dan tiga molekul asam lemak yg trikat scra ester.komponen struktural membran 2. FOSFOLIPIDA Nama lain golongan ini ialah fosfogliserida atau gliserol fosfatida.LIPIDA KOMPLEKS Lipida ini dbagi mnjadi a) triasil gliserol.KLASIFIKASI DAN TATA NAMA Pada umumnya klasifikasi lipida didaarkan ats krangka dasarnya mnjadi lipida kompleks dan lipida sderhana 3. TRIASIL GLISEROL Nama lain dari golongan senyawa ini adalah lemak netral dan trigliseri-da. 1 molekul asam lemak 1 kepala polar. LIPIDA 1. Senyawa induk fosfolipida adalah asam fosfatidat. Asam lemak yg ada dlm alam dpt dikelompokan ats dsar jumlah atom C.FUNGSI Lipida mempunyai beberapa fungsi diantaranya adalah 1. Senyawa ini trdiri dari “ ekor “ yg tdak bermuatan dan “ kepala”. asam fosfatidat dinamakan gugus fosfatidil.

4. Polinukleotida prtama adalah asam deoksiribonukleat (singkatan teteap DNA) dan yg kdua adalah asam ribonukleat (RNA).Ada golongan lipida lain yang tidak dapat diubah menjadi sabun. ASAM NUKLEAT 1. dan sitosin. r-RNA dan t-RNA. 2. uridin. sitidin. guanin. asam fosfat yg trikat brikutnya adalah anhidrida. yaitu urasil. semaua bagian dihasilkan dari hidrolisis mononukletida.Oleh karena itu asam nukleat juga dinamakan polinukleotida. Nukleosida difosfat dan trifosfatnya trgolong snyawa energi tnggi.FUNGSI Asam nukleat berfungsi sebagai penyimpan sifat keturunan . deoksi timidin. Perbedaan antara dua asam trsebut adalah bahwa DNA mngandung basa N-BASA N adenin. gula yg beratom C sbanyak lima buah dan asam fosfat.DI-DAN POLINUKLOTIDA Sesuai dngan namanya maka polimer itu mngandung dua atau lbih satuan pnyusun yg dikenal sbagai mononukleotida. 3. timin. Berbeda dngan DNA yg trutama trdapat dlm inti sel. Lanolin ialah campuran aster asam lemak dan ianosterol yg trmasuk golngan sterol. sebaliknya RNA sekurangnya ada tiga buah msing2 Bernama m-RNA. Tiga turunan pirimidin yg umum trdapat dlm nukleutida.Steroida yang banyak terdapat dalam kehidupan adalah sterol . guanin dan sitosin. .penyimpan energi dan beberapa diantaranya bekerja sebagai ko-enzim. Senyawa turunan purin yg umum trdapat adalah adenindan guanin.KLASIFIKASI DAN TATANAMA Senyawa ini adalah suatu polimer.LIPIDA SEDERHANA Lipida yang dibicarakan diatas semuanya dapat dihidrolisis dengan alkali dalam keadaan panas yang selanjutnya menghasilkan sabun. Nukleosida yg prtama ada bebrapa yaitu. sdangkan RNA kandngan basa N-adalah adenin.dan sitosin. LILIN Adalah senyawa yg brbentuk ester asam lemak dngan alkohol bkan gliserol.Miko sterol adalah sterol yang terdapat dalam jamur dan ragi misalnya ergosterol yang merupakan bahan baku vitamin D. deoksi guanosin.MONONUKLEOTIDA DAN BAGIAN-BAGIANYA Bagian dari senyawa ini adalah basa nitrogen.RNA pd umumnya trdapat dlm sitoplasma.suatu alkohol yang berintikan perhidrosiklopentano fenantren. deoksi sitidin. Yg brmuatan negatif yaitu asam sialat. adenosin guanosin. urasil. 4.dan berkepala oligosakaridayg mngandung bag.Satuan penyusunannya disebut mononukleotida.senyawa itu termasuk steroida dan terpena. DNA jenisnya hanya sebuah. timin. sdangkan yg kdua adalah deoksi adenosin.

yg potensialnya redoksnya sama dngan 0. yg disingkat F. LYUBIMOVA mnjlaskan bahwa ATP dihidrolisis mnjadi ADP olh miosin dlm suatu proses yg membthkan enrgi. oleh karena dapat mnyimpan energi yg bsar. Frits lippman (pd tahun 1940) brhasil disusun sbuah lingkaran yg mnggambarkan prjalanan dan fungsi ATP dlm sel hidup. ENZIM 1. Engelhardt dan M.0 vol.ENERGI BIOKIMIA DAN LINGKARAN ATP 1. 2. H. Waburg dan O. Pengukur yg dmaksud pd umumnya ialah elektrode H. Mayerhof dinyatakan bahwa senyawa trsebut trbentuk pd proses pemecahan anerobik glukosa menjadi asam laktat dlm jar.LINGKARAN ADENOSIN TRIFOSFAT Adenosin tri-fosfat adalah senyawa yg trmasuk dalam golongan mononukleotida. Oleh karena dapat menyimpan .REAKSI OKSIDO REDUKSI DAN AF Dalam ilmu biokimia bnyak dijumpai reaksi oksidasi dan reduksi.ENERGI BEBAS Bagian energi dlm bhan makanan yg dpt dipergunakan untk mlakukan krja sprti biosintesa (kerja ilmiah). atau pd pembentukanya memerlukan energi yang bsar dinamakan senyawa energi yang tinggi. Kalau dlm suatu sistem atau suatu proses ada senyawa yg dioksidasi maka sebaliknya tntu ad senyawa yg tereduksi. kontraksi muskular (kerja mekanik) dan lain2nya dsebut enrgi bebas. Oleh karena itulah maka proses itu dbri nama proses oksido-reduksi. Bila suatu sistem brbah dari satu ke lain keadaan maka trjadilahprubahan energi bebas yg akn mncapai minimum apabila sistem trsebut mncapai keseimbanganya. SEJARAH . Kalkacar (denmark) dan V. Senyawa sprti ATP. Otot. yaitu salah satu monomer dlm asam nukleat. Oleh O. Untuk mngetahuibsarnya perubahan potensial redoks suatu sistem maka dipergunakanlah sbuah pngukur. 3. Balitzur (uni soviet) dpat membuktikan bahwa ATP jg tmbul dari ADP dlam suatu proses yg dnamakan fosforilasi oksidatif.N. Pd prubahan itu trjadilah prubahan energi bebas yg bsarnya AF=FB-FA Dalam ilmu biokimia senyawa yg pnting di dlm sel hidup adalah senyawa fosfat organik. transpor aktif (kerja osmotik). Kedua proses itu sbenarnya tdk dpt dipisahkan satu sama lain.

4. yg bsa brupa senyawa organik dngan berat molekul ckup tnggi atau logam.KLASIFIKASI DAN TATANAMA Dasar untuk mngklasifikasi enzim ada beberapa yaitu ats dasar nama substrat yg dikatalisis. Pada tahun 1866 louis pasteur mndapatkan bahwa cairan anggur bergula dpt mngalami perubahan mnjadi alkohol dan CO2 oleh karena adanya ragi yg tmbuh didlmnya. Nama yang diberikan senyawa diatas tdak tepat karena mononukleotida yg satu bkan ribosa melainkan ribiol. Sedangkan pada tahun 1872 E. Bagian proteinnya dnamakan apo-enzim dan bgian nir-proteinya dsebut koenzim. Oleh karena reaksi itu bnyak sekali maka biokatalisator yg dbentuk jmlah maupun jnisnya tak trhitung bnyaknya. Koenzim lain yg mngandung vitamin yg bekerja pd reaksi oksidoreduksi adalah flavin adenin dinukleotida dan flavin monokleutida msing2 dsingkt dngan FAD dan FMN. nama jasad hdup yg mnghasilkan enzim dan jenis reaksi yg dikatalisa. Buchner dpt mngekstrak zat yg trdapat dlm ragi yg selanjutnya senyawa itu dpt mlangsungkan fermentasi alkohol tanpa brhubungan dng struktur sel ragi itu sendiri.KOFAKATOR Uutuk aktifitasnya kadang2 enzim ini membthkan kofakator. 2. hidrolase. Apabila enzim itu trdiri dari bgian sprti yg dterangkan di atas maka keseluruhan enzim itu dinamakan holo-enzim. transferase. Biotin dkenal sbagai vtamin atau faktor tumbuh. Atas dasar jenis reaksinya maka enzim dbagi mnjadi 6 golongan yaitu Oksidoreduktasa. Dari nama tersebut diketahui bhwa koenzim (lbih tepak disebut gugus protesis) ini adalahsebuah nukleutida. liase. Senyawa inipun mnjadi bagian dari koenzim yg mngangkat CO2.vitamin yg tremasuk dalam B kompleks lain yg ikt aktif adalahn vitamin B1 atau dkenal sbgai tiamin.STUKTUR TIGA DIMENSI DAN SIFAT KATALITIK . ligase.Enzim adalah protein yg khusus disintesis oleh sel hidup untk mngkatalisis reaksi yg berlngsung di dlamnya. biasa dsebut dngan karboksilasi. isomerase. 3.

Sign up to vote on this title
UsefulNot useful