P. 1
38587563 Laporan Isolasi Dna

38587563 Laporan Isolasi Dna

|Views: 396|Likes:
Published by Yusakhiril Lukman

More info:

Published by: Yusakhiril Lukman on Apr 01, 2012
Copyright:Attribution Non-commercial

Availability:

Read on Scribd mobile: iPhone, iPad and Android.
download as TXT, PDF, TXT or read online from Scribd
See more
See less

10/28/2013

pdf

text

original

ISOLASI DNA Laporan Praktikum UNIVERSITAS NEGERI MALANG FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM Jurusan Biologi

karena atom hidrogennya mempunyai kebebasan tertentu. dan pirimidin yang umum adalah sitosin dan timin. Dua purin yang paling banyak terdapat dalam DNA adalah adenin dan guanin. Fluktuasi kimia semacam itu disebut pergeseran tautomer. dengan meninggalkan gugusan asam amino ( -NH ) dan muatan negatif netto yang diserap oleh sistem cincin molekul yang berkonjugasi. dan struktur struktur molekul berbeda yang dihasilkannya disebut tauto mer ( Goodenough 1988 ). Tujuan : Tujuan dari praktikum kali ini adalah mengetahiu pengaruh jenis buah dan jenis detergen terhadap kualitas DNA yang dihasilkan dalam proses isolasi. Misalnya saja satu atom hidrogen dapat berpindah dari suatu gugusan asam amino ( -NH2 ).September 2010 A. yaitu purin dan pirimdin. molekul resultannya disebut dinukleotida . bil a . C. bila tiga menjadi trinukleotida . Molekul molekul yang berisi ikatan demikian itu mempunyai potensi untuk hadir dalam sejumlah struktur kimia yang berbeda. Purin dan pirimidin berisi beberapa ikatan ganda yang berhubungan. Judul : Isolasi DNA B. Pendahuluan : DNA merupakan suatu materi genetik yang terbentuk dari dua kelompok basa yang berbeda yang mengandung nitrogen. DNA adala polimer bukleotida biasa : bila dua nukleotida digabungkan.

DNA tersusun atas 3 komponen utama yaitu gula deeoksiribosa. Macam macam detergan yang digunakan . Proses ini har us dilakukan dengan hati hati. mitokondria. sehingga tidak menyebabkan kerusakan pada DNA. dan kloroplas. dapat dilakukan dengan memecahkan deinding sel. Penambahan detergen dalam isolasi DNA dapat dilakukan karena detergen dapat menyebabkan rusaknya membran sel. basa nitrogen. sehingga suatu deret 5 -3 pautan fosfat mengikat nukleotida nukleotida itu menjadi satu sejauh panjangnya polimer. membran plasma dan membran inti baik dengan cara mekanik maupun secra kimiawi. Jika dengan cara mekanik bisa dilakukan dengan memblender atau menggerus dengan menggunakan mortar dan pistil. 2006 ). Residu fosfat ( PO4 ) sepanjang rantai ini bersifat asam. atau ikatan fosfodiester. Gugusan fosfat ini. juga terikata secara kimiawi pada 3 -karbon gul a nukleotida kedua. yang terikat pada 5 -karbon gula pentosa pada satu nukleotida. Ikatan ikatan fosfat itu sangat kuat dan dikenal sebagai ikatan ikatan ester kovalen. Hal ini bertujuan untuk memisahkan DNA dengan partikel lain ytang tidak diinginkan. D. Untuk mengluarkan DNA dari sel. 2005 ). dimana basa nitrogen da n kedua benag polinukleotida saling berpasangan dalam pasangan yang tetap melalui ikatan hidrogen dan antara nukleotida yang satu dengan nukleotida yang lain dihubungkan dengan ikatan fosfat. Hanya satu gugusan fosfat dari setiap trifosf at pelopor termasuk dalam polimer. sehingga diberi nama a sam nukleat ( Goodenough 1988 ). melalui ikatan yang dibentuk melalui sis i hidrofobik detregen dengan protein dan lemak pada membran membentuk senyawa lipid protein kompleks ( Machfud. Proses isolasi DNA diawali dengan proses ekstraksi DNA.beberapa membentuk polinukleotida. DNA yang menyusun kromosom ini merupakan nukleotida rangkap yang tersusun heliks ganda. Kajian Pustaka DNA ( Deoxyribose Nucleid Acid ) adalah master molekul yang mengkode semua informasi yang dibutuhkan untuk proses metabolisme dalam setiap organisme ( jamilah.

Alat dan Bahan 1. pear ) . sunlight ) .Pipet tetes .Blender . Alat . keduanya berfungsi seperti halnya lysing buffer ( Dollard.Kertas saring . melon.Sendok plastik kecil 2. E. nanas. Bahan -Buah ( pepaya.Saringan .Spatula .Sendok .Tabung reaksi .Aquades .Beaker glass . Pemekatan dengan etanol pada lapisan atas sampel sehingga ter jadi presipitasi DNA pada perbatasan kedua larutan. Garam garam memegang peran penting yang lain untuk menghilangkan proteindan karbohidart karena garam dapat menyebabkan kedua terpresipitasi dan bersama sama dengan detergen. bukrim.Garam dapur F.Detergen ( rinso.Kain saring . 1994 ).jega berpengeruh pada hasil dari isolasi DNA dengan kualitas baik karena kandung an pada masing masing detergen berbeda. attack. Metode Kerja .Alkohol absolut 95 % .

pear ) . nanas.Memblender 20 gr buah dan 20 ml aquades selama 1 menit ( semua buah diblender satu persatu : buah pepaya. Menambahkan 1 sendok detrgen. lalu menyaring kembali dengan kertas saring . G. 56 ml aquades . Mengaduk detrgen diatas dan jangan sampai berbuih . Menyaring dengan saringan. sunlight t ) . dan memasukkannya kedalam beaker glass ( semua detergen dimasukkan ke dalam beaker glass satu per satu : rinso. attack. Memasukkan 15 ml saringan buah ( alikot ) kedalam tabung reaksi . DATA HASIL PENGAMATAN. 2 spatula NaCl. lalu meneteskan 6 ml etanol 70% yang dingin melalui dinding tabung reaksi . ANALISIS DATA DAN PEMBAHASAN Tabel Data Hasil Pengamatan Buah Detergen Waktu Banyak DNA Pepaya Rinso 15 detik . Mencatat waktu awal terbentuknya benang benang DNA dan membandingkan ketebalan lapisan DNA yang terbentuk pada masing masing jenis buah Mengulangi tiap jenis buah dan detergen masing-masing 2 kali. Meletakkan hasil saringan pada beaker glass . melon. bukrim. Menambahkan 1ml campuran detergen. Mengambil detergen.

.

37 menit Rinso 11 detik 15 detik Attack 6 detik Tomat 13 detik Bukrim 17 detik 38 detik Sunlight 27 detik 19 detik .57 detik Sunlight 13.31 detik Nanas 6.15 detik Melon 9.33 detik Attack 5.27 detik 34 detik Rinso 7.13 detik Bukrim 8.24 detik Bukrim 45 detik 30.04 detik Sunlight 3.49 detik Attack 6.17 detik Attack 3 detik 4 detik Bukrim 20 detik 26 detik Sunlight 7 detik 8 detik Rinso 8.26 detik 7.05 detik 9.91 detik 6.40 menit 3.

Sedangkan waktu yang paling lama yang dibutuhkan detergen untuk menghasilkan DNA ini dittempati oleh larutan sabun bukrim. namun dalam mengaduk diusahakan jangan sampai berbuih. Untuk detergen yang lain memiliki waktu yang berada ditengah tengah larutan sabun atta ck . Kemudian untuk waktu yang dibutuhkan detergen untuk membentuk DNA itu paling cepat didapatkan oleg larutan sabun attack dengan waktu untuk ulangan pertama 3 detik dan ulangan yang keduan 4 detik.Keterangan : + : tipis ++ : sedang +++ : agak tebal ++++ : tebal Analisis Data Praktikum kali ini yaitu isolasi DNA bertujuan untuk mengetahui pengaruh macam buah dan jenis detergen terhadap kualitas DNA yang dihasilkan dalam proses isolasi. aquades 56 ml. nanas. Kemudian menuangkan 15 ml alikot kedalam tabung reaksi yang selanjutnya ditetesi etanol 70 % dingin melalui dinding tabung reaksi. damn pear. Setalah proses isolasi DNA dilakuakn. da n mengaduknya. melon. Perolehan kualifikasi ini sama untuk setiap ulangan art inya pada semua ulangan perolehan DNA yang dapat diisolasi ini sama. DNA yang berhasil diisolasi paling tebal dengan kualifikasi +++ ( agak tebal ) ditemukan pada tabung reaksi yang be risi larutan sabun rinso dan attack. Sebelumnya buah buah ini di blender terlebih dahulu selama satu menit agar nantinya bisa didapatkan alikot. untuk ulangan pertama 20 detik dan ulangan yang kedua 26 detik. Setelah buah diblender menyiapkan detergen yang telah ditambai dengan 2 spatula NaCl. sedangkan isolasi DNA yang kualifikasinya paling tipis didapatkan oleh tabung reaksi yang berisi larutan sabun cair sunlight deng an kualifikasi + ( tipis ). kami mendapatkan data bahwa pada penggunaan buah pepaya sebagai sumber DNA. misalnya pada larutan sabun bukrim ini kualifikasinya ulangan pertama dan kedua sama yaitu ++ ( sedang ). Buah yang digunakan dalam proses isolasi DNA kali ini adalah buah pepay a.

DNA yang berhasil diisolasi paling tebal dengan kualifikasi ++++ ( tebal ) ditemukan pada tabung r eaksi yang berisi larutan sabun attack. Proses isolasi yang kedua ini menggunakan buah nanas. Untuk detergen yang lain memiliki waktu yang berada ditengah tengah larutan atta ck dan larutan sabun bukrim. DNA yang berhasil diisolasi paling tebal dengan kualifikasi ++++ ( tebal ) ditemukan pada tabung r eaksi yang berisi larutan sabun attack. dan untuk ulangan yang kedua selama 7. dimana didapatkan data bahwa pada penggunaan buah nanas sebagai suber DNA.24 detik. Kemudia n untuk waktu yang dibutuhkan detergen untuk membentuk DNA itu paling cepat didapatkan oleh larutan sabun attack dengan waktu untuk ulangan pertama yaitu 5. sedangkan isolasi DNA yang kualifikasinya pali ng tipis didapatkan oleh tabung reaksi yang berisi larutan sabun cair sunlight deng an .57 detik. Sedangkan waktu yang paling lama yang dibutuhkan detergen untuk menghasilkan DNA ini ditempatioleh larutan sabun bukrim. untuk ulangan pertama selama 15 detik. sedangkan isolasi DNA yang kualifikasinya pali ng tipis didapatkan oleh tabung reaksi yang berisi larutan sabun cair sunlight deng an kualifikasi + ( tipis ). 31 detik dan untuk ulangan yang kedua yaitu 6.dan bukrim. Proses isolasi yang ketiga ini menggunakan buah melon. Pada larutan sabun rinso waktu yang dibutuhkan untuk membentuk DNA ini. Sedangkan waktu yang dibutuhkan pada larutan sabun sunlight untuk membentuk DNA pada ulangan pertama sela 13. dimana didapatkan data bahwa pada penggunaan buah melon sebagai sumber DNA.27 detik dan ulangan kedua selama 34 detik.26 detik. Sedangkan waktu yang dibutuhkan pada larutan sabun sunlight untuk membentuk DNA pada ulangan pertama selama 7 detik dan ulangan ke dua selama 8 detik. Pada larutan sabun rinso waktu yang dibutuhkan untuik membentuk DNA ini untuk ulangan pertama selama 8. misalnya pada larutan sabun bukarim dan rinso yang mempunyai kualifikasi untuk ulangan pertamadan kedua sama yaitu bukrim ++ ( sedang ) dan rinso +++ ( agak ). untuk ulangan pertama 45 detik dan ulangan yang kedua 30. Perolehan kualifikasi ini sama untuk semua ulangan ulan gan artinya pada semua ulangan perolehan DNA yang dapat diisolasi ini sama.33 detik. dan untuk ulangan kedua selama 17 detik.

40 menit dan ulangan yang kedua 3. misalnya pada larutan sabun bukrim dan rinso yang mempunyai kualifikasi untuk ulangan pertama dan kedua sama yaitu bukrim ++ ( sedeang ) dan rinso +++ ( agak tebal ). sedangkan isolasi DNA yang kualifikasinya palin g tipis didapatkan oleh tabung reaksi yang berisi larutan sabun cair sunlight deng an kualifikasi + ( tipis ). dan untuk ulangan yang kedua selama 9. misalnya pada larutan sabun bukrim dan attack yang mempunyai kualifikasi untuk ulangan pertama dan kedua sama yaitu bukrim +++ ( agak tebal ) dan rinso ++ ( sedang ). Kemudian untuk waktu yang dibutuhkan detregen untuk membentuk DNA itu paling cepat didapatkan oleh larutan sabun attack dengan waktu : untuk ulangan pertama yaitu selama 6 detik dan untuk ulangan yang kedua yaitu 13 detik.15 detik. untuk ulangan pertama 17 detik dan ulangan yang kedua 38 detik. DNA yang berhasil diisolasi paling tebal dengan kualifikasi ++++ ( tebal ) ditemukan pada tabung r eaksi yang berisi larutan sabun rinso.37 menit. untuk ulangan pertama 3.04 detik. Sedangkan wakt u yang paling lama yang dibutuhkan detergen untuk menghasilkan DNA ini ditempati oleh larutan sabun bukrim.13 detik. Sedangkan waktu yang paling lama yang dibutuhkan detergen untuk menghasilkan DNA ini ditempati oleh larutan sabun cair senlight. Perolehan kualifikasi ini sama untuk semua ulangan ulan gan artinya pada semua ulangan perolehan DNA yang dapat diisolasi ini sama. Proses isolasi yang keempat ini menggunakan buah pear. Kemudian untuk waktu yang dibutuhkan detregen untuk membentuk DNA itu paling cepat didapatkan oleh larutan sabun rinso dengan waktu : untuk ulangan pertama yaitu selama 7. Pada larutan sabun atta ck waktu yang dibutuhkan untuk membentuk DNA ini untuk ulangan pertma selama 6. Perolehan kualifikasi ini sama untuk semua ulangan ulan gan artinya pada semua ulangan perolehan DNA yang dapat diisolasi ini sama. Untuk detergen yang lain memiliki waktu yang berada ditengah tengah .91 detik dan untuk ulangan yang kedua yaitu 6.49 detik. Untuk detergen yang lain memiliki waktu yang berada ditengah tengah larutan sabun sunlight dan rinso.kualifikasi + ( tipis ). Sedangkan waktu yang dibutuhkan pada larutan sabun bukrim untuk membentuk DNA pada ulangan pertama selama 8.05 detik dan ulangan yang kdua selama 9. dimana didapatkan data bahwa pada penggunaan buah pear sebagai sumber DNA.

dan sunlight. Pada larutan sabun rinso waktu yang dibutuhkan untuk membentuk DNA ini untuk ulangan pertma selama 11 detik. Cara yang digunakan untuk merusak membran membran inti untuk mengambil DNA tersebut sangat beraneka ragam. Pembhasan Pada dasarnya isolasi DNA dapat dilakukan dengan menggunakan berbagai macam sumber DNA yang dapat diperoleh dari hewan maupun tumbuhan. Dengan melihat tabel hasil pengamatan dan juga analisis data dapat diketrahui bahwa jenis detergen itu mempengaruhi hasil dari isolasi DNA. Sedangkan waktu yang dibutuhkan pada larutan sabun cair sunlight untuk membentuk DNA pada ulangan pertama selama 27 detik dan ulangan yang kdua selama 19 detik. sedangkan waktu yang dibutuhkan untuk membentuk isolasi DNA paling lama ini di tempati oleh sumber DNA buah melon. Untuk sumber DNA yang menghasilkan isolasi DNA paling tebal itu diperoleh oleh buah nanas. Untuk sumber DNA yang membutuhkan waktu pailing cepat tuk menghasilkan proses isolasi DNA ini dimiliki oleh buah pepaya. Selain perusakan dengan cara fisik membran inti dapat dirusak dengan cara menggunakan senyawa senyawa kimia. dan untuk ulangan yang kedua selama 15 detik. Untuk waktu yang dibutuhkan untuk menghasilkan isolasi DNA ini bervariasi dari setiap detergen. larutan detergen attack sering menghasilkan DNA dengan ketebalan paling tinggi sedangkan larutan dengan sabun cair sunlight memiliki hasil isolas i DNA yang paling tipis. . Pada pengamatan kali ini macam detergen yang digunakan sebanyak 4 macam detergen yaitu rinso. Dari detergen yang telah digunakan ada yang berpengaruh sangat baik dalam pembentukan isolasi DNA dan ada pula yang memberikan pengaruh kurang baik terhadap iaolasi DNA. bukrim. misalnyadengan pemblenderan atau penggerusan dengan mortal dan pistil.larutan sabun bukrim dan attack. . attack. Untuk wakttu yang dibutuhkan untuk menghasilkan isolasi DN A paling lama ini diperoleh oleh larutan sabun bukrim dan untuk larutan sabun yang paling cepat menghasilkan isolasi DNA adalah pada larutan sabun attack. Pada beberapa perlakuan dan juga ulan gan yang dilakukan.

sementara filtrat berada dibagian dasar tabung karena ethanol memil iki kerapatan yang lebih kecil dibandingkan air ( Jamilah 2005 ). Sehingga adalam penentuan kepekatan antara kelompok satu dengan kelompok yang lain itu bisa berbeda. Dalam penentuan kepekatan kadar isolasi DNA ini dilakuakn oleh 4 kelompok besar. larutan akan tampak terbalik untuk beberapa saat. Pada saat penambahan etanol.Pada teori yang kami peroleh dijelaskan bahwa semakin banyak kandungan air pada buah maka sel yang terlarut dalam ekstrak akan semakin sedikit. Detergen mengandung sodium dodesil sulfat ( SDA ) yang dapat menyebabkan hilangnya molekullipid pada membran sel sehingga struktur membran akan rusak dan melisiskan isi sel ( kamilah. Pada salah satu sumber menyatakan bahwa dalam proses pembuatan sumber DNA untuk isolasi DNA hendaknya jangan terlalu encer karena semakin encer sumber DNA . Jika melihat dari jenis buah yang digunakan sebagai sumber DNA. Pada saat penghancuran jarin ga jaringan sampel pada awal proses isolasi DNA. dan pada akhirnya ethanol akan berada di ba gian atas tabung.2005 ). DNA yang terpresipitasi akan semakin sedikit. Misaslnya saja dalam penentuan kadar kepekatan hasil isolasi DNA yang kami nilai. Hal ini terbukti bahwa pada perlakuan buah melon mempunyai kadar iar yang lebih banyak bila dibandingkan dengan buah yang lain. dalam penentuan kepekatan bisa saja kelompok kami mengatakan bahwa pada buah ini sangat pekat namun kelompok lain mengatakan kepekatanm buah ini sedikit seperti itu. terjadi pelepasan senyawa polifeno l dan polisakarida ( Zubaidah. Dalam proses isolasi DNA detergen berfungsi menggantikan senyawa senyawa kimia. . : 38 ). ternyata buah yang memiliki kadar air rendah menghasilkan presipitasi DNA yang lebih baik jika dibandingkan dengan sumber DNA yang dari buah yang memiliki kadar air yang tinggi. Misalnya pada buah pepaya. Namunb pqada pengamatan iaolasi DNA kali ini kami rasa hasil yang diperoleh kurang akurat.

Apakah fungsi dari penembahan detergen ? . baik dari inti. .Diskusi . maupun kloroplas. Adapun fungsi dari penambahan garam yaitu untuk menghilangkan protein dan karbohidrat.. mitokondria... Apakah fungsi dari penambahan alkohol . Isolasi DNA merupakan cara ataupun metode yang digunakan untuk memisahkan DNA dari sel . . Dalam hal ini penambahan garam bisa dikatakan dapat membantu dalam hal pemekatan DNA.G. Apa kesimpulan dari praktikum isolasi DNA ? .. Karena pada detergen mengandung sodium dodesil sulfat ( SDA ) yang dapat . Mengapa larutan tidak boleh berbuih ketika diaduk dengan penambahan detergen ? .. Apakah yang dimaksud dengan isolasi DNA ? . karena ion Na+ yang diakndung oleh garam mampu memblikir dengan kutub negatif fosfat DNA. Apakah kecepatan pembentukan DNA pada masing masing buah dan detergen berbeda ? . Fungsi dari penambahan detergen yaitu untuk melisiskan barier sel secar kimia sebagai pengganti senyawa kimia yang mampu merusak dinding dan membran sel... Jawaban : .... Mengapa alkohol yang ditambahkan dalam keadaan dingin ? .. Apakah fungsi dari penambahan garam ? . Penambahan garam juga dpat digunakan untuk melarutka n DAN. Karena pada garam ini memang dapat menyebabkan protein dan karbohidrat terpresipitasi.

selain itu det ergen yang digunakan dalam proses isolasi DNA nantinya juga akan menghasilkan hasil isolasi DNA yang berbeda. . . .. kecepatan pembentukan DNA pada masing masing buah dan detergen itu berbeda karena jenis detergen ada yang memberikan pengruh baik dalam proses isolasi DNA dan ada jiga yang memberikan pengaruh kurang baik dalam proses isolasi DNA. . . Iya.menyebabkan hilangnya molekullipid pada membran sel sehingga struktur membran akan rusak dan melisiskan isi sel. Pada buah juga demikian ada buah yang memberikan pengaruh baik dalam proses isolasi DNA dan ada juga yang memberikan pengruh kurang baik dalam proses isolasi DNA.. Selain itu jika alkohol yang dingin yang diberikan maka konsentrasi DNA yang akan terikat oleh alkohol tersebut akan semakin pekat. . Kesimpulan dari praktikum kali ini adalah bahwa sumber DNA yang digunakan itu berpengaruh terhadap hasil dari proses isolasi DNA. Larutan sabun tidak boleh berbuih karena agar sel dapat mengalami lisis yang disebabkan karena rusaknya dinding dan membran sel.. karena pada alkohol yang dingin dapat membentu mempercepat proses mempertifikasi DNA. mislanya pada buah yang memiliki kadar air rendah maka nantinya akan menghasilkan presipitasi DNA yang lebih baik.. dan sebaliknya jika buah yang memiliki kadar air tinggi maka nantinya akan menghasilkan presipitasi DNA yang kurang baik. Fungsi dari penambahan alkohol yaiut untuk mengikat strand DNA yang telah terkumpul. Strand strand DNA yang terikat oleh alkohol akan nampak sebagai benang benang putih yang terapung diatas filtrat.. Selain itu alkohol juga berfun gsi mempertifikasi DNA. Alkohol yang ditambahkan dalam keadaan dingin.

Semakin rendah kadar air dalam buah maka semakin tinggi hasil presipitasi DNA. Kesimpulan . Jenis buah yang digunakan dalamproses isolasi DNA berpengaruh terhadap hasil dari isolasi DNA itu sendiri . Detergen berpengaruh terhadap hasil dari isolasi DNA . dan sebaliknya jika buah yang memiliki kadar air tinggi maka nantinya akan menghasilkan presipitasi DNA yang rendah .H....

pengaruh berbagai macam detergen. distribusi dan upaya eliminasi bakteri penyebab CVPD ( Citrus Vein Phloem Degeneration ). Http : //www. Com Http : //www. Skripsi tidak diterbitkan. Genetics. Identifikasi. Isolasi DNA. Desertasi tidakl diterbitkan. dan ekstrak nanas ( Ananas comunis )terhadap hasil isolasi DNA berbagai macam buah sebagia topik praktikum mata kuliah genetika. 1988. // wiki. Genetics //. Com Http : //www/ structur DNA. ursula. Jakarta : erlangga.Daftar Pustaka Jamilah. Malang : program pasca sarjana Universitas Brawijaya. com . 2004. 2005. penambahan enzim. Goodenough. siti. Malang : Unoversitas Negeri Malang. variasi genetik. Zubaidah.

You're Reading a Free Preview

Download
scribd
/*********** DO NOT ALTER ANYTHING BELOW THIS LINE ! ************/ var s_code=s.t();if(s_code)document.write(s_code)//-->