Faulina Milianie H1E109073 Bioteknologi lingkungan Metabolisme dan Ko-Metabolisme

Metabolisme

Mikroorganisme terdiri dari 10 elemen, sebagian digunakan untuk membuat karbohidrat, lemak, protein dan asam nukleus. Beberapa elemen membutuhkan enzim dan kofaktor. Semua organisme dapat hidup di semua tempat yang memiliki sedikit nutrisi, dengan tambahan karbon, energi dan atom hidrogen. Molekul nutrisi tidak bisa masuk ke dalam membran plasma tanpa melewati difusi pasif. Mereka harus ditransfer dengan 1 dari 3 mekanisme yang menggunakan pembawa membran protein. 1. Kebutuhan Nutrisi 95% atau lebih sel kering terbuat dari beberapa elemen: karbon, oksigen, hidrogen, nitrogen, sulfur, phosphorus, potasium,kalsium, magnesium dan besi. Faktor Pertumbuhan : a) asam amino, untuk sintesis protein b) Purines and pyrimidines, untuk sintesis asam nukleus c) Vitamin, Vitamin merupakan molekul organik yang biasanya digunakan seluruh atau sebagian untuk cofaktor enzim dan sebagian kecilnya untuk pertumbuhan 2. Jenis Nutrisi Mikroorganisme Phtoautotroph Algae, Cyanobacteria Light + Chlorophyll CO2 + H2O CH2O +O2 Purple and green bacteria Light + bacteriochlorophyll CO2 + 2H2S CH2O + H2O + 2S Photoheterothop Purple nonsulfur bacteria (Rhodospirillum) Light + bacteriochlorophyll CO2 + 2CH3CHOHCH3 CH2O + H2O + 2CH3COCH3 Peningkatan Nutrisi Molekul nutrisi tidak bisa masuk ke dalam membran plasma tanpa melewati difusi pasif. Mereka harus ditransfer dengan 1 dari 3 mekanisme yang menggunakan pembawa membran protein. a. Transfor Pasif difusi Sederhana Difusi pasif adalah proses dimana molekul pindah dari konsentrasi tinggi ke konsentrasi rendah, merupakan hasil dari random thermal agitation. Sebagian kecil substansi, dapatmasuk ke dalam membran plasma seperti glycerol melalui Difusi Pasif. b. Fasilitas Difusi Proses difusi masuk ke dalam membran permeabel akan meningkat pesat dengan menggunakan pembawa protein yang disebut permeases yan ditemukan di plasma membran. Sejak difusi dilakukan oleh pembawa maka ini disebut fasilitas difusi. Fasilitas difusi akan meningkat dengan gradien yang lebih banyak dan konsentrasi difusi lebih rendah dibanding difusi pasif. c. Transfor Aktif Transpor aktif adalah transpor molekul dari konsentrasi tinggi atau gradien tinggi dengan menggunakan metabolisme energi yang masuk d. Grup Translokasi Yang paling terkenal kelompok sistem translokasi adalah phosphoenolpyruvate: gula sistem phosphotransferase (PTS), yang mengangkut berbagai gula ke dalam sel prokariot sementara Bersamaan fosforilasi mereka menggunakan phosphoenolpyruvate (PEP) sebagai donor fosfat. Kultur media Media kultur diperlukan untuk menumbuhkan mikroorganisme di laboratorium dan untuk melaksanakan prosedur khusus seperti identifikasi mikroba, air dan analisis makanan, dan isolasi mikroorganisme tertentu. Berbagai macam media yang tersedia untuk tujuan ini dan lainnya. Kultur murni dapat diperoleh melalui penggunaan piring penyebaran, piring beruntun, atau menuangkan piring dan diperlukan untuk studi hati-hati dari spesies mikroba individu. Gambaran Umum Metabolisme Metabolisme adalah suatu sistem perubahan kimiawi yang menjaga kegiatan nutrisional dan fungsional organisme. Anabolisme adalah proses sintesis komponen-komponen sel dari molekul-molekul sederhana, biasanya membutuhkan energi. Katabolisme adalah disimilasi atau penguraian molekul-molekul organik kompleks yang membebaskan energi. Proses ini merupakan sebagian dari proses keseluruhan metabolisme. Fermentasi: Pathway Embden-Meyerhof Fermentasi adalah reaksi oksidasi-reduksi internal seimbang di mana beberapa atom dari sumber energi (elektron donor) menjadi lebih berkurang sedangkan yang lain menjadi lebih teroksidasi, dan energi yang dihasilkan oleh substrat tingkat fosforilasi. Sebuah jalur biokimia umum untuk fermentasi glukosa adalah glikolisis, yang juga bernama jalur Embden-Meyerhof untuk penemu utama. Dapat dibagi menjadi tiga tahap utama., yaitu tahap reaksi Redoks, tahap Persiapan, dan tahap Produksi

3.

4.

5.

6.

Faulina Milianie H1E109073 Bioteknologi lingkungan

7. Produk fermentasi. Hasil akhir dari glikolisis adalah konsumsi glukosa, sintesis bersih dua ATP, dan produksi produk fermentasi. Respirasi dan Transportasi Elektron Respirasi: dimana molekul oksigen atau oksidan lainnya berfungsi sebagai akseptor elektron terminal. Pembahasan penawaran respirasi dengan kedua karbon dan transformasi elektron: a) jalur biokimia yang terlibat dalam transformasi karbon organik menjadi CO2 b) elektron cara ditransfer dari senyawa organik ke akseptor elektron terminal, mengemudi sintesis ATP dengan mengorbankan kekuatan motif proton. Transportasi elektron Elektron sistem transportasi terdiri dari membran yang terkait pembawa elektron. Sistem ini memiliki dua fungsi dasar: a) untuk menerima elektron dari donor elektron dan mentransfernya ke akseptor elektron b) untuk menghemat sejumlah energi yang dilepaskan selama transfer elektron untuk sintesis ATP. Neraca dari Respirasi aerobik dan Penyimpanan Energi menghasilkan ATP dan Sel Jumlah ATP yang dihasilkan oleh organisme memiliki efek langsung terhadap hasil sel. hasil sel berbanding lurus dengan jumlah ATP yang dihasilkan telah dikonfirmasi dari studi eksperimental tentang hasil pertumbuhan berbagai mikroorganisme dan menyiratkan bahwa biaya energi untuk perakitan makromolekul jauh sama untuk semua mikroorganisme. Penyimpanan energi Sebagian besar mikroorganisme menghasilkan polimer tidak larut yang nantinya dapat teroksidasi untuk produksi ATP. Pembentukan polimer penting untuk sel karena dua alasan. Pertama, energi potensial yang tersimpan dalam bentuk yang stabil, dan kedua, polimer tidak larut memiliki sedikit efek pada tekanan osmotik internal sel. Gambaran Umum Alternatif Mode Generasi Energi a) Respirasi anaerobik b) Chemolithotrophi c) Phototrophy d) Pentingnya Angkatan Motif Proton Strategi bioenergi alternatif Biosintesis Monomer a) Monomer dari Polisakarida: Gula Metabolisme gula ; Polisakarida disintesis dari bentuk-bentuk aktif dari heksosa seperti UDPG, yang strukturnya ditunjukkan di sini. Glikogen ini disentesis dari adenosin-phosphoglucose dengan penambahan berurutan glukosa. Pentosa untuk sintesis asam nukleat dibentuk oleh dekarboksilasi dari heksosa seperti glukosa-6-fosfat. b) Monomer dari Protein: Asam Amino Sintesis dari berbagai asam amino dalam sebuah keluarga sering membutuhkan banyak langkah enzimatis katalis terpisah mulai dari asam amino orangtua c) Monomer Asam nukleat: Nukleotida prekursor dari kerangka purin Inosinic asam, cikal bakal dari semua nukleotida purin. prekursor dari kerangka pirimidin, asam orotic. Uridylate, cikal bakal dari semua nukleotida pirimidin. Uridylate terbentuk dari orotate menyusul dekarboksilasi dan penambahan ribosa-5phosphate. d) Monomer dari Lipid: Asam Lemak Tampil adalah biosintesis dari kering C16 lemak, plamitate. Tion kondensasi asetil-ACP dan malonil-ACP membentuk acetoacetylCoA. Selain liach berurutan dari unit asetil berasal dari malonil-CoA. Fiksasi nitrogen Pemanfaatan gas nitrogen (N2) sebagai sumber nitrogen disebut fiksasi nitrogen dan adalah properti dari hanya prokariota tertentu. Dari tabel di bawah ini dapat dilihat bahwa berbagai prokariota, baik anaerobik dan aerobik, nitrogen memperbaiki. Ada beberapa bakteri, disebut simbiosis, yang memperbaiki nitrogen hanya berkaitan dengan tanaman tertentu. Sejauh yang saat ini dikenal, tidak ada organisme eukariotik nitrogen. Salah satu nitrogen fiksasi bakteri yang paling menarik dan penting adalah jenis tertentu, seperti Rhizobium Bradyrhizobium, Sinorhizobium atau Azorhzobium, mereka dapat membangun hubungan simbiosis dengan tanaman polongan.

8.

9.

10.

11.

Ko-Metabolisme

Ko-metabolisme didefinisikan sebagai degradasi simultan dari dua senyawa, di mana degradasi dari senyawa kedua (substrat sekunder) tergantung pada keberadaan senyawa pertama (substrat primer).