Pengertian Protein Dan Bintil Akar

TUGAS TERSTRUKTUR MATA KULIAH PENGELOLAAN DAS TERPADU

“Indikator Kualitas Air ” Dosen Pengampu: Dr.Ir.Sugeng Prijono, MS

Disusun oleh:
Diana Permatasari Kairupan 0910480213

MINAT MANAJEMEN SUMBERDAYA LAHAN PROGRAM STUDI AGROEKOTEKNOLOGI FAKULTAS PERTANIAN UNIVERSITAS BRAWIJAYA MALANG 2011

Sehingga tanaman sangat memerlukan Nitrogen untuk pembentukan protein pada tanaman dan apabila kekurangan Nitrogen dapat diartikan sebagai kekurangan protein. sekunder (tingkat dua). Nitrogen berperan dalam pembentukan sel . yaitu berupa struktur primer (tingkat satu). Suatu gen tunggal mungkin mempunyai panjang ratusan ribu nukleotida. . protein . Yang banyak tersimpan pada pucuk dan daun muda. Ia berfungsi sebagai sebagai bahan sintetis klorofil . jaringan . Kandungan Nitrogen merupakan unsur yang dominan mempengaruhi pertumbuhan tanaman tersebut. dan asam amino. DNA memberikan perintah perangkat sintesis protein dalam bentuk RNA. tersier (tingkat tiga). terutama saat pertumbuhan vegetatif. protein banyak ditemukan pada bagian antara batang dengan bunga 1. Proses penggunaan informasi di RNA untuk menyintesis protein adalah translasi. Struktur Protein Struktur tersier protein. protein banyak ditemukan dibagian daunnya. Beberapa penelitian menunjukkan keberadaan protein yang memiliki letak berbeda-beda pada tumbuhan. Protein ini memiliki banyak struktur sekunder beta-sheet dan alpha-helix yang sangat pendek. Tumbuhan membentuk protein yaitu informasi didalam gen ditentukan oleh rangkaian linear nukleotida pada DNA. dan kuartener (tingkat empat). Dalam unsur-unsur tersebut mengandung unsur Nitrogen yang merupakan unsur pembentuk pada protein. padi. Model dibuat dengan menggunakan koordinat dari Bank Data Protein (nomor 1EDH).1. Proses pembentukan salinan RNA dari DNA adalah transkipsi. Setelah DNA ditranskripsikan di dalam nukleus RNA bergerak ke sitoplasma. Unsur Nitrogen yang terdapat pada protein adalah 16% dari protein tersebut. Struktur protein dapat dilihat sebagai hirarki. Pada famili serealia seperti gandum. Sedangkan pada kantong semar. Karena itu kehadirannya dibutuhkan dalam jumlah besar . Protein 1. polong – polongan dan jagung protein berada pada bagian bijinya. DNA tidak membentuk protein secara langsung.1 Pengertian Protein Protein adalah senyawa organik kompleks berbobot molekul tinggi yang merupakan polimer dari monomer-monomer asam amino yang dihubungkan satu sama lain dengan ikatan peptida. Dan translasi berlangsung di sitoplasma.2 Pembentukkan Protein Terbentuknya protein bermula dari proses anabolisme dan kemudian dirombak pada tumbuhan tersebut melalui proses katabolisme. Dan masih banyak lagi unsur-unsur yang merupakan pembentuk dari protein yang tersedia pada tumbuhan. dan organ tanaman. Pada tanaman tembakau.Tumbuhan menyerap unsur-unsur hara dalam tanah melalui akar dan disalurkan keseluruh bagian tanaman sampai ke daun sehingga tumbuhan membentuk protein dan melakukan perombakan (proses katabolisme). Pada tumbuhan protein dapat dilihat dari kandungan Nitrogen pada tumbuhan.

Bila struktur domain pada struktur kompleks ini berpisah. "lekukan-beta"). Pada struktur kuartener. berupa pilinan rantai asam-asam amino berbentuk seperti spiral. . dan o gamma-turn. Pada protein yang lebih kompleks. Model dibuat dengan menggunakan koordinat dari Bank Data Protein (nomor 1EDH). maka fungsi biologis masing-masing komponen domain penyusunnya tidak hilang. "puntiran-alfa"). struktur sekunder protein adalah struktur tiga dimensi lokal dari berbagai rangkaian asam amino pada protein yang distabilkan oleh ikatan hidrogen. contoh struktur kuartener yang terkenal adalah enzim Rubisco dan insulin. struktur tersier yang merupakan gabungan dari aneka ragam dari struktur sekunder. setelah struktur kompleksnya berpisah. Beberapa molekul protein dapat berinteraksi secara fisik tanpa ikatan kovalen membentuk oligomer yang stabil (misalnya dimer. protein tersebut tidak fungsional. Struktur protein lainnya yang juga dikenal adalah domain. Berbagai bentuk struktur sekunder misalnya ialah sebagai berikut: o alpha helix (α-helix. o beta-turn. Frederick Sanger merupakan ilmuwan yang berjasa dengan temuan metode penentuan deret asam amino pada protein. "lempeng-beta"). berupa lembaran-lembaran lebar yang tersusun dari sejumlah rantai asam amino yang saling terikat melalui ikatan hidrogen atau ikatan tiol (S-H). Hubungan rantai polipeptida yang berperan di dalamnya akan menimbulkan sebuah fungsi baru berbeda dengan komponen penyusunnya. ada beberapa domain yang terlibat di dalamnya. Protein ini memiliki banyak struktur sekunder beta-sheet dan alphahelix yang sangat pendek. atau kuartomer) dan membentuk struktur kuartener. dengan penggunaan beberapa enzim protease yang mengiris ikatan antara asam amino tertentu. menjadi fragmen peptida yang lebih pendek untuk dipisahkan lebih lanjut dengan bantuan kertas kromatografik. Struktur ini terdiri dari 40-350 asam amino. Inilah yang membedakan struktur domain dengan struktur kuartener.• • • • struktur primer protein merupakan urutan asam amino penyusun protein yang dihubungkan melalui ikatan peptida (amida). (β-turn. Protein sederhana umumnya hanya memiliki satu domain. o beta-sheet (β-sheet. "lekukan-gamma"). Gambar Struktur Protein. (γ-turn. trimer. Struktur tersier biasanya berupa gumpalan.

triptofan. Pertumbuhan tanaman lambat . misalnya bisa ular. Tanaman tumbuh kerdil. e. Pada tanaman polong/kacang-kacangan yang mayoritas mengandung protein yaitu protein globulin. tidak memiliki lysine. Bahan enzim untuk mengkatalisi reaksi-reaksi biokimia misalnya tripsin b. e.am lapisan aleuron (biji jagung) . b. Protein ini memiliki asam amino yang esensial. melindungi tubuh terhadap zat-zat asing. Protein pelindung. a. Tulang-tulang di bawah permukaan daun muda tampak pucat. valin. mentransfer zat-zat atau unsure-unsur tertentu misalnya hemoglobin untuk mengikat O2. hydrogen (H).1. Protein dibentuk dari asam amino yaitu : a.5 Pembentuk dan Fungsi Protein disusun atas unsure karbon (C ). lisin. Produksi bunga dan biji rendah. glutamine dan prolin. Dalam tubuh kita protein mempunyai beberapa fungsi antara lain : a. c. c. Protein yang dihasilkan oleh tumbuhan berbeda – beda dapat dicontohkan pada beberapa tanaman sebagai berikut: Protein prolamin banyak terdapat pada tanaman biji-bijian/sereal seperti beras polongpolongan dan jagung. Tanaman akan mati atau kering apabila tidak diatasi 1. d. b. c. f. misalnya myosin untuk kontraksi otot. glisin. dan methionine. tumbuhan. d. Protein kontraktil .3 Jenis protein Protein yang terdapat pada makhluk hidup memiliki jenis yang berbeda dan memiliki fungsi masing-masing. untuk kontraksi jaringan tertentu. d. oksigen dan kadang-kadang ada unsur phosphor (P) dan sulfur (S). g. . f. Daun menguning karena kekurangan klorofil. f. merupakan racun yang berasal dari hewan. ovalbumin (putih telur).4 Ciri-ciri tumbuhan yang kekurangan protein Kekurangan protein pada tanaman sama dengan kekurangan Nitrogen karena padatanaman terdapat 16% Nitrogen penyusun protein gejala kekurangannya yaitu: a. misalnya antibody yang mengadakan perlawanan terhadap masuknya molekul asing (antigen) ke dalam tubuh. metionin. Asam amino non esensial yaitu asam amino yang dapat disintesis oleh tubuh yaitu alanin. asparagin. Toksin . b. Lebih lanjut mengering dan rontok. kerdil dan lemah. Protein transport . e. Peptide: 2 – 10 asam amino Polipeptide: 10 – 100 asam amino Protein: > 100 asam amino Antara asam amino saling berikatan dengan ikatan peptide Glikoprotein: gabungan glukose dengan protein Lipoprotein: gabungan lipid dan protein 1. leusin. kekurangan cysteine. Asam amino esensial yaitu asam amino yang tidak dapat dibentuk oleh tubuh yang berjumlah 8 yaitu isoleusin. tronin dan fenilanin. Protein cadangan disimpan dalam beberapa bahan sebagai cadangan makanan misalnya da. Jaringan tanaman mengering dan mati.

ikan. Bakteri yang dapat membentuk bintil akar adalah Rhizibium dan Brodyrhizobium. Bintil akar tidak selalu tumbuh di pangkal akar.1 Bintil Akar Bintil akar adalah organ simbiosis yang mampu melakukan fiksasi N dari udara sehingga mampu memenuhi kebutuhan N dari hasil fiksasi tersebut. telur. multi terjadi fiksasi N 23 Bintil berlanjut menjadi periode aktif fiksasi N 28-37 Bintil mencapai besar maksimal dan fiksasi N berlanjut 50-60 Pelapukan bintil . perlu diketahui mengenai bintil akar itu sendiri terlebih dahulu. Rhizobium : Lebih banyak membentuk bintil akar pada tanaman kacang-kacangan di daerah beriklim sedang. merupakan protein yang menyusun struktur sel. Protein hewani . Hormone merupakan protein yang berfungsi sebagai pengatur proses dalam tubuh. ada juga yang tumbuh di ujung-ujung akar. protein ada dua macam yatu : a. b. yaitu protein yang berasal dari tumbuh-tumbuhan contohnya kacangkacangnya. 1. misalnya hormone insulin. keratin untuk rambut dan bulu. yaitu protein yang berasal dari hewan contohnya daging. pada hewan hormone auksin dan gibberellins pada tumbuhan. Protein nabati . h. 2.g. Protein structural. Seringkali bintil akar terdapat pada tanaman legum yang tumbuh pada tanah berpasir yang kurang subur seperti tanah jenis PMK.6 Sumber Protein Berdasarkan sumbernya. Brodyrhizobium : Membentuk bintil akar pada tanaman kacang-kacangan pada iklim tropis. jaringan dan tubuh organism hidup misalnya glikoprotein untuk dinding sel. 2. 2.2 Tahap Pembentukan Bintil Akar Umur Bintil (Hari) Tahap Nodulasi 0 Bakteri masuk ke daalm rambut akar/sel epidermis 1-2 Benang infeksi mencapai dasar sel epidermis dan memasuki korteks 3-4 Suatu massa kecil sel-sel terinfeksi dalam premordium bintil 5 Pembagian pesat dari sel-sel bakteri dan sel-sel inang 7-9 Bintil mulai Nampak 12-18 Pertumbuhan lanjut dari bintil menjadi jaringan bakteroid merah muda.Proses Fiksasi Nitrogen oleh Bintil Akar Untuk memahami proses fiksasi nitrogen (N) oleh bintil akar.

tidak terpencar kedalam sejumlah DNA yang sangat besar yang menyusun kromosom bakteri. 1984). Hal ini memudahkan untuk memotong bagian untaian DNA yang sesuai dari kromoson Rhizobium dan menyisipkanya ke dalam mikroorganisme lain (Prentis. simbiosis masih tetap efektif pada suhu 7 C sampai 40 C. Fungsi Lenoglobin diduga untuk mengirim O2 bagi respirasi dalma bintil dan produksi ATP. Gen – gen nif ini berbentuk suatu rantai . suhu optimal yang dikehendaki adalah 26 C. sedikit alkali. Lenoglobin Aktifitas nitrogenase dan fikasasi N2 oleh legume berhubungan erat dengan Lenoglobin. d. Namun beberapa dapat hidup dibawah pH 5. Pemanasan selama 5’ pada suhu 60 C sampai 62 C dapat mematikan Rhizobium f. Kelembaban Kelembaban yang berlebihan akan menurunkan jumlah fiksasi N2 menurun.2. dimana enzim ini akan menambat gas nitrogen di udara dan merubahnya menjadi gas amoniak. b. Faktor-faktor yang mempengaruhi keberadaan bakteri bintil akar: a. . tetapi semuanya terkelompok dalam suatu daerah. Misal pada kacang kapri. Suhu Suhu optimal bagi kehidupan bakteri Rhizobium bervariasi tergantung pada spesies tanaman dan iklim. Sumber makanan (BO dan perakaran) Sumber makanan diperlukan untuk bertahan sambil menginfeksi akar c. bakteri ini menggunakan enzim nitrogenase.mengurangi bintil akar dan fiksasi N2 oleh bintil akar dengan cara mengganggu pembentukan benang – benang infeksi oleh Rhizobium. Gen yang mengatur proses penambatan ini adalah gen nif (Singkatan nitrogen – fixation). pH sangat rendah menghambat proses infeksi bakteri e. pH Pertumbuhan bakteri menghendaki pH optimal sedikit dibawah netral.3 Mekanisme Penambatan Nitrogen oleh bakteri bintil akar : Untuk menambat nitrogen. Mikroorganisme lain (sbg kompetitor di rizosfir) Mikroorganisme lain. dapat menghalangi bakteri bintil akar untuk menginfeksi akar.terutama yang antagonis. Pada suhu 20 C bintil akar tidak dapat tumbuh dengan baik. Kelembaban tanah 25-75% dari kapasitas lapang optimal untuk simbiosis kedelai dan alfalfa. Namun. g. • Senyawa racun Atom N dalam ion NH4+ dan dan NO3.

Ca dibutuhkan oleh Rhizobium untuk meginfeksi akar. • • • • Ketersediaan nutrisi Atom P diperlukan untuk pembentukan dan aktifitas bintil yang maksimal.5 Siklus Penyediaan Nitrogen di Alam Sumber : Anonim a. Kekurangan S akan mengganggu sitesis nitrogenase sehingga kekurangan S menurunkan fiksasi N2.• Mn pada kadar tinggi mengganggu pertumbuhan bintil akar. 2010.org/wiki/Protein .wikipedia. http://id. Mo adalah unsure penting bagi pertumbuhan bakteri karena Mo berperan pada nitrogenase. 2.

2011. http://fandicka.com/2011/04/04/proses-fiksasi-nitrogen-oleh-bintilakar/ .wordpress.blogspot. tumbuhan.Anonim b.html 2011. http://agusbio.com/2011/04/pembentukan-protein-pada- Anonim c .

Sign up to vote on this title
UsefulNot useful