P. 1
makalah

makalah

|Views: 148|Likes:

More info:

Published by: イヴァンス アウゲル on Apr 24, 2012
Copyright:Attribution Non-commercial

Availability:

Read on Scribd mobile: iPhone, iPad and Android.
download as DOC, PDF, TXT or read online from Scribd
See more
See less

07/11/2012

pdf

text

original

MAKALAH EVOLUSI Evolution of Genomic Diversity and Sex at Extreme Environtments : Fungal Life under Hypersaline Dead Sea

Stress oleh : Kelompok 3 1. Hiasinta Guruh 3. Anita Juhari 4. Eka Oktavianti 5. Rizka A 6. Noer M (0810910010) (08109130 ) (0810913026) (08109130 ) (08109130 ) 2. Imam Fikry Fanani (0810910050)

JURUSAN BIOLOGI FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM UNIVERSITAS BRAWIJAYA 2011

kondisi tersebut terus memburuk dengan adanya tingkat volume air yang terus menurun pada setiap tahunnya. Adanya spesies yang dapat bertahan dan hidup stabil di perairan Laut Mati tersebut. bahkan dalam populasi kecil. Keanekaragaman genom yang terjadi sangat dipengaruhi oleh seleksi alam. Beberapa biota laut yang dapat bertahan hidup di lingkungan tersebut. Keragaman genom juga menyebabkan adanya evolusi pada makhluk hidup yang tinggal pada lingkungan yang ekstrim dengan ditandai adanya proses adaptasi dan spesiasi.1 Latar Belakang Keanekaragaman genom di alam dapat membentuk suatu keanekaragaman kehidupan dalam skala regional dan lokal di dunia. pengaruh ekologi dan stress lingkungan. Biota yang dapat bertahan hidup disana adalah alga hijau uniseluler Dunaliella parva sebagai produsen utama. keseimbangan. Bagaimana keragamanan genom yang dimiliki jamur Aspergillus versicolor di Perairan Laut Mati? 2.2 Permasalahan 1.9 yang membuat lingkungan menjadi sangat ekstrim dan membuat sebagian besar kehidupan tidak dapat bertahan disana. dan siklus.BAB I PENDAHULUAN 1. melatar belakangi peneliti melakukan penelitian ini. dan berbagai spesies Archaea halofilik keluarga Halobacteriaceae. Interaksi yang terjadi antar genom dapat menyebabkan efek mutasi dan migrasi. juga terdapat spesies yang tumbuh stabil di perairan Laut Mati yaitu jamur filamen (DSW) Gymnascella marismortui yang merupakan spesies endemik. diversifikasi. Namun. Faktor apa saja yang mempengaruhi keragaman genom jamur Aspergillus versicolor di Perairan Laut Mati? 1. Keragaman genom yang terjadi berkorelasi positif dengan adanya keanekaragaman. sebagai konsumen utama. Laut Mati memiliki salinitas yang cukup tinggi dengan pH 5. Peneliti menghubungkan peningkatan stres lingkungan dan genomik (coding dan noncoding). Keberadaan mikroorganisme ini hanya terjadi pada musim penghujan saja. Keanekaragaman genom di alam secara teoritis dapat dipelihara dengan ekologi spasial dan variasi temporal. Aspergillus versicolor dan Eurotium herbariorum. 1.3 Tujuan . Salah satu tempat yang dapat mempengaruhi keragaman genom pada makhluk hidup adalah Laut Mati. Pada saat ini.

diharapkan mahasiswa dapat mengetahui dan memahami bagaimana evolusi dapat terjadi akibat adanya stress lingkungan yang mempengaruhi keanekaragaman genom pada suatu spesies tertentu. .Tujuan dari peneliti dalam penelitian ini adalah mengetahui keanekaragaman genom yang bersifat adaptif pada Jamur Aspergillus versicolor yang hidup di perairan Laut Mati. 1.4 Manfaat Setelah melakukan pembelajaran tentang jurnal ini.

Studi ini dilakukan untuk mengetahui diversitas genomic dari suatu fungi dari kelas Ascomycetes yaitu A. band diproduksi dengan ukuran 40–500 bp dalam sampel yang berbeda di seluruh gel yang dicetak.BAB II ISI Diversitas genom selalu berhubungan dengan diversitas ekologi dan stress lingkungan. . Dari hasil AFLP. keseimbangan dan siklus. Pada suatu populasi kecil. diversitas genom sangat dipengaruhi oleh seleksi alam sehingga terbentuk suatu diversitas. versicolor pada lingkungan dengan kadar garam tinggi didaerah sekitar laut mati. Pengambilan sampel A. DSSW. DSSC dan DSDW. DSAS. Matriks biner dibangun untuk semua yang terisolasi oleh penilaian keberadaan (1) ataupun ketiadaan (0) AFLP band. Hal ini terjadi dengan ditandai adanya mutasi dan migrasi. versicolor dilakukan di beberapa tempat yang berbeda yaitu daerah non saline yaitu sungai Jordan (JRS) dan tanah nonsaline di lower Nahal keziv (ECII) dan daerah saline yaitu pantai teresterial laut mati (DSTS). Metode yang digunakan untuk mengetahui suatu diversitas genom adalah Amplified Fragment Length Polymorphisme (AFLP) yang bisa digunakan untuk menganalisis daerah coding dan non coding pada suatu individu dan populasi sehingga bisa untuk mengetahui suatu evolusi dari individu tersebut.

Dead Sea surface water (DSSW). Dead Sea aquatic shore (DSAS). 50–280 m). H. A–G. A–G. southern Jordan River (JRS)) Dari hasil AFLP. band diproduksi dengan ukuran 40–500 bp dalam sampel yang berbeda di seluruh gel yang dicetak. bisa diperkirakan keanekaragaman genetik yang diharapkan dengan rumus di mana hek adalah nilai dari he untuk lokus kth. Untuk analisis keanekaragaman genom dalam suatu populasi. DSTS. YA and Y2. versicolor (Dead Sea deep water (DSDW. Matriks biner dibangun untuk semua yang terisolasi oleh dengan penilaian 1 untuk ada atau 0 untuk tidak ada pada band AFLP. Dead Sea Arubotaim salt cave. .Gambar 1 Peta Pengambilan Sampel A. he merupakan perkiraan keragaman genetik untuk suatu lokus tunggal yang dirumuskan he = n(1-∑xi2)/(n-1) di mana n adalah jumlah haploid individu dan xi adalah frekuensi alel pada lokus dalam sampel dari populasi. K and I. dan r adalah jumlah total lokus yang diteliti.

regional dan local) menunjukkan kehidupan dan keteraturan korelasi yang positif dengan heterogenitas lingkungan abiotik dan biotic.Gambar 2 Nilai H e dari Populasi Fungi A. DSDW. . Struktur dan evolusi keragaman ini secara umum dari segi molekular dan tingkat organisme dan di semua skala geografis ( global. Ukuran stress lingkungan berupa gabungan dari salinitas dan tekanan. 5. Dalam hal ini menunjukkan suatu bukti terdapat hubungan genetik pada A. 6. migrasi dan genetik drift . mengalami penurunan pada lingkungan di laut mati pada kedalaman 50-280 m. 3. DSSW. berinteraksi dengan efek dari mutasi. termasuk diversifikasi. versicolor di seluruh Israel. Keanekaragaman genom A. 4. versicolor mengalami peningkatan seiring bertambahnya stress lingkungan. Evolusi keragaman genom di bawah tekanan lingkungan telah menunjukkan keragaman fenotip dan genotip di alam. DSTS. DSAS. ‘‘African’’ south-facing slope (ECII). Berdasarkan hasil penelitian ini menunjukkan bahwa diversitas genetic dari A. JRS. Namun. versicolor memuncak di pantai dan air permukaan Laut Mati tetapi kemudian menurun drastis di laut dalam hipersaline air (50-280m) dengan salinitas > 34% dan tekanan tinggi. Teori ini ditunjukkan terhadap jamur tanah Ascomycetes A. versicolor berdasarkan pada 605 AFLP band dari lokus gen yang berada pada daerah coding and noncoding 1. versicolor terhadap stress lingkungan. Evolusi keanekaragaman hayati ternyata pada populasi kecil sangat dipengaruhi seleksi alam. 2. siklus. keseimbangan.

versicolor memiliki sifat adaptif yang terhadap lingkungan terutama toleransi terhadap tingginya kadar garam. A. versicolor dikondisikan ke permukaan aktifitas air rendah dan radiasi yang tinggi.119 pada spesies Gryllotalpa tali yang hidup di Israel ke angka 0. Ekspresi fenotip terhadap toleransi garam menguatkan suatu bukti genetic pada spesies ini. Hasil yang diperoleh pada A. Isolat ini kurang toleran saat gabungan hypersalinity dan tekanan yang tinggi sangat mirip ditempat suatu Negara ditemukan di deep- . sebagaimana terefleksi dengan penurunan curah hujan tahunan dan peningkatan variasi hujan dan tidak dapat diprediksi. seperti gurun (tetapi tidak termasuk keadaan ekstrim) akan diseleksi untuk protein heterozygosity yang lebih tinggi.039 pada Gryllotalpa marismortui yang tinggal di habitat Salinitas tinggi (batas laut mati) di lingkungan ekstrim untuk mole crickets. Kenaikan karagaman parallel dalam meningkatkan level stress. DSDW mengalami kondisi stress yang ekstrim dari lingkungan yang mengalami hypersalinitas dan tekanan yang tinggi. kesesuaian genotip cenderung meningkat dengan jumlah lokus heterozygous yang mengandungnya Pada lingkungan salinitas tinggi.. Dalam uji coba fisiologis viabilitas.. penurunan drastis telah ditunjukkan dalam studi dari allozyme heterozygosity pada mole crickets di lingkungan yang hypersalin di Israel Berdasarkan 21 lokus allozyme. Kondisi sea basins. Teori ini memprediksikan bahwa pada kondisi stabil. versicolor merupakan spesies kosmopolitan yang distribusinya dari antartika sampai di gurun pasir mesir. versicolor lebih dramatis dari pada perolehan untuk Gryllotalpa marismortui. yaitu dengan meningkatnya daya tahan kekeringan menguatkan teori lingkungan tentang keanekaragaman genetik. Isolat A.Heterosigositas (H) dan He yang positif dan signifikan secara keseluruhan berkorelasi dengan variasi curah hujan. strain jamur dari DSTS dengan salinitas 5-29% menunjukkan pola hidup penengah antara bahwa dari DSW dan nonsaline (ECII) isolat pada pengujian kedua spora dan miselium. penurunan H jelas ketika populasi menembus ke dalam gurun dan cekungan Laut Mati. Dalam hal ini terlihat peningkatan yang stabil keanekaragaman genom secara keseluruhan baik di daerah pengkodean dan noncoding dari nilai He sebesar 0. Tidak semua spesies Mediterania (misalnya Gryllotalpa gryllotapa) menunjukkan kenaikan H.137 (Sungai Yordan) ke nilai He tinggi sebesar 0. penurunan dari angka 0. A. Kemudian kami membuktikan bahwa temuan ini benar juga untuk keragaman DNA dari genom noncoding diketik untuk beragam molekul penanda.278 pada DSSW. Karena heterosigositas protein juga terkait dengan perkembangan homeostasis dan fungsi fisiologis. stamina individu di lingkungan ekologi yang stress tidak menentu dan berfluktuasi. Penurunan secara drastic terjadi pada variabel kedalaman 50-280 m.

Berdasarkan estimasi distribusi mikrofungi tanah dan morfologi seks di alam menunjukkan korelasi positif antara seksualitas (dengan cara meiospores) dengan stres ekologis (Gambar. 6.DSW (hypersaline water). Dead Sea area. 4. konversi gen. mutasi. 3 dengan penambahan estimasi dari DSW). Proporsi seksual spesies dalam mycobiota daerah Israel yang berbeda.diinkubasi pada kondisi DSW yang sesuai dengan kondisi isolat yang diperoleh dari air laut tersebut. Stress lingkungan mempengaruhi keragaman dan seks yang saling terkait dan dibentuk oleh tekanan lingkungan. y menunjukkan prosentase sexual species dari total 70 species yang teridentifikasi. Pada DSW. 2. Baik keragaman genomik dan seks tampaknya mengikuti pola naik dan turun. ECII. DSTS (hypersaline mud). ECI (Lower Nahal Oren. 7. Carmel). Peningkatan mutasi. Stres mempengaruhi keragaman ekologi dan jenis kelamin sehingga memiliki hubungan yang sangat erat yang dibentuk oleh semacam tekanan ekologis. dan seks memastikan tingkat yang lebih tinggi sehingga memiliki potensi yang lebih tinggi untuk adaptasi. northern Negev Desert. rekombinasi. 3. diikuti dengan peningkatan proporsi reproduksi seksual dan penurunan tajam dalam air laut (site 7).1. Gambar 3. tidak . central coastal plain. Kondisi stres memang diketahui meningkatkan polimorfisme genetik. rekombinasi. Kenaikan reproduksi seksual dengan stres meningkat telah dibuktikan. Meningkatnya stress terhadap hipersaline menyebabkan penurunan terhadap keragaman ekologi dan jenis kelamin. Situs 4-6 ditandai dengan intensitas stres meningkat. Mt. dan jenis kelamin. 5.

Tetapi ketika lingkungan mendekati iklim. konvergensi gen dan seks memastikan tingkat keragaman genetik yang lebih tinggi.hanya regional dalam jamur Israel tetapi juga secara lokal di lereng Afrika''''stres dalam ECI dan ECII. semua keragaman menghasilkan mekanisme penurunan. Kenaikan mutasi. rekombinasi. . menyediakan potensi lebih tinggi untuk adaptasi genetik. termal atau kandungan kimia yang menyebabkan niche menjadi sempit. homogen. dan sangat stres.

versicolor mengalami peningkatan seiring bertambahnya stress lingkungan. diversitas genom sangat dipengaruhi oleh seleksi alam sehingga terbentuk suatu diversitas. Pada suatu populasi kecil. keseimbangan dan siklus. Diversitas tingkat genom dan seks ditambah adaptasi dipengaruhi oleh berbagai bentuk seleksi alam sesuai dengan pola dan tingkat stres yang menghasilkan pola adaptif evolusi . Berdasarkan hasil penelitian ini menunjukkan bahwa diversitas genetik dari A. Peningkatan mutasi. Stress lingkungan juga mempengaruhi keragaman dan seks (meiospores) yang saling terkait dan dibentuk oleh tekanan lingkungan. rekombinasi. dan seks memastikan tingkat yang lebih tinggi dan memberikan potensi yang lebih tinggi untuk adaptasi. dan siklus seleksi. mengalami penurunan pada lingkungan di laut mati pada kedalaman 50280 m. versicolor terhadap stress lingkungan. Struktur ekologis laut mati mewakili tepi hypersaline kehidupan. Jadi.BAB III KESIMPULAN Diversitas genom selalu berhubungan dengan diversitas ekologi dan stress lingkungan. Namun. diversitas. Dalam hal ini menunjukkan suatu bukti hubungan genetik pada A. Penanda diversitas genetik menunjukkan peningkatan terhadap stress dan terjadi penurunan pada stress lingkungan yang ekstrem terutama dipengaruhi oleh kedalaman laut. diversitas genetik di alam dipengaruhi oleh faktor abiotik dan biotik sehingga tercapai suatu kesetimbangan. Ukuran stress lingkungan berupa gabungan dari salinitas dan tekanan.

You're Reading a Free Preview

Download
scribd
/*********** DO NOT ALTER ANYTHING BELOW THIS LINE ! ************/ var s_code=s.t();if(s_code)document.write(s_code)//-->